Method Article
Per piccole specie chirali, Coulomb esplosione Imaging fornisce un nuovo approccio per determinare la manualità delle singole molecole.
Questo articolo viene illustrato come COLTRIMS (freddo Target rinculo Ion Momentum Spectroscopy) o la tecnica del "reazione microscopio" può essere utilizzata per distinguere tra enantiomeri (stereoisomeri) di specie chirali semplici a livello di singole molecole. In questo approccio, un getto molecolare gassoso del campione si espande in una camera a vuoto e si interseca con impulsi laser a femtosecondi (fs). L'alta intensità degli impulsi conduce a digiuno più ionizzazione, accendendo una cosiddetta esplosione di Coulomb che produce parecchi frammenti cationici (caricati positivamente). Un campo elettrostatico guide questi cationi su rivelatori sensibili tempo e posizione. Simile ad uno spettrometro di massa di tempo di volo, l'orario di arrivo di ogni ione si ottengono informazioni sulla sua massa. Come un surplus, il campo elettrostatico è regolato in modo che la direzione di emissione e l'energia cinetica dopo frammentazione portare a variazioni nel tempo-di-volo e in posizione di impatto sul rivelatore.
Ogni impatto di ioni crea un segnale elettronico nel rivelatore; Questo segnale è trattato dall'elettronica ad alta frequenza e registrato evento per evento da un computer. I dati registrati corrispondono ai tempi di effetto e posizioni. Con questi dati, l'energia e la direzione di emissione di ogni frammento può essere calcolati. Questi valori sono correlati alle proprietà strutturali della molecola sotto inchiesta, vale a dire le lunghezze di legame e le posizioni relative degli atomi, che permette di determinare la molecola per molecola la manualità delle specie chirali semplici e altre caratteristiche isomerica.
Chiralità è una caratteristica della nostra natura che è stato affascinanti ricercatori per più di 150 anni. Nella 19th century, Pasteur, Van ' t Hoff e altri scoperto che molecole possono accadere in due strutture di immagine speculare che non sono super-imposable - come la nostra mano destra e sinistra. Questa proprietà è stata definita 'chirale', dalla parola greca per 'mano'.
Finora, nessuna differenza in proprietà termodinamiche o nei livelli di energia di destri e forme (i due ' enantiomeri') è stata trovata. Al fine di analizzare la manualità di un dato campione e a separare gli enantiomeri, interazione con altre molecole chirali può essere utilizzato, come avviene ad esempio in vari metodi cromatografici. 1 chiroottiche metodi quali dicroismo circolare (vibrazionale), CD (V) e dispersione rotatoria ottica, ORD, ordinariamente sono impiegati per distinguere tra enantiomeri. 2
Quando si tratta della determinazione della struttura microscopica, queste tecniche richiedono informazioni aggiuntive, ad esempio da calcoli di chimica quantistica. L'unica tecnica che ampiamente è accettato per determinare direttamente la configurazione assoluta è anomala diffrazione di raggi x. 3
Recentemente è stato dimostrato che la configurazione assoluta di specie chirali semplice può essere determinata da Coulomb esplosione Imaging. 4 , 5 in questo approccio, molecole in fase gassosa sono moltiplicare ionizzato affinché i restanti nuclei fortemente respingono ogni altro. Questa repulsione conduce alla frammentazione veloce ('esplosione') delle molecole. La direzione e l'entità del frammento momenta correlato alla struttura della molecola – per piccole molecole, le direzioni di slancio corrispondono sorprendentemente bene per gli assi di legame. Esplosione di Coulomb per determinazione della struttura molecolare è stato sperimentato utilizzando fasci di ioni molecolari da un acceleratore. 6 questa tecnica di lamina fascio ha recentemente stato anche chiesto il riconoscimento chirale. 7
Contrariamente anomala diffrazione di raggi x, il campione non deve essere cristallina ma fornito in fase gassosa. Questo rende l'approccio di Coulomb esplosione ideale per specie volatili e così complementari per diffrazione dei raggi x. In alcuni casi, la manualità può essere determinata anche per singole molecole.
In pratica, la ricostruzione esatta della struttura molecolare ha dimostrato difficile anche per i derivati del metano, ad es. molecole con un carbonio centrale e diversi sostituenti. Ciò è attribuita al fatto che l'interazione tra i frammenti non è esattamente Coulombic e che non tutti i legami rompono simultaneamente. Al fine di ottenere informazioni stereochimiche, soprattutto per distinguere tra enantiomeri, questa ricostruzione non è fortunatamente necessaria. Invece, i vettori di slancio di diversi frammenti possono essere correlati per produrre una quantità che si è distinta per le molecole di mano destra e sinistra. Per ottenere risultati affidabili, momenta frammento almeno quattro deve essere registrate.
Per misurare queste informazioni di slancio, i frammenti da uno – e un solo – disgregazione molecolare devono essere rilevato in un passaggio di misurazione singola. Questa condizione è definita solitamente come 'coincidente rilevamento'. Inoltre, le indicazioni di emissione devono essere analizzati, che gli importi in pratica per registrare il tempo e la posizione del frammento impatto in un formato di dati modalità elenco.
In fisica atomica e molecolare, tecniche sono state sviluppate che implementano questo approccio di misurazione impiegando elettrostatiche spettrometri di massa per massa rivelatori multi hit separazione e tempo - e posizione-sensibili. L'esempio più prominente è l'installazione COLTRIMS (freddo Target rinculo Ion Momentum Spectroscopy) – noto anche come reazione microscopio. 8 , 9 uno schizzo per questo tipo di esperimento è dato in Figura 1. Contrariamente a un COLTRIMS standard che può registrare anche gli elettroni, Coulomb esplosione Imaging richiede solo il rivelatore di ioni.
Spettrometro e rilevatore sono montati sotto vuoto ultraelevato (< 1 x 10-9 hPa) per evitare la creazione di ioni da gas residuo. Singole molecole del campione sono fornite tramite un getto molecolare gratis gassoso creato da espansione supersonica: in virtù della pressione del vapore, le molecole espandono attraverso un piccolo ugello (circa 50 micron di diametro) nel vuoto. Questa parte dell'esperimento, la camera di origine, è separata dalla regione di interazione di solito due skimmer e fasi differenzialmente pompati. Un ulteriore pompata differenzialmente sezione si trova dietro la regione di interazione per il getto del gas di discarica e quindi evitare gas di fondo della regione di interazione.
Le radiazioni ionizzanti si interseca con il getto molecolare inferiore ai 90°. Maggior parte dei laboratori oggi utilizzano impulsi laser a femtosecondi, anche se la radiazione di sincrotrone, ioni veloci o impatto elettronico sono possibili 'proiettili' per indurre esplosione di Coulomb.
Il seguente protocollo rende il presupposto che esegue l'installazione per l'imaging coincidente di ioni e un laser a femtosecondi sono disponibili in laboratorio. L'intensità di picco necessaria per indurre l'esplosione di Coulomb in quattro o persino cinque frammenti deve essere dell'ordine di 6 x 1014 W/cm2. Per evitare misurazioni estremamente lunghi, il tasso di ripetizione del laser dovrebbe essere 10 kHz o più. Questo è fondamentale perché, da un lato, coincidente rilevazione può essere accertato solo se la probabilità di frammentazione nel fuoco del laser è significativamente inferiore a 1 ogni impulso laser (idealmente non più di 10%). Il tasso di frammentazione totale, d'altra parte, non dovrebbe essere inferiore a qualche kHz perché la quota delle vie multifragmentation pertinenti è di solito meno di 10-4. Fatto come incoraggiante, va ricordato che in linea di principio un evento singolo frammentazione è già sufficiente per identificare la configurazione di un campione di enantiopuri, e che la rilevazione di poche centinaia permette di determinare l'abbondanza di enantiomeri in un esempio di composizione enantiomerica sconosciuta.
Attenzione: assicurarsi di avere familiarità con tutti i possibili pericoli connessi con l'esperimento e in laboratorio. La procedura riportata di seguito include i laser di classe IV, alta tensione e vuoto. Consultare il foglio di dati materiale di sicurezza (MSDS) per le specie a essere investigato.
1. preparazione
2. Accendere lo spettrometro e rivelatori
Nota: questa parte del protocollo leggermente dipende dall'implementazione effettiva del sistema spettrometro e rivelatore. Qui la descrizione è valida per un'installazione standard di COLTRIMS con un rilevatore di linea di ritardo esagonale (HEX75). 10 in questa implementazione, un rivelatore ha 7 canali di uscita: uno per le piastre di microcanali (MCP) e due per ciascuno dei tre strati dell'anodo.
3. Consegna del campione
4. Misura
Nota: le seguenti operazioni vengono eseguite nel software di acquisizione dati.
5. Analisi dei dati
Nota: analisi dei dati in un esperimento di Coulomb esplosione Imaging è un complesso, ma gratificante attività dal momento che molti parametri possono essere regolati dopo l'esperimento e una moltitudine di correlazioni tra il misurato quantità di moto può essere esplorata. Solitamente vengono eseguiti tutti i passaggi seguenti dopo l'esperimento del software di analisi dati.
In questa parte, vi mostriamo i risultati ottenuti per halomethanes. Queste specie sono l'ideale per gli esperimenti di prova-de-principio grazie alla loro semplicità e alta pressione di vapore. Nel frattempo, l'alotano specie più complessa è stato studiato facendo uso di singoli fotoni di raggi-x-soft da una fonte di sincrotrone per indurre ionizzazione più. 14
CHBrClF
Bromochlorofluoromethane (CHBrClF) è un esempio da manuale per molecole chirali con un atomo di carbonio stereogenico. È anche il candidato ideale per l'Imaging di Coulomb esplosione grazie alla sua struttura semplice e l'elevata tensione di vapore (circa 600 hPa a temperatura ambiente). Purtroppo, la specie non è disponibile in commercio; per l'esperimento presentato qui, una miscela racemica fu sintetizzata da reagire CHBr2Cl con HgF2 secondo riferimento15. Enantio-arricchita campioni sono difficili da ottenere in quantità necessaria in modo che solo i risultati per racemati sono stati ottenuti finora.
Per i risultati presentati qui il campione è stato raffreddato a circa 240 K per ottenere una densità di destinazione appropriata con l'ugello dato (10% di probabilità di ionizzazione per impulso). L'intensità di picco del laser è stata stimata per essere di 6 x 1014 W/cm2. La misura a una frequenza di ripetizione di 100 kHz laser ha preso 11 h.
Al fine di distinguere R e S-enantiomeri, un triplo prodotto normalizzato viene calcolata dai vettori di slancio del tre alogeni fluoro, cloro e bromo. Geometricamente, questa quantità può essere interpretata come il coseno dell'angolo tra lo slancio di fluoro e l'aereo dei momenti cloro e bromo.
La figura 3 Mostra cosθ per l' isotopo CH79Br35ClF, insieme alla definizione geometrica. Due picchi chiari sono visibili, che indica gli enantiomeri. La posizione dei picchi è coerenza con una simulazione di dinamica molecolare classica. Come quasi nessuno sfondo è presente, l'assegnazione di manualità funziona a livello di singola molecola.
CHBrCl2
La chiralità di CHBrCl2 si verifica solo se l'isotopi 35Cl 37Cl sono presenti sia nella stessa molecola. Un campione con la naturale abbondanza di isotopi così contiene molecole chirali e achirale. Due ulteriori complicazioni derivano qui: in primo luogo, le distribuzioni di tempo di volo degli isotopi cloro e bromo si sovrappongono rispettivamente a causa della piccola differenza di massa. Ciò è particolarmente rilevante per cloro come la determinazione di manualità dipende la corretta assegnazione degli isotopi. In secondo luogo, la specie chirale CH79Br35Cl37Cl ha (all'interno di precisione di installazione) la stessa massa totale della specie achirale CH81Br35Cl2. L'indagine di questa specie può quindi essere visto come un test di benchmark per il metodo.
Con lo spettrometro utilizzato (spettrometro lunghezza s = 60,5 mm, intensità di campo elettrico E = 57,1 V/cm), i dati per l' isotopo chirali CH79Br35Cl37Cl potrebbe essere selezionata tramite la quantità di moto totale, utilizzando un algoritmo suggerito da riferimento16 per assegnare che dei successi appartiene a quale isotopo.
Considerazioni geometriche portano alla conclusione che ci possono essere gli orientamenti della molecola nello spazio dove i due isotopi di cloro hanno lo stesso ora di volo; in questo caso, non possono essere distinti come una questione di principio. Una procedura per risolvere questi eventi è stata descritta in materiali integrativi riferimento4. Di conseguenza, la configurazione anche di molecole isotopicamente chirali può essere determinata con alta affidabilità.
Figura 1 : Vista in un programma di installazione di COLTRIMS. Molecole l'installazione attraverso l'ugello di entrare e passano attraverso un paio di skimmer. Nella camera di interazione, gli impulsi laser attraversano con il getto molecolare inferiore ai 90°. Gli ioni sono guidati dal campo elettrico dello spettrometro al rivelatore (in alto). Per una migliore visibilità, non tutte le piastre di spettrometro sono mostrate. Le molecole restanti vengono scaricate in una sezione differenzialmente pompata (dump di getto) per mantenere la pressione di fondo della regione di interazione più basso possibile. Figura modificata da riferimento17 con autorizzazione da G. Kastirke. Clicca qui per visualizzare una versione più grande di questa figura.
Figura 2 : Quattro-particella coincidenza spettro. Questo istogramma è un'estensione di uno spettro di massa di tempo di volo a quattro particelle: la somma del tempo di voli per il primo e il secondo colpo sul rivelatore vengono tracciate sulla x-asse, la somma per il terzo e quarto colpo sul y-axis. Il centro delle cime permette di identificare le masse dei quattro frammenti rilevati. La forma delle strutture contiene informazioni aggiuntive: se la quantità di moto dei frammenti è possibile aggiungere fino a zero, gli eventi sono contenuti in una linea sottile (H, CF, Cl, Br). Se un frammento inosservato trasporta lo slancio, la quantità di moto totale diverso da zero della particella misurata conduce ad un ampliamento delle funzionalità. A scopo illustrativo, dati da sincrotrone e laser, non misure vengono utilizzati qui grazie a statistiche superiore. Figura riprodotta da riferimento5 con permesso da Wiley-VCH. Clicca qui per visualizzare una versione più grande di questa figura.
Figura 3 : Distinzione di enantiomeri nel break-up di cinque-particella di CHBrClF tramite il parametro di chiralità cos Θ come definito nel testo. Il picco a valori positivi corrisponde per il R-enanziomero, il picco a valori negativi per il S-enanziomero. L'inserto viene illustrato cos θ geometricamente. Il bassosfondo consente un'assegnazione di manualità per singole molecole. Figura riprodotta da riferimento4 con il permesso di AAAS. Clicca qui per visualizzare una versione più grande di questa figura.
A causa della varietà di componenti, un programma di installazione COLTRIMS richiede un livello piuttosto elevato di competenza tecnica, soprattutto nei settori della tecnica del vuoto, rivelazione di particelle, veloce elettronica e analisi dei dati. Prima di dedicarsi alla ricerca delle specie complesse, dovrebbe quindi essere accuratamente controllato se l'installazione è in esecuzione correttamente, ad esempio eseguendo e analizzando una misura su una specie di biatomica o triatomica.
Ottimizzare l'intensità e la durata del laser gli impulsi e la sovrapposizione con il getto molecolare è essenziale per ottenere come molti più eventi di ionizzazione come possibile. Come la distribuzione di quantità di moto potrebbe ampliare a causa di ionizzazione sequenziale durante i diversi cicli dell'impulso laser, la durata dell'impulso non dovrebbe idealmente superare 40 fs. Durante la misurazione, è fondamentale ottenere statistiche sufficienti. Sul lato positivo, la determinazione della configurazione assoluta non richiede una precisione particolarmente elevata rispetto ad altri esperimenti di coincidenza, cioè la procedura è piuttosto robusta di fluttuazioni nel laser o intensità del getto e di elettrico distorsioni di campo nello spettrometro.
La limitazione più fondamentale della tecnica riguarda la sua applicabilità ai più grandi molecole. Si deve tenere a mente che i risultati rappresentano i momenti di frammenti, non la struttura delle molecole nello spazio reale. Per bio-molecole complesse, la relazione tra momenti misurati e struttura molecolare non dovrebbe essere così semplice per quanto riguarda le molecole presentate qui. Inoltre, molecole complesse possono produrre molti canali di scioglimento che non riportano informazioni sulla configurazione, possibilmente riducendo la resa dei canali pertinenti. Teorico di modellazione della frammentazione, controllo di rottura modelli e procedure di analisi più sofisticate sarà necessari se la tecnica deve essere esteso alle molecole con tre o più atomi di carbonio. Allo stato attuale, non sembra possibile studiare la configurazione delle proteine o molecole di analoga complessità, ma le reali limitazioni devono ancora essere determinato.
Un'altra limitazione della configurazione attuale è il consumo di campione relativamente alto a causa del getto molecolare. Può essere ridotto mediante l'implementazione di un meccanismo di riciclaggio (ad es. trappole fredde nei vacuometri vuoto). Tuttavia, sarebbe utile testare altri metodi di preparazione del campione come getti effusive, thermodesorption18 o laser desorbimento tecniche19 che sono state applicate con successo per lo studio di bio-molecole in fase gassosa.
Coulomb esplosione Imaging è un metodo distruttivo, cioè le molecole che hanno state frammentate per la determinazione della configurazione non possono essere utilizzate ulteriormente. Tuttavia, solo una piccola frazione è effettivamente ionizzata (che è uno dei motivi per il consumo di campione alto accennato nel paragrafo precedente). Così potrebbe essere possibile utilizzare le molecole riciclate per la successiva applicazione.
Come la misurazione della quantità di moto che permette di creare un set di dati 'allineato' delle molecole e di selezionare determinate direzioni spaziali, la tecnica di coincidenza apre nuove prospettive per l'indagine degli effetti di asimmetria in molecole chirali, questo è in particolare il caso se la quantità di moto degli elettroni sono misurati in coincidenza che può essere raggiunto utilizzando un'installazione completa di COLTRIMS. Pompa-sonda tecniche consentono inoltre di studiare le dinamiche strutturali delle specie chirali.
Molto recentemente, Coulomb esplosione Imaging è anche stato utilizzato per determinare le geometrie assolute di cis e trans-isomeri,20 l'aggiunta di una nuova classe di specie possibili e questioni da affrontare. Come l'indagine della stereochimica con spettroscopia di coincidenza è ancora nella sua infanzia, gli autori sperano che questo articolo aiuta ad per ispirare i ricercatori che lavorano nelle indicazioni descritte nei paragrafi precedenti a nuove sperimentazioni.
Gli autori non dichiarano interessi concorrenti.
Ringraziamo Robert Berger (Philipps-Universität Marburg, Germania) per ispirare le discussioni circa l'interpretazione dei nostri dati e chiralità molecolare in generale. Siamo grati a Julia Kiedrowski, Alexander Schießer e Michael Reggelin da TU Darmstadt (Germania), così come Benjamin Spenger, Manuel Mazenauer e Jürgen Stohner da ZHAW Wädenswil (Svizzera) per la fornitura del campione.
Il progetto è stato sostenuto dall'iniziativa di uno stato di Hessen per scientifica ed eccellenza economica sotto il fuoco ELCH (Electron dynamics dei sistemi chirali) e il Ministero federale dell'istruzione e ricerca (BMBF). MS riconosce il sostegno finanziario della Fondazione Adolf Messer.
Name | Company | Catalog Number | Comments |
CHBrCl2 | SigmaAldrich | 139181-10G | or other suitable sample |
femtosecond laser system | KMLabs | Wyvern500 | |
High-reflective mirrors | EKSMA | 042-0800 | |
mirror mounts | Newport | U100-A-LH-2K | |
focusing mirror (protected silver, f = 75 mm) | Thorlabs | CM254-075-P01 | (if available: f = 60 mm) |
COLTRIMS spectrometer, including electronics and data acquisition system | RoentDek | custom | contrary to the standard COLTRIMS, only one detector is needed |
Richiedi autorizzazione per utilizzare il testo o le figure di questo articolo JoVE
Richiedi AutorizzazioneThis article has been published
Video Coming Soon