ここでは、ロボットベースのDesign-Build-Test-Learn(DBTL)アプローチを使用して比色ガスセンサーを開発するためのプロトコルを紹介します。このプロトコルは、ハイスループットの自動化、機械学習、多目的最適化を統合して、CO2などのガスを検出するためのセンサーの配合を効率的に検出および最適化し、迅速で費用対効果の高い正確なセンサー開発を可能にします。
この論文では、効率的で高速な比色ガスセンサーの開発を目的としたロボットベースの実験プログラムを紹介します。このプログラムは、自動化された設計-構築-テスト-学習(DBTL)アプローチを採用しており、ガスの異なる濃度間隔に対して複数のレシピを最適化しながら、検索プロセスを繰り返し最適化します。各反復では、アルゴリズムはさまざまな取得関数に基づいてレシピ提案のバッチを生成し、反復回数の増加に伴って、各濃度間隔の重み付け目的関数の値が大幅に向上します。
DBTL メソッドは、パラメーターの初期化から始まり、ハードウェア環境とソフトウェア環境を設定します。ベースラインテストは、パフォーマンス基準を確立します。その後、DBTL法は、各ラウンドのレシピの割合に基づいて次のラウンドの最適化を設計し、パフォーマンスを反復的にテストします。パフォーマンス評価では、ベースラインデータを比較して、DBTLメソッドの有効性を評価します。パフォーマンスの向上が期待を満たさない場合、メソッドは反復的に実行されます。目的が達成された場合、実験は終了します。プロセス全体は、DBTL反復最適化プロセスを通じてシステムパフォーマンスを最大化します。
従来の手動開発プロセスと比較して、この実験プロセスで採用されたDBTL手法は、多目的最適化とさまざまな機械学習アルゴリズムを使用しています。成分体積の上限と下限を定義した後、DBTL法は反復実験を動的に最適化して、最高のパフォーマンスで最適な比率を取得します。この方法は、効率を大幅に向上させ、コストを削減し、最適なレシピを見つける際に、多配合の変数空間内でより効率的に機能します。
ガスセンサの実用化は非常に広範であり、環境モニタリング、航空宇宙、排ガス処理などのさまざまな分野で使用されています1,2,3。ガスセンサの動作原理は、通常、電気化学、ガスクロマトグラフィー、光学などの複数のメカニズムに依存しています。数ある検出機構の中でも、色の変化に基づくものは、他に類を見ない酸塩基機構へと進化しました。低コストでアプリケーションが簡単なため、CO2センサー1,4,5など、多くのポータブルおよび使い捨てガスセンサーの設計に広く使用されています。このタイプのセンサーは、特定の化学物質の色の変化を使用してガス濃度を検出します。ガス濃度が変化すると、センサー材料はイオン錯体化やインジケーターの色の変化などの化学反応を起こし、ガス感受性色素の色が変化します6。色の変化を検出・解析することで、間接的にガス濃度を測定することができます。一方、低コストと携帯性の利点にもかかわらず、このタイプのセンサーには、長い開発サイクルや低効率など、いくつかの欠点があります7,8,9。同時に、従来のセンサー設計方法では、必要な応答時間、可逆性、検出限界の達成など、複数のセンシング特性を同時に満たすのに苦労しています。従来の研究開発パラダイムの下では、これらの困難は比色ガスセンサーの生産と広範な適用を著しく妨げています。
オンデマンドの研究開発における上記の課題に対応して、この実験プロセスを通じて開発された比色センサー技術は、従来のガスセンシングの欠点のいくつかに対処することができます。反復的な設計-構築-テスト-学習(DBTL)アプローチ10,11を採用することにより、センサ開発の効率を大幅に向上させることができ、それにより研究開発時間を短縮し、研究開発1,12のニーズを効果的に満たすことができる。一般的なDBTL開発セットアップでは、新しい材料の開発は反復的なフィードバックループとして捉えられます。ループには4つの主要なステップが含まれています:1.最適化パラメータの設計、ターゲット、および試行実験のためのパラメータ空間のサンプル。2. 選択したパラメータのサンプルを作成します。3.ビルドされたサンプルの目標値をテストします。4.ターゲットフィードバックの機械学習分析により、次のバッチパラメータの選択をガイドします。この反復プロセスでは、サンプルの迅速な構築とテストを可能にするハイスループット実験プラットフォームと機械学習アルゴリズムが主要なコンポーネントです。自動化されたハイスループットテストプラットフォームは、最大384個のセンシングユニットを同時にテストでき、高品質の応答データを大量に収集します。機械学習アルゴリズム13、14、15、16、17、例えば、多目的ベイズ最適化などを利用することにより、センシングユニットの複数のセンシングメトリクス(例えば、感度、応答時間、可逆性)を同時に自動的に最適化することができ、それにより、様々なセンシング特性の全体的な性能を向上させることができる。最適化アルゴリズムによって生成されたセンシングユニットのレシピは、個別のキャリブレーションなしで定量的なCO2濃度検出を達成でき、二乗平均平方根誤差(RMSE)メトリックも必要な指標を満たすことができます。
私たちのプログラムは、比色ガスセンシングに基づいて開発された実験手順です(フローチャートについては図1を参照)。自走式ラボの発展に伴い、自動化されたDBTLアプローチは、その高い効率、速度、および再現性により、優れた見通しを示しています5,12。従来の手動開発プロセスでは、一度に 1 つの変数を調整する従来の手動開発プロセスでは、一度に 1 つの変数を調整した後、別の変数を変更してターゲット パラメーターを最適化し、目的の結果を達成します。このプロセスの主な欠点には、手動実験の効率の低さ、人為的ミスの影響を受けやすいこと、複雑な高次元シナリオでの多次元変数の管理の難しさ、局所最適法にとらわれやすいことなどがあります。この実験プログラムで採用されているDBTL法は、手動の開発プロセスと比較して、ロボティクスと多目的ベイズ最適化などの高度なアクティブラーニングアルゴリズムを組み合わせて使用しています。ベイズ最適化は、評価コストの高い目的関数15,18を最適化するための確率論的アプローチである。サロゲートモデル (多くの場合はガウス過程) を構築して目的関数を近似し、取得関数を使用してサンプリングする次のポイントを決定します。獲得機能は、探索 (サンプリングの少ない領域の検索) と活用 (既知の高パフォーマンス領域の絞り込み) のバランスを取り、グローバルな最大値または最小値を効率的に見つけます。この方法は、従来の最適化手法が苦手な高次元の非凸型探索空間で特に役立ちます。コンポーネントコンテンツの上限と下限を大まかに定義した後、実験を動的に最適化して、最高のパフォーマンスで最適な比率を反復的に取得します。この方法は、効率を大幅に向上させ、コストを削減し、最適なレシピ5,12を開発するための多変数空間内でより効率的に実行します。
この記事の全体的な目標は、機械学習、マルチオブジェクトベイズ最適化、および自動液体処理プラットフォームやハイスループットガステストプラットフォームなどの実験的テストプラットフォームなどのさまざまなコンピューターテクノロジーを通じて、自動DBTL法に基づく実験手順を確立することです。これにより、比色ガスセンサーの設計と研究が可能になります。カスタマイズされた液体ハンドリングロボットプラットフォーム「Opentrons OT-2」は、プログラム設定に従って実験を完了し、レシピの合成、混合、浸漬などのステップを自動的に実行します。自家製のハイスループットガス試験プラットフォームは、ガス試験と比色センサーの読み取りにハイスループットで使用され、ターゲットガスの濃度を正確に制御し、センシングユニットの色の変化をリアルタイムで記録します。DBTLに基づいて設計された他の実験システムと比較して、このシステムは比較的低いハードウェアコストを持っています。同時に、人為的ミスを伴うタスクの側面に、半自動化されたアプローチで部分的に対処しました。DBTL設計の利点を維持しながら、最大の限界利益を提供します。
1.予備実験(フィージビリティテスト)
注:Zhangの論文8に基づいて、二酸化炭素などの対象ガスの化学比色センサーの関連変数を選択できます。比色センサーの定式化のオンデマンド最適化を実行する前に、次の手順を使用して予備実験を実施して、可変空間を確立することができます。
2. ロボット実験プラットフォームを利用して、Design-Build-Test-Learn(DBTL)反復最適化プロセスを実施します。
3. 最適な比色センサーアレイの構築と特性評価
4. 比色センサーアレイのキャリブレーション
この実験装置の典型的な例は、「Wide-Range High-Sensitive Colorimetric CO2 Sensor Array」12です。まず、実験では、ベイズ多目的最適化後の固定 CO2 濃度での ΔE の経時変化に基づいてグラフを生成します (図 7A)。その応答時間、ΔE、および可逆性の低さに基づいて、不要な1(応答時間が遅い)、不要な2(応答しない)、および不要な3(ベースラインドリフト)は、必要な応答時間を満たす最高の感度のレシピを達成するように目標が設定されている多目的ベイズ最適化関数によって排除する必要があります。ただし、図7Bの左側に示されているように、目的値を直接加算すると、不要なサンプルと優先サンプルの違いが明確でなくなり、アルゴリズム主導の最適化が遅れる可能性があります。したがって、シグモイド法は、さまざまな目的間でバランスの取れたパフォーマンスを優先するために、センサーの開発に適用されました。シグモイド関数は、センサーレシピを評価およびフィルタリングするためのスムーズな翻訳メカニズムとして使用されます。この機能により、任意のターゲット特性(応答時間、可逆性、ΔEなど)のスコアが、定義されたしきい値を下回ると0に近づき、それを超えると1に近づくようになります。すべてのターゲットのスコアを乗算することにより、いずれかの特性がしきい値を満たさない場合、最終的な加重スコアは大幅に減少し、他の領域での優れたパフォーマンスに関係なく、最適でないレシピを効果的に除外します。解析後の最終スコアをチャートにプロットし(図7B)、最終的に「好ましい」比率が優れているかどうかを確認し、各ラウンドでスクリーニングの最適化を完了しました。このセンシングにより、ユニットは100秒未満で応答しながら最高の感度を示します。
数回にわたる最適化とスクリーニングの結果、最適化レシピの総合スコアの総合スコアは、固定のCO2 濃度で大幅に改善され、比色センシング性能が大幅に向上しました(図7C)。4 回の反復後、最高スコアは基本的に変わらない可能性が高く、準グローバル最大値に達したことを示します。この時点で、各 CO2 濃度間隔で最も高いスコアを持つ上位 6 つの組成を選択することで、最適な製品配列を形成できます。最適な製品アレイを最適化・組み合わせることで、広範囲で高感度な比色ガスセンシングアレイを実現することができます。
最後に、ターゲットセンシングアレイの感度を評価するために、各同一の配合のすべてのセンシングユニットの平均RGB値を取ります。次に、6 つのセンシング定式化の平均 RGB 値を応答ベクトルの形式で接続します。応答ベクトルから CO2 濃度を可逆的に予測するには、リッジ回帰モデルを使用してデータを近似します。最終的には、二酸化炭素濃度の平均絶対誤差が0.27%に達すると計算することができます(図7D)。
図1:フローチャート。 DBTL の周期的な実験は、パラメーターの初期化とハードウェアおよびソフトウェア環境のセットアップから始まります。ベースラインテストは、パフォーマンス標準を確立します。その後、DBTL法は、メモリレイアウトの最適化調整をテストおよびガイドすることにより、さまざまなセンサーレシピの実際のパフォーマンスを特定します。パフォーマンス評価では、ベースラインデータを比較して、DBTLメソッドの有効性を評価します。性能の向上が期待を満たさない場合は、メソッドを再調整し、反復テストを実施します。目標が達成されると、実験は終了します。プロセス全体は、グローバルに最適なレシピを見つけるために繰り返し最適化されます。 この図の拡大版を表示するには、ここをクリックしてください。
図2:実験準備のためのパラメータ調整と実験シナリオ。 (A) 座標設定:異なる口径のチップカートリッジの位置は、座標2、3、6、および9で設定されます。変数「location」は、異なるニードルトレイの位置を記録するために使用されます。ニードルトレイの座標位置は、X軸とY軸に分割されています。変数「init_well_num」は、ニードルトレイの座標位置を記録するために使用されます。(B)チップカートリッジはリキッドハンドラーの左上隅の位置に配置され、X軸は1〜12に分割され、Y軸はAHに分割されます。座標を記録するときは、最初にY軸の座標が記録され、次にX軸の座標が記録されます。(C)シミュレーション実験:実際の液抽出は行いません。設定ファイルが正常に動作しているかどうか、通信、データベース、ログにエラーがないか確認します。 この図の拡大版を表示するには、ここをクリックしてください。
図3:ピペッティング操作 (A)液体吸引:チップカートリッジ付きのロボットアームを使用して、事前に設定された座標位置にあるソース溶液チューブから必要な溶液を吸引します。(B)ミキシング:ディープウェルプレートをあらかじめ設定した周波数で振とうし、抽出した溶液を均一に混合します。(C)分注:混合後、小さなウェルから溶液を試験用ポリテトラフルオロエチレンメンブレンの事前定義されたスポットに分注し、96ウェルすべてに対してこのプロセスを繰り返します。 この図の拡大版を表示するには、ここをクリックしてください。
図4:実験データの記録と浸漬スポットのボックス選択 (A)膜番号とガス試験ID、ガス試験の日付/タイミング情報を含む:実験のトレーサビリティと精度を確保するために、最近の実験で使用されたベントコードと膜を含むリストを作成し、その後の分析に使用します。(B)ボックス選択:図の左半分はサンプルのない領域です。図の右半分は、比色センサーを備えたメンブレン上の領域です。ボックスを選択するプロセスでは、センサーの精度を保証するために、各検出ポイントの包括的なカバレッジを確保することが重要です。ボックスの選択が完了すると、システムは自動的に写真を撮影し、その後の比色分析を実行します。 この図の拡大版を表示するには、ここをクリックしてください。
図5:多目的関数の構成。 システムは、ベイズ多目的最適化に基づいて新しい解レシピを生成し、新しいレシピの ID 情報を表示します。設定ファイルに設定された上限と下限に基づいて、各レシピに必要な量を動的に調整し、次の反復サイクルに備えます。 この図の拡大版を表示するには、ここをクリックしてください。
図 6.サロゲートモデルの視覚化。 (A)1次元変数(ここでは染料の量)の代理モデルで、他の変数は一定に保たれています。(B)2次元変数(ここでは、染料の量とポリエチレングリコールの量)の代理モデルで、他の変数は変更されません。略語:PEG =ポリエチレングリコール。 この図の拡大版を表示するには、ここをクリックしてください。
図7:広範囲のCO2 センサ を開発するためのセットアップの使用例のデータ分析(A) 特定のCO2 濃度範囲内の優先センシングユニットと3つの最適でないセンシングユニットの応答曲線。灰色の曲線は異なる時間でのCO2 濃度であり、色付きの曲線は応答色の変化です。 (B) 優先センシングユニットの4つの対物レンズ(感度、可逆性、応答時間、および応答強度)と、多目的機能を使用する前後の3つの最適でないセンシングユニットのスコア。シグモイド多目的関数の後、目的関数に関して、好ましいレシピは望ましくないレシピから分離されました。 (C) 0.04%〜0.2%のCO2 濃度範囲に対するベイズ最適化実験の5ラウンド以内のセンシングユニットのスコア分布のスコア分布。アルゴリズムの推奨レシピの目標値が増加し、センシングユニットのパフォーマンスが向上しました。 (D) 単一のセンサーの検量線とそのテストデータ。この図はChen et al.1から取得しました。 この図の拡大版を表示するには、ここをクリックしてください。
この記事では、比色ガスセンサーをより迅速かつ正確に開発できる実験的なデザインを提案します。この実験プロセスは、湿度、CO2、アンモニア1,4,5などのさまざまなガスの比色センサーの開発に使用できます。このプラットフォームの方法により、干渉ガスの存在、湿度、その他のさまざまな実験シナリオを考慮して、高感度、低検出限界、必要な応答時間など、さまざまな好みを持つユーザーのニーズを満たすことができます。センサーレシピの調整可能なパラメーターを動的に調整して、前提条件のターゲット要件を満たします。例えば、より高い感度と可逆性が求められるターゲットセンサーを設計する場合、機械学習スクリーニングのたびにセンシング性能の感度と可逆性の重みパラメータを増加させて最適な比率にすることで、オンデマンドでの研究開発の最適化を実現できます。センサーの性能は、多くの場合、多次元探索空間でグローバルに最適なレシピを見つけることができるかどうかに関係しています。従来の実験計画では、実験の最適化サイクルが長く、手作業による作業負荷が大きかず、大きな誤差が生じていました19。しかし、比色ガスセンサーの設計には、実験の効率と精度に対する厳しい要件があるため、高次元パラメータ宇宙ガスの実験設計は、そのような実験20,21に対する重大な障害と見なされています。
この実験では、自動液体処理、プログラム制御のマスフローコントローラー、高速カメラなどの機能を統合した自動実験プラットフォームを利用することで、この障害に対処し、1つのバッチで最大96個のセンシングユニットの準備とテストを可能にします。この自動化された実験プラットフォームとDBTL法により、複数の周期的な反復を通じて、ガスセンサー製剤のさまざまなソース溶液の投与量比が多変量空間内のグローバル最適に徐々に調整され、多目的グローバル最適化が達成されました。これにより、実験の質、研究開発の効率が大幅に向上し、最適化サイクルが短縮されました12。
異なる比色ガスセンサーの設計では、ステップ0の実験前段階でターゲットを絞った設計が必要です。実験結果に影響を与える可能性のある変数をスクリーニングして、後続の実験の比色効果に強い影響を与えるソースエージェントを特定する必要があります。
さらに、実験内容を変更して、比色液体センサーを設計することもできます。例えば、対象液の特性に応じて、適切な指示薬、溶剤、およびその他の添加剤。ガス試験プラットフォームは、試験のための液体環境に適応するように再設計することができ、新しい試験プロトコルと実際のアプリケーションで液体環境をシミュレートするための機器を開発します。多孔質フィルムや特殊コーティングなどの適切な基板材料を選択して、液体との吸収と反応を強化します22,23。試験プラットフォームと実験プロセスを調整した後、比色液体センサーの開発実験を行うことができます。
DBTLループを使用する利点は、主に時間の節約、検出範囲の拡大、および高感度の達成にあります。機械学習(DBTLでは「L」)フェーズでは、パラメータナビゲーションのための機械学習アルゴリズムの統合により、この開発アプローチが高次元空間で貴重な情報を効果的に発見することが可能になり、それによってセンサ開発の効率が向上する24,25。さらに、DBTLループは、複数のセンサーユニットの性能を同時に最適化し、各ユニットを特定の濃度間隔に最適化できるため、より広い検出範囲とより高い感度を実現できます。マルチパラメータ次元での多目的動的最適化は、センサーの全体的な性能を向上させるのにも役立ち、ローカル最適5,26に陥るのを防ぎます。
DBTLのアプローチは、比色ガスおよび液体センサーの開発に限定されません。十分な資金があれば、上記の方法は、新薬合成や高価値材料27,28,29などの他の材料の研究開発にも拡張できる。さまざまな材料特性とアプリケーション要件については、実験プラットフォーム(ビルド)および(テスト)パーツの特定のプロセスと詳細を変更します。最適化アルゴリズムやパラメータ設定を調整した後、他の高価値材料の研究開発を行うことが可能です。さらに、その潜在的な応用は幅広い科学分野にまで及びます。たとえば、機械構造設計の分野では、DBTLアプローチは、特に航空宇宙、自動車、ロボット工学のアプリケーション向けの軽量コンポーネントなどの複雑な構造を最適化するために、変革をもたらす可能性があります。自動化と機械学習の統合により、ハイスループットの実験とデータドリブンな意思決定が可能になり、従来の研究開発プロセスに関連する時間とコストが大幅に削減されます。DBTLの方法論は、設計、製造、テストのコンポーネントをさまざまな分野の特定の要件に適合させることで、分野を超えてイノベーションを推進するための多用途で変革的なアプローチを提供します。
著者は、宣言する利益相反を持っていません。
この研究は、浙江省自然科学財団(LQ24F040006)と深セン先端技術大学のスタートアップファンドの支援を受けています。
Name | Company | Catalog Number | Comments |
96-Well Deep Well Plate | NEST | NEST 2 mL 96-Well Deep Well Plate, V Bottom | |
96-Well PCR Plate | NEST | NEST 0.1 mL 96-Well PCR Plate | |
cresol red | sigma aldrich | 1.05225 | Dyes for colorimetric reagents |
Ethyl cellulose | sigma aldrich | 200689 | Dyes for colorimetric reagents |
Ethyl cellulose | Aladdin | E110670-100g | Additive |
Industrial Camera | HKVision | MV-CS060-10UM/C-PRO | used for recording color changes |
Liquid handler | Opentrons | OT2 | liquid handler |
Mass Flow Controller | ASERT | AST10-DLCMX-500C-042-A2B2-48VY | used in controlling analytes gas mixtures |
m-cresol purple | sigma aldrich | 1.05228 | Dyes for colorimetric reagents |
Opentrons OT-2 Tips | Opentrons | OT-2 Tips, 300µL | |
Opentrons OT-2 Tips | Opentrons | OT-2 Tips, 20µL | |
phenol red | sigma aldrich | 1.07241 | Dyes for colorimetric reagents |
polyethylene glycol | sigma aldrich | P1458 | Dyes for colorimetric reagents |
PTFE film | Interstate Specialty Products | PM15M | PTFE mambrane |
Tetrabutylammonium hydroxide | sigma aldrich | 86854 | Base for colorimetric reagents |
thymol blue | sigma aldrich | 1.08176 | Dyes for colorimetric reagents |
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