Method Article
我们提出了一种循序渐进的方法来识别和解决与原子力显微镜微压痕相关的最常见问题。我们举例说明了以不同程度的骨关节炎驱动的变性为特征的天然人类关节软骨外植体的新问题。
毫无疑问,原子力显微镜(AFM)是目前评估生物领域微观甚至纳米线索的最强大和最有用的技术之一。然而,与任何其他微观方法一样,可能会出现方法学挑战。特别是,样品的特性、样品制备、仪器类型和压痕探头都可能导致不必要的伪影。在该协议中,我们举例说明了健康和骨关节炎关节软骨外植体的这些新问题。为此,我们首先通过分步方法展示如何 通过 整个组织外植体的大型 2D 镶嵌荧光成像,根据变性的不同阶段生成、分级和视觉分类离 体 关节软骨盘。 离体 模型的主要优势在于它由老化的、天然的、人类软骨组成,可以研究骨关节炎从早发到进展的相关变化。此外,还介绍了组织制备中的常见陷阱,以及实际的AFM程序以及随后的数据分析。我们展示了样品制备和处理、高级退化引起的形貌样品特性以及样品-尖端相互作用等基本但关键的步骤如何影响数据采集。我们还仔细研究了AFM中最常见的问题,并在可能的情况下描述了如何克服这些问题。了解这些局限性对于正确的数据采集、解释以及最终将研究结果嵌入到广泛的科学背景中至关重要。
由于电子设备和系统的尺寸不断缩小,微纳基技术和装备的快速发展势头强劲。其中一种设备是原子力显微镜 (AFM),它可以扫描生物表面并在纳米和微米尺度上检索地形或生物力学信息1,2。在其广泛的功能中,该工具可以作为微压头和纳米压头操作,以获取有关各种生物系统的机械性能的信息3,4,5,6。数据是通过机械探针与表面的物理接触来收集的,机械探针的尖端可以小至约 1 nm7。然后根据悬臂尖端的压痕深度和施加在样品上的力8 显示样品的变形。
骨关节炎(OA)是一种长期退行性慢性疾病,其特征是关节和周围组织中的关节软骨恶化,这可能导致骨表面完全暴露。OA的负担是沉重的;目前,65岁及以上的女性中有一半和男性中有三分之一患有OA9。创伤、肥胖和由此导致的关节10 生物力学改变决定了关节软骨退化,这被视为常见的最终结果。Ganz 等人的开创性研究认为,OA 过程的早期步骤可能涉及软骨的生物力学特性11,从那时起,研究人员证实了这一假设12。同样,人们普遍认为,组织的生物力学特性在功能上是由超微结构组织以及细胞-细胞和细胞-基质串扰协调的。任何改变都会极大地影响整体组织的生物力学功能13。迄今为止,OA 诊断是临床诊断,并且基于平片 X 线照相14。这种方法是双面的:首先,缺乏明确的退行性临界阈值来制定 OA 的诊断,使得病情难以量化,其次,成像方法缺乏敏感性和标准化,无法检测局部软骨损伤15,16,17。为此,软骨机械性能的评估具有决定性的优势,即它描述了在OA过程中变化的参数,无论疾病的病因如何,并且在非常早期的阶段对组织功能有直接影响。压痕仪器测量组织抵抗压痕的力。事实上,这并不是一个新概念;最早的研究可以追溯到 1980 年代和 1990 年代。在此期间,大量研究表明,设计用于关节软骨关节镜测量的压痕仪器可能非常适合检测软骨的退行性变化。甚至在 30 年前,一些研究就能够证明压痕仪器能够通过在关节镜检查期间进行压缩刚度测量来检测组织变性过程中软骨表面的体内变化18,19,20。
关节软骨的 AFM 压痕 (AFM-IT) 提供有关组织的关键机械特性(即刚度)的信息。这是一个机械参数,描述了施加的无损载荷与缩进组织区域21的变形之间的关系。AFM-IT 已被证明能够量化宏观上未受影响的胶原网络中僵硬的年龄依赖性变化,从而区分与 OA 发病相关的病理变化(关节软骨外桥量表 0 级)22。我们之前已经证明,AFM-ITs基于空间软骨细胞组织作为早期软骨退行性变的基于图像的生物标志物,不仅可以量化,而且可以实际确定最早的退行性机械变化。这些发现已经得到其他人的证实 23,24.因此,AFM-IT是诊断和识别早期退行性变化的有趣工具。这些变化已经可以在细胞水平上测量,重塑对OA病理生理过程的理解。
在该协议中,我们展示了关节软骨外植体的完整组织学和生物力学分级程序,从天然软骨外植体制备到 AFM 数据采集和处理。通过循序渐进的方法,我们展示了如何通过二维大马赛克成像,然后进行微AFM压痕,根据变性的不同阶段对关节软骨组织进行生成、分级和视觉分类。
尽管目前,AFM-IT 是测量软骨生物力学变化的最灵敏的工具之一7,但与任何其他仪器技术一样,它具有局限性和实际特性25,可能导致错误的数据采集。为此,我们仔细研究了软骨外植体AFM测量过程中出现的最常见问题,并在可能的情况下描述了如何最大限度地减少或克服这些问题。这些因素包括样品的形貌方面和在与AFM兼容的环境中稳定它们的困难,组织表面的物理特性,以及在这些表面上进行AFM测量的困难。还给出了错误的力-距离曲线的示例,强调了可能导致它们的条件。还讨论了悬臂尖端几何形状固有的其他限制以及使用赫兹模型进行数据分析。
使用从德国图宾根大学医院接受全膝关节置换术的患者身上采集的股骨髁。本研究仅包括来自退行性和创伤后关节病变患者的关节软骨样本。在研究开始之前,已获得部门、机构和地方伦理委员会的批准(项目编号:674/2016BO2)。在参与之前,已收到所有患者的书面知情同意书。
注:图1中给出了按时间顺序排列的实验步骤的流程 图。
1. 软骨盘的组织处理和生成
2. 软骨椎间盘分选作为细胞空间模式的函数
3. 软骨外植体的生物力学方法
4. 统计分析
使用自制的切割装置,我们能够从新鲜的人髁突中取出并生成小(4 mm x 1 mm)软骨盘,其中包含单细胞空间模式30,包括单串(SS,图2A),双串(DS),小簇(SC),大簇(BC;图2A)和漫反射(图2B)。具有代表性的软骨外植体如图3A所示。使用自上而下的荧光成像选择仅显示一种类型图案的圆盘(图2)。软骨表面椎间盘的形貌变化通过软骨盘产生的60μm厚切片的侧视图成像进一步说明(图2C)。在外植的骨关节炎软骨盘表面,存在浅表纤维颤动和基质裂隙(图3B,C)。这在代表晚期OA进展的椎间盘中尤为明显,以BC的存在为代表(图2A)。荧光后分选后,通过AFM微压痕评估圆盘的刚度。为此,通过生物相容性胶水(图3D)成功地将生成的软骨盘固定在AFM培养皿中,以避免测量过程中的样品漂移(图3E)。必须调整胶水的使用量。胶水量不足会导致椎间盘不稳定,而添加过多的胶水可能会导致胶水在软骨椎间盘下方和/或上方不必要的扩散。后者会导致测量伪影和荧光显微镜下对圆盘的识别不良。胶水应用不当或样品在固定过程中突然移动是导致组织从培养皿上脱落的常见问题,应避免。
图4A显示了与蜂窝图案排列一起逐渐降低的具有代表性的刚度降低。含有SS(中位数为2.6 kPa)的椎间盘的刚度值较高,代表未受损的健康软骨区域。随着 OA 的发生和进展,AFM 测量显示 DS (1.5 kPa) 的刚度急剧下降 42%,SC (0.6 kPa) 的硬度下降 77%,最终以 BC (0.3 kPa;图4A)。含有漫反射图案的圆盘表现出更高的弹性,杨氏模量单一值有重要变化。对于所有具有指定主要细胞模式组织的软骨盘,发现与所采用的设定点(4.477 nN)相关的压痕深度与刚度成反比(图4B)。图4C显示了具有代表性的力-距离曲线,图4D显示了赫兹拟合以及接触点的识别。
除其他因素外,正确的拟合取决于基线的正确确定。如果自动基线检测是错误的(例如,由于基线湍流),也可以手动确定拟合,它允许用户为测量选择更具代表性的基线。但是,如果生成的力-距离曲线不允许适当的拟合,则必须将其丢弃。图 5 显示了不正确的力-距离曲线示例。一方面,由于组织的不规则表面(示例如图5A,B所示),以及由于样品固定不当导致样品的不稳定性(示例如图5C,D所示),因此很难在骨关节炎关节软骨外植体上生成合适的力-距离曲线。伪影可能是由多个探针-样品接触点(由于退化软骨表面不平整)或不需要的组织运动(通过焦平面的变化可见)引起的。这些伪影可以在生成的力-距离曲线中看到,表明悬臂梁和软骨表面之间的接触不理想,或者样品与培养皿的固定不当(见图5A-D)。
图1:实验程序流程图。按时间顺序总结实验步骤,从术中切除的软骨样本开始,到生成 4 mm x 1 mm 软骨盘,通过自上而下和侧视成像根据细胞模式组织对椎间盘进行荧光染色和分选,最后通过原子力测量进行弹性评估。请点击这里查看此图的较大版本.
图 2:代表性软骨盘的荧光成像。 (A) 马赛克 2D 图像和用细胞膜渗透性染料在 100 倍放大倍率下染色的软骨盘的放大示例区域。顶部圆盘显示具有代表性的单弦圆盘,而下方圆盘代表大簇圆盘(底部)。(B) 从表面(顶部)看到的漫反射图案圆盘的马赛克图像,以及从底部(底部)成像的同一圆盘的马赛克图像。(C) 60 μm 软骨盘切片核染色的侧视图。白色比例尺表示 500 μm 用于马赛克图片(较大的视场,A [左面板],B、C)和 100 μm 用于放大、聚焦的图片(A[右面板])。请点击这里查看此图的较大版本.
图 3:外植的关节软骨盘。 (A) 从新鲜的人类关节软骨生成的 4mm x 1mm 软骨盘外植体的代表性图像。白色描绘的比例尺代表 2 毫米。 (B) 天然骨关节炎软骨的代表性图像,其中组织表面呈现肉眼可见的浅表颤动和裂隙。白色比例尺表示 1,000 毫米。 (C) 纤化软骨表面的示意图。(D)在AFM测量之前,通过生物相容性样品胶将每个软骨盘外植体正确固定到AFM培养皿的表面,以避免在实际压痕测量过程中由于样品漂移而产生伪影,如(E)所示。白色比例尺表示 4 mm。 请点击这里查看此图的较大版本.
图 4:根据关节软骨盘的主要细胞模式组织进行分类的原子力显微镜测量的代表性结果。 (A) 箱线图显示计算出的五个圆盘的杨氏模量的中位数,每个圆盘对应一个细胞模式,源自一名患者。每个圆盘总共进行了 25 次测量(五个不同测量点的 5 次测量)。矩形内的黑线表示中值,矩形的下肢和上肢分别表示第一和第三四分位数,误差线表示每组的最低值和最高值。(B) 描绘每个细胞图案的 125 个压痕深度点的点图。(C) 使用AFM获得的示例力-距离曲线,计算出的杨氏模量为0.4 kPa。(D) (C) 中所示的力-距离曲线的代表性赫兹拟合点和接触点确定。x 轴显示垂直尖端位置(即压电陶瓷穿过的距离,从力-距离曲线的接触部分自动减去考虑悬臂弯曲的长度)。*p < 0.05。对于统计分析,使用Friedman检验。缩写:SS = 单弦;DS = 双弦;SC = 小簇;BC = 大集群。请点击这里查看此图的较大版本.
图 5:错误的力-距离曲线示例。 (A) 力-距离曲线显示一个巨大的偏差,然后在观察到表面的连续压痕之前恢复到接近基线水平。这种现象可归因于相对较大的障碍物(例如,从软骨最顶层突出的大表面裂隙)。(B)延伸的力-距离曲线显示多个小峰。这些曲线被认为是由软骨表面的微尺度不规则性(例如纤维性颤动)引起的。(C) 和 (D) 都显示具有双相路线的力-距离曲线。两种力-距离曲线都代表了样品固定不良和样品漂移。在这些情况下,看到焦平面的突然变化也很常见。请点击这里查看此图的较大版本.
作为一种进行性和多因素疾病,OA会引发关节软骨的结构和功能变化。在整个 OA 过程中,机械特征的损伤伴随着关节软骨表面的结构和生化变化27,31。OA中最早发生的病理事件是蛋白多糖耗竭伴胶原网络破坏32,33,34。这种早期的细微表面变化很难通过批量测试来精确定位和识别,因为机械行为是在整个组织深度上平均的。此外,一个尚未解决的问题是器官和组织水平的功能变化是否与微米或纳米尺度的结构和功能变化有关。为此,AFM 被认为是最灵敏的方法之一,能够检测 OA 发病时发生的最早生物力学变化7。它允许在天然样品中进行微米和纳米尺度的刚度测量,提供有关关节软骨机械性能的信息35,36。在该协议中,使用微AFM压痕,我们测量了健康和骨关节炎关节软骨人外植体的弹性特性。结果表明,软骨外植体高度代表了早期局部OA事件,在模式特异性软骨外植体中,硬度明显逐渐降低。此外,结果与先前发表的研究一致,该研究显示,随着细胞模式组织23,24,27,37 的刚度显着降低。
目前需要模拟OA发病机制和进展各个方面的经证实的原生人类模型来解决转化研究的不足以及将体外数据转化为临床环境的挑战。迄今为止,还没有模型能够准确表示复杂的天然人类软骨室,更不用说与年龄相关的关节组织了,这些关节组织在疾病引发刺激下容易发生OA38。迄今为止,最常用的基于外植体的模型是牛或牛来源的,并应用强炎性细胞因子治疗或机械负荷39,40,41。另一方面,该协议演示了如何生成小(4 mm x 1 mm)外植的圆盘状人软骨样本,这些样本指示特定OA事件的各个阶段。使用细胞空间组织作为基于图像的生物标志物对软骨外植体进行分类和分期30,42。由于生物力学特性的早期变化可以在双弦开始出现时立即识别和量化23,27,在软骨表面仍然看起来宏观完整的阶段 26,这种基于外植体的模型允许研究局部天然软骨隔室,并可能提供有关早期 OA 的有见地的信息。此外,该软骨模型可用于研究 3D 原生局部栖息地38,39 中细胞和基质对机械和炎症改变的反应。这些软骨外植体相对简单且易于生成,也可用于研究 OA 异质性,这是开发和测试疾病修饰 OA 药物的限制因素43。还必须注意的是,可扩展性和对接受关节置换手术的患者的依赖性是该模型的两个缺点。
众所周知,关节软骨根据测试的鳞片水平呈现出一种特殊的行为。正如 Loparic 等人所指出的,在微观尺度上,软骨表现为非结构化和均匀的材料35,并且这种方法给出了局部整体软骨刚度的近似值。关于微缩痕或纳米压痕是否更适合,Stolz 等人 2004 年的一项研究 44 比较了微米和纳米尺度压痕在评估关节软骨结构机械性能方面的效果。作者强调,对于关节软骨的微尺度球形压痕,纳米级精细结构成分(即单个胶原纤维和蛋白聚糖)通常分担承重任务。在这种情况下,聚集体的机械性能与单个纳米组分的机械性能明显不同。同一作者提出,微缩痕和纳米压痕的组合可用于评估关节软骨的整体局部刚度曲线,以及与精细结构部件相关的刚度44。
许多基于 AFM 的压痕实验使用锋利的锥体悬臂尖端(半径 = 15-20 nm)22,36,44 来评估软骨力学。尽管目前认为具有锋利悬臂的纳米压痕更适合评估最精细的机械性能,但在测试软生物样品时,球形悬臂尖端产生的结果更一致,更易于建模和解释44,45。此外,Stolz 等人证明,酶促(即弹性蛋白酶)降解的关节软骨的 AFM 纳米压痕是不可能的,因为组织变得如此粘稠,以至于尖端-样品粘附主导力-距离曲线,使数据不可行44。
在本AFM测量中,使用了具有半径为5 μm的球形悬臂尖端的悬臂。选择悬臂的动机是打算在相当大的表面上平均组织的机械性能,同时最大限度地减少对软骨表面造成的损害。悬臂施加的力与得到的样品压痕之间的关系用赫兹拟合模型拟合。使用球面压头时,建议使用赫兹拟合模型,忽略悬臂尖端和样品表面之间的吸引力46。赫兹模型的方程如方程1和方程2所示。
式1
式2
其中 F = 力; E = 杨氏模量; v = 泊松比;δ = 缩进; a = 接触圆半径; Rs = 球体半径。
该模型最终计算了细胞/组织弹性47,正式表示为杨氏模量 (E)。赫兹拟合模型考虑了几个特征,例如尖端形状和大小、压痕和样品变形能力。如果不能理想地满足这些要求,模型可能会提供不准确的杨氏模量46 估计值。
赫兹拟合模型假设应变和弹性应力线性取决于弹性模量,这意味着样品中的压痕仍然比样品本身的厚度小得多46。在这种设置中,这个假设很容易得到满足,其中软骨外植体的厚度为1毫米,而压痕只有几微米。
关节软骨可以建模为多孔粘弹性材料48,49。粘弹性行为是由细胞内/细胞质或基质成分(如分子、细胞器和胶原蛋白-蛋白多糖网络)之间的摩擦引起的50,51。顾名思义,粘弹性材料结合了两种不同的特性:粘性材料(材料在承受外部载荷时缓慢变形)和弹性材料(一旦施加的载荷被移除,材料就会恢复到其初始配置52,53)。粘弹性行为表现为力-距离曲线46,52 中的接近(延伸)和回缩曲线之间的滞后,类似于本研究中获得的滞后(图 4C)。此外,粘弹性材料的一个特点是其机械性能取决于变形率,材料的刚度随着施加载荷的速率(压痕速度)而增加54。因此,通过选择不同的加载速率,生成一系列力-距离曲线,每条曲线表示被测样品在每个加载速率52下的机械性能。因此,在尝试比较各种工作的结果时,考虑所有压痕参数至关重要。总体而言,当在微米尺度上测量时(如本研究使用 5 μm 球形悬臂尖端),关节软骨表现为一种非结构化且均匀的材料,产生累积弹性模量,其中包括由于组织的多孔粘弹性质而对刚度的弹性和粘性贡献35。
赫兹模型的另一个假设是压痕深度小于球形悬臂尖端55 的半径。压痕深度表示悬臂尖端在首次与样品接触后的最大位移。在最大载荷下,最大压痕深度是样品和悬臂尖端的总位移。Bueckle的指南规定,在整个56中,具有相同结构的样品的最大压痕深度为总厚度的10%,否则,结果会根据深度厚度比而变化。对于5 μm的悬臂尖端半径,本研究中的软骨外植体平均缩进1.1 μm,少数情况下有几个3 μm的峰值,特别是对于高度退化的软骨外植体。在这种情况下,寻求折衷方案,因为在实验环境中,需要与大压痕相关的相对较高的力来中和退化软骨的表面不规则性。较轻微的压痕将导致检查浅表颤动和胶原裂缝,这两者都是高度退化的软骨的共同特征57。
对于赫兹拟合模型来说,正确识别悬臂尖端与样品直接接触的点(通常称为接触点)也至关重要。然而,当压入太粘或太软的样品时,这可能会带来问题,因为它可能导致多个探针-样品接触点58,59。事实上,正如 A-Hassan 等人所强调的那样,对于软生物组织,接触点的准确测定是最棘手的问题之一60.在天然骨关节炎软骨外植体中也观察到这种效应,因为根据变性阶段,组织表面失去其天然的机械特性并且通常不均匀,呈现浅表纤维颤动和裂隙(图3B,C)。这种现象在软骨外植体中尤为明显,其中主要的细胞模式是大簇(图2C)。软骨表面的这些不均匀性可能导致多个探针与样品接触点,从而产生错误的结果。在某些情况下观察到巨大的偏转,然后在力-距离曲线的最后拉伸之前快速恢复基线(图5A)。这可能归因于悬臂尖端路径中的大障碍物(例如,软骨磨损和分裂的晚期纤维性颤动区域)。在其他情况下,力-距离曲线的最终斜率散布着较小的不规则性(图5B),表明与连续较小的障碍物(例如,组织的微纤维性颤动)接触。在这种情况下,必须重新测量甚至更改测量地点,以确保数据的可靠性和可重复性。为此,仔细检查AFM输出的力-距离曲线以正确识别接触点也很重要。这是一个需要注意的关键点,因为已经表明,错误地识别 50 nm 的接触点会导致错误地估计 E 的值61 个数量级。一些研究已经开始使用自动化方法来确定力-距离曲线的接触点,目的是在通过目视检查估计接触点时绕过主观用户输入并提高准确性。当处理大量的力-位移曲线时,这一点变得更加重要,例如在细胞力学测量中产生的曲线47,62。尽管已经提出了几种策略来自动确定接触点47,63,64,65,但最佳策略高度依赖于实验条件和因素,例如用于分析数据的模型,探针的形状,悬臂尖端和样品之间的(非)粘附力机械相互作用,以及样品63的(非)赫兹行为。
样品漂移是另一个可能导致伪影和接触点测定错误的常见问题(图3E)。这基本上意味着样品没有正确安装在样品架(培养皿)中,并且样品在AFM测量期间正在移动。当将悬臂梁移动到新的测量位置时,这种效果尤为明显。在实际测量过程中,通过焦平面的突然变化可以很容易地观察到这一方面。由此产生的力-距离曲线通常具有双相延伸斜率,起初温和上升,对应于圆盘底部和培养皿之间的空隙变窄,因为圆盘被悬臂向下推(见图3E),随后在斜坡的第二部分更牢固的倾斜, 表明圆盘现在与培养皿底部直接接触后进一步缩进(图5C,D)。为了克服变形,可以尝试通过使用足够的样品粘合剂(图3D)来更好地固定样品,通过关闭外部热源(灯)来保持温度恒定以避免热漂移,并进行快速扫描测量。在这里的实验中,我们观察到悬臂浸入介质的前 15 分钟内发生的悬臂偏转漂移(由于温度的突然变化)。经过这段时间的流逝,漂移通常可以忽略不计。因此,我们建议实验者在悬臂浸泡后仔细检查基线,并在稳定后开始测量。该过程的持续时间可能会因所使用的悬臂而有很大差异。
任何AFM测量的另一个关键参数是设定点,简单地说,它是悬臂施加在样品上的力的量度。对于接触模式(如本研究所述),设定点表示悬臂的一定偏转。当执行多次扫描或多次重复现场时,如此处的协议所示,悬臂尖端可以从样品表面吸附颗粒,因此有时需要卸下悬臂,正确清洁它66,然后在继续测量之前重新校准。
虽然AFM微压痕提供了新的和有趣的数据收集机会,特别是在骨关节炎软骨的背景下,但如上所述,所产生数据的一致性和可重复性在很大程度上取决于几个参数。当使用这种方法评估软骨组织变性引起的机械变化时,必须首先对各种空间模式进行一些初步测量,以便将结果扩大到特定的实验设计。中试AFM测量应采用最标准化的程序进行,采集足够多的相同模式的样本(例如,五个圆盘),以指示数据变异的程度。当试图量化和评估最早的相关OA刚度变化时(即,在单弦和双弦之间, 图4A),这一点尤为重要。事实上,在之前的一项研究中,使用类似的方法,我们发现需要 30 个人类标本的样本量来评估基质中的生物力学变化作为细胞空间组织的函数37。
此外,该协议中提出的许多步骤容易受到人为错误的影响,并且严重依赖操作员的经验。考虑到所有可能影响实际AFM结果的因素,本研究中报告的绝对E值是不可推广的,并且特定于该实验设置。然而,这里介绍的各种杨氏模量与基于细胞模式的软骨外植体之间的关系(空间模式越病理,软骨的弹性模量 [EM] 越低)不受影响,因为研究结果与先前的研究一致,显示刚度变化是细胞模式组织的函数23,37。
总体而言,该分步方案展示了标准化 3D 天然关节软骨外植体的功能,其不仅代表了 OA 驱动的细胞重组事件,从发病到晚期进展,而且还与硬度的逐渐降低有关。外植体可能反映了用于研究OA发生和进展的可靠仿生模型,允许 在体外测试和开发不同的治疗方式。将这种人类外植体模型与基于AFM的生物力学评估相结合,可以导致生物医学研究和制药行业的范式转变,为识别急需的有效OA药物的新方法铺平道路。
作者没有什么可透露的。
我们感谢图宾根大学医院骨科的骨科医生提供组织样本。
Name | Company | Catalog Number | Comments |
Amphotericin B | Merck KGaA, Darmstadt, Germany | 1397-89-3 | |
Atomic force microscop (AFM) head | CellHesion 200, Bruker Nano GmbH, Berlin, Germany | JPK00518 | |
Biocompatible sample glue | Bruker Nano GmbH, Berlin, Germany | H000033 | |
Calcein AM | Cayman, Ann Arbor, Michigan, USA | 14948 | Cell membrane permeable stain, used for cartilage disc sorting- top view imaging |
Cantilever | Bruker Nano GmbH, Berlin, Germany | SAA-SPH-5UM | Frequency Nom: 30KHz, k: 0.2N/m, lenght nom: 115μm, width nom: 40μm, geometry: rectangular, cylindrical tip with a 5μm end radius |
Cartilage ctting device | Self-made | n/a | Cutting plastic device containing predefined wholes of 4mmx1mm |
CDD camera integrated in the AFM | The Imaging Source Europe GmbH, Bremen, Germany | DFK 31BF03 | |
CDD camera integrated in the fluorescence microscope | Leica Biosystems, Wetzlar, Germany | DFC3000G | |
Cryotome | Leica Biosystems, Wetzlar, Germany | CM3050S | |
Data Processing Software for the AFM | Bruker Nano GmbH, Berlin, Germany | n/a | Version 5.0.86, can be downloaded for free from the following website https://customers.jpk.com |
Dulbecco's modified Eagle's medium (DMEM) | Gibco, Life Technologies, Darmstadt, Germany | 41966052 | |
Fluorescence Microscope (Leica DMi8) | Leica Biosystems, Wetzlar, Germany | 11889113 | |
Glass block cantiliver holder | Bruker Nano GmbH, Berlin, Germany | SP-90-05 | Extra long glass block with angled faces, designed especially for the use with the JPK PetriDishHeaterTM (Bruker). |
Inverted phase contrast microscope (integrated in the AFM) | AxioObserver D1, Carl Zeiss Microscopy, Jena, Germany | L201306_03 | |
Leibovitz's L-15 medium without L-glutamine | Merck KGaA, Darmstadt, Germany | F1315 | |
Microscope glass slides | Sigma-Aldrich, St. Louis, Missouri, USA | CLS294775X50 | |
Mounting medium With DAPI | ibidi GmbH, Gräfelfing, Germany | 50011 | Mounting media with nuclear DAPI (4′,6-diamidino-2-phenylindole) counterstaining used for cartilage discs side view imaging |
Penicillin-Streptomycin | Sigma-Aldrich, St. Louis, Missouri, USA | P4333 | |
Petri dish heater associated with AFM (Petri Dish Heater) | Bruker Nano GmbH, Berlin, Germany | T-05-0117 | |
Scalpel | Feather Medical Products, Osaka, Japan | 2023-01 | |
Silicone Skirt | Bruker Nano GmbH, Berlin, Germany | n/a | Protective silicone membrane (D55x0.25) which is placed on the basis of the base of the glas block to prevent medium condensation in the AFM head. |
Statistical program - SPSS | IBM, Armonk, New York, USA | SPSS Statistics 22 | Vesion 280.0.0.0 (190) |
Tissue culture dishes | TPP Techno Plastic Products AG, Trasadingen, Switzerland | TPP93040 | |
Tissue-tek O.C.T. Compound | Sakura Finetek, Alphen aan den Rijn, Netherlands | SA6255012 | Water-soluble embedding medium |
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