1. בידוד מוח מיטוכונדריאלי (מעובד מתוך בראון MR et al. 9) <ol style=";text-align:right;direction:rtl"><li style=";text-align:right;direction:rtl"> להקריב את העכברוש תוך שימוש בשיטות שאושרו על ידי הטיפול בבעלי החיים מוסדיים ועדת שימוש (IACUC). </li><li style=";text-align:right;direction:rtl"> חותכים את ראשו של בעל החיים על ידי עריפת ראש, לחתוך את העור ולחשוף את הגולגולת. </li><li style=";text-align:right;direction:rtl"> פתח את הגולגולת בעדינות על ידי חיתוך עם מספריים או rongeur. הסר את המוח. </li><li style=";text-align:right;direction:rtl"> ברר היטב את המוח בלי המוח הקטן במאגר הבידוד (ראה טבלת מס &#39;1) ולהעביר אותו ל5 מיליליטר זכוכית / טפלון homogenizer (ראה רשימת ציוד). </li><li style=";text-align:right;direction:rtl"> Homogenize רקמות בעדינות 10 פעמים (אין בועות), כ 5 דקות. </li><li style=";text-align:right;direction:rtl"> צנטריפוגה מדגם ב 1,500 × גרם במשך 10 דקות ב 4 ° C בצנטריפוגה ספסל עליונה. </li><li style=";text-align:right;direction:rtl"> שמור את supernatant (המיטוכונדריה וsynaptosomes) וזורקים את הכדור (חומר גרעיני ותא פסולת). צנטריפוגה ב 16,000 × גרם במשך 10 דקות ב 4 ° C בצנטריפוגה ספסל עליונה. </li><li style=";text-align:right;direction:rtl"> להשליךsupernatant מחדש להשעות גלולה ב 500 μl של הצפת בידוד. לשבש synaptosomes עם כלי שיבוש תא (ראה רשימת ציוד). החל לחץ של 1200 psi במשך 10 דקות, ואחרי לחץ מהיר. </li><li style=";text-align:right;direction:rtl"> שכבת תערובת על הדרגתיים Ficoll (ראה טבלה 2), המקום בSW-50.1 הרוטור צנטריפוגות ב 126,500 × גרם במשך 20 דקות ב 4 ° C בultracentrifuge (ראה רשימת ציוד). גלולה היא המיטוכונדריה מטוהרת, השכבה בין הצפיפויות של Ficoll השונים היא synaptosomes בלא הפרעה. </li><li style=";text-align:right;direction:rtl"> לשטוף גלולה ידי צנטריפוגה במאגר הבידוד ב16,000 × גרם במשך 10 דקות ב 4 ° C בצנטריפוגה ספסל עליונה. </li></ol> 2. בידוד Submitochondrial שלפוחית ​​(SMV) (מעובד מתוך צ&#39;אן et al. 10) <ol style=";text-align:right;direction:rtl"><li style=";text-align:right;direction:rtl"> Re-להשעות המיטוכונדריה במאגר 200 בידוד μl בשילוב עם נפח שווה של 1% digitonin ולאפשר לשבת על קרח במשך 15 דקות. </li><li style=";text-align:right;direction:rtl"> הוסף יותר בידוד Buffאה ו צנטריפוגות ב 16,000 × גרם במשך 10 דקות ב 4 ° C בצנטריפוגה ספסל עליונה. לעשות את זה פעמיים. </li><li style=";text-align:right;direction:rtl"> Re-להשעות גלולה ב 200 הצפת בידוד μl ולהוסיף 2 μl של 10% Lubrol PX (C12E9). לערבב ולאפשר לשבת על קרח במשך 15 דקות. </li><li style=";text-align:right;direction:rtl"> תערובת שכבת בידוד על הצפת, מקום בSW-50.1 הרוטור צנטריפוגות ב 182,000 × גרם ב 4 מעלות צלזיוס במשך שעה 1. </li><li style=";text-align:right;direction:rtl"> לשטוף סופי גלולה ידי צנטריפוגה בצנטריפוגה שולחן עליונה בבידוד במאגר 16,000 × גרם במשך 10 דקות ב 4 ° C. </li></ol> 3. הקלטת אלקטרו <ol style=";text-align:right;direction:rtl"><li style=";text-align:right;direction:rtl"> אסדת electrophysiology טיפוסית כוללת מגבר, מחשב PC מצויד בממשק ממיר Digidata 1440A אנלוגי לדיגיטלי בשיתוף עם pClamp10.0 תוכנה, מניפולטורים, מיקרוסקופ, שולחן בידוד רעידות, כלוב פאראדיי. </li><li style=";text-align:right;direction:rtl"> צינורות נימי התכה של זכוכית בורה מוכנסים לתוך Flaming / בראון Micropipette פולר דגם P-87. תכנית פיפטה-חולץ היא מותאמת לליצור pipettes עם התנגדויות בין 80 עד 100 MΩ. </li><li style=";text-align:right;direction:rtl"> SMVs ממוקמים בפתרון תאי פיסיולוגי (ATP הוא הוסיף בזמן המתאים במהלך ההקלטה) (לוח 3). pipettes צמד תיקון מלא עם אותו הפתרון (לא ה-ATP). הקלטות נעשות על ידי יצירת חותם גיגה אוהם על SMVs בטמפרטורת חדר. שלפוחית ​​הם דמיינו ידי מיקרוסקופ שלב בניגוד למיקרוסקופ הפוך ניקון או Zeiss. </li><li style=";text-align:right;direction:rtl"> פוטנציאל הממברנה נשמר במתח הנע בין -100 mV ל+ 100 mV לתקופות של 10 שניות. הקלטות מסוננות ב5 קילוהרץ באמצעות מעגלי המגבר. רמת הרעש חשמלי או שאינם ספציפי התועה של הרשות הפלסטינית הן פחות מ 1 רצויה להקלטה מוצלחת. </li><li style=";text-align:right;direction:rtl"> הנתונים מנותחים עם תוכנת Clampfit 10.0 למשל כדי לקבוע תדר ומשרעת של אירועי ערוץ אחד. תלות מתח נקבעה על ידי מתכנן מערכת יחסים מתח נוכחי. </li></ol>

<ol>
	<li>Cheng, W. C., Berman, S. B., Ivanovska, I., Jonas, E. A., Lee, S. J., Chen, Y., Kaczmarek, L. K., Pineda, F., Hardwick, J. M. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Mitochondrial+factors+with+dual+roles+in+death+and+survival.">Mitochondrial factors with dual roles in death and survival.</a> Oncogene. 25, 4697-4705 (2006).</li><li>Duchen, M. R., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Mitochondria+and+calcium+in+health+and+disease.">Mitochondria and calcium in health and disease.</a> Cell Calcium. 44, 1-5 (2008).</li><li>Lemasters, J. J. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Modulation+of+mitochondrial+membrane+permeability+in+pathogenesis,+autophagy+and+control+of+metabolism.">Modulation of mitochondrial membrane permeability in pathogenesis, autophagy and control of metabolism.</a> J. Gastroenterol. Hepatol. 22, S31-S37 (2007).</li><li>Cox, G. B., Jans, D. A., Fimmel, A. L., Gibson, F., Hatch, L. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Hypothesis.+The+mechanism+of+ATP+synthase.+Conformational+change+by+rotation+of+the+beta-subunit.">Hypothesis. The mechanism of ATP synthase. Conformational change by rotation of the beta-subunit.</a> Biochim. Biophys. Acta. 768, 201-208 (1984).</li><li>Cox, G. B., Fimmel, A. L., Gibson, F., Hatch, L. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=The+mechanism+of+ATP+synthase:+a+reassessment+of+the+functions+of+the+b+and+a+subunits.">The mechanism of ATP synthase: a reassessment of the functions of the b and a subunits.</a> Biochim. Biophys. Acta. 849, 62-69 (1986).</li><li>Cory, S., Huang, D. C., Adams, J. M. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=The+Bcl-2+family:+roles+in+cell+survival+and+oncogenesis.">The Bcl-2 family: roles in cell survival and oncogenesis.</a> Oncogene. 22, 8590-8607 (2003).</li><li>Vander Heiden, M. G., Thompson, C. B. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Bcl-2+proteins:+regulators+of+apoptosis+or+of+mitochondrial+homeostasis.">Bcl-2 proteins: regulators of apoptosis or of mitochondrial homeostasis.</a> Nat. Cell Biol. 1, 209-216 (1999).</li><li>Alavian, K. N., Li, H., Collis, L., Bonanni, L., Zeng, L., Sacchetti, S., Lazrove, E., Nabili, P., Flaherty, B., Graham, M., Chen, Y., Messerli, S. M., Mariggio, M. A., Rahner, C., McNay, E., Shore, G. C., Smith, P. J. S., Hardwick, J. M., Jonas, E. A. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Bcl-xL+regulates+metabolic+efficiency+of+neurons+through+interaction+with+the+mitochondrial+F1FO+ATP+synthase.">Bcl-xL regulates metabolic efficiency of neurons through interaction with the mitochondrial F1FO ATP synthase.</a> Nat. Cell Biol. 13 (10), 1224-1233 (2011).</li><li>Brown, M. R., Sullivan, P. G., Dorenbos, K. A., Modafferi, E. A., Geddes, J. W., Steward, O. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Nitrogen+disruption+of+synaptoneurosomes:+an+alternative+method+to+isolate+brain+mitochondria.">Nitrogen disruption of synaptoneurosomes: an alternative method to isolate brain mitochondria.</a> Journal of Neuroscience Methods. 137, 299-303 (2004).</li><li>Chan, T. L., Greenawalt, J. W., Pedersen, P. L. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Biochemical+and+ultrastructural+properties+of+a+mitochondrial+inner+membrane+fraction+deficient+in+outer+membrane+and+matrix+activities.">Biochemical and ultrastructural properties of a mitochondrial inner membrane fraction deficient in outer membrane and matrix activities.</a> J. Cell Biol. 45 (2), 291-305 (1970).</li><li>Young, H. K. o., Delannoy, M., Hullihen, J., Chiu, W., Pedersen, P. L. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Mitochondrial+ATP+Synthasomes.">Mitochondrial ATP Synthasomes.</a> J. Biol. Chem. 278 (14), 12305-12309 (2003).</li></ol>

אין ניגודי האינטרסים הכריזו.

השיטות שתוארו במסמך זה יאפשר את בידודה של המיטוכונדריה טהורה בסוף השלב 1 ושלפוחית ​​submitochondrial (SMVs) אחרי שלב 2 מהמוח כולו, ללא הבחנה של תא phenotypes.SMVspurified בשיטה זו בעצם נקיה מזיהום על ידי אברונים subcellular אחרים כפי שמוצג ב איור 1 והעבודה הקודמת שלנו (Alavian KN et al. 8) ולשמור על השלמות המבנית ותפקודית שלהם לפני ההקפאה. לאחר הקפאה והפשרה, מבודד המיטוכונדריה או SMVs משמשים להקלטות ומבחני ביוכימיים, אבל לא ללימודים בדרכי הנשימה. יתר על כן שיטה זו ניתן להשתמש כדי לבודד המיטוכונדריה מכבד תוך שימוש באותן פעולות. בגלל המיטוכונדריה וSMVs נוטות ליצור אשכולות, כאשר מצופים לתוך תא הקלטת אלקטרו, תשומת לב צריך להינתן לטעינת המדגם, כפי שדילול מוגזם או הצטברויות מוגזמות עלולים להפחית possibiliטיי של היווצרות חותם. יתר על כן, תשומת לב צריכה להינתן לכמה פרטים טכניים לפני שמתחילה את הבידוד. זה חיוני כדי להשתמש בכלים נקיים ולשמור אותם על קרח. כל הנהלים צריכים להתבצע על קרח ואת כל הצנטריפוגות להגדיר עד 4 ° C. הכנת שיפוע Ficoll כראוי היא קריטית עבור ניסוי מוצלח. יצירת הפרדה מושלמת בין שני הריכוזים של Ficoll משפרת את הטוהר של שברים subcellular. מגבלה של שיטה זו היא שהטילה את הסכום הסופי של חלבון, אשר יכול להיות קטן אם מדגם מאזור מסוים במוח הוא רצוי למשל המיטוכונדריה מsubstantia nigra pars compacta או סטריאטום. איגום דגימות מכמה בעלי חיים עשוי להיות נחוץ כדי לשפר את הכמות הכוללת של חלבון שנקטפו. המיטוכונדריה או SMVs הם aliquoted ב1 מ&quot;ג / מ&quot;ל ​​ולאחסן ב -80 ° C, והם יציבים להקלטות לכמה חודשים, לעומת זאת, זה preferablדואר לא מחדש להקפיא מדגם המיטוכונדריה לאחר ההפשרה. שלפוחית ​​מטוהרים על ידי שיטה זו שימושיות כדי ללמוד את ה-ATP synthase, תוך שימוש בגישות שונות, כגון הקלטת תיקון מהדק, טכניקות ביוכימיות ומחקרים פונקציונליים אחרים. עם הכנה זו ניתן לנתח את ההשפעות של תרופות או מולקולות קטנות על פעילות F1FO ATPase ומבנה.

<table border="1">
 <tbody>
 <tr>
 <td>Name </td>
 <td>Company</td>
 <td>Catalogue number</td>
 </tr>
 <tr>
 <td>Potter-Elvehjem Tissue Grinder withPTFEPestle</td>
 <td>Krackeler Scientific, Inc.</td>
 <td>1-7725T-5 </td>
 </tr>
 <tr>
 <td>Eppendorf Centrifuge 5424 </td>
 <td>Eppendorf </td>
 <td>5424 000.410</td>
 </tr>
 <tr>
 <td>4639 Cell Disruption Vessel</td>
 <td>Parr Instrument Company</td>
 <td>4639</td>
 </tr>
 <tr>
 <td>Ficoll</td>
 <td>Sigma-Aldrich</td>
 <td>F5415</td>
 </tr>
 <tr>
 <td>Polycarbonate centrifuge tubes</td>
 <td>Beckman Coulter</td>
 <td>P20314</td>
 </tr>
 <tr>
 <td>SW-50.1 rotor </td>
 <td>Beckman Coulter</td>
 <td></td>
 </tr>
 <tr>
 <td>L8-70M Ultracentrifuge</td>
 <td>Beckman Coulter</td>
 <td></td>
 </tr>
 <tr>
 <td>Digitonin</td>
 <td>Sigma-Aldrich</td>
 <td>D5628 </td>
 </tr>
 <tr>
 <td>Lubrol PX (C12E9) </td>
 <td>Calbiochem</td>
 <td>205534</td>
 </tr>
 <tr>
 <td>Axopatch 200B </td>
 <td>Axon Instruments </td>
 <td></td>
 </tr>
 <tr>
 <td>Digidata 1440A </td>
 <td>Molecular Device</td>
 <td></td>
 </tr>
 <tr>
 <td>pClamp10.0</td>
 <td>Molecular Device</td>
 <td></td>
 </tr>
 <tr>
 <td>Manipulator</td>
 <td>Sutter Instrument</td>
 <td></td>
 </tr>
 <tr>
 <td>Borosilicate glass capillary</td>
 <td>World Precision Instruments</td>
 <td>1308325</td>
 </tr>
 <tr>
 <td>Flaming/Brown Micropipette Puller Model P-87</td>
 <td>Sutter Instrument</td>
 <td></td>
 </tr>
 </tbody>
</table>

f1fo atpase vesicle preparation and technique for performing patch clamp recordings of submitochondrial vesicle membranes

המיטוכונדריה הוא מעורב בפונקציות רבות תאיות חשובות, כולל חילוף חומרים, הישרדות 1, פיתוח ו, סידן איתות 2. שניים מתפקידיו החשובים ביותר המיטוכונדריה קשורים לייצור יעיל של ה-ATP, מטבע האנרגיה של התא, על ידי זרחון חמצוני, והגישור של אותות למוות תאים מתוכנת 3. האנזים האחראי בעיקר לייצור של ה-ATP הוא synthase F1FO-ATP, המכונה גם ה-ATP synthase 4-5. בשנים האחרונות, את תפקידו של המיטוכונדריה במוות של תאים אפופטוטיים ונימקים קיבלה תשומת לב רבה. במוות של תאים אפופטוטיים, Bcl-2 חלבונים משפחתיים כגון Bax להזין את הקרום החיצוני של המיטוכונדריה, oligomerize וpermeabilize קרום החיצוני, משחררים גורמים פרו אפופטוטיים ל6 cytosol. במוות של תאי נמקי קלאסי, כגון זה המיוצר על ידי איסכמיה או הפעלת יתר רעילה בתאי עצב, largהדואר, גידול מוסדר היטב בסידן מטריצה ​​תורם לפתיחה נקבובית קרום פנימי, נקבובית מעבר חדירות המיטוכונדריה או MPTP. זה depolarizes הקרום הפנימי וגורם למשמרות אוסמוטי, תורם לקרע חיצוני קרום, שחרור של גורמים פרו אפופטוטיים, ובעיות בתפקוד מטבולי. חלבונים רבים, כולל Bcl-XL 7 אינטראקציה עם ה-ATP synthase F1FO, ויסות תפקודו. Bcl-XL אינטראקציה ישירות עם מקטע הבטא של ה-ATP synthase F1FO, ואינטראקציה זו מקטינה מוליכות דליפה בתוך F1FOATPasecomplex, הגדלת התחבורה הנקי של H + על ידי F1FO במהלך F1FO פעילות ATPase 8 ויעילות ובכך להגדיל המיטוכונדריה. כדי לחקור את הפעילות והאפנון של ה-ATP synthase, אנחנו מבודדים משלפוחית ​​submitochondrial מכרסם במוח (SMVs) המכיל F1FO ATPase. את SMVs לשמר את השלמות המבנית ותפקודית של ATPase F1FO כפי שמוצג בAlavian et al. כאן, אנו מתארים שיטהשאנחנו השתמשנו בהצלחה לבידודה של SMVs ממוח חולדה ואנו להתוות את טכניקת מהדק התיקון לניתוח פעילות ערוץ (מוליכות דליפת יון) של SMVs.

הצעד הראשון של הפרוטוקול שלנו מאפשר לבידוד של מטוהרים המיטוכונדריה, כפי שמוצג על ידי כתם מערבי באיור 1. באיור 2 מוצג דוגמה להקלטת תיקון שלפוחית ​​submitochondrial מוח נגזרת. שימוש בתצורת התיקון מבפנים החוצה אנחנו מדגימים פעילות מווסתת על ידי ערוץ ה-ATP. השליטה (CTL) הקלטה (משמאל) מראה פעילות ערוץ רבת מוליכות עם מוליכות שיא של 600 נ&quot;ב בממוצע. שירד מייד עם תוספת של 1 מ&quot;מ ה-ATP לאמבטיה. ההשפעה הכוללת של ה-ATP היא להפחית את המוליכות של טלאי SMVs באופן ריכוז תלוי. כדי למדוד את היעילות של F1FO ATPase לאחר בידוד, מדדנו את תנועתם של יוני H + לSMVs בתגובה להידרוליזה ה-ATP, כפי שמוצג באיור 3, מדידת הירידה בעוצמת הקרינה של SMV-נשלל H + מחוון ACMA. H-ATP רגיש + קיבוע יון לSMVs מוגבר לאחר להוסיףition של ה-ATP. assay זה יכול לשמש גם כדי למדוד את היעילות של H + קיבוע יון. SMVs היעילה פחות יצבור H + יונים לאט יותר או לשווי שיא קטן יותר. לדוגמא H + קיבוע יון הוא מוחלש על ידי התוספת של Bcl-XL מעכבים וFCCP (Alavian et al., 2011). <table border="1" style=";text-align:right;direction:rtl"><tbody><tr><td fo:width="1in"></td><td fo:width="2in"> ריכוז סופי </td></tr><tr><td> סוכרוז </td><td> 250 מ&quot;מ </td></tr><tr><td> Hepes </td><td> 20 מ&quot;מ </td></tr><tr><td> EDTA </td><td> 1 מ&quot;מ </td></tr><tr><td> BSA </td><td> 0.5% </td></tr></tbody></table> טבלת מס &#39;1. מאגר הבידוד. <table border="1" style=";text-align:right;direction:rtl"><tbody><tr><td fo:width="2in"> Ficoll </td><td fo:width="2in"> 20% 22 מ&quot;ל&gt; </td></tr><tr><td> סוכרוז </td><td> M 12 מ&quot;ל 1 </td></tr><tr><td> EDTA </td><td> 0.1 מ &#39;μl 18.75 </td></tr><tr><td> טריס-HCl </td><td> 375 1 ז μl (pH 7.4) </td></tr><tr><td colspan="2"> שכבה עליונה 7.5% מFicoll </td></tr><tr><td> Ficoll מניית </td><td> 10 מ&quot;ל </td></tr><tr><td> מאגר הבידוד </td><td> 6 מ&quot;ל </td></tr><tr><td colspan="2"> שכבה תחתונה 10% מFicoll </td></tr><tr><td> Ficoll מניית </td><td> 15.5 מ&quot;ל </td></tr><tr><td> מאגר הבידוד </td><td> 2.5 מ&quot;ל </td></tr></tbody></table> טבלת 2. מאגר Ficoll. <table border="1" style=";text-align:right;direction:rtl"><tbody><tr><td fo:width="1in"> KCl </td><td fo:width="1in"> 120 מ&quot;מ </td></tr><tr><td> NaCl </td><td> 8 מ&quot;מ </td></tr><tr><td> EGTA </td><td> 0.5 מ&quot;מ </td></tr><tr><td> Hepes </td><td> 10 מ&quot;מ </td></tr><tr><td> pH </td><td> 7.3 </td></tr></tbody></table> לוח 3. הפנימי סולוtion. <img src="/files/ftp_upload/4394/4394fig1.jpg" alt="איור 1" /> איור 1. immunoblot נציג lysate מטוהר מCytosol ומיטוכונדריה. הפנל העליון מראה immunoblot באמצעות נוגדן נגד חלבון GAPDH cytosolic. הפנל התחתון מראה immunoblot באמצעות נוגדן נגד CoxIV חלבון קרום innner המיטוכונדריה. <img src="/files/ftp_upload/4394/4394fig2.jpg" alt="איור 2" fo:content-width="5in" fo:src="/files/ftp_upload/4394/4394fig2highres.jpg"/> איור 2. הקלטת שתי נציג תיקון מהדק לפני ואחרי תוספת של 1 מ&quot;מ ה-ATP. מחזיק פוטנציאל הוא +70 mV. הקו המקווקו מייצג 0 הרשות הפלסטינית. כל זכר מתועד עבור 10 שניות ויש 10 שניות בין עקבות. <img src="/files/ftp_upload/4394/4394fig3.jpg" alt="איור 3"/> איור 3. דוגמא עקבות של שינויי עוצמת הקרינה שלמחוון ACMA לאורך זמן בנוכחות SMVs ובהעדר (קו שחור) והנוכחות (עקבות אדומות) של ה-ATP.

Watch this Scientific Journal Video about F1FO ATPase Vesicle Preparation and Technique for Performing Patch Clamp Recordings of Submitochondrial Vesicle Membranes at JoVE.com

F1FO ATPase Vesicle Preparation and Technique for Performing Patch Clamp Recordings of Submitochondrial Vesicle Membranes

שיטה לבודד את שלפוחית ​​submitochondrial מועשרת במתחמי ה-ATP synthase F1FO ממוח חולדה מתוארת. שלפוחית ​​אלה מאפשרים מחקר של הפעילות של F1FO ATPase המורכב והאפנון שלה תוך שימוש בטכניקה של הקלטת תיקון מהדק.

<sub&gt; 1</sub&gt; F<sub&gt; O</sub&gt; הכנת שלפוחיות ATPase וטכניקה לביצוע הקלטות מהדק תיקון של קרום שלפוחית ​​Submitochondrial

Mitochondria are involved in many important cellular  functions including metabolism, survival1, development and, calcium signaling2. Two of the most ...

f1fo-atpase-vesicle-preparation-technique-for-performing-patch-clamp

Nanyang Technological University

Research

JoVE Journal

Neuroscience

F1FO ATPase Vesicle Preparation and Technique for Performing Patch Clamp Recordings of Submitochondrial Vesicle Membranes

10.2K Views.  Yale University. שיטה לבודד את שלפוחית ​​submitochondrial מועשרת במתחמי ה-ATP synthase F1FO ממוח חולדה מתוארת. שלפוחית ​​אלה מאפשרים מחקר של הפעילות של F1FO ATPase המורכב והאפנון שלה תוך שימוש בטכניקה של הקלטת תיקון מהדק.

Video: F1FO ATPase Vesicle Preparation and Technique for Performing Patch Clamp Recordings of Submitochondrial Vesicle Membranes

Patch Clamp Recordings from Mouse Retinal Neurons in a Dark-adapted Slice Preparation

Our visual experience is initiated when the visual pigment in our retinal photoreceptors absorbs photons of light energy and initiates a cascade of intracellular events that lead to closure of cyclic-nucleotide-gated channels in the cell membrane. The resulting change in membrane potential leads in turn to reductions in the amount of neurotransmitter release from both rod and cone synaptic terminals. To measure how the light-evoked change in photoreceptor membrane potential leads to downstream activity in the retina, scientists have made electrophysiological recordings from retinal slice preparations for decades1,2. In the past these slices have been cut manually with a razor blade on retinal tissue that is attached to filter paper; in recent years another method of slicing has been developed whereby retinal tissue is embedded in low gelling temperature agar and sliced in cool solution with a vibrating microtome3,4. This preparation produces retinal slices with less surface damage and very robust light-evoked responses. Here we document how this procedure can be done under infrared light to avoid bleaching the visual pigment.

Here we describe a procedure for generating dark-adapted slices of the mouse retina for electrophysiological recordings.

הצמד תיקון הקלטות מתא עצב עכבר רשתית בהכנת Dark המותאמות פרוסה

Our visual experience is initiated when the visual pigment in our retinal photoreceptors absorbs photons of light energy and initiates a cascade of ...

Paired Patch Clamp Recordings from Motor-neuron and Target Skeletal Muscle in Zebrafish

Larval zebrafish represent the first vertebrate model system to allow simultaneous patch clamp recording from a spinal motor-neuron and target muscle. This is a direct consequence of the accessibility to both cell types and ability to visually distinguish the single segmental CaP motor-neuron on the basis of morphology and location. This video demonstrates the microscopic methods used to identify a CaP motor-neuron and target muscle cells as well as the methodologies for recording from each cell type. Identification of the CaP motor-neuron type is confirmed by either dye filling or by the biophysical features such as action potential waveform and cell input resistance. Motor-neuron recordings routinely last for one hour permitting long-term recordings from multiple different target muscle cells. Control over the motor-neuron firing pattern enables measurements of the frequency-dependence of synaptic transmission at the neuromuscular junction. Owing to a large quantal size and the low noise provided by whole cell voltage clamp, all of the unitary events can be resolved in muscle. This feature permits study of basic synaptic properties such as release properties, vesicle recycling, as well as synaptic depression and facilitation. The advantages offered by this in vivo preparation eclipse previous neuromuscular model systems studied wherein the motor-neurons are usually stimulated by extracellular electrodes and the muscles are too large for whole cell patch clamp. The zebrafish preparation is amenable to combining electrophysiological analysis with a wide range of approaches including transgenic lines, morpholino knockdown, pharmacological intervention and in vivo imaging. These approaches, coupled with the growing number of neuromuscular disease models provided by mutant lines of zebrafish, open the door for new understanding of human neuromuscular disorders.

Larval zebrafish represent the first vertebrate model system to allow simultaneous patch clamp recording from a spinal motor-neuron and target skeletal muscle. This video demonstrates the microscopic methods used to identify a segmental CaP motor-neuron and target muscle cells as well as the methodologies for recording from each cell type.

מותאמים הצמד תיקון הקלטות מ-מוטור נוירון שרירים יעד השלד דג הזברה

Larval zebrafish represent the first vertebrate model system to allow simultaneous patch clamp recording from a spinal motor-neuron and target muscle.  ...

Culturing and Electrophysiology of Cells on NRCC Patch-clamp Chips

Due to its exquisite sensitivity and the ability to monitor and control individual cells at the level of ion channels, patch-clamping is the gold standard of electrophysiology applied to disease models and pharmaceutical screens alike 1. The method traditionally involves gently contacting a cell with a glass pipette filled by a physiological solution in order to isolate a patch of the membrane under its apex 2. An electrode inserted in the pipette captures ion-channel activity within the membrane patch or, when ruptured, for the whole cell. In the last decade, patch-clamp chips have been proposed as an alternative 3, 4: a suspended film separates the physiological medium from the culture medium, and an aperture microfabricated in the film replaces the apex of the pipette. Patch-clamp chips have been integrated in automated systems and commercialized for high-throughput screening 5. To increase throughput, they include the fluidic delivery of cells from suspension, their positioning on the aperture by suction, and automated routines to detect cell-to-probe seals and enter into whole cell mode. We have reported on the fabrication of a silicon patch-clamp chip with optimized impedance and orifice shape that permits the high-quality recording of action potentials in cultured snail neurons 6; recently, we have also reported progress towards interrogating mammalian neurons 7. Our patch-clamp chips are fabricated at the Canadian Photonics Fabrication Centre 8, a commercial foundry, and are available in large series. We are eager to engage in collaborations with electrophysiologists to validate the use of the NRCC technology in different models. The chips are used according to the general scheme represented in Figure 1: the silicon chip is at the bottom of a Plexiglas culture vial and the back of the aperture is connected to a subterranean channel fitted with tubes at either end of the package. Cells are cultured in the vial and the cell on top of the probe is monitored by a measuring electrode inserted in the channel.The two outside fluidic ports facilitate solution exchange with minimal disturbance to the cell; this is an advantage compared to glass pipettes for intracellular perfusion.
<img alt="Figure 1" src="/files/ftp_upload/3288/3288fig1.jpg" />
Figure 1. Principle of measurement using the NRCC patch-clamp chip
We detail here the protocols to sterilize and prime the chips, load them with medium, plate them with cells, and finally use them for electrophysiological recordings.

We show how planar patch-clamp chips fabricated at the National Research Council of Canada are sterilized, primed, loaded with medium, plated with cells, and used for electrophysiological recordings.

Culturing ו Electrophysiology של תאים על Patch-clamp צ&#39;יפס NRCC

Due to its exquisite sensitivity and the ability to monitor and control individual cells at the level of ion channels, patch-clamping is the gold standard ...

Patch Clamp Recordings in Inner Ear Hair Cells Isolated from Zebrafish

Patch clamp analyses of the voltage-gated channels in sensory hair cells isolated from a variety of species have been described previously1-4 but this video represents the first application of those techniques to hair cells from zebrafish. Here we demonstrate a method to isolate healthy, intact hair cells from all of the inner ear end-organs: saccule, lagena, utricle and semicircular canals. Further, we demonstrate the diversity in hair cell size and morphology and give an example of the kinds of patch clamp recordings that can be obtained. The advantage of the use of this zebrafish model system over others stems from the availability of zebrafish mutants that affect both hearing and balance. In combination with the use of transgenic lines and other techniques that utilize genetic analysis and manipulation, the cell isolation and electrophysiological methods introduced here should facilitate greater insight into the roles hair cells play in mediating these sensory modalities.

The purpose of this video is to demonstrate procedures for obtaining healthy, intact hair cells from the inner ear organs of adult zebrafish and then using them for patch clamp studies aimed at characterizing the biophysical properties of their voltage-gated channels.

הקלטות קלאמפ תיקון בתאי שיער באוזן פנימיים מבודדות מדג הזברה

Patch  clamp analyses of the voltage-gated channels in sensory hair cells isolated  from a variety of species have been described previously1-4 but this  ...

Isolation of Sensory Neurons of Aplysia californica for Patch Clamp Recordings of Glutamatergic Currents

The marine gastropod mollusk Aplysia californica has a venerable history as a model of nervous system function, with particular significance in studies of learning and memory. The typical preparations for such studies are ones in which the sensory and motoneurons are left intact in a minimally dissected animal, or a technically elaborate neuronal co-culture of individual sensory and motoneurons. Less common is the isolated neuronal preparation in which small clusters of nominally homogeneous neurons are dissociated into single cells in short term culture. Such isolated cells are useful for the biophysical characterization of ion currents using patch clamp techniques, and targeted modulation of these conductances. A protocol for preparing such cultures is described. The protocol takes advantage of the easily identifiable glutamatergic sensory neurons of the pleural and buccal ganglia, and describes their dissociation and minimal maintenance in culture for several days without serum.

Isolation of Sensory Neurons of Aplysia californica for Patch Clamp Recordings of Glutamatergic Currents

We describe the dissection of the nervous system of the marine sea hare Aplysia after anesthesia, the isolation of neurons for short term-tissue culture, and recordings of single cell ion currents via the patch clamp technique.

בידוד של נוירונים חושיים של<em&gt; Aplysia californica</em&gt; להקלטות מהדק תיקון של זרמי glutamatergic

The marine gastropod mollusk Aplysia californica has a venerable  history as a model of nervous system function, with particular significance in  studies ...

Patch Clamp Recordings from Embryonic Zebrafish Mauthner Cells

Mauthner cells (M-cells) are large reticulospinal neurons located in the hindbrain of teleost fish. They are key neurons involved in a characteristic behavior known as the C-start or escape response that occurs when the organism perceives a threat. The M-cell has been extensively studied in adult goldfish where it has been shown to receive a wide range of excitatory, inhibitory and neuromodulatory signals1. We have been examining M-cell activity in embryonic zebrafish in order to study aspects of synaptic development in a vertebrate preparation. In the late 1990s Ali and colleagues developed a preparation for patch clamp recording from M-cells in zebrafish embryos, in which the CNS was largely intact2,3,4. The objective at that time was to record synaptic activity from hindbrain neurons, spinal cord neurons and trunk skeletal muscle while maintaining functional synaptic connections within an intact brain-spinal cord preparation. This preparation is still used in our laboratory today. To examine the mechanisms underlying developmental synaptic plasticity, we record excitatory (AMPA and NMDA-mediated)5,6 and inhibitory (GABA and glycine) synaptic currents from developing M-cells. Importantly, this unique preparation allows us to return to the same cell (M-cell) from preparation to preparation to carefully examine synaptic plasticity and neuro-development in an embryonic organism. The benefits provided by this preparation include 1) intact, functional synaptic connections onto the M-cell, 2) relatively inexpensive preparations, 3) a large supply of readily available embryos 4) the ability to return to the same cell type (i.e. M-cell) in every preparation, so that synaptic development at the level of an individual cell can be examined from fish to fish, and 5) imaging of whole preparations due to the transparent nature of the embryos.

We have developed an intact brain-spinal cord preparation to record and monitor electrical activity via patch clamp recording from the Mauthner neurons and other reticulospinal cells in zebrafish embryos. Thus, we are able to record excitatory and inhibitory synaptic currents, voltage-gated channel activity and action potentials from key neurons in a developing embryo.

תיקון הקלטות קלאמפ מתאים עוברי דג הזברה מאוטנר

Mauthner cells (M-cells) are large  reticulospinal neurons located in the hindbrain of teleost fish. They are key  neurons involved in a characteristic ...

Whole-cell Patch-clamp Recordings from Morphologically- and Neurochemically-identified Hippocampal Interneurons

GABAergic inhibitory interneurons play a central role within neuronal circuits of the brain. Interneurons comprise a small subset of the neuronal population (10-20%), but show a high level of physiological, morphological, and neurochemical heterogeneity, reflecting their diverse functions. Therefore, investigation of interneurons provides important insights into the organization principles and function of neuronal circuits. This, however, requires an integrated physiological and neuroanatomical approach for the selection and identification of individual interneuron types. Whole-cell patch-clamp recording from acute brain slices of transgenic animals, expressing fluorescent proteins under the promoters of interneuron-specific markers, provides an efficient method to target and electrophysiologically characterize intrinsic and synaptic properties of specific interneuron types. Combined with intracellular dye labeling, this approach can be extended with post-hoc morphological and immunocytochemical analysis, enabling systematic identification of recorded neurons. These methods can be tailored to suit a broad range of scientific questions regarding functional properties of diverse types of cortical neurons.

Cortical networks are controlled by a small, but diverse set of inhibitory interneurons. Functional investigation of interneurons therefore requires targeted recording and rigorous identification. Described here is a combined approach involving whole-cell recordings from single or synaptically-coupled pairs of neurons with intracellular labeling, post-hoc morphological and immunocytochemical analysis.

הקלטות תיקון מהדק כל התא מMorphologically- וinterneurons היפוקמפוס זיהה Neurochemically

GABAergic inhibitory interneurons play a central role within neuronal circuits of the brain. Interneurons comprise a small subset of the neuronal ...

Whole-cell Patch-clamp Recordings in Brain Slices

Whole-cell patch-clamp recording is an electrophysiological technique that allows the study of the&#160;electrical properties of a substantial part of the neuron. In this configuration, the micropipette is in tight contact with the cell membrane, which prevents current leakage and thereby provides more accurate ionic current measurements than the previously used intracellular sharp electrode recording method. Classically, whole-cell recording can be performed on neurons in various types of preparations, including cell culture models, dissociated neurons, neurons in brain slices, and in intact anesthetized or awake animals. In summary, this technique has immensely contributed to the understanding of passive and active biophysical properties of excitable cells. A major advantage of this technique is that it provides information on how specific manipulations (e.g., pharmacological, experimenter-induced plasticity) may alter specific neuronal functions or channels in real-time. Additionally, significant opening of the plasma membrane allows the internal pipette solution to freely diffuse into the cytoplasm, providing means for introducing drugs, e.g., agonists or antagonists of specific intracellular proteins, and manipulating these targets without altering their functions in neighboring cells. This article will focus on whole-cell recording performed on neurons in brain slices,&#160;a preparation that has the advantage of recording neurons in relatively well preserved brain circuits, i.e., in a physiologically relevant context. In particular,&#160;when combined with appropriate pharmacology, this technique is a powerful tool allowing identification of specific neuroadaptations that occurred following any type of experiences, such as learning, exposure to drugs of abuse, and stress. In summary, whole-cell patch-clamp recordings in brain slices provide means to measure in ex vivo preparation long-lasting changes in neuronal functions that have developed in intact awake animals.

This protocol describes basic procedural steps for performing whole-cell patch-clamp recordings. This technique allows the study of&#160;the electrical behavior of neurons, and when performed in brain slices, allows the assessment of various neuronal functions from neurons that are still integrated in relatively well preserved brain circuits.

הקלטות תיקון מהדק כל תא פרוסות המוח

Whole-cell patch-clamp recording is an electrophysiological technique that allows the study of the&#160;electrical properties of a substantial part of the ...

Subcellular Patch-clamp Recordings from the Somatodendritic Domain of Nigral Dopamine Neurons

Dendrites of dopaminergic neurons receive and convey synaptic input, support action potential back-propagation and neurotransmitter release. Understanding these fundamental functions will shed light on the information transfer in these neurons. Dendritic patch-clamp recordings provide the possibility to directly examine the electrical properties of dendrites and underlying voltage-gated ion channels. However, these fine structures are not easily accessible to patch pipettes because of their small diameter. This report describes a step-by-step procedure to collect stable and reliable recordings from the dendrites of dopaminergic neurons in acute slices. Electrophysiological measurements are combined with post hoc recovery of cell morphology. Successful experiments rely on improved preparation of slices, solutions and pipettes, adequate adjustment of the optics and stability of the pipette in contact with the recorded structure. Standard principles of somatic patch-clamp recording are applied to dendrites but with a gentler approach of the pipette. These versatile techniques can be implemented to address various questions concerning the excitable properties of dendrites.

Subcellular patch-clamp recordings offer the possibility to investigate the functional properties of dendrites. However these fine structures are not easily accessible due to their small diameter. The protocol described here aims to facilitate the collection of stable and reliable recordings from the dendrites of dopamine neurons in slices in vitro.

הקלטות תיקון מהדק subcellular מן האחוזה Somatodendritic של נוירונים Nigral דופמין

Dendrites of dopaminergic neurons receive and convey synaptic input, support action potential back-propagation and neurotransmitter release. Understanding ...

Whole-cell Patch-clamp Recordings for Electrophysiological Determination of Ion Selectivity in Channelrhodopsins

Over the past decade, channelrhodopsins became indispensable in neuroscientific research where they are used as tools to non-invasively manipulate electrical processes in target cells. In this context, ion selectivity of a channelrhodopsin is of particular importance. This article describes the investigation of chloride selectivity for a recently identified anion-conducting channelrhodopsin of Proteomonas sulcata via electrophysiological patch-clamp recordings on HEK293 cells. The experimental procedure for measuring light-gated photocurrents demands a fast switchable &#8211; ideally monochromatic &#8211; light source coupled into the microscope of an otherwise conventional patch-clamp setup. Preparative procedures prior to the experiment are outlined involving preparation of buffered solutions, considerations on liquid junction potentials, seeding and transfection of cells, and pulling of patch pipettes. The actual recording of current-voltage relations to determine the reversal potentials for different chloride concentrations takes place 24 h to 48 h after transfection. Finally, electrophysiological data are analyzed with respect to theoretical considerations of chloride conduction.

This article describes how the ion selectivity of channelrhodopsin is determined with electrophysiological whole-cell patch-clamp recordings using HEK293 cells. Here, the experimental procedure for investigating chloride selectivity of an anion-selective channelrhodopsin is demonstrated. However, the procedure is transferable to other channelrhodopsins of distinct selectivity.