Method Article
Для малых видов хиральным, кулона взрыва Imaging предоставляет новый подход для определения handedness отдельных молекул.
Эта статья показывает, как COLTRIMS (холодная целевой Recoil Ион импульс спектроскопия) или метод «реакция микроскопа» может использоваться для различения энантиомеров (стереоизомеры) видов простых хиральная на уровне отдельных молекул. В этом подходе газообразных молекулярной jet образца расширяется в вакуумной камере и пересекается с (fs) Фемтосекундных лазерных импульсов. Высокая интенсивность импульсов приводит к быстрой несколько ионизации, разжигая так называемого взрыва кулона, которая производит несколько фрагментов катионные (положительно заряженные). Электростатическое поле руководства этих катионов на время и позиция чувствительных детекторов. Же время полета масс-спектрометр, время прибытия каждого иона дает информацию о его массы. Как положительное сальдо электростатическое поле корректируется таким образом, что направление выбросов и кинетической энергии после фрагментации привести к вариации в время полета и в позиции удара на детектор.
Каждый Ион воздействия создает электронный сигнал детектора; Этот сигнал обрабатывается путем высокочастотной электроники и записанная на событие с помощью компьютера. Зарегистрированные данные соответствуют раз влияние и позиции. С этими данными могут быть рассчитаны энергии и выбросов направление каждого фрагмента. Эти значения связаны с структурных свойств молекулы под следствием, т.е. до длины Бонд и относительных позиций атомов, позволяющий определить молекул, молекулы handedness простой хиральная видов и другие изомерных функции.
Хиральность — это функция нашей природы, что увлекательный исследователи уже более 150 лет. В 19го века, Пастер, Вант Гоффа и другие обнаружили, что молекулы могут возникать в двух структур зеркальное изображение, которые не являются супер навязываемых - как наши левой и правой руки. Это свойство было названо «хиральная», от греческого слова «рука».
До настоящего времени обнаружено никакой разницы в термодинамических свойств или уровней энергии и для левши форм (два «энантиомеров»). Чтобы проанализировать handedness данного образца и разделения энантиомеров, взаимодействие с другими хиральные молекулы может использоваться, как например в различных chromatographical подходов. 1 Chiroptical (колебательных) круговой дихроизма, CD (V) и оптических вращательное дисперсии, Орд, регулярно используются различать энантиомеров. 2
Когда дело доходит до определения микроскопические структуры, эти методы требуют дополнительной информации, например от квантово химических расчетов. Только техника, которая широко признается непосредственно определить абсолютную конфигурацию является аномальным дифракции рентгеновских лучей. 3
Недавно было показано, что абсолютное конфигурацию хиральных видов простых может определяться кулона взрыва Imaging. 4 , 5 в этом подходе, молекул в газовой фазе умножить ионизированные так что оставшихся ядер сильно отталкивают друг друга. Это отталкивание приводит к быстрой фрагментации («взрыв») молекул. Направление и масштабы соотносятся импульсов фрагмент в структуре молекулы – для малых молекул, импульс направления соответствуют удивительно хорошо Бонд осей. Кулоновского взрыва для определения молекулярной структуры были впервые с помощью молекулярных ионных пучков из ускорителя. 6 этот луч фольга техника имеет недавно также применяется для хиральная признание. 7
Вопреки аномальных рентгеновской дифракции образец не должен быть кристаллический, но в газовой фазе. Это делает кулона взрыва подход идеально подходит для неустойчивых видов и таким образом дополняют дифракции рентгеновских лучей. В некоторых случаях преобладающая рука может определяться даже для отдельных молекул.
На практике реалистичный молекулярной структуры оказалось трудно даже производные метана, например молекул с центральным углерода и различных фторсодержащими заместителями. Это объясняется тот факт, что взаимодействие между фрагменты точно не Coulombic и что не все облигации разорвать одновременно. Для того чтобы получить стереохимические информацию, особенно в том, чтобы различать энантиомеров, Эта реконструкция к счастью не обязательна. Вместо этого импульса векторов различных фрагментов может быть соотнесена приносить количество, которое отличается для молекул, и для левши. Чтобы получить надежные результаты, по крайней мере четыре фрагмента импульсы должны быть записаны.
Для того чтобы измерить этот импульс информации, фрагменты из одного – и только один – молекулярного распада должны быть обнаружены в шаге однократное измерение. Это условие обычно называют «совпадающих обнаружения». Кроме того направления выбросов должны быть проанализированы, что суммы на практике для записи времени и положение фрагмента воздействие в режиме списка формат данных.
В атомной и молекулярной физики были разработаны методы, реализующие этот подход измерения с использованием электростатического спектрометры для массового разделения и чувствительных к времени и позиции многих хит детекторов. Наиболее ярким примером является установка COLTRIMS (холодная целевой Recoil Ион импульс спектроскопия)-также известен как реакция микроскопа. 8 , 9 эскиз для такого рода эксперимент приводится на рисунке 1. Отличие от стандартного COLTRIMS, который может записывать электронов также кулона взрыва Imaging требует только Ион детектора.
Спектрометр и детектор монтируются под ультра-высокого вакуума (< 1 x 10-9 hPa) чтобы избежать создания ионов из остаточного газа. Одной молекулы образца предоставляются через газообразных свободной молекулярной струи, созданные сверхзвуковой расширения: силу давления пара, молекулы расширить через малую насадку (диаметром около 50 мкм) в вакууме. Эта часть эксперимента, источник палата, отделена от взаимодействия региона обычно два скиммеров и дифференцированно перекачиваемой этапов. Дополнительных дифференциально накачкой секции расположен позади взаимодействия региона дамп струи газовой и таким образом избежать фон газа в регионе взаимодействия.
Ионизирующее излучение пересекается с молекулярной струи под 90°. Большинство лабораторий в настоящее время используют Фемтосекундных лазерных импульсов, хотя синхротронного излучения, быстрых ионов или электронов воздействия возможных «снарядов» чтобы побудить кулона взрыва.
Следующий протокол делает предположение, что запуск программы установки для совмещения изображений ионов и фемтосекундный лазер доступны в лаборатории. Пика интенсивности, необходимо побудить кулона взрыв на четыре или даже пять фрагментов должна быть порядка 6 x 1014 Вт/см2. Чтобы избежать чрезвычайно длинные измерений, частота повторения лазера должно быть 10 кГц, или больше. Это важно, потому что, с одной стороны, совпадающих обнаружения только может быть установлено, если вероятность фрагментации в фокусе лазерного значительно ниже 1 доллара лазерного импульса (в идеале не более 10%). Общая фрагментация скорость, с другой стороны, должна быть не ниже, чем в нескольких кГц потому, что доля соответствующих multifragmentation путей, как правило, менее чем в 10-4. Как обнадеживающий факт, следует отметить, что в принципе уже достаточно для определения конфигурации образца enantiopure событие одного фрагментации, и что обнаружение нескольких сотен позволяет определить обилие энантиомеров в Образец энантиомерные неизвестного состава.
осторожность: Убедитесь в том быть в курсе всех возможных опасностей, связанных с эксперимента и в лаборатории. Описанная ниже процедура включает в себя IV класса лазеров, высокого напряжения и вакуума. Консультироваться паспорт безопасности материала (MSDS) для видов расследоваться.
1. Подготовка
2. Переходя на спектрометр и детекторы
Примечание: Эта часть протокола слегка зависит от фактической реализации системы спектрометр и детектор. Здесь описание действителен для стандартной установки COLTRIMS с гексагональной задержки линии детектор (HEX75). 10 в этой реализации, детектор имеет 7 выходных каналов: один для микроканалов пластин (MCP) и два для каждого из трех слоев анода.
3. Пример доставки
4. Измерение
Примечание: следующие шаги выполняются в программе приобретения данных.
5. Анализ данных
Примечание: анализ данных в эксперименте кулона взрыва Imaging представляет собой комплекс, но награждение задача, потому что многие параметры могут быть доработаны после эксперимента и множество корреляции между измеряемой импульсы могут быть изучены. После эксперимента в программное обеспечение для анализа данных обычно выполняются все следующие шаги.
В этой части мы показываем результаты, полученные для halomethanes. Эти виды являются идеальными для доказательства принцип экспериментов из-за их простоты и высокое давление паров. В то же время более сложных видов галотан исследовано с помощью единого софт x-ray фотоны из источника синхротронного навести множественные ионизации. 14
CHBrClF
Bromochlorofluoromethane (CHBrClF) является хрестоматийным примером для хиральные молекулы с атомом углерода stereogenic. Он также является идеальным кандидатом для кулона взрыва изображений из-за своей простой структурой и высокое давление паров (около 600 hPa при комнатной температуре). К сожалению этот вид не доступен коммерчески; для эксперимента, представленные здесь рацемические смеси был синтезирован реакции CHBr2Cl с2 HgF согласно ссылка15. Enantio обогащенный образцы трудно получить в количествах, необходимых тем, что до настоящего времени были получены только результаты для рацематы.
Для получения результатов, представленных здесь образец охлаждался до приблизительно 240 K для получения соответствующей целевой плотности с заданным сопла (10% вероятности ионизации в импульсе). Пика интенсивности лазера составляла 6 x 1014 Вт/см2. Измерения на 100 кГц частота повторения лазерных принял 11 h.
Для того, чтобы отличить R и S-энантиомеров, нормализованных тройной продукт рассчитывается от импульса векторов трех галогенов фтор, хлор и бром. Геометрически это количество может интерпретироваться как косинус угла между импульса фтора и плоскостью хлора и брома импульсов.
Рисунок 3 показывает cosθ для изотопов CH79Br35ClF, вместе с геометрическим определением. Две вершины ясно видны, указывающее энантиомеров. Положение вершины согласуется с классической молекулярной динамики моделирования. Как почти не фон присутствует, назначение Преобладающая рука работает на уровне одной молекулы.
CHBrCl2
Хиральность2 CHBrCl возникает, только если в той же молекулы присутствуют изотопы 35Cl и 37Cl. Таким образом, образец изобилием природных изотопов содержит хиральные и ахиральных молекул. Здесь возникают две дополнительные осложнения: во-первых, время полета распределений изотопов хлора и брома пересекаются соответственно из-за небольшой массы разница. Это особенно актуально для хлора, как определение handedness зависит от правильного назначения изотопов. Во-вторых хиральные видов CH79Br35Cl37Cl имеет (в пределах точности установки) той же общей массы как ахиральных видов CH в81Br35Cl2. Таким образом, расследование этого вида может рассматриваться как тест для метода.
С помощью спектрометра используется (спектрометр длина s = 60,5 мм, прочность электрического поля E = 57.1 V/см), данные для хиральная изотопов CH79Br35Cl37Cl может быть выбран через общий импульс, используя алгоритм, предложенные ссылки16 назначить который ударяет принадлежит к какой изотопа.
Геометрических соображений приводят к выводу, что может быть ориентаций молекул в пространстве, где два Изотопы хлора у того же времени рейса; в этом случае они не могут быть уважаемым в принципе. Процедура, чтобы разобраться в этих событиях был описан в дополнительных материалов ссылка4. В результате конфигурации даже гетерогенны хиральные молекулы могут определяться с высокой надежностью.
Рисунок 1 : Представление настройки COLTRIMS. Молекулы настройки через сопло и пройти через пару скиммеры. В зале взаимодействия лазерных импульсов крест с молекулярной струи под 90°. Ионы руководствуется электрического поля спектрометра для детектора (вверху). Для лучшей видимости отображаются не все спектрометр пластины. Оставшиеся молекулы сбрасываются в дифференциально перекачиваемой секции (Джет дамп) сохранить фон давление в регионе взаимодействия как можно ниже. Рисунок изменен17 ссылка с разрешения G. Kastirke. Пожалуйста, нажмите здесь, чтобы посмотреть большую версию этой фигуры.
Рисунок 2 : Четыре частица совпадение спектра. Эта Гистограмма является расширением массового спектра время полета до четырех частицы: сумма времени рейсы для первой и второй удар на детектор строятся на x-оси, сумма за третий и четвертый удара на y-ось. Центр вершины позволяет идентифицировать массы четыре обнаруженных фрагментов. Фигура структуры содержит дополнительную информацию: Если импульсы фрагментов добавить до нуля, события содержатся в узкой линией (H, CF, Cl, Br). Если фрагмент незамеченными несет импульса, ненулевое полный импульс частицы, измеренной приводит к расширение функций. Для целей иллюстрации данные из синхротрон, не лазер, измерения используются здесь из-за выше статистики. Рисунок воспроизводится от5 ссылки с разрешения Wiley-VCH. Пожалуйста, нажмите здесь, чтобы посмотреть большую версию этой фигуры.
Рисунок 3 : Различие энантиомеров в пяти частиц распада CHBrClF через параметр хиральности cos Θ как это определено в тексте. Пик на положительные значения соответствует R-энантиомер, пик на отрицательные значения для S-энантиомер. Врезные иллюстрирует cos θ геометрически. Низкийфон позволяет назначение handedness для отдельных молекул. Рисунок воспроизводится от4 ссылка с разрешения AAAS. Пожалуйста, нажмите здесь, чтобы посмотреть большую версию этой фигуры.
Из-за различных компонентов COLTRIMS установки требует довольно высокий уровень технических знаний, особенно в области вакуумной техники, обнаружения частиц, быстро электроники и анализа данных. Прежде чем перейти к расследованию сложных видов, оно должно таким образом быть тщательно проверены если установка выполняется правильно, например , выполняя и анализа измерений на двухатомного или трехатомных видов.
Оптимизация, интенсивность и продолжительность лазерные импульсы и параллелизма с молекулярной jet имеет важное значение для достижения как многие несколько ионизации событий как можно. Как распределения импульса может расширить за счет последовательного ионизации во время различных циклов лазерного импульса, длительность импульса в идеале не должна превышать 40 fs. Во время измерения крайне важно для получения достаточных статистических данных. На положительной стороне определение абсолютной конфигурации не требует особо высокой точности, по сравнению с другими совпадение эксперименты, т.е. процедура довольно устойчива к колебаниям в лазерных или интенсивности струи и электрические поле искажения в спектрометре.
Наиболее фундаментальное ограничение техники касается ее применимости для больших молекул. Надо иметь в виду, что результаты представляют импульсов фрагментов, не структура молекул в реальном пространстве. Для сложных био молекул отношения между измеряемых импульсов и молекулярной структуры ожидается не будет так просто, как молекулы, представленные здесь. Кроме того сложных молекул может производить много каналов распада, которые несут информацию о конфигурации, возможно снижение доходности соответствующих каналов. Теоретическое моделирование фрагментации, контроль распада структур и более сложные процедуры анализа необходимо будет если техника должна быть удлиненным молекулы с тремя или более атомов углерода. На данном этапе это не представляется возможным расследовать конфигурации белков или молекулы аналогичные сложности, но фактические ограничения все еще должна быть определена.
Еще одно ограничение текущей настройки является относительно высокий образец потребление благодаря молекулярной струи. Она может быть уменьшена путем реализации механизма утилизации (например холодной ловушки в вакуумной foreline). Тем не менее было бы целесообразно проверить другие методы подготовки образцов таких экспансивный струй, термодесорбции18 или лазерные методы десорбции19 , были успешно применены для изучения био молекул в газовой фазе.
Кулоновского взрыва Imaging является разрушительной метод, т. е. молекул, которые дробят для определения конфигурации не может быть использован далее. Однако только малая часть фактически ионизированный (которая является одной из причин потребления высокий образец, упомянутых в предыдущем пункте). Таким образом можно было использовать повторно молекул для последующего применения.
Измерения импульсов позволяет создать «соответствие» набор данных молекул и для выбора определенных пространственных направлениях, совпадение техника открывает новые перспективы для расследования эффекты асимметрии в хиральные молекулы, это, в частности случае если импульсы электроны измеряются в совпадение, которое может быть достигнуто с помощью полной установки COLTRIMS. Насос зонд методы позволяют дополнительно изучить Структурная динамика хиральная видов.
Совсем недавно, кулона взрыва изображений используется также для определения абсолютной геометрии СНГ и транс-изомеров,20 Добавление нового класса возможных видов и вопросов для рассмотрения. Как исследование стереохимии с совпадением спектроскопии все еще находится в зачаточном состоянии, авторы надеются, что эта статья поможет вдохновить исследователи, работающие по направлениям, изложенным в предыдущих пунктах для новых экспериментов.
Авторы заявляют не конкурирующие интересы.
Мы благодарим Роберт Бергер (Филиппс-Universität Марбург, Германия) для вдохновляющим дискуссии о толковании наших данных и молекулярная Хиральность в целом. Мы благодарны Julia Kiedrowski, Александр Schießer и Майкл Реггелин из ту Дармштадт (Германия), а также Бенджамин Spenger, Мануэль Mazenauer и Юрген Stohner от ZHAW Веденсвиль (Швейцария) для предоставления образца.
Проект был поддержан Гессен государство инициатива для науки и экономического превосходства под фокус ELCH (электрон динамика хиральная систем) и Федеральное министерство образования и научных исследований (BMBF). МС признает финансовую поддержку Фондом Adolf Messer.
Name | Company | Catalog Number | Comments |
CHBrCl2 | SigmaAldrich | 139181-10G | or other suitable sample |
femtosecond laser system | KMLabs | Wyvern500 | |
High-reflective mirrors | EKSMA | 042-0800 | |
mirror mounts | Newport | U100-A-LH-2K | |
focusing mirror (protected silver, f = 75 mm) | Thorlabs | CM254-075-P01 | (if available: f = 60 mm) |
COLTRIMS spectrometer, including electronics and data acquisition system | RoentDek | custom | contrary to the standard COLTRIMS, only one detector is needed |
Запросить разрешение на использование текста или рисунков этого JoVE статьи
Запросить разрешениеThis article has been published
Video Coming Soon
Авторские права © 2025 MyJoVE Corporation. Все права защищены