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* Ces auteurs ont contribué à parts égales
Avec son petit corps, transparent et documenté neuroanatomie et une foule de techniques génétiques qui se prêtent et réactifs, C. elegans Fait un organisme modèle idéal pour In vivo Imagerie neuronale utilisant relativement simples et peu coûteuses techniques. Nous décrivons ici l'imagerie seul neurone dans les animaux adultes intacts génétiquement codés à l'aide des indicateurs de calcium fluorescentes.
Le ver nématode C. elegans est un organisme modèle idéal pour relativement simple, l'imagerie à faible coût neuronale in vivo. Son petit corps transparentes et simples, bien caractérisé le système nerveux permet l'identification et l'imagerie de fluorescence d'un neurone à l'intérieur de l'animal intact. Techniques d'immobilisation simples avec un impact minimal sur la physiologie de l'animal permettent prolongée imagerie time-lapse. Le développement de fluorophores calcium génétiquement encodés sensibles tels que cameleon 1 et 2 GCaMP permettre l'imagerie in vivo de calcium neuronal concernant la physiologie cellulaire et l'activité neuronale. De nombreuses souches transgéniques exprimant ces fluorophores dans des neurones spécifiques sont facilement disponibles ou peuvent être construits en utilisant des techniques bien établies. Ici, nous décrivons des procédures détaillées pour la mesure dynamique du calcium dans un seul neurone in vivo en utilisant à la fois GCaMP et caméléon. Nous discutons des avantages et des disadvantles âges de deux, ainsi que diverses méthodes de préparation des échantillons (immobilisation des animaux) et l'analyse d'image. Enfin, nous présentons les résultats de deux expériences: 1) Utilisation GCaMP pour mesurer la réponse d'un neurone sensoriel spécifique à un champ électrique externe et 2) Utilisation cameleon pour mesurer la réponse physiologique de calcium d'un neurone à l'endommagement laser traumatique. Techniques d'imagerie calcique comme ceux-ci sont largement utilisés dans C. elegans et ont été étendues aux mesures chez les animaux se déplaçant librement, les neurones multiples simultanément et de comparaison entre fonds génétiques. C. elegans présente un système robuste et flexible pour l'imagerie neuronale in vivo avec des avantages par rapport aux systèmes d'autres modèles de simplicité et de coût.
Nous présentons ici des méthodes pratiques pour l'imagerie in vivo de calcium dans C. neurones elegans. Le développement de la codés génétiquement sensible au calcium avec une grande fluorophores signal sur bruit rend C. elegans un système relativement simple et rentable pour la mesure de la neurophysiologie et de l'activité. Notre formation d'image est effectuée avec un microscope standard à l'aide d'imagerie à grand champ de fluorescence des fluorophores couramment disponibles. Nous présentons plusieurs techniques employant différents fluorophores et la préparation des échantillons différents, de discuter les forces et les faiblesses de chacun. Les données sont ensuite présentées à partir de deux expériences exemple. Une excellente ressource supplémentaire sur les techniques décrites ici peuvent être trouvés dans WormBook, "Imagerie l'activité des neurones et les muscles" de R. Kerr, ( http://www.wormbook.org ) 3.
Deux grandes classes d'génétiquementment codées reporters fluorescents de calcium sont couramment utilisés dans C. elegans: GCaMP seul canal et FRET à base de cameleon. Nous allons décrire les méthodes et montrer des exemples de données générés par chacun.
GCaMP est basé sur une modification de la protéine fluorescente verte (GFP) qui est sensible à la concentration de calcium environnante. Ceci est réalisé par fusion de la GFP et de la calmoduline de calcium de haute affinité protéine, de telle sorte que la fixation du calcium par la calmoduline de la molécule apporte une confirmation dans la GFP efficace fluorescent 2. Les récents progrès dans ces fluorophores générer taille exceptionnelle du signal avec une augmentation jusqu'à 500% de l'intensité de fluorescence dans une gamme physiologique de la calcémie et de la cinétique relativement rapide de ~ 95 ms de temps de montée et temps de descente ~ 650 msec 4. Sur des périodes de temps relativement courtes (minutes), ces signaux peuvent permettre grandes pour l'imagerie basse résolution (faible grossissement) et, étant donné un sage init amesure de référence ial, nier la nécessité pour base continue ou mesures comparatives.
Cameleon a l'avantage d'être un fluorophore FRET basée sur une mesure qui génère ratiométrique comparaison de deux canaux indépendants ou longueurs d'onde 1. Il se compose de deux fluorophores séparés (cyan et jaune émettant des protéines fluorescentes, CFP et YFP) reliés par une protéine calmoduline. Le complexe est éclairé par la lumière bleue (440 nm) qui excite la PCP. Fixation du calcium apporte les fluorophores se rapprocher, ce qui augmente le transfert d'énergie de fluorescence par résonance (FRET) à partir de la PCP (donneur) de la YFP (accepteur) et provoquer l'émission de la PCP (480 nm) et pour diminuer l'émission YFP (535 nm) pour augmenter . Le taux de calcium relatifs sont mesurés par le rapport de l'intensité de la YFP / PCP. Cameleon cinétique est plus lente que celle de GCaMP, mesurée in vivo pour avoir un temps de montée d'environ 1 s et un temps de décroissance de 3 ~ 5 sec. Cependant,le rapport des signaux en opposition mobiles augmente la taille du signal et pour compenser un certain nombre d'objets possibles à cause de changements de concentration en fluorophore, de mouvement ou de la dérive et de mise au point de blanchiment.
Génétiquement codés rapporteurs fluorescents annuler une grande partie de la préparation des échantillons avec des sondes exogènes administrées et C. elegans petit corps transparent permet l'imagerie chez l'animal intact en utilisant de simples fluorescence large champ. Le principal défi technique dans la préparation des échantillons est donc d'immobiliser les animaux en toute sécurité. Il ya un certain nombre de différentes techniques couramment utilisées chacune avec des avantages et des inconvénients. L'utilisation d'un agent pharmacologique de paralyser les animaux est facile à mettre en œuvre et permet le montage de plusieurs animaux sur une préparation (lévamisole, un agoniste cholinergique qui provoque le tissu musculaire à saisir est généralement utilisé 6). C. elegans peut aussi être physiquement immobilisé par leur montagele raide 10% d'agarose 7, 8. Cet impact réduit sur la physiologie des animaux, permet à long terme d'imagerie (heures) et la récupération de plusieurs animaux, mais est techniquement plus difficile. Ces deux techniques limiter l'accès physique aux animaux (qui sont sous une lamelle) et ne peut donc être utilisé avec certains stimuli expérimentaux (tels que la lumière, la température, champ électrique ou de dommage au laser). Pour les stimuli où l'accès physique est nécessaire, comme le toucher ou l'administration de produits chimiques, de nombreuses études ont réussi à coller C. elegans en place (en utilisant de la colle d'vétérinaire) 9. Ce qui est techniquement plus difficile, est une préparation unique animal et ne permet pas la récupération des animaux. Enfin, de nombreux dispositifs microfluidiques ont été employées que physiquement contre C. elegans, la préservation de la physiologie animale, ce qui permet une exposition à la plupart des types de stimuli (en fonction de la conception du dispositif) et peut permettre l'échange rapide et de récupération des animaux 10, 11. Cependant microfluidique besoin d'autres compétences techniques et des capacités dans la conception, la fabrication et la mise en œuvre. L'activité animaux immobilisés et de relance de réponse peut généralement être mesurée en sensoriels et des interneurones. L'activité des neurones moteurs nécessite des techniques plus sophistiquées d'imagerie chez l'animal en mouvement. Ici, nous allons présenter les méthodes détaillées utilisant les deux techniques les plus simples de la paralysie pharmacologique et immobilisation rigide agarose.
Les méthodes présentées ici peuvent être utilisés pour mesurer l'activité neuronale et la physiologie des cellules de C. elegans. Nous donnons un exemple de chaque: en utilisant GCaMP pour mesurer la réponse du neurone sensoriel ASJ à un champ électrique externe, et en utilisant cameleon pour mesurer la réponse physiologique au calcium endommagement laser d'un neurone. Ces exemples montrent les avantages et les inconvénients des deux types de fluorophores et d'illustrer ce qui est possible avec le système.
1. Configuration optique
2. Préparation des échantillons et d'acquisition de données.
3. Analyse des données
4. Résolution de problèmes
Nous présentons ici les résultats de deux expériences distinctes. Le premier emploie GCaMP pour mesurer la réponse d'un neurone sensoriel spécifique à un stimulus externe définie, ce qui donne un bon exemple de la façon dont les journalistes de calcium fluorescents peuvent être utilisés pour surveiller optiquement l'activité neuronale dans intacts C. elegans. La seconde emploie cameleon pour mesurer le calcium intracellulaire transitoire déclenché dans le neurone en réponse aux dommages laser spécifique, ce qui illustre comment la physiologie de calcium peut être mesurée dans une seule cellule in vivo. De se concentrer sur les aspects techniques de chaque mesure les résultats d'essais individuels sont présentés et discutés en détail. Souvent, la réponse moyenne au cours du temps (calculée comme étant la réponse moyenne à chaque point dans le temps par rapport à la stimulation) ou une mesure spécifique (comme l'amplitude moyenne de la réponse) sont calculées sur l'ensemble de nombreuses épreuves. Typiquement 10-20 essais sont nécessaires pour générer une mesure moyenne acceptable, mais tson nombre dépendra de la variabilité inhérente de la réponse. Une telle analyse de données pour les expériences présentées ici peuvent être trouvés dans 12 et 13.
GCaMP mesure de la réponse sensorielle: Lorsqu'il est soumis à un fort champ électrique externe (≥ 3 V / cm), C. elegans activement ramper vers le pôle négatif du champ avec le mouvement dirigé précis. Nous avons déjà montré que ce comportement electrotactic est principalement médiée par les neurones ASJ gauche et droite, amphid neurones sensoriels situés dans la tête de l'animal 12. Pour visualiser cette réponse, nous avons utilisé une souche transgénique exprimant GCaMP3 spécifiquement dans les neurones ASJ gauche et à droite par l'AMP-9 promoteur. Nous immobilisé animaux pour l'imagerie utilisant des tampons d'agarose contenant du lévamisole 0,05% en sandwich entre deux lamelles (comme décrit dans les procédures). La stimulation électrique a été administré à l'aide d'une chambre d'imagerie sur mesure qui s'adapte à laplatine d'un microscope inversé Nikon Ti (voir 12). En bref, la préparation lamelle est placée (avec le côté ver le bas) sur un trou dans une petite chambre en matière plastique permettant un accès pour les objectifs ci-dessous et le niveau d'imagerie à travers la lamelle. La chambre a été remplie avec 0,25 mM de NaCl et 50 mM de tampon glycérol et le stimulus de champ électrique appliqué au moyen de deux électrodes de platine le long des extrémités de la chambre. Comme décrit ci-dessus, un seul neurone ASJ exprimer CGaMP a été imagées par un X100 1.4 Objectif NA immersion dans l'huile et le niveau GFP jeu de filtres. Un film time-lapse a été acquis pour 80 secondes (1 image / s, 300 ms de temps d'exposition), tout en soumettant l'animal à un écran externe 3 V / cm champ électrique pendant trois procès distincts d'une durée 10 sec (figure 3). Nous avons mesuré l'intensité de fluorescence au niveau du corps cellulaire en utilisant l'analyse d'image décrite ci-dessus. La vidéo affiche des fautes légères à la fois le mouvement et la dérive accent au cours de l'expérience. La strength du signal GCaMP demeure robuste mais montrant une grande augmentation d'environ 250% de la fluorescence en réponse à la fois le 1 er et 3 ème stimuli. Le résultat des stimuli seconde est considérablement réduit démontrant la variabilité dans la réponse neuronale. Le blanchiment est faible comme en témoigne le retour à un niveau de base cohérente.
Cameleon mesure de physiologie cellulaire de calcium: traumatique des lésions cellulaires déclenche une grande calcium transitoire dans un neurone qui joue un rôle essentiel dans le destin dicter la réponse physiologique cellulaire (mort cellulaire soit par rapport à l'initiation du processus de réparation). On peut mesurer cette réponse aux dommages induits in vivo en utilisant un laser femtoseconde à rompre individuelle C. elegans neurones 14, tandis que la mesure simultanée de signaux calciques cellulaires en utilisant cameleon YC3.60 13, 15. Animaux exprimant cameleon YC3.60 dans les six neurones mécano (sous lamec-4 promoteur), ont été immobilisés en utilisant 10% d'agarose et le polystyrène nanoparticules comme décrit dans les procédures. Nous avons utilisé une optique d'imagerie double pour enregistrer des signaux à la fois de la CFP et YFP canaux de fluorescence comme décrit dans les procédures. Nous imager un seul neurone ALM et laser ciblé l'axone ~ 20 um du corps cellulaire (figure 4A). L'axone a été coupée par une brève (<1 sec) exposition à la lumière d'un laser pulsé infrarouge femtoseconde centré au point cible long de l'axone par l'objectif de reproduction (voir 13 pour plus de détails sur la chirurgie au laser). Time-lapse images à une trame toutes les 3 secondes, avec 400 msec temps d'exposition ont été enregistrées pour 320 s tandis que la chirurgie au laser et les niveaux de calcium calculées en utilisant une analyse ratiométrique.
Signaux ont été mesurés indépendamment sur le corps de cellule (figure 4B) et pour le segment en 5 um axone du point de coupure (figure 4C). Les chiffres montrent à la fois la CPF intensités et YFP ainsi que le rapport qui en résultent FRET. La mesure au niveau du corps cellulaire se comporte bien avec la PCP diminue rapidement et la YFP augmenter en réponse aux dommages laser à sec t = 0 (flèche rouge). Il en résulte immédiatement une augmentation de 200% ~ dans le signal ratiométrique (AF / F) qui se maintient pendant ~ 90 secondes avant de retomber à des niveaux de base près. Le blanchiment est faible comme le montre la ligne de base cohérente.
Dans le segment de l'axone à proximité du point de coupure, la quantité locale de fluorophore varie au cours de l'expérience, ce qui complique le signal. La chirurgie au laser rompt l'axone et rompt brièvement la membrane, ce qui permet fluorophore à s'échapper et à réduire temporairement sa concentration cytoplasmique locale. Cela est évident à partir d'une baisse initiale de la trace YFP à la figure 4C et une comparaison du segment axone près du point de dégâts dans les images YFP aux temps t = 0 s et t = 6 s, la figure 4A. À later points dans le temps, l'extrémité coupée gonfle dans le cadre de sa reprise continue, ce qui entraîne fluorophore localisé plus et une augmentation de l'intensité. Cela est particulièrement évident dans la trace augmente lentement PCP à la figure 4C et une comparaison du segment axonal dans les images de la PCP au temps t = 0 s et t = 270 s, la figure 4A. Cependant, ces variations affectent les deux canaux de manière égale et le rapport FRET compense efficacement. La mesure qui en résulte montre une réponse semblable au corps cellulaire avec un ~ immédiate augmentation de 150% du signal (AF / F), un redressement spectaculaire de base à près de ~ 90 secondes, puis une, plus petite réponse secondaire à ~ 150 sec. L'analyse ratiométrique est essentiel à cette mesure, car il serait extrêmement difficile de séparer le signal de calcium à partir des autres effets, qui peuvent varier considérablement d'un neurone à neurone et de la chirurgie à la chirurgie. Le signal d'axone a plus de bruit par rapport au signal de corps cellulaire en raison principalement de gradateur de fluorescence etle plus petit retour sur investissement au sens étroit axone.
Figure 1. Configuration de base et de l'optique ratiométriques. A) La photo montre le montage expérimental constitué d'un microscope inversé et composé optique d'imagerie ratiométrique. B) Un diagramme schématique illustrant l'optique d'imagerie nécessaires pour les ratiométriques FRET base de mesures. L'image est divisée en deux longueurs d'onde ou des canaux, qui sont prévus côte-à-côte sur la matrice CCD.
Figure 2. Préparation de l'échantillon. C. elegans sont montés sur des plots d'agarose minces pour l'imagerie. A coussinets d'agarose) sont faites en prenant en sandwich une petite goutte deagarose fondu entre deux lames de microscope espacées par deux morceaux de ruban de laboratoire. B) Les animaux sont transférés sur le bloc d'agarose et recouverte d'une lamelle couvre-objet, maintenu en place par une petite quantité de cire à chacun des quatre coins.
Figure 3. Des exemples de données GCaMP. GCaMP Le signal, AF / F, enregistrée in vivo du corps cellulaire d'un neurone ASJ réponse à une alternance de marche / arrêt de champ électrique (vert trace). D'épaisses lignes grisées indiquent les périodes où le champ électrique externe (3 V / cm) a été appliquée à l'animal. La barre d'échelle représente une augmentation de 100% de l'intensité de fluorescence.
Figure 4. Exemple des données Cameleon. A) Trois cadres séparés montrant la double imagevoir d'un neurone ALM avant et après la chirurgie laser de l'axone 20 um à partir du corps cellulaire. La flèche rouge sur le panneau du milieu indique le point de coupure. Le panneau du bas montre le corps cellulaire et le segment de l'axone produire des signaux à B et C. B) Le cameleon YC3.60 signal mesuré au niveau du corps cellulaire du neurone ALM avant et après la chirurgie au laser (flèche rouge). C) Le YC3 cameleon 0,60 signal mesuré sur le segment des axones dans les 5 um du point de coupe avant et après la chirurgie au laser. Traces jaunes indiquent les signaux YFP, des traces bleues indiquent les signaux de la PCP et des traces oranges sont la résultante FRET rapport. Tous les temps sont fonction du temps de la chirurgie au laser. Barres d'échelle représentent une augmentation de 100% de l'intensité de fluorescence. Cliquez ici pour agrandir la figure .
Indicateurs de calcium génétiquement codés ont été largement utilisés dans C. elegans neurobiologie. De nombreux groupes ont utilisé ces techniques pour étudier la réponse des neurones sensoriels primaires à des stimuli externes comme démontré ici avec la réponse ASJ à un champ électrique. Exemples les plus notables figurent sensation du toucher mécanique, des produits chimiques spécifiques, de la température et un champ électrique 12, 16-19. L'activité des interneurones et les cellules musculaires ont également été contrôlée à la fois en réponse à des stimuli et dans le contrôle du comportement animal. Beaucoup de ces études ont poussé ces techniques un peu plus loin en utilisant la reconnaissance d'image et de techniques de suivi pour permettre l'enregistrement des neurones chez les animaux partiellement restreints ou même se déplacer librement ainsi que l'enregistrement des neurones simultanément. D'autres études ont porté sur d'autres aspects de la physiologie de calcium tels que la réponse aux lésions neuronales 13, 20, présenté ici, ainsi quedégénérescence neuronale sur des échelles de temps plus longues 21.
Lors de la conception d'une expérience particulière, chacune des techniques alternatives concernant les reporters de calcium couramment utilisés et immobilisation des animaux doit être examinée attentivement. Techniques d'immobilisation sera dicté par les aspects techniques tels que la nécessité d'un accès physique à l'animal, la possibilité de récupérer les animaux suite à l'imagerie ou la nécessité d'un débit élevé. Différents journalistes de calcium fluorescents ont des avantages et des inconvénients spécifiques aussi bien. GCaMP emploie seule analyse simple image de la chaîne et le grand signal-sur-bruit le rend applicable à de nombreuses situations. Cameleon d'autre part nécessite une imagerie plus complexe et l'analyse qui en résulte, mais la mesure ratiométrique peut être critique dans des situations avec des objets potentiellement importants. Par exemple, les fluctuations de la quantité de fluorophore (comme dans l'exemple endommagement laser) peut également se produire sur de longues périodes(H) en raison de changements dans les niveaux d'expression. D'autres stratégies d'imagerie à double sont également possibles tels que GCaMP co-exprimé avec (ou physiquement liés à) un fluorophore DP. Bien que n'étant pas FRET en fonction ce serait de profiter de la large gamme dynamique des variantes GCaMP modernes tout en utilisant le canal rouge comme une mesure de référence en temps réel.
Il est important de noter que de nombreux systèmes à deux canaux microscope d'imagerie et des logiciels d'analyse sont disponibles dans le commerce qui, bien que souvent plus cher, peut être attrayante pour les chercheurs hésitent à construire le système de construction d'une habitation décrite ici. Les systèmes commerciaux d'imagerie double (DualView2-DV2, Photometrics) utilisent généralement des optiques similaires à notre système maison construite, mais sont contenues dans une pièce jointe microscope simple avec des procédures standardisées d'alignement. Alternativement, filtre rapide des systèmes d'échange (Lambda DG-4/DG-5 De plus, Sutter Instruments) permettre l'octroi rapide imagerie en temps réel séquentielle de deux canaux de couleur wiThout optique d'imagerie supplémentaires, mais sont également coûteux et nécessitent une synchronisation précise entre l'échange du filtre et acquisition de la caméra.
En résumé, C. elegans présente un certain nombre d'avantages comme système d'imagerie in vivo. Les fluorophores codés génétiquement sont souvent cellule spécifique et peut éliminer la nécessité pour l'injection ou l'administration de fluorophores exogènes. C. elegans accessibilité optique permet d'imagerie dans les animaux intacts qui sont facile et rentable de maintenir, ne nécessitent pas de dissection compliquée ou la culture neuronale et de préserver la physiologie cellulaire. En outre, C. elegans possède de grandes capacités pour l'analyse génétique d'un grand nombre de réactifs disponibles génétiques et des techniques bien établies. Il ya des inconvénients de cours sur le système, la principale préoccupation étant peut-être qu'il est un invertébré. En outre, les fluorophores signaler les changements relatifs dans rathe concentration de calciumr à une valeur absolue et la résolution temporelle des mesures peuvent être limitées par deux la dynamique du fluorophore mais également les temps d'intégration nécessaires de faibles signaux de fluorescence. Enfin, bien que le calcium est une partie intégrante de l'activité neuronale et de signalisation des fluorophores ne pas rapporter directement le niveau de tension de membrane telle que mesurée avec les techniques d'électrophysiologie. Néanmoins illustré par les procédures présentées ici, C. elegans est un attrayant, relativement simple et rentable du système pour un large éventail d'études d'imagerie neuronale.
Les auteurs déclarent n'avoir aucun conflit d'intérêts financiers.
Plusieurs personnes ont contribué aux travaux décrits dans le présent document. CVG a construit le dispositif expérimental, et LS, SHC, et CVG a effectué les expériences. CVG et SHC a écrit le manuscrit. Tous les auteurs par la suite participé au processus de révision et approuvé la version finale du manuscrit. Nous remercions Paul Sternberg pour la souche GCaMP. Certaines souches de nématodes utilisées dans ce travail ont été fournies par le Centre de Caenorhabditis Genetics (CCG), qui est financé par le NIH Centre National de Ressources de recherche (NCRR). Le programme MATLAB analyse d'image a été adaptée de celle utilisée dans 18 ans. Les auteurs ont été pris en charge par l'Université de Boston et le Massachusetts Life Sciences Center.
Name | Company | Catalog Number | Comments |
Eclipse Ti-U inverted microscope | Nikon | ||
Intensilight HG Illuminator | Nikon | C-HGFI | Fluorescent light source |
CFI Plan Apo VC 60X Oil | Nikon | ||
Optical table or 3'X3' optical grade breadboard | Thor Labs | If an optical table is not used an optical grade breadboard on a solid laboratory bench should suffice. | |
Clara Interline Camera | Andor Technology | High-sensitivity CCD camera | |
wtGFP Longpass Emission | Chroma Technology Corp. | 41015 | GFP filter set for imaging GCaMP |
Filter 440 +/- 10 nm | Chroma | D440/20x EX | excitation filter for cameleon |
Dichroic mirror > 455 nm longpass | Chroma | 455DCLP BS | microscope dichroic for cameleon imaging |
Dichroic mirror > 515 nm longpass | Chroma | 515DCLP BS | dichroic mirror for cameleon imaging |
Filter 535 +/- 15 nm | Chroma | D535/30m EM | YFP emission filter |
Filter 480 +/- 20 nm | Chroma | D485/40m EM | CFP emission filter |
Lens, 200 mm, Achromat | Thor Labs | AC508-200-A1 | Relay lens for FRET optics (3) |
Silver broadband mirror | Thor Labs | ME2S-P01 | FRET optics (2) |
NGM buffer | |||
Levamisole | Sigma | ||
Polybead Microspheres | Polysciences, Inc. | 08691-10, 2.5% by volume, 50 nm diameter | polystyrene nanoparticles for C. elegans immobilization |
Transgenic strain, Strain gpa-9::GCaMP3(in pha-1; him-5 bkg) | Sternberg Lab | Strain PS6388 | |
Transgenic strain, mec- 4::YC3.60 | Gabel Lab | Strain CG1B |
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