Method Article
Ce protocole établit des méthodes pour extraire et quantifier les réponses à la phéromone sexuelle volatile chez C. elegans, fournissant des outils pour étudier la communication chimique et la trajectoire de navigation.
La communication chimique est vitale pour la santé de l’organisme, la reproduction et le bien-être général. La compréhension des voies moléculaires, des processus neuronaux et des calculs régissant ces signaux reste un domaine de recherche actif. Le nématode Caenorhabditis elegans fournit un modèle puissant pour étudier ces processus car il produit une phéromone sexuelle volatile. Cette phéromone est synthétisée par les femelles vierges ou les hermaphrodites appauvris en spermatozoïdes et sert d’attractif pour les mâles.
Ce protocole décrit une méthode détaillée pour isoler la phéromone sexuelle volatile de plusieurs souches de C. elegans (souche WT N2, daf-22 et fog-2) et C. remanei. Nous fournissons également un protocole pour quantifier la réponse chimiotaxique masculine à la phéromone sexuelle volatile. Notre analyse utilise des mesures telles que l’indice de chimiotaxie (C.I.), le temps d’arrivée (A.T.) et un tracé de trajectoire pour comparer avec précision les réponses masculines dans diverses conditions. Cette méthode permet d’établir des comparaisons robustes entre des mâles de différents antécédents génétiques ou stades de développement. De plus, le dispositif expérimental décrit ici est adaptable à l’étude d’autres produits chimiques de chimioattraction.
L’interaction entre la communication chimique et le succès de la reproduction est un principe fondamental dans le règne animal 1,2,3,4,5,6,7,8,9,10. Les phéromones sexuelles déclenchent un large éventail de comportements sexuellement dimorphes essentiels pour localiser les partenaires, coordonner les étapes impliquées dans la recherche et l’attraction d’un partenaire, et finalement favoriser la propagation d’une espèce 11,12,13,14,15,16,17. Des progrès significatifs ont été réalisés dans la compréhension de la signalisation des phéromones, mais les mécanismes moléculaires, les circuits neuronaux et les processus informatiques régissant ces interactions restent souvent incomplètement définis 18,19,20,21,22,23,24,25,26.
Le nématode Caenorhabditis elegans fournit un modèle puissant pour disséquer ces questions. Notamment, C. elegans présente une stratégie de reproduction inhabituelle - les hermaphrodites peuvent s’autoféconder mais aussi se croiser avec les mâles 27,28,29,30,31,32,33. Cette flexibilité nécessite un système de communication robuste pour signaler l’état reproducteur. C. elegans est connu pour ses phéromones hydrosolubles bien caractérisées, les ascarosides, qui jouent des rôles variés dans le développement, le comportement et les interactions sociales. Des découvertes récentes ont révélé une classe distincte de phéromones sexuelles volatiles employées par les nématodes. Ces phéromones sont spécifiquement produites par les femelles vierges sexuellement matures de C. elegans et C. remanei et les hermaphrodites appauvris en spermatozoïdes, servant d’attractif pour les mâles adultes 29,34,35. Cet attractif présente un dimorphisme sexuel remarquable dans sa production et sa perception. La gonade somatique femelle régit la synthèse de cette phéromone sexuelle volatile, et la production reflète dynamiquement l’état reproducteur, cessant lors de l’accouplement et reprenant plusieurs heures plus tard29,34.
Comprendre la communication des phéromones sexuelles des nématodes donne un aperçu de l’évolution des systèmes de communication chimique, de l’interaction entre l’état reproducteur et le comportement, et des mécanismes sous-jacents au traitement neuronal sexuellement dimorphe 24,26,36,37,38,39 . Des études impliquent que le neurone amphide AWA chez les mâles est essentiel pour la détection des phéromones, le récepteur couplé aux protéines G SRD-1 jouant un rôle clé dans la détection des phéromones chez les mâles24. C. elegans est bien adapté à l’étude de la communication chimique animale, en particulier de la signalisation des phéromones sexuelles, en raison de sa dépendance au système olfactif pour la recherche de partenaire. Bien que l’on sache beaucoup de choses sur la signalisation des ascarosides, le système de phéromones sexuelles volatiles offre des possibilités uniques de comparaison 25,26,36,40,41,42,43,44,45,46,47,48,49,50,
51,52,53,54,55,56,57. De plus, C. elegans est un puissant organisme modèle génétique en raison de son génome entièrement séquencé, de sa lignée cellulaire clairement définie et de ses mutants olfactifs bien caractérisés.
Cependant, l’ensemble des circuits neuronaux impliqués dans le traitement de cette phéromone, les calculs qui traduisent sa perception en comportements ciblés de recherche de partenaire et la régulation de sa biosynthèse restent à élucider. Des recherches plus approfondies sur ces processus sont cruciales pour comprendre les divers mécanismes régissant la communication animale et les comportements reproductifs. L’identification de gènes clés impliqués dans la synthèse, la sécrétion et la perception des phéromones promet de dévoiler de nouveaux acteurs moléculaires dans la communication animale. Les analyses décrites ici fournissent une base pour répondre à ces questions.
1. Extraction brute de phéromones sexuelles chez les femelles et les hermaphrodites
2. Extraction brute de phéromones sexuelles chez des femelles vierges d’un jour (figure 1A)
REMARQUE : Nous adoptons un protocole24 précédemment établi pour extraire les phéromones sexuelles des femelles mutantes vierges fog-2 (féminisation de la lignée germinale) d’un jour de C. elegans et des femelles WT de C. remanei.
3. Une grande quantité d’extraction brute de phéromones sexuelles à partir d’hermaphrodites vierges âgés de 6 jours (Figure 1A)
4. Test de chimioattraction des phéromones sexuelles volatiles
REMARQUE : Le test de chimioattraction des phéromones sexuelles volatiles a été adapté des méthodes précédemment établies utilisées dans d’autres études de chimioattraction 24,29,59,60,61. Ces modifications ont été mises en œuvre pour optimiser la sensibilité et la spécificité du test pour la détection des réponses aux phéromones sexuelles volatiles. Cette approche personnalisée améliore l’applicabilité du test à des besoins de recherche spécifiques.
5. Lignes directrices sur le moment et la notation pour le test de chimioattraction
6. Modifications facultatives
7. Analyse des données
Analyse de trajectoire de la perception des phéromones sexuelles volatiles : souche défectueuse dans le test de chimioattraction
Ce test de chimioattraction différencie de manière fiable les souches de type sauvage et mutantes de C. elegans dans leur réponse aux phéromones sexuelles volatiles. Les expériences réussies avec les mâles him-5 démontrent systématiquement une chimiotaxie robuste envers la source de phéromones. Cela se traduit par un indice de chimiotaxie (C.I.) élevé (Figure 2), dépassant souvent 0,5, indiquant une forte préférence pour la source de phéromones. À l’inverse, les expériences avec le récepteur des phéromones mutant SRD-1 donnent systématiquement des résultats négatifs. L’IC pour les mâles srd-1 est généralement d’environ zéro24. Cela confirme la capacité du test à détecter l’absence de réponse chimiotactique.
Dans les expériences sous-optimales, de nombreux facteurs peuvent affecter les résultats. Par exemple, une concentration insuffisante de phéromones peut entraîner de faibles réponses chez les mâles him-5 , tandis qu’une contamination ou une manipulation inappropriée peut provoquer des mouvements imprévisibles dans les deux souches. Ces scénarios se traduisent par des valeurs C.I. plus faibles pour les mâles him-5 et des valeurs non nulles potentiellement trompeuses pour les mâles srd-1 . Par conséquent, la mise en œuvre réussie de ce protocole est marquée par une distinction claire dans les indices de chimiotaxie entre les souches de type sauvage et mutantes, étayée par l’analyse de trajectoire confirmant visuellement les différences comportementales (Figure 3). L’analyse des données devrait inclure des comparaisons statistiques des valeurs C.I. pour s’assurer que les différences observées sont significatives.
Démonstration de l’analyse et de la visualisation des données du test de chimioattraction par vidéo
Résultats positifs du test : La figure 3 présente la réponse chimiotactique robuste des mâles him-5 à une phéromone sexuelle volatile. Les trajectoires codées en couleur révèlent (A) le coût en temps, (B) la distance : en augmentant la proximité de la source de phéromones au fil du temps, confirmant l’attraction des vers. (C) vitesse : vitesses variables le long des trajectoires, fournissant des informations sur la dynamique des réponses chimiotactiques. (D) rectitude : la façon dont les vers se déplacent directement vers la source de phéromones. Plus le chemin est droit, plus leur mouvement est efficace et ciblé en réponse à l’attractif chimique. (E) Exactitude de la direction : Cela montre la capacité des vers à s’orienter et à se déplacer avec précision vers la source de la phéromone, l’attractif chimique. Il mesure essentiellement la capacité des vers à détecter le gradient chimique et à naviguer le long de celui-ci pour atteindre leur cible.
Une baisse de vitesse à zéro indique généralement un arrêt ou un virage. La combinaison des informations de vitesse et des données de rectitude peut aider à identifier les événements de virage. Plus précisément, un événement de virage est indiqué lorsque la vitesse tombe à zéro et que la rectitude est également très faible. En revanche, les expériences avec des mutants sensoriels défectueux ou celles menées dans des conditions sous-optimales (par exemple, une faible concentration de phéromones, une densité de vers inappropriée) peuvent donner des résultats différents.
En comparant les trajectoires et en quantifiant des paramètres tels que la directionnalité, la vitesse et la rectitude, les chercheurs peuvent mieux comprendre les mécanismes sous-jacents de la chimiotaxie. Des expériences réussies avec des trajectoires claires et dirigées vers la source de phéromones valident la capacité du test à détecter des stimuli attrayants. À l’inverse, l’absence de tels motifs chez les témoins négatifs ou les souches mutantes confirme la spécificité du test et sa capacité à identifier les défauts sensoriels. Le test de chimioattraction en vrac basé sur la vidéo, comme illustré à la figure 3, fournit un outil puissant pour disséquer les détails du comportement de la chimiotaxie des vers. En analysant les trajectoires individuelles, les chercheurs peuvent découvrir non seulement la présence ou l’absence d’attraction, mais aussi la différence dans la réponse, offrant ainsi une compréhension plus profonde des mécanismes génétiques et neuronaux sous-jacents régissant la chimiotaxie.
Figure 1 : Déroulement de l’extraction des phéromones sexuelles brutes. La phéromone sexuelle brute est extraite de femelles mutantes vierges fog-2 synchronisées âgées d’un jour de C. elegans et de femelles WT de C. remanei, où les vers sont synchronisés, lavés, isolés et incubés dans un tampon M9 pour la production de phéromones. Le surnageant contenant des phéromones extrait est stocké à -80 °C pendant une période pouvant aller jusqu’à 1 an pour être utilisé dans des essais de chimioattraction, et des tests de contrôle de la qualité ont été effectués sur des mâles N2 ou him-5 pour vérifier l’attractivité. Pour l’extraction à grande échelle de C. elegans hermaphrodites vierges âgés de 6 jours, les vers sont synchronisés et lavés à plusieurs reprises pendant 6 jours, la phéromone sexuelle étant extraite de la même manière, mais modifiée en fonction du volume de granulés de vers et mélangée de manière homogène à des fins expérimentales. Veuillez cliquer ici pour voir une version agrandie de cette figure.
Figure 2 : L’essai de chimioattraction des phéromones sexuelles volatiles et le calcul de l’indice de chimioattraction. (A) Cet essai consiste à préparer des mâles WT N2 ou him-5 à l’aide d’un protocole normalisé de synchronisation de l’eau de Javel, en testant leur réponse à une substance témoin positive avant l’essai de chimioattraction des phéromones sexuelles volatiles. L’expérience comprend le marquage des plaques pour les points de contrôle et d’essai et l’utilisation de sodium de côté pour immobiliser les vers à ces endroits afin d’obtenir un marquage précis. Les résultats sont généralement notés 30 minutes après le début de l’expérience (indiqués par la fermeture du couvercle). (B) Vue latérale de la configuration du test de chimioattraction avec deux distances distinctes. (C) Calcul et interprétation de l’C.I. C.I. est une mesure quantitative de l’attractivité ou de la répulsion d’un stimulus de test. Le C.I. varie de 1, indiquant une forte attraction, à -1, indiquant une forte répulsion. Une faible valeur de C.I. peut résulter de deux scénarios : soit un petit nombre de vers dans les points expérimentaux et de contrôle, soit une répartition égale des vers entre les deux points. (D) Indices de chimioattraction pour les mâles de C. elegans him-5 et srd-1 en réponse aux phéromones sexuelles volatiles des femelles de C. remanei et C. elegans. Les mâles de différents antécédents génétiques réagissent différemment au stimulus de la phéromone sexuelle. Les mâles him-5 présentent une réponse aux deux phéromones, avec un indice nettement plus élevé pour les phéromones des femelles de C. remanei. En revanche, les mâles de la souche srd-1 de la souche mutante du chimiorécepteur ne présentent aucune réponse à l’une ou l’autre des phéromones dans cette analyse. p < 0,01. Abréviations : WT = type sauvage ; C.I. = indice de chimioattraction. Veuillez cliquer ici pour voir une version agrandie de cette figure.
Figure 3 : Analyse de la trajectoire des mâles him-5 en réponse à la phéromone sexuelle volatile. Cette figure illustre les schémas de mouvement des vers mâles him-5 au cours d’un essai de chimioattraction avec un stimulus de phéromone sexuelle volatile. Les trajectoires individuelles sont codées en couleur pour représenter (A) le temps : progression de la trajectoire au cours de l’expérience. La couleur représente le temps écoulé depuis le début du test. (B) Distance à la phéromone : Proximité de la source de phéromones à chaque point temporel. (C) Vitesse : Vitesse de la vis sans fin en chaque point. (D) Rectitude : Caractère direct du chemin emprunté par la vis sans fin. (E) Exactitude de la direction : Alignement du mouvement avec la direction de la source de phéromones. Dans les trois exemples, les vers mâles ont réussi à atteindre l’emplacement de la phéromone. La moyenne des données a été calculée sur 20 images afin de filtrer les mouvements causés par la torsion du corps. Les expériences sont réalisées sur une boîte de Pétri de 10 cm et suivent la méthode de test de chimioattraction en vrac basée sur la vidéo (voir le protocole section 7.3.7.2) mentionnée dans ce protocole. Veuillez cliquer ici pour voir une version agrandie de cette figure.
Ce protocole fournit une méthodologie robuste pour l’extraction des phéromones sexuelles volatiles de C. elegans, ainsi que l’établissement d’un test de chimioattraction robuste pour mesurer les réponses de chimioattraction masculine. Des informations supplémentaires peuvent être trouvées dans le guide d’utilisation de WormLab (voir la table des matériaux) ; Pour un code de base permettant de visualiser la trajectoire du mouvement du ver, reportez-vous à la section 7.3.8.5 du protocole. Plusieurs étapes cruciales du protocole sont importantes pour le résultat. Tout d’abord, une synchronisation minutieuse des populations de vers est essentielle pour contrôler l’âge et l’état reproducteur, assurant ainsi l’extraction réussie des phéromones sexuelles volatiles des femelles vierges ou des hermaphrodites appauvris en spermatozoïdes29,34. Deuxièmement, des étapes de lavage répétées sont nécessaires pour éliminer complètement les bactéries, minimisant ainsi la contamination qui pourrait interférer avec la signalisation des phéromones dans les tests de chimiotaxie ultérieurs. Ensuite, le choix des paramètres de l’essai, tels que la concentration de l’attractif, la taille de la plaque et la durée de l’essai, peut tous influencer les résultats et doit être adapté aux objectifs expérimentaux spécifiques.
Des temps de séchage précis et un espacement constant des points de test sont essentiels pour des résultats fiables des tests de chimiotaxie. Les plaques humides affectent considérablement l’indice de chimiotaxie. S’il reste une couche d’eau à la surface de la gélose, les forces capillaires peuvent piéger les vers au point de départ. Cela peut entraver leur mouvement, conduisant à des résultats faussement négatifs dans le test. De plus, les temps de séchage prolongés posent un défi différent pour ceux qui sont libérés plus tard. Au fur et à mesure que la plaque sèche, les composants organiques des phéromones s’évaporent et se diffusent, créant un gradient de concentration moins distinct. Il est donc difficile pour les vers relâchés plus tard de localiser la phéromone cible, même s’ils sont libres de se déplacer plus tard. Par conséquent, assurez-vous que les plaques sont suffisamment sèches pour éliminer toute humidité de surface qui pourrait affecter les résultats de l’expérience.
Le volume de solution de gélose ajouté aux plaques doit être ajusté en fonction des exigences spécifiques de l’expérience, afin d’assurer des conditions de dosage optimales. L’épaisseur de la couche de gélose, ajustée en faisant varier la quantité de solution de gélose versée dans le plat. En règle générale, une distance plus courte entre l’attractif et la plaque de gélose permet d’obtenir des résultats plus robustes. À l’inverse, une distance plus longue peut aider à éliminer les effets des composants non volatils, ce qui permet une évaluation plus claire de l’influence de l’attractif volatil. L’épaisseur de la gélose peut être adaptée aux besoins expérimentaux spécifiques, comme le montre la figure 2B.
Le processus de cueillette de 20 vers ne doit pas dépasser 1 à 2 minutes pour éviter que les vers cueillis tôt ne se dessèchent et ne deviennent malsains, ce qui pourrait affecter les résultats. Assurez-vous que les vers sont libérés simultanément sur la plaque de test pour éviter que les vers libérés tôt ne s’éloignent trop du point de départ. Les retards dans cette étape peuvent entraîner des positions de départ variables parmi les échantillons, ce qui entraîne des comparaisons injustes. L’ensemble du processus, de la cueillette des mâles à la fermeture du couvercle, devrait prendre entre 2 et 5 minutes.
Adaptez l’espacement entre les points d’expérience/de contrôle et le point de départ sur la plaque d’essai en fonction de la taille de la plaque et des objectifs spécifiques de l’expérience. L’augmentation de la distance entre les points peut rendre le test plus difficile, ce qui est bénéfique pour détecter des effets subtils. À l’inverse, la réduction de la distance crée un test d’essai plus robuste qui met en évidence les défauts graves.
Un dépannage peut être nécessaire à différents points du protocole. Si la phéromone extraite n’induit pas de réponse chimiotaxique, vérifiez soigneusement l’âge et l’état reproducteur des femelles et des hermaphrodites sources. Seules les femelles vierges ou les hermaphrodites appauvris en sperme produiront la phéromone cible. En raison de l’efficacité sexuelle élevée des mâles C . elegans , la présence d’un seul mâle sur la plaque d’isolement femelle L4 peut affecter considérablement les résultats. De plus, assurez le contrôle de la contamination bactérienne tout au long du processus d’extraction. Bien que ce protocole d’extraction offre un moyen simple d’obtenir des phéromones sexuelles volatiles brutes, il présente certaines limites. L’extrait de phéromone brute peut contenir des traces d’autres molécules de signalisation, ce qui rend difficile l’isolement définitif des effets spécifiques de la phéromone sexuelle elle-même. Les composants fonctionnels de la phéromone sexuelle volatile n’ont pas encore été identifiés. Bien qu’aucune différence fonctionnelle n’ait été signalée entre les phéromones sexuelles des femelles vierges d’un jour et des hermaphrodites de six jours, la possibilité d’une différence subtile ne peut être exclue.
Dans le test de chimioattraction, un faible indice de chimiotaxie pourrait indiquer un problème de santé ou de développement chez les mâles testés. Pour garantir des résultats optimaux, utilisez des mâles adultes sains d’un jour élevés à 20 °C sur une plaque OP50 propre et sans contamination. Des changements brusques de température allant de températures d’entreposage plus basses (comme 15 °C) à 20 °C peuvent avoir un effet négatif sur le comportement de chimioattraction jusqu’à trois générations. Pour une meilleure pratique, laissez les souches récemment décongelées ou maintenues à des températures plus basses s’adapter à 20 °C pendant plus de trois générations avant de les utiliser. Bien qu’il soit recommandé d’isoler les mâles d’essai au stade L4 la veille du jour du test, ce n’est pas strictement nécessaire. La préexposition aux hermaphrodites adultes n’a pas d’impact significatif sur les résultats des tests de chimioattraction. Les hermaphrodites d’un jour ne produisent pas de phéromones sexuelles volatiles en raison de l’existence de l’auto-sperme. Par conséquent, l’isolement masculin L4 peut être évité lors d’un dépistage à grande échelle. Cependant, pour les études portant spécifiquement sur les effets d’une expérience d’accouplement antérieure ou d’autres études connexes, il est nécessaire d’isoler les mâles au stade L4 1 jour avant le jour du test.
La mutation him-5 chez C. elegans provoque une forte incidence de mâles en raison d’un taux accru de non-disjonction du chromosome X pendant la méiose chez le parent des mâles. Ainsi, le système chimiosensoriel des mâles requis pour la chimiotaxie est toujours intact. Il est ainsi plus facile d’obtenir un grand nombre de mâles pour le dosage. Par conséquent, les mâles him-5 présentent une chimiotaxie robuste comparable à celle des mâles WT N2, ce qui en fait un contrôle approprié dans les dosages de chimiotaxie aux phéromones sexuelles.
Considérations supplémentaires :
Remplacement de l’azoture de sodium : L’azoture de sodium utilisé pour paralyser les vers pendant l’enregistrement vidéo peut être évité. Au lieu de cela, utilisez une goutte de solution M9 pour immobiliser temporairement les vers, bien que la tension superficielle soit suffisante pour un test vidéo.
Densité des vers : Limitez le nombre de vers par plaque pour éviter l’encombrement et maintenir des conditions optimales. La surpopulation affectera l’analyse post-vidéo, car le programme aura de la difficulté à identifier les vers s’ils se chevauchent. Un maximum de 20 vers est recommandé pour une boîte de Pétri de 6 cm, et 100 vers pour une boîte de Pétri de 10 cm.
Les tests de chimioattraction traditionnels offrent une approche simple, nécessitant un effort minimal pour l’acquisition de données. Bien que ces tests fournissent un aperçu rapide de la réponse à la chimiotaxie, ils ne capturent que le point final d’une réponse comportementale complexe. Cela limite leur capacité à révéler les détails de la perception des phéromones et de la réponse locomotrice. En revanche, l’analyse avancée de la trajectoire donne un aperçu des mouvements individuels et collectifs. Cette approche met en évidence les différences qui ne sont pas prises par les seules mesures fondées sur les paramètres. En permettant d’explorer en détail les modèles cinétiques détaillés et la variabilité de la réponse au sein des populations testées, cette méthode améliore considérablement notre compréhension des mécanismes chimiosensoriels. Cela met en évidence l’applicabilité de l’essai à diverses questions de recherche et souligne l’importance de tenir compte de la variabilité individuelle dans la conception expérimentale.
Cette méthodologie offre un cadre pour l’étude des phéromones sexuelles volatiles chez C. elegans. Il peut faciliter la découverte de gènes liés à la synthèse, à la sécrétion et à la perception des phéromones sexuelles volatiles, approfondissant ainsi notre compréhension de la communication chimique au niveau des circuits moléculaires et neuronaux. De plus, le test de chimioattraction et l’analyse des données de trajectoire peuvent être utilisés pour étudier d’autres chimioattractants chez C. elegans.
Les auteurs n’ont aucun conflit d’intérêts à divulguer.
Nous sommes reconnaissants au Dr Tingtao Zhou d’avoir conçu et écrit le code pour les visualisations de trajectoire utilisées dans notre analyse. Ce travail a été soutenu par le financement de R01 NS113119 (PWS), de la bourse postdoctorale senior Chen et de l’Institut Tianqiao et Chrissy Chen pour les neurosciences.
Name | Company | Catalog Number | Comments |
10 cm Petri dishes | Falcon | 25373-100 | Falcon bacteriological Petri dish 100 x 15 mm |
6 cm Petri dishes | Falcon | 25373-085 | Falcon bacteriological Petri dish 60 x 15 mm |
C. remanei (EM464) | CGC | ||
Centrifuge | Eppendorf | centrifuge 5418 | Any brand should work. |
Chemoattraction assay plates | Homemade solution | N/A | 1.5% agar, 25 mM NaCl, 1.5 mM Tris-base, and 3.5 mM Tris-Cl |
Cholesterol | Alfa Aesar | 57-88-5 | |
Dissecting Microscope | Leica | LeicaMZ75 | Any brand should work. |
E. Coli OP50 | CGC | ||
Ethanol | Koptec | 64-17-5 | |
fog-2(q71) (JK574) | CGC | ||
him-5(e1490)(CB4088) | CGC | ||
Household bleach | Clorox Germicidal bleach concentrated | Bleach | |
M9 buffer | Homemade solution | N/A | 3 g KH2PO4, 11.3 g Na2HPO4.7H2O, 5 g NaCl, H2O to 1 L. Sterilize by autoclaving. Add 1 mL 1 M MgSO4 after cool down to room temperature. |
Magnesium Sulfate, Anhydrous, Powder | Macron | M1063-500GM-EA | |
Microwave | TOSHIBA | N/A | Any brand should work. |
N2 | CGC | ||
NaOH | Sigma-aldrich | S318-3 | 1 M |
NGM plates solution | Homemade solution | N/A | 2.5 g Peptone, 18 g agar, 3 g NaCl, H2O to 1 L.Sterilize by autoclaving. Once the autoclave is done (2 h), wait until the temperature of the medium drops to 65 °C. Put on a hotplate at 65 °C and stir. Then add the following, waiting 5 min between each to avoid crystallization: 1 mL CaCl2 (1 M), 1 mL MgSO4 (1 M), 25 mL K3PO4 (1 M, pH=6), 1 mL Cholesterol ( 5 mg/mL in ethanol). |
Parafilm | Bemis | 13-374-10 | Bemis Parafilm M Laboratory Wrapping Film |
Peptone | VWR | 97063-324 | |
Pipet- aid | Drummond Scientific | 4-000-100 | Any brand should work. |
Plastic paper | Octago | Waterproof Screen Printing Inkjet Transparency Film | https://www.amazon.com/Octago-Waterproof-Transparency-Printing-Printers/dp/B08HJQWFGD |
Potassium chloride | Sigma-aldrich | SLBP2366V | |
Potassium phosphate | Spectrum | 7778-77-0 | |
Pipette | Eppendorf | SKU: EPPR4331; MFG#: 2231300006 | 20 - 200 µL, 100 - 1000 µL, any brand should work. |
Rotator | Labnet | SKU: LI-H5500 | Labnet H5500 Mini LabRoller with Dual Direction Rotator. Any brand should work. |
Sodium chloride | VWR | 7647-14-5 | |
sodium phosphate dibasic | Sigma-aldrich | SLCG3888 | |
Tris-base | Sigma-aldrich | 77-86-1 | |
Tris-Cl | Roche | 1185-53-1 | |
Tryptone | VWR | 97063-390 | |
Vortex | Scientific industries | Vortex-Genie 2 | Any brand should work. |
WormLab system | MBF Bioscience | N/A | https://www.mbfbioscience.com/help/WormLab/Content/home.htm; https://www.mbfbioscience.com/products/wormlab/ |
Wormpicker | Homemade | N/A | made with platinum and glass pipet tips |
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