המחברים מבקשים להודות ל Biosecurity המושבה הטיקאית (מחלקת קווינסלנד לחקלאות ודיג באוסטרליה) על אספקת Rhipicephalus microplus קרציות מנוצל עבור מחקר זה, ו לוקאס Karbanowicz לעזרה עם צילומי וידאו.

1. דיסקציה של אפיתל גוט מ ר microplus <ol style=";text-align:right;direction:rtl"><li style=";text-align:right;direction:rtl"> איסוף קרציות חצי מבושל מן הבקר ביום הניסוי. לנתח מתקתק בתוך 24 שעות לאחר הסרת מן המארח. </li><li style=";text-align:right;direction:rtl"> לדבוק רצועת סרט דביק לתחתית של צלחת פטרי 92 מ&quot;מ x 16 מ&quot;מ פטרי. הוסף טיפה של דבק סופר לקלטת. מניחים את סמן, בצד הגחון על הדבק סופר, לאפשר יבש במשך 2 דקות. </li><li style=";text-align:right;direction:rtl"> יוצקים 100 מ&quot;ל של פוספט שנאגרו מלוחים (PBS) לתוך צלחת פטרי, או עד הקופסה הוא שקוע לחלוטין. </li><li style=";text-align:right;direction:rtl"> ניצול בגודל 11 אזמל, לחתוך מן החלק העליון של העיניים אל התחתונים התחתונים, משני צידי הקופסה. </li><li style=";text-align:right;direction:rtl"> בעזרת מלקחיים סטרילית, להסיר לחלוטין את כיח ואת alloscutum , כדי לחשוף את האיברים הפנימיים. </li><li style=";text-align:right;direction:rtl"> הסר את החוט הלבן כמו אברים (קנה הנשימה) ו ממברנות אחרות כדי למנוע זיהום. </li><li style=";text-align:right;direction:rtl"> הסר את המעיים באמצעות מלקחיים, על ידי צובט את האזור העליון ומשוך מפֶּגֶר. הסר את כל רקמות הבטן הנותרים, להבטיח כי לא רקמות אחרות כבר גזור. </li><li style=";text-align:right;direction:rtl"> חנות gut ב קר קרח קר של תמיסת מלח מאוזן (HBSS) ללא סידן כלורי ו מגנזיום גופרתי עם קוקטייל מעכב proteinase (PIC). הצמד להקפיא את האומץ בקרח יבש לאחסן ב -20 מעלות צלזיוס. הערה: כדי לסייע לנתיחה בטן ופרטים של האיברים הפנימיים של תפר עיין בפרק 3.1 של ד &#39;Sonenshine, &quot;ביולוגיה של קרציות&quot; 19 . </li></ol> 2. דיסוציאציה תא אפיתל <ol style=";text-align:right;direction:rtl"><li style=";text-align:right;direction:rtl"> יוצקים את המעיים גזור על מסנן תא 70 מיקרומטר בתוך צינור 50 מ&quot;ל. </li><li style=";text-align:right;direction:rtl"> שטפו את רקמת הבטן עם 50 מ&quot;ל קר HBSS קר עם PIC עד הפתרון פועל ברור, ואת האומץ לקחת על המראה לבן / ברור. </li><li style=";text-align:right;direction:rtl"> Re- להשעות האומץ ב 30 מ&quot;ל קר HBSS קר עם PIC, מערבבים בעדינות צנטריפוגה ב XG 500 ב 4 מעלות צלזיוס למשך 10 דקות כדי גלולה המעיים. הסר את supernatant וחזור על תהליך לשטוף שלוש פעמים. </li><lI&gt; כדי לעקור תאי המעיים אפיתל, מחדש להשעות את המעיים ב 10 מ&quot;ל של תרבית תאים בינוני בינוני Dulbecco שונה הנשר (DMEM), 2% עגל בסרום (FCS), 0.5 mM ethylenediaminetetraacetic חומצה (EDTA), 1 מ&quot;מ טריס (2 Carboxyethyl) פוספין (TCEP), PIC ו דגירה של 60 דקות על 37 מעלות צלזיוס תחת סיבוב איטי באמצעות רולר ב 6 סל&quot;ד. </li><li style=";text-align:right;direction:rtl"> מסנן את ההשעיה באמצעות מסננת תא 250 מיקרומטר, מערבולת הזרימה דרך ומסנן דרך מסננת 70 מיקרומטר התא לאסוף את זרימת הנותרים דרך. </li><li style=";text-align:right;direction:rtl"> צנטריפוגה ההשעיה ב XG 500 ב 4 מעלות צלזיוס למשך 20 דקות כדי גלולה תאים בודדים. </li></ol> 3. בידוד של תאים אפיתל יחיד באמצעות שיפוע צנטריפוגה שיפוע <ol style=";text-align:right;direction:rtl"><li style=";text-align:right;direction:rtl"> הכן צפיפות צנטריפוגה שיפוע ( למשל , Percoll) על ידי סינון באמצעות נייר AP15 מראש מסנן. הכן 40% ו Percoll 20% ב mqH 2 0 (V / V) ו מגניב על 4 מעלות צלזיוס למשך 1 שעות לפני שכבת שיפוע. </li><li style=";text-align:right;direction:rtl"> שימוש peristalticהמשאבה להגדיר את המהירות הנמוכה ביותר, שכבת 3 מ&quot;ל של 40% צפיפות צנטריפוגה צנטריפוגה צינור 16 ultracentrifuge, ומאפשר לה להתיישב על קרח במשך 15 דקות. המהירות של המשאבה צריכה להוביל &lt;1 מ&quot;ל לכל שיעור הזרימה המינימלית. </li><li style=";text-align:right;direction:rtl"> הטיית הצינור ל זווית 45 °, להשתמש המשאבה peristaltic שכבת 20% צפיפות צנטריפוגה שיפוע על גבי השכבה 40%. מהירות המשאבה צריכה להוביל ל &lt;1 מ&quot;ל לכל שיעור הזרימה המינימלית. אפשר השכבות להתיישב על קרח במשך 15 דקות. </li><li style=";text-align:right;direction:rtl"> השתמש המשאבה peristaltic ב &lt;1 מ&quot;ל לכל שיעור הזרימה המינימלית לשכבה 3 מ&quot;ל של DMEM בינוני המכיל תאים בטן לתקתק מעל 20-40% צפיפות צנטריפוגה שיפוע. </li><li style=";text-align:right;direction:rtl"> תוכנית צנטריפוגה להאצת מקסימלית האטה מינימלית. צנטריפוגה ב XG 600 במשך 10 דקות. איסוף interphases בין DMEM: 20% צפיפות צנטריפוגה שיפוע, ואת 20%: 40% צפיפות צנטריפוגה gradients לבודד תאים בודדים אפיתל. חנות שנאספו interphases ב 4 מעלות צלזיוס עבור ניתוחים הבאים. </li></ol><html> 4. הערכת בידוד התא <ol style=";text-align:right;direction:rtl"><li style=";text-align:right;direction:rtl"> המיאצטומטר <ol style=";text-align:right;direction:rtl"><li style=";text-align:right;direction:rtl"> לנקות את שקופית hemacytometer עם אלכוהול. </li><li style=";text-align:right;direction:rtl"> . Re- להשעות את התאים על ידי pipetting בעדינות את התאים למעלה ולמטה. פיפטה 100 μL ההשעיה התא במקום צינור microcentrifuge 1.5 מ&quot;ל. </li><li style=";text-align:right;direction:rtl"> הוסף 400 μL של 0.4% Trypan כחול. בעדינות לערבב על ידי לחיצה על הצינור. </li><li style=";text-align:right;direction:rtl"> פיפטה 100 μL של ההשעיה תא כחול Trypan מטופלים לאט למלא שני החדרים של hemocytometer. </li><li style=";text-align:right;direction:rtl"> מניחים את hemocytometer תחת מיקרוסקופ אור, תוך התמקדות קווי הרשת של hemocytometer עם מטרה 10X. </li><li style=";text-align:right;direction:rtl"> באמצעות מונה ידית יד, לספור את התאים חיים ללא כתם בתוך קבוצה של 16 ריבועים. בתוך אותו ריבוע, ספור את התאים הכחולים המתים. המשך לספור עד שייספרו ארבע קבוצות של 16 ריבועים. </li><li style=";text-align:right;direction:rtl"> חישוב התאים הכולל לכל מ&quot;ל באמצעות הנוסחה: 47eq1.jpg &quot;/&gt; </li><li style=";text-align:right;direction:rtl"> חישוב אחוז הכדאיות התא באמצעות הנוסחה: <img alt="משוואה 2" src="/files/ftp_upload/55747/55747eq2.jpg" /></li></ol></li><li style=";text-align:right;direction:rtl"> תא מבודד ויזואליזציה <ol style=";text-align:right;direction:rtl"><li style=";text-align:right;direction:rtl"> לדלל 1 μL של תאים מבודדים μL 9 של HBSS בצינור microcentrifuge 1.5 מ&quot;ל. קפיצי microcentrifuge את הצינור בעדינות כדי לערבב. </li><li style=";text-align:right;direction:rtl"> פיפטה 5 μL של תאים מבודדים ב HBSS באמצע שקופית זכוכית. החל שלוש טיפות של המדיום גובר עם 4 &#39;, 6-diamidino-2-phenylindole (DAPI). </li><li style=";text-align:right;direction:rtl"> דגירה את השקופית בטמפרטורת החדר למשך 5 דקות. בזהירות במקום להחליק להחליק על ההכנה, הימנעות בועות אוויר. </li><li style=";text-align:right;direction:rtl"> דמיינו תאים מוכתמים DAPI ב עירור 360 ננומטר פליטה ב 460 ננומטר תחת מיקרוסקופ פלואורסצנטי. </li></ol></li></ol> 5. Cell Cell חלבון Biotinylation <ol style=";text-align:right;direction:rtl"><li style=";text-align:right;direction:rtl"> Biotinylate 100 μL של תאים תא אפיתל יחיד באמצעות Biotin (סוג A) הצמידהKit, על יחס טוחנת של 1: 1 חלבון פני השטח כדי מצומד, בהתאם להוראות היצרן </li><li style=";text-align:right;direction:rtl"> עבור תמוגה התא, להוסיף 100 μL של PBS, 1% Triton X-100, גליצרול 10%, 100 מיקרומטר גלוטתיון חמצון PIC לתאים biotinylated. דגירה על קרח במשך 1 שעות עם ערבוב עדין כל 10 דקות. </li><li style=";text-align:right;direction:rtl"> צנטריפוגה תאים biotinylated ב XG 20,000 ב 4 מעלות צלזיוס למשך 20 דקות כדי גלולה חומר מסיס. איסוף supernatant המכיל cytoplasmic, חלבונים הממברנה biotinylated. </li><li style=";text-align:right;direction:rtl"> לקבוע את ריכוז החלבון באמצעות assay Bradford. </li></ol> 6. בידוד של חלבונים פנימיים Biotinylated <ol style=";text-align:right;direction:rtl"><li style=";text-align:right;direction:rtl"> הוסף 50 μL של חרוזים מגנטיים Streptavidin לתוך צינור microcentrifuge 1.5 מ&quot;ל. </li><li style=";text-align:right;direction:rtl"> מניחים את הצינור לתוך מעמד מגנטי, איסוף חרוזים כנגד הצד של הצינור. הסר וזורקים את supernatant. </li><li style=";text-align:right;direction:rtl"> הוסף 1000 μL של TBS, 0.1% Tween-20 לצינור. מערבבים בעדינות ולאסוף את החרוזים עם סטן מגנטיד. הסר וזורקים את supernatant. </li><li style=";text-align:right;direction:rtl"> שלב 40 מיקרוגרם של חלבונים משטח התא biotinylated, מדולל μL 300 ב 1x PBS עם חרוזים מגנטיים שטף. לדגור על 2 שעות בטמפרטורת החדר עם תסיסה. </li><li style=";text-align:right;direction:rtl"> לאסוף את החרוזים עם מעמד מגנטי, להסיר ולזנוח supernatant. </li><li style=";text-align:right;direction:rtl"> הוסף 300 μL של TBS, 0.1% Tween-20 לצינור, בעדינות ערבוב כדי להשעות מחדש את החרוזים. איסוף חרוזים, להסיר ולזנוח supernatant. חזור על צעד זה לשטוף פעמיים. </li><li style=";text-align:right;direction:rtl"> הוסף 100 μL של 0.1 M גליצין pH 2.0 חרוזים מגנטיים, ו דגירה בטמפרטורת החדר למשך 5 דקות. איסוף חרוזים ולהסיר supernatant המכיל eluted biotinylated חלבונים פני השטח. </li><li style=";text-align:right;direction:rtl"> דמיינו חלבונים משטח מבודד על ג&#39;ל 4-20% Tris-MOPS SDS-PAGE. </li></ol> 7. הערכה של חלבונים פנימיים Biotinylated <ol style=";text-align:right;direction:rtl"><li style=";text-align:right;direction:rtl"> נקודה כתם <ol style=";text-align:right;direction:rtl"><li style=";text-align:right;direction:rtl"> חותכים 7 ס&quot;מ x 3 ס&quot;מ רצועה של קרום nitrocellulose. </li><li style=";text-align:right;direction:rtl"> החל 10 מיקרוגרם סך הכל סמןתוכן (מ 1.8 לעיל), ו 10 מיקרוגרם של חלבון פני השטח biotinylated על הממברנה. אפשר ייבוש במשך 15 דקות בטמפרטורת החדר. </li><li style=";text-align:right;direction:rtl"> העברה למכל ו לצלול ב 100 מ&quot;ל של חיץ חסימה. דגירה בטמפרטורת החדר עם תסיסה במשך שעה. מחק חסימת חיץ. </li><li style=";text-align:right;direction:rtl"> לשטוף nitrocellulose קרום μL 100 μL, 0.05% Tween-20 במשך 5 דקות עם תסיסה. בטל לשטוף חיץ לחזור על שוטף שלוש פעמים. </li><li style=";text-align:right;direction:rtl"> דגירה ב 1/5000 Streptavidin חזרת peroxidase (HRP) ב 100 μL PBS, 0.05% Tween-20 עבור 2 שעות עם תסיסה בטמפרטורת החדר, ולבטל כל פתרון שנותר. </li><li style=";text-align:right;direction:rtl"> לשטוף nitrocellulose קרום μL 100 של PBS, 0.05% Tween-20 במשך 5 דקות עם תסיסה. מחק חיץ לשטוף וחזור לשטוף שלוש פעמים. </li><li style=";text-align:right;direction:rtl"> לזיהוי, להמיס 1 טבליה של 4-chloro-1-napthol ב 10 מ&quot;ל של מתנול קר כקרח. הוסף 4 מ&quot;ל של מלאי מתנול ל 20 מ&quot;ל של כפות. הוסף 10 μL של מי חמצן טריים 30% ו immediaTely להחיל על קרום nitrocellulose. </li><li style=";text-align:right;direction:rtl"> דגירה עם תסיסה בטמפרטורת החדר עד המצע מייצר מוצר סוף כחול מסיס. פעולה זו עשויה להימשך בין 2-15 דקות. </li><li style=";text-align:right;direction:rtl"> מחק פתרון איתור לשטוף את הממברנה שלוש פעמים μl 100 μL 2 O. </li></ol></li><li style=";text-align:right;direction:rtl"> אסאי ELISA <ol style=";text-align:right;direction:rtl"><li style=";text-align:right;direction:rtl"> לדלל 200 ng של כל מדגם עם 400 μL של 100 מ&quot;מ חיץ ציפוי קרבונט מעיל 2 נתיבים של השורה הראשונה (A #) של צלחת אליסה (בארות תחתית שטוחה) </li><li style=";text-align:right;direction:rtl"> הוסף 100 μL של חיץ ציפוי 100 מ&quot;מ קרבונט לכל בארות המתאימים אחרים בשורות (BH). </li><li style=";text-align:right;direction:rtl"> הכנת דילולים סדרתי של כל מדגם על ידי pipetting 100 μL מכל טוב בשורה A, והעברת לתוך שורה ב לערבב בעדינות על ידי pipetting ולהימנע בייצור בועות. חזור על דילולים למטה כל שורה, להשליך את 100 μL הסופי מכל טוב בשורה H. </li><li style=";text-align:right;direction:rtl"> מכסים את הצלחת עם parafilm ו דגירה על 4 מעלות צלזיוס למשך הלילה. </li><li style=";text-align:right;direction:rtl"> לשטוף את platדואר עם 200 μL PBS, 0.05% Tween-20 לכל טוב שלוש פעמים. </li><li style=";text-align:right;direction:rtl"> הוסף 200 μL של חיץ חסימת על בארות מצופה, לכסות עם Parafilm ו דגירה על 4 מעלות צלזיוס למשך הלילה. </li><li style=";text-align:right;direction:rtl"> לדלל 1 / 15,000 Streptavidin-HRP לחסום חיץ ולהוסיף 100 μL היטב כל צלחת. כיסוי עם parafilm ו דגירה על 4 מעלות צלזיוס למשך הלילה. </li><li style=";text-align:right;direction:rtl"> לשטוף את הצלחת 200 μL PBS, 0.05% Tween-20 לכל טוב חמש פעמים. </li><li style=";text-align:right;direction:rtl"> כדי לזהות, להוסיף 100 μL של מגיב TMB לכל טוב. לאחר פיתוח צבע מספיק, בדרך כלל בין 10-15 דקות, להוסיף 100 μL של 1 M חומצה זרחתית לעצור את התגובה. </li><li style=";text-align:right;direction:rtl"> קרא את ספיגת כל טוב ב λ = 450nm. </li></ol></li></ol>

<ol>
	<li>Rodriguez-Valle, M., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Efficacy+of+Rhipicephalus+(Boophilus)+microplus+Bm86+against+Hyalomma+dromedarii+and+Amblyomma+cajennense+tick+infestations+in+camels+and+cattle.">Efficacy of Rhipicephalus (Boophilus) microplus Bm86 against Hyalomma dromedarii and Amblyomma cajennense tick infestations in camels and cattle.</a> Vaccine. 30, 3453-3458 (2012).</li><li>De Rose, R., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Bm86+antigen+induces+a+protective+immune-response+against+Boophilus+microplus+following+DNA+and+protein+vaccination+in+sheep.">Bm86 antigen induces a protective immune-response against Boophilus microplus following DNA and protein vaccination in sheep.</a> Vet. Immunol. Immunopathol. 71, 151-160 (1999).</li><li>Garc&#237;a-Garc&#237;a, J. C., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Sequence+variations+in+the+Boophilus+microplus+Bm86+locus+and+implications+for+immunoprotection+in+cattle+vaccinated+with+this+antigen.">Sequence variations in the Boophilus microplus Bm86 locus and implications for immunoprotection in cattle vaccinated with this antigen.</a> Exp. Appl. Acarol. 23, 883-895 (1999).</li><li>Abbas, R. Z., Zaman, M. A., Colwell, D. D., Gilleard, J., Iqbal, Z. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Acaricide+resistance+in+cattle+ticks+and+approaches+to+its+management:+The+state+of+play.">Acaricide resistance in cattle ticks and approaches to its management: The state of play.</a> Vet. Parasitol. 203, 6-20 (2014).</li><li>Kearney, S. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=.">.</a> Acaricide (chemical) resistance in cattle ticks. , (2013).</li><li>Foil, L. D., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Factors+that+influence+the+prevalence+of+acaricide+resistance+and+tick-borne+diseases.">Factors that influence the prevalence of acaricide resistance and tick-borne diseases.</a> Vet. Parasitol. 125, 163-181 (2004).</li><li>Rodriguez, M., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=High+level+expression+of+the+B.+microplus+Bm86+antigen+in+the+yeast+Pichia+pastoris+forming+highly+immunogenic+particles+for+cattle.">High level expression of the B. microplus Bm86 antigen in the yeast Pichia pastoris forming highly immunogenic particles for cattle.</a> J Biotechnol. 33, 135-146 (1994).</li><li>Rodriguez, M., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Effect+of+vaccination+with+a+recombinant+Bm86+antigen+preparation+on+natural+infestations+of+Boophilus+microplus+in+grazing+dairy+and+beef+pure+and+cross-bred+cattle+in+Brazil.">Effect of vaccination with a recombinant Bm86 antigen preparation on natural infestations of Boophilus microplus in grazing dairy and beef pure and cross-bred cattle in Brazil.</a> Vaccine. 13 (18), 1804-1808 (1995).</li><li>Lew-Tabor, A. E., Rodriguez Valle, M. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=A+review+of+reverse+vaccinology+approaches+for+the+development+of+vaccines+against+ticks+and+tick+borne+diseases.">A review of reverse vaccinology approaches for the development of vaccines against ticks and tick borne diseases.</a> Ticks Tick Borne Dis. 7, 573-585 (2016).</li><li>Capella, A. N., Terra, W. R., Ribeiro, A. F., Ferreira, C. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Cytoskeleton+removal+and+characterization+of+the+microvillar+membranes+isolated+from+two+midgut+regions+of+Spodoptera+frugiperda+(Lepidoptera).">Cytoskeleton removal and characterization of the microvillar membranes isolated from two midgut regions of Spodoptera frugiperda (Lepidoptera).</a> Insect Biochem. Mol. Biol. 27, 793-801 (1997).</li><li>Cioffi, M., Wolfersberger, M. G. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Isolation+of+separate+apical,+lateral+and+basal+plasma+membrane+from+cells+of+an+insect+epithelium.+A+procedure+based+on+tissue+organization+and+ultrastructure.">Isolation of separate apical, lateral and basal plasma membrane from cells of an insect epithelium. A procedure based on tissue organization and ultrastructure.</a> Tissue Cell. 15, 781-803 (1983).</li><li>Koefoed, B. M. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=A+simple+mechanical+method+to+isolate+the+basal+lamina+of+insect+midgut+epithelial+cells.">A simple mechanical method to isolate the basal lamina of insect midgut epithelial cells.</a> Tissue Cell. 17, 763-768 (1985).</li><li>Roche, J. K. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Isolation+of+a+purified+epithelial+cell+population+from+human+colon.">Isolation of a purified epithelial cell population from human colon.</a> Methods Mol. Med. 50, 15-20 (2001).</li><li>Terra, W. R., Costa, R. H., Ferreira, C. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Plasma+membranes+from+insect+midgut+cells.">Plasma membranes from insect midgut cells.</a> An. Acad. Bras. Ci&#234;nc. 78, 255-269 (2006).</li><li>Vargas, A. E., Markoski, M. M., Ca&#241;edo, A. D., Helena, F., Nardi, N. B. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Identification,+isolation+and+culture+of+intestinal+epithelial+stem+cells+from+murine+intestine.">Identification, isolation and culture of intestinal epithelial stem cells from murine intestine.</a> Stem Cells. 879, 479-490 (2012).</li><li>Autengruber, A., Gereke, M., Hansen, G., Hennig, C., Bruder, D. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Impact+of+enzymatic+tissue+disintegration+on+the+level+of+surface+molecule+expression+and+immune+cell+function.">Impact of enzymatic tissue disintegration on the level of surface molecule expression and immune cell function.</a> Eur. J. Microbiol. Immunol. 2, 112-120 (2012).</li><li>Karhemo, P. R., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=An+optimized+isolation+of+biotinylated+cell+surface+proteins+reveals+novel+players+in+cancer+metastasis.">An optimized isolation of biotinylated cell surface proteins reveals novel players in cancer metastasis.</a> J. Proteomics. 77, 87-100 (2012).</li><li>Obenchain, F. R., Galun, R. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Physiology+of+Ticks.">Physiology of Ticks.</a> Current Themes in Tropical Science Volume 1. , 201-205 (1982).</li><li>Sonenshine, D., Roe, R. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Chapter+3.1.">Chapter 3.1.</a> &amp;#34;Biology of Ticks&amp;#34. 1, (2014).</li><li>Raikhel, A. S., Balashov, Y. S. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=.">.</a> &amp;#34;An Atlas of Ixodid Tick Ultrastructure&amp;#34 (English Translation). , (1983).</li></ol>

למחברים אין מה לחשוף.

התפשטות בקר קרים מהווים בעיה רצינית עבור תעשיית הבקר באזורים טרופיים וסובטרופיים של העולם, עם השיטה הנפוצה ביותר של שליטה להסתמך על שימוש אקריצידים 1 , 4 . Bm86 זוהה בעבר בתוך השטח האפיתל במעיים לתקתק כמו אנטיגן המגן נגד ר microplus שריצה 10, עם הצלחה מוגבלת כאסטרטגיה חיסון עקב וריאציה רצף גיאוגרפי Bm86 ואת הדרישה קבוע לחיזוק 4. פרסומים קודמים המתמקדים במתודולוגיות בידוד אפיתל התמקדו בעיקר בחוליות או חרקים , 9 , 11 , 12 , 13 , 14 . לדוגמה, שבירה מוקדמת מנסה לבודד midgutתוך שימוש בטכניקות יונקים, נמצא כי אותה מתודולוגיה לא ניתן להחיל על חרקים בשל מבנה התא וארגונים שונים 12 . יתר על כן, טכניקות יונקים להסתמך על השימוש או dipase או collagenase, כדי לעכל את התא תא צומת חלבונים 9 , 13 . דיפאז ו collagenase להשפיע באופן משמעותי על פני התא חלבונים חלבונים, ולכן טכניקות התלויים בשימוש שלהם אינם מתאימים למחקר חלבונים פני התא 15 . בידוד חרקים midgut תא כרגע להתמקד בשתי טכניקות. הראשון מנצל הפרעה מכנית של midgut דרך אולטראסאונד ואחריו הפרדה על מעבר רציף סוכרוז ליניארי 8 , 11 , 12 , 14 . טכניקה מכנית זו מייצרת דגימות כמעט ברורה של מזהמים, Howeור מייצרת תשואה נמוכה של microvillarmembranes 14 . הטכניקה השנייה מסתמכת על טריס הפרעה של ממברנות לשחרר ממברנות microvillar 8 . הטכניקה המתוארת במאמר זה מאפשרת בידוד של תאים אפיתל, biotinylation של חלבונים פנימיים ובידוד שלהם 16 , המאפשרים מחקרים נוספים באמצעות יישומים במורד הזרם כגון ספקטרומטריית מסה או FACS. השיטה המתוארת כאן מנצל את הסוכן chelating EDTA ואת הפחתת סוכן TCEP. פונקציות EDTA כדי להשריש יונים סידן, מעכב cadherins, שבירת cadherin בתיווך צמתים תא תא ואילו TCEP מקטין את הקשר דיסולפיד אשר מעניקה צמיגות של גליקן עשיר דמויי רירית מטריקס רירית המפריד בין לומן המעיים מן האפיתל. אפיתל הוא התאושש בעקבות שיבוש מכני של הרקמות על ידי רועד, ואחריו צנטריפוגה שיפוע רציפה ב densitY צנטריפוגה שיפוע. תאים אפיתל מבודדים בין DMEM: 20% צפיפות צנטריפוגה שיפוע, ו 20%: 40% צפיפות צנטריפוגה שכבות שיפוע. ניצול של טמפרטורה גבוהה במהלך דיסוציאציה תא אפיתל יגרום רקמות גדולות כדי לנתק מן המעיים, מה שמוביל לכישלון לבודד תאים אפיתל. הבטחת כי דיסוציאציה תא אפיתלי מתבצע מיד לכתוב לנתיחה לנתיחה; ניצול של buffers קר כקרח והימנעות מהירויות צנטריפוגה גבוהות הוא קריטי בשמירה על תאים חיים קיימא. למרות זאת, הפירוק של תאים גדולים מן הלמידה הבסיסית יכול לספק קצת זיהום. יתר על כן, אפיתל midgut של טיק משתנה באופן דרמטי בזמן מארוחת הדם האחרונה 18 , 19 , 20 . ככזה, פרוטוקול זה תוכנן וגישה על ר microplus </eמ &#39;&gt; מתקתק החל העיכול, ואת הטכניקות שנקבעו עלולות להיות שונות אוכלוסיות תאים וכתוצאה מכך תלוי כאשר הארוחה האחרונה של דם נלקחה. הפרוטוקול תוכנן לאסוף אוכלוסיות תאים שונים אפיתל, אולם כמו קרציות מנוצל היו חצי חרוך התאים דמיינו ( איור 1 ) הם בעלי אופי אחיד. לסיכום, שיטות המשמשות במחקר זה בהצלחה מבודדים תאים אפיתל מן המעיים כולו של ר microplus . חלבונים מפני השטח של תאים אפיתל R. מיקרופלוס התקבלו לניתוח נוסף ומחקרים. לבסוף, פרוטוקול פיתחה הוכיח את התשואה הפוטנציאלית של תאים אפיתל מן המעיים סמן, ואת היעילות של חלבונים פנימיים biotinylated של התא. פרוטוקול שפותח יכול להיות מנוצל בכל מינים סמן של משמעות כלכלית במאמץ לחקור טאק: אינטראקציות מארח על ידי לימוד חלבון הממברנה comמיקום המעיים.

Rhipicephalus microplus , סמן בקר, הוא ectoparasite משמעותי ביותר במונחים של השפעה כלכלית על תעשיית הבקר של אזורים טרופיים תת טרופיים כפי שהוא נוקט קדחת הבקר קדחת (babesiosis), anaplasmosis ו piroplasmosis סוס 1 , 2 , 3 , 4 . המאמצים הוקדשו לבקרת סמן בקר, כדי להפחית את ההשפעה המזיקה, אולם לשיטות קונבנציונליות כגון שימוש בחומרי אקריצידים כימיים יש חסרונות משתמעים, כגון נוכחות של שאריות כימיות בחלב ובבשר, ועלייה בשכיחות של קרציות עמידות כימית 5 , 6 , 7 . כתוצאה מכך, פיתוח שיטות חלופיות של בקרת טיקים נחקרו, כגון שימוש בבקר התנגדות טבעי, בקרה ביולוגית (biopesticides) וחיסוןInes 4 , 5 , 6 , 7 , 8 , 9 . במרדף אחר חלבונים המסוגלים לשמש מועמדים לחיסונים, המחקר הנוכחי מתמקד במעי הגס. קיר midgut בנוי משכבה אחת של תאים אפיתל מנוחה על לאמידה בסיסית דקה, עם החיצוני של הלמידה הבסיסית להרכיב רשת של שרירים. אור ותצפיות מיקרוסקופ אלקטרונים מציינות כי midgut מורכב משלושה סוגים של תאים: מילואים (לא מובחנים), הפרשה, ומערכת העיכול. מספר סוגי התאים משתנה במידה ניכרת בהתאם לשלב הפיזיולוגי. תאי הפרשה ותאי העיכול מקורם בתאי מילואים 18 , 19 , 20 . בניית ספריות cDNAכדי לבחון את ההרכב של המעיים סמן גרמה לזיהוי של חלבונים אנטיגניים, כגון Bm86, כמו מועמדים חיסונים פוטנציאליים 2 , 3 , 4 . Glycoprotein Bm86 הוא מקומי על פני השטח של תאים מעיים לתקתק וגורם תגובה חיסונית מגן נגד סמן בקר ( ר microplus ) בבקר מחוסן. Anti-Bm86 IgGs המיוצר על ידי המארח החוסן הם ingested על ידי סמן, לזהות אנטיגן זה על פני השטח של תאים מעיים לתקתק, ולאחר מכן להפריע לתפקוד רקמות המעיים ואת היושרה. חיסונים המבוססים על אנטיגנים Bm86 הראו שליטה אפקטיבית של ר &#39; microplus ו Rhipicephalus annulatus, על ידי הקטנת מספר, משקל ויכולת הרבייה של נקבות נקבות, וכתוצאה מכך הפחתת הזחל מופחת בדורות דלקת הבאים 4 . עם זאת, חיסונים המבוססים על Bm86 אינם יעילים כנגד כל שלבי הסימוןהוכיחו יעילות משביעת רצון נגד כמה זנים גיאוגרפיים של ר &#39;microplus , וכתוצאה מכך את בשר בקר תעשיות חלב אימצו כראוי חיסונים אלה 2 , 4 . היכולת לבודד תאים אפיתל מן המעיים סמן הוא חידוש משמעותי אשר יאפשר את התקדמות המחקר כדי לקבוע הרכב חלבון חלבון כולל מורפולוגיה ופיזיולוגיה בתנאים סביבתיים שונים. השיטה המתוארת כאן מנצל את הסוכן chelating ethylenediaminetetraacetic חומצה (EDTA) ואת הסוכן הפחתת tris (2-carboxyethyl) פוספין (TCEP) לשחרר את האפיתל מן הרקמות תמיכה תת אפיתל שלה 10 . אפיתל הוא התאושש בעקבות שיבוש מכני של הרקמות על ידי רועד, ואחריו צנטריפוגה שיפוע רציפה Percoll. מאמר זה מתאר טכניקה ריאלי ו אפשרי לבידוד של מעי גס epiהתאים. חלבונים משטח התא biotinylated, מבודדים מפני השטח של תאים אלה אפיתל ניתח לאחר מכן ביישומים במורד הזרם כגון FACS ו / או LC-MS / MS- ניתוח.

<table border="1" fo:keep-together.within-page="1" fo:keep-with-next.within-page="always">
	<tbody>
		<tr>
			<td>0.4% Trypan Blue</td>
			<td>ThermoFisher Scientific</td>
			<td>15250061</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>1.5 mL microcentrifuge tube</td>
			<td>Eppendorf</td>
			<td>3322</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>100mM Carbonate Buffer</td>
			<td></td>
			<td></td>
			<td>3.03 g Na2CO3, 6.0 g NaHCO3 1000 ml distilled water pH 9.6</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>16 mL centrifuge tubes with sealing cap</td>
			<td>Thermo Scientific</td>
			<td>3138-0016</td>
			<td>Cool in ice prior to gradient</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>250 &#181;M cell strainer</td>
			<td>Thermo Fisher</td>
			<td>87791</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>3,3&#8242;,5,5&#8242;-Tetramethylbenzidine (TMB) Liquid Substrate System for ELISA</td>
			<td>Sigma</td>
			<td>T0440</td>
			<td>Stored at 4C</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>30% Hydrogen Peroxide</td>
			<td>Labscene</td>
			<td>BSPA5.500</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>4-20% Tris-MOPS Gel</td>
			<td>Gen Script</td>
			<td>M42015</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>4-Chloro-1-naphthol tablet</td>
			<td>Sigma-Aldrich</td>
			<td>C6788</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>50 mL Falcon Tube</td>
			<td>Corning Blue</td>
			<td></td>
			<td>30 x 115mm style. Polyproplyene conical tube.</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>70 &#181;M cell strainer</td>
			<td>BD Falcon</td>
			<td>352350</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>AP15 filter paper</td>
			<td>Millipore</td>
			<td>AO1504200</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Biotin (Type A) Conjugation Kit</td>
			<td>Abcam</td>
			<td>Ab102865</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Dissection microscope</td>
			<td>Olympus</td>
			<td>SZX7</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>DP Manager&#160;</td>
			<td>Olympus</td>
			<td>2.2.1.195</td>
			<td>Cell imagery software</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Duct Tape</td>
			<td>Home Handyman</td>
			<td></td>
			<td>48mm x 25mm Duct Tape</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Dulbecco&#8217;s Modified Eagle Medium</td>
			<td>Gibco</td>
			<td>11995-065</td>
			<td>DMEM - ice cold for protocol</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>EDTA</td>
			<td>Amresco</td>
			<td>0105-500G</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>F96 Maxisorp Immuno Plate</td>
			<td>Nunc</td>
			<td>439454</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Fetal Bovine Serum</td>
			<td>Sigma-Aldrich</td>
			<td>12003C</td>
			<td>FCS</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Fluorescence microscope&#160;</td>
			<td>&#160;Olympus&#160;</td>
			<td>BX51</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Fluoroshield with DAPI</td>
			<td>Sigma-Aldrich</td>
			<td>F6057-20ML</td>
			<td>DAPI</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Forceps</td>
			<td>Dumont</td>
			<td></td>
			<td>#9 Dumont - Switerzland</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Glycerol</td>
			<td>Sigma-Aldrich</td>
			<td>G5516</td>
			<td>Glycerol for molecular biology &#62;99%</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Glycine</td>
			<td>Sigma-Aldrich</td>
			<td>410225</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Hand-Held Counter</td>
			<td>Officeworks</td>
			<td>JA0376230</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Hank&#8217;s Balanced Salt Solution</td>
			<td>Sigma Life Sciences</td>
			<td>H9394</td>
			<td>HBSS &#8211; ice cold for protocol</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Hemacytometer</td>
			<td>Optik Lakor</td>
			<td>-</td>
			<td>-</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>L-Glutathione oxidized</td>
			<td>Sigma-Aldrich</td>
			<td>G4376</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Magnetic Separation Stand</td>
			<td>Novagen</td>
			<td>-</td>
			<td>4-Tube Magnetic Separation Rack</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Methanol</td>
			<td>Sigma-Aldrich</td>
			<td>179337</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Milli-Q Water</td>
			<td>Millipore</td>
			<td>ZRXQ003WW</td>
			<td>Integral Water Purification System for Ultrapure Water</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Nitrocellulose Membrane</td>
			<td>Life Sciences</td>
			<td>66485</td>
			<td>30cm x 3M pure nitrocellulose membrane</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>PageRuler Prestained protein Ladder</td>
			<td>Thermo-Fisher</td>
			<td>SM0671</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>PBS</td>
			<td></td>
			<td></td>
			<td>1.16 g Na2HPO4, 0.1 g KCl, 0.1 g K3PO4, 4.0 g NaCl (500 ml distilled water) pH 7.4</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Percoll</td>
			<td>Sigma-Aldrich</td>
			<td>P1644-500ML</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Peristaltic Pump</td>
			<td>Masterflex</td>
			<td>7518-10</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Phosphoric Acid</td>
			<td>Sigma-Aldrich</td>
			<td>P6560</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Pierce Protein-Free T20 PBS Blocking Buffer</td>
			<td>Thermo-Scientific</td>
			<td>37573</td>
			<td>Stored at 4C. Blocking Buffer</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Protease Inhibitor Cocktail</td>
			<td>Sigma-Aldrich</td>
			<td>P8215-5ML</td>
			<td>PIC &#8211; stored at -20 &#176;C</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Quick Start Bradford Dye Reagent 1x</td>
			<td>Biorad</td>
			<td>500-0205</td>
			<td>For Bradford Assay</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Quick Start BSA Standards</td>
			<td>Biorad</td>
			<td>500-0207</td>
			<td>BSA standards for Bradford Assay</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Scalpel</td>
			<td>Lab. Co</td>
			<td></td>
			<td>Size 11 Scalpel</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>SilverQuest TM Staining Kit</td>
			<td>Invitrogen</td>
			<td>LC6070</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Simply Blue TM Safe Stain&#160;</td>
			<td>Invitrogen</td>
			<td>LC6060</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Sorvall C6+ Ultracentrifuge</td>
			<td>Thermo Scientific</td>
			<td>46910</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Streptavidin (HRP)</td>
			<td>Abcam</td>
			<td>AB7403</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Streptavidin Magnetic Beads</td>
			<td>New England Biolabs</td>
			<td>S1420S</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Super Glue - Ultra Fast Mini</td>
			<td>UHU</td>
			<td></td>
			<td>UHU Super Glue 1mg. Ultra Fast mini</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Table-top Centrifuge</td>
			<td>Eppendorf</td>
			<td>22331</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>TCEP</td>
			<td>Thermo Fisher</td>
			<td>20490</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Triton X-100</td>
			<td>Biorad</td>
			<td>161-0407</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Tween-20</td>
			<td>Sigma</td>
			<td>P2287-500ML</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Vortex Mixer</td>
			<td>Ratek</td>
			<td>VM1</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Water Bath</td>
			<td>Grant</td>
			<td>GD100</td>
			<td></td>
		</tr>
	</tbody>
</table>

purification of biotinylated cell surface proteins from rhipicephalus microplus epithelial gut cells

Rhipicephalus microplus - תווית בקר - הוא ectoparasite משמעותי ביותר במונחים של השפעה כלכלית על בעלי חיים כמו וקטור של מספר פתוגנים. המאמצים הוקדשו לשלוט בקר בקר כדי להפחית את ההשפעות המזיקות שלה, עם דגש על גילוי של מועמדים חיסון, כגון BM86, הממוקם על פני השטח של תאים מעיים לתאי אפיתל. המחקר הנוכחי מתמקד בשימוש של cDNA וגנום ספריות, כדי המסך עבור מועמדים חיסון אחרים. הבידוד של תאים מעיים לתקתק מהווה יתרון חשוב בחקירת הרכב של חלבונים פני השטח על קרום תאים בטן קרום. מאמר זה מהווה שיטה חדשנית וראוי לבידוד של תאי אפיתל, מן התוכן מעיים לתקתק של מיקרופלוס חצי רתומה למחצה . פרוטוקול זה מנצל TCEP ו EDTA לשחרר את התאים אפיתל מן הרקמות תמיכה subepithelial ו צפיפות רציפה צנטריפוגה gradieNt לתאי אפיתל נפרדים מסוגי תאים אחרים. חלבונים משטח התא היו biotinylated ומבודדים מן התאים בטן אפיתל בטן, באמצעות חרוזים מגנטיים streptavidin מקושר המאפשר עבור יישומים במורד FACS או LC-MS / MS- ניתוח.

תאים אפיתל היו מבודדים מרקמות המעיים של ר microplus לפי סכימה הציג באיור 1 . נציג מיקרוסקופ פלואורסצנטי הקרינה של תאים מעיים לתאי אפיתל מוכן באמצעות פרוטוקול זה מוצגים בתרשים 2A ו 2 ב. כמו בידוד התא מתבצע על רבעי מחורץ מיקרופלוס חצי , תאים מופיעים כמו יחיד, כדורית, משטח מורפולוגיה חלקה גודל עקבי לאורך המדגם. הבדלים בגודל ובסוג של אוכלוסיות תאים המעיים, הם ניכרים יותר לאחר הטיק ממשיך להיות מבוגרים מלאות. מכתים פלואורסצנטי של גרעין של תאים אפיתל מבודד עם DAPI מסייע לדמיין את התאים. בידוד גרוע הם דמיינו כדי להכיל דיסוציאציה חלקית של epithתאים אליאליים עם אוכלוסיות תאים משתנים המזוהים באמצעות גדלים התא משתנה מורפולוגיות ( איור 2 ג ו 2 ד ) ניצול פרוטוקול זה, כ 1.2 x 10 7 תאים לכל / מ&quot;ל ​​מ 50 ניתוחים קרביים בטן, עם הכדאיות 75-80% היו מבודדים בהצלחה ר &#39;מיקרופלוס בטן. זיהום צולבות של חלבונים המארחת ( איור 3 א ) ניתן למזער על ידי שטיפת כראוי האומץ לתקתק עד שיש להם מראה לבן כי התוצאה לבן / בהיר Percoll שיפוע ( איור 3 ב ). חלבונים על פני השטח היו מבודדים באמצעות biotinylation של חלבונים הקשורים בחלל, הרס של ממברנות הסלולר ואת טיהור חלבונים פנימיים biotinylated עם חרוזים streptavidin מגנטי. סך של 20-24 מיקרוגרם של biotiny מטוהריםחלבונים משטח מאוחסנים יכול להיות מבודד עבור הזרם יישומים למטה מ דיסקציה ראשונית של 50x קרביים האומץ באמצעות פרוטוקול זה. השוואה של חלבונים על ידי SDS-PAGE ( איור 4 ), כתם כסף ( איור 4 ב ), נקודה כתם ( איור 5 ) ו ELISA ( איור 6 ) עולה כי המתודולוגיה המתוארת בהצלחה מטוהרים חלבונים פנימיים biotinylated תאים אפיתל מבודדים מ R. מְעִי. <img alt="איור 1" class="xfigimg" src="/files/ftp_upload/55747/55747fig1.jpg" /> איור 1 : ייצוג סכמטי לבודד חלבונים biotinylated נוכח פני השטח של תאים microgut R. microplus . <a href="https://ecsource-jove-com.remotexs.ntu.edu.sg/files/ftp_upload/55747/55747fig1large.jpg" target="_blank">נא cl</a>Ick כאן כדי להציג גרסה גדולה יותר של דמות זו. <img alt="איור 2" class="xfigimg" src="/files/ftp_upload/55747/55747fig2.jpg" /> איור 2 : הדמיה מיקרוסקופ פלואורסצנטי (100x) של תאים מיקרו אפלוס midprout midgut מוכתם DAPI. התוכנה שימשה כדי לנהל את שכבת הקרינה. A &amp; B) מייצגים תאים אפיתל בהצלחה מבודד מן midgut R. microplus . C / D) תאים אפיתל מבודדים מן המעיים microplus R. מזוהמים עם רקמות לתקתק גדול. <img alt="איור 3" class="xfigimg" src="/files/ftp_upload/55747/55747fig3.jpg" /> איור 3 : שיפוע Percoll המכיל DMEM: 20% Percoll: 40% Percoll. שכבות תא אפיתל נוצרו בין DMEM: 20% PErcoll ואת 20: 40% Percoll. ( א ) בטן לנתיחה לנתיחה ללא צעד שטיפה נאותה. ( ב ) טקט לנתיחה לנתיחה עם צעד שטיפה נאותה. <a href="https://ecsource-jove-com.remotexs.ntu.edu.sg/files/ftp_upload/55747/55747fig3large.jpg" target="_blank">אנא לחץ כאן כדי להציג גרסה גדולה יותר של דמות זו.</a> <img alt="איור 4" class="xfigimg" src="/files/ftp_upload/55747/55747fig4.jpg" /> איור 4 : הפרדות אלקטרופורטי של חלבונים פנימיים biotinylated לרוץ על 4-20% Tris-MOPS ג&#39;ל, ב 140 V עבור 55 דקות עם 10 מיקרוגרם של המדגם מנוצל. (L) סולם חלבון PageRuler prestained (1) ללא תווית ר microplus כולו מדגם בטן (2) חלבונים Biotinylated שחולצו מן הבטן ר microplus שלם לפי צעד 6. (3) חלבונים מתאי האפיתל שחולצו מן הבטן microplus נטולות-תווית ר (4 ) חלבונים Biotinylated שחולצו מ R. microplusתאים אפיתל לפי צעד 6. ( א ) SDS-PAGE מוכתמים על ידי כתם כסף כחול קומסי ( B ). <img alt="איור 5" class="xfigimg" src="/files/ftp_upload/55747/55747fig5.jpg" /> איור 5 : ניתוח כתם נקודה. Streptavidin-HRP מצומדות מדולל 1 / 5,000. ( A ) סך של 10 מיקרוגרם של חלבון גלם לחלץ חלבון תמצית ( B ) חלבונים פנימיים Biotinylated שחולצו תאים אפיתל מטוהרים (10 מיקרוגרם). <img alt="איור 6" class="xfigimg" src="/files/ftp_upload/55747/55747fig6.jpg" /> איור 6 : הערכה של חלבונים פנימיים biotinylated פני השטח באמצעות ELISA. ELISA של חלבונים פני השטח פותחה על ידי נוגדנים Strep-HRP מצומדות בדילול 1 / 15,000 נגד ריכוזים שונים של טיק biotinylatedK gut חלבונים (מ 0.7 ng ל 100 ng). Unlabeled תירס בטן חלבונים ו אלבומין בסרום שור (BSA) שימשו שליטה שלילית של ELISA. <a href="https://ecsource-jove-com.remotexs.ntu.edu.sg/files/ftp_upload/55747/55747fig6large.jpg" target="_blank">אנא לחץ כאן כדי להציג גרסה גדולה יותר של דמות זו.</a>

Watch this Scientific Journal Video about Purification of Biotinylated Cell Surface Proteins from Rhipicephalus microplus Epithelial Gut Cells at JoVE.com

Purification of Biotinylated Cell Surface Proteins from Rhipicephalus microplus Epithelial Gut Cells

צפיפות שונה צנטריפוגה מבוססי מתודולוגיה שיפוע מבוסס נוצל לבודד תאים אפיתל מ רקמה Rhipicephalus רקמת microplus . משטח חלבונים הקשורים היו biotinylated ו מטוהרים באמצעות חרוזים מגנטיים streptavidin עבור יישומים במורד הזרם.

טיהור של biotinylated Cell חלבונים משטח מ<em&gt; Rhipicephalus microplus</em&gt; תאים אפיתל גוט

Rhipicephalus microplus &#8211; the cattle tick &#8211; is the most significant ectoparasite in terms of economic impact on livestock as a vector of ...

purification-biotinylated-cell-surface-proteins-from-rhipicephalus

Nanyang Technological University

Research

JoVE Journal

Biochemistry

Purification of Biotinylated Cell Surface Proteins from Rhipicephalus microplus Epithelial Gut Cells

9.4K Views.  The University of Queensland.  צפיפות שונה צנטריפוגה מבוססי מתודולוגיה שיפוע מבוסס נוצל לבודד תאים אפיתל מ רקמה Rhipicephalus רקמת microplus . משטח חלבונים הקשורים היו biotinylated ו מטוהרים באמצעות חרוזים מגנטיים streptavidin עבור יישומים במורד הזרם. 

Video: Purification of Biotinylated Cell Surface Proteins from Rhipicephalus microplus Epithelial Gut Cells

Tandem Affinity Purification of Protein Complexes from Eukaryotic Cells

The purification of active protein-protein and protein-nucleic acid complexes is crucial for the characterization of enzymatic activities and de novo identification of novel subunits and post-translational modifications. Bacterial systems allow for the expression and purification of a wide variety of single polypeptides and protein complexes. However, this system does not enable the purification of protein subunits that contain post-translational modifications (e.g., phosphorylation and acetylation), and the identification of novel regulatory subunits that are only present/expressed in the eukaryotic system. Here, we provide a detailed description of a novel, robust, and efficient tandem affinity purification (TAP) method using STREP- and FLAG-tagged proteins that facilitates the purification of protein complexes with transiently or stably expressed epitope-tagged proteins from eukaryotic cells. This protocol can be applied to characterize protein complex functionality, to discover post-translational modifications on complex subunits, and to identify novel regulatory complex components by mass spectrometry. Notably, this TAP method can be applied to study protein complexes formed by eukaryotic or pathogenic (viral and bacterial) components, thus yielding a wide array of downstream experimental opportunities. We propose that researchers working with protein complexes could utilize this approach in many different ways.

We describe here a novel, robust, and efficient tandem affinity purification (TAP) method for the expression, isolation, and characterization of protein complexes from eukaryotic cells. This protocol could be utilized for the biochemical characterization of discrete complexes as well as the identification of novel interactors and post-translational modifications that regulate their function.

טיהור טנדם זיקה של קומפלקסי חלבונים מתאים איקריוטיים

The purification of active protein-protein and protein-nucleic acid complexes is crucial for the characterization of enzymatic activities and de novo ...

Biotinylated Cell-penetrating Peptides to Study Intracellular Protein-protein Interactions

Here we present a protocol to study intracellular protein-protein interactions that is based on the widely used biotin-avidin pull-down system. The modification presented includes the combination of this technique with cell-penetrating sequences. We propose to design cell-penetrating baits that can be incubated with living cells instead of cell lysates and therefore the interactions found will reflect those that occur within the intracellular context. Connexin43 (Cx43), a protein that forms gap junction channels and hemichannels is down-regulated in high-grade gliomas. The Cx43 region comprising amino acids 266-283 is responsible for the inhibition of the oncogenic activity of c-Src in glioma cells. Here we use TAT as the cell-penetrating sequence, biotin as the pull-down tag and the region of Cx43 comprised between amino acids 266-283 as the target to find intracellular interactions in the hard-to-transfect human glioma stem cells. One of the limitations of the proposed method is that the molecule used as bait could fail to fold properly and, consequently, the interactions found could not be associated with the effect. However, this method can be especially interesting for the interactions involved in signal transduction pathways because they are usually carried out by intrinsically disordered regions and, therefore, they do not require an ordered folding. In addition, one of the advantages of the proposed method is that the relevance of each residue on the interaction can be easily studied. This is a modular system; therefore, other cell-penetrating sequences, other tags, and other intracellular targets can be employed. Finally, the scope of this protocol is far beyond protein-protein interaction because this system can be applied to other bioactive cargoes such as RNA sequences, nanoparticles, viruses or any molecule that can be transduced with cell-penetrating sequences and fused to pull-down tags to study their intracellular mechanism of action.

This is a protocol to study intracellular protein-protein interactions based on the biotin-avidin pull-down system with the novelty of combining cell-penetrating sequences. The main advantage is that the target sequence is incubated with living cells instead of cell lysates and therefore the interactions will occur within the cellular context.

חודר Biotinylated תא פפטידים ללמוד אינטראקציות חלבון תאיים

Here we present a protocol to study intracellular protein-protein interactions that is based on the widely used biotin-avidin pull-down system. The ...

Purification of Hepatocytes and Sinusoidal Endothelial Cells from Mouse Liver Perfusion

This protocol demonstrates a method for obtaining high yield and viability for mouse hepatocytes and sinusoidal endothelial cells (SECs) suitable for culturing or for obtaining cell lysates. In this protocol, the portal vein is used as the site for catheterization, rather than the vena cava, as this limits contamination of other possible cell types in the final liver preparation. No special instrumentation is required throughout the procedure. A water bath is used as a source of heat to maintain the temperature of all the buffers and solutions. A standard peristaltic pump is used to drive the fluid, and a refrigerated table-top centrifuge is required for the centrifugation procedures. The only limitation of this technique is the placement of the catheter within the portal vein, which is challenging on some of the mice in the 18 - 25 g size range. An advantage of this technique is that only one vein is utilized for the perfusion and the access to the vein is quick, which minimizes ischemia and reperfusion of the liver that reduces hepatic cell viability. Another advantage to this protocol is that it is easy to distinguish live from dead hepatocytes by eyesight due to the difference in cellular density during the centrifugation steps. Cells from this protocol may be used in cell culture for any downstream application as well as processed for any biochemical assessment.

The goal of this protocol is to obtain high viability and high yield of hepatocytes and sinusoidal endothelial cells from liver. This is accomplished by perfusing the liver with a type IV collagenase solution via the portal vein, followed by differential centrifugation to obtain hepatocytes and sinusoidal endothelial cells.

טיהור של Hepatocytes ותאי אנדותל Sinusoidal מן הכבד העכבר זלוף

This protocol demonstrates a method for obtaining high yield and viability for mouse hepatocytes and sinusoidal endothelial cells (SECs) suitable for ...

Isolation of Glomeruli and In Vivo Labeling of Glomerular Cell Surface Proteins

Proteinuria results from the disruption of the glomerular filter that is composed of the fenestrated endothelium, glomerular basement membrane, and podocytes with their slit diaphragms. The delicate structure of the glomerular filter, especially the slit diaphragm, relies on the interplay of diverse cell surface proteins. Studying these cell surface proteins has so far been limited to in vitro studies or histologic analysis. Here, we present a murine in vivo biotinylation labeling method, which enables the study of glomerular cell surface proteins under physiologic and pathophysiologic conditions. This protocol contains information on how to perfuse mouse kidneys, isolate glomeruli, and perform endogenous immunoprecipitation of a protein of interest. Semi-quantitation of glomerular cell surface abundance is readily available with this novel method, and all proteins accessible to biotin perfusion and immunoprecipitation can be studied. In addition, isolation of glomeruli with or without biotinylation enables further analysis of glomerular RNA and protein as well as primary glomerular cell culture (i.e., primary podocyte cell culture).

Isolation of Glomeruli and In Vivo Labeling of Glomerular Cell Surface Proteins

Here we present a protocol for murine in vivo labeling of glomerular cell surface proteins with biotin. This protocol contains information on how to perfuse mouse kidneys, isolate glomeruli, and perform endogenous immunoprecipitation of the protein of interest.

בידוד של Glomeruli, In Vivo תיוג של חלבונים פני שטח התא Glomerular

Proteinuria results from the disruption of the glomerular filter that is composed of the fenestrated endothelium, glomerular basement membrane, and ...

Translating Ribosome Affinity Purification (TRAP) for RNA Isolation from Endothelial Cells In Vivo

Many studies have been limited to using in vitro cellular assays and whole tissues or isolating of specific cell types from animals for in vitro analysis of transcriptome and gene expression by qPCR and RNA sequencing. Comprehensive transcriptome and gene expression analysis of specific cell types in complex tissues and organs will be critical to understand cellular and molecular mechanisms by which genes are regulated and their association with tissue homeostasis and organ functions. In this article, we demonstrate the methodology for isolation of ribosome-bound RNA directly in vivo in the vascular endothelia of animal lungs as an example. The specific materials and procedures for tissue processing and RNA purification will be described, including the assessment of RNA quality and yield as well as real time qPCR for arteriogenic gene assays. This approach, known as translating ribosome affinity purification (TRAP) technique, can be utilized for characterization of gene expression and transcriptome analysis of certain cell types directly in vivo in any specific type in complex tissues.

Translating Ribosome Affinity Purification TRAP for RNA Isolation from Endothelial Cells In Vivo

We present an approach to purify ribosome-bound mRNA from vascular endothelial cells (ECs) directly in mouse brain, lung and heart tissues via EC-specific genetic tag of enhanced green fluorescence protein (EGFP)in ribosomes in combination with RNA purification.

תרגום הריבוכמה אהדה לטיהור (מלכודת) לבידוד רנ א מתאי האנדותל בvivo

Many studies have been limited to using in vitro cellular assays and whole tissues or isolating of specific cell types from animals for in vitro analysis ...

Expression, Purification, Crystallization, and Enzyme Assays of Fumarylacetoacetate Hydrolase Domain-Containing Proteins

Fumarylacetoacetate hydrolase (FAH) domain-containing proteins (FAHD) are identified members of the FAH superfamily in eukaryotes. Enzymes of this superfamily generally display multi-functionality, involving mainly hydrolase and decarboxylase mechanisms. This article presents a series of consecutive methods for the expression and purification of FAHD proteins, mainly FAHD protein 1 (FAHD1) orthologues among species (human, mouse, nematodes, plants, etc.). Covered methods are protein expression in E. coli, affinity chromatography, ion exchange chromatography, preparative and analytical gel filtration, crystallization, X-ray diffraction, and photometric assays. Concentrated protein of high levels of purity (&#62;98%) may be employed for crystallization or antibody production. Proteins of similar or lower quality may be employed in enzyme assays or used as antigens in detection systems (Western-Blot, ELISA). In the discussion of this work, the identified enzymatic mechanisms of FAHD1 are outlined to describe its hydrolase and decarboxylase bi-functionality in more detail.

Expression and purification of fumarylacetoacetate hydrolase domain-containing proteins is described with examples (expression in E. coli, FPLC). Purified proteins are used for crystallization and antibody production and employed for enzyme assays. Selected photometric assays are presented to display the multi-functionality of FAHD1 as oxaloacetate decarboxylase and acylpyruvate hydrolase.

ביטוי, טיהור, התגבשות ואנזים אנזימים המכילים חלבונים בתחום הידרוקלז

Fumarylacetoacetate hydrolase (FAH) domain-containing proteins (FAHD) are identified members of the FAH superfamily in eukaryotes. Enzymes of this ...

Real-Time, Semi-Automated Fluorescent Measurement of the Airway Surface Liquid pH of Primary Human Airway Epithelial Cells

In recent years, the importance of mucosal surface pH in the airways has been highlighted by its ability to regulate airway surface liquid (ASL) hydration, mucus viscosity and activity of antimicrobial peptides, key parameters involved in innate defense of the lungs. This is of primary relevance in the field of chronic respiratory diseases such as cystic fibrosis (CF) where these parameters are dysregulated. While different groups have studied ASL pH both in vivo and in vitro, their methods report a relatively wide range of ASL pH values and even contradictory findings regarding any pH differences between non-CF and CF cells. Furthermore, their protocols do not always provide enough details in order to ensure reproducibility, most are low throughput and require expensive equipment or specialized knowledge to implement, making them difficult to establish in most labs. Here we describe a semi-automated fluorescent plate reader assay that enables the real-time measurement of ASL pH under thin film conditions that more closely resemble the in vivo situation. This technique allows for stable measurements for many hours from multiple airway cultures simultaneously and, importantly, dynamic changes in ASL pH in response to agonists and inhibitors can be monitored. To achieve this, the ASL of fully differentiated primary human airway epithelial cells (hAECs) are stained overnight with a pH-sensitive dye in order to allow for the reabsorption of the excess fluid to ensure thin film conditions. After fluorescence is monitored in the presence or absence of agonists, pH calibration is performed in situ to correct for volume and dye concentration. The method described provides the required controls to make stable and reproducible ASL pH measurements, which ultimately could be used as a drug discovery platform for personalized medicine, as well as adapted to other epithelial tissues and experimental conditions, such as inflammatory and/or host-pathogen models.

We present a protocol to make dynamic measurements of the airway surface liquid pH under thin film conditions using a plate-reader.

בזמן אמת, חצי אוטומטי מדידה פלורסנט של משטח נתיב האוויר הנוזלי של ה-pH העיקרי של תאים אפיתל דרכי האוויר האנושי

In recent years, the importance of mucosal surface pH in the airways has been highlighted by its ability to regulate airway surface liquid (ASL) ...

PeptiQuick, a One-Step Incorporation of Membrane Proteins into Biotinylated Peptidiscs for Streamlined Protein Binding Assays

Membrane proteins, including transporters, channels, and receptors, constitute nearly one-fourth of the cellular proteome and over half of current drug targets. Yet, a major barrier to their characterization and exploitation in academic or industrial settings is that most biochemical, biophysical, and drug screening strategies require these proteins to be in a water-soluble state. Our laboratory recently developed the peptidisc, a membrane mimetic offering a &#8220;one-size-fits-all&#8221; approach to the problem of membrane protein solubility. We present here a streamlined protocol that combines protein purification and peptidisc reconstitution in a single chromatographic step. This workflow, termed PeptiQuick, allows for bypassing dialysis and incubation with polystyrene beads, thereby greatly reducing exposure to detergent, protein denaturation, and sample loss. When PeptiQuick is performed with biotinylated scaffolds, the preparation can be directly attached to streptavidin-coated surfaces. There is no need to biotinylate or modify the membrane protein target. PeptiQuick is showcased here with the membrane receptor FhuA and antimicrobial ligand colicin M, using biolayer interferometry to determine the precise kinetics of their interaction. It is concluded that PeptiQuick is a convenient way to prepare and analyze membrane protein-ligand interactions within one&#160;day in a detergent-free environment.

We present a method that combines membrane protein purification and reconstitution into peptidiscs in a single chromatographic step. Biotinylated scaffolds are used for direct surface attachment and measurement of protein-ligand interactions via biolayer interferometry.

PeptiQuick, שילוב של צעד אחד של חלבונים ממברנות לתוך ביוטילדיסקי Peptiquick עבור כריכת חלבון מפושטת

Membrane proteins, including transporters, channels, and receptors, constitute nearly one-fourth of the cellular proteome and over half of current drug ...

Transverse Sectioning of Mature Rice (Oryza sativa L.) Kernels for Scanning Electron Microscopy Imaging Using Pipette Tips as Immobilization Support

Starch granules (SGs) exhibit different morphologies depending on the plant species, especially in the endosperm of the Poaceae family. Endosperm phenotyping can be used to classify genotypes based on SG morphotype using scanning electron microscopic (SEM) analysis. SGs can be visualized using SEM by slicing through the kernel (pericarp, aleurone layers, and endosperm) and exposing the organellar contents. Current methods require the rice kernel to be embedded in plastic resin and sectioned using a microtome or embedded in a truncated pipette tip and sectioned by hand using a razor blade. The former method requires specialized equipment and is time-consuming, while the latter introduces a new host of problems depending on rice genotype. Chalky rice varieties, particularly, pose a problem for this type of sectioning due to the friable nature of their endosperm tissue. Presented here is a technique for preparing translucent and chalky rice kernel sections for microscopy, requiring only pipette tips and a scalpel blade. Preparing the sections within the confines of a pipette tip prevents rice kernel endosperm from shattering (for translucent or &#8216;vitreous&#8217; phenotypes) and crumbling (for chalky phenotypes). Using this technique, endosperm cell patterning and the structure of intact SGs can be observed.

Transverse Sectioning of Mature Rice Oryza sativa L. Kernels for Scanning Electron Microscopy Imaging Using Pipette Tips as Immobilization Support

This protocol allows for the preparation of transverse sections of cereal seeds (e.g., rice) for the analysis of endosperm and starch granule morphology using scanning electron microscopy.

חתך רוחבי של אורז בוגר (Oryza sativa L.) גרעינים לסריקת הדמיית מיקרוסקופיה אלקטרונית באמצעות טיפים פיפטה כתמיכה ללא תנועה

Starch granules (SGs) exhibit different morphologies depending on the plant species, especially in the endosperm of the Poaceae family. Endosperm ...

Cell Fractionation of U937 Cells by Isopycnic Density Gradient Purification

This protocol describes a method to obtain subcellular protein fractions from mammalian cells using a combination of detergents, mechanical lysis, and isopycnic density gradient centrifugation. The major advantage of this procedure is that it does not rely on the sole use of solubilizing detergents to obtain subcellular fractions. This makes it possible to separate the plasma membrane from other membrane-bound organelles of the cell. This procedure will facilitate the determination of protein localization in cells with a reproducible, scalable, and selective method. This method has been successfully used to isolate cytosolic, nuclear, mitochondrial, and plasma membrane proteins from the human monocyte cell line, U937. Although optimized for this cell line, this procedure may serve as a suitable starting point for the subcellular fractionation of other cell lines. Potential pitfalls of the procedure and how to avoid them are discussed as are alterations that may need to be considered for other cell lines.

This fractionation protocol will allow researchers to isolate cytoplasmic, nuclear, mitochondrial, and membrane proteins from mammalian cells. The latter two subcellular fractions are further purified via isopycnic density gradient.

פיצול תאים של תאי U937 על ידי טיהור הדרגתי בצפיפות איזופיקנית

This protocol describes a method to obtain subcellular protein fractions from mammalian cells using a combination of detergents, mechanical lysis, and ...