Method Article
* Эти авторы внесли равный вклад
Протокол описывает выделение кишечных микробных EV от чувствительных к соли крыс, которых кормили HSD с использованием центрифугирования градиента плотности. ВВ характеризовали с помощью отслеживания наночастиц, анализов TEM, LPS/BCA и секвенирования 16S рРНК для анализа размера, морфологии, состава и происхождения микробиоты.
Высокое потребление соли является основным фактором риска развития гипертонии, и ее основной механизм может быть тесно связан с внеклеточными везикулами (ВВ), секретируемыми микробиотой кишечника. Эти ВВ, вырабатываемые микробиотой кишечника, содержат различные биологически активные компоненты, которые могут играть решающую роль в развитии гипертонии, вызванной диетой с высоким содержанием соли (HSD). Чтобы исследовать этот механизм, мы разработали эффективный метод экстракции, основанный на центрифугировании с градиентом плотности, для выделения ВВ из микробиоты кишечника чувствительных к соли крыс, которых кормили HSD. С помощью анализа размера частиц, просвечивающей электронной микроскопии (ПЭМ) и обнаружения липополисахаридов (ЛПС) мы определили градиентное распределение ВВ кишечной микробиоты и добились точной экстракции. Кроме того, секвенирование гена 16S рРНК было использовано для анализа происхождения и различий в составе ВВ между нормальной группой и группой HSD, что выявило влияние высокого потребления соли на генетические характеристики ВВ кишечной микробиоты. Это исследование предоставляет ценные инструменты и научные знания о механизмах микробиоты кишечника, лежащих в основе солевой гипертензии, и предлагает новые перспективы для профилактики и лечения связанных с ней заболеваний.
Микробиота кишечника, также известная как микрофлора микробиоты кишечника или микроэкология кишечника, представляет собой комплекс из десятков тысяч микроорганизмов, расположенных в биологическом желудочно-кишечном тракте и играющих важнейшую роль в поддержании здоровья человека1. В последние годы в ходе дальнейших исследований было установлено, что микробиота кишечника может продуцировать внеклеточные везикулы (ВВ)2. ВВ представляют собой небольшие везикулы, выделяемые клетками, которые переносят различные молекулы в клетке, такие как белки, нуклеиновые кислоты и липиды 3,4. Они могут взаимодействовать с другими микробами5, эпителиальными клетками кишечника и даже отдаленными тканями и органами6, тем самым влияя на здоровье человеческого организма 7,8. Существует тесная связь между ВВ, вырабатываемыми этой кишечной микробиотой, и рационом питания9.
ВВ, вырабатываемые кишечной микробиотой, могут быть важными факторами, с помощью которых диета с высоким содержанием соли (HSD) влияет на здоровье организма. HSD не только напрямую нарушает баланс кишечноймикробиоты10, что приводит к значительному сокращению количества полезных бактерий (таких как Lactobacillus)11, но и способствует размножению вредных бактерий (таких как Bacteroides и т. д.)12. Этот дисбаланс снижает барьерную функцию кишечника и увеличивает риск воспаления кишечника. Кроме того, HSD также влияет на кислотно-щелочной баланс и всасывание питательных веществ в кишечнике, изменяя метаболическую активность13 кишечной микробиоты, например, снижая выработку короткоцепочечных жирных кислот14,15 с множественными физиологическими функциями.
Эти изменения не только влияют на здоровье кишечника, но и могут косвенно регулировать производство и высвобождение ВВ и изменять состав и функцию ВВ. Среда с высоким содержанием соли может влиять на нормальные физиологические функции кишечных клеток, включая высвобождение и транспорт ВВ, тем самым нарушая роль ВВ в передаче межклеточной информации и иммунной регуляции. В то же время воспаление кишечника может способствовать развитию различных ВВ с особыми функциями16 и распространяться по всему организму через ось кишечник-орган и другими путями 17,18, что тесно связано с возникновением и развитием гипертонической болезни19,20, сердечно-сосудистых21 и цереброваскулярных заболеваний22,23, ожирения24,25, сахарного диабета26 и другие хронические заболевания.
Таким образом, общая цель данного исследования заключалась в разработке эффективного и надежного метода извлечения ВВ из микробиоты кишечника чувствительных к соли крыс, которых кормили HSD, и систематическом изучении их физических свойств, состава и функций. В связи с особенностями значительного повышения артериального давления после диеты с высоким содержанием соли, были отобраны чувствительные к соли крысы и выявлено влияние HSD на микробиоту кишечника EV путем построения эффективного метода экстракции. Метод был основан на центрифугировании с градиентом плотности и сочетал в себе различные методы динамической идентификации, такие как определение размера частиц, измерение LPS/BCA, просвечивающая электронная микроскопия и протеомный анализ. Протокол направлен на выявление влияния HSD на микробиоту кишечника EV и его механизмы при сердечно-сосудистых заболеваниях. Обладая высокой эффективностью, воспроизводимостью и широкой применимостью, этот подход не только является важным инструментом для изучения механизма ВВ кишечной микробиоты при солевой гипертензии, но и закладывает теоретическую основу для разработки стратегий вмешательства в заболевания на основе ВВ. Благодаря этому исследованию мы надеемся открыть новые возможности для профилактики и лечения сердечно-сосудистых заболеваний, таких как гипертония27,28.
Это экспериментальное исследование на животных соответствует соответствующим этическим принципам и международным стандартам. Исследования с участием животных были одобрены Комитетом по благополучию и этике лабораторных животных Университета китайской медицины в Чэнду (учреждение: Университет китайской медицины в Чэнду; номер протокола: 2018-21).
1. Подготовка животных и режим питания
2. Мониторинг артериального давления
ПРИМЕЧАНИЕ: Плетизмография хвостовой манжеты использовалась в качестве неинвазивного метода измерения артериального давления, а измерение объемного давления (VPR) использовалось при измерении артериального давления по объему хвостовой крови.
3. Извлечение электромобилей
4. Идентификация электромобилей
Концентрации ВВ определяли в различных фракциях (рис. 2А). Экспериментальные результаты показали, что концентрация EV демонстрирует типичную нормальную картину распределения в серии решений градиента плотности (рис. 2B). В частности, во фракции 9 концентрация EV достигла наивысшей точки (3,85 x 109), что позволяет предположить, что основная доля распределения EV может составлять 936.
Для определения содержания белка использовались наборы ВСА, позволяющие оценить содержание белка в разных фракциях (рисунок 2В). В этом методе содержание белка во фракции 9 составляло 0,417 мкг/л, что еще раз демонстрирует распределение ВВ. Поскольку ЛПС является уникальным компонентом грамотрицательных бактерий37,38, для определения экспрессии ЛПС также использовались наборы для детектирования эндотоксинов (рис. 2D) с целью оценки распределения ВВ в различных фракциях. Результаты эксперимента показали, что в фракциях 9 и 10 экспрессия ЛПС была достоверно выше, чем у других фракций (поглощение для фракции 9 = 0,8086, для фракции 10 = 0,8515), а его распределение показало нормальное распределение, что доказало, что ВВ в основном распределены во фракции 9. Относительно большие количества белка во фракции 9 также наблюдались при гель-электрофорезе SDS-PAGE ВВ, выделенных из различных фракций (рис. 2E).
В этом исследовании EV изучались с помощью просвечивающей электронной микроскопии (TEM; Рисунок 2F). С помощью визуализации с высоким разрешением, полученной с помощью ПЭМ, удалось четко визуализировать морфологическую структуру ВВ, в которой представлены круглые мембраноподобные структуры, что имеет решающее значение для понимания биологии ВВ.
Изменения артериального давления определяли в группах НСД и НСД через 2 месяца выращивания в НСД и НСД крыс. Мы видим, что САД (рис. 3A), ДАД (рис. 3B) и МБП (рис. 3C) были значительно увеличены в группе HSD, что указывает на то, что модель гипертензии в этом исследовании была успешно построена.
В этом исследовании концентрация ВВ была обнаружена в разных группах (рис. 3D), и результаты показали, что концентрация ВВ в группе HSD была значительно выше, чем у крыс в группе NSD. Это говорит о том, что HSD влияет на уровень ВВ, возможно, из-за изменений в составе микробиоты кишечника, из которой происходят ВВ.
Затем в этом исследовании был измерен размер частиц EV. Результаты измерений показывают, что размер частиц EV преимущественно составляет около 60 нм (рисунок 3E), а размер частиц группы HSD немного ниже, чем у группы NSD. Измеренные данные предоставляют важную информацию для оценки распределения по размерам и однородности электромобилей, облегчая последующий экспериментальный дизайн и разработку приложений.
Затем, в этом исследовании, была изучена величина экспрессии ЛПС ВВ в группе HSD и группе NSD (рис. 3F). Результаты показали, что экспрессия ЛПС у ВВ в группе HSD также была значительно выше, чем в группе NSD. Это может быть связано с увеличением количества грамотрицательных бактерий в кишечной микробиоте, полученной из экзовезикул, или с более высокой концентрацией ВВ в группе HSD, чем в группе NSD.
Чтобы еще больше подтвердить различия между ВВ в группах HSD и NSD, в этом исследовании изучалась полученная микробиота кишечника и проводилось секвенирование 16S рРНК образцов ВВ из групп NSD и HSD для дальнейшего уточнения влияния HSD на ВВ в микробиоте кишечника у мышей.
Анализ α-разнообразия показал, что разнообразие кишечной микробиоты было значительно снижено в группе HSD, при этом снизились индексы Шеннона и ACE (рис. 4A). β-Анализ разнообразия, основанный на PCoA (рис. 4B), различал микробные фенотипы между группами на уровне ASV. Вмешательство с высоким содержанием соли частично обратило вспять фенотипические изменения микрофлоры кишечника и обнаружило значимые различия в составе микробиоты кишечника, полученной из внешних везикул, между группами (p = 0,001).
После фильтрации бактерий с низкой численностью и стандартизации данных, таксономическая аннотация идентифицировала различные диапазоны микробных сообществ в образцах. Микробиота кишечника, полученная методом экзовезикул, в основном состояла из протеобактерий (93,19%), Firmicutes (4,57%) и Bacteroidota (1,19%; Рисунок 4С). В группе HSD значительно увеличивалось количество наружных пузырьков Firmicutes (рисунок 4D). На уровне рода результаты показали, что такие роды, как Nevskia и Acinetobacter , были более многочисленны в группе NSD, в то время как Delftia, Burkholderia_Ca и Clostridium_sen были более многочисленны в группе HSD (рис. 4E). Кроме того, в этом исследовании также использовались тепловые карты, чтобы показать различия в ВВ кишечной микробиоты между группой HSD и группой NSD (рис. 4F). После вмешательства с высоким содержанием соли численность некоторых бактерий, Delftia и Burkholderia_Ca, значительно увеличилась, а Nevskia и Acinetobacter значительно уменьшилась (рис. 4G). В заключение следует отметить, что вмешательство с высоким содержанием соли значительно изменило разницу в продукции ВВ, полученных из кишечной микрофлоры, в основном потому, что оно изменило распределение их родительских бактерий, а основными характеристиками были уменьшение разнообразия, изменения в равновесной структуре и изменения в численности различных бактерий.
Рисунок 1: Экстракция и характеристика наружных везикул, полученных из кишечных микробов. (A) Технологическая схема экстракции наружных везикул. (В) Характеристика наружных пузырьков. Пожалуйста, нажмите здесь, чтобы просмотреть увеличенную версию этой цифры.
Рисунок 2: Базовая характеристика EV и анализ локального градиента плотности. (A) Измерения концентрации экстравезикул и размера частиц с различными градиентами плотности (нм; частицы/мл). (B) Сравнение концентраций наружных пузырьков раствора по градиенту плотности 3 - 16 (частиц/мл). (C) Определение содержания белка в растворе на градиенте плотности 6-12 с помощью набора BCA (μг/мл). (D) Решение для измерения экспрессии ЛПС по градиенту плотности 7-11 с помощью набора для детекции эндотоксинов (Abs). (Д) Растворы с градиентом плотности 6 - 12 подвергали гель-электрофорезу SDS-PAGE и окрашивали бриллиантовым синим цветом Кумасси. (F) TEM: Масштабная линейка составляет 100 нм; Отдельные пузырьки показаны на изображении. Пожалуйста, нажмите здесь, чтобы просмотреть увеличенную версию этой цифры.
Рисунок 3: Анализ изменений артериального давления и ВВ при различных диетах. а) СБП; (B) DBP; (C) ПМБ; (D) Сравнение концентраций внешних везикул в группах HSD и NSD; (E) Сравнение размеров наружных везикул в группах HSD и NSD. (F) ЛПС в пробах НСД и НСД, определяемых методом спектрофотометрии. *p < 0,05, ** p < 0,01, *** p < 0,001, а NS означает отсутствие значимости, t-критерий. Пожалуйста, нажмите здесь, чтобы просмотреть увеличенную версию этой цифры.
Рисунок 4: Анализ теста на 16s рРНК при различных диетах. (A) Анализ разнообразия α; (В) Анализ главных координат; (C) обилие микробиоты кишечника на уровне типов; (D) изменения в бактериях на уровне типов; (E) Результат LEfSe; (F) анализ кластерной тепловой карты на основе дифференциальных родов бактерий; (G) Изменения в бактериях рода. *p < 0,05, ** p < 0,01, *** p < 0,001, а NS означает отсутствие значимости, t-критерий. Пожалуйста, нажмите здесь, чтобы просмотреть увеличенную версию этой цифры.
В этом исследовании мы сосредоточились на ВВ микробиоты кишечника у чувствительных к соли крыс на HSD и добились ряда ключевых достижений. Во-первых, был успешно разработан эффективный метод экстракции, основанный на центрифугировании с градиентом плотности, для выделения ВВ из чувствительной к соли микробиоты кишечника крыс на HSD, и большинство компонентов, не относящихся к ВВ, были выделены с помощью тщательного, стандартизированного экспериментального процесса на животных и обработки образцов. Метод центрифугирования с использованием градиента плотности для экстракции EVs является высокоэффективным и воспроизводимым, лучше, чем обычный метод ультрацентрифугирования, и может лучше сохранить целостность и функциональность EVs, обеспечивая качество образца и осуществимость исследования.
Во-вторых, электромобили были всесторонне идентифицированы с помощью различных динамических технологий: определение размера и концентрации частиц указывает на то, что электромобили имеют определенное распределение по размерам; Измерения ЛПС и БЦА позволяют количественно оценить содержание белка и экспрессию ЛПС в ВВ; ПЭМ ясно показывает морфологическую структуру электромобилей; А характеристики белка определяют белковый спектр. Эти результаты идентификации всесторонне раскрывают физические и биохимические свойства электромобилей, обеспечивая надежную информационную поддержку для последующих исследований.
Кроме того, технология секвенирования гена 16S рРНК с использованием углубленного анализа различий между происхождением и составом нормальных ВВ и ВВ HSD, а также анализа разнообразия α и анализа разнообразия β показала, что высокое потребление соли значительно влияет на генетические характеристики кишечных микробных ВВ, включая структуру микробного сообщества, видовое богатство и разнообразие, чтобы более комплексно разрешить влияние диеты с высоким содержанием соли на ВВ кишечной микробиоты. Предоставляет несколько уровней доказательств для механистических исследований.
Несмотря на то, что этот метод имеет некоторые преимущества по сравнению с обычным методом центрифугирования с превышением скорости с точки зрения восстановления экзосом и целостности, все же существуют некоторые ограничения, такие как высокий спрос на образцы и сложность отличия хозяина от источника микрофлоры. Тем не менее, по сравнению с существующими методами, центрифугирование с градиентом плотности имеет уникальные преимущества в поддержании функциональной целостности экзосом, что обеспечивает надежную техническую поддержку для дальнейшего исследования механизма, с помощью которого диета с высоким содержанием соли влияет на кровяное давление хозяина через кишечную флору. Более того, для нечеткой градиентной стратификации, возникшей во время эксперимента, мы также улучшили ее, увеличив время центрифугирования или заменив ротор с более высокой производительностью.
В будущем мы сможем продолжить изучение механизма развития ВВ кишечной микробиоты при гипертонии, вызванной диетой с высоким содержанием соли, особенно ее взаимодействие с иммунной системой, такой как провоспалительные Т-клетки 39,40; или использовать продукты растительного происхождения для вмешательства в микробиоту кишечникаEVs 41,42, дальнейшего вмешательства в заболевания и изучения их роли в регулировании метаболизма хозяина и иммунного ответа.
В заключение следует отметить, что данное исследование не только предоставляет важный инструмент для изучения механизма солевой гипертензии кишечной микробиоты через модель чувствительных к соли крыс, углубляет понимание взаимосвязи между HSD, кишечной микробиотой и ВВ, а также открывает новый способ профилактики и лечения сердечно-сосудистых заболеваний, таких как гипертония, обеспечивает уникальную перспективу для изучения взаимодействия диеты, микробов и хозяина.
Авторы заявляют, что у них нет известных конкурирующих финансовых интересов или личных отношений, которые могли бы повлиять на работу, описанную в этой статье.
Эта работа была поддержана Национальным фондом естественных наук Китая (82205240), Фондом естественных наук провинции Сычуань (2025ZNSFSC1836) и Клиническим базовым проектом Ортопедической больницы провинции Сычуань (PY202414).
Name | Company | Catalog Number | Comments |
Essential Supplies | |||
Centrifugal Filter (10nkDa 2 mL) | Millipore | UFC903096 | |
Centrifuge Tude(50 mL) | BKMAN | 20220404 | |
Centrifuge Tudes | BECKMAN COULTER | Z30815SCA | |
Vacuum Filtration System | Biosharp | 24902581 | |
Reagents | |||
Chromogenic LAL Endotoxin Assay Kit | Beyotime | 022124240705 | |
Coomassie Blue Fast Staining Solution | Beyotime | Z972241010 | |
EDTA | Damas-beta | P3117308 | |
Enhanced BCA Protein Assay Kit | Beyotime | A006241112 | |
Ethanol | KESH | ||
HCl | |||
OptiPrep (60% wt/vol, iodixanol) | Serumwerk | 00124 | |
PBS | Labshark | 130114005 | |
phosphotungstic acid | RUIXIN | ||
Sucrose | Damas-beta | P1917057 | |
Tris (VWR) | Damas-beta | P3061764 | |
Trypan blue staining solution (0.4%) | Beyotime | BD07242904 | |
Equipment | |||
Absorbance Microplate Reader | SpectraMax | ABP01690 | |
Biomicroscope | Motic | BA210Digital | |
Desk centrifuge | Cence | CHT210R | |
Desktop high-speed micro centrifuge | DLAB | D3024 | |
Fixed Angle Aluminum Rotor + 500 mL Centrifugal Cup | Cence | ||
High precision electronic balance | SKR | BN-200 | |
Laminar flow cabinet | Nantong Hunan Scientific Instrument Co., Ltd. | SW-CJ-2FDS | |
SW 32.1 Ti Swing bucket turn+ SW 32.1 Ti Rotor bucket | BECKMAN COULTER | ||
Transmission electron microscope | JEOL | JEM-1400FLASH | |
Tube rotator | |||
Ultracentrifuge | BECKMAN COULTER | Optima XE-100 | |
Ultra-pure water system | ULPHW | UPR-II-15TNZ | |
Water-Cieculation Multifunction Vacuum Pump | Qiang Qiang | SHZ-D(III) |
Запросить разрешение на использование текста или рисунков этого JoVE статьи
Запросить разрешениеThis article has been published
Video Coming Soon
Авторские права © 2025 MyJoVE Corporation. Все права защищены