This work was supported by the Committee Technology and Innovation (CTI) Switzerland grant 14796-PFLS-LSCTI. MicroPost arrays were generously provided by MicroDuits GmbH.

Micropost 배열 1. 배양 세포 참고 : 모든 단계는 불임을 보장하기 위해 생물 안전 캐비닛에서 수행해야합니다. 여기에 지정된 볼륨은 T25 세포 배양 플라스크에 대한 것입니다. 세포 배양 배지 및 세포 레시피 파종 밀도 골암 세포주 HuO9 및 M132에 최적화되어있다. <ol><li> micropost 배열에 파종을위한 세포 배양을 준비합니다. <ol><li> 표준 광학 현미경에 배양 플라스크를 배치하여 세포 배양 품질을 검사한다. 세포가 덮여 얼마나 많은 문화 플라스크 바닥의 추정에 의한 전형적인 성장과 형태를 보여 있는지 확인합니다. 70 % -80 %의 범위는 건강한 성장 속도를 반영한​​다. 그들은 죽은 세포 및 / 또는 자란 문화를 대표로 세포를 부동의 양에주의를 기울이십시오. </li><li> 4 ㎖의 1X 인산염과 중간 및 세척을 제거하여 세포를 Trypsinize은 식염수 (PBS) 버퍼를 버퍼. 셀 때까지 실온에서 0.8 ㎖의 1X 트립신 / 에틸렌 디아민 테트라 아세트산 (EDTA)를 첨가하고, 배양약 2-4 분 소요 S를시키다. 현미경으로 프로세스를 확인하고 가끔 빠지을 지원하기 위해 조심스럽게 플라스크를 누릅니다. </li><li> 5 ml의 세포 배양 배지 (둘 베코 변형 이글 배지 (DMEM), 10 % 소 태아 혈청 (FBS와 / F12), 1 % 페니실린 / 스트렙 (PEN / 패 혈성)) 반응을 정지하고 가만히 잔여 세포를 씻어을 추가 플라스크의 바닥에. 그 후 균일 한 혼합물을 얻기 위해 상하 수회 현탁액을 피펫. 효과적인 빠지을 얻기 위해 플라스크의 원래의 성장 영역에서 모든 솔루션을 피펫해야합니다. </li><li> 15 ML 튜브에 세포 현탁액을 전송하고 3 분 동안 0.5 XG에서 테이블 상단 원심 분리기를 사용하여 원심 분리. </li><li> 상층 액을 제거하고 최대 피펫 팅에 의해 5 배 아래로 5 ml의 배지에서 세포 펠렛을 다시 일시 중지합니다. 그렇게하는 동안 거품의 발생을 방지해야합니다. </li><li> 셀 카운팅 챔버와 microsco 광을 사용하여 세포 농도를 결정PE. 세포 집합체에 대한 세포 계수 챔버에서 세포 현탁액을 확인하고 다음 실험을 위해 단지 하나의 세포를 가지고 확인합니다. 피펫은 세포를 분리 집계를 형성하기 위해 다시 여러 번 아래로 경향합니다. </li><li> 25,000 세포 / ml의 세포 용액을 얻기 위해 충분한 배지로 세포 현탁액을 희석. 밀폐 튜브를 수회 반전시킴으로써 잘 섞는다. </li></ol></li><li> 세포 파종을위한 micropost 배열을 준비합니다. 중요 참고 :이 잠재적 microposts를 손상시킬 수있는 직접적으로 불필요한 거품이 소개되어 특히, micropost 배열에 피펫하지 마십시오. 또한, micropost 배열이 결코 모세관 힘이 microposts의 붕괴로 이어질 발생하는 것으로 밖으로 건조하지 있는지 확인하십시오. <ol><li> 핀셋을 사용하여 12- 웰 플레이트의 웰에 직면하고 1 ㎖의 에탄올 (99 %)을 첨가하여 습윤 micropost 어레이 부착 유리 기판을 배치했다. 20 ~ 30 초 동안 실온에서 품어. </li><li> 에탄올을 희석잘 측에 약 1 ㎖의 멸균 탈 이온수 (DI 물)을 첨가하고 전사 피펫 또는 흡인 장치를 사용하여 약 1ml의 흡입에 의해 단계적. 이 단계에서 적어도 3 번 반복합니다. </li><li> 추가하고 약 1 ml의 흡입에 의해 같은 방식으로 PBS 버퍼와 DI-물을 교체합니다. 이 단계를 3 번​​ 반복합니다. </li><li> 추가하고 약 매체의 1 ml의 흡입에 의해 매체와 PBS 버퍼를 교체합니다. 이 단계를 3 번​​ 반복합니다. </li></ol></li><li> 각 준비 micropost 배열의 상단에 피펫 1 ml의 세포 용액 (25,000 세포). 멀티 웰 플레이트 닫고 인큐베이터로 전송 (CO 2 5 %, 37 ° C). 세포 부착 및 6 -7 시간 동안 microposts 위에 성장 보자. </li><li> 가벼운 현미경을 사용하여 때때로 접착 공정을 검사합니다. 세포의 대부분은 여러 microposts에 걸쳐 퍼져 나타납니다 있는지 확인합니다. </li></ol> 2. 고정 및 염색 세포 참고 : 모든 단계를하고여기에 주어진 볼륨은 12 웰 플레이트의 단일 잘위한 것입니다. 그것은 microposts의 붕괴가 발생합니다 액체의 흡인 후 우물에서 건조를 방지하기 위해 한 번에하지 더 열두 우물의 네 이상을 처리하는 것이 좋습니다. <ol><li> 우물에서 대기음 매체와 세척 세포를 1 ml의 PBS 버퍼로 2 배. 배양 동안 micropost 배열에 축적 된 세포 파편을 제거하고 죽은 세포를 분리 PBS로 세척하는 동안 부드러운 힘을 적용해야합니다. </li><li> 5 분 동안 0.5 ml의 3.7 % 완충 포르말린 용액으로 세포를 고정한다. </li><li> 1 ml의 멸균 탈 이온수와 micropost 배열 배를 세척하여 포름 알데히드 용액을 교체합니다. </li><li> 약 90 초 동안 (50 % 물, 40 % 에탄올 및 10 % 아세트산 0.05 % 쿠마시 브릴리언트 블루)와 색소 세포를 염색. 1 ml의 멸균 탈 이온수로 2 배 오프 초과 염색 액을 씻으십시오. 배열을 micropost 1 ml의 탈 이온수를 추가합니다. </li><li> 광학 현미경을 사용하여 염색 결과를 확인한다. 반복 T세포체가 가시화 되기에는 너무 희미 경우 그 단계를 염색. </li><li> 4 ° C에서 냉장고에 상단에 염색 된 세포에 저장 micropost 배열. 항상 물 속에서 그들을 유지하기 위해 확인합니다. </li></ol> 3. 세포 이미징 참고 : 4 단계는 무한 보정 광학없이 현미경에 적용됩니다. <ol><li> 고해상도 이미징을위한 얇은 유리 바닥 페트리 접시에 2 ml의 디 - 물을 추가합니다. </li><li> microposts면이 위를 향하도록하여 영상 접시에 핀셋을 사용하여 micropost 배열을 전송합니다. </li><li> 광학 현미경의 이동 무대에 영상 페트리 접시를 놓습니다. </li><li> 스케일 수가 유리 기판, 실리콘 엘라스토머와 위에 액체의 굴절률 부정합을 보상하기 위해, 광 경로를 따른 모든 재료의 전체 두께를 나타낸다까지 촬상에 사용 렌즈의 보정 링을 돌려. 이 microposts의 밝은 모습으로 이어질한다코어. </li><li> 다운 50 %, 조명 측에 조리개를 닫고 일반 명 시야 모드 활성화 광로에서 어떠한 위상차 링을 제거한다. </li><li> microposts가 관찰 들판을 가로 질러 수평 라인을 형성 micropost 배열을 맞 춥니 다. 시작점 (예를 들어, 왼쪽 상단)을 정의하고 다수의 이미지를 복용하는 동안 micropost 배열을 스캔 스테이지에서 페트리 접시 단계적으로 이동합니다. </li><li> 20 배 또는 40 배 목표를 사용하여 카메라의 최고 해상도 설정으로 모든 이미지를 가져 가라. 이미지의 중심에서 단일 세포를 목표로. </li><li> micropost 팁에 초점이 될 때까지 기판을 통해 Z 축을 따라 스윕. 현미경의 미세 조정 초점 휠을 사용하여 약 2 ~ 3 μm의에 대한 micropost 바닥에 초점을 향해 돌립니다. </li><li> (한 번에 하나의 촬상 파라미터 휩쓸고 하나의 어레이 부분의 테스트 이미지의 시리즈를 취함으로써 표준 촬상 확립 수순 예, 노출 시간,조리개 설정, 램프 설정 등). MechProfiler 이미지를 분석하고 빠르고 신뢰성있는 분석을위한 적절한 매개 변수 세트를 결​​정합니다. </li></ol> 오픈 소스 소프트웨어 &quot;MechProfiler&quot;4. ​​이미지 분석 주 : 모든 소프트웨어 기능은 마우스 왼쪽 버튼을 이용하여 포인팅 디바이스로 활성화 될 수있다. 그러나, 숙련 된 작업자가 양손 효율적인 이미지 처리를 가능하게하는 키보드의 좌측 절반으로 설계 문서화 단축 키를 사용한다. <ol><li> 이미지 분석 소프트웨어 MechProfiler를 시작하고 &quot;열기&quot;를 클릭하여 분석 할 필요가 이미지의 범위를 엽니 다. </li><li> 소프트웨어 개발자에 의해 주어진 &quot;설정&quot;섹션에 모든 매개 변수를 삽입합니다. 맞춤형 소프트웨어 매뉴얼 상세히 기재된 절차에 따라서 (즉, 형상 및 최소 임계 거리)를 구성해야 파라미터를 결정. </li><li> 이미지 분석의 - 한 - &quot;자르기&quot;를 사용하여 관심 영역에 자르기로 (클릭하고 마우스 버튼으로 드래그 누름). 그려진 사각형 안에 두 번 클릭하여이 작업을 완료합니다. </li><li> &quot;세포 윤곽을 그리기&quot;및 셀에 연결된 모든 microposts을 포함하여 도면에 대한 십자 커서를 사용을 클릭하여 각각의 눈에 보이는 세포 개요 하나씩을 표시. </li><li> &quot;취소 게시물&quot;을 클릭하여 원치 않는 microposts을 취소하고 그리기 십자 커서를 사용합니다. 이미지 섹션 외부의 셀에 속하거나 그 어떤 다른 이유가 아니라 관심의 세포에 의해 편향되는 모든 microposts을 묶습니다. </li><li> 소프트웨어 서브 루틴 마우스 클릭하여 &quot;무게 중심 찾기&quot;를 시작합니다. 바로 옆에 자신의 중앙에 붉은 십자가가 눈에 보이는 모든 microposts가 등록 될 때까지 &quot;무게 중심 찾기&quot;버튼에 필터 설정을 조정합니다. 필터 설정이 너무 경우가 너무 높은 경우, MU 낮은 microposts은 무시 될 것이다ltiple 위치는 하나의 micropost에 대해 표시됩니다. 분석 세션 동안 일정하게 설정 필터를 유지합니다. </li><li> 여러되거나 누락 micropost 위치와 무게 중심의 매뉴얼 편집 기능 &quot;수동 편집&quot;를 사용합니다. 클릭을 가로 질러 드래그하여 문제의 micropost을 선택하려면 마우스 크로스 헤어를 사용합니다. 사각형 내부를 두 번 클릭하고 자동으로 닫힙니다 확대 된 이미지 섹션에서 누락 된 빨간색 마커를 배치합니다. 이 그린 셀 개요를 벗어나면 이러한 micropost 폐기 진행하기 전에 (단계 4.5 참조). </li><li> 마우스 클릭으로 &quot;그리드 생성&quot;기능을 활성화하여 이상적인 micropost 그리드를 찾아보십시오. 위치 그린 셀 내부 윤곽선 블루 링으로 도시 진정한 micropost 헤드, 대응 확인. </li><li> 마우스 클릭으로 해당 &quot;마누엘 편집&quot;기능을 사용하여 필요한 셀 영역 내부에 잘못 그리드 메이커를 수정합니다. 한때의 micropost을 선택 십자선을 사용하여클릭을 가로 질러 드래그하여 estion. 나타나는 사각형 내부를 두 번 클릭하고 자동으로 닫힙니다 확대 된 이미지 섹션에서 누락 된 파란색 마커를 배치합니다. </li><li> micropost의 화상 부 내측 위치 및 생성 된 이상적 그리드 간의 차이에 기초하여 계산 된 편차 값들의 히스토그램을 얻기 위해 마우스 버튼을 클릭하여 &quot;계산 처짐&quot;를 사용. </li><li> &quot;저장&quot;에 마우스를 클릭하여 값의 테이블을 포함한 완전한 분석을 저장합니다. </li><li> &quot;보기 재설정&quot;편리 오른쪽 키보드 커서 키를 사용하여 수행 할 수 있습니다 &quot;다음 이미지&quot;에 다른 이미지 섹션 또는 마우스 클릭을 분석 클릭하거나 이미지 분석을 계속합니다. </li></ol> 5. 데이터 분석 - Mechanoprofiling <ol><li> 분석 된 이미지가있는 폴더에서 오피스 스프레드 시트 프로그램을 사용하여 파일 &quot;results.xls&quot;를 엽니 다. 그것은 알루미늄과 데이터를 포함분석 된 셀의 모든 micropost의 처짐 및 작업 (즉, 기판의 변형 에너지)와 같은 표준 파생 조치를 포함하여 L 계산 된 값. </li></ol>

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	<li>Sharma, R. I., Snedeker, J. G. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Biochemical+and+biomechanical+gradients+for+directed+bone+marrow+stromal+cell+differentiation+toward+tendon+and+bone.">Biochemical and biomechanical gradients for directed bone marrow stromal cell differentiation toward tendon and bone.</a> Biomaterials. 31 (30), 7695-7704 (2010).</li><li>Suresh, S. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Biomechanics+and+biophysics+of+cancer+cells.">Biomechanics and biophysics of cancer cells.</a> Acta Biomater. 3 (4), 413-438 (2007).</li><li>Bartalena, G., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=A+novel+method+for+assessing+adherent+single-cell+stiffness+in+tension:+design+and+testing+of+a+substrate-based+live+cell+functional+imaging+device.">A novel method for assessing adherent single-cell stiffness in tension: design and testing of a substrate-based live cell functional imaging device.</a> Biomed Microdevices. 13 (2), 291-301 (2011).</li><li>Tan, J. L., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Cells+lying+on+a+bed+of+microneedles:+An+approach+to+isolate+mechanical+force.">Cells lying on a bed of microneedles: An approach to isolate mechanical force.</a> PNAS. 100 (4), 1484-1489 (2003).</li><li>Akiyama, Y., Hoshino, T., Iwabuchi, K., Morishima, K. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Room+Temperature+Operable+Autonomously+Moving+Bio-Microrobot+Powered+by+Insect+Dorsal+Vessel+Tissue.">Room Temperature Operable Autonomously Moving Bio-Microrobot Powered by Insect Dorsal Vessel Tissue.</a> PloS ONE. 7 (7), (2012).</li><li>Biais, N., Ladoux, B., Higashi, D., So, M., Sheetz, M. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Cooperative+retraction+of+bundled+type+IV+pili+enables+nanonewton+force+generation.">Cooperative retraction of bundled type IV pili enables nanonewton force generation.</a> Plos Biology. 6 (4), 907-913 (2008).</li><li>Wuang, S. C., Ladoux, B., Lim, C. T. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Probing+the+Chemo-Mechanical+Effects+of+an+Anti-Cancer+Drug+Emodin+on+Breast+Cancer+Cells.">Probing the Chemo-Mechanical Effects of an Anti-Cancer Drug Emodin on Breast Cancer Cells.</a> Cell Mol Bioeng. 4 (3), 466-475 (2011).</li><li>Schoen, I., Hu, W., Klotzsch, E., Vogel, V. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Probing+Cellular+Traction+Forces+by+Micropillar+Arrays:+Contribution+of+Substrate+Warping+to+Pillar+Deflection.">Probing Cellular Traction Forces by Micropillar Arrays: Contribution of Substrate Warping to Pillar Deflection.</a> Nano Lett. 10 (5), 1823-1830 (2010).</li><li>Lemmon, C. A., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Shear+Force+at+the+Cell-Matrix+Interface:+Enhanced+Analysis+for+Microfabricated+Post+Array+Detectors.">Shear Force at the Cell-Matrix Interface: Enhanced Analysis for Microfabricated Post Array Detectors.</a> Mech Chem Biosyst. 2 (1), 1-16 (2005).</li><li>Lam, R. H. W., Weng, S. N., Lu, W., Fu, J. P. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Live-cell+subcellular+measurement+of+cell+stiffness+using+a+microengineered+stretchable+micropost+array+membrane.">Live-cell subcellular measurement of cell stiffness using a microengineered stretchable micropost array membrane.</a> Integr Biol-UK. 4 (10), 1289-1298 (2012).</li><li>Roure, O., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Force+mapping+in+epithelial+cell+migration.">Force mapping in epithelial cell migration.</a> PNAS. 102 (39), 14122-14122 (2005).</li><li>Papenburg, B. J., Rodrigues, E. D., Wessling, M., Stamatialis, D. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Insights+into+the+role+of+material+surface+topography+and+wettability+on+cell-material+interactions.">Insights into the role of material surface topography and wettability on cell-material interactions.</a> Soft Matter. 6 (18), 4377-4388 (2010).</li><li>Badique, F., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Directing+nuclear+deformation+on+micropillared+surfaces+by+substrate+geometry+and+cytoskeleton+organization.">Directing nuclear deformation on micropillared surfaces by substrate geometry and cytoskeleton organization.</a> Biomaterials. 34 (12), 2991-3001 (2013).</li><li>Sniadecki, N. J., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Magnetic+microposts+as+an+approach+to+apply+forces+to+living+cells.">Magnetic microposts as an approach to apply forces to living cells.</a> PNAS. 104 (37), 14553-14558 (2007).</li><li>Weng, R. H. W. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=A+silicone-based+stretchable+micropost+array+membrane+for+monitoring+live-cell+subcellular+cytoskeletal+response.">A silicone-based stretchable micropost array membrane for monitoring live-cell subcellular cytoskeletal response.</a> Lab Chip. 12, 731-740 (2012).</li><li>Desai, R. A., Yang, M. T., Sniadecki, N. J., Legant, W. R., Chen, C. S. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Microfabricated+Post-Array-Detectors+(mPADs):+an+Approach+to+Isolate+Mechanical+Forces.">Microfabricated Post-Array-Detectors (mPADs): an Approach to Isolate Mechanical Forces.</a> J Vis Exp. (8), e311 (2007).</li><li>Yang, M. T., Fu, J. P., Wang, Y. K., Desai, R. A., Chen, C. S. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Assaying+stem+cell+mechanobiology+on+microfabricated+elastomeric+substrates+with+geometrically+modulated+rigidity.">Assaying stem cell mechanobiology on microfabricated elastomeric substrates with geometrically modulated rigidity.</a> Nat Protoc. 6 (2), 187-213 (2011).</li><li>Sniadecki, N. J., Han, S. J., Ting, L. H., Feghhi, S. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Micropatterning+in+Cell+Biology.">Micropatterning in Cell Biology.</a> Methods in Cell Biol. 121, 61-73 (2014).</li></ol>

The lead author (NG) is co-founder of MicroDuits GmbH, the commercial supplier of the micropost arrays used in this study. No other authors have any potential conflicts of interest with this work.

이 작품은 실질적으로 진입 기술 및 실제적인 장벽을 낮춤으로써 견인 힘 현미경 분야의 발전을 추구한다. 이 장벽은 양측에서 온다. 가장 먼저 재현성 제조 및 실험적 micropost 배열을 의뢰하기 위해 극복해야 할 많은 비 사소한 기술적 문제가 있습니다. 전형적인 실험이 수백 또는 세포의 수천의 분석이 필요할 수 있습니다 염두에두고 - 둘째, 마찬가지로 적지 않은 단일 셀 힘의 신뢰할 수있는 반자동 분석이 필요하다. 전술 한 기술은 주민 엔지니어링 전문 지식이없는 세포 생물학 실험실 내에서 micropost 기반 견인 힘 현미경에 액세스 할 수 있도록하기 위해 개발되었습니다. 이 문서에 제시된 센서 및 분석 기술은 비전문가가 쉽게 정확하게 하나의 세포에 의해 가해지는 힘을 분석 할 수 있어야합니다. 그렇다 세포 생물학 (L)에 액세스로부터적어도 중급 밝은 필드 현미경 AB는 설명 방법은 몇 가지 추가 기술적 인 요소가 필요합니다. 여기에 대부분의 사용자는 기술의 힘과 다양성에도 불구하고, 심지어 제한된 경험을 가진 유효한 견인 힘 현미경 실험을 수행 할 수 있습니다. 그럼에도 불구하고 고려되어야 제시된 프로토콜의 세 가지 중요한 측면이있다. 첫째는 micropost 배열은 항상 붕괴 그 모세관 힘에 방지하기 위해 액체로 덮여 있는지 확인하는 것이 필요하다. 두 번째는 최선의 노출 시간, 아이리스의 조리개와 보정 링의 위치를​​ 변화시키면서 동일한 배열 위치의 일련의 이미지를 취함으로써 수행된다 micropost 취득한 화상에 대한 촬상 파라미터를 최적화 할 필요가있다. 그것은 micropost 팁에 대한 정확한 초점 평면을 찾는 것이 중요하며,이 형태는 센서 어레이의 작은 차원 깊이 주어진 경험을한다. 공개적으로 접근 가능한 이미지 분석 소프트웨어 MechProfiler의 discusse을 다운로드해야합니다 세 번째여기 거라고하는 상세한 사용자 매뉴얼 및 교육 예는 다운로드 사이트에서 구할 수 있습니다. 적합한 현미경 설정을 구성 할 수 있도록 수동으로 제공되는 예를 분석하는 소프트웨어를 사용 경험 한 후, 사용자는 촬상 설정에 시험 화상이 사용될 취해야한다. 얻어진 화상에 기초하여, 형상의 임계 값은 마찬가지로 최적화되어야한다. 단일 micropost 화상은 몇 시간 내에 (셀 수백 분석) 통계적으로 중요한 결과의 발생을 허용 관계없이 하나 이상의 셀을 포함하는지 여부의 오픈 소스 MechProfiler 소프트웨어를 사용하여 분 이내에 훈련 사용자에 의해 분석 될 수있다 . 일부 조정이 필요 다른 태양은 어떤 응용 세포 염색 과정의 최적화이다. 세포가 과도하게 묻은 경우 소프트웨어는 올바른 micropost의 위치 등록이 실패 할 수 있습니다. 염색이 너무 약한 경우, 다른 한편으로는 검출 할 수있는 사용자에 의해 더 많은 노력이 필요얇은 세포 돌기로 &quot;true&quot;로 세포의 윤곽이 누락 될 수 있습니다. 그러나, 세포 염색 및 배열 이미징 절차의 고정 프로토콜을 적용하여이 오류의 범위는 허용 가능한 낮은된다. 이 작업 동안 다른 세포 염색 절차 크리스탈 바이올렛, 트윈 20 또는 트리톤 X 또는 에오신를 추가하여 염료의 조합과 같은 계면 활성제의 존재하에 다양한 농도에 기초하여, 시험 하였다. 그럼에도 불구하고, 실험에서 실질적으로 변화 염색의 강도뿐만 아니라 안정성을 실험한다. 전술 한 바와 같이 브릴리언트 블루 G만을 사용은 여전히​​ 박형 전지 윤곽을 볼 수 있지만, 충분한 강도로 현상 된 형상 접근을 방해하지 않고 결합 허용 가능한 세포 얼룩 내성을 보여 주었다. 일반적으로 제시된 기술을 수정하는 옵션이 있습니다. 형광 현미경 염색 소기관으로 여기에 제시된 시야 기술을 조합함으로써, 예를 들어세포 역학의 맥락에서 기본 세포 프로세스에 대한 추가 정보를 제공 할 수있는 핵 또는 액틴 필라멘트 네트워크, 등을들 수있다. 또한, 사용한 장쇄 알킬 carboxycyanines (DII 또는 DIO) microposts 형광해진다. 14 그럼에도 불구하고,이 기술에서 각각의 표시 편차를 제어하는 것이 중요하다. 보충도 10 및 그림 11은 잠재적 인 함정을 설명한다. 거꾸로 현미경을 사용하여 녹색 형광 채널 (그림 10B와 10C)에서 쿠마 블루 G 염색 NIH 3T3 섬유 아세포의 세포 찍은 이미지는 잘못된 위치 분석 (그림 10E)로 이어지는 주요 micropost 기관이 아닌 자신의 팁을 제시한다. 셀 얼룩에 의한 형광 신호의 흡수로 인해 수 밝은 필드 모드 micropost 팁 몇 군데되지 않을 수 있습니다 (그림 10A)로 전환 한 후 다시 집중하기 위해 최선의 노력에도 불구하고. 이것은 IMA 대조적이다직립 현미경 (도 11B-11F)의 황색 형광 채널로 촬영 GES가 상기 복수 선명한 이미지는 Z 축을 따라 얻을 수있다. 여기에서 사용자는 이미지가 불량 편향 값을 호출 피할 micropost 바닥에 가까운 어딘가에 매우 팁 (도 11C)에 초점면으로 취하고되지 않도록 할 필요가있다. 그것은 micropost 분석 기술의 한계가 있다는 것을 또한 주목해야한다. 예를 들어, 검출 된 편차의 정확도는 광학 설치의 품질에 의존한다. 현미경은 종종 연결된 카메라의 감광도가 다수의 화소보다 더 높은 우선 순위를 갖는 형광 이미징을 위해 최적화된다. 당연히, 이것은 더 큰 픽셀 크기의 이미지로 이끈다. 또한,이 세포 돌기 기판 하단에 도달하면 명 시야 이미지를 결정할 수 있음을 유의해야한다. 그러나, 상업적 micropost 어레이는 촛점을 사용하여 테스트 하였다현미경 사용. 그것은 세포가 micropost 배열의 나머지 micropost 팁에만 접착을 촉진 아닌 바이너리 코팅을 받아 들일 것으로 보인다 것으로 나타났습니다. 또 다른 요인은 0.2 μm의 것으로 밝혀졌다 micropost 어레이의 위치 오차로부터 도출한다. 함께 2.8 윈 / μm의 주어진 스프링 상수이 0.6 윈의 힘 판독의 오류로 이어집니다. micropost 분석에 대한 또 다른 제약은 여러 셀에 의해 공유 microposts에서 적용 힘이 결정되지 않을 수 있다는 사실에서 유래. 따라서, 오직 고립 된 단일 세포를 분석 할 수있다. 제시된 프로토콜에 대한 특별한 제한은 신뢰할 수있는 결과를 얻기 위해 사용자에 대한 교육 일정량을 필요 민감한 형상 접근의 올바른 애플리케이션으로부터 유도한다. micropost 어레이는 수평 또는 관찰 영역의 가장자리를 따라 수직 라인을 형성하도록 정렬되는 것을 또한, 빠른 분석을 위해 사용자는 이미지를 취한다. DespitE 육각형 그리드 지오메트리 내의 microposts를 찾기위한 소프트웨어 알고리즘이보다 5 ° 오프 축 회전 각도에 의해 microposts의 촬상을 한정되지 않는다는 불완전한 microposts 후 리드를 함유하지 않고 어려운 화상 부분을 잘라낼 수 있도록 사실 &quot;그리드 생성&quot;기능의 실패에. 이러한 경우에 사용자는 micropost 위치를 분석하기 시작하기 전에 통합 회전 기능을 사용할 수있다. 설명 된 방법은 주로 두 골암 세포주 HuO9라는 부모 세포주, 및 M132 표시된 유래 높은 전이 라인의 특성을 적용 하였다. 이 문맥 백에 여섯 단세포 이미지 시야 모드에서 촬영하고 MechProfiler 소프트웨어를 사용하여 분석 하였다. 후속 데이터 마이닝은 부모 세포주 HuO9가 약간 더 힘을 발휘하고 일반적으로 전이성 세포주 M132에서 세포보다 세포 당 microposts을 커버 것으로 나타났다. 그러나 세포예상 결과 광범위한 기여 정착의 순간에서 세포주기의 다른 단계에 따라서 동기화되지 않았다. 24 시간까지의 기간에 걸쳐 라이브 셀 이미지를 취함으로써, 그것은 다른 사람이, 확산 차단을 마이그레이션하고 다른 속도 (보충 동영상 참조) 다시 마이그레이션 반면 확산 후 많은 세포가 초기 위치에 유지 한 것으로 나타났습니다. 이것은 셀의 기계적 프로필 종종 일정하지 및 세포 집단에 걸쳐 또는 현재 활동에 따라 단일 셀 내에서 크게 달라질 수 있음을 나타낸다. 또 다른 요인은 셀이 셀은 평탄면에 부착하고 미세한 단계로 이주 할 수 고전 TFM, 대조적 인 다른 micropost 도달 이산 마이그레이션 단계를 수행하도록 강요된다 micropost 배열에 해당 될 수있다. 그러나, 이러한 작은 단계를 분석하기 위해 매우 진보 m에 대한 액세스를 요구하는 초점 포인트의 밀착성 형광 이미지를 고려할 필요가있다icroscopes 매우 정교한 이미지 분석 소프트웨어. 그럼에도 불구하고, 큰 개체군 내의 기계적 프로필 분포는 여전히 종종 세포주의 특성을 정의한다. 따라서 다수의 셀의 특성을 가능하게 높은 처리량 방법이 필수적이다. 여기에 제시된 수동 이미징 프로세스 및 오픈 액세스 소프트웨어는 완전 자동 현미경 시스템에 확장을위한 큰 잠재력을 품고. 요약하면 강력한 견인 힘 현미경의 접근 방식은 표준 세포 생물학 실험실에서 쉽게 채용입니다 표시됩니다. 이미지 분석에 세포 파종에서 전체 워크 플로우는 간단하고 효과적이다. 여기에 설명 된 프로토콜이 완전히 기능하지만, 개선도 생균 촬상으로부터 이미지 시퀀스의 해석을 단순화 직교 레이아웃 및 개발 절차 micropost 어레이를 처리 할 수​​ 있도록 분석 알고리즘을 적응 진행 중이다. 뼈 암세포 리튬에 대한 결과와 문맥NES, 여기에 설명 된 방법은 이러한 분석법 골 암 환자로부터 생검 세포의 전이 잠재 성을 예측하기 위해 임상있게 예후 값을 보유 할 수 있는지 여부를 설정하기 위해 임상에서 생검 화면 셀에 사용될 수있다. 이러한 분석은 치료 전략에 영향을 미칠 것이다. 다른 잠재적 인 애플리케이션은 잠재적으로 약물의 효능 또는 독성을 수립을 지원하기 위해, 평활근 세포 또는 심근 세포와 같은 세포에 기계적 활성 시험 약학 적 활성 화합물에 관한 것이다.

- 기계에 민감한 세포 기반 분석은 역학 세포 생물학에서 재생할 수있는 중심적인 역할을 반영하는 다양한 애플리케이션으로, 부착 세포를 조사 할 수 있습니다. 이 애플리케이션은 세포 내 프로세스 또는 전체 셀 동작을 구동하는 기본 메커니즘에 초점을 맞추고있다. 한편, 예컨대 세포 외 매트릭스 조성물 또는 매트릭스 강성 같은 외부 환경 요인 극적 셀의 기계적 및 생물학적 반응에 영향을 미칠 수있다. (1) 같은 약학 적 활성 화합물의 많은 클래스의 사용 후에 관측 될 수 있고, 효과가있는 아르 종종 세포 배양 모델을 이용하여 특징으로한다. (2) 등의 골격 구조 및 기능의 변화와 관련된 세포 표현형으로 표시 변경을 유도 할 수 자발 또는 실험적으로 유도 된 유전자 돌연변이에 의한 것과 같은 다른 한편 유전자형 특성에서. (3)이 예는 많은 수의 몇 가지주제에있는 세포의 기계적 표현형 관련이며,이 모든 유용하게 micropost 배열로 조사되었다. 이 글을 쓰는 시점에서, 약 200 기사 세포 micropost 상호 작용을 설명하는 발표되었다. 이 작품은 micropost 편향 원칙의 이론적 인 측면뿐만 아니라 제조에 실제적인 지침을 설명합니다. 세포와 유연한 micropost 배열의 상호 작용을 설명하는 첫 번째 기사는 연속 부드러운 기판을 탄 등 nanonewton 규모의 세포 수축력을 추정하는 데 사용되는 고전적인 견인 힘 현미경 (TFM)과는 대조적으로 2003 년 4 탄 및 동료에 의해 ​​출판되었다. 실리콘 엘라스토머로 이루어지는 다수의 근접하게 이격 된 수직 빔을 사용하는 방법을 설명했다. 이 기술의 주요 장점은 두 가지 주요 기능에서 등장. 유지하면서 제 휴대 명백 기판의 강성을 변경하기 위해 하나의 유일한 micropost 치수를 변경해야달리 일정하므로, 표면 토폴로지 및 화학의 차이를 피하는 기판 조성물. 둘째 microposts는 이산 개별 초점 유착 정도의 힘과 공간 해상도로 분석 할 수 있습니다 및 표준 TFM에 의해 유사한 분석에 고유 한 분석 문제를 줄일 수있는 개별 스프링과 같은 역할을합니다. 오늘 micropost 배열에 대한 응용 프로그램의 범위는 크게 몇 하나의 셀에 대한 힘의 단지 매핑을 초과합니다. 예를 들어, 아키야마는 곤충 근육 탑재 자율 마이크로 로봇을 개발하기 위해서는, micropost 어레이 액츄에이터 방 애벌레로부터 격리 등쪽 혈관 조직의 사용을보고한다. (5) 그러나 microposts 대부분의 게시 된 응용 프로그램은 감염이나 암과 같은 질환의 연구에 초점을 맞추고있다. 예를 들어, micropost 어레이는 나이 세리아 gonorrh 번들의 타입 IV의 필리의 구동력 발생을 연구하기 위해 사용되어왔다. 신호 캐스케이드 감염 향상과 연관된 6 기타 세포 골격 타겟팅 약학 화합물로 처리 유방암 세포를 연구 microposts를 사용한 콜로니 OEA. 7 micropost 편향 종종 셀을 가정 단부 하중 고전 캔틸레버 빔 이론을 이용하여 설명하는 매우 micropost의 선단에 부착. 편향 δ 원인이 여기에 적용되는 힘 (F)은 micropost의 &quot;휨 강성&quot;K에 의존에 의해 계산된다 : <img alt="식 (1)" src="/files/ftp_upload/53350/53350eq1.jpg" /> (1) E, I, L 및 인 영률 각각 관성 빔 길이의 면적 모멘트. 기판 휨이 교류로 촬영되지 않습니다 그러나,이 방정식의 결과는 빔 전단 이후 작업뿐만 아니라 굴곡의 힘의 근사치를 제공카운트. microposts 전형적 폴리 디메틸 실록산 (PDMS)와 같은 부드러운 재료로 제조되는 것을 고려할 때 이러한 요소가 포함될 필요가 실리콘 고무 기반. . Schoen 외는 micropost (L / D) 및 해당 중합체의 포아송 비 (V)의 종횡비에 기초하여 이러한 교정 인자가 있다는 것을 증명 8 그것은로 주어진다. : <img alt="식 (2)" src="/files/ftp_upload/53350/53350eq2.jpg" /> (2) T 기울기는 (V) 동일한 문서에서 발견 될 수있는 피팅 파라미터 = 1.3를 포함 틸팅 계수되면서 : <img alt="식 (3)" src="/files/ftp_upload/53350/53350eq3.jpg" /> (3) 즉 micropost 보정의 강성 K CORR은 순수한 굽힘 강성 K = K 벤드의 생성물 및 보정 계수 CORR 의미주어진: <img alt="식 (4)" src="/files/ftp_upload/53350/53350eq4.jpg" /> (4) 따라서, 셀 력 계산 이제 판독 식 (1)의보다 정교한 변형을 사용하여 수행한다 : <img alt="식 (5)" src="/files/ftp_upload/53350/53350eq5.jpg" /> (5) 보정의 영향은 즉시 micropost 치수에 대한 일반적인 값을 사용으로 더 분명해진다. 예를 들면, 원형 단면과 PDMS 계 실리콘 고무로 만들어진 5 ㎛의 직경 15 마이크론 길이 micropost는 0.77의 보정 계수에 이르게하기 때문에 보정 전 계산은 23 %가 소비 된 전지의 힘을 과대 평가한다. 이것은 훨씬 더 심각한 작은 종횡비 microposts에 대한된다. 전통적으로, micropost 이미지 분석은 이상적인 빔 굽힘 이론에 근거하고있다. 2005 년 MICR의 사용을 개척 한 그룹opost 어레이 micropost 분석에 적합한 이미지 분석 소프트웨어를 발표 9 소프트웨어는 소프트웨어 라이센스가 필요하고 사용자가 각각의 위치에 대한 세 개의 이미지를 취한다.; 전송 모드와 스테인드 세포에 형광 모드에서 또 하나의 micropost의 상단과 하단면에서 한 각. 각각의 상부 및 하부 위치를 비교 한 후 소프트웨어가 힘 벡터 필드를 결정하고, 포스트 당 힘과 같은 관련 파라미터를 계산 micropost. 기타 소프트웨어 패키지는 존재와 그 분석의 원칙은 간단하게 그들을 설명하는 해당 기사에 언급되어 있지만, 이러한 분석 소프트웨어 패키지는 일반적으로 공개적으로 사용할 수 없습니다. (10, 11) 셀 매핑 힘을 위해 설계 micropost 어레이는 모든 이웃 microposts 사이의 등거리 간격 장점이 후자의 직교 micropost 레이아웃 또는 육각형 하나에 되로 분류 될 수있다. 일반적인 microposts 하원형 단면을 적이 그들의 사이즈 타원 또는 사각형 단면 microposts 또한보고되었다 그러나, 길이가 50 ㎛ 인 내지 1.0 μm의 직경이 10 ㎛ 내지 2. (4)를 배열한다. 12,13 micropost 재료로서 PDMS 기반 실리콘의 혼합물의 혼합물을 사용하는 나노 입자를 추가로 허용한다. 코발트 나노로드를 추가 예를 들어 micropost의 자기 활성화를 가능하게하고, 따라서 잠재적 인 실험 디자인에 자유의 또 다른 학위를 제공합니다. 14 대부분의 그룹은 커버 유리와 같은 또는 페트리 접시 내부 평면 딱딱한 기판 상에 자신의 micropost 배열을 생산하고 있습니다. 그러나 맨과 동료들은 최근에 신축 막에 형성된 micropost 배열을보고했다. 15 세포 수축성의 관점에서 라이브 셀 세포 내 동적 응답을 공부하는 동안이 부착 세포에 세포 스트레칭 힘의 응용 프로그램을 할 수 있습니다. 널리 사용되는 가장 맛 음료SU8 포토 레지스트를 이용하여 실리콘 웨이퍼 위에 마이크로 구조를 생성하는 데 사용되는 간단한 표준 클린 룸 공정에서 Sniadecki 동료. 16-18의 통찰력 프로토콜에 기재된 바와 같이 micropost 어레이 제작 오리스 공정은 소프트 리소그래피에 기초한다. 이것은 실리콘 고무 몰드로 이송 구조 위에 캐스팅 된 상기 복사 프로세스가 이어진다. 제 2 단계에서, 이들 몰드 선택된 기판 위에 실리콘 고무를 사용하여 초기 미세 구조를 복제하기 위해 사용된다. 그러나 microposts위한 제조 공정을 확립 그들의 애플리케이션과 관련된 서적의 큰 증가에도 불구하고 마이크로 공학 전문가에도 상당한 시간이 소요; 허용 가능한 품질 레벨을 산출하기 위해 특정 테스트 환경과 micropost 레이아웃 최적화 및 적응을 필요로하는 많은 공정 단계가있다. 상업 micropost 배열은 준비-T에 사용할 수 있습니다지속적으로 높은 품질의 오 사용 ( &quot;기성&quot;) 형식입니다. 따라서 그들은 현장 생산에 필요한 복잡하고 긴 제조 공정에 대한 대안이다. 이 논문에서 시판 micropost 어레이는 단일 시야 현미경 이미지를 사용하여 셀룰러 힘을 매핑하는데 사용 하였다. 더 중요한이 문서에서는이 원고에 대한 보충 자료 등을 다운로드 할 수 있습니다 MechProfiler라는 이름의 완전한 기능을 오픈 소스 소프트웨어를 설명합니다. 소프트웨어 적극적 유지 버전도 http://www.orthobiomech.ethz.ch에서 찾을 수있다. &quot;기성품&quot;분석과 호환 오픈 소스 분석 소프트웨어의 조합은 현저히 TFM 정확한 실험을 달성하기 엔트리 장애물을 낮춘다. 클린 룸 시설이나 소프트웨어 개발 전문 중 하나에 대한 액세스 권한이없는 연구원은 성공적으로 세포의 힘을 분석 할 수 있습니다. 이 메케에 초점을 사용자로 하여금ensitivity 분석 출력보다는 기술 자체, 및 더 넓은 지역에 사용할 견인력을 측정한다. 또한, 이것은 micropost 어레이 전자동 스크리닝 향해 방법을 포장하는 중요한 단계이다. MechProfiler 분석 소프트웨어는 파일 형식 TIFF, PNG, BMP와 JPG의 이미지를 처리​​합니다. 이미지는 형광, 위상차 또는 밝은 장광 현미경을 사용하여 수행 될 수있다. 독립 실행 형 프로그램은 (이용 가능한 그림 12) 무료 matlab에 컴파일러 런타임과 함께 실행하고 기본 알고리즘은 약 1 분에 하나 또는 여러 개의 세포와 이미지를 처리하는 사용자 수 있도록 효율적인 이미지 처리를 위해 수 있습니다. 또한, 이들 세포 중 살아있는되거나 &quot;고정&quot;. MechProfiler 소프트웨어 크게 상업용 품질 micropost 어레이의 재현성에 의존하여 데이터 분석 처리량을 증가시킬 수있다, 구체적으로는, 기본 및 #8220은 비 - 편향 &quot;배열의 각 포스트의 위치가 이상적 그리드에 대해 추정 될 수있다 (본 연구에 사용 된 배열에서 그리드 제조 편차를 100nm 이하였다). 단 하나의 관심 영역에 작물, 분석 용 이미지 파일의 선택이 열리면 세포에 의해 덮여 게시물을 정의되거나 또는 폐기해야하는 사후 위치를 결정하고, 편향 / 이상적 그리드에 대해 힘을 산출하고, 최종적으로 표준 Office 스프레드 시트에 포함, 수출 가능성을 가진 모든 세포 관련 데이터를 저장합니다.

<table border="0" cellpadding="0" cellspacing="0">
	<tbody>
		<tr>
			<td>T25 cell culture flasks</td>
			<td>Nunc</td>
			<td>156367</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>1x PBS-buffer</td>
			<td>Sigma</td>
			<td>D8537</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>0.5% Trypsin-EDTA</td>
			<td>Life Technologies</td>
			<td>15400054</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Medium DMEM/F12</td>
			<td>Sigma</td>
			<td>D8437</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>FBS South America</td>
			<td>Life Technologies</td>
			<td>10270106</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Penicillin-Streptomycin 100x</td>
			<td>Sigma</td>
			<td>P4333</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>15 ml centrifuge vials</td>
			<td>Sarstedt</td>
			<td>62.554.502&#160;</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Micropost array&#160;</td>
			<td rowspan="2">MicroDuits</td>
			<td rowspan="2">MPA-col1/FN</td>
			<td>Micropost dimensions:</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>pre-coated with Collagen I/Fibronectin</td>
			<td>&#216;= 6.4 &#181;m, l=18.2 &#181;m; grid=&#160;13 &#181;m, kcorr= 2.87 nN/&#181;m</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Ethanol abs p.A.</td>
			<td>Merck</td>
			<td>100.983</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>12-well plate</td>
			<td>Nunc</td>
			<td>150628</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Formalin solution, neutral buffered 10%</td>
			<td>Sigma</td>
			<td>HT5011</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Brilliant Blue G-250</td>
			<td>Sigma</td>
			<td>27815</td>
			<td>Coomassie blue</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Methanol ACS p.A.</td>
			<td>Merck</td>
			<td>1.06009</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Acetic acid</td>
			<td>Sigma</td>
			<td>695092</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Glass bottom dish</td>
			<td>WillCo Wells BV</td>
			<td>GWSb-3522</td>
			<td>35 mm diameter, aperture 22&#160;mm</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>T-100 Eclipse</td>
			<td>Nikon</td>
			<td>n/a</td>
			<td>Inverted microscope</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>D3-L3</td>
			<td>Nikon</td>
			<td>n/a</td>
			<td>Camera controler</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>DS Fi2</td>
			<td>Nikon</td>
			<td></td>
			<td>Camera</td>
		</tr>
	</tbody>
</table>

easy and accurate mechano-profiling on micropost arrays

Cell culture substrates with integrated flexible microposts enable a user to study the mechanical interactions between cells and their immediate surroundings. Particularly, cell-substrate interactions are the main interest. Today micropost arrays are a well-characterized and established method with a broad range of applications that have been published over the last decade. However, there seems to be a reservation among biologists to adapt the technique due to the lengthy and challenging process of micropost manufacture along with the lack of easily approachable software for analyzing images of cells interacting with microposts. 
The force read-out from microposts is surprisingly easy. A micropost acts like a spring with the cell ideally attached at its tip. Depending on size a cell applies force from its cytoskeleton through one or multiple focal adhesion points to the micropost, thus deflecting the micropost. The amount of deflection correlates directly to the applied force in direction and in magnitude. The number of microposts covered by a cell and the post deflection patterns are characteristic and allow determination of values like force per post and many biologically relevant parameters that allow &#8220;mechano-profiling&#8221; of cell phenotypes.
A convenient method for mechano-profiling is described here combining the first generation of ready-to-use commercially available microposts with an in-house developed software package that is now accessible to all researchers. As a demonstration of typical application, single images of bone cancer cells were taken in bright-field microscopy for mechano-profiling of cell line models of metastasis. This combination of commercial traction force sensors and open source software for analysis allows for the first time a rapid implementation of the micropost array technique into routine lab work done by non-expert users. Furthermore, a robust and streamlined analysis process enables a user to analyze a large number of micropost images in a highly time-efficient manner.

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Easy and Accurate Mechano-profiling on Micropost Arrays

Described are protocols for quantifying mechanical interactions between adherent cells and microstructured substrates. These interactions are closely linked to essential cell behaviors including migration, proliferation, differentiation, and apoptosis. The protocols present an open-source image analysis software called MechProfiler, which enables determination of involved forces for each micropost.

Micropost 배열에 쉽고 정확한 - 기계 프로파일

Cell culture substrates with integrated flexible microposts enable a user to study the mechanical interactions between cells and their immediate ...

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Nanyang Technological University

Research

JoVE Journal

Bioengineering

11.1K 조회수.  Balgrist University Hospital. Described are protocols for quantifying mechanical interactions between adherent cells and microstructured substrates. These interactions are closely linked to essential cell behaviors including migration, proliferation, differentiation, and apoptosis. The protocols present an open-source image analysis software called MechProfiler, which enables determination of involved forces for each micropost. 

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Studying Cell Rolling Trajectories on Asymmetric Receptor Patterns

Lateral displacement of cells orthogonal to a flow stream by rolling on asymmetric receptor patterns presents an opportunity for development of new devices for label-free separation and analysis of cells1. Such devices may use lateral displacement for continuous-flow separation, or receptor patterns that modulate adhesion to distinguish between different cell phenotypes or levels of receptor expression. Understanding the nature of cell rolling trajectories on receptor-patterned substrates is necessary for engineering of the substrates and design of such devices.
Here, we demonstrate a protocol for studying cell rolling trajectories on asymmetric receptor patterns that support cell rolling adhesion2. Well-defined, &mu;m-scale patterns of P-selectin receptors were fabricated using microcontact printing on gold-coated slides that were incorporated in a flow chamber. HL60 cells expressing the PSGL-1 ligand 3were flowed across a field of patterned lines and visualized on an inverted bright field microscope. The cells rolled and tracked along the inclined edges of the patterns, resulting in lateral deflection1. Each cell typically rolled for a certain distance along the pattern edges (defined as the edge tracking length), detached from the edge, and reattached to a downstream pattern. Although this detachment makes it difficult to track the entire trajectory of a cell from entrance to exit in the flow chamber, particle-tracking software was used to analyze and yield the rolling trajectories of the cells during the time when they were moving on a single receptor-patterned line. The trajectories were then examined to obtain distributions of cell rolling velocities and the edge tracking lengths for each cell for different patterns.
This protocol is useful for quantifying cell rolling trajectories on receptor patterns and relating these to engineering parameters such as pattern angle and shear stress. Such data will be useful for design of microfluidic devices for label-free cell separation and analysis.

We describe a protocol to observe and analyze cell rolling trajectories on asymmetric receptor-patterned substrates. The resulting data are useful for engineering of receptor-patterned substrates for label-free cell separation and analysis.

비대칭 수용체 패턴에 셀 롤링의 탄도를 공부

Lateral displacement of cells orthogonal to a flow stream by rolling on asymmetric receptor patterns presents an opportunity for development of new ...

연구

생체공학

High efficiency, Site-specific Transfection of Adherent Cells with siRNA Using Microelectrode Arrays (MEA)

The discovery of RNAi pathway in eukaryotes and the subsequent development of RNAi agents, such as siRNA and shRNA, have achieved a potent method for silencing specific genes1-8 for functional genomics and therapeutics. A major challenge involved in RNAi based studies is the delivery of RNAi agents to targeted cells. Traditional non-viral delivery techniques, such as bulk electroporation and chemical transfection methods often lack the necessary spatial control over delivery and afford poor transfection efficiencies9-12. Recent advances in chemical transfection methods such as cationic lipids, cationic polymers and nanoparticles have resulted in highly enhanced transfection efficiencies13. However, these techniques still fail to offer precise spatial control over delivery that can immensely benefit miniaturized high-throughput technologies, single cell studies and investigation of cell-cell interactions. 
Recent technological advances in gene delivery have enabled high-throughput transfection of adherent cells14-23, a majority of which use microscale electroporation. Microscale electroporation offers precise spatio-temporal control over delivery (up to single cells) and has been shown to achieve high efficiencies19, 24-26. Additionally, electroporation based approaches do not require a prolonged period of incubation (typically 4 hours) with siRNA and DNA complexes as necessary in chemical based transfection methods and lead to direct entry of naked siRNA and DNA molecules into the cell cytoplasm. As a consequence gene expression can be achieved as early as six hours after transfection27. Our lab has previously demonstrated the use of microelectrode arrays (MEA) for site-specific transfection in adherent mammalian cell cultures17-19. In the MEA based approach, delivery of genetic payload is achieved via localized micro-scale electroporation of cells. An application of electric pulse to selected electrodes generates local electric field that leads to electroporation of cells present in the region of the stimulated electrodes. The independent control of the micro-electrodes provides spatial and temporal control over transfection and also enables multiple transfection based experiments to be performed on the same culture increasing the experimental throughput and reducing culture-to-culture variability. 
Here we describe the experimental setup and the protocol for targeted transfection of adherent HeLa cells with a fluorescently tagged scrambled sequence siRNA using electroporation. The same protocol can also be used for transfection of plasmid vectors. Additionally, the protocol described here can be easily extended to a variety of mammalian cell lines with minor modifications. Commercial availability of MEAs with both pre-defined and custom electrode patterns make this technique accessible to most research labs with basic cell culture equipment.

High efficiency, Site-specific Transfection of Adherent Cells with siRNA Using Microelectrode Arrays MEA

The article details the protocol for site-specific transfection of scrambled sequence of siRNA in an adherent mammalian cell culture using a microelectrode array (MEA).

Microelectrode 배열을 사용하여 siRNA와 자기편 세포의 높은 효율, 특정 사이트 Transfection (MEA)

The discovery of RNAi pathway in eukaryotes and the subsequent development of RNAi agents, such as siRNA and shRNA, have achieved a potent method for ...

Sealable Femtoliter Chamber Arrays for Cell-free Biology

Cell-free systems provide a flexible platform for probing specific networks of biological reactions isolated from the complex resource sharing (e.g., global gene expression, cell division) encountered within living cells. However, such systems, used in conventional macro-scale bulk reactors, often fail to exhibit the dynamic behaviors and efficiencies characteristic of their living micro-scale counterparts. Understanding the impact of internal cell structure and scale on reaction dynamics is crucial to understanding complex gene networks. Here we report a microfabricated device that confines cell-free reactions in cellular scale volumes while allowing flexible characterization of the enclosed molecular system. This multilayered poly(dimethylsiloxane) (PDMS) device contains femtoliter-scale reaction chambers on an elastomeric membrane which can be actuated (open and closed). When actuated, the chambers confine Cell-Free Protein Synthesis (CFPS) reactions expressing a fluorescent protein, allowing for the visualization of the reaction kinetics over time using time-lapse fluorescent microscopy. Here we demonstrate how this device may be used to measure the noise structure of CFPS reactions in a manner that is directly analogous to those used to characterize cellular systems, thereby enabling the use of noise biology techniques used in cellular systems to characterize CFPS gene circuits and their interactions with the cell-free environment.

A microfabricated device with sealable femtoliter-volume reaction chambers is described. This report includes a protocol for sealing cell-free protein synthesis reactants inside these chambers for the purpose of understanding the role of crowding and confinement in gene expression.

무 세포 생물학 밀봉 Femtoliter 상공 회의소 배열

Cell-free systems provide a flexible platform for probing specific networks of biological reactions isolated from the complex resource sharing (e.g., ...

Ligand Nano-cluster Arrays in a Supported Lipid Bilayer

Currently there is considerable interest in creating ordered arrays of adhesive protein islands in a sea of passivated surface for cell biological studies. In the past years, it has become increasingly clear that living cells respond, not only to the biochemical nature of the molecules presented to them but also to the way these molecules are presented. Creating protein micro-patterns is therefore now standard in many biology laboratories; nano-patterns are also more accessible. However, in the context of cell-cell interactions, there is a need to pattern not only proteins but also lipid bilayers. Such dual proteo-lipidic patterning has so far not been easily accessible. We offer a facile technique to create protein nano-dots supported on glass and propose a method to backfill the inter-dot space with a supported lipid bilayer (SLB). From photo-bleaching of tracer fluorescent lipids included in the SLB, we demonstrate that the bilayer exhibits considerable in-plane fluidity. Functionalizing the protein dots with fluorescent groups allows us to image them and to show that they are ordered in a regular hexagonal lattice. The typical dot size is about 800 nm and the spacing demonstrated here is 2 microns. These substrates are expected to serve as useful platforms for cell adhesion, migration and mechano-sensing studies.

We present a protocol to functionalize glass with nanometric protein patches surrounded by a fluid lipid bilayer. These substrates are compatible with advanced optical microscopy and are expected to serve as platform for cell adhesion and migration studies.

지원되는 지질 이중층에 리간드 나노 클러스터의 배열

Currently there is considerable interest in creating ordered arrays of adhesive protein islands in a sea of passivated surface for cell biological ...

Biological Compatibility Profile on Biomaterials for Bone Regeneration

Large non-union bone fractures are a significant challenge in orthopedic surgery. Although auto- and allogeneic bone grafts are excellent for healing such lesions, there are potential complications with their use. Thus, material scientists are developing synthetic, biocompatible biomaterials to overcome these problems. In this study, we present a multidisciplinary platform for evaluating biomaterials for bone repair. We combined expertise from bone biology and immunology to develop a platform including in vitro osteoclast (OC) and osteoblast (OB) assays and in vivo mouse models of bone repair, immunogenicity, and allergenicity. We demonstrate how to perform the experiments, summarize the results, and report on biomaterial biocompatibility. In particular, we tested OB viability, differentiation, and mineralization and OC viability and differentiation in the context of &#946;-tricalcium phosphate (&#946;-TCP) disks. We also tested a &#946;-TCP/Collagen (&#946;-TCP/C) foam which is a commercially available material used clinically for bone repair in a critical-sized calvarial bone defect mouse model to determine the effects on the early phase of bone healing. In parallel experiments, we evaluated immune and allergic responses in mice. Our approach generates a biological compatibility profile of a bone biomaterial with a range of parameters necessary for predicting the biocompatibility of biomaterials used for bone healing and repair in patients.

The number of novel biomaterials engineered for repairing large bone lesions is continuously expanding with the aim to enhance bone healing and overcome the complications associated with bone transplantation. Here, we present a multidisciplinary strategy for pre-clinical biocompatibility testing of biomaterials for bone repair.

뼈 재생을 위해 생체에서 생물학적 호환성 프로필

Large non-union bone fractures are a significant challenge in orthopedic surgery. Although auto- and allogeneic bone grafts are excellent for healing such ...

Interfacing Microfluidics with Microelectrode Arrays for Studying Neuronal Communication and Axonal Signal Propagation

Microelectrode arrays (MEAs) are widely used to study neuronal function in vitro. These devices allow concurrent non-invasive recording/stimulation of electrophysiological activity for long periods. However, the property of sensing signals from all sources around every microelectrode can become unfavorable when trying to understand communication and signal propagation in neuronal circuits. In a neuronal network, several neurons can be simultaneously activated and can generate overlapping action potentials, making it difficult to discriminate and track signal propagation. Considering this limitation, we have established an in vitro setup focused on assessing electrophysiological communication, which is able to isolate and amplify axonal signals with high spatial and temporal resolution. By interfacing microfluidic devices and MEAs, we are able to compartmentalize neuronal cultures with a well-controlled alignment of the axons and microelectrodes. This setup allows recordings of spike propagation with a high signal-to-noise ratio over the course of several weeks. Combined with specialized data analysis algorithms, it provides detailed quantification of several communication related properties such as propagation velocity, conduction failure, firing rate, anterograde spikes, and coding mechanisms.
This protocol demonstrates how to create a compartmentalized neuronal culture setup over substrate-integrated MEAs, how to culture neurons in this setup, and how to successfully record, analyze and interpret the results from such experiments. Here, we show how the established setup simplifies the understanding of neuronal communication and axonal signal propagation. These platforms pave the way for new in vitro models with engineered and controllable neuronal network topographies. They can be used in the context of homogeneous neuronal cultures, or with co-culture configurations where, for example, communication between sensory neurons and other cell types is monitored and assessed. This setup provides very interesting conditions to study, for example, neurodevelopment, neuronal circuits, information coding, neurodegeneration and neuroregeneration approaches.

This protocol aims to demonstrate how to combine in vitro microelectrode arrays with microfluidic devices for studying action potential transmission in neuronal cultures. Data analysis, namely the detection and characterization of propagating action potentials, is performed using a new advanced, yet user-friendly and freely available, computational tool.

Microelectrode 배열 마이크로 신경 통신 및 Axonal 신호 전파 공부에 대 한 인터페이스

Microelectrode arrays (MEAs) are widely used to study neuronal function in vitro. These devices allow concurrent non-invasive recording/stimulation of ...

Human iPSC-Derived Cardiomyocyte Networks on Multiwell Micro-electrode Arrays for Recurrent Action Potential Recordings

Cardiac safety screening is of paramount importance for drug discovery and therapeutics. Therefore, the development of novel high-throughput electrophysiological approaches for hiPSC-derived cardiomyocyte (hiPSC-CM) preparations is much needed for efficient drug testing. Although multielectrode arrays (MEAs) are frequently employed for field potential measurements of excitable cells, a recent publication by Joshi-Mukherjee and colleagues described and validated its application for recurrent action potential (AP) recordings from the same hiPSC-CM preparation over days. The aim here is to provide detailed step-by-step methods for seeding CMs and for measuring AP waveforms via electroporation with high precision and a temporal resolution of 1 &#181;s. This approach addresses the lack of easy-to-use methodology to gain intracellular access for high-throughput AP measurements for reliable electrophysiological investigations. A detailed work flow and methods for plating of hiPSC-CMs on multiwell MEA plates are discussed emphasizing critical steps wherever relevant. In addition, a custom-built MATLAB script for rapid data handling, extraction and analysis is reported for comprehensive investigation of the waveform analysis to quantify subtle differences in morphology for various AP duration parameters implicated in arrhythmia and cardiotoxicity.

This article contains a set of protocols for the development of human induced pluripotent stem cell-derived cardiomyocyte (hiPSC-CM) networks cultured on multiwell MEA plates to reversibly electroporate the cell membrane for action potential measurements. High-throughput recordings are obtained from the same cell sites repeatedly over days.

재발 동작 전위 기록을 위한 멀티웰 마이크로 전극 어레이의 인간 iPSC 유래 심근구 네트워크

Cardiac safety screening is of paramount importance for drug discovery and therapeutics. Therefore, the development of novel high-throughput ...

Fabrication of Ti3C2 MXene Microelectrode Arrays for In Vivo Neural Recording

Implantable microelectrode technologies have been widely used to elucidate neural dynamics at the microscale to gain a deeper understanding of the neural underpinnings of brain disease and injury. As electrodes are miniaturized to the scale of individual cells, a corresponding rise in the interface impedance limits the quality of recorded signals. Additionally, conventional electrode materials are stiff, resulting in a significant mechanical mismatch between the electrode and the surrounding brain tissue, which elicits an inflammatory response that eventually leads to a degradation of the device performance. To address these challenges, we have developed a process to fabricate flexible microelectrodes based on Ti3C2 MXene, a recently discovered nanomaterial that possesses remarkably high volumetric capacitance, electrical conductivity, surface functionality, and processability in aqueous dispersions. Flexible arrays of Ti3C2 MXene microelectrodes have remarkably low impedance due to the high conductivity and high specific surface area of the Ti3C2 MXene films, and they have proven to be exquisitely sensitive for recording neuronal activity. In this protocol, we describe a novel method for micropatterning Ti3C2 MXene into microelectrode arrays on flexible polymeric substrates and outline their use for in vivo micro-electrocorticography recording. This method can easily be extended to create MXene electrode arrays of arbitrary size or geometry for a range of other applications in bioelectronics and it can also be adapted for use with other conductive inks besides Ti3C2 MXene. This protocol enables simple and scalable fabrication of microelectrodes from solution-based conductive inks, and specifically allows harnessing the unique properties of hydrophilic Ti3C2 MXene to overcome many of the barriers that have long hindered the widespread adoption of carbon-based nanomaterials for high-fidelity neural microelectrodes.

Fabrication of Ti3C2 MXene Microelectrode Arrays for In Vivo Neural Recording

We describe here a method for fabricating Ti3C2 MXene microelectrode arrays and utilizing them for in vivo neural recording.

생체 내 신경 녹음을 위한 Ti3C2 MXene 마이크로 전극 어레이 의 제조

Implantable microelectrode technologies have been widely used to elucidate neural dynamics at the microscale to gain a deeper understanding of the neural ...

Substructure Analyzer: A User-Friendly Workflow for Rapid Exploration and Accurate Analysis of Cellular Bodies in Fluorescence Microscopy Images

The last decade has been characterized by breakthroughs in fluorescence microscopy techniques illustrated by spatial resolution improvement but also in live-cell imaging and high-throughput microscopy techniques. This led to a constant increase in the amount and complexity of the microscopy data for a single experiment. Because manual analysis of microscopy data is very time consuming, subjective, and prohibits quantitative analyses, automation of bioimage analysis is becoming almost unavoidable. We built an informatics workflow called Substructure Analyzer to fully automate signal analysis in bioimages from fluorescent microscopy. This workflow is developed on the user-friendly open-source platform Icy and is completed by functionalities from ImageJ. It includes the pre-processing of images to improve the signal to noise ratio, the individual segmentation of cells (detection of cell boundaries) and the detection/quantification of cell bodies enriched in specific cell compartments. The main advantage of this workflow is to propose complex bio-imaging functionalities to users without image analysis expertise through a user-friendly interface. Moreover, it is highly modular and adapted to several issues from the characterization of nuclear/cytoplasmic translocation to the comparative analysis of different cell bodies in different cellular sub-structures. The functionality of this workflow is illustrated through the study of the Cajal (coiled) Bodies under oxidative stress (OS) conditions. Data from fluorescence microscopy show that their integrity in human cells is impacted a few hours after the induction of OS. This effect is characterized by a decrease of coilin nucleation into characteristic Cajal Bodies, associated with a nucleoplasmic redistribution of coilin into an increased number of smaller foci. The central role of coilin in the exchange between CB components and the surrounding nucleoplasm suggests that OS induced redistribution of coilin could affect the composition and the functionality of Cajal Bodies.

We present a freely available workflow built for rapid exploration and accurate analysis of cellular bodies in specific cell compartments in fluorescence microscopy images. This user-friendly workflow is designed on the open-source software Icy and also uses ImageJ functionalities. The pipeline is affordable without knowledge in image analysis.

하위 구조 분석기: 형광 현미경 이미지에서 세포 체의 신속한 탐색 및 정확한 분석을 위한 사용자 친화적인 워크플로우

The last decade has been characterized by breakthroughs in fluorescence microscopy techniques illustrated by spatial resolution improvement but also in ...

High-Dimensionality Flow Cytometry for Immune Function Analysis of Dissected Implant Tissues

The success of implanting laboratory-grown tissue or a medical device in an individual is subject to the immune response of the recipient host. Considering an implant as a foreign body, a hostile and dysregulated immune response may result in the rejection of the implant, while a regulated response and regaining of homeostasis can lead to its acceptance. Analyzing the microenvironments of implants dissected out under in vivo or ex vivo&#160;settings can help in understanding the pattern of immune response, which can ultimately help in developing new generations of biomaterials. Flow cytometry is a well-known technique for characterizing immune cells and their subsets based on their cell surface markers. This review describes a protocol based on manual dicing, enzymatic digestion, and filtration through a cell strainer for the isolation of uniform cell suspensions from dissected implant tissue. Further, a multicolor flow cytometry staining protocol has been explained, along with steps for initial cytometer settings to characterize and quantify these isolated cells by flow cytometry.

Isolation of cells from dissected implants and their characterization by flow cytometry can significantly contribute to understanding the pattern of immune response against implants. This paper describes a precise method for the isolation of cells from dissected implants and their staining for flow cytometric analysis.