Method Article
Biz Gabor gibi tek bir canlı hücre içinde hücre içi dinamiklerini ölçmek için filtreleme dayalı bir karanlık alan mikroskobu yöntemi göstermektedir. Teknik mitokondriyal parçalanma gibi organellerin yapısında değişiklikler, duyarlı.
Biz lekesiz canlı hücrelerin içinde organel morfolojisi ve organizasyon kaynaklanan hücre içi doku ölçebilirsiniz mikroskopik bir enstrüman ortaya koymaktadır. Önerilen araç organel boyut ve şekil nanoölçekli değişiklikleri, etiket optik mikroskopi hassasiyet uzanır ve programlanmış hücre ölümü ya da hücresel organel dinamikleri altında yatan temel biyolojik süreçlere ilişkin yapı-işlev ilişkisi çalışmada, hızlandırmak için kullanılabilir farklılaşması. Mikroskop kolayca mevcut mikroskopi platformlarda uygulanacak ve bu nedenle, bilim adamları, uygulamak ve sınırsız erişim ile önerilen yöntemler kullanabilirsiniz bireysel laboratuarlar, dissemine olabilir.
Önerilen tekniği iki boyutlu optik Gabor filtreleri yoluyla hücre gözlemleyerek ve hücre içi yapısını karakterize etmek mümkün. Bu filtreler anlamda nano ölçekli (10 nm) hassasiyet, boyutu ve yönü olmayan küresel hücre içi organelleri ile ilgili spesifik morfolojik özellikleri ile ayarlanmış olabilir. Elastik saçılma tarafından oluşturulan kontrast dayalı, teknik, detaylı bir ters saçılma modeli veya Mie teorisi üzerine morfometrik ölçümler ayıklamak için güvenmeye gelmez. Bu teknik, bu yüzden kesin bir teorik dağılım açıklamasına kolayca verilmez için küresel olmayan organelleri ve fonksiyonunu değerlendirmek için lekesiz canlı hücrelerin içinde elde edilebilir ayırt edici morfometrik parametreler sağlar. Discretized nesnenin yoğunluğu yerine dönüşümü doğrudan nesne alanında faaliyet gösterdiği dijital görüntü işleme tekniği göre avantajlıdır. Yüksek görüntü örnekleme oranları dayalı değildir ve bu nedenle oldukça büyütülmüş dijital görüntüler floresan konfokal mikroskopi tek tek organel segmentasyon ve yeniden yapılanma ötesine böylece büyük ölçüde organel yapısı çalışmanın kolaylaştırılması, hızla bir seferde yüzlerce hücre içinde morfolojik aktivite ekranı için kullanılabilir sınırlı görüş alanları.
Bu gösteriye metodoloji göstermek için bir deniz diatom veri göstermektedir. Biz de ilgili bir biyolojik bağlamda yöntem nasıl uygulanabilir bir fikir vermek için canlı hücreler alınan ön veriler göstermektedir.
1. Hücrelerin hazırlanıyor
2. Optik kurulum hazırlanıyor
3. Süzgeç Yükleme ve kurulum süzülmüş-arka plan görüntüleri elde etmek için kullanarak
4. Hücreleri Kaplama
5. Deney yaparak
6. Staurosporine (STS) hücreleri ortaya çıkarmak için orta açma ve deney boyunca orta korumak
7. Temsilcisi Sonuçlar
Deney bitiminde, toplanan veriler, çok sayıda hücre içi yapısal veri ayıklamak için işlenmesi gereken süzülmüş görüntüleri yer alacak. İki örnek filtre dönemde S = 0.95μm, Gauss zarf standart sapma s = S / 2 = 0.45μm ve yönelimleri Φ = 0 ° 'ye kadar Φ = 160 ° 20 9 Gabor gibi filtreler oluşan bir optik filtre banka için gösterilir ° 'lik artışlarla. ([1] Daha fazla ayrıntı için bakınız).
Örnek 1: Deniz Diyatom
Önce karanlık alan (DF) görüntüleme (Şekil 1) açıkça görülüyordu odaklı özelliklere sahip bir deniz diatom örneği (Carolina Biyolojik Supply Company) yönlendirme hassas filtre banka uygulanır. Optik süzülmüş görüntüleri filtrelenmemiş görüntünün yanında, karşılaştırma için örnek gösterilmiştir.
Şekil 1: Koyu alan (DF) ve deniz diatom optik filtrelenmiş bir görüntü çıkar. Biz görüntü (en sol panelinde beyaz ok) sağ alt diatom analiz edecektir.
Diatom dokuz Gabor filtreden görüntüleri seti, nesne yönelimi ve yuvarlaklık için piksel-piksel işlendi. İşleme (1), böylece yanıt önemi kodlama sinyal yanıt genel büyüklüğünü belirlemek için her pikselin Gabor filtreden dokuz görüntüleri ölçülen tepkiler toplayarak, ve (2) Gabor filtresi yönünü bulma oluşuyordu, Φ, hangi yanıtı maksimize eden ve böylece her pikselin nesneleri tercih edilen bir yönelim var ölçüde kodlama tüm açılardan bu maksimal yanıt oranı ortalama yanıt alınması. Oryantasyon derecesi parçacık geometrik boy oranına yakından ilişkilidir. Şekil. 2B, incie filtre banka (parametre 1) ve yönelim ya da en-boy oranı (parametre 2) derecesi piksel genel yanıt sırasıyla, renk doygunluğu ve renk tonu olarak kodlanmış. Büyük değerler (kırmızı) daha yüksek bir tercih açısı yanıt mevcut olduğu alanlarda gösterir yakın bir boy oranı 1 (mavi), tercih edilen hiçbir yanıt açısı var olduğu alanlarda mevcut. Altyapı parçacık yönü her satırı yakından filtrelenmemiş karanlık alan (Şekil 2A) görünür altta yatan bir yerel nesne yönelimi ile mutabık kalınan bir sadak arsa (Şekil 2C), kodlanır.
Şekil 2: A: diatom Karanlık saha görüntüsü. B: Nesne yönelim görüntü. Parlaklık toplam Gabor filtre yanıt önemi kodlar çalışırken renk skalası oryantasyon derecesi (en boy oranı) gösterir. C: yanıt yoğunluk ≥% 10 maksimum nesneleri Yönlendirme. Çizgi segment ilgili yapının uzun ekseni gösterir.
Örnek 2: Apoptotik hücreleri
İşte biz, diatom olarak aynı şekilde işlendi staurosporine (STS) ile tedavi edilen sığır endotel hücreleri filtre görüntüleri göstermek. Şekil 3 T anında dokuz süzülmüş görüntüleri =- 180 dakika ile birlikte hücrelerin filtrelenmemiş bir karanlık alan (DF) görüntü gösterir. STS tedavi öncesinde.
Şekil 3: birkaç yaşam endotel hücreleri içeren bir alanın Karanlık saha (DF) ve optik süzülmüş görüntüleri.
Süzülmüş görüntüleri sonradan STS tedavi sonrası üç saatlik bir süre boyunca her 20 dakikada elde edildi. Şekil 4a, zamanın bir fonksiyonu olarak hücrelerin bir boy oranı haritasını gösterir. Bu durumda, renk tonu, renk tonu için Şekil olarak oryantasyon derecesi (etiketli odaklığı) temsil eder. Yukarıda 2b. Ancak, en-boy oranı parlaklığı ortalama filtre cevabı ağırlıklı değildi. (Şekil 4b) etiketli bu hücrelerde mitokondri floresan görüntüleri ile boy oranı haritaları kayıt olarak, ölçülen boy oranı düşüşü mitokondri içeren hücresel bölgelerde sınırlı olduğunu belirledi ve doğrudan görülebiliyor mitokondriyal parçalanma ile eş zamanlı aynı hücrelerin floresans görüntüler. Şekil 5 tasvir zaman araziler hücrelerde apoptozis geçiren zamanın bir fonksiyonu olarak en-boy oranı değişiklik gösterir. = 60-100 floresan mitokondri kayıt bölgelerde dakika değil, loş bir arka plan floresan alanları ile kayıt bölgelerde her bir hücrenin içinde, T-boy oranı bir düşüş var.
Şekil 4: En-boy oranı (a) ve floresan (b) endotel hücreleri apopitoz indükleyen staurosporine ile tedavi edilen görüntüler .
Şekil 5: staurosporine ile tedavi edilen endotel hücreleri parçacık boy oranı (odaklığı) azalma karşılaştırarak Zaman araziler. Bireysel izleri tek hücre zaman içinde araziler temsil eder. Odaklığı içinde damla floresan mitokondri (sol panel) hücreleri ile kayıt bölgeleri ile sınırlı kalan eşiğe bölgede (sağ panel) yoktur.
Şimdi en-boy oranı düşüşü mitokondriyal parçalanma karşılık geldiğini tespit ettik, biz, bu hücrelerin apoptoz neden hücreleri etiket kalmadan optik dağılım yöntemi kullanılarak parçalanma ölçmek ve bu farklı genetik ve deneysel koşullar etkisinin araştırılması dinamik.
Bu yöntem, örneğin parçacık boyutunu veya yönünü kodlamak nesnenin verim morfometrik haritalar yukarıda açıklanan. Bu yapısal bilgiler çeşitli şekillerde kullanılabilir:
Bugüne kadar biz yöntemi 30-50 nm [2] sırasına partikül boyutu farklılıklar duyarlı olduğunu göstermiştir. Biz yöntemi parçacık yönelim ve en boy oranı değişikliklerine duyarlı olduğunu göstermiştir [3] ve apoptozisi indüklediği mitokondriyal parçalanma (yukarıda Şekil 4-5) ile tutarlı bir parçacık-boy oranı azaltmak için.
Örneğin 2 sonuç bizim yöntemi, belirli bir organel fonksiyonu açısından yorumlanabilir ve floresan etiket veya eksojen boyalar olmadan toplanan olabilir hücresel fonksiyonları dinamik ölçümler izin verdiğini göstermektedir. Ancak, özellikle etiketli organeller karşı ölçülen tepkiler ilk doğrulama gerekli oldu. Bu ilk doğrulama tamamlandıktan sonra, organel dinamikleri etiket yöntemi ile doğrudan probed olabilir.
Yöntemi uygularken, birden fazla hücre koşulları ve mitokondri ile yaptı, farklı hücre içindeki organellerin konumu ile dinamik bir yapısal ölçüm ilişkilendirerek dinamik yapısal davranışları, benzersiz (spesifik hücresel devletler karakterize bir kütüphane, sonuçta yol açabilir örneğin, apoptozis, oksidatif ve metabolik stres, inflamatuar yanıt, vb.) .. Bu bilgi, daha fazla klinik hücre analizi ilaç keşfi de dahil olmak üzere çeşitli uygulamalarda kullanılan bir "hücre devlet analizörü" içine dahil olabilir.
Burada özetlenen yöntem mikroskopik görüntüleme sistemi ile elde edilen optik dağılım verileri belirli Subselüler dinamiklerini ayıklamak için kullanılabilecek genel bir yaklaşımı temsil ettiğini not etmek önemlidir. Bununla birlikte, kullanılan özel enstrümantasyon önemli ölçüde geliştirilmiş olabilir. Özellikle, mekansal filtreleme için mekansal ışık modülatör mevcut seçimi, veri toplama verimliliği, uzamsal frekans çözünürlüğü ve optik sinyal verim en üst düzeye çıkarmak için en uygun olmayabilir. [3] Burada kullanılan dijital mikro ayna cihazı ile ilişkili Kromatik ve geometrik sapmaları tartışılmıştır. Biz şu anda bu sorunları azaltmak için DMD yerde bir state-of-the-art likit kristal cihazın potansiyel avantajları ve dezavantajları araştırıyoruz. Buna ek olarak, veri toplama cihaz, mekansal filtreleme ve mikroskop kontrolü ayrı ayrı insan kullanıcı tarafından harekete geçirilir. Bu süzülmüş çok sayıda görüntü işlemeden önce toplanması gerekir alma süresi büyük ölçüde sınırlar. Böylece, kurulum otomasyonu alma süresi 10 filtrelenmiş bir görüntü başına milisaniye gürültü sinyal yeterli ulaşması bekleniyor CCD pozlama, süresi ile orantılı olmak şarttır. Temporal çözünürlük Bu artış aynı zamanda daha doğrusu bizi canlı hücre içindeki organellerin yapısal dinamikleri karakterize etmek için izin verecektir. Bu nedenle, etkin bir donanım kontrolü birleştirmek mikroskop kontrolü, CCD görüntü elde etme ve mekansal ışık modülatör optik filtreleme de dahil olmak üzere bileşenleri, harekete geçirme ve düzene özelleştirilmiş bir grafik kullanıcı arayüzü geliştirme üzerinde çalışıyoruz.
Bu araştırma mikro ayna cihazı, N. Boustany, Whitaker Vakfı Hibe RG-02-0682 tarafından finanse edildi. Devam eden işler N. Boustany NSF DBI-0852857 hibe tarafından finanse edilmektedir. RM Pasternack kısmen Rutgers Cumhurbaşkanlığı Yüksek Lisans Bursu ile desteklenmiştir. Biz de yararlı bir tartışma için optik filtreleme stratejileri ile ilgili çalışmalar ve Dr. DN Metaxas kullanılan iBMK hücreler için Dr. E. Beyaz teşekkür etmek istiyorum.
Name | Company | Catalog Number | Comments |
DMEM | Invitrogen | Low glucose DMEM | |
Liebowitz L15 medium | Invitrogen | Without phenol red | |
L-glutamine | Invitrogen | ||
Mitotracker Green | Invitrogen | ||
Bovine Brain Extract | Clonetics | ||
Fetal Bovine Serum | Gemini Bio Products | ||
Heparin | Sigma-Aldrich | ||
Staurosporine | Sigma-Aldrich | ||
Dymethylsulfoxide | Sigma-Aldrich | ||
Inverted microscope | Carl Zeiss, Inc. | Axiovert 200M | |
DMD | Texas Instruments | TI 0.7 XGA DMD 1100 | |
CCD | Roper Scientific | Cascase 512B | High (16 bit) dynamic range CCD |
CCD | Roper Scientific | Coolsnap cf |
Bu JoVE makalesinin metnini veya resimlerini yeniden kullanma izni talebi
Izin talebiThis article has been published
Video Coming Soon
JoVE Hakkında
Telif Hakkı © 2020 MyJove Corporation. Tüm hakları saklıdır
Sitemizdeki deneyiminizi iyileştirmek için çerezleri kullanıyoruz
Sitemizi kullanmaya devam ederek ya da "Devam et" butonuna tıklayarak, çerezleri kabul edebilirsiniz.