יישור נתוני סדרות זמן מסונכרנות באמצעות מודל אפיון אובדן מחזור התא לצורך השוואות בין ניסויים

אתגר מרכזי בניתוח ניסויים בסדרות זמן הוא שלעתים קרובות הם נבדלים זה מזה במשך ההתאוששות מסנכרון ובתקופת מחזור התא. כך שלא ניתן להשוות או לנתח בקלות מדידות מניסויים שונים במצטבר ללא יישור. יישור קו החיים של שעונים הוא שיטה להשוואות ספציפיות לשלב ורלוונטיות ביולוגית בין ניסויים ולצבירת ניסויים משוכפלים מרובים, ששניהם היו בעבר קשים או בלתי אפשריים.

בעבר נעשו השוואות ספציפיות לשלב מסוים ורלוונטיות ביולוגית על ידי מעקב אחר אירועים פורצי דרך. עם זאת, באמצעות שיטות אד הוק אלה, הבדלים עדינים אך חשובים עדיין לא מזוהים. השוואה בין ניסויים בסדרות זמן קשה במיוחד בין ניסויים עם הבדלים משמעותיים בתזמון, כגון באוכלוסיות מוטנטיות או בתנאי גדילה המשפיעים על זמן ההתאוששות המסונכרן או על תקופת מחזור התא.

יישור קו החיים של השעונים מאפשר השוואה ספציפית לשלב במקרים אלה. השתמשנו בשעונים כדי ליישר נתונים שעתוק ופרוטאומי של סדרות זמן, מה שאיפשר השוואה ישירה בין הדינמיקה של ה-mRNA לבין החלבון המתאים. יתר על כן, אנו מתאימים ניסויים בסדרות זמן בין מינים שונים, ומספקים תובנות קריטיות לגבי שינויים אבולוציוניים במחזור התא.