Sign In

In This Article

  • Summary
  • Abstract
  • Introduction
  • Protocol
  • תוצאות
  • Discussion
  • Disclosures
  • Acknowledgements
  • Materials
  • References
  • Reprints and Permissions

Summary

במאמר זה, אנו מתארים פרוטוקול מפורט עבור מודל יעיל של שריר ניוון שרירים Duchenne באמצעות MYOD1-המרה בתאי השתן כדי להעריך את השיקום של mrna הדיסטרופין ואת רמות החלבון לאחר דילוג קפיצה.

Abstract

ניוון שרירים duchenne (DMD), מחלת שרירים מתקדמת וקטלנית, נגרמת על ידי מוטציות בגנים Dmd כי התוצאה העדר של חלבון הדיסטרופין. עד היום, השלמנו מחקר ראשון ביוזמת החוקרת במרכז הלאומי לנוירולוגיה ופסיכיאטריה על בסיס הזרקה מערכתית של מחלת האוליונואותים והדס אשר נוטה exon-53 דילוג. לטיפול יעיל של DMD, בדיקות חוץ גופית עם myoblasts נגזר מהחולים DMD למסך תרופות להעריך את הזכאות למטופל לפני התחייבות ניסויים קליניים הוא חשב חיוני. לאחרונה, אנו דיווחו תא חדש MYOD1-המרה של שתן (udc) מטופלים עם המעכב מתילייסטון מעכבי (3-deazaneplanocin a הידרוכלוריד), כמודל הסלולר של dmd. UDC חדש אוטוולוגי עשוי להראות פניאוסקופיה של מחלת הפנוטיפים ספציפיים של DMD, המוביל ליישום של רפואה מדויקת במגוון של מחלות הקשורות שרירים. במאמר זה, אנו מתארים פרוטוקול מפורט עבור מודל יעיל של תאי שריר DMD באמצעות MYOD1-udcs המרה יחד עם הפוכה הטרנססקריפט פולימראז התגובה שרשרת (RT-PCR), מערבי לחסום, ואימונוציטוטוכימיה כדי להעריך את השיקום של mrna הדיסטרופין ואת רמות החלבון לאחר לדלג דילוג.

Introduction

ניוון שרירים duchenne (DMD), מחלת שרירים מתקדמת, קטלנית, נגרמת על ידי מוטציות משמרת מסגרת ב- Dmd גן כי התוצאה העדר חלבון הדיסטרופין1. מניעת טיפול מבוסס-הגאות מדלגת על תרפיה מבטיחה להיות מבטיח עבור DMD. טיפול זה מבוסס על ההמרה של DMD הפנוטיפ ביותר של בקר מתון ניוון שרירים כמו הפנוטיפ על ידי שינוי טרום mRNA שחבור לשחזר את מסגרת הקריאה Dmd 2. השלמנו לאחרונה מחקר הראשון של האדם המבוסס על חוזרות ונשנות של הממשל החוזר של זרחניות oliglllllllllllllllllllllle (pmo), אשר יכול לגרום אקסון 53 דילוג ב dmd, והפגינו פרופיל בטיחות מעולה,3יעילות מבטיחה 000010964,

עם זאת, כדי לפתח טיפולים חסכוניים ויעילים למחלה, בדיקות חוץ גופית שימוש בתאי שריר העיקרי שהתקבלו מחולים DMD חיוניים לסינון סמים ואימות זכאות החולה לפני התחייבות ניסויים קליניים, כמו גם בסמנים המשקפים את היעילות של מדלג על טיפולים במהלך ניסויים אנושיים4. לאחרונה, אנו דיווחו על טכנולוגיה הרומן כדי לפתח מטופלים ספציפיים MYOD1המרה תאים שמקורם בשתן (udcs)5,6 כמודל הראשי של מחוז myoblast7. כך, כדי ליצור את myoblasts, רק אוסף של שתן מחולים נדרש ולא הליך פולשני נדרש. במאמר זה, אנו מתארים פרוטוקול מפורט עבור מודל יעיל של שריר DMD באמצעות MYOD1המרה udcs מטופלים עם 3-deazaneplanocin הידרוכלוריד כדי להעריך את הדיסטרופין משוחזר mrna ו חלבון לאחר דילוג להקפיץ.

Protocol

ועדת האתיקה של המרכז הלאומי לנוירולוגיה ופסיכיאטריה אישרה את המחקר (מזהה אישור: A2017-018, A2018-029). כל האנשים נתנו הסכמה מושכלת לפני מתן שתן. כל הניסויים נערכו תחת ההנחיות והתקנות הרלוונטיות.

1. בידוד ותרבות ראשית של UDCs

הערה: udcs היו מבודדים על פי פרוטוקול שפורסם בעבר8,9,10 עם כמה שינויים.

  1. איסוף דגימות שתן במהלך micturition ספונטנית בבקבוקי פלסטיק מעוקר.
    הערה: אין צורך בעיקור של פתח השופכה החיצוני. מידסטרים שתן רצוי כדי להפחית את הסיכון של זיהום נגיפי. אם זמן המניה לפני ההליך הבא הוא > 1 h, יש להעביר דגימות שתן ל-4 ° צ' כדי לשמר את הכדאיות של התא. עם זאת, יש להימנע מטמפרטורה של < 4 ° צ' מכיוון שעלולים להופיע מאיצים לא מסיסים.
  2. צנטריפוגה את דגימת השתן כולה ב 400 x g עבור 10 דקות בטמפרטורת החדר.
  3. . משאיר 1 מ ג בשפופרת
  4. השהה מחדש את כדורי בנפרד 1 mL של שתן ולאחר מכן לאסוף אותם בצינור 50 mL אחת.
  5. הוסף 10 מ ל של מאגר כביסה המורכב 99 mL של PBS ללא סידן ומגנזיום, 1% פניצילין/סטרפטומיצין (P/S), 0.5 μg/mL אמפוריטיצין B, ו צנטריפוגה את הדגימות ב 200 x g עבור 10 דקות בטמפרטורת החדר.
  6. משאיר 0.2 mL. בצינור הקירור
  7. השהה מחדש את כדורי התא ב 4.5 mL של המדיום הראשי מורכב מתערובת 1:1 של גלוקוז גבוה בינונית משתנה הנשר של מדיום (DMEM) בלי סודיום פירובט ו-F-12 מזון מזינים של Ham שיושלם עם גורם גידול באפידרמיס האנושי רקומביננטי (EGF), אינסולין, הידרוקורטיזון, אדרנלין, T3, העברת, 10% טטרציקלין-סרום העוברי בחינם (FBS), 1% P/S, ו 0.5 μg/mL אמפוריטיצין B.
  8. הזרע את התאים בשלוש בארות של טין מצופה שש צלחות היטב (נפח כולל של כל טוב, 1.5 mL). מחולל תרבות ב 37 ° צ' ו 5% CO2 עבור 24 שעות.
  9. הוסף 1.5 mL של המדיום הראשי מדי יום עבור 3 הימים הבאים.
  10. ביום 4, להחליף את המדיום עם 1.5 mL של גידול בינוני שיושלם עם EGF אדם רקומביננטי, אינסולין, הידרוקורטיזון, אדרנלין, T3, transferrin, 15% טטרציקלין-FBS חינם, 0.5% L-אלנין-L-גלוטמין, 0.5% חומצות אמינו לא חיוניות, ו 2.5 ng/mL פיברופיצוץ פקטור גידול-בסיסי (bFGF), רקומביננטי האדם הנגזר טסיות גורם גידול (PDGF), EGF, ו 1% P/S.
  11. . לשנות את אמצעי הגדילה כל יום
    הערה: מושבות UDC מופיעות בתוך שבוע.
  12. כאשר התרבות UDC הופך 80 על 90% confluent, להסיר את המדיום ולשטוף את התאים עם PBS, לפצל את כל התאים באמצעות 0.25% טריפסין-EDTA והזרע ב 3000-5000 תאים/ס"מ2 אל המנה החדשה טין מצופה 60 מ"מ (מעבר 1).
    הערה: ניתן לאחסן את UDCs בחנקן נוזלי. UDCs מחולקים בדרך כלל ב 60 לפחות 70% השטף ב-60 מ"מ צלחת התרבות לתוך שלוש צינורות מלאי.

2. בניית ויראלי

  1. ההגביר את אזור הקידוד של MYOD1 (NM_002478 .4) פלמיד על ידי תגובת שרשרת פולימראז (PCR).
    הערה: התערובת לMYOD1 הגברה ותנאים עבור הציקלייר התרמי מוצגים בטבלה 1 ובטבלה 2, בהתאמה.
  2. לזהות להקה אחת של כ 1,000 בגודל bp על ידי 0.7% agarose ג'ל אלקטרופורזה באמצעות 1 μL של מוצר ה-PCR המוגבר כדי לוודא שרצף MYOD1 מוגבר בהצלחה.
  3. נקו את מוצר ה-PCR בעזרת ערכת הניקוי וקבעו את הריכוז שלו בעזרת ספקטרוסקופיה.
  4. מודדת את התערובת כפי שמוצג בטבלה 3 ב 37 ° c לילה כדי לעכל וקטור הretroviral יעיל עם מערכת ט-on ו-גן עמיד בפני אנזימים הגבלה אזורים ממוקדים באתר שיבוט מרובים.
  5. לזהות להקה אחת על ידי 0.7% agarose ג'ל אלקטרופורזה באמצעות 1 μL של המוצר מתעכל כדי לאשר כי וקטור retroviral יעיל היה מתעכל בהצלחה.
  6. נקה את המוצר מתעכל באמצעות לנקות את ערכת ולקבוע את הריכוז שלה על ידי ספקטרוסקופיה.
  7. כדי לשכפל את הקטע MYOD1 מוגבר (מופק על ידי שלבים 2.1-2.3) לתוך וקטור retroviral יעיל מתעכל (המיוצר על ידי שלבים 2.4-2.6), לבצע תגובת שיבוט ב-fusion. הגדר את התגובה כפי שמוצג בטבלה 4, מגדיר את התגובה עבור 15 דקות ב 50 ° c, ולאחר מכן מקום על הקרח.
  8. בצע טרנספורמציה באמצעות התאים המוסמכים של E. coli לפי הוראות היצרן (טבלת חומרים).
  9. בחר את התאים המוסמכים השתנה על ידי culturing על צלחת תרבות LB המורכב 10 g/L bacto טריטונים, 5 g/L bacto תמצית שמרים, 5 g/L הרוג, 15 g/L bacto אגר, ו 50 mg/L אמפיצילין.
  10. להרים את המושבה הנבחרת ואת התרבות ליברות בינונית תרבות ללא bacto אגר ב 200 rpm ב 37 ° c לילה.
  11. לטהר את הווקטורים הMYOD1-שנוספו באמצעות ערכת טיהורפלבאמצע (טבלת חומרים) וככמת באמצעות ספקטרוסקופיה.
  12. ודא כי MYOD1 מוכנס כראוי לתוך וקטור retroviral יעיל ידי רצף ישיר של מוצר ה-PCR מוגבר על ידי המטרה התחל והפוכה בהתאמה משני הצדדים על פני רצף MYOD1 שנוספו.
    הערה: ניתן להבחין ברצף MYOD1 בין רצפים וקטוריים מבוססי כששיבוט ההיתוך מצליח.
  13. עבור ייצור retroviral יעיל, הזרע את התאים האריזות ב 50,000 תאים/cm2 על 10 ס מ מצופה קולגן לוחות ותרבות ב dmem עם 10% fbs מחולל לחות ב 37 ° צ' ו 5% CO2 עבור 24 h.
  14. כאשר התאים האריזות מתרבים 80% שליטה, לערבב 30 μg של MYOD1וקטורים retroviral יעיל שנוספו, 30 μg של וקטורים אריזה, ומגיב העברה המכיל פפטיד תאים (טבלה של חומרים) על ידי vortexing, ו דגירה אותם עבור 10 דקות.
  15. הוסיפו את התערובת המועבדתית למדיום של תאי אריזה ומחולל תרבות ב37 ° c ו-5% CO2.
    הערה: ציפוי קולגן הכרחי. החצייה יכולה להיות טובה יותר ב -24 שעות או יותר לאחר זריעה, מכיוון שאריזת תאים מתנתק בקלות מלוחית התרבות.
  16. לאחר 4 שעות או לילה, לשנות את המדיום לגידול טרי בינוני.
  17. לאסוף את supernatant ויראלי ולהחליף עם בינוני טרי ב 24 ו 48 h לאחר הזיהום ולשלב את סופרנטאנט.
  18. כדי לרכז את supernatant ויראלי, לערבב אותו עם מרכז מגיב ו דגירה ב 37 ° c לילה, ואז צנטריפוגה ב 1,500 x g עבור 45 min ב 4 ° c.
  19. לסנן את הרטרו וירוס על ידי מסנן pvdf עם נקבוביות 0.45 יקרומטר.
  20. בדוק את סיכוייו של וקטור retroviral יעיל באמצעות ערכת PCR כמותי מערכת ציקלer תרמית על פי הוראות היצרן.
  21. הפרד את הסופר הנגיפי לתוך מניות קטנות ומפצל אותם ב-80 ° c.

3. זיהום עם MYOD1-retroviral וקטור udcs

  1. הזרע את UDCs ב 3000-5000 תאים/cm2 על טין מצופה 60 mm צלחת.
  2. לאחר 24 שעות של זריעה, להדביק את הרטרו המוברג (שלב 2.21) בריבוי של זיהום של 200 על ידי הוספת hexadime, ברומיד בריכוז של 8 μg/mL.
  3. לאחר מחולל הדגירה של 24 שעות על 37 ° c ו-5% CO2, להחליף את בינונית התרבות עם בינוני גדילה טריים המכיל 1 μg/mL puromycin כדי לבחור את התאים הMYOD1-התמרה. . לשנות את המדיום כל יום
    הערה: בעת בחירה עבור תאים MYOD1, 1 Μg/mL puromycin משמש בדרך כלל לבחירה. יש לקבוע את המינון המתאים. השתמש בצלחת המכילה תאים בלתי מבוקר ובחר את המינון שהורג את כל התאים בתוך 3-5 ימים. MYOD1-תאים חיוביים יש לבחור בתוך 7-10 ימים לאחר הוספת puromycin. ניתן לאחסן את ה- MYOD1dc בחנקן נוזלי.

4. הבידול היוגניים של MYOD1-התמרה-בקרי מקור מטופלים עם 3-deazanein הידרוכלוריד (DZNep)

הערה: לאחרונה, זה כבר דווח כי DZNep, מתילסטון היפואז מעכבי, יכול לקדם באופן משמעותי את הביטוי של מיוגנאין, אחד הגורמים הרגולטורים שריר מאוחר, וגם להוביל בידול שפופרת7.

  1. צלחת MYOD1-התמרה dc בארות מצופה קולגן בצפיפות של 3.5 x 104 תאים/cm2. מחולל תרבות ב-37 ° c ו-5% CO2.
  2. לאחר 24 שעות, לשנות את מדיום הצמיחה כדי בידול בינוני מורכב הסוכר גבוה הגלוקוז עם L-alanine-L-גלוטמין, 5% סרום סוסים, התוספת שלה, 1 μg/mL דוקסיציקלין, ו 5 μM DZNep.
    הערה: הפתרון 10 מ"מ DZNep ניתן לאחסן ב-80 ° c עבור 3 חודשים. להשתמש במקפיא להפשיר ולהימנע חוזרות ההפשרה מחזורים. שני MYOD1 מופעל על ידי דוקסיציקלין ו DZNep לדכא התפשטות ולקדם את הבידול מיוגניים של udcs. לכן, מומלץ כי דוקסיציקלין ו DZNep נוספו לאחר אינדוקציה של בידול מיוגני. DZNep מקדמת בידול מיוגני של MYOD1-udcs באופן תלוי-מינון. מצד שני, זה מראה על רעילות. ציטובית בריכוז גבוה לכן, לקבוע את הריכוז המתאים של DZNep, החל 1-10 μM בהתאם להשפעות שלה על בידול מיוגני וזמינות הסלולר.
  3. לאחר 3 ימים, לשנות את המדיום בידול מדיום בידול טרי ללא DZNep. ואז, לשנות את המדיום כל 3 ימים.
    הערה: מיזוג של UDCs זה לזה והטופס מיוכן בתוך 1 עד 2 שבועות לאחר בידול.

5. exon דילוג ב- MYOD1המרה udcs

הערה: כאן, שלושה פרוטוקולים מתוארים כדי להעריך אקסון דילוג בתאי החולה-נגזר: 1) הפוכה הטרנססקריפט פולימראז תגובת שרשרת (RT-PCR) של הדיסטרופין mrna; 2) למחצה של אות חלבון הדיסטרופין משוחזר על ידי אבן חשופה מערבית; ו-3) למחצה של הדיסטרופין משוחזר של אות שוחזר על ידי אימונולוצינטוכימיה. כל השיטות יכולות לזהות מדלג בצורה תלוית-מינון.

  1. הערכה של האקסון מדלג על יעילות על-ידי RT-PCR
    1. כדי להפוך את ה- MYOD1מחלת החלבון (aso) לתוך ה-udcs המרה של מטופלים ביום 7 לאחר בידול, לערבב ASO, מגיב העברה (טבלת חומרים), ובידול בינונית לריכוז הסופי של 1-10 מעלות μm. תרבות לחות על 37 ° c ו 5% CO2.
    2. לאחר 72 h של דגירה עם ASO, לשנות את המדיום בינוני בידול טרי ללא אסו.
    3. החל מ 3-7 ימים לאחר הוצאת ה-ASO, הסר בידול בינוני ושטוף 1x עם PBS. הוסף מאגר פירוק תאים, לאחר UDCs והקציר הכולל RNA באמצעות ערכת החילוץ RNA.
    4. למדוד את הריכוז RNA עם ספקטרוסקופיה.
    5. לשלב את הריאגנטים הנדרש עבור תגובה אחת RT-PCR בצינורות PCR לפי שולחן 5.
    6. הניחו את צינורות ה-PCR עם התערובת בציקליית התרמוטראה. , הפעל את הציקלהתרמי. לפי שולחן 6
    7. לבצע אלקטרופורזה שבב ולחשב את האקסון מדלג על יעילות באמצעות ריכוז מולרי מתחת.
      Exon מדלגת על היעילות (100%)
      הערה: אחסן את מוצר ה-PCR במקרר ב-4 ° c לאחסון לטווח קצר או 20 ° c לאחסון לטווח ארוך.
  2. זיהוי של הדיסטרופין לאחר דילוג על ידי בסיס מערבי
    1. מעבר ל-ASO ותרבות MYOD1-udcs לפי שלבים 5.1.1 ו5.1.2.
    2. . להחליף את המדיום כל 3 ימים
    3. לאחר 2 שבועות של בידול, לחלץ את החלבון הכולל מתאים מתורבת באמצעות radioimmunoprecipitation מאגר (ריפה) המכיל מעכבי פרוטאז.
    4. Sonicate lysates על קרח וצנטריפוגה ב 14,000 x g עבור 15 דקות ב 4 ° c.
    5. לאסוף את סופרנטנט ולקבוע ריכוזי חלבון באמצעות ערכת שיטת החלבון BCA.
    6. הוסף 15 μg של חלבון מוחלט בצינור 0.5 mL ולדלל על ידי הוספת מאגר ריפה המכיל מעכבי פרוטאז לנפח הכולל של 10 μL. לרוץ 15 μg של חלבון מוחלט למסלול.
    7. הוסף מאגר לדוגמה, הפחתת הסוכן והמים האחרים כפי שמוצג בטבלה 7. הספרות הסלולרית מייעלות. ב-70 ° c במשך 10 דקות
    8. להכין את מאגר אצטט-tris פועל המכיל 8.95 g/L tricine, 6.06 g/L טריס בסיס, 1.0 g/L נתרן dodecyl סולפט (SDS).
    9. לטעון את המדגם (20 μL) אל טריס-אצטט 3 על 8% ג'ל ולבצע אלקטרופורזה ב 150 V עבור 75 דקות.
    10. הכן את מאגר הכתמים ללא מתנול.
    11. להשרות את קרום PVDF עבור 20 s ב מתנול ולאחר מכן במאגר לחסום עד השימוש (לפחות 10 דקות). חותכים את קרום PVDF לגודל של 6 x 8 ס מ באמצעות ג'לים מיני ו 8 x 12 ס מ באמצעות ג'לים midi.
    12. חותכים את הניירות לחסום בגודל זהה לזה של קרום PVDF ולהשרות את אלה במאגר לחסום עד השימוש.
    13. לאחר האלקטרופורזה, חותכים את הג לאותו גודל של קרום PVDF ומשרים את הג'ל במים מזוקקים.
    14. מניחים את הניירות הבלושים, קרום PVDF, ו ג'ל על מנגנון העברה חצי יבש (איור 1). העברה ב 4 mA/cm2 עבור 30 דקות.
    15. שטפו את הממברנה 2x עם מים מזוקקים.
    16. להכין אנטי הדיסטרופין (1:500) ו anti-α-טובולין (1:1200) נוגדן כמו נוגדנים העיקרי.
    17. הכינו את הנוגדן האנטי-עכבר מצועם (1:100) כנוגדן משני.
    18. מודיית את הקרומים עם נוגדנים העיקרי, לשטוף עם מאגר לשטוף, ולאחר מכן דגירה עם הנוגדן המשני באמצעות מכשיר אוטומטי עיבוד מערבי (טבלת חומרים) בטמפרטורת החדר.
      הערה: אנטי-α-טובולין נוגדן משמש בדרך כלל כבקרת טעינה. פתרונות הנוגדן העיקריים המעורבים, כולל 1:500 נגד הדיסטרופין ו 1:1200 anti-α-טובולין נוגדנים לעבוד היטב כאשר תגובת הנוגדן מבוצעת בו זמנית.
    19. שטפו את הקרום במים מזוקקים.
    20. לזהות את החלבונים באמצעות זיהוי כימול מגיב המכשיר מצמידים חיוב (CCD) מצלמה מבוססי imager.
    21. נתח את הנתונים באמצעות תוכנה מתאימה.
  3. זיהוי של הדיסטרופין לאחר דילוג על ידי אימונוציטוטוכימיה
    1. מתכנת באופן ישיר את ה-UDCs לתוך מיופופרות ב-96 לוחית מצופה קולגן על פי שלבים 4.1-4.3.
    2. העברה של ה-ASO והתרבות MYOD1-udcs בהתאם לשלבים 5.1.2 ו5.1.3.
    3. לאחר 2 שבועות של בידול, לשטוף את התאים עם PBS ולתקן אותם ב 4% פאראפורמלדהיד עבור 10 דקות ב 4 ° c.
    4. חדירות MYOD1-udcs ב 0.1% nonionic ניקוי עבור 10 דקות בטמפרטורת החדר ולחסום את אלה עם 10% סרום עז עבור 15 דקות ב 37 ° c.
    5. מודיית את התאים עם נוגדן העיקרי לילה ב 4 ° c.
    6. לשטוף את התאים עם PBS ו המדגירה אלה עם הנוגדן המשני עבור 30 דקות בטמפרטורת החדר.
      הערה: כאן, עכבר נגד הדיסטרופין (1:30) משמש כנוגדן העיקרי, אנטי עכבר IgG משמש את הנוגדן המשני, ו Hoechst (1:10000) משמש לצביעת גרעינים.
    7. תמונה לוחות באמצעות מיקרוסקופ פלורסנט ולהשתמש מנתח כדי לחצי לכמת את האות הניאון באופן אוטומטי בכל טוב תחת באותו מצב.

תוצאות

נוכל לאסוף את האוקרי-משכל. בקלות ולא באופן פולשני UDCs הקימו מושבות בתוך שבוע לאחר תחילת תרבות התא העיקרי הבחנו יכולת ההתרבות מסומן. התרבות של UDCs היה פשוט, זיהום חיידקי או פטרייתי היה נדיר כאשר ההליך בוצע כראוי.

איור 2 מציג את הדמויות הייצוגיות לעומת זאת של מושבת ה-udc שבוע לאחר התרבות הראשית (איור 2א) ו- MYOD1-udc שבוע לאחר בידול (איור 2ב). איור 3 מציג את גילוי מוצלח של הדילוג אקסון ב udcs שהתקבלו מ-dmd חולים על ידי RT-PCR. איור 3מראה RT-PCR ניתוח של הדיסטרופין לאחר antisense הטיפול האנטי-והשפל ב dznep מטופלים MYOD1-udcs נגזר של גבר בן 6 עם אקסון 45-54 מחיקה ב dmd גן. מסגרת הקריאה הפתוחה שוחזרה באמצעות הקפיצה 44. ביום 14 בעקבות בידול, אנו אישר את האינדוקציה של אקסון לדלג בצורה תלוית מינון (איור 3ב). הלהקות העליונות מציינות מוצרים מקומיים, והלהקות הנמוכות יותר מציינות מוצרים שהמערכת דילגה עליהם מ44 שחזרו על מסגרת הקריאה הפתוחה.

איור 4 מציג את הזיהוי המוצלח של הדיסטרופין לאחר דילוג אקסון ב udcs שהתקבלו מ-dmd חולים על ידי המערב בצורה תלוית מינון. גילינו גם את הביטוי הדיסטרופין המשוחזר באמצעות אימונולוצינטוכימיה (איור 5). מדדנו את עוצמות הדיסטרופין עם מיקרוסקופ פלורסנט 1 שבוע לאחר ה96 החושים האנטי הגיוניות (ASO) על צלחת היטב (איור 5א). אותות פלורסנט גבוהים בהרבה נצפו ב- MYOD1-udcs שטופלו ב-aso מאשר ב- MYOD1-udcs שטופלו בבקרת aso (איור 5B).

תוצאות אלה מרמזות על כך שהחדש שלנו יכול להעריך אקסון מדלגת ביעילות ב- MYOD1-udcs שהתקבלו מ-dmd חולים ב-mrna וברמת החלבון.

figure-results-2139
איור 1: ייצוג סכמטי של מחסנית ההעברה לאבן חשופה מערבית למחצה. שני מסמכים שספוגים במאגר הכתמים הונחו בטרמינל השלילי, ושני ניירות שספוגים במאגר היו מוערמים על גבי זה. הג, אשר נספג במאגר, הונח בעדינות על קרום PVDF. אנא לחץ כאן כדי להציג גירסה גדולה יותר של איור זה.

figure-results-2657
איור 2: תמונות מייצגות של UDCs. (A) תמונת חדות פאזה של udcs שבוע לאחר התרבות הראשית. סרגל קנה מידה = 200 μm. שיבוץ: תמונה מוגדלת של האזור במלבן הלבן. (ב) תמונת חדות פאזה של MYOD1-udcs שבוע לאחר בידול. סרגל קנה מידה = 50 μm. דמות זו שונתה מתוך טקיזאווה ואח '7. אנא לחץ כאן כדי להציג גירסה גדולה יותר של איור זה.

figure-results-3290
איור 3: הערכה מוצלחת של הדילוג על האקסון בתאים שמקורם בשתן (UDCs) שהתקבלו מ-DMD חולים על ידי RT-PCR. (א) RT-PCR ניתוח של הדיסטרופין לאחר הטיפול נגד ההיגיון התרופה ב 3-deazaneplanocin הידרוכלוריד (dznep)-מטופלים MYOD1-udcs נגזר ניוון שרירים duchenne (dmd) החולה עם אקסון 45-54 מחיקה. DZNep מטופלים MYOD1-udcs טופלו גם עם השליטה antisense ב 1-10 μm ריכוז כפקדים. הלהקות העליונות היו בלתי מתויקות (Ex 45-54 מחיקה) שנשארה מחוץ למסגרת הקריאה. הלהקות הנמוכות יותר היו מוצרים 44 שהמערכת דילגה עליהם (לשעבר 44-54 מחיקה ו-Ex 44 שהמערכת דילגה עליהם) ששחזר את מסגרת הקריאה הפתוחה. (ב) דילוג על היעילות המחושבת כ 44 (התעתיק הנוכחי שהמערכת דילגה עליו)/(מקורי + אקסון 44-התעתיק המחושב [מסומן בחצים]) x 100% באמצעות מערכת אלקטרופורזה בשבב זעיר. בכיוון אחד של ANOVA ואחריו הבדיקה הפוסט-הוק של Bonferroni שימש כדי להשוות את מדלג היעילות (n = 3 עבור כל קבוצה, * * * * P < 0.0001). הנתונים מבוטאים כממוצע ± SEM. דמות זו שונתה מתוך טקיזאווה ואח '7. אנא לחץ כאן כדי להציג גירסה גדולה יותר של איור זה.

figure-results-4601
איור 4: הערכה מוצלחת של הדילוג על האקסון בתאים שמקורם בשתן (UDCs) מ-DMD חולים על ידי אבן חשופה מערבית. (א) הנציג המערבי כתם עבור הדיסטרופין ב dznep מטופלים MYOD1-udcs מהמטופל dmd עם אקסון 45-54 מחיקה לאחר אקסון 44 דילוג. לאיתור הדיסטרופין, אנטי הדיסטרופין (נגד C-terminal) נעשה שימוש. (ב) עוצמות התנועה היחסיות של הלהקות מנורמלות לביטוי α-טובולין הושוו בתאים שמקורם בחולים עם ובלי טיפול אנטי-מונותי באמצעות ביצוע ANOVA חד כיוון ואחריו בדיקת ההודעה הפוסט הוק של Bonferroni (n = 3 עבור כל קבוצה, * * P < 0.01, * * * p < 0.001, דמות זו שונתה מתוך טקיזאווה ואח '7. אנא לחץ כאן כדי להציג גירסה גדולה יותר של איור זה.

figure-results-5535
איור 5: החום מפות של אימונוציטוכימיה עבור הדיסטרופין לאחר antisense הטיפול האנטי-והשפל ב dznep מטופלים MYOD1-udcs שהתקבלו מחולה dmd עם אקסון 45-54 מחיקה. (A) מחיקה של אקסון 45-54 שוחזר את מסגרת הקריאה הפתוחה בהתבסס על דילוג אקסון של אקסון 44. (ב) עוצמת האות היתה בשימוש במיקרוסקופ פלורסנט לאחר 1 שבוע של אנטי-היגיון בשיטת ה96. בכיוון אחד ANOVA ואחריו הבדיקה הפוסט הוק של Bonferroni שימש השוואה (n = 3-4 עבור כל קבוצה, * * * * P < 0.0001). דמות זו שונתה מתוך טקיזאווה ואח '7. אנא לחץ כאן כדי להציג גירסה גדולה יותר של איור זה.

ריאגנטאמצעי אחסוןריכוז סופי
2x PCR בכורה12.5 מיקרומטר1x
פריימר קדימה5 כפול0.2 μM
פריימר הפוכה5 כפול0.2 μM
תבנית80
מים מזוקקים מעוקריםעד 25 μL
נפח כולל לכל תגובה25 μL

טבלה 1: תערובת לMYOD1 הגברה על-ידי RT-PCR.

98 ° cעשרה מנות
55 ° cעשרה מנות} 35 מחזורים
72 ° cעשרה מנות

שולחן 2: התנאים עבור הציקלייר תרמית עבור MYOD1 הגברה.

ריאגנטאמצעי אחסון
מאגר 10x K2 מיקרומטר
וקטור רטרונגיפי (500 ng/μL)2 מיקרומטר
אנזים הגבלה 1 (2-ל -15 יו)1 ליטר
אנזים הגבלה 2 (2-15 יו ')1 ליטר
מים מזוקקים מעוקרים14 μL
נפח כולל20 μL

שולחן 3: תערובת לצינור לעכל וקטור הנגיף.

ריאגנטאמצעי אחסון
קטע MYOD1 מזוקק100
וקטור כפוף מתעכל100
5x אנזימים מראשות הבמה4 מיקרומטר
מים מזוקקים מעוקריםעד 20 μL
נפח כולל20 μL

שולחן 4: תערובת לתגובת שיבוט בהיתוך.

פתרוןאמצעי אחסון/היענות (μL)ריכוז סופי
מים בחינםשתנה-
מאגר חד-PCR משלב אחד41x
שילוב dNTP (המכיל 10 מ"מ של כל dNTP)0.8400 מ"מ של כל dNTP
פריימר קדימה (10 ממ)1.20.6 ממ '
פריימר הפוך (10 מ"מ)1.20.6 ממ '
שילוב אנזים חד-PCR0.8-
מעכב RNase (אופציונלי)שתנה5/10 יחידות/תגובות
תבנית RNA50-400 מטרים
נפח כולל20

שולחן 5: תרכובות הכרחי לתגובה אחת של הצעד היחיד RT-PCR.

1 מחזורתעתיק הפוך30 דקות50 ° c
1 מחזורשלב ההפעלה הראשונית של ה-PCR15 דקות95 ° c
1 מחזורדנטורציה1 דקות94 ° c
ריפוי1 דקות60 ° c
סיומת1 דקות72 ° c
1 מחזורהארכה סופית7 דקות72 ° c
החזיק4 מעלות צלזיוס

שולחן 6: מצב של ציקלאה תרמי לשלב אחד RT-PCR.

ריאגנטאמצעי אחסון
חלבון (15 μg)10 מיקרומטר
מאגר לדוגמה (4x)5 מיקרומטר
הפחתת הסוכן (10x)2 מיקרומטר
מים בדימוס3 מיקרומטר
נפח כולל20 μL

שולחן 7: הכנת דגימות עבור סודיום dodecyl סולפט פוליאקרילאמיד ג'ל לג (SDS-עמוד).

Discussion

כאן, אנו מתארים פרוטוקול מפורט של דילוג אקסון ב- MYOD1המרה udcs שהתקבלו מ-dmd חולים. באמצעות מערכת השיטה, הוקרן רצפי החושים אופטימלית ביעילות. אנו מניחים כי UDCs המרה MYOD1יכול להיות שימושי עבור החקירה של פתופסיולוגיה של המחלה.

הערכת דילוג אקסון באמצעות החולים נגזר תאים ברמת mrna היא הכרחית להקרנה תרופות חדשות והערכת זכאות למטופל לפני התחייבות ניסויים קליניים. החישוב של האקסון דילוג היעילות ניתן להעריך רק ברמת mRNA.

הערכה של אקסון דילוג ברמת החלבון חשוב גם מכיוון שחזור הדיסטרופין חשוב כמו ביואריקר פונדקאית כדי לנבא את היתרונות של בדילוג אקסון. עד כה, הקרנת ההקרנה של אנטי הגיוני רצפי הגאות מבוצעת לעתים קרובות באמצעות קווי השריר הראשי או שורות התאים המוכאיים כולל בתאי התמס האדם (RD) תאים, אבל אנחנו לא יכולים למדוד את ההתאוששות של רמות הדיסטרופין באמצעות קווי תא שריר או תא RD קווי כי הם מבטאים את זה חלבון ב אנחנו יכולים בבירור לזהות את השחזור של הדיסטרופין ב-DMD החולה נגזר MYOD1-udcs באופן תלוי במינון. בתוך הכדאיות החדשה שלנו, אנו מחשיבים כי הערכת החלבון המשוחזר על ידי הכתמים המערביים מעולה בקוונפיבביליות. מצד שני, הערכה על ידי אימונוציטוכימיה באמצעות 96 צלחות היטב היא אידיאלית לסינון תרכובות מועמד רבים בו זמנית.

במאמר זה, אנו מתארים פרוטוקול מפורט עבור שריר DMD מודל יעיל באמצעות MYOD1-udcs המרה יחד עם RT-PCR, בלוק המערבי, ואימונוציטוטוכימיה להעריך את הדיסטרופין המשוחזר ב-mrna ורמות החלבון לאחר דילוג להקפיץ. ניתן לאסוף את UDCs באופן בלתי פולשני ובקלות. לכן, אנו מניחים כי החדש לחלוטין בשיטת החוץ הגופית ניתן להחיל על מגוון רחב של מחקרים בסיסיים וטרנסלבותית ללא קשר לסוג של הפרעות שרירים.

Disclosures

המרכז הלאומי של נוירולוגיה פסיכיאטריה מפתחת כעת NS-065/ncnp-01, אקסון 53 מדלגת על התרופה dmd, עם ניפון shinyaku ושות, בע מ.

Acknowledgements

עבודה זו נתמכת על ידי האגודה היפנית לקידום המדע המענק למחקר מדעי (C) [גרנט לא. 18K07544 כדי י. א. י., מענקים בסיוע למחקר על הפרעות עצבים ומנטליות [מענק 28-6 לי א], והסוכנות היפנית למחקר ופיתוח רפואי [גרנט nos. 18ek0109239h0002, 18lm0203066h0001, ו 18lm0203069h0001 לי א].

Materials

NameCompanyCatalog NumberComments
1% P/S Solution StabilizedThermo Fisher15070-063Cell culture
Amphotericin BSigma AldrichA2942
Anti-dystrophinAbcamab15277Western blot (WB)
Anti-dystrophinLeicaNCL-DYS1Immunocytochemistry(ICC)
Anti-mouse IgG, Dylight 488Vector LaboratoriesDK-2488ICC
Anti-α-tubulinSigmaT6199Western bot and ICC
BZ-X800KEYENCEBZ-800Fluorescent microscope
CELLBANKERZENOAQCB011Cell stock in liquid nitrogen
ChemiDoc MP Imaging SystemBio-Rad170-8280J1WB
CloneAmp HiFi PCR premixClontech639298Retroviral production
cOmplete Protease Inhibitor CocktailRoche4693116001Protein extraction for WB
E.coli DH5 α Competent CellsTAKARA9057
ECL Prime Western Blotting Detection ReagentGE healthcareRPN2232WB
EGFPeprotechAF-100-15Cell culture
Endo-PorterGeneTools2922498000ASO transfection
Extra Thick Blot Filter PaperBio-Rad1703965WB
EzFastBlot HMWAttoAE-1460WB
fibroblast growth factor-basicSigma-AldrichF0291Cell culture
GlutamaxThermo Fisher Scientific35050-061Cell culture
GP2-293 packaging cellsClontech631458Retroviral production
Ham's F-12 Nutrient MixThermo Fisher Scientific11765-054Cell culture
High glucose DMEM with GlutaMAX-IThermo Fisher Scientific10569-010Cell culture
High glucose DMEM without sodium pyruvateGE HealthcareSH30022.01Cell culture
HiSpeed Plasmid Purification KitQIAGEN12643Retroviral production
Histofine Simple Stain MAX PONICHIREI BIOSCIENCE INC.424151WB
Hoechst 33342Thermo Fisher ScientificH3570ICC
Human PDGF-ABPeprotech100-00AB-10UGCell culture
iBind Flex SolutionThermo Fisher ScientificSLF2020WB
iBind Flex Western DeviceThermo Fisher ScientificSLF2000WB (Automated mestern-processing device)
Immobilon-P Transfer Membrane (PVDF)MERCKIPVH304F0WB
In-Fusion HD cloning KitClontech639648Retroviral production
ITS Liquid Media SupplementSigma-AldrichI3146Cell culture
MILTEX HV 0.45 μm filterMERCKSLHV033RSRetroviral production
MultiNASHIMADZUMCE-202Microchip electrophoresis
MYOD1 (GFP-tagged)ORIGENERG209108Retroviral production
NanoDropThermo FisherND-ONE-WSpectrophotometer
Nonessential amino acidsThermo Fisher11140-050Cell culture
NucleoSpin Gel and PCR Clean-Up KitClontech740986.20PCR clean up
NuPAGE 3-8% Tris-Acetate Protein GelsInvitrogenEA03785BOXWB
NuPAGE AntioxidantInvitrogenNP0005WB
NuPAGE LDS Sample BufferInvitrogenNP0007WB
NuPAGE Sample Reducing AgentInvitrogenNP0009WB
NuPAGE Tris-Acetate SDS Running BufferInvitrogenLA0041WB
One Step TB Green PrimeScript RT-PCR KitTAKARARR066ATiter check of retroviral vector
PBSThermo Fisher Scientific14190-250Cell culture
Pierce BCA Protein Assay KitThermo Scientific23227WB
Polybrene Infection / Transfection ReagentSigma-AldrichTR-1003Retroviral infection
pRetroX-TetOne-Puro VectorClontech634307Retroviral vecor
PuromycinClontech631305Cell culture
QIAGEN OneStep RT-PCR KitQiagen210212PCR
REGM Bullet KitLonzaCC-3190Material for growth medium of UDCs
REGM SingleQuotsLonzaCC-4127Material for primary medium of UDCs
Retrovirus Titer SetTAKARA6166Titer check of retroviral vector
Retro-X ConcentratorClontech631455Retroviral production
RIPA bufferThermo Fisher Scientific89901WB
RNeasy kitQiagen74104RNA extraction for PCR
Tetracycline-free foetal bovine serumClontech631106Cell culture
Triton-XMP Biomedicals9002-93-1ICC
Trypsin-EDTA (0.05%)Gibco25300054Cell culture
XCell SureLock Mini-CellInvitrogenEI0001WB
Xfect transfection reagentClontech631317Transfection of plasmids into packaging cells

References

  1. Hoffman, E. P., Brown, R. H., Kunkel, L. M. Dystrophin: the protein product of the Duchenne muscular dystrophy locus. Cell. 51, 919-928 (1987).
  2. Cirak, S., et al. Exon skipping and dystrophin restoration in patients with Duchenne muscular dystrophy after systemic phosphorodiamidate morpholino oligomer treatment: an open-label, phase 2, dose-escalation study. Lancet. 378, 595-605 (2011).
  3. Komaki, H., et al. Systemic administration of the antisense oligonucleotide NS-065/NCNP-01 for skipping of exon 53 in patients with Duchenne muscular dystrophy. Science Translational Medicine. 10 (437), (2018).
  4. Antoury, L., et al. Analysis of extracellular mRNA in human urine reveals splice variant biomarkers of muscular dystrophies. Nature Communications. 9, 3906 (2018).
  5. Rahmoune, H., et al. Glucose transporters in human renal proximal tubular cells isolated from the urine of patients with non-insulin-dependent diabetes. Diabetes. 54, 3427-3434 (2005).
  6. Zhang, Y., et al. Urine derived cells are a potential source for urological tissue reconstruction. The Journal of Urology. 180, 2226-2233 (2008).
  7. Takizawa, H., et al. Modelling Duchenne muscular dystrophy in MYOD1-converted urine-derived cells treated with 3-deazaneplanocin A hydrochloride. Scientific Reports. 9, 3807 (2019).
  8. Zhou, T., et al. Generation of human induced pluripotent stem cells from urine samples. Nature Protocols. 7, 2080-2089 (2012).
  9. Chen, W., et al. Skeletal myogenic differentiation of human urine-derived cells as a potential source for skeletal muscle regeneration. Journal of Tissue Engineering and Regenerative Medicine. 11, 334-341 (2017).
  10. Kim, E. Y., Page, P., Dellefave-Castillo, L. M., McNally, E. M., Wyatt, E. J. Direct reprogramming of urine-derived cells with inducible MyoD for modeling human muscle disease. Skeletal Muscle. 6, 32 (2016).

Reprints and Permissions

Request permission to reuse the text or figures of this JoVE article

Request Permission

Explore More Articles

159duchenne dmd

This article has been published

Video Coming Soon

JoVE Logo

Privacy

Terms of Use

Policies

Research

Education

ABOUT JoVE

Copyright © 2025 MyJoVE Corporation. All rights reserved