Atomik Kuvvet Mikroskopi Görüntüleme Bakteriyel İmmobilizasyon

Canlı Gram-negatif ve Gram-pozitif bakterilerin jelatin kaplı mika üzerinde hareketsiz ve Atomik Kuvvet Mikroskobu (AFM) kullanarak sıvı görüntülü olabilir.

AFM görüntüleme aracı mekanik problar bir yüzey, yüksek çözünürlüklü (nm ölçekli). Numunenin kimyasal tedavi etmek gerek kalmadan, sıvı bir ortamda, görüntü hücreleri ve biyomoleküllerin yeteneği vardır. Bu amacı gerçekleştirmek için, örnek tarama AFM konsol ucu tarafından uygulanan kuvvetler tarafından kaldırılmasını engellemek için yeterli montaj yüzeyine uygun olmalıdır. Birçok durumda, başarılı görüntüleme için örnek montaj yüzeyine immobilizasyonu bağlıdır. Optimal, immobilizasyon minimal invaziv metabolik süreçleri ve fonksiyonel özellikleri tehlikeye böyle örnek olmalıdır. Domuz (domuz) jelatin kaplama taze bölünmüş mika yüzeyleri, negatif yüklü bakterilerin yüzeye immobilize ve sıvı AFM tarafından görüntülenmiş. Jelatin kaplı mika bakteri hücrelerinin immobilizasyonu negatif yüklü bakteri ve pozitif yüklü jelatin arasında elektrostatik etkileşim nedeniyle büyük olasılıkla. Çeşitli faktörler, kimyasal bileşenler bakteri asılı olduğu, sıvı, bakteri görüntülü hangi bakteri suşu ve orta jelatin kaplı mika, yüzey özellikleri bakteri inkübasyon süresi de dahil olmak üzere bakteriyel immobilizasyon, müdahale edebilirsiniz. Genel olarak, jelatin kaplı mika kullanımı genellikle görüntüleme mikrobiyal hücreler için geçerli olmak üzere bulunur.

1. Mika hazırlanması:

1. AFM mikroskobu (yaklaşık 22 × 30 mm) uyum için gerekli boyut makas ile mika (Elektron Mikroskobu Bilimleri) kesin.
2. Cleave, her iki tarafta mika, genellikle bant kullanarak, dış katmanı kaldırmak için sadece yumuşak kesintisiz katmanları kalmayıncaya kadar.

2. Jelatin solüsyonu hazırlanması:

1. Bir laboratuvar şişesi 100 ml distile su ekleyin.
2. Mikrodalga şişe su kaynamaya başlayana kadar ısıtın. (Mikrodalga mevcut değilse, sıcak bir plaka üzerinde bir beher su ısıtılır.)
3. 0.5 gram jelatin (Sigma G-6144, G-2625 ya da G-2500) tartılır ve sıcak distile su ekleyin.
4. Yavaşça girdap jelatin kadar şişe tamamen çözülür.
5. 60-70 ° C'ye kadar jelatin solüsyonu soğutun
6. Kesim bölünmüş mika batırılmış olabilir içine küçük bir beher (20 ml) yaklaşık 15 ml dökün.

3. Mika kaplama:

1. Batmak mika ısıtılmış jelatin çözüm içine kareler ve mika (Şekil 1a) kaplı olduğu gibi hızlı çekilme.
2. Kaplama sonra, (Şekil 1b), havadaki kuru bir kağıt havlu üzerine, kenarında, hemen mika destek. Jelatin kaplı mika, en az 2 hafta süreyle kullanılabilir. Aşırı jelatin solüsyonu buzdolabında saklanmalı ve sadece 60-70 ° C arasında stok solüsyonu tekrar ısıtmayı tarafından yaklaşık bir ay için kullanılan Jelatin yeniden ısıtırken sırasında haşlanmış olmadığından emin olmak için alınmalıdır.

4. Jelatin kaplı mika bakteri Montaj:

1. Pelet bakteri kültürü 1 ml (0.5 - 1.0 OD 600 nm) 800 4500 RCF. Bakteri bağlı olarak, minimum RCF pelet ~ 5 dakika içinde hücreler
2. Filtreli deiyonize su ya da tampon aynı hacimde pelet yıkayın.
3. Santrifüj yoluyla hücreler tekrar toplayın.
4. Nanopure deiyonize su ya da tampon 500 mcL derhal pelletini tekrar. (Bakteriyel süspansiyon AFM görüntüleme için hücrelerin yeterli bir konsantrasyon elde etmek için gözle görülür bir şekilde bulanık olması gerekir.)
5. Bir pipet ucu (Şekil 1c) kullanarak yüzey üzerinde jelatin kaplı mika ve yayılması için hücre süspansiyonu (10-20 mcL) uygulayın. Bakım bakteriyel bir çözüm uygulayarak veya yayarken fiziksel pipet ile jelatin yüzeyine dokunmayın değil alınmalıdır.
6. İzin yüzeyi, 10 dakika dinlenme ve su ya da tampon (Şekil 1 cd) bir dere ile durulayın. Prosedürü boyunca, örnek kurumasına izin olmadığından emin olmak için özen gösterin.

5. Temsilcisi Sonuçlar:

Şekil 2, jelatin kaplı mika üzerine monte edilmiş ve AFM tarafından görüntülendi bakteri hücreleri örnek görüntüleri gösterir. Bizim laboratuvarlarımızda, örnekler, genellikle 100 mm tarama kafası ile donatılmış bir PicoPlus atomik kuvvet mikroskobu (Agilent Technologies, Tapınağı, AZ) kullanarak görüntülü. Cihaz bir tarama 0.5-1.0 satır / s hızda, line-scan başına 128-512 piksel işletilmektedir Tipik olarak kullanılan konsol Veeco 0.01 'den 0.1 nN / nm arasında değişen nominal yay sabitleri ile silisyum nitrür probları (MLCT-AUHW Veeco, Santa Barbara, CA).

Şekil 1: 60-70 ° C 20 ml beher yerleştirilen bir sıcaklık az jelatin . Bir cımbız kullanarak taze mika kareler tamamen jelatin (a) çekilmiş ve bir mikro santrifüj raf (b) yaslanmış bir kağıt havlu üzerine dik olarak yerleştirilen içine dalmış olan bölünmüş. Bakteriyel örnek bir damlacık X ve Y yönlerinde (c) hem de bir pipetlemeyin ucu ile mika ve yayılması üzerine yerleştirilir. Örnek mika yüzey üzerinde en az 10 dakika süreyle inkübe izin sonra distile su akışı örnek durulayın. Immobilizasyon çalıştı Eğer, (d) sağ panelinde görüldüğü gibi mika opak bir yerde görmek mümkün olacak. Immobilizasyon işe yaramadıysa sol paneldeki gibi net bir mika parçası alacak. Damlacık bakteri konsantrasyonu mika ölçeklerde opak nokta jelatin işlenmiş mika yerinde.

Şekil 2 E. AFM görüntüleri coli. Panel (a), hücreler, jelatin kaplı mika üzerine monte edilir ve görüntülü olarak 0.005 M PBS. Karşılaştırma için, jelatin kaplı mika üzerine monte edilmiş ve hava görüntülü bakteri hücrelerinin bir görüntü paneli (b) 'de gösterilmiştir. Septa pili (inset panel (b)) varlığı ile gösterildiği gibi sıvı, daha fazla çözünürlük, toplanan görüntü açıkça görülebilir hava elde edilebilir. Rağmen

Çeşitli faktörler AFM tarafından mikrobiyal montaj hücre ve görüntüleme etkileyebilir. Mika kaplama için kullanılan jelatin önemlidir. Ticari jelatin, balık, inek, ve domuz da dahil olmak üzere bir dizi omurgalıların izole edilmiştir. Kökeni ve işleme yöntemi Her iki bakteri immobilizasyon için jelatin uygunluğunu belirler. Sayısız kaynakları ve türleri jelatin hareketsizleştirir bakteri onların etkinliği değerlendirilmiştir [1]. Sigma G-6144, G-2625 için en etkili jelatin bulundu. Domuz (domuz) türetilen bu jelatin, sırasıyla, düşük Bloom ve orta Bloom olarak kabul edilir. Jelatin ile tedavi edilen substrat ve incelenmesi gereken belirli bir bakteri suşu arasında uyumluluk için test etmek için çok önemlidir. Önemlisi, sığır elde edilen jelatin (sığır), test edilen bakterilerin herhangi bir hareketsizleştirir etkili değil. Hücre immobilizasyon için basit bir test örneği, su ya da tampon (4.6 adım sonra) ile iyice durulandıktan sonra, mika üzerinde kurumasına izin gerektirir. Bakteriler hareketsiz iseniz, bulutlu bir bölgede (Şekil 1d) görülecektir. Yüzey bulutlu değilse, durulama suyu akışı bakteri kaldırdı. Bu testi yaparken, kullanıcı bulutlu bir görünüm de yol açabilir, bu tür tuzları olarak katkı maddeleri, etkileri dikkatli olmalıdır.

Jelatin kaplı mika immobilizasyon tekniği Gram-negatif ve Gram-pozitif bakterilerin (1), bakteriyel spheroplasts (2), virüs partikülleri (3) ve diatom kabukları (4) başarıyla uygulanmıştır. Jelatin ile immobilizasyonu dispersiyon hücrelerinin görüntüler için alınması gereken bireysel bir bakterinin sağlayan taban üzerinde bir avantaja sahiptir. Ayrıca yöntem, bol sayıda hücre, hücreler için harcanan zamanı azaltır, her alanda mevcut olduğunu garanti eder. Bu teknik aynı zamanda, hem de E. hücre yüzeylerinde kuvvet ölçümleri toplanması için kullanılır olmuştur coli (5) ve Pseudomonas aeruginosa (6). Farklı bakteri suşlarının özellikleri immobilizasyon etkileyebilir. Örneğin E. ise vahşi-tip coli (DH5α) stably jelatin G-6144, dış membran lipoprotein eksikliği büyük bir yük ile kaplanmış sıvı kullanarak yüzeylerde immobilize NlpI iyi hareketsiz ve yüksek Bloom jelatin (Sigma G-2500) yerine gerekli değildi.

Bakteriyel çözümün içeriğinin de hücre immobilizasyon etkileyebilir. Büyüme medya, bazı tamponlar, ve tuzları bakteriyel bağlanma (jelatin yüzey için bakteri ile rekabet) engel olabilir ve test edilmesi olacak. Sonuçta, AFM tarafından sıvı bakteri başarılı görüntüleme tasarlanmış deney ile uyumlu bir sıvı orta mika yüzeyi ve görüntüleme bakteri uygulamak için en uygun sıvı seçerek immobilizasyon optimize (hücre sayısı) bağlıdır. Örneğin, seyreltilmiş bir tampon başarıyla E. nerede kullanılır olmuştur coli 0.01m fosfat jelatin kaplı mika immobilize tamponlu salin (PBS), gevşek bağlı hücreleri çıkarmak için aynı tampon ile durulanır ve daha sonra 0.005M PBS (Şekil 2) görüntülenmiş. Ozmotik duyarlı, 0.25 M sakkaroz, [2-6] montaj ve görüntüleme bakteriler için başarıyla kullanılmaktadır hücreleri için. Görüntüleme modunda sıvılarda görüntü zayıf bağlı bakteri çalışırken dikkate alınması gereken başka bir faktör. İletişim modu görüntüleme gevşek bağlı bakterilerin yerini alabilir. Temassız görüntüleme modları, dokunulduğunda Modu ve MAC Modu, prob ucu tarafından uygulanan yanal kuvvetleri azaltmak ve bu nedenle tercih edilebilir.

Alternatif olarak, düşük yay sabitleri ile konsol kullanarak ve iletişim modunda gücü en aza indirerek görüntü gevşek bağlı bakteriler de yardımcı olabilir.

Görüntüleme bakteriyel sıvı örnekleri yaşayan hücre yüzeyinde kuruma ödün etkisi olmadan temsili görüntü almak için bir fırsat sunuyor. Canlı bir hücre yüzey özellikleri, yükseklik ve sertlik doğru tedbirler alınabilir. Benzeri moda, konsol bağlı özel prob moleküllerinin etkileşimleri, haritadaki yerini, hücre yüzeyinde belirli hedefler belirlemek ve bağlayıcı kuvvetleri ölçmek için kullanılan olabilir [7]. Sıvı bir ortamda bakteri immobilizasyonu canlı bakteri hücreleri dinamik çalışmalar kolaylaştırır. Bu bakteri büyüme ve bölünmesi, görüntüleme orta moleküler türler ekleme ve çevre sıcaklık veya basınç gibi fiziksel özelliklerini değiştirerek etkisini çalışmaları içerebilir. Genel olarak, gelecekteki araştırma olanakları ile yüksek çözünürlükte, sıvı bakteri çalışma seçeneği, yakıt hayal.

Çıkar çatışması ilan etti.

Bu araştırma, Biyolojik ve Çevresel Araştırma Dairesi, ABD Enerji Bakanlığı ve hibe finansmanı Virginia Commonwealth Sağlık Araştırma Kurulu tarafından desteklenmektedir. Oak Ridge Ulusal Laboratuvarı'nda, Sözleşme No: DE-AC05-00OR22725 altında ABD Enerji Bakanlığı için UT-Battelle, LLC tarafından yönetilmektedir.