توجد نظائر الكلور على هيئة ^35Cl و^37Cl بنسبة 3:1، بينما توجد نظائر البروم على هيئة ^79Br و^81Br بنسبة 1:1. ينتج الطيف الكتلي لهاليدات الألكيل عادةً قمتين أيونيتين جزيئيتين مميزتين، قمة الأيون الجزيئي، [M]، وقمة الأيون الجزيئي زائد اثنين، [M + 2]. الارتفاعات النسبية لهاتين القمتين تتناسب مع نسب الوفرة النظائر للهاليد. على سبيل المثال، يُظهر 2-كلورو بروبان و1-برومو بروبان قمتين بارتفاعات نسبية للذروة بنسبة 3:1 و1:1 على التوالي.

تفقد هاليدات الألكيل عادةً إلكترونًا غير رابط من الهالوجين لتكوين أيونات جزيئية. تنتج الذروة القاعدية عن الانقسام غير المتجانس لرابطة الكربون-الهالوجين، حيث تنتقل الإلكترونات الرابطة إلى الذرة الأكثر سالبية كهربائية، لتكوين كاتيون وذرة هالوجين. ومن المثير للاهتمام أن الانقسام ⍺ يُلاحظ فقط في كلوريدات الألكيل، وليس بروميدات الألكيل. في كلوريدات الألكيل، تظهر روابط C-Cl وC-C قوى متشابهة، بينما في بروميدات الألكيل، تكون رابطة C-Br أضعف من رابطة C-C. وبالتالي، تشكل كلوريدات الألكيل كاتيونًا مستقرًا، حيث يتم تقاسم الشحنة الموجبة بين الذرتين.

على الرغم من أن الفلوروألكانات واليودوألكانات أقل شيوعًا، إلا أنها تظهر سلوكًا فريدًا للتفتت. تُظهر الفلوروألكانات، بسبب قوة الرابطة C-F ووجود نظير واحد فقط (^19F)، تفتتًا محدودًا وتفتقر إلى قمم نظيرية. تتفتت الألكانات اليودية، التي تحتوي على رابطة C–I ضعيفة ونظير واحد (^127I)، بشكل أساسي عن طريق فقدان اليود، مما يؤدي إلى أطياف أبسط مع انقسام نظيري أقل.