במאמר זה, אנו מתארים פרוטוקול מפורט עבור מודל יעיל של שריר ניוון שרירים Duchenne באמצעות MYOD1-המרה בתאי השתן כדי להעריך את השיקום של mrna הדיסטרופין ואת רמות החלבון לאחר דילוג קפיצה.
ניוון שרירים duchenne (DMD), מחלת שרירים מתקדמת וקטלנית, נגרמת על ידי מוטציות בגנים Dmd כי התוצאה העדר של חלבון הדיסטרופין. עד היום, השלמנו מחקר ראשון ביוזמת החוקרת במרכז הלאומי לנוירולוגיה ופסיכיאטריה על בסיס הזרקה מערכתית של מחלת האוליונואותים והדס אשר נוטה exon-53 דילוג. לטיפול יעיל של DMD, בדיקות חוץ גופית עם myoblasts נגזר מהחולים DMD למסך תרופות להעריך את הזכאות למטופל לפני התחייבות ניסויים קליניים הוא חשב חיוני. לאחרונה, אנו דיווחו תא חדש MYOD1-המרה של שתן (udc) מטופלים עם המעכב מתילייסטון מעכבי (3-deazaneplanocin a הידרוכלוריד), כמודל הסלולר של dmd. UDC חדש אוטוולוגי עשוי להראות פניאוסקופיה של מחלת הפנוטיפים ספציפיים של DMD, המוביל ליישום של רפואה מדויקת במגוון של מחלות הקשורות שרירים. במאמר זה, אנו מתארים פרוטוקול מפורט עבור מודל יעיל של תאי שריר DMD באמצעות MYOD1-udcs המרה יחד עם הפוכה הטרנססקריפט פולימראז התגובה שרשרת (RT-PCR), מערבי לחסום, ואימונוציטוטוכימיה כדי להעריך את השיקום של mrna הדיסטרופין ואת רמות החלבון לאחר לדלג דילוג.
ניוון שרירים duchenne (DMD), מחלת שרירים מתקדמת, קטלנית, נגרמת על ידי מוטציות משמרת מסגרת ב- Dmd גן כי התוצאה העדר חלבון הדיסטרופין1. מניעת טיפול מבוסס-הגאות מדלגת על תרפיה מבטיחה להיות מבטיח עבור DMD. טיפול זה מבוסס על ההמרה של DMD הפנוטיפ ביותר של בקר מתון ניוון שרירים כמו הפנוטיפ על ידי שינוי טרום mRNA שחבור לשחזר את מסגרת הקריאה Dmd 2. השלמנו לאחרונה מחקר הראשון של האדם המבוסס על חוזרות ונשנות של הממשל החוזר של זרחניות oliglllllllllllllllllllllle (pmo), אשר יכול לגרום אקסון 53 דילוג ב dmd, והפגינו פרופיל בטיחות מעולה,3יעילות מבטיחה 000010964,
עם זאת, כדי לפתח טיפולים חסכוניים ויעילים למחלה, בדיקות חוץ גופית שימוש בתאי שריר העיקרי שהתקבלו מחולים DMD חיוניים לסינון סמים ואימות זכאות החולה לפני התחייבות ניסויים קליניים, כמו גם בסמנים המשקפים את היעילות של מדלג על טיפולים במהלך ניסויים אנושיים4. לאחרונה, אנו דיווחו על טכנולוגיה הרומן כדי לפתח מטופלים ספציפיים MYOD1המרה תאים שמקורם בשתן (udcs)5,6 כמודל הראשי של מחוז myoblast7. כך, כדי ליצור את myoblasts, רק אוסף של שתן מחולים נדרש ולא הליך פולשני נדרש. במאמר זה, אנו מתארים פרוטוקול מפורט עבור מודל יעיל של שריר DMD באמצעות MYOD1המרה udcs מטופלים עם 3-deazaneplanocin הידרוכלוריד כדי להעריך את הדיסטרופין משוחזר mrna ו חלבון לאחר דילוג להקפיץ.
ועדת האתיקה של המרכז הלאומי לנוירולוגיה ופסיכיאטריה אישרה את המחקר (מזהה אישור: A2017-018, A2018-029). כל האנשים נתנו הסכמה מושכלת לפני מתן שתן. כל הניסויים נערכו תחת ההנחיות והתקנות הרלוונטיות.
1. בידוד ותרבות ראשית של UDCs
הערה: udcs היו מבודדים על פי פרוטוקול שפורסם בעבר8,9,10 עם כמה שינויים.
2. בניית ויראלי
3. זיהום עם MYOD1-retroviral וקטור udcs
4. הבידול היוגניים של MYOD1-התמרה-בקרי מקור מטופלים עם 3-deazanein הידרוכלוריד (DZNep)
הערה: לאחרונה, זה כבר דווח כי DZNep, מתילסטון היפואז מעכבי, יכול לקדם באופן משמעותי את הביטוי של מיוגנאין, אחד הגורמים הרגולטורים שריר מאוחר, וגם להוביל בידול שפופרת7.
5. exon דילוג ב- MYOD1המרה udcs
הערה: כאן, שלושה פרוטוקולים מתוארים כדי להעריך אקסון דילוג בתאי החולה-נגזר: 1) הפוכה הטרנססקריפט פולימראז תגובת שרשרת (RT-PCR) של הדיסטרופין mrna; 2) למחצה של אות חלבון הדיסטרופין משוחזר על ידי אבן חשופה מערבית; ו-3) למחצה של הדיסטרופין משוחזר של אות שוחזר על ידי אימונולוצינטוכימיה. כל השיטות יכולות לזהות מדלג בצורה תלוית-מינון.
נוכל לאסוף את האוקרי-משכל. בקלות ולא באופן פולשני UDCs הקימו מושבות בתוך שבוע לאחר תחילת תרבות התא העיקרי הבחנו יכולת ההתרבות מסומן. התרבות של UDCs היה פשוט, זיהום חיידקי או פטרייתי היה נדיר כאשר ההליך בוצע כראוי.
איור 2 מציג את הדמויות הייצוגיות לעומת זאת של מושבת ה-udc שבוע לאחר התרבות הראשית (איור 2א) ו- MYOD1-udc שבוע לאחר בידול (איור 2ב). איור 3 מציג את גילוי מוצלח של הדילוג אקסון ב udcs שהתקבלו מ-dmd חולים על ידי RT-PCR. איור 3מראה RT-PCR ניתוח של הדיסטרופין לאחר antisense הטיפול האנטי-והשפל ב dznep מטופלים MYOD1-udcs נגזר של גבר בן 6 עם אקסון 45-54 מחיקה ב dmd גן. מסגרת הקריאה הפתוחה שוחזרה באמצעות הקפיצה 44. ביום 14 בעקבות בידול, אנו אישר את האינדוקציה של אקסון לדלג בצורה תלוית מינון (איור 3ב). הלהקות העליונות מציינות מוצרים מקומיים, והלהקות הנמוכות יותר מציינות מוצרים שהמערכת דילגה עליהם מ44 שחזרו על מסגרת הקריאה הפתוחה.
איור 4 מציג את הזיהוי המוצלח של הדיסטרופין לאחר דילוג אקסון ב udcs שהתקבלו מ-dmd חולים על ידי המערב בצורה תלוית מינון. גילינו גם את הביטוי הדיסטרופין המשוחזר באמצעות אימונולוצינטוכימיה (איור 5). מדדנו את עוצמות הדיסטרופין עם מיקרוסקופ פלורסנט 1 שבוע לאחר ה96 החושים האנטי הגיוניות (ASO) על צלחת היטב (איור 5א). אותות פלורסנט גבוהים בהרבה נצפו ב- MYOD1-udcs שטופלו ב-aso מאשר ב- MYOD1-udcs שטופלו בבקרת aso (איור 5B).
תוצאות אלה מרמזות על כך שהחדש שלנו יכול להעריך אקסון מדלגת ביעילות ב- MYOD1-udcs שהתקבלו מ-dmd חולים ב-mrna וברמת החלבון.
איור 1: ייצוג סכמטי של מחסנית ההעברה לאבן חשופה מערבית למחצה. שני מסמכים שספוגים במאגר הכתמים הונחו בטרמינל השלילי, ושני ניירות שספוגים במאגר היו מוערמים על גבי זה. הג, אשר נספג במאגר, הונח בעדינות על קרום PVDF. אנא לחץ כאן כדי להציג גירסה גדולה יותר של איור זה.
איור 2: תמונות מייצגות של UDCs. (A) תמונת חדות פאזה של udcs שבוע לאחר התרבות הראשית. סרגל קנה מידה = 200 μm. שיבוץ: תמונה מוגדלת של האזור במלבן הלבן. (ב) תמונת חדות פאזה של MYOD1-udcs שבוע לאחר בידול. סרגל קנה מידה = 50 μm. דמות זו שונתה מתוך טקיזאווה ואח '7. אנא לחץ כאן כדי להציג גירסה גדולה יותר של איור זה.
איור 3: הערכה מוצלחת של הדילוג על האקסון בתאים שמקורם בשתן (UDCs) שהתקבלו מ-DMD חולים על ידי RT-PCR. (א) RT-PCR ניתוח של הדיסטרופין לאחר הטיפול נגד ההיגיון התרופה ב 3-deazaneplanocin הידרוכלוריד (dznep)-מטופלים MYOD1-udcs נגזר ניוון שרירים duchenne (dmd) החולה עם אקסון 45-54 מחיקה. DZNep מטופלים MYOD1-udcs טופלו גם עם השליטה antisense ב 1-10 μm ריכוז כפקדים. הלהקות העליונות היו בלתי מתויקות (Ex 45-54 מחיקה) שנשארה מחוץ למסגרת הקריאה. הלהקות הנמוכות יותר היו מוצרים 44 שהמערכת דילגה עליהם (לשעבר 44-54 מחיקה ו-Ex 44 שהמערכת דילגה עליהם) ששחזר את מסגרת הקריאה הפתוחה. (ב) דילוג על היעילות המחושבת כ 44 (התעתיק הנוכחי שהמערכת דילגה עליו)/(מקורי + אקסון 44-התעתיק המחושב [מסומן בחצים]) x 100% באמצעות מערכת אלקטרופורזה בשבב זעיר. בכיוון אחד של ANOVA ואחריו הבדיקה הפוסט-הוק של Bonferroni שימש כדי להשוות את מדלג היעילות (n = 3 עבור כל קבוצה, * * * * P < 0.0001). הנתונים מבוטאים כממוצע ± SEM. דמות זו שונתה מתוך טקיזאווה ואח '7. אנא לחץ כאן כדי להציג גירסה גדולה יותר של איור זה.
איור 4: הערכה מוצלחת של הדילוג על האקסון בתאים שמקורם בשתן (UDCs) מ-DMD חולים על ידי אבן חשופה מערבית. (א) הנציג המערבי כתם עבור הדיסטרופין ב dznep מטופלים MYOD1-udcs מהמטופל dmd עם אקסון 45-54 מחיקה לאחר אקסון 44 דילוג. לאיתור הדיסטרופין, אנטי הדיסטרופין (נגד C-terminal) נעשה שימוש. (ב) עוצמות התנועה היחסיות של הלהקות מנורמלות לביטוי α-טובולין הושוו בתאים שמקורם בחולים עם ובלי טיפול אנטי-מונותי באמצעות ביצוע ANOVA חד כיוון ואחריו בדיקת ההודעה הפוסט הוק של Bonferroni (n = 3 עבור כל קבוצה, * * P < 0.01, * * * p < 0.001, דמות זו שונתה מתוך טקיזאווה ואח '7. אנא לחץ כאן כדי להציג גירסה גדולה יותר של איור זה.
איור 5: החום מפות של אימונוציטוכימיה עבור הדיסטרופין לאחר antisense הטיפול האנטי-והשפל ב dznep מטופלים MYOD1-udcs שהתקבלו מחולה dmd עם אקסון 45-54 מחיקה. (A) מחיקה של אקסון 45-54 שוחזר את מסגרת הקריאה הפתוחה בהתבסס על דילוג אקסון של אקסון 44. (ב) עוצמת האות היתה בשימוש במיקרוסקופ פלורסנט לאחר 1 שבוע של אנטי-היגיון בשיטת ה96. בכיוון אחד ANOVA ואחריו הבדיקה הפוסט הוק של Bonferroni שימש השוואה (n = 3-4 עבור כל קבוצה, * * * * P < 0.0001). דמות זו שונתה מתוך טקיזאווה ואח '7. אנא לחץ כאן כדי להציג גירסה גדולה יותר של איור זה.
ריאגנט | אמצעי אחסון | ריכוז סופי |
2x PCR בכורה | 12.5 מיקרומטר | 1x |
פריימר קדימה | 5 כפול | 0.2 μM |
פריימר הפוכה | 5 כפול | 0.2 μM |
תבנית | 80 | |
מים מזוקקים מעוקרים | עד 25 μL | |
נפח כולל לכל תגובה | 25 μL |
טבלה 1: תערובת לMYOD1 הגברה על-ידי RT-PCR.
98 ° c | עשרה מנות | |
55 ° c | עשרה מנות | } 35 מחזורים |
72 ° c | עשרה מנות |
שולחן 2: התנאים עבור הציקלייר תרמית עבור MYOD1 הגברה.
ריאגנט | אמצעי אחסון |
מאגר 10x K | 2 מיקרומטר |
וקטור רטרונגיפי (500 ng/μL) | 2 מיקרומטר |
אנזים הגבלה 1 (2-ל -15 יו) | 1 ליטר |
אנזים הגבלה 2 (2-15 יו ') | 1 ליטר |
מים מזוקקים מעוקרים | 14 μL |
נפח כולל | 20 μL |
שולחן 3: תערובת לצינור לעכל וקטור הנגיף.
ריאגנט | אמצעי אחסון |
קטע MYOD1 מזוקק | 100 |
וקטור כפוף מתעכל | 100 |
5x אנזימים מראשות הבמה | 4 מיקרומטר |
מים מזוקקים מעוקרים | עד 20 μL |
נפח כולל | 20 μL |
שולחן 4: תערובת לתגובת שיבוט בהיתוך.
פתרון | אמצעי אחסון/היענות (μL) | ריכוז סופי |
מים בחינם | שתנה | - |
מאגר חד-PCR משלב אחד | 4 | 1x |
שילוב dNTP (המכיל 10 מ"מ של כל dNTP) | 0.8 | 400 מ"מ של כל dNTP |
פריימר קדימה (10 ממ) | 1.2 | 0.6 ממ ' |
פריימר הפוך (10 מ"מ) | 1.2 | 0.6 ממ ' |
שילוב אנזים חד-PCR | 0.8 | - |
מעכב RNase (אופציונלי) | שתנה | 5/10 יחידות/תגובות |
תבנית RNA | 50-400 מטרים | |
נפח כולל | 20 |
שולחן 5: תרכובות הכרחי לתגובה אחת של הצעד היחיד RT-PCR.
1 מחזור | תעתיק הפוך | 30 דקות | 50 ° c |
1 מחזור | שלב ההפעלה הראשונית של ה-PCR | 15 דקות | 95 ° c |
1 מחזור | דנטורציה | 1 דקות | 94 ° c |
ריפוי | 1 דקות | 60 ° c | |
סיומת | 1 דקות | 72 ° c | |
1 מחזור | הארכה סופית | 7 דקות | 72 ° c |
החזיק | ∞ | 4 מעלות צלזיוס |
שולחן 6: מצב של ציקלאה תרמי לשלב אחד RT-PCR.
ריאגנט | אמצעי אחסון |
חלבון (15 μg) | 10 מיקרומטר |
מאגר לדוגמה (4x) | 5 מיקרומטר |
הפחתת הסוכן (10x) | 2 מיקרומטר |
מים בדימוס | 3 מיקרומטר |
נפח כולל | 20 μL |
שולחן 7: הכנת דגימות עבור סודיום dodecyl סולפט פוליאקרילאמיד ג'ל לג (SDS-עמוד).
כאן, אנו מתארים פרוטוקול מפורט של דילוג אקסון ב- MYOD1המרה udcs שהתקבלו מ-dmd חולים. באמצעות מערכת השיטה, הוקרן רצפי החושים אופטימלית ביעילות. אנו מניחים כי UDCs המרה MYOD1יכול להיות שימושי עבור החקירה של פתופסיולוגיה של המחלה.
הערכת דילוג אקסון באמצעות החולים נגזר תאים ברמת mrna היא הכרחית להקרנה תרופות חדשות והערכת זכאות למטופל לפני התחייבות ניסויים קליניים. החישוב של האקסון דילוג היעילות ניתן להעריך רק ברמת mRNA.
הערכה של אקסון דילוג ברמת החלבון חשוב גם מכיוון שחזור הדיסטרופין חשוב כמו ביואריקר פונדקאית כדי לנבא את היתרונות של בדילוג אקסון. עד כה, הקרנת ההקרנה של אנטי הגיוני רצפי הגאות מבוצעת לעתים קרובות באמצעות קווי השריר הראשי או שורות התאים המוכאיים כולל בתאי התמס האדם (RD) תאים, אבל אנחנו לא יכולים למדוד את ההתאוששות של רמות הדיסטרופין באמצעות קווי תא שריר או תא RD קווי כי הם מבטאים את זה חלבון ב אנחנו יכולים בבירור לזהות את השחזור של הדיסטרופין ב-DMD החולה נגזר MYOD1-udcs באופן תלוי במינון. בתוך הכדאיות החדשה שלנו, אנו מחשיבים כי הערכת החלבון המשוחזר על ידי הכתמים המערביים מעולה בקוונפיבביליות. מצד שני, הערכה על ידי אימונוציטוכימיה באמצעות 96 צלחות היטב היא אידיאלית לסינון תרכובות מועמד רבים בו זמנית.
במאמר זה, אנו מתארים פרוטוקול מפורט עבור שריר DMD מודל יעיל באמצעות MYOD1-udcs המרה יחד עם RT-PCR, בלוק המערבי, ואימונוציטוטוכימיה להעריך את הדיסטרופין המשוחזר ב-mrna ורמות החלבון לאחר דילוג להקפיץ. ניתן לאסוף את UDCs באופן בלתי פולשני ובקלות. לכן, אנו מניחים כי החדש לחלוטין בשיטת החוץ הגופית ניתן להחיל על מגוון רחב של מחקרים בסיסיים וטרנסלבותית ללא קשר לסוג של הפרעות שרירים.
המרכז הלאומי של נוירולוגיה פסיכיאטריה מפתחת כעת NS-065/ncnp-01, אקסון 53 מדלגת על התרופה dmd, עם ניפון shinyaku ושות, בע מ.
עבודה זו נתמכת על ידי האגודה היפנית לקידום המדע המענק למחקר מדעי (C) [גרנט לא. 18K07544 כדי י. א. י., מענקים בסיוע למחקר על הפרעות עצבים ומנטליות [מענק 28-6 לי א], והסוכנות היפנית למחקר ופיתוח רפואי [גרנט nos. 18ek0109239h0002, 18lm0203066h0001, ו 18lm0203069h0001 לי א].
Name | Company | Catalog Number | Comments |
1% P/S Solution Stabilized | Thermo Fisher | 15070-063 | Cell culture |
Amphotericin B | Sigma Aldrich | A2942 | |
Anti-dystrophin | Abcam | ab15277 | Western blot (WB) |
Anti-dystrophin | Leica | NCL-DYS1 | Immunocytochemistry(ICC) |
Anti-mouse IgG, Dylight 488 | Vector Laboratories | DK-2488 | ICC |
Anti-α-tubulin | Sigma | T6199 | Western bot and ICC |
BZ-X800 | KEYENCE | BZ-800 | Fluorescent microscope |
CELLBANKER | ZENOAQ | CB011 | Cell stock in liquid nitrogen |
ChemiDoc MP Imaging System | Bio-Rad | 170-8280J1 | WB |
CloneAmp HiFi PCR premix | Clontech | 639298 | Retroviral production |
cOmplete Protease Inhibitor Cocktail | Roche | 4693116001 | Protein extraction for WB |
E.coli DH5 α Competent Cells | TAKARA | 9057 | |
ECL Prime Western Blotting Detection Reagent | GE healthcare | RPN2232 | WB |
EGF | Peprotech | AF-100-15 | Cell culture |
Endo-Porter | GeneTools | 2922498000 | ASO transfection |
Extra Thick Blot Filter Paper | Bio-Rad | 1703965 | WB |
EzFastBlot HMW | Atto | AE-1460 | WB |
fibroblast growth factor-basic | Sigma-Aldrich | F0291 | Cell culture |
Glutamax | Thermo Fisher Scientific | 35050-061 | Cell culture |
GP2-293 packaging cells | Clontech | 631458 | Retroviral production |
Ham's F-12 Nutrient Mix | Thermo Fisher Scientific | 11765-054 | Cell culture |
High glucose DMEM with GlutaMAX-I | Thermo Fisher Scientific | 10569-010 | Cell culture |
High glucose DMEM without sodium pyruvate | GE Healthcare | SH30022.01 | Cell culture |
HiSpeed Plasmid Purification Kit | QIAGEN | 12643 | Retroviral production |
Histofine Simple Stain MAX PO | NICHIREI BIOSCIENCE INC. | 424151 | WB |
Hoechst 33342 | Thermo Fisher Scientific | H3570 | ICC |
Human PDGF-AB | Peprotech | 100-00AB-10UG | Cell culture |
iBind Flex Solution | Thermo Fisher Scientific | SLF2020 | WB |
iBind Flex Western Device | Thermo Fisher Scientific | SLF2000 | WB (Automated mestern-processing device) |
Immobilon-P Transfer Membrane (PVDF) | MERCK | IPVH304F0 | WB |
In-Fusion HD cloning Kit | Clontech | 639648 | Retroviral production |
ITS Liquid Media Supplement | Sigma-Aldrich | I3146 | Cell culture |
MILTEX HV 0.45 μm filter | MERCK | SLHV033RS | Retroviral production |
MultiNA | SHIMADZU | MCE-202 | Microchip electrophoresis |
MYOD1 (GFP-tagged) | ORIGENE | RG209108 | Retroviral production |
NanoDrop | Thermo Fisher | ND-ONE-W | Spectrophotometer |
Nonessential amino acids | Thermo Fisher | 11140-050 | Cell culture |
NucleoSpin Gel and PCR Clean-Up Kit | Clontech | 740986.20 | PCR clean up |
NuPAGE 3-8% Tris-Acetate Protein Gels | Invitrogen | EA03785BOX | WB |
NuPAGE Antioxidant | Invitrogen | NP0005 | WB |
NuPAGE LDS Sample Buffer | Invitrogen | NP0007 | WB |
NuPAGE Sample Reducing Agent | Invitrogen | NP0009 | WB |
NuPAGE Tris-Acetate SDS Running Buffer | Invitrogen | LA0041 | WB |
One Step TB Green PrimeScript RT-PCR Kit | TAKARA | RR066A | Titer check of retroviral vector |
PBS | Thermo Fisher Scientific | 14190-250 | Cell culture |
Pierce BCA Protein Assay Kit | Thermo Scientific | 23227 | WB |
Polybrene Infection / Transfection Reagent | Sigma-Aldrich | TR-1003 | Retroviral infection |
pRetroX-TetOne-Puro Vector | Clontech | 634307 | Retroviral vecor |
Puromycin | Clontech | 631305 | Cell culture |
QIAGEN OneStep RT-PCR Kit | Qiagen | 210212 | PCR |
REGM Bullet Kit | Lonza | CC-3190 | Material for growth medium of UDCs |
REGM SingleQuots | Lonza | CC-4127 | Material for primary medium of UDCs |
Retrovirus Titer Set | TAKARA | 6166 | Titer check of retroviral vector |
Retro-X Concentrator | Clontech | 631455 | Retroviral production |
RIPA buffer | Thermo Fisher Scientific | 89901 | WB |
RNeasy kit | Qiagen | 74104 | RNA extraction for PCR |
Tetracycline-free foetal bovine serum | Clontech | 631106 | Cell culture |
Triton-X | MP Biomedicals | 9002-93-1 | ICC |
Trypsin-EDTA (0.05%) | Gibco | 25300054 | Cell culture |
XCell SureLock Mini-Cell | Invitrogen | EI0001 | WB |
Xfect transfection reagent | Clontech | 631317 | Transfection of plasmids into packaging cells |
Request permission to reuse the text or figures of this JoVE article
Request PermissionExplore More Articles
This article has been published
Video Coming Soon
Copyright © 2025 MyJoVE Corporation. All rights reserved