Method Article
We introduce the VacuSIP, a simple, non-intrusive, and reliable method for clean and accurate point sampling of water. The system was developed and evaluated for the simultaneous collection of the water inhaled and exhaled by benthic suspension feeders in situ, to cleanly measure removal and excretion of particulate and dissolved compounds.
Benthic suspension feeders play essential roles in the functioning of marine ecosystems. By filtering large volumes of water, removing plankton and detritus, and excreting particulate and dissolved compounds, they serve as important agents for benthic-pelagic coupling. Accurately measuring the compounds removed and excreted by suspension feeders (such as sponges, ascidians, polychaetes, bivalves) is crucial for the study of their physiology, metabolism, and feeding ecology, and is fundamental to determine the ecological relevance of the nutrient fluxes mediated by these organisms. However, the assessment of the rate by which suspension feeders process particulate and dissolved compounds in nature is restricted by the limitations of the currently available methodologies. Our goal was to develop a simple, reliable, and non-intrusive method that would allow clean and controlled water sampling from a specific point, such as the excurrent aperture of benthic suspension feeders, in situ. Our method allows simultaneous sampling of inhaled and exhaled water of the studied organism by using minute tubes installed on a custom-built manipulator device and carefully positioned inside the exhalant orifice of the sampled organism. Piercing a septum on the collecting vessel with a syringe needle attached to the distal end of each tube allows the external pressure to slowly force the sampled water into the vessel through the sampling tube. The slow and controlled sampling rate allows integrating the inherent patchiness in the water while ensuring contamination free sampling. We provide recommendations for the most suitable filtering devices, collection vessel, and storing procedures for the analyses of different particulate and dissolved compounds. The VacuSIP system offers a reliable method for the quantification of undisturbed suspension feeder metabolism in natural conditions that is cheap and easy to learn and apply to assess the physiology and functional role of filter feeders in different ecosystems.
Bentik süspansiyon besleyiciler deniz ekosistemlerinin 1 işleyişinde temel rol oynamaktadır. Su 2,3 geniş hacimli filtreleyerek, onlar kaldırmak ve partiküler (plankton ve detritus) ve (burada ve referanslar) çözünmüş bileşikler 1 ifraz ve bentik-pelajik bağlantı 4,5 ve besin döngüsü 6,7 önemli ajan vardır. Doğru partikül ve çözünmüş bileşikler kaldırılır ve (örneğin, süngerler, Ascidians, polychaetesi, ve Bivalvlerden gibi) bentik süspansiyon besleyiciler tarafından atılır ölçme onların fizyolojisi, metabolizma ve beslenme ekoloji anlamak esastır. Birlikte hızı ölçümleri pompalama ile, aynı zamanda bu organizmalar ve su kalitesi yanı sıra ekosistem ölçekli süreçleri ekolojik etkisi aracılık ettiği besin akı bir miktarının sağlar.
kaldırma ve üretim partikül oranı ve çözünmüş com ölçme uygun yöntemi seçmeSüspansiyon filtre besleyiciler tarafından lira beslenme aktivitesini 8 ile ilgili güvenilir veriler elde etmek için çok önemlidir. Riisgård ve diğerleri, uygunsuz yöntemler önyargı sonuçları işaret ettiği gibi, deneysel koşullar deforme yenmesi ve bazı maddelerin atılımı yanlış tahminler üretmek ve bu organizmalar tarafından işlenen besin akı hatalı ölçümü yol açabilir.
iki en sık kullanılan yöntemler inkübasyon (dolaylı teknikler) ya da ortam eşzamanlı toplama ve üfledi su (doğrudan teknikleri) ya dahil filtre besleyiciler partikül ve çözünmüş besin akıları ölçmek için. İnkübasyon yöntemleri inkübe su içinde parçacık konsantrasyonu ve çözünmüş besin değişim oranını ölçmek ve yeterli kontrol 8 ile karşılaştırıldığında, üretim veya kaldırma hızları tahmin dayanmaktadır. Bununla birlikte, bir inkübasyon odası içinde bir organizma içine kendi Feedin değiştirebilirg nedeniyle ve / veya gıda konsantrasyonda nedeniyle ya da boşaltım kuluçka su 7,9 bileşiklerin (ve referanslar orada) birikimine oksijen bir düşüş nedeniyle doğal akış rejiminde değişiklikler davranışı pompalama. Kapatılma ve modifiye su etkilerine ek olarak, inkübasyon teknikleri büyük bir eğilim yeniden filtreleme etkileri (örnek 10 bakınız) kaynaklanmaktadır. Bu metodolojik sorunların bazıları inkübasyon kabına 11 sağ hacim ve şekil kullanarak veya yerinde 12 bir sirkülasyon çan kavanoz sisteminin getirilmesi ile üstesinden olmasına rağmen, bu tekniğin genellikle çıkarma ve üretim oranları göz ardı etmektedir. Bu çözünmüş organik azot (DON) ve karbon (DOC) ya da inorganik besin olarak çözünmüş bileşiklerin metabolizması miktarının, inkübasyon teknikleri 13 kaynaklanan önyargılar özellikle yatkın olduğu kanıtlanmıştır.
60'ların sonlarında ve 70'lerin başlarında Henry Reiswig içinde9,14,15 ayrı yerinde organizmalar tarafından inhale ve üfledi su örnekleme yoluyla, dev Karayip süngerler tarafından parçacık kaldırma ölçmek için doğrudan tekniklerin uygulanmasını öncülük etmiştir. Daha küçük süspansiyon besleyiciler ve daha zorlu sualtı koşullarda Reiswig tekniğini uygulamak için zorluk nedeniyle, bu alandaki araştırmaların toplu çoğunlukla dolaylı kuluçka teknikleri 16 kullanılarak (in vitro) laboratuvara sınırlandırılmıştır. Yahel ve arkadaşları küçük çaplı şartlarında çalışmak için in situ tekniği Reiswig doğrudan sığdırılmıştır. Bu yöntem, Inex 16 olarak adlandırılan, rahatsız organizmalar tarafından (Ex) (In) inhale ve ekshale su eşzamanlı sualtı örnekleme dayanmaktadır. Numunelerin bir çift (inex) arasında bir bir madde (örneğin, bakteri) farklı konsantrasyonlarda hayvan tarafından bu maddenin tutma (veya üretimi) bir ölçüsünü sağlar. INEX tekniği açık uçlu tüpler istihdam vepasif toplama tüpünde ortam su yerine çalışılan organizmanın pompalama faaliyeti tarafından üretilen excurrent jet dayanır. Yahel ve arkadaşları başarılı 15 farklı süspansiyon çalışmada bu tekniği uygulanmış olsa da takson besleyiciler (örneğin, 17), yöntem bazı excurrent menfezlerin ufacık büyüklüğüne göre gerekli uygulama ve deneyimi yüksek seviyede ile kısıtlı olup, tarafından deniz koşulları.
Bu engelleri aşmak için, biz dakika tüpleri ile örneklenmiş suyun kontrollü emme (dış çapı <1,6 mm) dayalı alternatif bir teknik geliştirdi. Amacımız bu tür bentik süspansiyon besleyiciler excurrent deliği gibi temiz ve çok özel bir noktada, in situ su örnekleme kontrol sağlayacak basit, güvenilir ve ucuz cihaz oluşturmak oldu. Etkili olabilmesi için, yöntem, ortam akış rejimini etkileyen veya b değiştirmek şekilde değil müdahaleci olmayan olmak zorundaçalışılan organizmaların ehavior. Burada yer alan cihaz, VacuSIP olarak adlandırılır. Bu Yahel ve arkadaşları tarafından geliştirilen SIP sisteminin bir basitleştirme olduğunu. Derin deniz ROV tabanlı noktası örnekleme (2007) 18. VacuSIP orijinal SIP çok daha ucuzdur ve SCUBA-bazlı çalışmalar için adapte edilmiştir. Sistem laboratuvar ortamlarında için Wright ve Stephens (1978) 19 ve Møhlenberg ve Riisgård (1978) 20 tarafından sunulan ve test edilmiş prensiplere göre dizayn edilmiştir.
VacuSIP sistemi bentik süspansiyon besleyiciler metabolizmasının in situ çalışmalar için tasarlanmış olsa da, aynı zamanda, laboratuar çalışmaları için kullanılabilir ve daha kontrollü ve temiz, nokta-kaynağı, su örneği yerde gereklidir. In situ filtrasyon veya uzun süreli (en az-saat) boyunca entegre gerekmektedir sistem özellikle yararlıdır. VacuSIP 2011 yılından bu yana YAHEL laboratuarda başarılı bir şekilde kullanılmıştır ve ayrıca sahiptirKarayipler ve Akdeniz sünger türlerinin 21 aracılı besin akı iki son yıllarda yapılan çalışmalarda istihdam edilmiştir (Morganti ve ark. sunulmuştur).
VacuSIP uygulandığı özel numune, uzun örnekleme süresi ve tarla koşullarında, kullanımı toplama filtre ve duyarlı analitler için numune depolamak için, standart protokoller Okyanusbilimsel bazı sapmalar gerektirir. VacuSIP sistemi veya toplama sonra bakteriyel aktivite ile alınan su numunelerinin modifikasyonu riski ile kontaminasyon riskini azaltmak için, biz yerinde filtrasyon ve depolama işlemlerinde çeşitli test edilmiştir. Farklı filtreleme cihazları, toplama gemiler ve depolama prosedürleri çözünmüş inorganik (PO 4 3-, NO x - NH 4 +, SiO 4) analizi için en uygun tekniği elde etmek için incelenmiş ve organik (DOC + DON) bileşikleri ve ultra plankton (<1081 m) ve partiküler organik (POC + PON) örnekleme. Diğer bir özellikle alan koşulları altında, kirlenme riskini azaltmak için, işleme adımlarının sayısı minimumda edildi. yöntem sunulduğu görsel biçim tekrarlanabilirliği kolaylaştırmak ve verimli tekniği uygulamak için gereken süreyi azaltmak için aydınlatmaktadır.
Sistem görünümü
2 mm kadar küçük exhalant deliklerle süspansiyon besleyiciler in situ pompalanan su içinde örnek için, her bir numunenin pompa etkinliği ilk aşağıdaki uçucu menfezi (ler) i ve excurrent açıklığı 16 akışını gözlemleyerek fluorescein boyalı deniz suyu, süzüldü salgılayarak görüntülenmiştir (18 şekil 2b de bakınız). Çalışma örneğinin (Cari Olmayan ve excurrent) tarafından inhale ve üfledi su, daha sonra eş zamanlı olarak özel olarak oluşturulmuş bir manipülatör yüklü dakika tüpler bir çift kullanımı ile ya da "ar ikisine örneklenirbaş aşağı esnek taşınabilir tripod ms "(Şekil 1 ve Ek Video 1). Çalışma organizma tarafından inhale su dikkatlice içinde veya çalışma organizmanın uçucu madde diyafram yakın bir tüpün proksimal ucunu yerleştirerek toplanır. Bir özdeş tüp daha sonra excurrent menfez içine yerleştirilir. Bu işlem tortu tabanda, örneğin kişi veya hayvanın bozukluğu, önlemek için iyi bir bakım gerektirir. örneklemeyi başlamak için, bir dalgıç bağlı bir şırınga iğnesi ile toplama kabında bir septumu delip örnekleme tüpü içinden kap içine alınan su numuneleri zorlamak için harici su basıncı sağlayan, her tüpün uzak ucu. emiş önce şişelere oluşturulan vakum ile ve dış su ve tahliye numune kabı arasındaki basınç farkı ile başlatılır .
üfledi su temiz bir koleksiyon sağlamak ve ambi yanlışlıkla emme önlemek içinent suyu 16, su örnekleme hızı excurrent akış oranı önemli ölçüde daha düşük bir hızda (<% 10) muhafaza edilmesi gerekmektedir. Emme hızı, borunun uzunluğu ve iç çapı (ID) ile kontrol edilir. küçük iç çapı da ihmal edilebilir bir ölü hacmi (yerinde filtrasyon bir hassas analitler için tavsiye edilir. Örnekleme gemiler, filtrasyon montaj ve boru seçimi çalışması organizmalar ve özel araştırma sorusu tarafından dikte edilir. Aşağıda açıklanan protokol tam metabolik profili (genel bir bakış için bakınız Şekil 2) ilgi olduğunu varsayar. Ancak, protokolün modüler yapısı f veriyorveya kolay değişiklik basit, hatta çok farklı örnekleme planları karşılamak için. Tam metabolik profil için örnekleme protokolü aşağıdaki adımları içermelidir: (1) Akış görselleştirme; (2) Örnekleme ultra plankton besleme (plankton <10 mikron); (3) (in-line filtreleri kullanarak) inorganik besin alımı ve atılımı Örnekleme; (4) Örnekleme organik alımı ve atılımı çözünmüş (in-line filtreleri kullanarak); (5) Partikül besleme ve atılımı (in-line filtreleri kullanarak); (6) 2. adımı tekrarlayın (kalite kontrol gibi ultra-plankton besleme); (7) görselleştirme akış.
Lojistik mümkün, metabolik profil ölçümleri hızı pompalama ile birlikte kullanılması tavsiye edilir (örn, boya ön hız yöntemi, 16) yanı sıra solunum ölçümleri. Bu ölçümler en iyi örnekleme oturumun başında ve sonunda alınır. solunum ölçümü için, sualtı optodes veya mikro-elektrotlar tercih edilir.
1. Hazırlık Adımları ve Temizlik İşlemleri
2. Çalışma Sualtı
Şekil 1. VacuSIP doğru tesislerin bir örnek: inhale ve solunan su numuneleri için sarı (fotoğraf için yeşil kullanılan renk kodu ile özel bir dahili manipülatör kullanarak ascidian Polycarpa mytiligera (Akabe Körfezi, Kızıl Deniz) örnekleme (A) ) Tom Shelizenger ve Yuval Yacobi tarafından; (B) (NW Akdeniz sünger Agelas oroides örneklemeVacuSIP cihazı kullanılarak 3 mm osculum genişliği, Deniz). Kullanılan renk kodu solunan su örnekleri için inhale ve kırmızı için sarı. Bu rakamın büyük halini görmek için lütfen buraya tıklayınız.
Protokol bölümünde anlatılan VacuSIP tekniğinin 2. Genel Bakış Şekil. Laboratuvar çalışmaları sarı kutularda temsil edilir, mavi kutulara saha. Bu rakamın büyük halini görmek için lütfen buraya tıklayınız.
Tablo 1. genel ortalama örnekleme oranları (ml dk -1) farklı konteynerler ile elde edilenSu koleksiyonları ve farklı vakum seviyeleri için kullanılan: şişeler (yok) vakumlu değildi; EPA cam şişe ve HDPE şişeler kendi hacminin (½ hacim) yarısını Karyolalar; steril plastik tüpler zaten üretici tarafından vakumlu bulundu. 5-8 m derinliğinde, 18-22 ° C su sıcaklığında çalışan 79 cm uzunluğunda ve 25 mikron iç çapa PEEK tüpleri kullanılarak.
Tablo 2. numune kabı, sabitleyici, in-line bir filtre tertibatının, depolama genel protokol bölümünde açıklanan analiz yöntemleri. Analiz bileşikler şunlardır: ultra-plankton bolluğu (plankton <10 mikron), silikat (SiO 4), fosfat (PO 4 3-), nitrit + nitrat (NO 2 - + NO 3 -), çözünmüş organik madde (DOM), amonyum (NH4 +) ve parçacık halinde organik madde(POM). Tüm örnekleme gemiler silikon septum kap ve örnekleme önce vakumlu. Fiksatif şunlardır: paraformaldehit + glutaraldehid (Glut + Parafor), ortofosforik asit (H3 PO 4) ve hidroklorik asit (HCI). kullanılan in-line filtre meclisleri vardır: polikarbonat filtre sahipleri ve polikarbonat membran 0.2 mikron filtre (PC filtre tutucu + PC membran) ve paslanmaz çelik filtre tutucular ve bağlayıcı içermeyen cam elyaf Gff filtreler.
Deniz suyu toplama yöntemleri optimizasyonu
Toplayıcı şişeleri ve temizlik prosedürü seçimi
VacuSIP uyumlu toplama hazneli numune bir şırınga iğnesi ile delinmesi ile başlatılabilir sağlayan bir septum olmalıdır. Onlar yüksek sualtı basıncı (derinlikleri çalışan tipik tüplü 2-3 bar) dayanıklı olmalıdır ve bir vakum tutmak gerekir. Birçok (hepsi değil markalar) uçucu organik maddelerin analizi için EPA tarafından onaylanan şişeleri bu kriterleri karşılar. DOC ve DON analizi için onaylanmış önceden temizlenmiş küçük şişeler de mevcuttur. toplama ve analiz besin ve temizlik prosedürlerini optimize etmek için bu şişeleri uygunluğunu test etmek için, yüksek kaliteli çift distile su asit temizlenmiş polipropilen tüpler (PP borular) toplanmıştır, yeni bir yer satınCID temizlenmiş yüksek yoğunluklu polietilen şişeler, (HDPE şişeler) ve EPA, cam şişeler içinde, tüm politetrafloroetilen (PFTE) bölmeli kapak ile donatılmıştır. Yukarıdaki bölüm 1.5.2 açıklandığı gibi HDPE şişeler ve polipropilen borular temizlenmiş ve EPA cam şişeler üretici tarafından temizlendi.
EPA cam şişe bulunan NH 4 + miktarı nispeten az oldu (≤ 0.1 mmol L-1) ve yüksek kaliteli çift distile su standart kalitesine bağlıdır. Bunun aksine, NH4 + konsantrasyonları belirgin bir şekilde (sırasıyla 3 ve 7 kat, kadar) artmış ve daha yüksek bir ANOVA F (asit temizliği polipropilen tüpleri içinde ve yüksek yoğunluklu polietilen şişelerde değişkenlik (5,53) = 7.183, p sergiledi < 0.001, Şekil 3). amonyum analizi silikon septum ile yüksek kaliteli çift distile su temas hiçbir etkisi yoktu.
Karşılaştırma temizlenmiş / geri dönüşümlü cam şişe karşı yeni bir cam şişeleri
EPA cam şişe kereden fazla besin analizi için yararlanılabilir olup olmadığını test etmek için, NO x - PO 4 3- NH, yeni EPA cam şişelere toplanan deniz suyu örneklerinde 4 + konsantrasyonlar EPA cam şişelere toplanan ile karşılaştırıldı. (1.5.2), yukarıda tarif edildiği gibi geri dönüştürülmüş cam viyaller temizlenmiş ise, yeni EPA cam şişe, üretici tarafından önceden temizlenmiş. Geri kazanılmış şişeler yeni bir cam şişelerde bulunan düzeyde katı 1.5 kadar önemli ölçüde daha yüksek NH4 + konsantrasyonuna sahip (t testi, p <0.001, n = 5). Anlamlı bir farklılık NO x bulundu - ve yeni cam toplanan geri dönüşümlü şişelerde toplanan örnekler ve numuneler arasında PO 4 3- içerikküçük şişeler (Şekil 4).
Silikat toplama ve depolama prosedürleri
silikat analizi için en iyi örnekleme kabı belirlemek için, yüksek kaliteli iki defa destillenmiş su olmayan temizlenmiş asit temizliği, yüksek yoğunluklu polietilen şişelerde, ve asit temizliği polipropilen tüplere (PP borular) 'de (HDPE şişeler) içinde toplanmış ve EPA, cam şişeler içinde. beklenen konsantrasyon sapma değerleri kontamine kabul edildi, böylece beklenen silikat konsantrasyonu, sıfıra yakın oldu. Silikat konsantrasyonu önemli ölçüde asit temizlenmiş HDPE şişelerde düşük SiO 4 konsantrasyonunu gösteren, farklı şişeleri (ANOVA, F (3,19) = 210,047, p <0.001) toplanan numuneler arasında farklılık göstermiştir. Borosilikat cam şişeler nihai SiO 4 konsantrasyon 7 umol kadar artarak birlikte, örnekleri kontamineL-1 (Şekil 5).
Çözülmüş organik madde (DOM) ve besin analiz için filtrasyon cihazının seçimi
Filtre cihazı çözünmüş organik (DOC ve DON) ve inorganik besin analizinde düşük boş üretir belirlemek için - paslanmaz çelik filtre tutucular polikarbonat karşılaştırılmıştır (NO x, NH 4 +, PO 4 3-), Swinney-line olarak filtre tutucular. Her filtre tutucusu türüyle biz polikarbonat membran ve ön yakılan cam elyaf filtre hem test etti. polikarbonat membran ile donatılmış polikarbonat Swinney filtre tutucu açıkça 9 kata kadar tarafından numuneleri kirlenmiş ise paslanmaz çelik filtre tutucu ve yanmış cam elyaf filtre kombinasyonu, düşük boşlukları sağladı. Yıkama hacimleri artan yaptım Bu sorunu (Şekil 6) çözmek değil.
Farklı şişeleri ile toplanan Şekil 3. Amonyum konsantrasyonu (umol L -1, ortalama ± SD): (1) Temizlenmemiş HDPE şişe; (2) Temizlenmiş HDPE şişe; (3) Temizlenmiş HDPE şişe + Parafilm; (4) EPA cam flakon; (5) EPA cam şişe + Parafilm; (6) PP tüp temizlenmelidir. Parafilm silikon septum su numuneleri kontamine olup olmadığını test etmek için yerleştirilmiştir. Her bir muamele için, yüksek kaliteli, çift damıtılmış su 9 numune analiz edilmiştir. Numuneler taze analiz edildi. Önemli farklılıklar dört örnekleme damarları (ANOVA, F (5,53) = 7.183, p <0.001, güç testi = 0.992) arasında bulunmuştur. Bu rakamın büyük halini görmek için lütfen buraya tıklayınız.
.jpg "/>
Şekil 5. Silikat konsantrasyonu (umol L -1, ortalama ± SD) asit-temizlenmiş PP borular, PP borular, asit-temizlenmiş HDPE şişeleri, yeni EPA cam şişe: Yüksek kalitede çift distile su farklı şişelerde topladı. Önemli farklılıklar dört örnekleyici malzemeler arasında bulundu (ANOVA, F (3,19) = 210,047, p <0.001, güç testi = 1). Bu rakamın büyük halini görmek için lütfen buraya tıklayınız.
Şekil 6. Farklı filtrasyon meclisleri etkisini incelemek ve nitrit + nitrat birimler yıkayın (NO x - ľmol L -1). NO x için Örnekleri - (SS f paslanmaz çelik deniz suyu örnekleri filtreleme elde edilmiştirilter tutucu) veya polikarbonat in-line bir polikarbonat membran (PC filtresi) ya da bir ön-yanmamış cam elyafı filtreler ya sahip Swinney filtre yuvası (PC filtre tutucusu). Bilgisayar filtreler için,% 5 HCI ve yüksek kaliteli çift damıtılmış su farklı hacimlerde (10, 30, 60, 90 ve 120 mi) filtre tertibatını yıkanması için kullanılmıştır, çamaşır hacmi, Şekil açıklamasında parantez içinde verilmiştir. Değerler olarak ortalama ± standart sapma olarak ifade edilmiştir (n = 5). Deniz suyu Deniz Bilimleri Enstitüsü Deneysel Aquaria Bölgesinde toplandı ve örnekler süzüldükten sonra taze analiz edildi. Bu rakamın büyük halini görmek için lütfen buraya tıklayınız.
Şekil deney sonuçlarının 7. Örnek: inhale (IN, siyahChondrosia Akdeniz'de reniformis sünger tarafından işlenen farklı maddelerin daire) ve (EX, kırmızı üçgen) eşleştirilmiş üfledi su numunesi konsantrasyonları (ľmol L -1): (A) amonyum (NH 4 +); (B) nitrit + nitrat (NOx -); (C), fosfat (PO4 3-); (D) Silikat (SiO 4); (E) çözünmüş organik karbon (DOC); Organik azot (DON) içinde eritildi (F) sağlanması; (G) planktonik organik karbon (LPOC); (H) planktonik organik azot (LPON). Bu rakamın büyük halini görmek için lütfen buraya tıklayınız.
Şekil 8. bir akış sitometride bir örneği,(A, B, C, D) fitoplankton popülasyonlarının;: inhale su çekilir eşleştirilmiş su örneklerinin Etry analizi (A, C, E, G) ve nefes verme (B, D, F, H) sünger ile Chondrosia reniformis (E, F, G, H) heterotrofik bakteri. AB ve EF örnekleme (tüm planktonik grupların etkin bir şekilde muhafaza edilmiş) temiz ve doğru oldu. CD ve GH tüm planktonik grupların düşük kaldırılmasını gösteren solunan su kirliliği örnekleridir. Syn:. Synechococcus sp, pico: ototrofik picoeukariotes, nano: ototrofik nanoeukaryotes,: yüksekten DNA içeriği ile heterotrofik bakteri, düşük. Düşük DNA içeriği ile heterotrofik bakteri bu rakamın daha büyük bir versiyonunu görmek için lütfen buraya tıklayınız.
Ek Figuristiridye Chama pacifica farklı planktonik yırtıcı e 1. Hücre tutma verimliliği: Prochlorococcus sp. (Pro), Synechococcus sp. (Syn), piko-ökaryotlar (Pico Euk), nano-ökaryotlar (Nano Euk). Hata çubukları =% 95 CI. Bu dosyayı indirmek için tıklayınız.
Ek video 1. Örnekleme solunan su numuneleri için inhale için yeşil ve sarı kullanılan renk kodu ile özel bir dahili manipülatör kullanarak ascidian Polycarpa mytiligera. Örnekleme borular (PEEK, ID 54 um, 75 cm uzunluğunda) dikkatli ascidian arasında exhalant ve uçucu sifonlar yerleştirilir. Su daha bir oranda tahliye tüplere çekilir ~ 1 ml dk-1. Bu gösteriye floresein boya exhalant jet görselleştirmek için kullanılır. exhalant örnekleme borusu de Wi yerleştirilir unutmayınince exhalant jet. Bu dosyayı indirmek için tıklayınız.
hazırlık adımlar
DOM ve besin analizi için kolektör şişeler
Toplayıcı damarlar çözünmüş mikro bileşenleri ile etkileşime girebilir ve örnekleyici duvarları büyüme 30-34, DOM ve besin koleksiyonu için farklı şişeler test edildi bakteriler için bir substrat olabilir beri. Numuneler hızla 30 donmuş değilse cam şişe kadar iki kat silika ilk konsantrasyonunu artırabilir çünkü Borosilikat, silis miktarının 33,35 için tavsiye edilmez. Bizim sonuçlarımız, önceden temizlenmiş EPA şişeleri kullanarak en önemlisi amonyum için, DOC, DON ve inorganik besin düşük konsantrasyon boşlukları neden olduğunu göstermektedir.
DOC filtrasyon ve depolama
Filtrasyon pek çok durumda, gerekli ve deniz kimyada ilk analitik adımdır vemikrobiyoloji. Bu laboratuarda toplandıktan sonra numuneleri filtre mümkün olsa da, bu prosedür örnekleri uzakta uygun laboratuar olanaklarından genellikle uzak yerlerde, saatler ya da günler içinde, sualtı toplanır yerinde çalışmaları için tavsiye edilmez. In situ süzülerek in-line kullanımı numune muhafazası en aza indirir ve bu nedenle kirlenme riskini azaltır. Yerinde filtrasyon ayrıca bakteri çoğunu çıkarır ve örnek bileşim, uzun süreli numune alma ve taşıma sırasında bakteriyel metabolizma tarafından değiştirilebilir riskini azaltır zaman. filtrasyon düzeneği örnekleme cihazının ölü hacmini artırır ve aynı zamanda kirlilik kaynağı olabilir. Mümkün olan en küçük filtre sahiplerinin bir seçim (örneğin, in-line Swinney filtre tutucu 13 mm) ve dakika PEEK boru (örneğin, 254 mikron ID) ölü hacim ve çevre su ile kontaminasyon riskini azaltır.
Uygun filtre değilsekullanılan ya da özenle yıkanıp değilse, su örneklerinin eserler ve kirlenme 32,36-39 meydana gelme olasılığı. DOC analizi Çalışmalar iyice yüksek kaliteli çift distile su 38 ile boşaltılan olmadığında organik bileşiklerin (polikarbonat ve PFA-PTFE) yapılmış filtre ve filtre sahipleri, özellikle şiddetli DOC kontaminasyon 32,37 neden olabileceğini gösterdi. Mevcut protokol ve sonuçları bu kurallara uymak ve aynı zamanda polikarbonat filtre tutucular kaçınılması gerektiğini göstermektedir.
Yerinde iş ve interoperation içinde
VacuSIP sistemi kendi doğal ortamında rahatsız süspansiyon besleyiciler metabolizma ve sistemdeki ekolojik rolleri miktarının çalışma kolaylaştıran doğrudan örnekleme tekniğidir. tecrübeli ve donanımlı dalgıçlar için VacuSIP yönteminin uygulanması basit ve sadece kısa tr gerektirirTahliye. INEX VacuSIP deneyleri bu nedenle yüksek boşluklar dahil olmak üzere çoğu analitik eserler için kontrol bir 'within' tasarım istatistiksel analiz (yani, eşleştirilmiş veya tekrarlanan önlem analizi) için tasarlanmıştır. Kontrollü emiş kullanımı, böylece ortam su ile ekzale su kazara kontaminasyonu engelleyerek, yavaş ve ayarlanabilir örnekleme oranları sağlamaktadır. Mümkün olan yerlerde, düşük akım ve düşük bulanıklık ile çalışma alanlarının seçimi tavsiye edilir ve daha temiz ve daha doğru sonuçlar sağlayacaktır. Uzun süreli örnekleme süresi (saat dakika) bentik sınır tabakası karakterize yüksek patchiness entegrasyonunu sağlar. Tüm bu özellikler düzgün uygulandığında VacuSIP yöntemi çoğaltır az sayıda çalışırken bile güvenilir ve tekrarlanabilir sonuçlar veren, son derece sağlam olduğundan emin olun. Akdeniz sünger ve Hint-Pasifik istiridye türlerinden elde edilen tipik sonuçların bir örneği Şekil 7 ve Supplemen gösterilmektedirtary Şekil 1.
herhangi bir teknik olduğu gibi, VacuSIP potansiyel tuzaklar ücretsiz değil. En yaygın sorun, ortam su ile solunan su numunesinin kirliliğidir. Bu eserler nedenleri yüksek emiş oranı, tüp yerinden oynamalar ve hayvan davranışı içerir. Doğru örnekleme oranının doğru seçimi excurrent akış hızının önceden tahminleri bağlıdır. Bu tür tahminler boya ön hız yöntemi 16 kullanılarak elde edilebilir. İdeal olarak, emme hızı pompa hızının (örneğin, 1 mi dak-1 6 L saat -1 hızı pompa) 1% altında tutulmalıdır. Ortam su ile kirlenmesini önlemek için, örnekleme hızı pompa hızının% 10'undan fazla olmamalıdır.
örnekleme hızı kontrol etmek için, emme boru uzunluğunun ve iç çapı, planlanan çalışma derinliği ve su sıcaklığına göre ayarlanmalıdır. Hagen-Poiseuille denklemi (bakınız bölüm 1.3.1 üzeri) bir kılavuz olarak kullanılabilir. Bununla birlikte, bu denklem örnekleme zamanı ile bir birinci Ap yana sırası uyumu ve örnekleme oranı azalma olarak kabul edilir ve in-line filtrasyon belirsizlikler ekler edilmelidir. tahliye kapların kullanılması, bazen bilinmeyen vakum basınçları ile, ileri komplikasyonları tanıtır. Örnekleme oranları farklı vakum farklı tahliye kaplar bir fonksiyonu olarak değiştiği bir örneği, Tablo 1 'de gösterilmiştir.
örnekleme oranını düşürerek kolayca bu azalma teknik sınırlamalar tüp uzunluğu ve kimliğini ayarlayarak elde edilir (saatte kaç mikrolitre örnekleme oranları mümkün olan). Bununla birlikte, denemecileri yavaş pompalama oranı ile hayvanlar için bu sınırlama ile ve küçük organizmalar veya örnekler için dikte yavaş örnekleme oranı farkında olmalıdır. Yavaş örnekleme hızının hemen sonuç, bir tek numune Sessi sırasında toplanan suyun sınırlı hacmiüzerinde. Bu düşük hacimli bu numuneler ile çalıştırılabilir analiz ve çoğaltır sayısını sınırlamak olacak ve böylece aynı zamanda bu nüfus elde edilebilir bilgiler sınırlayacaktır.
Tüp değiştirmesi kolaylıkla lekeli olabilir ve örnekleme iptal veya yeniden, bir dalgıç sabit nöbet tutan şartıyla yapılabilir. Buna karşılık, örnekleme sırasında pompalama bırakma her zaman tespit etmek kolay değildir. Bu doğru değil sadece sünger, aynı zamanda gömlekliler, kabuklular ve polychaetesi için. Aslında, yaygın inanışın aksine, bir ascidian veya çift kabuklu pompalama durdu hangi olaylar sifon geometri (Yahel, yayınlanmamış veri) görünür hiçbir değişiklik ile belgelenmiştir. Ayrıca, bazı durumlarda, gömlekliler hiçbir örgü salgılanması ile aktif pompalama (yani, hiçbir filtreleme gerçekleşiyor olduğu) koruyabilirsiniz.
örnekleme oranını kontrol çok önemlidir. Bu bağlamda VacuSIP deney hayvanları, relativ, özellikle de diğer yöntemlere göre daha daely küçük ya da onlar yavaş yavaş pompa zaman. Enjektörler 2 kontrol etmek oldukça zordur. NO 3 - - NH Örneğin, Perea-Blázquez ve arkadaşları (2012a) 40 NO 2 (birkaç ılıman sünger türlerinin tarafından üfledi suyu örnek bir şırınga kullanılır ve şaşırtıcı belirli besinlerin yenmesi / atılımının genel bir model bulamadık 4 + PO 4 3-, SiO 4). açık bir deseni olmaması olasılığı nedeniyle Şırıngayı kullanmak için, ortam su ile dışarı verilen örneklerin kirlenmesi bir sonucudur. Heterotrofik bakteri 40 ± 14 ve% Synechococcus sp 54 ±% 18: Kirlilik kendi sünger Perea-Blázquez ve arkadaşları (2012b) 41 tarafından bildirilen pico plankton son derece düşük tutma verimliliği bellidir. Karşılaştırma için, VacuSIP, Mueller diğ. (2014) 21 heterotrofik bakteri giderme verimini bildirdiSiphonodictyon sp 72 ± 15%. ve Cliona delitrix 87 ±% 10.
Örnek kalitesinden emin ve ortam su hiçbir kirlenme meydana emin olmak için, şiddetle ilk flow sitometri kullanılarak pico ve nano plankton örnekleri analiz etmek önerilir. Bu, hızlı, güvenilir ve ucuz analiz numunesi kalitesinin derhal bilgi verecektir. Böyle Synechococcus sp gibi bazı av takson için çok yaygındır. sünger ascidian% 90 verim 14,42 yakın en temizlenmelidir. Bu kriter anlamlı sapmalar kirlenme (Şekil 8) meydana gelmiş olabileceğini düşündürmektedir.
güvenilir ve temiz numune alma, emin deney tasarımı tatmin yedi basit kurallar yapın: (1) (oran tahminleri pompalama dahil) bir ön anket yapmak ve iyi işyerini hazırlamak; (2) çalışılan hayvanlar biliyorum; (3) çalışılan örnek iyi tanımlanmış excurrent diyafram a sahip olduğunu doğrulamaknd ulaşabileceğiniz bir konuma; (4) çalışılan örnek önce ve her bir örnek toplandıktan sonra pompalıyor emin olun; (5) hafifçe excurrent açıklığı (Şekil 1) içinde solunan suyun toplanması için tüp yerleştirmek; (6) kullanmak örnekleme hızı
Bu basit kuralları ardından, VacuSIP sistemi nasıl aktif süspansiyon besleyiciler süreç partikül ölçüm pratik ve güvenilir bir yöntem ve çevresinde farklı ekosistemlerde filtre besleyiciler fonksiyonel rolünü değerlendirmek için kullanılabilecek doğru ve karşılaştırılabilir tahminler sağlayan doğal şartlarda, içinde çözünmüş bileşikler sunmaktadır Dünya.
The authors have nothing to disclose.
Biz saha içinde yaptığı yardım için Manel Bolivar teşekkür ederiz. Biz araştırma ve örnekleme izinleri verdikleri destekten dolayı "Parc Natural del Montgri les Illes Medler i el Baix Ter" minnettarız. sualtı manipülatör Ayelet Dadon-Pilosof tarafından tasarlanan ve Sn Pilosof tarafından imal edilmiştir. Bu eser İspanyol Hükümeti projesi CSI-Mercan [RC ve MR hibe numarası CGL2013-43106-R] tarafından ve TM "Ministerio de Educación, Kültür y Deporte (• MECD)" bir FPU burs ile desteklenmiştir. Bu G. Yahel için Katalan Hükümeti [hibe sayısı 2014SGR1029] ve ISF hibe 1280-1213 ve BSF hibe 2012089 tarafından finanse edilen bir Deniz Biyojeokimya katkısı ve Küresel Değişim Araştırma grubudur.
Name | Company | Catalog Number | Comments |
GorillaPod, Original | Joby | GP000001 | flexible portable tripod |
Flangeless Ferrule | IDEX Health & Science | P-200X | 1/16" in Blue/pk |
Male Nut | IDEX Health & Science | P-205X | 1/16" in Green/10 pk |
Female to Female Luer | IDEX Health & Science | P-658 | |
Female-Male Luer | IDEX Health & Science | P-655 | |
Peek Tubing (254 µm ID) | IDEX Health & Science | 1531 | 1/16" OD x 0.01 in ID x 5 ft length. Alternative ID can be used. |
Two component resin epoxy | IVEGOR | 9257 | Mix well the two component resin before use |
(TOC) EPA Vials | Cole -Parmer | 03756-20 | 40 ml glass vials. Manufactured also by Thomas Scientific (ref. number 9711F09). |
HDPE Vials | Wheaton | 986701 (E78620) | 20 ml high-density polyethylene vials |
Vacuette Z no additive | Greiner bio-one | 455001 | pre-vacuum by the manufacturer |
Septum Sample Bottles | Thomas Scientific | 1755C01 | 250 ml glass bottles |
Septum Cap 1 | Wheaton | W240844SP (E7865R) | 22-400 for HDPE vials |
Septum Cap 2 | Wheaton | W240846 (1078-5553) | 24-400 for glass vials and bottles. Also manufactured by Thermo Scientific National (ref. 03-377-42). |
In-line stainless steel Swinney Filter holders | Pall | 516-9067 | 13 mm of diameter |
PTFE Seal Washer | Pall | 516-8064 | ring for stainless steel filter holders |
TCLP Glass Filters | Pall | 516-9126 | binder-free glass fiber filters, 13 mm of diameter, pore size 0.7 µm |
Polycarbonate Filter Holders | Cole -Parmer | 17295 | 13 mm of diameter |
Isopore Membrane Filters | Millipore | GTTP01300 | 13 mm of diameter, pore size 0.2 µm |
Contrad 70 Solution | Decon Labs | 1002 | highly soluble basic mix of anionic and non-ionic surfactant solution |
Sterile Syringe Filters | VWR International Eurolab S.L. | 514-0061P | 25 mm of diameter , pore size 0.2 µm |
Fluorescein | Sigma-Aldrich | (old ref.28802) 46955-100G | 100 g |
Holdex, disposable,sterile | Greiner bio-one | 450263 | sterile, single-use tube holder with off-center luer for Vacuette |
Sterile Needles | IcoGammaPlus | 5160 | 0.7 mm x 30 mm |
Cryovials Nalgene | Nalgene | V5007(Cat. No.5000-0020) | 2 ml |
Cryobox carton | Rubilabor | M-600 | 145x145x55 mm p/microtube 1.5 ml |
Orthophosphoric Acid | Sigma | 79617 or Alternatively use Ultra-Pure Hydrochloric acid, final concertation 0.1% | |
Paraformaldehyde | Sigma | P6148 | 500 g |
Glutaraldehyde | Merck | 8,206,031,000 | 25%, 1 L |
Hand Vacuum Pump | Bürkle | 5620-2181 or Alternatively use standard laboratory vacuum pump |
Bu JoVE makalesinin metnini veya resimlerini yeniden kullanma izni talebi
Izin talebiThis article has been published
Video Coming Soon
JoVE Hakkında
Telif Hakkı © 2020 MyJove Corporation. Tüm hakları saklıdır