SMの実験室での作業は、ウェルカム·トラストの研究キャリア開発フェローシップ[WT097411MA]でサポートされています。

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著者は、彼らが競合する金融利害がないことを宣言します。

組織培養細胞を用いてインビトロで自食作用および細胞骨格を監視する場合、セクション1および2に記載のプロトコルは、組織培養細胞型の多種多様に適用することができる。さらに、オートファジーに従うこと（ 例えば、ATG8 / LC3はオートファゴソームVEの+）と細胞骨格（ 例えば 、アクチンテイル、セプチンケージ）のライブイメージングを用い赤痢菌感染の間にリアルタイムでダイナミクスは、組織培養細胞は一過性にGFP-を使用してトランスフェクションすることができる、 RFP-またはCFP-タグ作成物以前に7,8に記載されているように。 赤痢菌に感染した細胞の割合を増加させるために（ すなわち 、リアルタイム分析のために一般的に望ましい赤痢100でHeLa細胞の5〜30％に侵入できることを考慮すると：1 MOI）、直接赤痢菌 400μlの（OD 600 = 0.3を追加-0.6）2ml中の細胞に、MEM（血清飢餓）と、十分な細菌のエントリの少なくとも1.5時間後に感染を待つファゴソーム、複製、AUからの脱出tophagy認識とセプチンのケージング。あるいは、アドヘシンAfaEを発現する赤痢菌 M90T AFAI株を使用し、M90T株28と比較して上皮細胞においてはるかに高い浸潤能力を有することができる。注目すべきは、M90T AFAI株はまだゼブラフィッシュを用いてインビボで試験されていない。 赤痢菌コロニーのプレートは、2〜3日間4℃に維持し、いくつかの実験のために使用することができる。しかし、時間をかけて、病原性プラスミドを失った赤痢菌のコロニーはまた、コンゴレッドを吸収し、それらの病原性プラスミドを保持しているように見えることがあります。このような理由から、私たちは、可能な場合は、新鮮な細菌株を使用することをお勧めします。 in vivoでの感染の細胞生物学を監視する場合、プロトコルは、セクション3と4の使用野生型ABラインゼブラフィッシュで説明。 赤痢菌 -leukocyte相互作用を監視するには、トランスジェニックゼブラフィッシュ系統を使用することができ、 たとえば、MPX：GFPまたはLYZ：DsRedを視覚的にマクロファージ19,31を可視化するためにmCherryを：好中球19,29,30またはMPEG1を IZE。セクション3.8で説明したように生体内で自食作用を可視化するために、GFP-LC3ゼブラフィッシュトランスジェニック系統19,24を使用することができる。 インビボでオートファジーを摂動するために、効果的なモルホリノオリゴヌクレオチドの用量は、転写、スプライシングまたはタンパク質翻訳を阻害するその効率に基づいて実験的に評価されなければならない。これは、滴定実験を実行し、（スプライスモルホリノオリゴヌクレオチド用）、RT-PCRによって、あるいは（並進ホリノオリゴヌクレオチド用）、SDS-PAGE 32で枯渇を確認することをお勧めします。ゼブラフィッシュ胚または幼虫からのRNAの単離は、チオシアン酸グアニジニウム - フェノール - クロロホルム抽出を用いて行うことができる。ゼブラフィッシュの幼生（8〜15幼虫/管）からタンパク質を抽出するために、機械的に200μlの溶解緩衝液（1 Mトリス、5 MのNaCl、0.5 M EDTA、0.01％オクチルフェノールエチレンオキシドコンデンスで乳棒を用いて均質化するeおよびプロテアーゼ阻害剤）。 15分間、4℃で19000×gで遠心分離管と新しいチューブに上清を移す。レムリ緩衝液を添加し、15分間、95℃でサンプルを加熱する。溶解物を、必要になるまで-80℃で保存することができ、セクション2.3で説明したようにウェスタンブロッティングによって評価することができる。 ゼブラフィッシュは、生体内の薬物アプリケーションのための優れたモデルです。モルホリノオリゴヌクレオチドを用いた分析は、自食作用を操作するための確立された薬物（ 例えば 、ラパマイシンおよびバフィロマイシン）で補完することができる。未感染及び/又は感染した幼虫は、ラパマイシン（1.5μM）またはバフィロマイシン（80 nM）のE2で希釈し、25,33に記載されるようにオートファジーフラックスウェスタンブロッティングによって評価することができるで処理することができる。 3.5節で説明したように、感染した幼虫の感染と生存の結果にオートファジー操作の結果を評価することができる。 宿主細胞を研究することに加えin vitroおよびin vivoプロトコルにおける決定因子は、 例えば 、 赤痢菌ΔicsAは （ 赤痢菌タンパク質 ICSAは、N-WASPを動員し、次にARP2 / 3、示差的オートファジーによって認識される細菌の変異株を用いて、オートファジー認識に必要な細菌の決定因子を評価するために適用することができるその非存在下での、その非存在下ではなく、アクチンテイル、ないセプチンケージ）とShigellaΔicsB（赤痢菌は、ICSAのオートファジー機械の動員を防止し、細菌のエフェクタータンパク質ICSB、経由オートファジー応答を回避することはありえない、アクチンテイルとセプチンケージ形成にもっとセプチンケージ、より多くのオートファジー）7,8がある場合もあります。 赤痢菌は、ゼブラフィッシュの自然な病原体ではありませんし、37℃で最適に成長する。しかし、仕事は赤痢菌の侵入に必要な病原性因子は、CY内貪食空胞およびレプリケーションから逃れることが示されているtosolを発現させ、28℃で19でゼブラフィッシュの幼生において機能的であることができます。 28°C、正常なゼブラフィッシュの開発23を確保するためにゼブラフィッシュ飼育し、標準温度で最も一般的に使用される温度である。驚くべきことに、（ すなわち 、マクロファージ細胞死、上皮細胞内に侵入し、乗算、細胞から細胞への拡散、ホスト上皮の炎症性破壊）ヒトで細菌性赤痢を引き起こす主要な病原性のイベントが忠実に赤痢菌感染のゼブラフィッシュモデルで再現されている19。 オートファジーと細胞骨格の遺伝子は、普遍的に発現し、生物学的機能の広い範囲を持っている。マウスの研究は、胚致死性であり、そしてこの問題は、ゼブラフィッシュが複数あるという事実によって低減することができるが、それは（これらの遺伝子のいくつかはまた、ゼブラフィッシュの開発のために不可欠であると思われる本質的なオートファジー26またはセプチン遺伝子のノックアウト5を示しているパラロガス遺伝子33）。もしそうであれば、（i）のオートファジーを調節する薬理学的試薬の使用および細胞骨格、（ii）のモルホリノを滴定することができ、（iii）の遺伝子のノックアウトは、特定のセルのために設計することができるなど、この問題を克服するためのいくつかの選択肢が存在し、タイプ、および/ ​​または（iv）は、動物の発達のために必須ではないオートファジー認識に関与する遺伝子（ 例えば 、P62）を標的とすることができる。 ゼブラフィッシュは、 赤痢菌感染時にオートファジーと細胞骨格を調査するための理想的なモデルシステムであるが、分子ツールは、現在不足している。フィールドは、新しいツールを生成し、目的のタンパク質の細胞特異的発現を駆動する必要がある。オートファジー/細胞骨格遺伝子の発現をノックダウンするために、新しいモルホリノ配列は必要とされ、ゲノム工学のための新規な方法（ 例えば 、ターレン、CRISPR / Cas9）を使用することもできる。一方、いくつかのツールは、以前に、ヒトまたはマウスの研究のために生成された同じようにゼブラフィッシュのために働くことがあります。 細胞内細菌S.赤痢菌は、免疫系1,2によって認識される細菌の能力を含む、生物学における主要な問題に対処する例外的なモデル生物として浮上している。宿主細胞は、S.の運動性を制限するセプチンを採用赤痢菌とオートファジーにそれらをターゲットに、細胞自律的な免疫7,8の重要な要素。これらの観​​察は、自食作用および細胞質細菌を分解する能力を研究するための新しい分子のフレームワークを提案する。主要な問題は、完全に、基礎となる分子や細胞のイベントを解読するために、関連する動物モデルを用いて、生体内での細菌感染の間、in vitroで分析し、これらのイベントを検証することになりました。この目的のために、ゼブラフィッシュは、S.の分析のための貴重な新しいホストとして確立されている赤痢菌感染19。細菌と宿主細胞間の相互作用は、高解像度で撮像することができる、及びゼブラフィッシュモデルは、 生体内で赤痢菌感染症の細胞生物学を理解するのに有用であることを証明する必要があります。ゼブラフィッシュの幼生は、宿主防御における細菌オートファジーの役割を調査するために使用することができ、かつ作業がオートファジーの摂動に悪影響シゲラ感染19に応答して宿主の生存に影響を及ぼし得ることが示された。 赤痢菌の研究から生成された観測は、組織培養細胞を用いたin vitroでケージやオートファジーをセプチンおよびin vivoでゼブラフィッシュの幼虫を使用すると、宿主防御を理解する上での基本的な進歩を提供することがあります。彼らはまた、感染症と闘うことを目的とし、新しい戦略の開発を示唆している可能性があります。 本報告書の重要な目的は、in vitroで解析し、分子および細胞事象の意味を理解することです（ つまり 、オートファジー、アクチンテイル、ケージングセプチン）ENTとの関連で、生体内での細菌感染の間にゼブラフィッシュの幼虫を使用して怒り生物。ゼブラフィッシュ生物学や取り扱いに慣れていない場合は、1が適切なゼブラフィッシュの飼育23の奥行きプロトコルおよびゼブラフィッシュの感染19,35 のin vivoでの分析に指すことができる。

赤痢菌赤痢 、グラム陰性浸潤性腸病原性細菌は、細胞質ゾルへのファゴソームから脱出し、細胞質ゾルの免疫応答を回避し、細胞内および細胞間移行1,2を促進するために、ホストアクチン細胞骨格を重合させることができる。 試験管 3,4 におけるアクチンベースの運動性の理解にもかかわらず、 生体内で細菌の普及を制限するメカニズムは完全に定義されていない。これは自然免疫と宿主防御のより完全な理解のために重要である。 セプチン、後生動物の中で、タンパク質の高度に保存されたファミリーは、ヘテロオリゴマー複合体に集合し、細胞膜と細胞骨格5,6関連付ける無極性フィラメントを形成するタンパク質を-結合グアノシン三リン酸（GTP）である。最近の研究は、感染した宿主細胞はautophに標的細菌を区画化することによって、シゲラアクチンベースの運動性を抑制することができることを発見したAGY内部の「セプチンケージ」、アクチンベースの運動性7,8に対抗する最初の細胞メカニズムを明らかに。調査の広いオープンフィールドは現在、「セプチン生物学と感染症」にある。多様な病原体によって誘導されたセプチンアセンブリ（ 例えば 、 リステリア·モノサイトゲネス7,9,10-、マイコバクテリウムマリナム7,8、カンジダ·アルビカンス 11）は 、宿主防御5,12における重要な課題として浮上することがあります。 オートファジー、高度に保存された細胞内分解プロセスは、原因リソソーム13,14にサイトゾル細菌を送達する能力を細胞自律的免疫の重要な構成要素と見なされる。しかし、細菌の複製を制限したり、促進するための生体内での細菌のオートファジーの役割は不十分15,16を理解したままになります。それは、光学的にアクセス可能であるため、ゼブラフィッシュ（ ゼブラフィッシュ ） は、感染症の研究のための脊椎動物のモデルとして登場しました幼虫の段階で自然免疫系はすでに17,18機能しているとき。最近の研究は、Sにゼブラフィッシュの幼虫の感受性を特徴としている赤痢菌 、細菌、オートファジー15パラダイム、およびin vivo 19 に抗菌治療のためのオートファジーの操作を研究するために赤痢菌 -zebrafish感染モデルを使用してきました。 このレポートでは、新しいツールやSを研究するためのアッセイを提供するオートファジーと細胞骨格との相互作用フレクスナー 。最初のステップでは、オートファジー細胞骨格相互作用をモニターするためのプロトコルは、ヒト上皮細胞株HeLaのシゲラ感染を用いて説明する。 インビトロでのシゲラ感染プロセスに対するオートファジー細胞骨格相互作用の役割を評価するために、自食作用および細胞骨格成分（siRNAまたは薬理学的試薬を使用して）操作する方法が提供される。新しい仕事は、 赤痢菌感染 oを使用することによってそれを示しているゼブラフィッシュの幼生fは、類似のアッセイは、 インビボでの感染の細胞生物学を研究するために適用することができる。ゼブラフィッシュの幼生を準備し、感染させるプロトコルは詳述され、そしてインビボでシゲラ感染に対する宿主応答を評価するために、宿主の生存および感染した幼虫の細菌負荷を決定するためのプロトコルが提供される。モルフォリノ（1-4細胞期の胚に注入）、オリゴヌクレオチドまたは薬理学的試薬を用いて赤痢にセプチンとオートファジーのマーカーの動員をモニターするための方法（固定またはゼブラフィッシュ幼生の生活のどちらかを使用して）およびin vivoでのこれらのプロセスの役割をテストするための方法[（ゼブラフィッシュ風呂の水に直接添加する）]についても説明します。この作業プログラムは、サイトゾル宿主応答による感染の制御に必要なメカニズムへの洞察を提供することが期待される。

<table border="0" cellpadding="0" cellspacing="0" width="771">
	<tbody>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:412px;">Name of Material/ Equipment</td>
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			<td style="width:119px;">Catalog Number</td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:412px;">Bafilomycin A1</td>
			<td style="width:240px;">Sigma-Aldrich</td>
			<td>B1793&#160;</td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:412px;">Blebbistatin</td>
			<td style="width:240px;">Sigma-Aldrich</td>
			<td>B0560</td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;">Borosilicate glass microcapillars&#160;</td>
			<td>Harvard Apparatus</td>
			<td>30038</td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;">Coarse manual manipulator&#160;</td>
			<td>Narishige</td>
			<td style="width:119px;">M-152</td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;">Cytochalasin D</td>
			<td style="width:240px;">Sigma-Aldrich</td>
			<td style="width:119px;">C6762</td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;">4&#39;,6-diamidino-2-phenylindole (DAPI)</td>
			<td style="width:240px;">Molecular Probes</td>
			<td style="width:119px;">D1306</td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:412px;">Dumont #5 fine tweezers</td>
			<td style="width:240px;">Fine Science Tools</td>
			<td style="width:119px;">11254-20</td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;">Forchlorfeneuron&#160;</td>
			<td style="width:240px;">Sigma-Aldrich</td>
			<td style="width:119px;">32974</td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:412px;">Goat anti-mouse IgG (H+L) antibody</td>
			<td style="width:240px;">Molecular Probes</td>
			<td style="width:119px;">N/A&#160;</td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:412px;">Goat ant-rabbit IgG (H+L) antibody</td>
			<td style="width:240px;">Molecular Probes</td>
			<td style="width:119px;">N/A</td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:412px;">JetPEI transfection reagent</td>
			<td style="width:240px;">Polyplus transfection</td>
			<td style="width:119px;">101-01N</td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:412px;">Latrunculin B</td>
			<td style="width:240px;">Sigma-Aldrich</td>
			<td style="width:119px;">L5288</td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:412px;">LC3 antibody</td>
			<td style="width:240px;">Novus Biologicals</td>
			<td style="width:119px;">NB100-2220</td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:412px;">Low melting agarose</td>
			<td style="width:240px;">Promega</td>
			<td style="width:119px;">V2111</td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:412px;">MatTek glass bottom dish</td>
			<td style="width:240px;">MatTek corporation</td>
			<td style="width:119px;">P35G-1.0-14</td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;">MEM plus L-alanyl-L-glutamine&#160;</td>
			<td style="width:240px;">GIBCO</td>
			<td style="width:119px;">41090028</td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:412px;">MEM non-essential amino acids solution</td>
			<td style="width:240px;">GIBCO</td>
			<td style="width:119px;">11140-035</td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;">Microinjector&#160;</td>
			<td>Narishige</td>
			<td>IM-300</td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;">Micropipette puller device&#160;</td>
			<td>Sutter Instrument Co., Novato,</td>
			<td>P-87&#160;</td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:412px;">Mineral oil</td>
			<td style="width:240px;">Sigma-Aldrich</td>
			<td style="width:119px;">P35G-1.0-14</td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:412px;">Monoclonal anti-tubulin, acetylated antibody&#160;</td>
			<td style="width:240px;">Sigma-Aldrich</td>
			<td style="width:119px;">T6793</td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;">Nocodazole</td>
			<td style="width:240px;">Sigma-Aldrich</td>
			<td style="width:119px;">M1404</td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;">N-phenylthiourea&#160;</td>
			<td>Sigma-Aldrich</td>
			<td style="width:119px;">P7629</td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:412px;">Paraformaldehyde</td>
			<td style="width:240px;">Sigma-Aldrich</td>
			<td style="width:119px;">158127</td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;">Phalloidin&#160;</td>
			<td style="width:240px;">Molecular Probes</td>
			<td>A12379</td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:412px;">Phenol red solution</td>
			<td style="width:240px;">Sigma-Aldrich</td>
			<td style="width:119px;">P0290</td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:412px;">Protease inhibitor cocktail</td>
			<td style="width:240px;">Roche</td>
			<td style="width:119px;">4693116001</td>
		</tr>
		<tr height="22">
			<td height="22" style="height:22px;width:412px;">p62/SQSTM1 antibody</td>
			<td style="width:240px;">Cliniscience</td>
			<td style="width:119px;">PM045</td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;">Rapamycin</td>
			<td style="width:240px;">Sigma-Aldrich</td>
			<td style="width:119px;">R8781</td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:412px;">Sodium pyruvate</td>
			<td style="width:240px;">GIBCO</td>
			<td style="width:119px;">11360039</td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:412px;">Transfection reagent</td>
			<td style="width:240px;">Life Technologies</td>
			<td style="width:119px;">12252-011</td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;">Vectashield hard set mounting medium containing DAPI&#160;</td>
			<td style="width:240px;">Vector Laboratories</td>
			<td style="width:119px;">H-1500&#160;</td>
		</tr>
	</tbody>
</table>

use of shigella flexneri to study autophagy-cytoskeleton interactions

赤痢菌赤痢菌は、細胞質ゾルに到達するためにファゴソームから脱出し、その運動性と普及を促進するためのホストアクチン細胞骨格を重合させることができる細胞内の病原体である。新しい仕事は、アクチンベースの運動性に関与するタンパク質はまた、オートファジーは細胞自律的免疫に重要な細胞内分解プロセスにリンクされていることが示されている。驚くべきことに、宿主細胞は、S.のアクチンに基づく運動性を防止することができる細菌の内部の「セプチンケージ」を区画化し、オートファジーにそれらを標的とすることによってフレクスナー 。これらの観​​察は、セプチンのより完全な理解は、糸状GTP結合タンパク質のファミリーは、オートファジーのプロセスに新たな洞察を提供するであろうことを示している。このレポートは、Sに起因するオートファジー細胞骨格の相互作用を監視するためのプロトコルを記述フレクスナーインビトロ組織培養細胞を用いてin vivoでゼブラフィッシュの幼生を用いた。これらのプロトコルは、細胞内mechanisの調査を可能にする分子の細胞、および生物全体レベルでの細菌の拡散を制御するミリ。

インビトロでの組織培養細胞の感染の際に、S.ネリはファゴソームから脱出し、細胞質ゾルに侵入することができます。細胞質ゾルにおいて、宿主細胞は、セプチンケージ（ 図1A）の内側に細菌を区画化することにより赤痢菌のアクチンベースの運動性を防ぐことができます。セプチンケージによって捕捉された細菌はまた、オートファジーマーカーP62（ 図1B）およびLC3（ 図1C）で標識することができる。これらの観​​察は、侵襲性病原体の普及を制限する宿主防御の新規メカニズムを強調し、また、オートファジーと細胞骨格の間に新しいリンクを明らかにした。驚くべきことに、オートファジーマーカーの枯渇が著しく細菌（ 図2A）のセプチンのケージを低減し、作業もセプチンケージの枯渇が著しく、オートファジーマーカー8の動員を減少させることが示されている。したがって、少なくとも赤痢菌の場合には、ケージアセンブリとオートファゴソームをセプチン構成体nは相互に依存するプロセスとみなすことができる。セプチンケージによる赤痢菌の区画化のための他の細胞の要件は、アクチン重合およびアクトミオシン活性（ 図2B）が含まれる。 感染症の新たなモデル動物、ゼブラフィッシュの幼虫19の恩恵を受けることができない自然のマウス細菌性赤痢のモデル、および赤痢菌の病因、セプチン生物学および生体内での細菌のオートファジーの研究はありません。このようなインビボでの顕微鏡検査（ 図3A）のために尾静脈生存実験のための注射、および尾の筋肉注射などのさまざまな解剖学的部位における細菌を注入することにより、ゼブラフィッシュの幼虫を感染させることが可能である。用量に応じて、S.ゼブラフィッシュの幼虫に注入フレクスナーはどちらか48時間の感染後以内にクリアすることができ、または進行し、最終的に致命的な感染症（ 図3B - 3D）になることがあります。 赤痢菌の病原性ファのコンスは28℃、ゼブラフィッシュの最適な成長温度で表され、 赤痢菌によるゼブラフィッシュの感染は、III型分泌系（T3SS）19、ヒト疾患における必須病原性決定因子に応じ厳密に依存している。まとめると、これらの観察結果は、ゼブラフィッシュの幼虫は赤痢菌感染のin vivo分析のための貴重な新しいホストを表していることを示している。 ゼブラフィッシュ幼生の光アクセス性は、in vivoでのセプチンのケージ（ 図4A）、前哺乳類宿主モデルを使用して達成されたことがない成果の可視化を可能にします。セプチンケージが生体内で自食作用を標的とした細菌を捕捉するという証拠を補完するために、人は、GFP-LC3を発現するトランスジェニックゼブラフィッシュの幼虫に感染し、 赤痢菌 （ 図4B）にオートファジーマーカー補充を観察することができます。 in vivoでの赤痢菌オートファゴソームのultrastrucutral分析、EL用ectron顕微鏡は、明らかに二重膜小胞19による細菌の細胞質ゾル分画を表示するために使用することができる。オートファジーは、細胞自律的免疫及びintracytosolic細菌に対する重要な防御機構14-16の重要な要素と見られている。 インビボでオートファジー機能を特徴づけるために、P62のモルホリノで処理したゼブラフィッシュの幼生を使用することができる。コアオートファジー機械[ 例えば 。、36、オートファジー関連タンパク質（のATG）26]とは異なり、P62は、脊椎動物の発生27に必須ではないため、ゼブラフィッシュの幼虫は感染前に正常に開発することができます。驚くべきことに、P62-枯渇幼虫S.を接種大幅に増加し、死亡率の増加細菌負荷19におけるフレクスナー結果。セプチンケージアセンブリは、オートファゴソームの形成7,8と相互依存していることを示すin vitroの研究と一致して、 赤痢菌にセプチンの動員は明らかに（P62-枯渇幼虫低減される<strオング&gt;図4C）。これらのデータは、ゼブラフィッシュ生存率は、細胞内細菌感染を制御するために、p62を媒介自食作用に依存することを示している。 <img alt="図1" fo:content-width="5in" src="/files/ftp_upload/51601/51601fig1highres.jpg" width="500" /> インビトロでのセプチンケージ。図。（A）HeLa細胞を感染させたS.赤痢菌は、4時間40分間、固定し、SEPT9およびファロイジンに対する抗体で標識し、共焦点縮小コピーによって撮像された。スケールバーは、1μmである。（B）HeLa細胞を感染させたS.赤痢菌は、4時間40分間、固定し、P62とSEPT2に対する抗体で標識し、蛍光顕微鏡で画像化。スケールバーは、1μmである。（C）HeLa細胞を、GFP-ATG8 / LC3でトランスフェクトされたS.を感染させた4時間40分のためにフレクスナー 、固定、SEPT2に対する抗体で標識し、蛍光灯マイルにより撮像されたcroscopy。スケールバーは1μm。これらの図はMostowy ら 7から変更されている。 <img alt="図2" fo:content-width="5in" src="/files/ftp_upload/51601/51601fig2highres.jpg" width="500" /> シゲラ -septinケージの形成のための図2セルラー要件。（A）HeLa細胞をP62、ATG5、ATG6またはATG7 siRNAを、コントロール（CTRL）で処理した。 siRNAで処理した細胞の全細胞溶解物は、siRNAの枯渇（上）の効率を示すために、GAPDH、P62、ATG5、ATG6、またはATG7のために免疫ブロットした。 siRNAで処理した細胞は、Sに感染していた4時間40分のためにフレクスナー 、固定し、定量的な顕微鏡検査のために標識。グラフ（下）は処置当たりn個≥3実験からSEPT2ケージ内部の赤痢菌の平均±SEMの％を表す。（B）HeLa細胞は、Sに感染させたFD（CytD）サイトカラシン、DMSOで処理lexneri、ラトランキュリンB（LATB）、ノコダゾール（NOCO）、またはブレビスタチン（ブレブ）と4時間後に40分固定し、定量的な顕微鏡検査のために標識。グラフは、治療ごとに2つの独立した実験からSEPT2ケージの中に赤痢菌の平均％±SEMを表す。これらの数字はMostowy ら 7から変更されている。 <img alt="図3" fo:content-width="5in" src="/files/ftp_upload/51601/51601fig3highres.jpg" width="500" /> 図3 赤痢菌感染のゼブラフィッシュモデル。実体顕微鏡下でゼブラフィッシュの幼虫の向きを説明するために、（A）画像。 （左のパネル）ゼブラフィッシュの幼生72時間後に受精は、その背側は、注射針を向けて射出プレートに横方向に配置した。 （中央パネル）血流感染がINJによって行った尾静脈内細菌（赤色溶液）をパソ、泌尿生殖器の開口部に後方。尾の筋肉内（右のパネル）感染は、体節の上の細菌（赤色溶液）を注入することにより行った。（B）72時間後の受精の幼虫の生存曲線をSのさまざまな投与量を注射フレクスナー及び48時間感染後、28℃でインキュベートした。効果的な接種材料は、低（&lt;10 3 CFU、白丸）、中（〜4×10 3 CFU、白三角）または高（〜10 4 CFU、白四角）に分類された。 nは％±SEM（横棒）≥3種菌クラスごとの実験の平均。個別の幼虫からホモジネート中の生菌（C）列挙さまざまな時期に、感染後、LB上にプレーティングすることにより測定された注、感染を生き残った唯一の幼虫を列挙分析に含まれています。これも図示±SEM（横棒）を意味する。（D）GFP- 赤痢菌の分布によって決定ライブイメージングさまざまなタイミングで蛍光実体顕微鏡を用いて低、中、高用量接種（尾静脈注射）を使用して、感染後。送信画像（灰色）およびGFP蛍光（緑色）のオーバーレイ（B） - （D）これらの図はMostowy ら 19から変更されている。 <img alt="図4" fo:content-width="5in" src="/files/ftp_upload/51601/51601fig4highres.jpg" width="500" /> in vivoでの赤痢菌感染症の細胞生物学。図。（A）ゼブラフィッシュの幼虫はSEPT7に対する抗体で標識された固定24時間GFP- 赤痢菌 （低用量）と尾の筋肉、、（赤）およびGFPに感染させ、（緑）、共焦点顕微鏡で画像化。スケールバーは5μm。（B）GFP-LC3ゼブラフィッシュの幼虫はmCherry- 赤痢菌 （中用量）のために感染させた4時間、固定、mCherryを（赤）に対しておよびGFP（緑）に対する抗体で標識し、共焦点顕微鏡で画像化。スケールバー、1.5μmのコントロール（CTRL;左画像）のいずれかで処理された（C）ゼブラフィッシュの幼虫。またはP62（右画像）モルフォリノは（、4時間（中用量）のために、GFP 赤痢菌に感染して固定し、SEPT7に対する抗体で標識した赤）およびGFP（緑色）に、共焦点顕微鏡で画像化。矢印は、セプチンケージ（CTRL）かに捕捉された赤痢菌のいくつかの例を強調4時間後に感染（P62は枯渇）。スケールバーは5μm。これらの図はMostowy ら 19から変更されている。

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Use of Shigella flexneri to Study Autophagy-Cytoskeleton Interactions

病原体の普及に対抗するために、宿主細胞には、細菌を区分し、オートファジーを誘導するそれらの細胞骨格を再編成する。組織培養細胞のシゲラ感染を使用して、このプロセスの基礎となるホストおよび病原決定因子が同定され、特徴付けられる。 シゲラ感染のゼブラフィッシュモデルを使用して、発見された分子およびメカニズムの役割は、in vivoで調べた。

使用<em&gt;フレクスナー赤痢菌</em&gt;オートファジー細胞骨格の相互作用を研究するために

Shigella flexneri is an intracellular pathogen that can escape from phagosomes to reach the cytosol, and polymerize the host actin cytoskeleton to promote ...

use-of-shigella-flexneri-to-study-autophagy-cytoskeleton-interactions

Nanyang Technological University

Research

JoVE Journal

Immunology and Infection

Use of Shigella flexneri to Study Autophagy-Cytoskeleton Interactions

15.7K ビュー.  Imperial College London. 病原体の普及に対抗するために、宿主細胞には、細菌を区分し、オートファジーを誘導するそれらの細胞骨格を再編成する。組織培養細胞のシゲラ感染を使用して、このプロセスの基礎となるホストおよび病原決定因子が同定され、特徴付けられる。 シゲラ感染のゼブラフィッシュモデルを使用して、発見された分子およびメカニズムの役?...

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Use of an Optical Trap for Study of Host-Pathogen Interactions for Dynamic Live Cell Imaging

Dynamic live cell imaging allows direct visualization of real-time interactions between cells of the immune system1, 2; however, the lack of spatial and temporal control between the phagocytic cell and microbe has rendered focused observations into the initial interactions of host response to pathogens difficult. Historically, intercellular contact events such as phagocytosis3 have been imaged by mixing two cell types, and then continuously scanning the field-of-view to find serendipitous intercellular contacts at the appropriate stage of interaction. The stochastic nature of these events renders this process tedious, and it is difficult to observe early or fleeting events in cell-cell contact by this approach. This method requires finding cell pairs that are on the verge of contact, and observing them until they consummate their contact, or do not. To address these limitations, we use optical trapping as a non-invasive, non-destructive, but fast and effective method to position cells in culture.
Optical traps, or optical tweezers, are increasingly utilized in biological research to capture and physically manipulate cells and other micron-sized particles in three dimensions4. Radiation pressure was first observed and applied to optical tweezer systems in 19705, 6, and was first used to control biological specimens in 19877. Since then, optical tweezers have matured into a technology to probe a variety of biological phenomena8-13.
We describe a method14 that advances live cell imaging by integrating an optical trap with spinning disk confocal microscopy with temperature and humidity control to provide exquisite spatial and temporal control of pathogenic organisms in a physiological environment to facilitate interactions with host cells, as determined by the operator. Live, pathogenic organisms like Candida albicans and Aspergillus fumigatus, which can cause potentially lethal, invasive infections in immunocompromised individuals15, 16 (e.g. AIDS, chemotherapy, and organ transplantation patients), were optically trapped using non-destructive laser intensities and moved adjacent to macrophages, which can phagocytose the pathogen. High resolution, transmitted light and fluorescence-based movies established the ability to observe early events of phagocytosis in living cells. To demonstrate the broad applicability in immunology, primary T-cells were also trapped and manipulated to form synapses with anti-CD3 coated microspheres in vivo, and time-lapse imaging of synapse formation was also obtained. By providing a method to exert fine spatial control of live pathogens with respect to immune cells, cellular interactions can be captured by fluorescence microscopy with minimal perturbation to cells and can yield powerful insight into early responses of innate and adaptive immunity.

A method is described to individually select, manipulate, and image live pathogens using an optical trap coupled to a spinning disk microscope. The optical trap provides spatial and temporal control of organisms and places them adjacent to host cells. Fluorescence microscopy captures dynamic intercellular interactions with minimal perturbation to cells.

動的な生細胞イメージングのための宿主 - 病原体相互作用の研究のための光トラップの使用

Dynamic live cell imaging allows direct visualization of real-time interactions between cells of the immune system1, 2; however, the lack of spatial and ...

免疫・感染学

Use of the EpiAirway Model for Characterizing Long-term Host-pathogen Interactions

Nontypeable Haemophilus influenzae (NTHi) are human-adapted Gram-negative bacteria that can cause recurrent and chronic infections of the respiratory mucosa 1; 2. To study the mechanisms by which these organisms survive on and inside respiratory tissues, a model in which successful long-term co-culture of bacteria and human cells can be performed is required. We use primary human respiratory epithelial tissues raised to the air-liquid interface, the EpiAirway model (MatTek, Ashland, MA). These are non-immortalized, well-differentiated, 3-dimensional tissues that contain tight junctions, ciliated and nonciliated cells, goblet cells that produce mucin, and retain the ability to produce cytokines in response to infection. 
This biologically relevant in vitro model of the human upper airway can be used in a number of ways; the overall goal of this method is to perform long-term co-culture of EpiAirway tissues with NTHi and quantitate cell-associated and internalized bacteria over time. As well, mucin production and the cytokine profile of the infected co-cultures can be determined. This approach improves upon existing methods in that many current protocols use submerged monolayer or Transwell cultures of human cells, which are not capable of supporting bacterial infections over extended periods3. For example, if an organism can replicate in the overlying media, this can result in unacceptable levels of cytotoxicity and loss of host cells, arresting the experiment. The EpiAirway model allows characterization of long-term host-pathogen interactions. Further, since the source for the EpiAirway is normal human tracheo-bronchial cells rather than an immortalized line, each is an excellent representation of actual human upper respiratory tract tissue, both in structure and in function4.
For this method, the EpiAirway tissues are weaned off of anti-microbial and anti-fungal compounds for 2 days prior to delivery, and all procedures are performed under antibiotic-free conditions. This necessitates special considerations, since both bacteria and primary human tissues are used in the same biosafety cabinet, and are co-cultured for extended periods.

This method allows characterization of extended bacterial co-culture with EpiAirways, primary human respiratory epithelial tissue grown at the air-liquid interface, a biologically relevant in vitro model. The approach can be used with any microbe that is amenable to long-term co-culture.

長期宿主 - 病原体相互作用を特徴付けるためのEpiAirwayモデルの利用

Nontypeable Haemophilus influenzae  (NTHi) are human-adapted Gram-negative bacteria that can cause recurrent and chronic infections of the respiratory ...

Use of Galleria mellonella as a Model Organism to Study Legionella pneumophila Infection

Legionella pneumophila, the causative agent of a severe pneumonia named Legionnaires&#39; disease, is an important human pathogen that infects and replicates within alveolar macrophages. Its virulence depends on the Dot/Icm type IV secretion system (T4SS), which is essential to establish a replication permissive vacuole known as the Legionella containing vacuole (LCV). L. pneumophila infection can be modeled in mice however most mouse strains are not permissive, leading to the search for novel infection models. We have recently shown that the larvae of the wax moth Galleria mellonella are suitable for investigation of L. pneumophila infection. G. mellonella is increasingly used as an infection model for human pathogens and a good correlation exists between virulence of several bacterial species in the insect and in mammalian models. A key component of the larvae&#39;s immune defenses are hemocytes, professional phagocytes, which take up and destroy invaders. L. pneumophila is able to infect, form a LCV and replicate within these cells. Here we demonstrate protocols for analyzing L. pneumophila virulence in the G. mellonella model, including how to grow infectious L. pneumophila, pretreat the larvae with inhibitors, infect the larvae and how to extract infected cells for quantification and immunofluorescence microscopy. We also describe how to quantify bacterial replication and fitness in competition assays. These approaches allow for the rapid screening of mutants to determine factors important in L. pneumophila virulence, describing a new tool to aid our understanding of this complex pathogen.

Use of Galleria mellonella as a Model Organism to Study Legionella pneumophila Infection

The larva of the wax moth Galleria mellonella was recently established as an in vivo model to study Legionella pneumophila infection. Here, we demonstrate fundamental techniques to characterize the pathogenesis of Legionella in the larvae, including inoculation, measurement of bacterial virulence and replication as well as extraction and analysis of infected hemocytes.

使用<em&gt;ハチノスツヅリガ</em&gt;モデル生物として研究する<em&gt;レジオネラ·ニューモフィラ</em&gt;感染症

Legionella pneumophila, the causative agent of a severe pneumonia named Legionnaires&#39; disease, is an important human pathogen that infects and ...

Evaluation of the Efficacy And Toxicity of RNAs Targeting HIV-1 Production for Use in Gene or Drug Therapy

Small RNA therapies targeting post-integration steps in the HIV-1 replication cycle are among the top candidates for gene therapy and have the potential to be used as drug therapies for HIV-1 infection. Post-integration inhibitors include ribozymes, short hairpin (sh) RNAs, small interfering (si) RNAs, U1 interference (U1i) RNAs and RNA aptamers. Many of these have been identified using transient co-transfection assays with an HIV-1 expression plasmid and some have advanced to clinical trials. In addition to measures of efficacy, small RNAs have been evaluated for their potential to affect the expression of human RNAs, alter cell growth and/or differentiation, and elicit innate immune responses. In the protocols described here, a set of transient transfection assays designed to evaluate the efficacy and toxicity of RNA molecules targeting post-integration steps in the HIV-1 replication cycle are described. We have used these assays to identify new ribozymes and optimize the format of shRNAs and siRNAs targeting HIV-1 RNA. The methods provide a quick set of assays that are useful for screening new anti-HIV-1 RNAs and could be adapted to screen other post-integration inhibitors of HIV-1 replication.

Methods to evaluate the efficacy and toxicity of RNA molecules targeting post-integration steps of the HIV-1 replication cycle are described. These methods are useful for screening new molecules and optimizing the format of existing ones.

遺伝子または薬物療法で使用するためのHIV-1産生を標的RNAの有効性および毒性の評価

Small RNA therapies targeting post-integration steps in the HIV-1 replication cycle are among the top candidates for gene therapy and have the potential ...

Flow Virometry to Analyze Antigenic Spectra of Virions and Extracellular Vesicles

Cells release small extracellular vesicles (EVs) into the surrounding media. Upon virus infection cells also release virions that have the same size of some of the EVs. Both virions and EVs carry proteins of the cells that generated them and are antigenically heterogeneous. In spite of their diversity, both viruses and EVs were characterized predominantly by bulk analysis. Here, we describe an original nanotechnology-based high throughput method that allows the characterization of antigens on individual small particles using regular flow cytometers. Viruses or extracellular vesicles were immunocaptured with 15 nm magnetic nanoparticles (MNPs) coupled to antibodies recognizing one of the surface antigens. The captured virions or vesicles were incubated with fluorescent antibodies against other surface antigens. The resultant complexes were separated on magnetic columns from unbound antibodies and analyzed with conventional flow cytometers triggered on fluorescence. This method has wide applications and can be used to characterize the antigenic composition of any viral- and non-viral small particles generated by cells in vivo and in vitro. Here, we provide examples of the usage of this method to evaluate the distribution of host cell markers on individual HIV-1 particles, to study the maturation of individual Dengue virions (DENV), and to investigate extracellular vesicles released into the bloodstream.

Viruses or extracellular vesicles were immunocaptured with 15 nm magnetic nanoparticles coupled to antibodies recognizing surface antigens. The captured virions or vesicles were labeled with fluorescent antibodies against other surface antigens. The resultant complexes were separated in high magnetic field and analyzed with conventional flow cytometers triggered on fluorescence.

ビリオンの抗原性スペクトルと細胞外ベシクルを分析するためのフローVirometry

Cells release small extracellular vesicles (EVs) into the surrounding media. Upon virus infection cells also release virions that have the same size of ...

Creation of a Dense Transposon Insertion Library Using Bacterial Conjugation in Enterobacterial Strains Such As Escherichia Coli or Shigella flexneri

Transposon mutagenesis is a method that allows gene disruption via the random genomic insertion of a piece of DNA called a transposon. The protocol below outlines a method for high efficiency transfer between bacterial strains of a plasmid harboring a transposon containing a kanamycin resistance marker. The plasmid-borne transposase is encoded by a variant tnp gene that inserts the transposon into the genome of the recipient strain with very low insertional bias. This method thus allows the creation of large mutant libraries in which transposons have been inserted into unique genomic positions in a recipient strain of either Escherichia coli or Shigella flexneri bacteria. By using bacterial conjugation, as opposed to other methods such as electroporation or chemical transformation, large libraries with hundreds of thousands of unique clones can be created. This yields high-density insertion libraries, with insertions occurring as frequently as every 4-6 base pairs in non-essential genes. This method is superior to other methods as it allows for an inexpensive, easy to use, and high efficiency method for the creation of a dense transposon insertion library. The transposon library can be used in downstream applications such as transposon sequencing (Tn-Seq), to infer genetic interaction networks, or more simply, in mutational (forward genetic) screens.

Creation of a Dense Transposon Insertion Library Using Bacterial Conjugation in Enterobacterial Strains Such As Escherichia Coli or Shigella flexneri

Presented here is a simple method for creating a high-density transposon insertion library in Escherichia coli or Shigella flexneri using bacterial conjugation. This protocol allows the creation of a collection of hundreds of thousands of unique mutants in bacteria by the random genomic insertion of a transposon.

密なトランスポゾン挿入ライブラリを使用して細菌活用腸内細菌系統など、大腸菌や赤痢菌の作成

Transposon mutagenesis is a method that allows gene disruption via the random genomic insertion of a piece of DNA called a transposon. The protocol below ...

Imaging Ca2+ Responses During Shigella Infection of Epithelial Cells

Ca2+ is a ubiquitous ion involved in all known cellular processes. While global Ca2+ responses may affect cell fate, local variations in free Ca2+ cytosolic concentrations, linked to release from internal stores or an influx through plasma membrane channels, regulate cortical cell processes. Pathogens that adhere to or invade host cells trigger a reorganization of the actin cytoskeleton underlying the host plasma membrane, which likely affects both global and local Ca2+ signaling. Because these events may occur at low frequencies in a pseudo-stochastic manner over extended kinetics, the analysis of Ca2+ signals induced by pathogens raises major technical challenges that need to be addressed.
Here, we report protocols for the detection of global and local Ca2+ signals upon a Shigella infection of epithelial cells. In these protocols, artefacts linked to a prolonged exposure and photodamage associated with the excitation of Ca2+ fluorescent probes are troubleshot by stringently controlling the acquisition parameters over defined time periods during a Shigella invasion. Procedures are implemented to rigorously analyze the amplitude and frequency of global cytosolic Ca2+ signals during extended infection kinetics using the chemical probe Fluo-4.

Imaging Ca2+ Responses During Shigella Infection of Epithelial Cells

Here, we present protocols to visualize calcium (Ca2+) responses elicited by HeLa cells infected by Shigella. By optimizing the parameters of bacterial infection and imaging with Ca2+ fluorescent probes, atypical global and local Ca2+ signals induced by bacteria over a large range of infection kinetics are characterized.

上皮細胞の赤痢菌の感染時に Ca2 +応答をイメージング

Ca2+ is a ubiquitous ion involved in all known cellular processes. While global Ca2+ responses may affect cell fate, local variations in free Ca2+ ...

A High-throughput Platform for the Screening of Salmonella spp./Shigella spp.

Fecal-oral transmission of acute gastroenteritis occurs from time to time, especially when people who handled food and water are infected by Salmonella spp./Shigella spp. The gold standard method for the detection of Salmonella spp./Shigella spp. is direct culture but this is labor-intensive and time-consuming. Here, we describe a high-throughput platform for Salmonella spp./Shigella spp. screening, using real-time polymerase chain reaction (PCR) combined with guided culture. There are two major stages: real-time PCR and the guided culture. For the first stage (real-time PCR), we explain each step of the method: sample collection, pre-enrichment, DNA extraction and real-time PCR. If the real-time PCR result is positive, then the second stage (guided culture) is performed: selective culture, biochemical identification and serological characterization. We also illustrate representative results generated from it. The protocol described here would be a valuable platform for the rapid, specific, sensitive and high-throughput screening of Salmonella spp./Shigella spp.

A High-throughput Platform for the Screening of Salmonella spp./Shigella spp.

Salmonella spp./Shigella spp. are common pathogens attributed to diarrhea. Here, we describe a high-throughput platform for the screening of Salmonella spp./Shigella spp. using real-time PCR combined with guided culture.

サルモネラ属菌のスクリーニングのための高スループット プラットフォーム/赤痢菌属

Fecal-oral transmission of acute gastroenteritis occurs from time to time, especially when people who handled food and water are infected by Salmonella ...

Complementary Use of Microscopic Techniques and Fluorescence Reading in Studying Cryptococcus-Amoeba Interactions

To simulate Cryptococcus infection, amoeba, which is the natural predator of cryptococcal cells in the environment, can be used as a model for macrophages. This predatory organism, similar to macrophages, employs phagocytosis to kill internalized cells. With the aid of a confocal laser-scanning microscope, images depicting interactive moments between cryptococcal cells and amoeba are captured. The resolution power of the electron microscope also helps to reveal the ultrastructural detail of cryptococcal cells when trapped inside the amoeba food vacuole. Since phagocytosis is a continuous process, quantitative data is then integrated in the analysis to explain what happens at the timepoint when an image is captured. To be specific, relative fluorescence units are read in order to quantify the efficiency of amoeba in internalizing cryptococcal cells. For this purpose, cryptococcal cells are stained with a dye that makes them fluoresce once trapped inside the acidic environment of the food vacuole. When used together, information gathered through such techniques can provide critical information to help draw conclusions on the behavior and fate of cells when internalized by amoeba and, possibly, by other phagocytic cells.

Complementary Use of Microscopic Techniques and Fluorescence Reading in Studying Cryptococcus-Amoeba Interactions

This paper details a protocol for preparing a co-culture of cryptococcal cells and amoebae that is studied using still, fluorescent images and high-resolution transmission electron microscope images. Illustrated here is how quantitative data can complement such qualitative information.

クリプトコッカスの研究における顕微鏡技術と蛍光読解の補完的利用-アメーバ相互作用

To simulate Cryptococcus infection, amoeba, which is the natural predator of cryptococcal cells in the environment, can be used as a model for ...

A High-throughput Shigella-specific Bactericidal Assay

Serum bactericidal assays (SBAs) measure the functional activity of antibodies and have been used for many decades. SBAs directly measure antibody killing activity by assessing the ability of antibodies in serum to bind to bacteria and activate complement. This complement activation results in the lysis and killing of the target bacteria. These assays are valuable because they go beyond quantifying antibody production to elucidate the biological functions that these antibodies have, allowing researchers to study the role that antibodies may play in preventing infection. SBAs have been used to study immune responses for many human pathogens, but there is no widely accepted methodology for Shigella at present. Historically, SBAs have been very labor-intensive, requiring many time-consuming steps to accurately quantify surviving bacteria. This protocol describes a simple, robust, and high-throughput assay that measures functional antibodies specific for Shigella in serum in vitro. The method described here offers many advantages over traditional SBAs, including the use of frozen bacterial stocks, 96 well assay plates, a micro-culture system, and automated colony-counting. All of these modifications make this assay less labor-intensive and more high-throughput. This protocol is simpler and faster to perform than traditional SBAs while still using simple technologies and readily available reagents. The protocol has been successfully applied in multiple independent laboratories and the assay is robust and reproducible. The assay can be used to assess immune responses in pre-clinical as well as clinical studies. Quantifying shigellacidal antibody titers both before and after antigen exposure (either by immunization or infection) allows for a broader understanding of how functional antibody responses are generated and their contribution to protective immunity. The development of this standardized, well-characterized assay may greatly facilitate Shigella vaccine design.

A High-throughput Shigella-specific Bactericidal Assay

Here we present a protocol to measure Shigellacidal activity of antibodies in serum. Serum is mixed with bacteria and exogenous complement, incubated, and the reaction mixture is plated on agar plates. Viable bacteria form colonies which are counted, using an automated colony enumerator, and used to determine the bactericidal titer.

高スループット赤痢菌-特定の殺菌試験

Serum bactericidal assays (SBAs) measure the functional activity of antibodies and have been used for many decades. SBAs directly measure antibody killing ...