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Resgate de arenavírus recombinantes a partir de ADNc clonados, uma abordagem designada por genética reversa, permite aos investigadores para investigar o papel dos produtos de genes virais específicos, bem como a contribuição dos seus vários domínios e resíduos específicos, de diferentes aspectos da biologia do arenavírus . Da mesma forma, inverter técnicas de genética em linhas de células aprovadas pela FDA (Vero) para o desenvolvimento da vacina proporciona novas possibilidades para a produção de vacinas eficazes e seguras para combater arenavírus patogénicos humanos.
O desenvolvimento e implementação de arenavírus reversa genética representa um avanço significativo no campo 4 arenavírus. A utilização de sistemas de arenavírus minigenome baseados em células, juntamente com a capacidade de gerar arenavírus infecciosos recombinantes com mutações predeterminadas nos seus genomas facilitou a investigação da contribuição dos determinantes virais para as diferentes etapas do ciclo de vida arenavírus, bem como vírus-hospedeiro interacções e mecanismos de patogénese arenavírus 1, 3, 11. Além disso, o desenvolvimento de arenavírus trisegmented tem permitido a utilização do genoma arenavírus para expressar genes estranhos adicionais de interesse, criando assim a possibilidade de uma aplicação vector de vacina à base de arenavírus 5. Do mesmo modo, o desenvolvimento de arenavírus infecciosas único ciclo capaz de expressar genes repórter proporciona uma nova ferramenta experimental para melhorar a segurança de pesquisa envolvendo highly patogênicos arenavírus humanos 16. A geração de arenavírus recombinantes utilizando técnicas de genética reversa baseados em plasmídeo, até agora contou com a utilização de linhas de células de roedores 7,19, o que coloca algumas barreiras para o desenvolvimento da Food and Drug Administration (FDA) licenciado vacina ou vetores vacinais. Para superar esse obstáculo, descrevemos aqui a geração eficiente de arenavírus recombinantes em células Vero FDA-aprovados.
Arenavírus são vírus com envelope com um bisegmented, genoma de RNA de cadeia negativa 3, que pertencem à família Arenaviridae. O genoma arenavírus codifica quatro proteínas de maneira AMBISENSE a partir de dois segmentos virais independentes 3. O segmento de grande (L) codifica a RNA polimerase dependente de RNA (L) eo pequeno anel (Really Interesting New Gene) proteína dedo (Z), que serve como a principal força motriz do vírus da brotação. O segmento pequeno (S) codifica a nucleoproteína viral (NP) e da glicoproteína de superfície (GP) (Figura 1).
Vários membros da família Arenaviridae são responsáveis pela febre hemorrágica letal (HF) 3 em seres humanos. Das preocupações principais são vírus de Lassa (LASV) e vírus Junín (JUNV), que são conhecidos por causar alta mortalidade em pacientes hospitalizados, 8, 9. Embora esses vírus são endêmicos para a África Ocidental e rural Argentina, respectivamente,há preocupações crescentes de importação de LASV e JUNV para áreas não endêmicas, devido ao aumento de viagem para 10. Além disso, embora não seja normalmente associada com doença grave em humanos, o arenavírus protótipo vírus choriomeningitis linfocítica (LCMV) é considerado um patógeno negligenciado como tem havido casos de infecção letal em pacientes imunocomprometidos, 6, 15 e é responsável por defeitos congênitos e abortos espontâneos em mulheres grávidas, 2, 13. Actualmente não há EUA aprovados pela FDA vacinas contra arenavírus e tratamento é limitada ao nucleósido análogo ribavirina, que é apenas parcialmente eficaz e, muitas vezes associada com efeitos colaterais significativos.
A introdução de reverse-base plasmídeo genética 4 e geração de arenavírus recombinantes 7, 19 têm avançado muito no campo da pesquisa arenavírus. Actualmente, as células de roedores (tais como BHK-21) são utilizados para o Generção de arenavírus recombinantes devido à específica da espécie murina RNA polimerase I (pol-I) promotora dirigir a transcrição inicial dos segmentos L e S. No entanto salvamento vírus em células BHK-21 não são um método aprovado para a geração de arenavírus recombinantes como vacinas candidatas potenciais de sementes. Aqui vamos documentar o uso do ser humano pol-I promotor de resgate eficiente do Velho Mundo protótipo (OW) LCMV eo Novo Mundo (NW) JUNV Candid º 1 tensão em células Vero. Utilizando uma metodologia similar, geramos LCMV recombinante trisegmented (r3LCMV) e Candid # 1 (r3Candid # 1) arenavírus que contêm dois genes estranhos adicionais codificados em dois segmentos de RNA é diferente 5. Este novo sistema não só segue um protocolo altamente reprodutível e simples, mas pode ser imediatamente implementado na geração de arenavírus recombinantes como vacinas potenciais ou sementes vector de vacina.
1. Arenavirus Resgate transfecção
O nosso sistema de resgate foi baseado na utilização de ambas as proteínas II plasmídeos de expressão que codificam a polimerase de nucleoproteína (NP) e dependente de ARN-ARN-polimerase (L), os factores que actuam em trans necessárias para a replicação viral de ARN e a expressão do gene do genoma arenavírus 7, 19, e os plasmídeos, capazes de dirigir a síntese intracelular, via celular espécies de ARN antigenoma G RNA polimerase I (pol-I), de S e 7. Nos nossos estudos que utilizam a expressão de proteínas do plasmídeo pCAGGS, que utiliza o promotor de frango β-actina e as sequências de sinal polyadenylanation (PA), e o pol-I humana do plasmídeo, o qual utiliza o promotor da polimerase I humana e sequências de terminação de murino (Figura 2) . Os segmentos de ARN L S e são clonados no plasmídeo HPOL-I numa orientação antigenomic para permitir a geração de segmentos de RNA genómicas após a transcrição por HPOL-I. Para o resgate de wild-tyep recombinante LCMV (rLCMV) e Espontânea # 1 (rCandid # 1) o pCAGGS NP e L a partir de cada um dos vírus, foram co-transfectados juntamente com o seu respectivo segmentos de ARN L (Figura 3) Pol-I humana e S. Geração de LCMV recombinante trisegmented (r3LCMV) e Espontânea # 1 (r3Candid # 1) seguido de um protocolo similar, mas o segmento S foi dividido em dois plasmídeos diferentes de pol I-S, cada um codificando um gene repórter diferente: em um, a leitura aberta NP armação (ORF) foi substituído com o (GFP), gene repórter Proteína Fluorescente Verde (HPOL-GFP I S / GP) e, no outro, o precursor da glicoproteína virai (GPC) ORF é substituído com o Gaussia luciferase (Glic) gene repórter (HPOL-I S NP / Gluc). Uma representação esquemática do protocolo é ilustrada na Figura 4. Foi estabelecido o seguinte protocolo de transfecção e infecção por 6-well-placas.
A detecção de um resgate bem sucedido de rLCMV e rCandid º 1 é obtida através de um formando unidade de foco (UFF) imunofluorescência indireta (IFA). Para o tipo selvagem de vírus de resgate que utilize anticorpos específicos para o NP viral. O r3LCMV e r3Candid # 1 codificar dois genes repórter (GFP e Glic), permitindo assim a detecção de vírus e sem a necessidade de titulação de anticorpos por meio de microscopia de fluorescência (BPA) e / ou luminescência (Glic).
3. A passagem de sobrenadantes de cultura de tecidos
Resgate viral depende da eficiência de transfecção. As células Vero foram mostradoster eficiências de transfecção mais baixos do que outras linhas de células 14. Se os títulos de vírus no TCS são baixos, infectar as células frescas Vero a uma multiplicidade de infecção (MOI) de 0,01 (LCMV) ou 0,1 (Espontânea # 1) durante 72 horas para amplificar o vírus.
Salvamento bem sucedido de um arenavírus do tipo selvagem recombinante será confirmada pela presença de antigénios do vírus utilizando IFA (Figura 5). No caso de vírus recombinantes trisegmented, resgate viral bem sucedida pode ser avaliada através da observação se expressão da GFP por microscopia de fluorescência (Figura 6A). Salvamento bem sucedido irá ser ainda confirmada por avaliar a expressão Gluc (Figura 6B). Os resultados representativos que ilustram o sucesso do salvamento arenavírus de tipo selvagem e trisegmented foram obtidos usando o protocolo indicado acima.
Figura 1. Arenavirus organização do genoma e estrutura viral. Arenavírus são vírus envelopados, negativa de senso RNA com genomas bisegmented 3. Cada segmento utiliza uma estratégia de codificação de AMBISENSE para dirigir a síntese de duas Protei viralns 3 em orientação oposta. A (L) do segmento grande (7,2 kb) codifica para a RNA-dependente de ARN-polimerase (L) e da pequena proteína de dedo Ring (Z) que tem funções semelhantes a matriz, incluindo dirigir o processo de brotamento 3. O (S) do segmento pequeno (3,5 kb) codifica para o precursor da glicoproteína (CPG) e a nucleoproteína (NP). GPC é processada pós-traducionalmente para produzir GP-1 e GP-2, que se associam para formar o complexo de glicoproteína (GP), que constituem os pontos na superfície da estrutura do virião responsáveis pelo reconhecimento do receptor e a entrada nas células 17, 18. NP encapsidates o RNA (ARNv) do genoma viral e, juntamente com a forma da proteína G os ribonucleoproteínas virais (vRNPs), que são os componentes mínimos para a replicação virai e a transcrição 12. IGR: região intergênica.
Figura 2. Arenavirus rescuelectrónicos plasmídeos. Diagrama dos plasmídeos utilizados para a geração de arenavírus recombinante em células Vero. Proteína de expressão plasmídeo pCAGGS utiliza o promotor de frango β-actina e as β-globina de poliadenilação (pA), as sequências de sinal de coelho para dirigir a síntese de L viral e NP, 4, 7. CMV-IE potenciador: citomegalovírus imediato início potenciador. Intron: frango β-actina seqüência intron. O HPOL-I plasmídeos utiliza o promotor da polimerase I humana e sequências de terminador da polimerase de murino para dirigir a síntese de um dos segmentos de ARN viral. Ambos pCAGGS e plasmídeos HPOL-I são resistentes à ampicilina (Amp).
Figura 3. . De tipo selvagem e trisegmented salvamento arenavírus Nas oval negra são os plasmídeos necessários para a geração de arenavírus recombinante de tipo selvagem: pCAGGS NP e L, e HPOL-I S e L. NP e L são requeremd para iniciar a transcrição e replicação viral. O HPOL-I S e L síntese intracelular direta, via pol-I, de S e espécies de RNA antigenomic L. Nas oval vermelho são os plasmídeos necessários para a geração de arenavírus trisegmented: pCAGGS NP e L, bem como o HPOL-I L plasmídeo, que são as mesmas que as descritas para o tipo selvagem salvamento arenavírus. O HPOL-I S é separado em dois plasmídeos: um plasmídeo em, NP é substituído com GFP (HPOL-GFP I S / PG) e no outro plasmídeo, o GP é substituído pelo gene Gluc (HPOL-I S NP / Gluc ).
Figura 4. Protocolo de resgate Arenavírus. Arenavírus salvamento é feito em células Vero, utilizando um formato de placa de 6 poços. Resumidamente, as células Vero são transfectados em suspensão no Dia 1, utilizando Lipofectamine 2000. Em 24 horas após a transfecção, o meio é substituído com meio fresco infecciosas. As células transfectadas foram incubadas durante um adicional de 48 horas e, em seguida, em escala-up em um pratos de 100 mm (dia 4). Células Vero em pratos 100 milímetros são incubadas durante uma 72 horas adicionais. No dia 7 pós-transfecção TCS são coletadas para detecção viral por qualquer microscopia de fluorescência (r3LCMV e r3Candid n º 1), após a infecção em células Vero frescos IFA (rLCMV e rCandid º 1) ou. Se os títulos virais são mais baixos do que o esperado, o TCS pode ser utilizado para infectar células Vero frescas para amplificar o vírus.
Figura 5. Confirmação de um bem sucedido resgate viral de tipo selvagem. TCS de passagem celular (placas de 100 mm), são utilizadas para infectar células Vero frescas em placas de 96 poços. Em 24 horas após a infecção, as células foram fixadas, permeabilizadas e bloqueados antes da coloração com LCMV-ou Espontânea # anticorpos específicos para um. A presença de antigenes virais é observada através de microscopia de fluorescência. Barras de escala, 100 mM.
Tabela 1. Concentração de DNA Lipofectamine / plasmídeo para resgate arenavírus. Recomendado DNA e LPF2000 concentrações para a geração de recombinante wilarenavírus d-tipo e trisegmented em células Vero são indicados.
Geração de arenavírus recombinantes utilizando técnicas de genética reversa baseados plasmídeo tornou-se uma abordagem amplamente utilizado para a investigação de muitas facetas diferentes de biologia arenavírus. Aqui nós documentar uma melhoria crucial para o atual sistema através da realização de arenavírus resgata em células Vero, permitindo o potencial de geração de vacinas candidatas aprovadas pela FDA contra arenavírus e vetores de vacinas contra outras doenças infecciosas.
Os procedimentos experimentais envolvidos são, em geral, bem estabelecida e não deve representar obstáculos significativos. Existem, no entanto, diversos factores que devem ser cuidadosamente monitorizados para assegurar um sucesso consistente. A manutenção adequada de células Vero é crucial para um resgate viral bem sucedida. Além disso, é imperativo ter uma boa preparação de plasmídeos para gerar arenavírus recombinantes (ver protocolo para a manutenção de células e preparação plasmídeo). Para o resgate de rLCMV e rCandid # 1 do tipo selvagem ou as suas versões trisegmented, recomenda-se três transfecções independentes para cada um dos vírus recombinantes para aumentar a probabilidade de um resgate bem sucedido, tal como as células Vero não são facilmente transf 14. Se mais do que um vírus recombinante de resgate é tentada, dimensionar os seguintes passos em conformidade com o número de vírus para ser resgatado. Como um controlo negativo, que incluem a transfecção na ausência de pCAGGS NP (NP-pCAGGS).
Como as células # 1-infected LCMV e Espontânea não exibem efeito clássico citopático (CPE), resgate bem-sucedido viral do tipo selvagem rLCMV e rCandid # um vírus deve ser avaliado através da detecção de progênie infecciosas, o que poderia ser feito usando um clássico ou através de ensaio de placas de IFA. Recomendamos o uso da IFA em relação ao ensaio de placa clássico porque o primeiro pode ser concluída dentro de 24 horas em vez dos 5 - 6 dias necessários para o desenvolvimento de placas. O r3LCMV ou r3Candid º 1 ser resgatado codificar dois genes repórter (GPF e Glic), permitindo assim a detecção e virais sem a necessidade de titulação de anticorpos por meio de microscopia de fluorescência (BPA) e / ou luminescência (Glic). Tal como no resgate de LCMV e Espontânea # 1 salvamento recombinante de tipo selvagem, um vírus de resgate trisegmented vencida irá resultar na ausência de células Vero fluorescentes após inoculação com a TCS a partir de células transfectadas.
Dado que o G S e os segmentos são movidos pelo polyermase I humana promotor, este sistema de resgate pode ser aplicada em outras células humanas. Na verdade, também têm gerado com êxito tanto rLCMV de tipo selvagem e recombinante e trisegmented rCandid # um vírus em células embrionárias de rim humano 293T de alta eficiência. Além disso, a transfecção de células em monocamadas, também resultou na recuperação do vírus, embora não tão eficiente quanto a transfecção, quando as células Vero e 293T em suspensão. No que diz respeito à detecção de resgate viral LCMV e Espontânea # 1 do tipo selvagem, podem também ser utilizados anticorpos primários contra outras proteínas virais. Nocaso dos vírus R3, pudemos detectar Glic por luminescência em vez de expressão da GFP. Alternativamente, outros genes repórter podem ser usadas no lugar de Glic e GFP 5.
Nosso sistema de resgate vírus provou ser altamente eficiente em nossas mãos, e aqui nós proporcionar as melhores condições de transfecção. É altamente recomendável usar os valores indicados de plasmídeos. Se salvamento vírus é realizada em outras linhas de células humanas, a quantidade de células, o ADN e / ou LPF2000 deve ser testado.
A geração de arenavírus do tipo selvagem e usando trisegmented genética inversa à base de plasmideo em células Vero permitirá estudar vários aspectos da biologia do arenavírus, bem como para o futuro desenvolvimento de vacinas aprovadas pela FDA e vectores de vacina.
Agradecemos membros passados e presentes em JCT e laboratórios LM-S para o desenvolvimento e melhoria das técnicas de genética reversa arenavírus e plasmídeos. Agradecemos também Snezhana Dimitrova para suporte técnico. O anticorpo monoclonal dirigido para JUNV NP (SA02-BG12) foi obtido a partir de BEI Recursos (NIAID Biodefesa e Infecções Repositório de Recursos de Investigação). BYHC foi apoiado por Grant Número GM068411 Institucional de Ruth L. Prêmio por Serviço Nacional de Investigação Kirschstein. EO-R é um Fullbright-Conicyt (BIO 2008) e uma bolsa de Rochester Vaccine (2012) destinatário. Suporte atual EO-R é fornecida por uma bolsa de pós-doutorado para a Diversidade e Excelência Acadêmica do Gabinete para o Desenvolvimento Professores e Diversidade na Universidade de Rochester. Research in LM-S laboratório é financiado pelo NIH concede RO1 AI077719, R21NS075611-01, R03AI099681-01A1, os Centros de Excelência NIAID para Influenza Pesquisa e Vigilância (HHSN266200700008C) eA Universidade de Rochester Center for Biodefense Modeling Imune (HHSN272201000055C).
Pesquisa da JCT laboratório foi suportado por concessões RO1 AI047140, RO1 AI077719 e SR1 AI079665 do NIH.
Name | Company | Catalog Number | Comments |
Material and methods | |||
Cell lines Vero E6 (African green monkey kidney epithelial cells) are maintained in a 37 °C incubator with 5 % CO2 in DMEM 10 % FBS 1 % PS. Cells are available from the American Type Culture Collection (ATCC, catalogue number CRL-1586). Plasmids All plasmids, with the exception of hpol-I L, can be grown at 37 °C, for 16-18 hr. We recommend that cultures of the hpol-I L be grown at 30 °C for 24 hr. Plasmids are prepared using a plasmid maxi kit (EZNA Fastfilter Plasmid Maxi Kit, Omega Bio-tek) following the manufacturer's recommendations and stored at -20 °C. The concentration of the purified DNA plasmid is determined by spectrophotometry at 260 nm, with purity being estimated using the 260:280 nm ratio. Preparations with 1.8-2.0 260:280 nm ratios are considered appropriate for virus rescue purposes. Additionally, plasmid concentration and purity should be confirmed with agarose gel electrophoresis. Viruses The described protocol for rescuing rLCMV (Armstrong 53b) and rCandid#1 can be executed under biosafety level (BSL) 2 conditions. Contaminated material, including TCS and cells should be sterilized before disposal. Rescue of other arenavirus may require higher BSL facilities so proper safety/security measures must be followed. Tissue culture media and solutions DMEM 10 %FBS 1 %PS: 445 ml Dulbecco's modified Eagle's medium (DMEM), 50 ml of Fetal Bovine Serum (FBS), and 5 ml of 100X Penicillin/Streptomycin (PS). Store at 4 °C. This media will be used for maintenance of Vero cells. Infectious Media: 2-to-1 mixture of OptiMEM and DMEM 10 %FBS 1 %PS. Store at 4 °C. This media will be used during viral infections. 10X Phosphate buffered saline (PBS): 80 g of NaCl, 2 g of KCl, 11.5 g of Na2HPO4.7H2O, 2 g of KH2PO4. Add ddH2O up to 1 liter. Adjust pH to 7.3. Sterilize by autoclave. Store at room temperature. 1X PBS: Dilute 10X PBS 1:10 with ddH2O. Sterilize by autoclave and store at room temperature. 2.5 % BSA: 2.5 g of BSA in 97.5 ml of 1X PBS. Store at 4 °C. This is used as a blocking solution for IFA. |
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