Method Article
Here, we present human pluripotent stem cell (hPSC) culture protocols, based on non-colony type monolayer (NCM) growth of dissociated single cells. This new method, utilizing Rho-associated kinase inhibitors or the laminin isoform 521 (LN-521), is suitable for producing large amounts of homogeneous hPSCs, genetic manipulation, and drug discovery.
Human pluripotent stem cells (hPSCs) hold great promise for regenerative medicine and biopharmaceutical applications. Currently, optimal culture and efficient expansion of large amounts of clinical-grade hPSCs are critical issues in hPSC-based therapies. Conventionally, hPSCs are propagated as colonies on both feeder and feeder-free culture systems. However, these methods have several major limitations, including low cell yields and generation of heterogeneously differentiated cells. To improve current hPSC culture methods, we have recently developed a new method, which is based on non-colony type monolayer (NCM) culture of dissociated single cells. Here, we present detailed NCM protocols based on the Rho-associated kinase (ROCK) inhibitor Y-27632. We also provide new information regarding NCM culture with different small molecules such as Y-39983 (ROCK I inhibitor), phenylbenzodioxane (ROCK II inhibitor), and thiazovivin (a novel ROCK inhibitor). We further extend our basic protocol to cultivate hPSCs on defined extracellular proteins such as the laminin isoform 521 (LN-521) without the use of ROCK inhibitors. Moreover, based on NCM, we have demonstrated efficient transfection or transduction of plasmid DNAs, lentiviral particles, and oligonucleotide-based microRNAs into hPSCs in order to genetically modify these cells for molecular analyses and drug discovery. The NCM-based methods overcome the major shortcomings of colony-type culture, and thus may be suitable for producing large amounts of homogeneous hPSCs for future clinical therapies, stem cell research, and drug discovery.
La capacité de hPSCs de différencier vers les tissus adultes multilignée a ouvert de nouvelles voies pour le traitement des patients qui souffrent de maladies graves qui impliquent cardiovasculaires, hépatiques, pancréatiques, et les systèmes neurologiques 1-4. Différents types de cellules dérivées de hPSCs seraient également fournir des plates-formes cellulaires robustes pour la modélisation de la maladie, le génie génétique, le dépistage des drogues et de tests toxicologiques 1,4. La question clé qui assure leurs applications cliniques et pharmacologiques futures est la génération d'un grand nombre de hPSCs clinique de qualité à travers la culture de cellules in vitro. Cependant, les systèmes de culture actuels sont insuffisants ou de nature variable, impliquant diverses cultures nourricières et sans alimentation-de hPSCs les colonies 5,6.
croissance de type colonie d'actions hPSCs de nombreuses caractéristiques structurelles de la masse cellulaire interne (ICM) d'embryons de mammifères début. L'ICM est sujette à se différencier en trois feuillets germinatifsdans un environnement multicellulaire du fait de l'existence de gradients de signalisation hétérogènes. Ainsi, l'acquisition de l'hétérogénéité dans le développement précoce de l'embryon est considéré comme un processus nécessaire à la différenciation, mais une caractéristique non désirée de la culture HPSC. L'hétérogénéité de la culture HPSC est souvent induite par des signaux apoptotiques excessives et différenciation spontanée en raison des conditions de croissance sous-optimales. Ainsi, dans le type de colonies de culture, les cellules hétérogènes sont souvent observés dans la périphérie des colonies 7,8. Il a également été montré que les cellules dans les cellules souches embryonnaires humaines (CSEh) colonies réponses différentielles d'exposition à des molécules telles que BMP-4 9 signalisation. En outre, les méthodes de culture des colonies produisent des rendements de cellules faibles ainsi que les taux de cryoconservation de récupération très faible de cellules en raison de taux de croissance et signalisation apoptotique incontrôlables cheminements de 6,9. Ces dernières années, diverses cultures en suspension ont été développés pour hPSCs de culture, particulArly pour l'expansion de grandes quantités de hPSCs en alimentation-et les conditions sans matrice 6,10-13. Il est évident que différents systèmes de culture ont leurs propres avantages et inconvénients. En général, la nature hétérogène de hPSCs représente l'un des principaux inconvénients des méthodes colonie de type et de la culture agrégées, qui sont sous-optimal pour la livraison des matériaux d'ADN et d'ARN dans hPSCs pour le génie génétique 6.
De toute évidence, il est impératif de développer de nouveaux systèmes qui contournent certaines lacunes des méthodes de culture actuelles. Les découvertes d'inhibiteurs de petites molécules (comme l'inhibiteur de ROCK Y-27632 et JAK inhibiteur 1) qui améliorent la survie de cellule unique ouvrent la voie à dissociée-HPSC culture 14,15. Avec l'utilisation de ces petites molécules, nous avons récemment développé un procédé de culture en fonction du type non-colonie (MR) de la croissance dissociées hPSCs-9. Cette nouvelle méthode de culture combine à la fois des passages à cellule unique et de haute densitéplacage méthodes, ce qui nous permet de produire de grandes quantités de hPSCs homogènes sous des cycles de croissance cohérentes sans grandes anomalies chromosomiques 9. En variante, la culture peut être mise en œuvre NCM avec différentes petites molécules et des matrices telles que définies (laminines) afin d'optimiser le procédé de culture pour les applications de large. Ici, nous présentons plusieurs protocoles détaillés sur la base de la culture NCM et délimiter des procédures détaillées pour l'ingénierie génétique. Pour démontrer la polyvalence de protocoles MR, nous avons également testé la culture NCM avec des inhibiteurs de ROCK diverses et avec la seule isoforme de laminine 521 (c.-à-LN-521).
Base unique cellule non-colonie de type monocouche (NCM) culture de hPSCs.
1. Préparatifs
. 2 Protocole 1 (de base): Cultivez HPSC colonies en distribution
3 protocole n ° 2:. Autre HPSC colonies de mangeoires pour NCM
4 Protocole 3:. Autre HPSC colonies sur Matrigel à NCM Culture
5 Protocole 4:. NCM Culture de hPSCs sur LN-521
. 6 Protocole 5: NCM Culture pour l'ADN plasmidique transfection
. 7 Protocole 6: NCM Culture pour la transfection de microARN
Un schéma général de la culture NCM
La figure 1 représente un schéma typique de culture NCM montrant les changements dynamiques de hPSCs après placage à forte densité de cellule unique en présence de l'inhibiteur de ROCK Y-27632. Ces changements morphologiques comprennent des connexions intercellulaires après placage, la formation de grappes cellulaires, et la croissance cellulaire exponentielle suivie d'une condensation de cellules (Figure 1A). Une expérience représentative indique WA01 (H1) CSEh, plaqué comme cellules individuelles à une densité de 1,9 x 10 5 cellules / cm 2 en présence de 10 pM de Y-27632 au jour 1 (figure 1B, panneau de gauche), à la suite propagé sans la formation de colonies (figure 1B, panneau du milieu) au jour 2, et condensé en monocouche homogène qui est approprié pour les expériences souhaitées ou pour repiquage des cellules au jour 3 (figure 1B, panneau de droite).
<> Divers inhibiteurs de ROCK fortes soutenir la culture NCM
Un essai de plaque de 96 puits a été utilisé pour la preuve de concept de dépistage de drogues à haut débit. Il a également été conçu pour optimiser l'utilisation de différents inhibiteurs de ROCK pour soutenir la culture NCM. Environ 31 000 cellules dissociées SCU-i10, des cellules pluripotentes humaines induites (hiPSCs) 17, ont été étalées sur un Matrigel revêtu bien en présence de différentes concentrations d'inhibiteurs de ROCK. Après 24 h, les cellules ont été soumises à l'essai de survie basé CCK-8 pour déterminer la survie des cellules dans ces conditions. Nous avons précédemment montré que la méthode NCM requiert l'utilisation de l'inhibiteur de ROCK, le Y-27632, à 10 uM pour améliorer le placage à cellule unique. Dans ce rapport, nous avons confirmé que 10 uM Y-27632 augmenter de manière significative 24 h unicellulaire efficacité d'étalement de hiPSCs (P <0,05) (figure 2). Nous avons également constaté que Y-39983 (ROCK je inhibiteur), phenylbenzodioxane (ROCK II inhibitionteur), et thiazovivin (un inhibiteur de ROCK roman) moduler significativement unicellulaire efficacité de placage et de promouvoir la croissance NCM à 1 uM par rapport à leurs témoins (p <0,05) (figure 2). En outre, les effets des trois inhibiteurs de ROCK (à 1 uM) sur une seule cellule efficacité d'étalement étaient comparables à celle de Y-27632 à 10 uM (P> 0,05) (figure 2). Notamment, le ROCK je inhibiteur (à 5 uM) semble montrer cytotoxicité marquée par rapport à la drogue à 1 uM (P <0,05), impliquant une interaction plus spécifique que les autres molécules. Ainsi, différents inhibiteurs de ROCK peuvent être utilisés pour soutenir la culture NCM à l'avenir. Cependant, une caractérisation complète des deux CSEh et hiPSCs sous NCM avec ces nouveaux inhibiteurs serait nécessaire pour une utilisation future.
LN-521 soutient la culture NCM sans l'utilisation d'inhibiteurs de ROCK
Pour déterminer til le rôle d'une isoforme spécifique laminine pour soutenir la croissance des CSEh, nous cultivée hiPSCs SCU-i30 sur des plaques LN-521-enduits dans le milieu sans xéno-TeSR2. Fait intéressant, LN-521 seul, sans la présence d'inhibiteurs de ROCK, soutient le placage unique et la croissance cellulaire NCM ultérieure pour 15 passages dans ces conditions (figure 3). Immunomarquage de cellules SCU-i30 avec un anticorps polyclonaux anti-NANOG indiqué que les cellules sous cette condition avaient expression NANOG élevé dans les noyaux (figure 3A). Analyse par cytométrie de flux a montré que le profil d'expression de marqueur de CSEh était similaire aux cellules cultivées comme MR en utilisant l'inhibiteur de ROCK Y-27632 (figure 3B).
Haute efficacité de la prestation des microARN sans l'utilisation de particules lentiviraux
Transfection avec des microARN oligonucléotidiques marquées Dy547 a été réalisée en WA01 (H1), les cellules dans des conditions MR. CSEh WA01 ont été cultivées sur des MR 2,5% de Matrigel dans mTeSR1 pour 2 (figure 4A) et 18 (figure 4B) passages, respectivement. Ces cellules ont montré une grande h post-transfection efficacité de transfection 24 (figures 4A et 4B). En général, nous pouvons obtenir l'efficacité de transfection jusqu'à 91% dans les CSEh à 24 h après la transfection.
Figure 1. (A) Schéma de la culture NCM. Le graphique de la ligne délimite les changements dynamiques de l'association multicellulaire dans une culture typique de 3 jours dans des conditions NCM. (B) images de phase représentatifs de WA01 (H1) CSEh reproduits sous une condition NCM de 2,5% Matrigel en milieu mTeSR1 pour 16 passages (désignés comme WA01, mcp16). Le panneau inférieur est la vue agrandie du panneau supérieur. Barres d'échelle indiquent 100 um.ef = "https://www-jove-com.remotexs.ntu.edu.sg/files/ftp_upload/51519/51519fig1highres.jpg" target = "_blank"> S'il vous plaît cliquer ici pour voir une version plus grande de cette figure.
Figure 2. Des dosages de survie de cellules uniques en utilisant un format 96 puits. Environ 31.000 hiPSCs SCU-i10 17 ont été étalées sur 2,5% de Matrigel en présence de divers inhibiteurs de petites molécules liées à la kinase Rho-associés (ROCHE) les parcours à des concentrations indiquées . Après 24 h, les cellules ont été soumises à l'essai de survie CCK-8 par mesure de l'absorbance à 450 nm (A450). Le test t de Student a été utilisé pour déterminer si les différences dans une seule cellule efficacité de placage entre les différents inhibiteurs de ROCK sont de signification statistique. Le signe astérisque singulier (*) indique qu'il n'ya pas de différences significatives entre les inhibiteurs (P & #62; 0,05), alors que les doubles des signes d'astérisque (**) désigne la différence observée est de la signification statistique (P <0,05). Colonnes dans les histogrammes désignent les valeurs moyennes des déterminants et des bars quadruple représentent les écarts types.
Figure 3. Culture NCM de hiPSCs sur la laminine-521 (LN-521) sans la présence d'inhibiteurs de ROCK. L'ligne hiPSC SCU-i30 a été établi à la NIH Stem Cell Unit. Cellules SCU-i30 ont été cultivées sur LN-521 revêtues des plaques 6 puits à la libre xéno-moyen TeSR2 pour 15 passages sans l'utilisation d'inhibiteurs de petites molécules comme les inhibiteurs de ROCK. (A) Immunomarquage de cellules SCU-i30 avec un anti -NANOG anticorps polyclonaux et contre-avec Hoechst 33342 (Hoechst). Notamment, certaines cellules qui ont une coloration négative NANOG sont ecellules de e sous la mitose. (B) Débit d'analyse par cytométrie de HPSC expression du marqueur dans les cellules SCU-i30 cultivées comme NCM de 2,5% Matrigel avec l'utilisation de 10 uM Y-27632 (panneau supérieur) ou NCM sur LN-521 sans Y-27632 (panneau inférieur). Les procédures pour la coloration immunologique et l'analyse par cytométrie en flux ont été décrites précédemment 5. Barres d'échelle représentent 100 um. S'il vous plaît cliquer ici pour voir une version plus grande de cette figure.
Figure 4. NCM culture de hPSCs pour microARN transfection. WA01 CSEh ont été cultivées comme NCM de 2,5% Matrigel dans mTeSR1 pour 2 (A) et 18 (B) passages, respectivement. Images de phase et de fluorescence représentatifs de cellules transfectées avec WA01 Dy547 marqué au micro-ARN de contrôle pour la surveillance de l'efficacité de transfection 24 h après la transfection. Barres d'échelle représentent 100 um. S'il vous plaît cliquer ici pour voir une version plus grande de cette figure.
Il ya deux façons principales de hPSCs de culture in vitro: culture classique de type colonie (des cellules sur des mangeoires ou des matrices extracellulaires) et de la culture de suspension de hPSCs que les agrégats sans mangeoires 6. Les limites de ces deux type de colonie et de la suspension des méthodes de culture comprennent hétérogénéité accumulé et les changements épigénétiques héritables. NCM culture, sur la base à la fois des passages à cellule unique et à haute densité cellulaire plaquage, constitue une nouvelle méthode de culture de 6,18 HPSC de croissance. Bien que diverses méthodes de passages à cellule unique ont été documentés dans la littérature, mais aucun d'entre eux sont utilisés pour la propagation de routine. Par exemple, Wu et ses collègues ont utilisé une méthode de passages à cellule unique pour étudier les effets de différentes petites molécules cocktails sur la croissance HPSC 19. Toutefois, leurs produits de la culture sont finales colonies. Ainsi, les méthodes de passages seule cellule faibles fondé sur la densité appartiennent encore au type de colonie culture. En ce qui concerne la culture NCM, les hauts-tanièreslité placage transforme cette culture à une nouvelle méthode, étant donné que le produit final de cellules est une monocouche homogène. Récemment, Dvorak et ses collègues ont utilisé la méthode similaire à analyser de manière approfondie les propriétés HPSC sous cette condition de croissance 18. Leurs résultats soutiennent également nos principales conclusions. Il est maintenant clair que la culture NCM est une nouvelle méthode qui possède plusieurs nouvelles propriétés et peut en outre être modifié pour de nombreuses applications potentielles dans pluripotentes biologie des cellules souches.
Les propriétés de base de hPSCs de culture NCM
Il est concevable que hPSCs sous NCM part de la culture de nombreuses caractéristiques avec les mêmes types de cellules cultivées comme des colonies 9,18. Les taux des marqueurs de CSEh dans hPSCs, qui comprennent Oct-4, NANOG, AESS-3/4, Tra-1-60, Tra-1-81 et l'AESS-1, expression sont similaires dans les deux MR et de type colonie culture . NCM cellules adaptées conservent également des tendances similaires d'expression d'ARNm mondiale de colonies HPSC cultivés sur MEF couches d'alimentation 9. De toute évidence, les cellules NCM adaptées maintenir l'état pluripotent tel que déterminé par dosage tératome 9,18. Cependant, contrairement à HPSC colonies, les cellules dans des conditions MR ont un taux de croissance prévisible qui est caractérisé par des courbes de croissance, cohérentes cycles cellulaires, et le nombre de cellules 9. En raison de la haute densité à cellule unique placage, hPSCs dans des conditions NCM affichent une croissance exponentielle entre les jours 2 et 4 (figure 1B), ce qui augmente le nombre de cellules de 4 fois par rapport aux colonies cultivées sur HPSC MEF. Culture prolongée n'augmente pas la production de cellules, mais augmente l'apoptose et la différenciation de stress 9. NCM permet également cryoconservation optimale, permettant ainsi la récupération rapide des cellules sur placage cellules décongelées (Protocole 1). De plus, NCM facilite l'adaptation de la culture HPSC différents protocoles sans xéno-9. En général, MR soutient la croissance de hPSCs, maintient l'état pluripotent, et soutient le potentieltiel de hPSCs à se différencier en tissus adultes des trois feuillets embryonnaires.
stabilité chromosomique dans hPSCs sous NCM
En termes de stabilité chromosomique, il n'y a aucune comparaison directe entre les cellules provenant de différents procédés de culture. La majorité des hPSCs dans nos conditions de culture NCM ont caryotypes normaux et le nombre de copies du gène tel que déterminé par G-banding, l'hybridation génomique comparative basée sur la baie (aCGH), et l'hybridation fluorescente in situ (FISH) 9. Deux lignes (~ 13%) ont montré caryotype anormal, dans lequel une ligne (c.-à-WA09) exposé polyploïdie élevée et un autre (ES01) avaient 14% de cellules ayant la trisomie 20 9. On ne sait pas si ces caryotypes anormaux ont été tirées de la sélection de cellules préexistantes mutés avant la culture NCM ou induits lors NCM adaptation. Il est important que les colonies ou sous-ensemble de colonies HPSC départ utilisés pour la culture sh NCMould être bien caractérisé en termes de leur homogénéité et de la stabilité chromosomique à l'époque pour NCM adaptation. Notamment, le taux de caryotypes anormaux dans des conditions NCM est beaucoup plus faible que celui rapporté dans une analyse de cohorte récente, dans laquelle les auteurs révèlent 34% caryotype anormal sous prédominantes conditions de culture de type colonie 20. Par conséquent, notre étude indique que nous pouvons cultiver des cellules simples-dissociées et maintenir leur stabilité chromosomique dans des conditions NCM. Néanmoins, nous avons besoin aussi d'utiliser des méthodes plus sensibles pour examiner les anomalies chromosomiques de hPSCs dans les années à venir. En particulier, nous devons analyser les chromosomes 1, 12, 17, et 20 à l'aide de sondes plus élevés de résolution (c'est à dire, <50 ko), comme certaines lésions mineures (par exemple, l'amplicon 20q11.21) à ces chromosomes fréquemment modifiées ne peuvent pas être détectés par classique caryotype et FISH 20-22. En outre, l'élaboration de protocoles divers NCM nous permettra d'identifier Robust et des méthodes sûres pour des applications futures.
Culture NCM sous diverses modifications
L'utilisation de l'inhibiteur de ROCK, Y-27632, a ouvert la porte à des analyses basées seule cellule. La disponibilité des inhibiteurs de ROCK diverses donnerait plus de choix pour l'expansion à base de NCM et la cryoconservation de hPSCs (Figure 2). En théorie, toute petite molécule, qui peut augmenter considérablement l'efficacité de cellule unique de placage, peut être utilisé pour faciliter la culture des MR. JAK inhibiteur 1, qui fonctionne différemment de ces inhibiteurs de ROCK, représente un exemple 9. L'utilisation de molécules simples ou des approches combinatoires peut nous assurer une croissance optimale des cellules, des tests cellulaires, et la cryoconservation de hPSCs. Cependant, la culture NCM variante de hPSCs sur les protéines de la matrice extracellulaire, tels que définis la laminine isoforme LN-521, normalement exprimée dans les cellules hES 23-25, peut éliminer l'interférence de petitesmolécules (figure 3). LN-521 pourrait améliorer la survie dissociée-HPSC et soutient la pluripotence par l'activation de la voie α6β1-PI3K/AKT 24. La simplicité de hPSCs de passages avec LN-521 réduit l'hétérogénéité des cellules, compatibles avec les différents systèmes de culture cellulaire et d'une connexion xéno-gratuit-alimentation en utilisant un milieu complètement défini (protocole n ° 4). Il fournit également un module supplémentaire pour tests à haut débit sans l'influence de petites molécules. Bien que les CSPi sous culture NCM sur LN-521 retenus l'expression d'un panel de marqueurs HPSC, outre la caractérisation de ces cellules à l'aide de test de tératome et la différenciation de multilignée corps médiation embryoïde peut être nécessaire pour confirmer les Etats pluripotentes dans ces cellules. Fait à noter, hiPSCs cultivées sur la laminine isoforme LN-521 seraient cytogénétique stable (http://biolamina.com/). Cependant, nous avons également besoin d'appliquer à plus haute résolution et sensibles méthodes (voir ci-dessus) à eXamine la stabilité chromosomique dans ces cellules.
Polyvalence de la culture NCM pour le génie génétique
Méthodes basées sur la NCM représentent un système simple, robuste et économique qui peut être particulièrement utile pour la manipulation génétique de hPSCs (Protocoles 5-7). On sait que les colonies hESC sont difficiles à transfecter ou transduire, avec une grande variabilité dans l'efficacité de transfection / transduction entre les différents laboratoires 26-28. Par exemple, l'efficacité de transfection dans les cellules hES varie de 3 à 35% des colonies sous des conditions de culture 26. Des signaux de transduction lentiviraux dans des cellules dans des conditions BG01 de colonies se sont révélées être extrêmement bas 9. Cependant, l'efficacité de la transfection médiée par NCM a été supérieure à 75% et 9 modification des méthodes de transduction peut augmenter l'efficacité de la transduction médiée par un lentivirus jusqu'à 90% 28. Une étude comparative serré a révélé qu'il est ee associations de colonies multicellulaires hESC qui contribuent à la faible efficacité de transfection 9. En outre, nous avons récemment modifié d'un protocole de transfection de microARN et sont capables d'atteindre une efficacité de transfection élevée (~ 91%), sans l'utilisation de lentivirus (Protocole 6 et figure 4). Ce protocole est facile à utiliser et particulièrement utile pour les expériences de transfection transitoire au sein d'un 3 - au laps de temps de 5 jours. Comme nous l'avons délimité dans les protocoles ci-dessus, plusieurs facteurs doivent être pris en considérations lorsque nous optimisons l'efficacité de transfection / transduction dans hPSCs. Ces facteurs comprennent la densité cellulaire, la concentration de plasmide, les titres lentiviraux, multiplicité d'infection (MOI), la durée de transfection / transduction, la cytotoxicité des réactifs et des procédés utilisés pour l'efficacité de transfection de surveillance / transduction.
Nous élaborons et étendre les méthodes MR à hPSCs de culture sur Matrigel et sur les matrices extracellulaires définies. Cette méthode de cultureest un moyen efficace pour éliminer l'hétérogénéité trouve couramment dans les colonies HPSC et cultures agrégées. Cellules souches pluripotentes humaines dans des conditions de croissance MR sont pluripotentes et chromosomique stable. Ce nouveau système de culture est simple et polyvalent pour HPSC entretien, expansion à grande échelle, et les manipulations génétiques.
The authors declare that they have no competing financial interests.
This work was supported by the Intramural Research Program of the National Institutes of Health (NIH) at the National Institute of Neurological Disorders and Stroke. We would like to thank Dr. Ronald D. McKay for his discussion and comments on this project.
Name | Company | Catalog Number | Comments |
Countess automated cell counter | Invitrogen Inc. | C10227 | Automatic cell counting |
Faxitron Cabinet X-ray System | Faxitron X-ray Corporation, Wheeling, IL | Model RX-650 | X-ray irradiation of MEFs |
MULTIWELL 6-well plates | Becton Dickinson Labware | 353046 | Polystyrene plates |
DMEM | Invitrogen Inc. | 11965–092 | For MEF medium |
Mitomycin C | Roche | 107409 | Mitotic inhibitor |
Trypsin | Invitrogen Inc. | 25300-054 | For MEF dissociation |
DMEM/F12 | Invitrogen Inc. | 11330–032 | For hPSC medium |
Opti-MEM I Reduced Serum Medium | Invitrogen Inc. | 31985-062 | For hPSC transfection |
Heat-inactivated FBS | Invitrogen Inc. | 16000–044 | Component of MEF medium |
Knockout Serum Replacement | Invitrogen Inc. | 10828–028 | KSR, Component of hPSC medium |
Dulbecco’s Phosphate-Buffered Saline | Invitrogen Inc. | 14190-144 | D-PBS, free of Ca2+/Mg2+ |
Non-essential amino acids | Invitrogen | 11140–050 | NEAA, component of hPSC medium |
L-Glutamine | Invitrogen | 25030–081 | Component of hPSC medium |
mTeSR1 & Supplements | StemCell Technologies | 5850 | Animal protein-free |
TeSR2 & Supplements | StemCell Technologies | 5860 | Xeno-free medium |
β-mercaptoethanol | Sigma | M7522 | Component of hPSC medium |
MEF (CF-1) ATCC | American Type Culture Collection (ATCC) | SCRC-1040 | For feeder culture of hPSCs |
hESC-qualified Matrigel | BD Bioscience | 354277 | For feeder-free culture of hPSCs |
Laminin-521 | BioLamina | LN521-02 | Human recombinant protein |
FGF-2 (recombinant FGF, basic) | R&D Systems, MN | 223-FB | Growth factor in hPSC medium |
CryoStor CS10 | StemCell Technologies | 7930 | |
Accutase | Innovative Cell Technologies | AT-104 | 1X mixed enzymatic solution |
JAK inhibitor I | EMD4 Biosciences | 420099 | An inhibitor of Janus kinase |
Y-27632 | EMD4 Biosciences | 688000 | ROCK inhibitor |
Y-27632 | Stemgent | 04-0012 | ROCK inhibitor |
Y-39983 | Stemgent | 04-0029 | ROCK I inhibitor |
Phenylbenzodioxane | Stemgent | 04-0030 | ROCK II inhibitor |
Thiazovivin | Stemgent | 04-0017 | A novel ROCK inhibitor |
BD Falcon Cell Strainer | BD Bioscience | 352340 | 40 µm cell strainer |
Nalgene 5100-0001 Cryo 1 °C | Thermo Scientific | C6516F-1 | “Mr. Frosty” Freezing Container |
Lipofectamine 2000 | Invitrogen Inc. | 11668-027 | Transfection reagents |
DharmaFECT Duo | Thermo Scientific | T-2010-02 | Transfection reagent |
Non-targeting miRIDIAN miRNA Transfection Control | Thermo Scientific | IP-004500-01-05 | Labeled with Dy547, to monitor the delivery of microRNAs |
SMART-shRNA | Thermo Scientific | To be determined | Lentiviral vector |
pmaxGFP | amaxa Inc (Lonza) | Included in every transfection kit | Expression plasmid for transfection control |
Oct-4 | Santa Cruz Biotechnology | sc-5279 | Mouse IgG2b, pluripotent marker |
SSEA-1 | Santa Cruz Biotechnology | sc-21702 | Mouse IgM, differentiation marker |
SSEA-4 | Santa Cruz Biotechnology | sc-21704 | Mouse IgG3, pluripotent marker |
Tra-1-60 | Santa Cruz Biotechnology | sc-21705 | Mouse IgM, pluripotent marker |
Tra-1-81 | Santa Cruz Biotechnology | sc-21706 | Mouse IgM, pluripotent marker |
CK8 (C51) | Santa Cruz Biotechnology | sc-8020 | Mouse IgG1, against cytokeratin 8 |
α-fetoprotein | Santa Cruz Biotechnology | sc-8399 | AFP, mouse IgG2a |
HNF-3β (P-19) | Santa Cruz Biotechnology | sc-9187 | FOXA2, goat polyclonal antibody |
Troponin T (Av-1) | Thermo Scientific | MS-295-P0 | Mouse IgG1 |
Desmin | Thermo Scientific | RB-9014-P1 | Rabbit IgG |
Anti-NANOG | ReproCELL Inc, Japan | RCAB0004P-F | Polyclonal antibody |
Rat anti-GFAP | Zymed | 13-0300 | Glial fibrillary acidic protein |
Albumin (clone HSA1/25.1.3) | Cedarlane Laboratories Ltd. | CL2513A | Mouse IgG1 |
Smooth muscle actin (clone 1A4) | DakoCytomation Inc | IR611/IS611 | Mouse IgG2a |
Nestin | Chemicon International | MAB5326 | Rabbit polyclonal antibody |
TUBB3 | Convance Inc | MMS-435P | Tuj1, mouse IgG2a |
HNF4α (C11F12) | Cell Signaling Technologies | 3113 | Rabbit monoclonal antibody |
Paraformaldehyde (solution) | Electron Microscopy Sciences | 15710 | PFA, fixative, diluted in D-PBS |
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