We would like to thank Dr. Aaron Brault and Dr. Brandy Russell of the Centers for Disease Control and Prevention (CDC), USA for providing Zika viral strain PRVABC59. We thank Nicholas Ten of Yale University for copy-editing this manuscript. This work was supported by the Cedars-Sinai Medical Center Institutional Programmatic Research Award to V.A.

주 : 작업 흐름의 개략적 개요는도 1에 제시된다. 1. 세포 <ol><li> Zika 바이러스 생산 및 바이러스 성 복제주기의 분석을위한 베로 세포를 사용합니다. </li><li> 전체 10 % 소 태아 혈청 (FBS), 2 mM의 L- 글루타민, 페니실린 (100 단위 / ml), 스트렙토 마이신을 함유하는 성장 배지 (100 단위 / ml), 및 10 mM의 HEPES를 준비한다. </li><li> 5 % CO 2, 37 ℃에서 특정 완료 성장 배지 베로 세포 배양. </li></ol> 2. Zika 바이러스 생산 <ol><li> T-75 플라스크에 0.25 % 트립신을 사용하여 80 %의 세포 밀도의 베로 세포를 수확하고, 세포 수를 계산. <ol><li> T-75 배양 플라스크에서 미디어를 대기음 2 ml의 인산염 완충 생리 식염수 (PBS)로 세포를 씻어. </li><li> 0.25 % 트립신 2 ML을 추가하고 5 분 동안 37 ° C에서 플라스크를 품어. </li><li> 트립신을 불 활성화하는 성장 매체를 포함하는 혈청의 8 ML을 추가합니다. 피펫 위 SUS 아래로PEND 세포를 15 ㎖의 튜브에 세포를 전송하고. </li><li> 세포의 10 μl를 제거하고 0.4 % 트리 판 블루의 동일한 양으로 혼합한다. 셀 카운팅 챔버 슬라이드에 준비된 믹스를 넣고 자동 세포 계수기를 사용하여 카운트하여 생존 세포를 얻을 수 있습니다. </li></ol></li><li> 은 T-160 플라스크에 30 mL의 부피로 세포 7,000,000 개의 종자. </li><li> 다음 날, 플라스크 당 10 ml의 무 혈청 배지에서 Zika 바이러스 접종의 (0.1 MOI 0.01) 감염의 적절한 다수를 준비합니다. </li><li> T-160 플라스크에서 소비 된 용지를 제거하고 새로 제조 된 바이러스 접종 물 (10 ㎖)를 추가합니다. </li><li> 4 ~ 6 시간 동안 5 % CO 2와 37 ° C에서 접종 플라스크를 품어. 부드럽게 모든 시간에 옆으로 플라스크를 기울여 접종을 확산. </li><li> 배양 완료시, 각 플라스크 따뜻한 혈청 보충 성장 미디어 (30 ㎖)으로 접종을 교체합니다. 그런 다음 96 시간 동안 바이러스 문화를 계속합니다. </li><li> 에서의 진행을 확인위상차 현미경을 이용하여 40 배 및 200 배 배율 필요한 이미지 (도 2)를 가지고 세포 단층에 바이러스 플라크의 외관을 관찰하여 fection. </li></ol><img alt="그림 2" src="/files/ftp_upload/54767/54767fig2.jpg" /> 그림 2 :. 다양한 배율의 베로 세포의 단층에 Zika 바이러스에 의해 형성된 플라크 밝은 필드 이미지는 48 HPI에서 Zika 바이러스 플라크를 보여줍니다. 단일 층에 둥근 세포 병소의 존재를합니다. (스케일 바 = 50 μm의)는 <a href="https://www-jove-com.remotexs.ntu.edu.sg/files/ftp_upload/54767/54767fig2large.jpg" target="_blank">이 그림의 더 큰 버전을 보려면 여기를 클릭하십시오.</a> <ol start="8"><li> 96 시간 시점에서 원심 분리 4 ° C에서 10 분 동안 300 XG의 상등액에서 수확 세포 배양 상청 균체 잔사를 제거했다. </li><li> 조심스럽게 방해 펠렛 파편과 전송 t없이 뜨는을 제거15 ml의 튜브 오. 24,000 XG에 초 원심 분리 (옵션) 바이러스 입자를 집중 수행 할 수 있습니다. </li><li> -80 ° C에서 여러 분취에서 바이러스 배양 상층 액을 저장합니다. </li></ol> 플라크 분석 3. 측정 Zika 바이러스 역가 <ol><li> 12 웰 플레이트를 사용하여 2 ml의 볼륨에 웰 당 1 × 10 5 세포에서 종자 순진 베로 세포. </li><li> 다음날, 혈청이없는 배지를 사용하여 T-160 플라스크에서 수집 바이러스 배양 상청액의 연속 희석 1/10 제조. 각에서 소비 된 미디어를 잘 제거하고 중으로 베로 세포에 준비 접종의 400 μl를 추가합니다. </li><li> (37)에 접종 플라스크를 품어 4 ~ 6 시간 동안 5 % CO 2와 C를 °. 조심스럽게 하나 하나 시간에 옆으로 판을 기울여 접종을 확산. </li><li> 인큐베이션의 끝에, 세럼이 보충 미디어 접종 (웰 당 2 ml)로 교체한다. </li><li> 48 시간 포스트 접종에서, 위상 제어 방식을 사용하여 바이러스 초점을 계산AST 현미경. ml의 당 플라크 형성 단위 (PFU)와 같은 바이러스 역가를 계산합니다. 플라크 분석 그림 3을 참조하십시오. </li><li> 수정하고 플라크 명확한 시각화 20 % 에탄올 중에서 제조 된 4 % 포름 알데히드 셀 0.1 % 크리스탈 바이올렛 용액을 착색. </li></ol> 4. Zika 바이러스 성 게놈 복제 분석 <ol><li> 12 웰 플레이트를 사용하여 2 ml의 볼륨에 웰 당 1 × 10 5 세포에서 종자 순진 베로 세포. 세중에서 혈청 무료 매체를 사용하여 낮은 및 높은 역가의, 그 다음날은 바이러스 접종 (400 μL / 웰 0.01 및 0.1의 MOI)를 준비합니다. 모의 감염, 혈청이없는 배지 (400 μL / 웰) 만 사용합니다. </li><li> 3.4 단계 3.2를 반복합니다. </li><li> 48 및 96 시간 시점에서, RNA 및 면역 세포 화학 (ICC)에 샘플을 수집한다. <ol><li> 수확 RNA 샘플의 경우, 미디어를 제거한 다음 해물을 잘 직접 각 용해 액 400 μl를 추가하고 수집합니다. </li><li> ICC를 들어, 미디어 및 t 제거암탉 각 웰에 1 ml의 메탄올을 첨가하여 세포를 고정시키고, 30 분 동안 4 ℃에서 플레이트 배양한다. </li><li> 세포 파쇄물, 제조자의 지시 당 RNA 분리 키트를 이용하여 총 RNA를 분리. 분광 광도계를 사용하여 RNA를 정량화. </li></ol></li><li> 수확 된 RNA로부터 ZIKV 게놈 콘텐츠를 결정하기 위해 두 단계의 정량적 역전사 PCR (RT-qPCR에)을 수행한다. <ol><li> RNA의를 전사 바꾸려면, 먼저 0.2 ML 튜브에서 격리 RNA의 5 μg의,의 dNTPs (10 mM)을 1 μL, 1 μL 무작위 헥사 (250 NG)로 구성된 13 μL 반응 믹스를 설정합니다. 5 분 동안 65 ° C에서 튜브를 품어 다음 일분 얼음에 놓습니다. 그 후, 역전사 효소 1 ㎕를, 5 배 가닥 합성 완충액 4 ㎕를 0.1 M 디티 오 트레이 톨 1 μL, 반응 혼합물에의 RNase 억제제 1 μL를 추가한다. 50 ° C 및 inactiv 60 분이어서 25 ℃에서 추가로 5 분 동안 튜브를 부화15 분 동안 70 ° C로 가열하여 반응을 먹었다. </li><li> qPCR에가 2 배 녹색 염료 슈퍼 믹스의 12.5 μl를 포함하는 DNA 중합 효소와 Zika 바이러스 [용 Zika 바이러스 범 유전자형 프라이머 (특정 10 mM의 각각의 프라이머 1 μL와 결과의 cDNA 1 μl를 사용하여 수행 : 5&#39;-AARTACACATACCARAACAAAGTGGT-3 &#39; ; 반전 : 5&#39;-TCCRCTCCCYCTYTGGTCTTG-3 &#39;), Zika 바이러스 아시아 유전자형 PRVABC59 균주 프라이머 (5&#39;-AAGTACACATACCAAAACAAAGTGGT-3&#39;; 반전 : 5&#39;-TCCGCTCCCCCTTTGGTCTTG-3 &#39;)], 또는 C 형 간염 바이러스 (JFH RTQ F : 5 &#39;CTGGGTCCTTTCTTGGATAA-3, JFH RTQ R : 5&#39;CCTATCAGGCAGTACCACA-3&#39;), 또는를 들어 휴대 하우스 키핑 유전자 GAPDH (: 5&#39;-CCACCTTTGACGCTGGG-3 &#39;; 계 : 5&#39;-CATACCAGGAAATGAGCTTGACA-3&#39;) 25 μL 반응 볼륨입니다. </li><li> 실행 조건 15 초 동안 95 ° C 및 실시간 PCR 시스템에서 30 초 (40 회) 60 ° C를 사용하여 PCR을 수행합니다. </li><li> 는 Z 정상화 사이클 임계 값에 기초하여 (CT)의 값을 GAPDH의 발현 수준을 사용IKA 바이러스 게놈 측정. GAPDH에 비해 Zika 게놈 델타 코네티컷 (ΔCT) 값을 계산하고이 값을 ΔCT 얻었다. 그리고, 표시된 시점에서 감염과 감염되지 않은 세포 사이의 정규화 Zika 게놈 내용물의 비율을 고려하여 스크롤 변화를 계산한다. ZIKV 게놈 복제 결과를 그림 4를 참조하십시오. </li></ol></li><li> 메탄올 고정 된 세포를 사용하여 ICC를 수행합니다. <ol><li> (PBS에서 0.1 % 트리톤-× 100, 3 % 염소 혈청, 3 % BSA) 1X PBS로 고정 셀을 세 번 씻고 ICC 차단 버퍼 차단합니다. </li><li> 버퍼를 차단 100 4 ℃에서 밤새 품어 : 1의 희석에 마우스 단일 클론 항 dsRNA를 항체 J2 (1 μg의 / ㎖)를 사용합니다. </li><li> 1X PBS로 세포를 세척하고, 1 차 항체를 염소 항 - 마우스 IgG-594 (1 μg의 / ㎖)을 추가 블로킹 완충액 1000 희석하고, 실온에서 1 시간 동안 배양한다. </li><li> 훽스트 (Hoechst) 염료를 사용하여 핵에 대한 1X PBS와 얼룩 세포를 씻고100X 배율 형광 현미경 (도 4)를 사용하여 세포를 관찰한다. </li></ol></li></ol> Zika 바이러스 감염에 대해 사이토 카인 라이브러리를 스크리닝 (5) <ol><li> 웰 12 웰 플레이트를 사용하는 당 1 × 105 세포에서 순 베로 세포 종자. 세포가 (6 시간 후 - 시드)에 부착되면, 생물 중복에 표시된 농도 (2 ml의 볼륨 / 웰)에서 각각의 사이토 카인을 추가합니다. 차량 (PBS) 혼자 컨트롤을 포함합니다. </li><li> 12 시간 후 처리에서, Zika 바이러스 감염 (물론 당 0.1 400 μL의 MOI)를 수행합니다. 감염 (모의)없이 부정적인 제어 우물을 포함합니다. </li><li> 4 시간 게시물 감염에서, 사이토 카인 처리 된 미디어 (2 ㎖)와 함께 바이러스 접종을 교체합니다. 추가로 44 시간 동안 37 ℃에서 세포를 인큐베이션. </li><li> 48 시간 게시물 감염에서, 위상차 현미경을 사용하여 바이러스 성 플라크를 계산하고 40X 배율 (그림 5)에 감염된 세포의 대표 이미지를 수집. </li></ol>

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The authors have nothing to disclose.

여기에, 시험 관내에서 Zika 바이러스를 배양하기위한 간소화 된 프로토콜이 제공됩니다. 바이러스 배양을 확장 역가를 측정하고, 제공 한 게놈 복제를 정량화하기위한 최적의 엔드 포인트를 식별하는 단계를 포함하여 긴급. Zika 바이러스 감염 인자를 처리하는 동안, 바이오 안전성 절차를 엄격하게 따라야한다, 인간 병원체이기 때문에. 원숭이 신장 세포주 베로은 다양한 바이러스 학적 분석을 보여주는 사용 하였다. Zika 바이러스 복제의 반응 속도는 다양한 조직과 종의 세포에서 다를 수 있습니다. 이전 15 바와 같이 추가의 세포주가 사용될 수있다. Zika 바이러스 감염된 태아 (3)의 뇌 조직에서 분리 된 피질 신경 전구 세포를 감염 14 밝혀졌다. 따라서, 신경 세포 ZIKV 감염 병리학을 평가하는 추가 셀 고유 통찰력을 제공 할 수있다. 아프리카와 아시아 유전자형의 neurovirulent 표현형의 차이를 조사 할 수있다이 감염 배양 시스템을 사용. 여기에 설명 된 바이러스의 제조 방법은 비 - 인간 영장류 또는 설치류 모델 시스템에서의 생체 내 연구 병원성 향해 고역가 바이러스를 생성하는 데 유용 할 것이다. 이 동안,이 연구는 베로 세포의 사용에 한정되는 인간 모기 기원 세포주를 생산 높은 역가를 테스트 할 수있다. CPE는 3 일에 세포의 10~30%에서 관찰되는 경우 바이러스 생산하는 동안, 감염된 세포를 1 분할 될 수있다 : 4 밀도 및 배양 추가 4~5일 동안 계속 될 수있다. 7 일째의 끝에서, 전체 CPE를 관찰 할 수있다. ZIKV 팬 - 유전자형과 균주 특이 적 프라이머의 효율성을 비교하고 모두 낮은과 높은 역가의 바이러스에 감염된 세포에 Zika 바이러스 게놈을 정량화에 민감한 것으로 확인되었다. 더욱이, 본 연구에서, 항체 기반 프로브는 감염된 세포를 식별하기 위해 검증된다. 이 dsRNA를 특정 항체를 성공적으로 RECOZika 바이러스에 감염된 세포에서 gnized 세포질 바이러스 게놈. 이러한 최적화 된 시약은 번역, 게놈 복제, 조립 및 비리의 형태 형성과 같은 바이러스 복제의 다양한 단계를 해부하는 유용한 자원이 될 것입니다. 이 시험 관내 감염 세포 배양 시스템은 상보 적 DNA (cDNA의) 클론으로부터 생성 Zika 바이러스 특정 서브 플리 게놈 및 감염성 바이러스를 이용하여 장래의 연구에 적용 할 수있다. Zika 감염성 바이러스의 cDNA 클론의 개발 및 유전 적 분자 생물학적 기법을 조합하여 NS1 및 NS4B 포함한 바이러스 유전자의 기능 연구를 촉진 할 것이다. 형광 계 또는 형광 리포터 유전자 태그 Zika 바이러스 구축 높은 콘텐츠 스크리닝 분석법에 세포 배양 시스템을 사용하여 상기 제조에 유용한 도구가 될 것이다. 두 유형 I과 유형 II IFNs 안티 Zika 바이러스 활성을 보여 주었다. IFN-α, IFN-β와 IFN-γ는 더 EV 될 수 있습니다Zika 바이러스 감염과 관련된 질환에 대한 예방, 노출 후 예방, 치료 등의 임상 설정에서 aluated. Zika 바이러스 양성 임산부 포함 고위험군은 치료의 첫째 줄로 인터페론으로 치료 될 수있다. 인터페론 α 처리는 임신 한 여성 (18, 19)에 대한 안전한 것으로 나타났다. 요약 Zika 바이러스 성장의 다양한 양상을 조사하기 위해 사용될 수있는 감염 세포 배양 시스템이 기재되고 설명된다. 프로토콜과 여기에 설명 된 시약은 Zika 바이러스 및 신경 학적 연구 커뮤니티를 연구하는 사람들에게 중요한 자원입니다.

Zika 바이러스 (ZIKV)는 소두증와 가난한 임신 1,4를 성과와 관련된 중요한 인간 병원체이다. ZIKV는 같은 뎅기열, 웨스트 나일, 세인트 루이스 뇌염 바이러스와 같은 신경 학적 결함을 일으킬 수 의학적으로 관련 플라 비 바이러스의 집합에 속한다. 바이러스 전송의 주요 모드뿐만 아니라, 성적 전송은 5,6를보고되었습니다, 모기 벡터 Aedes aegypti에 의해, 그리고. ZIKV 인해 모기 벡터의 확대 지리적 분포 및 출생 결함과의 강한 상관 관계에 주요 글로벌 건강 문제가되고있다. ZIKV 먼저 Zika 숲에서 감시 붉은 털 원숭이에서 1947 년 고립 된, 우간다 및 제 인간의 경우는 1952 7,8보고되었다. 발열, 발진, 두통, 결막염, 근육 / 관절 통증 등의 가벼운 증상에 존재 ZIKV에 감염 될 개인. 감염된 임산부는 태아 1 ZIKV를 전송할 수 있습니다. 지IKV 감염은 길랑 바레 증후군, 말초 신경의자가 면역 탈수 초 질환 (9)에 연결되어있다. Zika 바이러스 게놈의 길이는 약 10.8 킬로베이스이고 긍정적 인 의미, 단일 가닥 RNA 분자로 구성되어 있습니다. 게놈의 구조는 단백질 코딩 영역을 측면 비 코딩 영역 (NCR)와, 5&#39;NCR-C-PRM-E-NS1-NS2A - NS2B-NS3-NS4A-2K-NS4B-NS5-3&#39;NCR로 구성되어 있습니다 6. 하나의 폴리 프로테인 (3419 AA)는 그 공동 및 사후 병진 (10) 작은 펩타이드로 분해입니다 번역됩니다. 5&#39;NCR 및 3&#39;NCR RNA 줄기 루프 구조는 모두 바이러스 게놈 번역 및 복제의 개시에 중요한 역할을한다. 게놈의 구조적 성분은 캡시드, 막 및 외피 단백질로 구성된다. 비 구조 단백질은 게놈 복제를 위해 중요하다. 현재 Zika 바이러스 균주는 세 가지 주요 유전자형으로 분류된다 : 서 아프리카, 동 아프리카, 아시아 6,10-13. 그것은이 제안되어있다가 나중에 추가로 12 진화 서부 아프리카와 아시아에 확산 동부 아프리카 혈통. 아시아 유전자형은 미국에서 현재 발생에 대한 책임이 있습니다. Zika 바이러스는 모기와 포유 동물 세포 모두에서 배양 할 수있다. 기본 피부 섬유 아세포, 미성숙 수지상 세포, 대뇌 피질의 신경 전구 세포와 베로 세포 Zika 10,14,15 바이러스 감염에 취약하다. 모두 유형 I 및 유형 II 인터페론 피부 섬유 아세포 (15) ZIKV 성장을 제한하는 것으로 나타났다. 이 연구의 목적은 포유 동물 세포 배양 시스템에서 생산 및 아시아 유전자형 ZIKA 바이러스 스트레인 PRVABC59의 시금위한 단계별 상세한 프로토콜을 제공하고 약물 개발 플랫폼으로 이러한 감염 배양 시스템의 유용성을 입증한다. 이 자원은 크게 더 난을 규명 할 수있는 Zika 바이러스 및 신경 학적 연구 커뮤니티에 혜택을 가능성이있다바이러스의 발병 기전과 바이러스 독성의 진화의 TS 메커니즘.

<table border="0" cellpadding="0" cellspacing="0" width="1209">
	<tbody>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:569px;">Dulbecco&#8217;s modified Eagle&#8217;s medium (DMEM)</td>
			<td style="width:355px;">Sigma Life Science</td>
			<td style="width:119px;">D5796</td>
			<td style="width:167px;"></td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:569px;">HEPES</td>
			<td style="width:355px;">Life Technologies</td>
			<td style="width:119px;">15630080</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:569px;">Glutamax</td>
			<td style="width:355px;">Life Technologies</td>
			<td style="width:119px;">35050061</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:569px;">2.5% Trypsin, 10X [-] Phenol Red&#160;&#160;</td>
			<td style="width:355px;">Corning</td>
			<td style="width:119px;">25-054-C1</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;">Trypan Blue Stain 0.4%</td>
			<td style="width:355px;">Life Technologies</td>
			<td>T10282</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;">Countess &#8211; Automated Cell Counter</td>
			<td style="width:355px;">ThermoFisher Scientific</td>
			<td style="width:119px;">C10227</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:569px;">Countess-cell counting&#160; chamber slides</td>
			<td style="width:355px;">ThermoFisher Scientific</td>
			<td style="width:119px;">C10283</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:569px;">Rneasy Mini Kit</td>
			<td style="width:355px;">Qiagen</td>
			<td style="width:119px;">74104</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:569px;">Nanodrop 2000</td>
			<td style="width:355px;">Thermo Scientific</td>
			<td style="width:119px;">Nanodrop 2000</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;">mouse monoclonal anti-dsRNA antibody J2&#160;</td>
			<td>English &#38; Scientific Consulting Kft.</td>
			<td style="width:119px;">10010200</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:569px;">Goat anti-rabbit IgG Alexa Fluor 594</td>
			<td style="width:355px;">Life Technologies</td>
			<td>A11020</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:569px;">SUPERSCRIPT III RT&#160;</td>
			<td style="width:355px;">Life Technologies</td>
			<td style="width:119px;">18080085</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:569px;">SYBR QPCR SUPERMIX W/ROX</td>
			<td style="width:355px;">Life Technologies</td>
			<td style="width:119px;">11744500</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;">QuantStudio12K Flex Real-Time PCR System</td>
			<td style="width:355px;">Thermo Fischer</td>
			<td style="width:119px;">4471088</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:569px;">RNase-Free DNase</td>
			<td style="width:355px;">Promega</td>
			<td style="width:119px;">M6101</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:569px;">Vero Cell Line&#160;</td>
			<td style="width:355px;">ATCC</td>
			<td style="width:119px;">CCL-81</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="22">
			<td height="22" style="height:23px;width:569px;">Zika viral strain PRVABC59</td>
			<td style="width:355px;">Centers for Disease Control and Prevention (CDC)</td>
			<td style="width:119px;"></td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="22">
			<td height="22" style="height:23px;width:569px;">IL-6</td>
			<td style="width:355px;">Peprotech</td>
			<td style="width:119px;">200-06&#160;&#160;&#160;&#160;&#160;&#160;&#160;&#160;&#160;&#160;&#160;&#160;&#160;</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="22">
			<td height="22" style="height:23px;width:569px;">IL-1 alpha&#160;&#160;&#160;&#160;&#160;&#160;&#160;</td>
			<td style="width:355px;">Peprotech</td>
			<td style="width:119px;">200-01A&#160;&#160;&#160;&#160;&#160;&#160;&#160;&#160;&#160;&#160;</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="22">
			<td height="22" style="height:23px;width:569px;">TNF-alpha</td>
			<td style="width:355px;">Peprotech</td>
			<td style="width:119px;">300-01A&#160;&#160;&#160;&#160;&#160;&#160;&#160;&#160;&#160;&#160;</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="22">
			<td height="22" style="height:23px;width:569px;">Interferon alpha A&#160;&#160;</td>
			<td style="width:355px;">R &#38; D Systems</td>
			<td style="width:119px;">11100-1</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="22">
			<td height="22" style="height:23px;width:569px;">Interferon beta</td>
			<td style="width:355px;">Peprotech</td>
			<td style="width:119px;">300-02BC</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="22">
			<td height="22" style="height:23px;width:569px;">Interferon gamma</td>
			<td style="width:355px;">Peprotech</td>
			<td style="width:119px;">300-02</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:569px;">Centrifuge 5415R</td>
			<td style="width:355px;">Eppendorf</td>
			<td style="width:119px;">5415R</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:569px;">Centrifuge 5810R</td>
			<td style="width:355px;">Eppendorf</td>
			<td style="width:119px;">5810R</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="32">
			<td height="32" style="height:33px;width:569px;">Nikon Eclipse Ti Immunofluorescence Microscope with Nikon Intenselight C-HGFI</td>
			<td style="width:355px;">Nikon</td>
			<td style="width:119px;">Visit Nikon for Request</td>
			<td></td>
		</tr>
	</tbody>
</table>

zika virus infectious cell culture system and the in vitro prophylactic effect of interferons

Zika 바이러스 (ZIKV)는 같은 소두증, 눈 결함 및 손상 성장으로 태아의 발달 이상에 연결되어 신흥 병원균이다. ZIKV는 플라 비비 리다 가족의 RNA 바이러스이다. ZIKV 주로 모기 전송뿐만 아니라 태아 수직 전송뿐만 아니라 성적 접촉을 모체로 확산 될 수있다. 현재까지 바이러스에 감염된 사람들을 보호하기 위해 가능한 신뢰할 수있는 치료 또는 예방 접종 옵션이 없습니다. 재현 효과 Zika 바이러스 감염 세포 배양 시스템의 개발 ZIKV 복제뿐만 아니라 약물과 백신 개발의 분자 메커니즘을 연구하는데 중요하다. 이와 관련하여, 바이러스의 생산 및 성장 분석을 위해 포유 동물 세포 기반 체외 Zika 바이러스 배양 시스템을 설명하기위한 프로토콜은 여기에보고된다. 바이러스 역가를 측정하는 세포 단층과 상패 분석​​에 Zika 바이러스에 의한 플라크의 형성에 대한 세부 사항이 표시됩니다. 바이러스 게놈 복제 속도론및 이중 가닥 RNA 게놈 replicatory 중간체가 결정된다. 이 문화 플랫폼은 인터페론 α (IFN-α)의 식별 결과 사이토 카인의 작은 세트의 라이브러리에 대해 화면으로 사용하고, IFN-β와 Zika 바이러스 성장의 강력한 억제제로 IFN-γ. 요약하면, 시험 관내 감염 Zika 바이러스 배양 시스템 및 각종 바이러스 학적 분석은 크게 더 바이러스 발병의 메커니즘과 바이러스 독성의 진화를 해명의 연구 커뮤니티에 도움이 할 수있는 잠재력을 가지고 본 연구에서 입증된다. 바이러스 IFN 알파는 또한 감염된 임산부 포함 고위험 인구 Zika 바이러스 감염에 대한 예방제, 노광 후 예방 및 치료 방법으로 평가 될 수있다.

Zika 바이러스 변형, 아시아 유전자형 (PRVABC59 GenBank 액 번호 KU501215)은이 연구 (12)에 이용되었다. 80 % 컨 플루 언시 베로 세포는 새로이 Zika 바이러스 감염을 연구에 사용 하였다. 바이러스 생산과 바이러스 학적 특성화 이후, 초기 통로 (P3) Zika 바이러스를 사용 하였다. 바이러스 플라크를 감염 둘째 날에 관찰되었다. 초기에 감염된 세포로부터 방출 Zika 바이러스 자손은 단층 배양 (도 2)에 보이는 플라크의 형성을 초래할 인접 세포로 확산 할 수있다. Zika 바이러스 감염의 세포 변성 효과 (CPE)는 같은 라운딩 및 분리 세포뿐만 아니라 용균 세포 사멸 등의 형태 학적 변화에 의해 특징입니다. 바이러스 역가를 측정하기 위해, T-160 플라스크에서 수확 한 바이러스 - 함유 세포가없는 상청액을 10-FOL시켰다D 용액을 희석하고 12- 웰 플레이트 형식으로 베로 세포 단층에 첨가 (도 3). 48 시간 후 접종 시점 이차 감염에서 발생하는 플라크를 카운팅 피하기 위해 엔드 포인트로서 사용 하였다. 30-100 반과 웰 정확한 역가를 구하는 계산을 위해 선택 하였다. RT-qPCR의 분석은 Zika 바이러스 게놈 복제를 추정하는데 사용 하였다. 고도 보존 ZIKV NS5 지역에 대한 특정 범 유전자형 프라이머 쌍은 3,16를 포함되었다. 팬 유전자형 프라이머의 게놈 위치에 따라 Zika 바이러스 변형 PRVABC59 특정 프라이머 (프라이머의 서열은 프로토콜 섹션 4.4.2에 제시되어있다) 또한 시험 하였다. 상기 프라이머 쌍은 모두 감염된 세포 (도 4)에서 Zika 바이러스 게놈의 증폭 감도 비슷한 수준을 나타내었다. 음성 대조군으로, C 형 간염 바이러스 - 특이 적 프라이머는 17을 시험 하였다. 중요한 증분ZIKV 바이러스 게놈의 콘텐츠 완화는 낮은 MOI는 강력한 바이러스 감염을 제안, 세포를 감염 높은 (그림 4)에서 모두 48과 96 시간의 시간 지점 사이에 관찰되었다. 플라 비 바이러스 게놈 복제하는 동안, 이중 가닥 (DS) RNA replicatory 중간체는 감각과 안티센스 게놈 RNA 사이베이스 쌍의 형성에 의해 생성된다. 구체적으로 인식 dsRNA에 대한 항체 검사는 바이러스에 감염된 세포 (그림 4)를 발견했습니다. dsRNA를 바이러스 게놈 복제 함이 제안 세포질 로컬 라이즈 하였다. 면역 세포 화학 염색은 48, 96 시간 시간 포인트 중 바이러스에 감염된 세포의 확장을 밝혔다. 감염성 바이러스 Zika 배양 시스템을 사용하여 사이토 카인의 작은 라이브러리 (도 5) 항 바이러스 활성을 결정하기 위해 선별 하였다. 세포를 12 시간 동안 다양한 사이토 카인으로 전처리 한 후 Zika 바이러스에 감염시켰다. 유형 I의 난<html> IFN-α nterferon는 시험 투여 량 [10 국제 단위 (IU) 100 IU 1,000 IU] 넓은 범위 Zika 바이러스에 대한 강력한 항 바이러스 활성을 나타냈다. IFN-β뿐만 아니라 강력한 억제 효과를 보여 주었다. 유형 II IFN-γ는 항 Zika에게 바이러스 활성을 보여 주었다. TNF-α는 IL-1 및 IL-6가 표시된 약물 농도 ZIKV을 억제하지 않았다 사이토킨. <img alt="그림 1" src="/files/ftp_upload/54767/54767fig1.jpg" /> 그림 1 :. Zika 바이러스 생산 및 분석 워크 플로우의 일반 개요 바이러스 생산의 경우는, ZIKV는 T-160 조직 배양 플라스크에 베로 세포에 접종한다. 48 또는 96 HPI에서 무 세포 바이러스 상등액을 수확하고 분석 하류 -80 ° C에 보관. 바이러스 역가 제한 희석 분석에 의해 측정된다. Zika 바이러스 접종 이후 바이러스 복제 속도론을 연구 및 약물 화합물을 스크리닝에 사용됩니다.= &quot;https://www-jove-com.remotexs.ntu.edu.sg/files/ftp_upload/54767/54767fig1large.jpg&quot;대상 = &quot;_ 빈&quot;HREF&gt;이 그림의 더 큰 버전을 보려면 여기를 클릭하십시오. <img alt="그림 3" src="/files/ftp_upload/54767/54767fig3.jpg" /> 도 3. Zika 바이러스 생산을 측정 플라크 분석 나이브 베로 세포는 바이러스 역가를 측정 하였다. 밝은 필드 이미지는 다양한 희석 (스케일 바 = 50 μm의)에서 바이러스 성 플라크의 밀도를 묘사한다. 참고 : 1 :. (100) 희석 이미지가 정확하게 계산 될 수있다 별개의 플라크를 보여줍니다 <a href="https://www-jove-com.remotexs.ntu.edu.sg/files/ftp_upload/54767/54767fig3large.jpg" target="_blank">이 그림의 더 큰 버전을 보려면 여기를 클릭하십시오.</a> <img alt="그림 4" src="/files/ftp_upload/54767/54767fig4.jpg" /> 그림 4 : Zika 바이러스 복제를 평가하기위한 시험 법. </strong&gt; (A) 그래프 RT-qPCR에 의해 측정 Zika 바이러스 게놈 내용을 보여줍니다. 모두 팬 유전자형 (ZIKV GEN)과 PRVABC59 - 변형 (ZIKV UNI)의 프라이머는 동일한 민감도와 특이도를 보였다. 예상대로, C 형 간염 바이러스 (HCV) 프라이머 제품을 증폭하지 않았다. (B) 그래프는 모의 감염되지 않은 대조군에 비해 낮고 높은 역가 감염된 세포의 표시된 시점에서 Zika 바이러스의 성장 동역학을 나타낸다. 평균 값과 표준 편차가 주어진다. 바이러스 복제를 조사하는 (C) 면역 세포 화학 분석. Zika 바이러스에 감염된 세포를 dsRNA에 특이 항체로 염색 하였다. 96 HPI에서 대부분의 셀이 감염되는 반면 HPI 48에 감염된 세포는 몇 클러스터에있다. 훽스트 얼룩은 핵의 시각화 (스케일 바 = 50 μm의)를 사용 하였다. BF :. 밝은 이미지 필드 <a href="https://www-jove-com.remotexs.ntu.edu.sg/files/ftp_upload/54767/54767fig4large.jpg" target="_blank">이 그림의 더 큰 버전을 보려면 여기를 클릭하십시오</a>. <img alt="그림 5" src="/files/ftp_upload/54767/54767fig5.jpg" /> 도 5 :. 인터페론은 강력한 항 바이러스 활성을 Zika 증명은 (A) 그래프 차량 제어에 비해 각종 사이토 카인에 의해 Zika 바이러스 성장의 조절을 도시. 평균값과 표준 편차를 막대 그래프에 도시되어있다. 인터페론은 Zika 바이러스 복제 (p 값 &lt;0.05)의 유의 한 억제를 보였다. (B 및 C) 또는 사이토 카인 처리없이 Zika 바이러스에 감염된 세포의 위상 콘트라스트 이미지. 감염된 세포에 의해 형성되는 바이러스 플라크를 초점으로 볼 수있다. 인터페론 처리 된 우물은 바이러스 성 플라크를 필요는 없습니다. ZIKV 감염없이 모의 제어는 음성 대조군을 포함했다. (스케일 바 = 50 μm의) <a href="https://www-jove-com.remotexs.ntu.edu.sg/files/ftp_upload/54767/54767fig5large.jpg" target="_blank">큰 보려면 여기를 클릭하십시오</a>이 그림의 버전입니다.

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Zika Virus Infectious Cell Culture System and the In Vitro Prophylactic Effect of Interferons

Zika Virus (ZIKV), an emerging pathogen, is linked to fetal developmental abnormalities and microcephaly. The establishment of an effective infectious cell culture system is crucial for studies of ZIKV replication as well as vaccine and drug development. In this study, various virological assays pertaining to ZIKV are illustrated and discussed.

Zika 바이러스 감염 세포 배양 시스템과<em&gt; 체외</em인터페론의&gt; 예방 효과

Zika Virus (ZIKV) is an emerging pathogen that is linked to fetal developmental abnormalities such as microcephaly, eye defects, and impaired growth. ZIKV ...

zika-virus-infectious-cell-culture-system-vitro-prophylactic-effect

Nanyang Technological University

Research

JoVE Journal

Immunology and Infection

Zika Virus Infectious Cell Culture System and the In Vitro Prophylactic Effect of Interferons

20.7K 조회수.  Cedars-Sinai Medical Center. Zika Virus (ZIKV), an emerging pathogen, is linked to fetal developmental abnormalities and microcephaly. The establishment of an effective infectious cell culture system is crucial for studies of ZIKV replication as well as vaccine and drug development. In this study, various virological assays pertaining to ZIKV are illustrated and discussed.

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Detection of Infectious Virus from Field-collected Mosquitoes by Vero Cell Culture Assay

Mosquitoes transmit a number of distinct viruses including important human pathogens such as West Nile virus, dengue virus, and chickungunya virus. Many of these viruses have intensified in their endemic ranges and expanded to new territories, necessitating effective surveillance and control programs to respond to these threats. One strategy to monitor virus activity involves collecting large numbers of mosquitoes from endemic sites and testing them for viral infection. In this article, we describe how to handle, process, and screen field-collected mosquitoes for infectious virus by Vero cell culture assay. Mosquitoes are sorted by trap location and species, and grouped into pools containing &le;50 individuals. Pooled specimens are homogenized in buffered saline using a mixer-mill and the aqueous phase is inoculated onto confluent Vero cell cultures (Clone E6). Cell cultures are monitored for cytopathic effect from days 3-7 post-inoculation and any viruses grown in cell culture are identified by the appropriate diagnostic assays. By utilizing this approach, we have isolated 9 different viruses from mosquitoes collected in Connecticut, USA, and among these, 5 are known to cause human disease. Three of these viruses (West Nile virus, Potosi virus, and La Crosse virus) represent new records for North America or the New England region since 1999. The ability to detect a wide diversity of viruses is critical to monitoring both established and newly emerging viruses in the mosquito population.

We describe a method to process and screen field-collected mosquitoes for a diversity of viruses by Vero cell culture assay. By employing this technique, we have detected 9 different viruses from 4 taxonomic families in mosquitoes collected in Connecticut.

베로 세포 배양 분석하여 필드 수집 모기에서 감염성 바이러스의 검출

Mosquitoes transmit a number of distinct viruses including important human pathogens such as West Nile virus, dengue virus, and chickungunya virus. Many ...

연구

면역학 및 감염병학

Visualizing Dengue Virus through Alexa Fluor Labeling

The early events in the interaction between virus and cell can have profound influence on the outcome of infection. Determining the factors 
that influence this interaction could lead to improved understanding of disease pathogenesis and thus influence vaccine or therapeutic design. Hence, the development 
of methods to probe this interaction would be useful. Recent advancements in fluorophores development1-3 and imaging technology4 can be exploited to 
improve our current knowledge on dengue pathogenesis and thus pave the way to reduce the millions of dengue infections occurring annually.

The enveloped dengue virus has an external scaffold consisting of 90 envelope glycoprotein (E) dimers protecting the nucleocapsid shell, 
which contains a single positive strand RNA genome5. The identical protein subunits on the virus surface can thus be labeled with an amine reactive dye and visualized 
through immunofluorescent microscopy. Here, we present a simple method of labeling of dengue virus with Alexa Fluor succinimidyl ester dye dissolved directly in a sodium 
bicarbonate buffer that yielded highly viable virus after labeling. There is no standardized procedure for the labeling of live virus and existing manufacturer&#x2019;s protocol 
for protein labeling usually requires the reconstitution of dye in dimethyl sulfoxide. The presence of dimethyl sulfoxide, even in minute quantities, can block 
productive infection of virus and also induce cell cytotoxicity6. The exclusion of the use of dimethyl sulfoxide in this protocol thus reduced this possibility. 
Alexa Fluor dyes have superior photostability and are less pH-sensitive than the common dyes, such as fluorescein and rhodamine2, making them ideal for 
studies on cellular uptake and endosomal transport of the virus. The conjugation of Alexa Fluor dye did not affect the recognition of labeled dengue 
virus by virus-specific antibody and its putative receptors in host cells7. This method could have useful applications in virological studies.

Taking advantage of the advancements in fluorophore development and imaging technology, a simple method of Alexa Fluor labeling of dengue virus was devised to visualize the early interactions between virus and cell.

알렉사 플루어 라벨링을 통해 뎅그열 바이러스를 떠올리

The early events in the interaction between virus and cell can have profound influence on the outcome of infection. Determining the factors 
that ...

A Primary Neuron Culture System for the Study of Herpes Simplex Virus Latency and Reactivation

Herpes simplex virus type-1 (HSV-1) establishes a life-long latent infection in peripheral neurons. This latent reservoir is the source of recurrent reactivation events that ensure transmission and contribute to clinical disease. Current antivirals do not impact the latent reservoir and there are no vaccines. While the molecular details of lytic replication are well-characterized, mechanisms controlling latency in neurons remain elusive. Our present understanding of latency is derived from in vivo studies using small animal models, which have been indispensable for defining viral gene requirements and the role of immune responses. However, it is impossible to distinguish specific effects on the virus-neuron relationship from more general consequences of infection mediated by immune or non-neuronal support cells in live animals. In addition, animal experimentation is costly, time-consuming, and limited in terms of available options for manipulating host processes. To overcome these limitations, a neuron-only system is desperately needed that reproduces the in vivo characteristics of latency and reactivation but offers the benefits of tissue culture in terms of homogeneity and accessibility.
Here we present an in vitro model utilizing cultured primary sympathetic neurons from rat superior cervical ganglia (SCG) (Figure 1) to study HSV-1 latency and reactivation that fits most if not all of the desired criteria. After eliminating non-neuronal cells, near-homogeneous TrkA+ neuron cultures are infected with HSV-1 in the presence of acyclovir (ACV) to suppress lytic replication. Following ACV removal, non-productive HSV-1 infections that faithfully exhibit accepted hallmarks of latency are efficiently established. Notably, lytic mRNAs, proteins, and infectious virus become undetectable, even in the absence of selection, but latency-associated transcript (LAT) expression persists in neuronal nuclei. Viral genomes are maintained at an average copy number of 25 per neuron and can be induced to productively replicate by interfering with PI3-Kinase / Akt signaling or the simple withdrawal of nerve growth factor1. A recombinant HSV-1 encoding EGFP fused to the viral lytic protein Us11 provides a functional, real-time marker for replication resulting from reactivation that is readily quantified. In addition to chemical treatments, genetic methodologies such as RNA-interference or gene delivery via lentiviral vectors can be successfully applied to the system permitting mechanistic studies that are very difficult, if not impossible, in animals. In summary, the SCG-based HSV-1 latency / reactivation system provides a powerful, necessary tool to unravel the molecular mechanisms controlling HSV1 latency and reactivation in neurons, a long standing puzzle in virology whose solution may offer fresh insights into developing new therapies that target the latent herpesvirus reservoir.

The protocol describes an efficient and reproducible model system to study herpes simplex virus type 1 (HSV-1) latency and reactivation. The assay employs homogenous sympathetic neuron cultures and allows for the molecular dissection of virus-neuron interactions using a variety of tools including RNA interference and expression of recombinant proteins.

헤르페스의 연구를위한 예비 신경 세포 문화 시스템은 바이러스 지연 및 재가입을 단순

Herpes simplex virus type-1 (HSV-1) establishes a life-long latent infection in peripheral neurons. This latent reservoir is the source of recurrent ...

In Vitro Analysis of Myd88-mediated Cellular Immune Response to West Nile Virus Mutant Strain Infection

An attenuated West Nile virus (WNV), a nonstructural (NS) 4B-P38G mutant, induced higher innate cytokine and T cell responses than the wild-type WNV in mice. Recently, myeloid differentiation factor 88 (MyD88) signaling was shown to be important for initial T cell priming and memory T cell development during WNV NS4B-P38G mutant infection. In this study, two flow cytometry-based methods &#8211; an in vitro T cell priming assay and an intracellular cytokine staining (ICS) &#8211; were utilized to assess dendritic cells (DCs) and T cell functions. In the T cell priming assay, cell proliferation was analyzed by flow cytometry following co-culture of DCs from both groups of mice with carboxyfluorescein succinimidyl ester (CFSE) - labeled CD4+ T cells of OTII transgenic mice. This approach provided an accurate determination of the percentage of proliferating CD4+ T cells with significantly improved overall sensitivity than the traditional assays with radioactive reagents. A microcentrifuge tube system was used in both cell culture and cytokine staining procedures of the ICS protocol. Compared to the traditional tissue culture plate-based system, this modified procedure was easier to perform at biosafety level (BL) 3 facilities. Moreover, WNV- infected cells were treated with paraformaldehyde in both assays, which enabled further analysis outside BL3 facilities. Overall, these in vitro immunological assays can be used to efficiently assess cell-mediated immune responses during WNV infection.

In Vitro Analysis of Myd88-mediated Cellular Immune Response to West Nile Virus Mutant Strain Infection

Two flow cytometry-based methods &#8211; an in vitro T cell priming assay and intracellular cytokine staining were utilized to measure antigen presenting capacity of dendritic cells and antigen-specific T cell responses to a West Nile virus mutant infection in mice.

웨스트 나일 바이러스 돌연변이 균주의 감염에에서 MyD88 매개 세포 면역 반응의 생체 외 분석

An attenuated West Nile virus (WNV), a nonstructural (NS) 4B-P38G mutant, induced higher innate cytokine and T cell responses than the wild-type WNV in ...

Neutrophil Isolation and Analysis to Determine their Role in Lymphoma Cell Sensitivity to Therapeutic Agents

Neutrophils are the most abundant (40% to 75%) type of white blood cells and among the first inflammatory cells to migrate towards the site of inflammation. They are key players in the innate immune system and play major roles in cancer biology. Neutrophils have been proposed as key mediators of malignant transformation, tumor progression, angiogenesis and in the modulation of the antitumor immunity; through their release of soluble factors or their interaction with tumor cells. To characterize the specific functions of neutrophils, a fast and reliable method is coveted for in vitro isolation of neutrophils from human blood. Here, a density gradient separation method is demonstrated to isolate neutrophils as well as mononuclear cells from the blood. The procedure consists of layering the density gradient solution such as Ficoll carefully above the diluted blood obtained from patients diagnosed with chronic lymphocytic leukemia (CLL), followed by centrifugation, isolation of mononuclear layer, separation of neutrophils from RBCsby dextran then lysis of residual erythrocytes. This method has been shown to isolate neutrophils &#8805; 90 % pure. To mimic the tumor microenvironment, 3-dimensional (3D) experiments were performed using basement membrane matrix such as Matrigel. Given the short half-life of neutrophils in vitro, 3D experiments with fresh human neutrophils cannot be performed. For this reason promyelocytic HL60 cells are differentiated along the granulocytic pathway using the differentiation inducers dimethyl sulfoxide (DMSO) and retinoic acid (RA). The aim of our experiments is to study the role of neutrophils on the sensitivity of lymphoma cells to anti-lymphoma agents. However these methods can be generalized to study the interactions of neutrophils or neutrophil-like cells with a large range of cell types in different situations.

Neutrophils are the most abundant type of white blood cells. The isolation of neutrophils from human blood by density gradient separation method and the differentiation of human promyelocytic (HL60) cells along the granulocytic pathway are described here; to test their role on sensitivity of lymphoma cells to anti-lymphoma agents.

호중구의 분리 및 분석 치료제에 림프종 세포 감도에서 자신의 역할을 확인하는 방법

Neutrophils are the most abundant (40% to 75%) type of white blood cells and among the first inflammatory cells to migrate towards the site of ...

Rescue and Characterization of Recombinant Virus from a New World Zika Virus Infectious Clone

Infectious cDNA clones allow for genetic manipulation of a virus, thus facilitating work on vaccines, pathogenesis, replication, transmission and viral evolution. Here we describe the construction of an infectious clone for Zika virus (ZIKV), which is currently causing an explosive outbreak in the Americas. To prevent toxicity to bacteria that is commonly observed with flavivirus-derived plasmids, we generated a two-plasmid system which separates the genome at the NS1 gene and is more stable than full-length constructs that could not be successfully recovered without mutations. After digestion and ligation to join the two fragments, full-length viral RNA can be generated by in vitro transcription with T7 RNA polymerase. Following electroporation of transcribed RNA into cells, virus was recovered that exhibited similar in vitro growth kinetics and in vivo virulence and infection phenotypes in mice and mosquitoes, respectively.

This protocol describes the recovery of infectious Zika virus from a two-plasmid infectious cDNA clone.

새로운 세계 Zika 바이러스 전염성 클론으로부터 재조합 바이러스의 구조 및 특성 규명

Infectious cDNA clones allow for genetic manipulation of a virus, thus facilitating work on vaccines, pathogenesis, replication, transmission and viral ...

Zika Virus Specific Diagnostic Epitope Discovery

High-density peptide microarrays allow screening of more than six thousand peptides on a single standard microscopy slide. This method can be applied for drug discovery, therapeutic target identification, and developing of diagnostics. Here, we present a protocol to discover specific Zika virus (ZIKV) diagnostic peptides using a high-density peptide microarray. A human serum sample validated for ZIKV infection was incubated with a high-density peptide microarray containing the entire ZIKV protein translated into 3,423 unique 15 linear amino acid (aa) residues with a 14-aa residue overlap printed in duplicate. Staining with different secondary antibodies within the same array, we detected peptides that bind to Immunoglobulin M (IgM) and Immunoglobulin G (IgG) antibodies present in serum. These peptides were selected for further validation experiments. In this protocol, we describe the strategy followed to design, process, and analyze a high-density peptide microarray.

In this protocol, we describe a technique to discover Zika virus specific diagnostic peptides using a high-density peptide microarray. This protocol can readly be adapted for other emerging infectious diseases.

Zika 바이러스 특정 진단 Epitope 발견

High-density peptide microarrays allow screening of more than six thousand peptides on a single standard microscopy slide. This method can be applied for ...

Rapid, Safe, and Simple Manual Bedside Nucleic Acid Extraction for the Detection of Virus in Whole Blood Samples

The rapid diagnosis of an infection is essential for the outbreak management, risk containment, and patient care. We have previously shown a method for the rapid bedside inactivation of the Ebola virus during blood sampling for safe nucleic acid (NA) tests by adding a commercial lysis/binding buffer directly into the vacuum blood collection tubes. Using this bedside inactivation approach, we have developed a safe, rapid, and simplified bedside NA extraction method for the subsequent detection of a virus in lysis/binding buffer-inactivated whole blood. The NA extraction is directly performed in the blood collection tubes and requires no equipment or electricity. 
After the blood is collected into the lysis/binding buffer, the contents are mixed by flipping the tube by hand, and the mixture is incubated for 20 min at room temperature. Magnetic glass particles (MGPs) are added to the tube, and the contents are mixed by flipping the collection tube by hand. The MGPs are then collected on the side of the blood collection tube using a magnetic holder or a magnet and a rubber band. The MGPs are washed three times, and after the addition of elution buffer directly into the collection tube, the NAs are ready for NA tests, such as qPCR or isothermal loop amplification (LAMP), without the removal of the MGPs from the reaction. The NA extraction method is not dependent on any laboratory facilities and can easily be used anywhere (e.g., in field hospitals and hospital isolation wards). When this NA extraction method is combined with LAMP and a portable instrument, a diagnosis can be obtained within 40 min of the blood collection.

Here, we present a protocol for the rapid virus nucleic acid extraction from the virus-inactivated whole blood. The extraction is performed directly in the blood collection tubes and requires no equipment or electricity. The method is not dependent on laboratory facilities and can be used anywhere (e.g., in field hospitals).

전체 혈액 샘플에서 바이러스의 검출, 안전, 신속 하 고 간단한 수동 침대 핵 산 추출

The rapid diagnosis of an infection is essential for the outbreak management, risk containment, and patient care. We have previously shown a method for ...

Evaluation of Zika Virus-specific T-cell Responses in Immunoprivileged Organs of Infected Ifnar1-/- Mice

The Zika virus (ZIKV) can induce inflammation in immunoprivileged organs (e.g., the brain and testis), leading to the Guillain-Barr&#233; syndrome and damaging the testes. During an infection with the ZIKV, immune cells have been shown to infiltrate into the tissues. However, the cellular mechanisms that define the protection and/or immunopathogenesis of these immune cells during a ZIKV infection are still largely unknown. Herein, we describe methods to evaluate the virus-specific T-cell functionality in these immunoprivileged organs of ZIKV-infected mice. These methods include a) a ZIKV infection and vaccine inoculation in Ifnar1-/- mice; b) histopathology, immunofluorescence, and immunohistochemistry assays to detect the virus infection and inflammation in the brain, testes, and spleen; c) the preparation of a tetramer of ZIKV-derived T-cell epitopes; d) the detection of ZIKV-specific T cells in the monocytes isolated from the brain, testes, and spleen. Using these approaches, it is possible to detect the antigen-specific T cells that have infiltrated into the immunoprivileged organs and to evaluate the functions of these T cells during the infection: potential immune protection via virus clearance and/or immunopathogenesis to exacerbate the inflammation. These findings may also help to clarify the contribution of T cells induced by the immunization against ZIKV.

Evaluation of Zika Virus-specific T-cell Responses in Immunoprivileged Organs of Infected Ifnar1-/- Mice

A protocol to evaluate antigen-specific T-cell responses in the immunoprivileged organs of the Ifnar1-/- murine model for the Zika virus (ZIKV) infection is described. This method is pivotal for investigating the cellular mechanisms of the protection and immunopathogenesis of ZIKV vaccines and is also valuable for their efficacy evaluation.

감염 된 Ifnar1/- 생쥐의 Immunoprivileged 장기에서 Zika 바이러스 관련 T 세포 응답의 평가

The Zika virus (ZIKV) can induce inflammation in immunoprivileged organs (e.g., the brain and testis), leading to the Guillain-Barr&#233; syndrome and ...

An Ex Vivo Chicken Primary Bursal-cell Culture Model to Study Infectious Bursal Disease Virus Pathogenesis

Infectious bursal disease virus (IBDV) is a birnavirus of economic importance to the poultry industry. The virus infects B cells, causing morbidity, mortality, and immunosuppression in infected birds. In this study, we describe the isolation of chicken primary bursal cells from the bursa of Fabricius, the culture and infection of the cells with IBDV, and the quantification of viral replication. The addition of chicken CD40 ligand significantly increased cell proliferation fourfold over six days of culture and significantly enhanced cell viability. Two strains of IBDV, a cell-culture adapted strain, D78, and a very virulent strain, UK661, replicated well in the ex vivo cell cultures. This model will be of use in determining how cells respond to IBDV infection and will permit a reduction in the number of infected birds used in IBDV pathogenesis studies. The model can also be expanded to include other viruses and could be applied to different species of birds.

An Ex Vivo Chicken Primary Bursal-cell Culture Model to Study Infectious Bursal Disease Virus Pathogenesis

Here we describe the isolation of chicken primary bursal cells from the bursa of Fabricius, the culture and infection of the cells with infectious bursal disease virus, and the quantification of viral replication.

Bursal 전염병 바이러스 병 인을 공부 하는 Ex Vivo 닭 기본 Bursal 세포 배양 모델

Infectious bursal disease virus (IBDV) is a birnavirus of economic importance to the poultry industry. The virus infects B cells, causing morbidity, ...