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Describimos protocolos para preparar ovocitos y purificar esporozoitos para el estudio de la infección de organoides intestinales y de las vías respiratorias humanas por Cryptosporidium parvum. Demostramos los procedimientos para la microinyección de parásitos en el lumen organoide intestinal y la inmunomancha ción de organoides. Por último, describimos el aislamiento de los ovocitos generados de los organoides.
Cryptosporidium parvum es una de las principales causas de la enfermedad diarreica humana. Para entender la patología del parásito y desarrollar fármacos eficientes, se necesita un sistema de cultivo in vitro que recapitula las condiciones en el huésped. Los organoides, que se asemejan mucho a los tejidos de su origen, son ideales para estudiar las interacciones huésped-parásito. Los organoides son estructuras tridimensionales (3D) derivadas del tejido que se derivan de células madre adultas y crecen en cultivo durante largos períodos de tiempo sin someterse a ninguna aberración o transformación genética. Tienen una polaridad bien definida con superficies apicales y basolaterales. Los organoides tienen varias aplicaciones en pruebas de drogas, biobanca, y modelado de enfermedades y estudios de interacción huésped-microbio. Aquí presentamos un protocolo paso a paso de cómo preparar los ovocitos y esporozoítos de Cryptosporidium para infectar los organoides intestinales y de las vías respiratorias humanas. A continuación, demostramos cómo se puede utilizar la microinyección para inyectar los microbios en el lumen organoide. Existen tres métodos principales por los que los organoides se pueden utilizar para los estudios de interacción huésped-microbio: microinyección, cizallamiento mecánico y chapado, y mediante la fabricación de monocapas. La microinyección permite el mantenimiento de la estructura 3D y permite un control preciso de los volúmenes del parásito y el contacto lateral apical directo para los microbios. Proporcionamos detalles para el crecimiento óptimo de organoides para la creación de imágenes u ovocitos. Por último, también demostramos cómo los ovocitos recién generados se pueden aislar del organoide para un mayor procesamiento y análisis aguas abajo.
El desarrollo de fármacos o vacunas para el tratamiento y la prevención de la infección por Cryptosporidium se ha visto obstaculizado por la falta de sistemas in vitro que imitan con precisión la situación in vivo en los seres humanos1,2. Muchos de los sistemas disponibles actualmente sólo permiten la infección a corto plazo (<5 días) o no soportan el ciclo de vida completo del parásito3,4. Otros sistemas que permiten el desarrollo completo del parásito se basan en líneas celulares inmortalizadas o líneas celulares cancerosas que no recapitulan fielmente la situación fisiológica en los seres humanos5,6,7 . Los organoides o 'mini-órganos' son estructuras derivadas de tejido 3D que se cultivan en una matriz extracelular complementada con varios factores de crecimiento específicos del tejido. Los organoides se han desarrollado a partir de diversos órganos y tejidos. Son genéticamente estables y recapitulan la mayoría de las funciones de los órganos de su origen, y pueden mantenerse en cultivo durante largos períodos de tiempo. Hemos desarrollado un método para infectar los organoides intestinales y pulmonares humanos con Cryptosporidium que proporciona un modelo in vitro preciso para el estudio de las interacciones huésped-parásito relevantes para la criptosporidiosis intestinal y respiratoria8 ,9,10,11,12,13. A diferencia de otros modelos de cultivo publicados, el sistema organoide es representativo de las interacciones del parásito huésped de la vida real, permite completar el ciclo de vida para que se puedan estudiar todas las etapas del ciclo de vida del parásito y mantiene la propagación del parásito hasta 28 días10.
Cryptosporidium parvum es un parásito apicomplexiano que infecta el epitelio de las vías respiratorias e intestinales, causando una enfermedad diarreica prolongada. La etapa ambiental resistente es el ovocitos, que se encuentra en los alimentos contaminados y el agua14. Una vez ingeridos o inhalados, el ovocitos y libera cuatro esporozoitos que se unen a las células epiteliales. Los esporozoítos se deslizan sobre las células de los huésped y atraen a los receptores de células huésped, pero el parásito no invade completamente la célula, y parece inducir a la célula huésped a engullirla15. El parásito, que se internaliza dentro de un compartimento intracelular pero extractitoplasma, permanece en la superficie apical de la célula, replicando dentro de una vacuola parasitoforosa. Se somete a dos rondas de reproducción asexual, un proceso llamado merogonía. Durante la merogonía, se desarrollan merontas tipo I que contienen ocho merozoitas que se liberan para invadir nuevas células. Estos merozoítos invaden nuevas células para convertirse en merontas de tipo II que contienen cuatro merozoitas. Estos merozoítos, cuando se liberan, infectan las células y se convierten en macrogamontes y microgamontes. Los microgametos se liberan y fertilizan los macrogametos que producen cigotes que maduran en ovocitos. Los ovocitos maduros se liberan posteriormente en el lumen. Los ovocitos son de paredes delgadas que se exquistan inmediatamente para reinfectar el epitelio, o paredes gruesas que se liberan en el medio ambiente para infectar al siguiente huésped14. Todas las etapas del ciclo de vida de Cryptosporidium han sido identificadas en el sistema de cultivo organoide previamente desarrollado por nuestro grupo10.
Dado que los organoides humanos replican fielmente los tejidos humanos9,11,13, y apoyan todas las etapas replicativas de Cryptosporidium10,son el sistema de cultivo de tejido ideal para estudiar Biología criptosporidio e interacciones huésped-parásito. Aquí describimos los procedimientos para infectar organoides con ovocitos de Cryptosporidium y esporozoitos exquistes, y aislar los nuevos ovocitos producidos en este sistema de cultivo de tejidos.
Todo el manejo y resección de tejidos se realizó bajo protocolos aprobados por la Junta de Revisión Institucional (IRB) con el consentimiento del paciente.
1. Preparación de C. parvum Oocysts for Injection
NOTA: Los ovocitos de Cryptosporidium se compraron en una fuente comercial (ver la Tabla de Materiales). Estos ovocitos se producen en terneros y se almacenan en solución salina con fosfato tampón (PBS) con antibióticos. Se pueden almacenar durante unos 3 meses a 4 oC y nunca deben congelarse. Normalmente usamos ovocitos dentro de un mes. Los organoides pueden estar infectados con ovocitos intactos, o los esporozoitos pueden aislarse de los ovocitos exquistes y utilizarse para infectar organoides si es importante no tener oocistos de arrastre del inóculo original.
2. In Vitro Purificación de Esporozoritas de C. parvum Oocysts
3. In Vitro Culture of Human Intestinal and Lung Organoids for Microinjection
4. Microinyección de oquistes/esporozoitos en el Lumen Organoide
5. Mancha de inmunofluorescencia de los organoides
6. Aislamiento de los ovocitos de los organoides
Los protocolos presentados aquí dan como resultado la purificación eficiente de ovocitos y esporozoitos(Figura 1A)listos para la microinyección. El protocolo de excystation da como resultado la liberación de esporozoitos de aproximadamente el 70-80% de los ovocitos, por lo tanto, es esencial filtrar los ovocitos y conchas restantes a través de un filtro de 3 m. La filtración da como resultado una purificación de casi 100% esporozoita(Figura 1B). Además, la adición de un tinte verde ayuda a asegurar la inyección de todos los organoides y permite la visualización de organoides inyectados durante al menos 24 h después de la inyección(Figura 2B).
Estos protocolos para la preparación de ovocitos y esporozoítos son sencillos y se han utilizado durante muchos años, por lo que se espera que los ovocitos tratados y los esporozoitos purificados sean viables e infecciosos. Sin embargo, en nuestros estudios, utilizamos microscopía electrónica de barrido para asegurar que el proceso de excestación no dañó los esporozoitos u ovocitos(Figura 2A)10. La inyección de cantidades iguales de ovocitos en el lumen organoide puede confirmarse visualmente mediante imágenes microscópicas simples(Figura 2C). Una porción de organoides infectados debe configurarse para verificar la propagación de parásitos por PCR cuantitativo como hemos descrito10.
El progreso a través del ciclo de vida del parásito se puede visualizar mediante la recopilación de organoides infectados en diferentes puntos de tiempo después de la infección y el análisis por microscopía electrónica de transmisión o por inmunofluorescencia combinada con 4o,6-diamidino-2-fenilindolo ( DAPI) tinción de núcleos parásitos10. Por ejemplo, se pueden utilizar anticuerpos contra antígenos superficiales de merozoita, como gp40 y gp1517 para identificar etapas merontas; los meronts de tipo I tendrán 8 núcleos y merontas de tipo II, 4 núcleos10. Recientemente, un panel de anticuerpos monoclonales específicos de trophozoites, merozoites, tipo I frente a ii meronts, y macrogamonts ha estado disponible18. Estos anticuerpos también serían muy eficaces para marcar el progreso del parásito a través de sus diversas etapas del ciclo de vida en los organoides.
Los ensayos de inmunofluorescencia también se pueden utilizar para explorar qué tipos de células están infectadas por Cryptosporidium. Esto era especialmente importante para mirar en los organoides de las vías respiratorias como muy poco se sabe acerca de la criptosporidiosis respiratoria, y la célula huésped exacta para el parásito no se conocía. Realizamos ensayos de inmunofluorescencia en organoides infectados por Cryptosporidium,colocalizando CC10, un marcador para las células del club y encontramos que Cryptosporidium infectó células CC10- negativas y positivas(Figura 3). Estos resultados fueron corroborados por TEM en los que observamos Cryptosporidium infectando células secretoras y no secretoras en los organoides de las vías respiratorias10.
Después de que los organoides diferenciados se han infectado durante cinco días, debe haber un número significativo de ovocitos que se producen. En nuestras manos, la infección de organoides de una placa de seis pocillos produjo alrededor de 4000 ovocitos, que podrían ser fácilmente identificados y contados en un hemocitómetro mediante el etiquetado con un anticuerpo específico de ovis. La presencia de cuatro esporozoitos en los ovocitos podría confirmarse secando una porción de los ovocitos en una corredera adhesiva, fijando con metanol y combinando la tinción DAPI con un anticuerpo específico de ovocitos(Figura 4). La verificación de la producción de ovocitos de paredes gruesas podría realizarse mediante el análisis TEM10.
Figura 1: Preparación y purificación de ovocitos y esporozoítos de Cryptosporidium. (A) Representación esquemática del método utilizado para la preparación de ovocitos y esporozooítos para la infección. (B) Imagen que muestra la excestación in vitro de ovocitos. La filtración de ococitos y conchas no exquistadas proporciona una solución purificada de esporozoítos. Barra de escala a 10 m. Por favor, haga clic aquí para ver una versión más grande de esta figura.
Figura 2: Microinyección de ovocitos en el lumen organoide. Esta cifra ha sido modificada de Heo et al.10. (A) escanear imágenes de microscopía electrónica (SEM) de ovocitos y esporozoitos. (B) Imagen que muestra organoides inyectados con ovis. El tinte verde ayuda a visualizar la inyección de cada organoide y persiste durante al menos 24 h. (C) Imagen de un organoide inyectado con ovocitos. Haga clic aquí para ver una versión más grande de esta figura.
Figura 3: Imagen de inmunofluorescencia del organoide infectado por Cryptosporidium. Mucina está etiquetada con anticuerpo anti-mucina 5 (rojo) en el lumen del organoide, las células del club están etiquetadas con anti-CC10 (amarillo), Cryptosporidium se detecta con anticuerpo específico de oocisto (verde), y los núcleos celulares se tiñen con DAPI (azul). El panel B es una ampliación del área indicada en el cuadrado en el panel A. Haga clic aquí para ver una versión más grande de esta figura.
Figura 4: Imagen de inmunofluorescencia del ovis aislado de organoides intestinales diferenciados. La pared de Ooccyst está etiquetada con anticuerpoespecífico sorquista en verde y los cuatro núcleos de esporozoita se visualizan con DAPI (azul) Haga clic aquí para ver una versión más grande de esta figura.
Cultivo de parásitos Cryptosporidium en organoides intestinales y de las vías respiratorias proporciona un modelo preciso para estudiar las interacciones huésped-parásito10, pero también tiene muchas otras aplicaciones. Por ejemplo, los métodos actuales de selección y propagación de parásitos Cryptosporidium modificados genéticamente requieren el paso en ratones19 que no permite el aislamiento de parásitos que tienen modificaciones esenciales para la infección in vivo. El cultivo organoide de Cryptosporidium proporciona una alternativa a este procedimiento. Sin embargo, hemos observado que los esporozoitas electroporados se agrupan y bloquean la micropipeta. Con el fin de seleccionar parásitos modificados genéticamente, los organoides pueden cultivarse en transtoques recubiertos de colágeno en un formato bidimensional en condiciones de diferenciación para permitir la infección con esporozoitos transinfectados y, en consecuencia, la selección de los ovocitos modificados genéticamente. Los transwells permiten el acceso a las superficies apical y basolateral y son estables durante largos períodos de tiempo.
Actualmente, cultivamos organoides en un formato bidimensional para la detección de alto rendimiento de fármacos para organoides derivados del tejido canceroso (datos no publicados). Este método de cultivo organoide también se puede adaptar para las pruebas defármacos anti-Cryptosporidium utilizando la luciferasa modificada genéticamente etiquetada Cryptosporidium cepas19. Por otra parte, a pesar de que la infección no está estrechamente sincronizada, infección de organoides con esporozoítos proporciona suficiente sincronización del ciclo de vida que los fármacos pueden ser probados para su eficacia contra etapas específicas del ciclo de vida.
Los sistemas de cocultivo organoides se están desarrollando teniendo en cuenta algunos otros aspectos del sistema huésped, como la microbiota y las células inmunitarias20. Por lo tanto, la capacidad de diseccionar interacciones entre el parásito y las células huésped, las células inmunitarias y la microbiota pronto será posible in vitro. La manipulación genética de Cryptosporidium también es ahora posible19,y la combinación de cepas de reportero fluorescente de Cryptosporidium y el cultivo organoide proporcionará las herramientas para la secuenciación de una sola célula de las células infectadas, y más específicamente la secuenciación de células únicas de las células infectadas con etapas específicas del parásito.
El éxito de los experimentos descritos aquí depende en gran medida de la viabilidad e infectividad de los ovocitos. Diferentes lotes de ovocitos de Cryptosporidium pueden variar ampliamente en las tasas de excisestación y la capacidad de infectar las células huésped. Los rendimientos suficientes de los esporozoítos dependen de las buenas tasas de excisestación y la tasa de excystation no siempre está correlacionada con la infectividad. Si se observan niveles bajos de infección o excestación deficiente con un lote particular de ovocitos, el tiempo y el esfuerzo pueden ahorrarse obteniendo un nuevo lote de ovocitos en lugar de intentar aumentar el número de ovocitos, o alargando los tiempos de incubación.
Los medios de cultivo organoides deben refrescarse cada día alterno. Se recomienda el uso de pasajes anteriores de cultivos organoides. Es importante descongelar un nuevo vial de organoides si los organoides comienzan a diferenciarse en pasajes posteriores ya que la salud de los cultivos organoides determina enormemente la viabilidad del parásito. Después de la infección, los medios organoides deben refrescarse todos los días para evitar la acumulación de sustancias tóxicas en los medios.
El cultivo organoide de Cryptosporidium es limitado en que el parásito no puede propagarse indefinidamente, y la infección se desvanece después de tres pasajes durante 28 días10. La microinyección de suficientes organoides para experimentos con ratones como hemos descrito puede ser lenta y físicamente gravosa. Sin embargo, hasta la fecha, ningún otro método permite el ciclo de vida completo en un sistema in vitro completamente representativo de la infección humana, ni se ha descrito ningún sistema de cultivo que permita la exploración de las interacciones huésped-patógeno importantes para infección respiratoria. El cultivo organoide de Cryptosporidium proporciona una nueva herramienta poderosa que abre vías de exploración en interacciones huésped-parásito que antes no eran posibles para Cryptosporidium.
Los autores no tienen nada que revelar.
Estamos agradecidos a Deborah A. Schaefer de la Escuela de Ciencias Biomédicas Animales y Comparadas, Facultad de Agricultura y Ciencias de la Vida, Universidad de Arizona, Tucson, AZ, EE. UU. por ayudarnos con la producción y análisis de ovocitos. También agradecemos a Franceschi Microscopy and Imaging Center y a D.L. Mullendore de la Universidad Estatal de Washington por la preparación de TEM y la toma de imágenes de ovocitos organoides aislados.
D.D. es beneficiario de una subvención VENI de la Organización Neerlandesa de Investigación Científica (NWO-ALW, 016.Veni.171.015). I.H. es galardonado con una beca VENI de la Organización Neerlandesa de Investigación Científica (NWO-ALW, 863.14.002) y recibió el apoyo de becas Marie Curie de la Comisión Europea (Propuesta 330571 FP7-PEOPLE-2012-IIF). La investigación que ha llevado a estos resultados ha recibido financiación del Consejo Europeo de Investigación en virtud del Acuerdo Avanzado de Subvenciones DEL ERC no 67013 y del NIH NIAIH en virtud de R21 AT009174 a RMO. Este trabajo es parte del Instituto Oncode, que es financiado en parte por la Sociedad Holandesa contra el Cáncer y fue financiado por una subvención de la Sociedad Holandesa contra el Cáncer.
Name | Company | Catalog Number | Comments |
Basement membrane extract (extracellular matrix) | amsbio | 3533-010-02 | |
Crypt-a-Glo antibody (Oocyst specific antibody) | Waterborne, Inc | A400FLR-1X | Final Concentration = Use 2-3 drops/slide |
Crypto-Grab IgM coated Magnetic beads | Waterborne, Inc | IMS400-20 | |
Dynamag 15 rack | Thermofisher Scientific | 12301D | |
Dynamag 2 rack | Thermofisher Scientific | 12321D | |
EMD Millipore Isopore Polycarbonate Membrane Filters- 3µm | EMD-Millipore | TSTP02500 | |
Fast green dye | SIGMA | F7252-5G | |
Femtojet 4i Microinjector | Eppendorf | 5252000013 | |
Glass capillaries of 1 mm diameter | WPI | TW100F-4 | |
Matrigel (extracellular matrix) | Corning | 356237 | |
Microfuge tube 1.5 mL | Eppendorf | T9661-1000EA | |
Micro-loader tips | Eppendorf | 612-7933 | |
Micropipette puller P-97 | Shutter instrument | P-97 | |
Normal donkey Serum | Bio-Rad | C06SB | |
Penstrep | Gibco | 15140-122 | |
Sodium hypoclorite (use 5%) | Clorox | 50371478 | |
Super stick slides | Waterborne, Inc | S100-3 | |
Swinnex-25 47 mm Polycarbonate filter holder | EMD-Millipore | SX0002500 | |
Taurocholic acid sodium salt hydrate | SIGMA | T4009-5G | |
Tween-20 | Merck | 8221840500 | |
Vectashield mounting agent | Vector Labs | H-1000 | |
Vortex Genie 2 | Scientific industries, Inc | SI0236 | |
Adv+++ (DMEM+Penstrep+Glutamax+Hepes) | Final amount | ||
DMEM | Invitrogen | 12634-010 | 500 mL |
Penstrep | Gibco | 15140-122 | 5 mL of stock in 500 mL DMEM |
Glutamax | Gibco | 35050038 | 5 mL of stock in 500 mL DMEM |
Hepes | Gibco | 15630056 | 5 mL of stock in 500 mL DMEM |
INTESTINAL ORGANOID MEDIA-OME (Expansion media) | Final concentration | ||
A83-01 | Tocris | 2939-50mg | 0.5 µM |
Adv+++ | make up to 100 mL | ||
B27 | Invitrogen | 17504044 | 1x |
EGF | Peprotech | AF-100-15 | 50 ng/mL |
Gastrin | Tocris | 3006-1mg | 10 nM |
NAC | Sigma | A9125-25G | 1.25 mM |
NIC | Sigma | N0636-100G | 10 mM |
Noggin CM | In house* | 10% | |
P38 inhibitor (SB202190) | Sigma | S7076-25 mg | 10 µM |
PGE2 | Tocris | 2296/10 | 10 nM |
Primocin | InvivoGen | ant-pm-1 | 1 mL/500 mL media |
RSpoI CM | In house* | 20% | |
Wnt3a CM | In house* | 50% | |
In house* - cell lines will be provided upon request | |||
INTESTINAL ORGANOID MEDIA-OMD (Differentiation media) | To differentiate organoids, expanding small intestinal organoids were grown in a Wnt-rich medium for six to seven days after splitting, and then grown in a differentiation medium (withdrawal of Wnt, nicotinamide, SB202190, in a differentiation medium (withdrawal of Wnt, nicotinamide, SB202190, prostaglandin E2 from a Wnt-rich medium or OME) | ||
LUNG ORGANOID MEDIA- LOM (Differentiation media) | Final concentration | ||
Adv+++ | make up to 100 mL | ||
ALK-I A83-01 | Tocris | 2939-50mg | 500 nM |
B27 | Invitrogen | 17504044 | 0.0763888889 |
FGF-10 | Peprotech | 100-26 | 100 ng/mL |
FGF-7 | Peprotech | 100-19 | 25 ng/mL |
N-Acetylcysteine | Sigma | A9125-25G | 1.25 mM |
Nicotinamide | Sigma | N0636-100G | 5 mM |
Noggin UPE | U-Protein Express | Contact company directly | 10% |
p38 MAPK-I | Sigma | S7076-25 mg | 1 µM |
Primocin | InvivoGen | ant-pm-1 | 1:500 |
RhoKI Y-27632 | Abmole Bioscience | M1817_100 mg | 2.5 µm |
Rspo UPE | U-Protein Express | Contact company directly | 10% |
Reducing buffer (for resuspension of oocysts and sporozoites for injection) | Final concentration | ||
L-Glutathione reduced | Sigma | G4251-10MG | 0.5 μg/μL of OME/OMD/LOM |
Betaine | Sigma | 61962 | 0.5 μg/μL of OME/OMD/LOM |
L-Cysteine | Sigma | 168149-2.5G | 0.5 μg/μL of OME/OMD/LOM |
Linoleic acid | Sigma | L1376-10MG | 6.8 μg/mL of OME/OMD /LOM |
Taurine | Sigma | T0625-10MG | 0.5 μg/μL of OME/OMD/LOM |
Blocking buffer (for immunoflourescence staining) | Final concentration | ||
Donkey/Goat serum | Bio-Rad | C06SB | 2% |
PBS | Thermo-Fisher | 70011044 | Make up to 100 mL |
Tween 20 | Merck | P1379 | 0.1% |
List of Antibodies used | |||
Alexa 568 goat anti-rabbit | Invitrogen | A-11011 | Dilution-1:500; RRID: AB_143157 |
Crypt-a-Glo Comprehensive Kit- Fluorescein-labeled antibody Crypto-Glo | Waterborne, Inc | A400FLK | Dilution- 1:200 |
Crypta-Grab IMS Beads- Magnetic beads coated in monoclonal antibody reactive | Waterborne, Inc | IMS400-20 | Dilution-1:500 |
DAPI | Thermo Fisher Scientific | D1306 | Dilution-1:1,000; RRID : AB_2629482 |
Phalloidin-Alexa 674 | Invitrogen | A22287 | Dilution-1:1,000; RRID: AB_2620155 |
Rabbit anti-gp15 antibody generated by R. M. O’Connor (co-author). | Upon request | Upon request | Dilution-1:500 |
Sporo-Glo | Waterborne, Inc | A600FLR-1X | Dilution- 1:200 |
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