מטבולומיקה ממוקדת על תאים ראשוניים נדירים

המטרה העיקרית של המעבדה שלי היא לשמור על תאי גזע המטופויטיים בריאים שמושכים למעלה בהזדקנות כדי למנוע ממאירויות המטולוגיות, ואנחנו עושים זאת על ידי ביצוע התערבויות תזונתיות. לכן, בפרט, אנו מעוניינים להבין כיצד מטבוליטים שמקורם בתזונה מווסתים את הגבעול וגם מטבוליטים תוך-תאיים כיצד הם מווסתים את גורל תאי הגזע. תאי גזע המטופויטיים הם אוכלוסייה נדירה מאוד, כלומר אנו תמיד מתמודדים עם האתגר שאין לנו מספיק חומר לבצע את הניסויים שלנו.

אבל עכשיו עם הקמת שיטות תא בודד, וגם עם שיטות קלט נמוך, השגנו ידע חדש על איך תאי גזע אלה מוסדרים. תאי גזע המטופויטיים הם אוכלוסייה נדירה מאוד ובנוסף, הם זעירים מאוד. עכשיו, עם השיטות שפיתחנו כאלה, למשל, מטבולומיקה קלט נמוך מבוסס על מפרט מסה, אנחנו עכשיו יכולים לזהות עם מספר נמוך מאוד של תאים, מאות מטבוליטים, זה איפשר לנו עכשיו להבין מה התפקיד של מטבוליטים מסוימים עבור ויסות תאי גזע.

בעבר, ניתוח מטבולומי של תאים ראשוניים נדירים דרש עכברים רבים וימי עבודה והכנת דגימות. עם הפרוטוקול החדש שלנו, אנו זקוקים לפחות עכברים ופחות זמן. בנוסף, צמצמנו את מספר השלבים הידניים, כך שהפרוטוקול כולו הופך לחזק יותר.

בעתיד, תכננו להתאים את פרוטוקול הקלט הנמוך שלנו כדי לאפשר ניתוח נוסף ותאים ראשוניים נדירים. לדוגמה, מטבולומיקה לא ממוקדת וליפידומיקה.