מחקר זה מומן בחלקו על ידי הפרסים NIH 5T32AI07506, 5R01AI033774, 5R37AI033142, 5R01AI052733.

כל העבודה של בעלי החיים שנעשתה בהתאם לתקנות והנחיות של המכון לבעלי חי לימודים אלברט איינשטיין המכללה לרפואה. 1 תנאי גידול של ג neoformans H99 (סרוטיפ) <ol style=";text-align:right;direction:rtl"><li style=";text-align:right;direction:rtl"> לגדול ג פרט מושבות neoformans (CN) על צלחות אגר Sabouraud. </li><li style=";text-align:right;direction:rtl"> יום אחד לפני הניסוי, לבחור מושבה אחת ולחסן 10 מ&quot;ל של מרק Sabouraud. </li><li style=";text-align:right;direction:rtl"> מאפשר לתרבות לגדול בין לילה ב 37 מעלות צלזיוס רועדת במהירות של 250 סל&quot;ד. </li></ol> .2 בידוד והכנת יסודי עצם המקרופאגים מC57 / עכברים BL6 <ol style=";text-align:right;direction:rtl"><li style=";text-align:right;direction:rtl"> להרדים עכברים ידי הצבת בעלי חיים בתא CO 2 עד אין נשימה ארוכה יותר. כצעד שני, cervically לנקוע את הצוואר לפני תחילת נתיחה. לעקר את כל גוף עם 70% אתיל אלכוהול. </li><li style=";text-align:right;direction:rtl"> הסר את שני עצמות הירך ועצמות שוקה והמקום בDMEM סטרילי. </li><li style=";text-align:right;direction:rtl"> הסרת רקמה עודפת ושרירים באמצעות דהlicate מגבונים עד עצמות הן נקיות לחלוטין. </li><li style=";text-align:right;direction:rtl"> מניחים את עצמות רק בשלמותה בצלחת פטרי המכילה 70% אתיל אלכוהול ודגירה במשך 3 דקות כדי להרוג מיקרואורגניזמים הקשורים. הסר עצמות ומניחים בצלחת פטרי עם DMEM סטרילי. </li><li style=";text-align:right;direction:rtl"> לחתוך בזהירות קצות עצמות. החזק עצם מעל צינור חרוטי 50 מ&quot;ל ריק מונח על קרח ובזהירות סומק 10 מ&quot;ל של DMEM הקר באמצעות מחט G 25 דרך כל עצם. הערה: כל עכבר יניב 4 עצמות (2 עצמות ירך, 2 tibias). לכן עכבר אחד אמור להניב כ 40 מ&quot;ל של השעיה תא. </li><li style=";text-align:right;direction:rtl"> השעיה תא צנטריפוגה בטמפרטורת חדר למשך 10 דקות ב 650 x גרם. </li><li style=";text-align:right;direction:rtl"> במהלך צנטריפוגה זו, להכין ומסנן לעקר מקרופאג מח עצם האכלת תקשורת אשר מורכבת מDMEM בתוספת 20% L929, 10% עוברי עגל בסרום, 10% NCTC-109, 1% העט סטרפטוקוקוס, 1% HEPES, 1% L-גלוטמין , 1% חומצות אמינו לא חיוניות, 0.1% 2-mercaptoethanol. </li><li style=";text-align:right;direction:rtl"> גלולה וכתוצאה Resuspend עם 10 מ&quot;ל של האכלת תקשורת. Pass suspens תאיון דרך מסננת 70 מיקרומטר תא לשבש גושי תאים ולהסיר חלקי לכלוך גדול. </li><li style=";text-align:right;direction:rtl"> צלחת 1 מ&quot;ל של השעיה תא לתוך 10 מ&quot;ל של תקשורת האכלה בצלחות פטרי שצוינו לשימוש בתרבית רקמה (עבור הסכום כולל של 10 צלחות). </li><li style=";text-align:right;direction:rtl"> לאפשר לתאים לדבוק ב37 מעלות צלזיוס עם 10% CO 2. הוסף 5 מ&quot;ל של תקשורת האכלה טריות ביום 3 ביום 7, להחליף לחלוטין את תקשורת ההאכלה ומקרופאגים הם מוכנים לשימוש. </li><li style=";text-align:right;direction:rtl"> היום לפני הניסוי, לנתק מקרופאגים מצלחת על ידי הסרת תקשורת האכלה ולהוסיף 5 מ&quot;ל של תא עדין הפשטה מגיב לצלחת. </li><li style=";text-align:right;direction:rtl"> דגירה של 5-10 דקות ב37 מעלות צלזיוס ולהסיר מקרופאגים עם pipetting העדין. </li><li style=";text-align:right;direction:rtl"> תאים גלולה על ידי צנטריפוגה ב650 XG עבור 10 דקות. </li><li style=";text-align:right;direction:rtl"> Resuspend גלולה ב 1 מ&quot;ל של האכלת תקשורת. באמצעות דילול 1:20, לחשב את הריכוז של מקרופאגים ידי pipetting 10 μl של השעיה תא על haemocytometer. </li><li style=";text-align:right;direction:rtl"> שימוש בזכוכית מ&quot;מ 14 תחתית צלחות פטרי, צלחתריכוז של 1 x 10 5 מקרופאגים ישירות על גבי היטב הפנימיים המחזיק מרבי של 200 μl, כך לקחת בזהירות כך שלא יחרוג כרך זה, כפי שמוצג באיור 4. </li><li style=";text-align:right;direction:rtl"> אפשר התאים לדבוק בצלחת פטרי הזכוכית על ידי הצבת את הכלים ב37 מעלות צלזיוס חממה במשך שעה 1. </li><li style=";text-align:right;direction:rtl"> להוסיף 1-2 מ&quot;ל של האכלת תקשורת בתוספת LPS ב1 מ&quot;ג / מ&quot;ל ​​וIFNg ב500 u / ml ולאפשר לתאי דגירה לילה. </li></ol> .3 Co-דגירה של ראשוניים Murine המקרופאגים וג neoformans <ol style=";text-align:right;direction:rtl"><li style=";text-align:right;direction:rtl"> ביום של ניסוי, להסיר 1 מ&quot;ל של תאי תרבות ושמרי גלולה מחוסן לילה על ידי צנטריפוגה במשך 5 דקות ב420 x גרם. </li><li style=";text-align:right;direction:rtl"> שטוף תאים 3 פעמים עם PBS סטרילי כדי להסיר תקשורת ומוצרי cryptococcal תאיים כמו glucuronoxylomannan פוליסכריד (GXM) במהירות ובזמן שהוזכר לעיל. </li><li style=";text-align:right;direction:rtl"> גלולה תא הגלולה ב 1 מ&quot;ל של PBS סטרילי ולעשות דילול 1: 100. פיפטה 10 μl של tהוא הדילול על haemocytometer ולספור תאים. הוספת תאי שמרים במשרד פנים של 1: 5. לדוגמא, אם יש 1 x 10 5 מקרופאגים / טוב, להפוך את ההשעיה תא של 5 x 10 6 / מ&quot;ל של Cn ולהוסיף של פתרון זה 100 μl לסכום כולל של 5 x 10 5 Cn. </li><li style=";text-align:right;direction:rtl"> הוספת נפח מחושב של השעיה תא cryptococcal עד 1 מ&quot;ל של תקשורת האכלה עם נוגדן מב 18B7 בריכוז של 10 מיקרוגרם / מ&quot;ל. דגירה השעיה תא בטמפרטורת חדר למשך 5 דקות. </li><li style=";text-align:right;direction:rtl"> הסירו תקשורת האכלה מזכוכית עם תחתית צלחת פטרי ולשטוף 1x עם PBS סטרילי. הוסף 100 μl של Cn opsonized ישירות לטוב. </li><li style=";text-align:right;direction:rtl"> לאפשר לתאי דגירה לשעה 2 ב 37 מעלות צלזיוס עם 10% CO 2. </li><li style=";text-align:right;direction:rtl"> לאחר שיתוף דגירה, לבדוק על ידי מיקרוסקופ שמקרופאגים הפנימו Cn. כדי להיחשב הפנים, צריכים לראות בבירור תאי cryptococcal בתחומי מקרופאג. </li><li style=";text-align:right;direction:rtl"> 3x צלחת פטרי לשטוף עם PBS סטרילי כדי להסיר כל וכל extracellular Cn. </li><li style=";text-align:right;direction:rtl"> להוסיף 1-2 מ&quot;ל של האכלת תקשורת ללא התוספת של מב 18B7, ומיקרוסקופ להגדיר. </li></ol> Exocytosis .4 חזותי לא אלים בזמן אמת ניצול דיגיטלי אור מיקרוסקופית הערה: כדי לבצע ניסויים אלה, מיקרוסקופ שמגיע עם תא דוגרים מצורף הכולל CO משלוח 2 והסקה נדרש. <ol style=";text-align:right;direction:rtl"><li style=";text-align:right;direction:rtl"> לפני הניסוי, מראש לחמם את החדר דוגרים במשך דקות לפחות 30 ל37 מעלות צלזיוס. ודא שיחידת CO 2 קוראת 5% בתחילת הניסוי. </li><li style=";text-align:right;direction:rtl"> זכוכית מקום תחתית צלחת פטרי על פלטפורמת מיקרוסקופ, לכסות עם CO 2 מכסה, ולסגור את כל הדלתות כדי להבטיח שאין בריחות חום. </li><li style=";text-align:right;direction:rtl"> באמצעות מטרת 10X עם מיקרוסקופ בניגוד שלב, להתמקד בתחום ברור של מקרופאגים הנגועים. בהתבסס על הניסוי, לקבוע את המטרה בשימוש על ידי כמה מקרופאגים צריכים להיחקר. </li><li style=";text-align:right;direction:rtl"> הגדרת תוכנת מיקרוסקופ כדי taKe תמונה כל 4 דקות לתקופה 24 שעות. </li><li style=";text-align:right;direction:rtl"> לאחר 24 שעות, הניסוי הגיע להשלמת פרויקט וכן סך של 361 תמונות יהיה כבר נאסף. לייצא את התמונות האלה כ.jpegs בדחיסת 5%. שימוש בתוכנת J תמונה, להציג תמונות כסטאק חזותי ב5 פריימים לשנייה. אם הסרט צריך להיות שנצפו לפרסום או הצגה, לשמור אותו כאחד .avi או .mov קובץ תלוי באיזה פורמט עובד הכי טוב עבור הצופה. </li></ol>

<ol>
	<li>Voelz, K., May, R. C. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Cryptococcal+Interactions+With+the+Host+Immune+System.">Cryptococcal Interactions With the Host Immune System.</a> Eukaryotic cell. 9 (6), 835-846 (2010).</li><li>Johnston, S. A., May, R. C. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Cryptococcus+interactions+with+macrophages:+evasion+and+manipulation+of+the+phagosome+by+a+fungal+pathogen.">Cryptococcus interactions with macrophages: evasion and manipulation of the phagosome by a fungal pathogen.</a> Cellular microbiology. 15 (3), 403-411 (2012).</li><li>Sabiiti, W., May, R. C. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Mechanisms+of+infection+by+the+human+fungal+pathogen+Cryptococcus+neoformans.">Mechanisms of infection by the human fungal pathogen Cryptococcus neoformans.</a> Future microbiology. 7 (11), 1297-1313 (2012).</li><li>Bliska, J. B., Casadevall, A. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Intracellular+pathogenic+bacteria+and+fungi+&#8212;+a+case+of+convergent+evolution.">Intracellular pathogenic bacteria and fungi &#8212; a case of convergent evolution.</a> Nature Reviews Microbiology. 7, 165-171 (2008).</li><li>Alvarez, M., Casadevall, A. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Cell-to-cell+spread+and+massive+vacuole+formation+after+Cryptococcus+neoformans+infection+of+murine+macrophages.">Cell-to-cell spread and massive vacuole formation after Cryptococcus neoformans infection of murine macrophages.</a> BMC immunology. 8 (1), 16 (2007).</li><li>Ma, H., Croudace, J. E., Lammas, D. A., May, R. C. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Direct+cell-to-cell+spread+of+a+pathogenic+yeast.">Direct cell-to-cell spread of a pathogenic yeast.</a> BMC immunology. 8, 15 (2007).</li><li>Alvarez, M., Casadevall, A. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Phagosome+extrusion+and+host-cell+survival+after+Cryptococcus+neoformans+phagocytosis+by+macrophages.">Phagosome extrusion and host-cell survival after Cryptococcus neoformans phagocytosis by macrophages.</a> Curr Biol. 16 (21), 2161-2165 (2006).</li><li>Ma, H., Croudace, J. E., Lammas, D. A., May, R. C. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Expulsion+of+live+pathogenic+yeast+by+macrophages.">Expulsion of live pathogenic yeast by macrophages.</a> Curr Biol. 16 (21), 2156-2160 (2006).</li><li>Johnston, S. A., May, R. C. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=The+human+fungal+pathogen+Cryptococcus+neoformans+escapes+macrophages+by+a+phagosome+emptying+mechanism+that+is+inhibited+by+Arp2/3+complex-mediated+actin+polymerisation.">The human fungal pathogen Cryptococcus neoformans escapes macrophages by a phagosome emptying mechanism that is inhibited by Arp2/3 complex-mediated actin polymerisation.</a> PLoS pathogens. 6 (8), (2010).</li><li>Carnell, M., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Actin+polymerization+driven+by+WASH+causes+V-ATPase+retrieval+and+vesicle+neutralization+before+exocytosis.">Actin polymerization driven by WASH causes V-ATPase retrieval and vesicle neutralization before exocytosis.</a> The Journal of cell biology. 193 (5), 831-839 (2011).</li><li>Voelz, K., Lammas, D. A., May, R. C. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Cytokine+signaling+regulates+the+outcome+of+intracellular+macrophage+parasitism+by+Cryptococcus+neoformans.">Cytokine signaling regulates the outcome of intracellular macrophage parasitism by Cryptococcus neoformans.</a> Infection and immunity. 77 (8), 3450-3457 (2009).</li><li>Bain, M. J., Lewis, E. L., Okai, B., Quinn, J., Gow, A. R. N., Erwig, L. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Non-lytic+expulsion/exocytosis+of+Candida+albicans+from+macrophages.">Non-lytic expulsion/exocytosis of Candida albicans from macrophages.</a> Fungal genetics and biology. 49 (9), 677-678 (2012).</li></ol>

החוקרים מצהירים כי אין לנו אינטרסים כלכליים מתחרים או סכסוכים אחרים בעלי עניין.

כאן יש לנו תארנו שיטה שבאמצעותה ניתן להקליט אינטראקציות פטרייתי-macrophage ומנותח בזמן אמת על פני תקופה 24 שעות. המעבדה שלנו השתמשה בפרוטוקול זה כדי ללמוד רב של ההיבטים זמניים של exocytosis לא אלים ותמשיך להשתמש במיקרוסקופ בזמן אמת כדי לברר את הרכיבים מורפולוגיים המקיפים את התהליך הזה. לטכניקה זו כדי להניב תוצאות אידיאליים, תשומת לב מיוחדת צריכה להינתן לצעדים מסוימים בפרוטוקול. צפיפות התאים שמצופית בלילה שלפני חשובה כי תאים רבים מדי יכולים ליצור סרט שאינו שמיש כהצגה של התנועה ויחסי הגומלין של תאים בודדים מתעכבת, ואילו מעט מדי תאים עשויים להניב נתונים שאינו משמעותי. המטרה היא להשיג שדה מחולק באופן שווה של מקרופאגים כך שניתן בעקבות מקרופאגים פרט לאורכה של תקופת הזיהום. באותה רוח, שטיפת Cn תאי היא שלב קריטי כמו לשעברtracellular Cn יחלק לאורך זמן אשר יכול לטשטש את השדה ולהוביל לאובדן של נראות של מקרופאגים. בהתאם לאורכו של הסרט, המסגרת יכולה לעבור מחוץ לפוקוס מה שהופך את תמונות לבלתי שמישות ללמוד ולכן, ההקלטה צריכה להיבדק בנקודות שונות במהלך הזיהום. כפי שתואר, יש דרכים שונות בטכניקה זו ניתן לשנות כך שתתאים לפרמטרים של ניסויים אחרים. צבעים רבים ושונים ניאון וסמנים יכולים לשמש כדי להדגיש דינמיקת קרום וphagosomal אבל צריך להיות זהיר של הלבנת תמונה ומשפיעים זה יכול להיות בכושר של התאים. גם מגוון רחב של סוגי תאים יכול לשמש כגון J774.1 כמו מקרופאג-תאים, מונוציטים או אמבות בשיתוף עם זני פטריות אחרים כדי ללמוד את ההבדלים שעלולים להתרחש. אנו מציעים להשתמש במטרת 10X כי הניסויים שלנו, כרוכים באיסוף נתונים של כמות גדולה של תאים, אך אחד יכול להשתמש גבוה יותרמטרה ללמוד רק כמה תאים. העיתוי שכל תמונה שצולמה גם יכול להיות מותאם. אם ניקח תמונה כל 4 דקות ל24 שעות מניבה סרט שפועל בערך דקה 1 באורך כאשר כל המסגרות כבר דחוסות. גם היבט הגדלת (משך הזיהום או הזמן בין מסגרות) מגדיל את כמות קבצים שצריכים להיות מאוחסנים אשר עשוי להיות בעיה עבור חלק מעבדות. exocytosis לא אלים הוא תהליך דינמי מאוד שמתרחש במהירות ובמרווחי זמן שונים במהלך הדבקה. לכן, מנסה ללכוד מקרופאגים עוברים אינטראקציה זה בשיטות אחרות כגון מיקרוסקופיה שידור ואלקטרונים סורקים יכול להיות מאוד נדיר. בשל אופייה של איך דגימות קבועות ומעובד, אחד לא יכול להיות בטוח כי מה שנצפה הוא בודאות exocytosis לא אלים מול תהליכים תאיים אחרים כגון תמוגה או אפופטוזיס. כמו כן, סימן היכר של exocytosis לא אלים הוא שהמארח והפתוגן להישאר באמצעות<html> ble לאחר מכן וזה משהו שלא ניתן להסיק מתמונות קבועות מאז שיטות אלה רק יכולות לייצר תמונות של תהליך ברגע נתון. בעוד פרוטוקול זה יכול לספק אינספור תמונות של תהליכים תאיים, ישנן מספר מגבלות בשימוש בטכניקה זו כדי לחקור אינטראקציות הפתוגן מארח. המטרה הנמוכה אנו משתמשים כדי ללמוד כמות גדולה של מקרופאגים בפעם אחת אינו מאפשר תמונה ברזולוציה גבוהה מספיק כדי להמחיש את יחסי הגומלין בין phagosome וקרום התא, שאינו היבט הבין היטב של exocytosis לא אלים. ברגע שכל התמונות כבר נרשמו, בהודעה הניתוח של מקרופאגים רבים הבאים יכול להיות מאוד משעמם וגוזל זמן. המקרופאגים, גם אלה דבקו זכוכית, יכולים להיות מאוד נעימים וביעברו בתוך ומחוץ למסגרת מהר מאוד. זה יכול לעשות את זה קשה לעקוב אחרי מקרופאגים בודדים מהתחלה ועד הסוף, במיוחד אלה שנמצאים בסמוך לפריפריה של המסגרת. jove_content &quot;&gt; למרות מגבלות אלה, זה הוא פרוטוקול ניתן להשתמש במגוון דרכים כדי ללמוד את ההיבטים שונים של אינטראקציות מאכסן לפתוגן.

השלבים של זיהום פטרייתי בין תאים ומקרופאגים cryptococcal מתועדים היטב 1-3. לאחר תאי שמרים הם מעובדים על ידי מקרופאגים, מגוון רחב של אינטראקציות עלול להתרחש: מקרופאג עשוי lyse שחרור העומס פטרייתי שלה לתוך מרחב החוץ תאי, או שזה יכול לשלוט בזיהום על ידי שמירה על תאי שמרים בתוך גבולות קרום התא שלו 4. עם זאת, לפני כמה שנות תוצאה חדשה שתוארה באופן עצמאי על ידי שתי קבוצות: exocytosis לא אלים, תהליך שבו מקרופאג נמחק כל תאי cryptococcal או לסביבה או תא השכן והן המארח והפתוגן להישאר קיימא 5 -8. מספר מחקרים ניסו להבין את המנגנונים המולקולריים מאחורי אינטראקציה זו, אך עדיין אין לנו הבנה מלאה על מה שמניע את התופעה הזאת. היכולת ללכוד תמונות בזמן אמת ולאחר מכן לאחר מכן לנתח להדביק מרובהעורך מקרופאגים מאפשר לענות על שאלות רבות על התכונות הפיזיות המקיפות exocytosis לא אלים בכל הקשור לעיתוי, יכולת מרחבית, שינוי במורפולוגיה ואפילו לחץ של מקרופאגים בזיהום פטרייתי. ידי מתן אפשרות לתאים להיות שוכנו בסביבה שדומה לזו של חממה, אנו יכולים להציץ באופי הדינמי של אינטראקציות תא מקרופאג פטרייתי. חוקרים השתמשו בטכניקה זו כדי ללמוד מרכיבים שונים של תהליך זה. התפקיד של phagosome בתהליך זה נעשה לכאורה באמצעות מכתים הניאון ויקטינו סוכני חסימה 9, בעוד שקבוצה אחרת השתמשה בשיטה זו כדי להראות שexocytosis לא אלים נחסם בתאים שהיו WASH nucleating תחומים חלבון נמחק 10. ההשפעה של איתות ציטוקינים גם הובררה באמצעות מיקרוסקופ בזמן אמת 11. תהליך זה אינו מוגבל לג neoformans כפי שגם נצפה עם קנדידה אלביקנס, another פתוגן פטרייתי שיש לו את היכולת להדביק מקרופאגים 12. ממצאים אלה הם דוגמאות לאופן ששיטה זו יכולה לספק שפע של מידע לאזור שאנחנו יודעים כל כך מעט על.

<table border="0" cellpadding="0" cellspacing="0" width="976">
	<tbody>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:359px;">Sabouraud Dextrose Agar</td>
			<td style="width:183px;">BD</td>
			<td style="width:227px;">DF0109-17-1</td>
			<td style="width:207px;"></td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;">Sabouraud Dextrose Broth</td>
			<td>BD</td>
			<td>DF0382-17-9</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;">Dubelcco&#39;s Modified Eagle&#39;s Medium(DMEM)</td>
			<td>Corning Cellgro</td>
			<td>10-013-CV</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;">Fetal Calf Serum ( FCS)&#160;</td>
			<td>Atlanta Biologicals</td>
			<td>S12450</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;">NCTC 109</td>
			<td>Invitrogen</td>
			<td>21340-039</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;">Penicillin-Streptomycin</td>
			<td>Gibco</td>
			<td>15140-122</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;">HEPES Buffer</td>
			<td>Corning Cellgro</td>
			<td>25-060-Cl</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;">Glutamax</td>
			<td>Invitrogen</td>
			<td>35050-061</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;">Non-essential Amino Acids</td>
			<td>Corning Cellgro</td>
			<td>25-025-Cl</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;">2-Mercaptoethanol</td>
			<td>Invitrogen</td>
			<td>21985-023</td>
			<td>Toxic</td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;">3003 Tissue Culture Petri Dishes&#160;</td>
			<td>Fisher Scientific&#160;</td>
			<td>08772E</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;">CellStripper</td>
			<td>Corning Cellgro</td>
			<td>25-056-Cl</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;">Mat-tek Glass Bottom Culture Dishes</td>
			<td>MatTek</td>
			<td>P35GC-1.5-14-C</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;">LPS</td>
			<td>Sigma</td>
			<td>L3137</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;">Mouse IFN-g</td>
			<td>Roche</td>
			<td>NC 9222016</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;">mAb 18B7</td>
			<td colspan="2">&#160;&#160;&#160;&#160;&#160;&#160; Non-commerical antibody produced in our lab</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;">Axiovert 200M Microscope with Incubating Chamber</td>
			<td>Zeiss</td>
			<td></td>
			<td></td>
		</tr>
	</tbody>
</table>

visualizing non-lytic exocytosis of cryptococcus neoformans from macrophages using digital light microscopy

היבטים של הזיהום של מקרופאגים ידי neoformans קריפטוקוקוס רבים נחקרו רבים ומוגדרים היטב. עם זאת, אינטראקציה מסוימת שאינו מובנת באופן ברור הוא exocytosis לא אלים. בתהליך זה, תאי שמרים משתחררים למרחב החוץ תאי על ידי מנגנון הבין היטב שמשאיר את שני מקרופאג וCn קיימא. כאן, אנו מתארים כיצד לעקוב מספר גדול של מקרופאגים נגועים בנפרד לתקופה זיהום 24 שעות על ידי מיקרוסקופ-פקע זמן. מקרופאגים נגועים הם שוכנו בתא חימום עם CO 2 אווירה מחוברת למיקרוסקופ המספק את אותם תנאים כמו חממת טכנולוגיה של תרבית התאים. מיקרוסקופיה דיגיטלית חי יכולה לספק מידע על האינטראקציות הדינמיות בין מארח ופתוגן שאינו זמין מתמונות סטטיות. יכולת לדמיין כל תא נגוע יכול לספק רמזים באשר לאופן מקרופאגים להתמודד זיהומים פטרייתיים, ולהיפך. אני טכניקה זוכלי רב עוצמה sa בלימוד הדינמיקה שנמצאות מאחורי תופעה מורכבת.

התמונות שטכניקה זו מייצרת ניתן לנתח במגוון רחב של דרכים לאיסוף מידע המקיף את מה שקורה אחרי התאים phagocytosed ג neoformans. כפי שניתן לראות באיור 1, ישנם כ 100 מקרופאגים שהם או נגועים או נגוע. כל אחד ממקרופאגים אלה מעניק לצופה הזדמנות ללמוד אינטראקציות מאכסן לפתוגן ברמה מאוד מיקרוסקופית. כאיורי 2 ו -3 מופע, יש תוצאות שונות שיכול להתרחש בין תא מקרופאג ושמרים, ואפילו בין מקרופאג-macrophage. יכולים להיות הבקיע המקרופאגים כעוברים exocytosis לא אלים, העברת תאי תאים, או כל תהליך תאי אחר שעלולים להתרחש. התזמון של אירועים כאלה במהלך הזיהום יכול גם להיות הוברר מבוסס על הפרמטרים שנקבעים כאשר מוקלט הסרט. <img alt="איור 1" fo:content-width= Src &quot;5in&quot; = &quot;/ קבצים / ftp_upload / 52,084 / 52084fig1highres.jpg&quot; width = &quot;500&quot; /&gt; איור 1:. שדה של המקרופאגים נגועים נתון זה מראה את כל שדה של מקרופאגים נגועים בנפרד בתחילת תקופת זיהום 24 שעות. יש לציין כי השדה הוא ללא Cn תאי ויותר מכך, עד כמה ברור הוא שמקרופאגים נגועים (כפי שצוינו על ידי ראש חץ גדול) ושאינם מכילים תאים פטרייתי (כפי שצוין על ידי חץ קטן). סרגל קנה מידה מייצג 50 מיקרומטר. <a href="https://www-jove-com.remotexs.ntu.edu.sg/files/ftp_upload/52084/Updated_Field_of_Macrophages.mov" target="_blank">סרט 1:</a> ויזואליזציה של Macrophage- ג neoformans 24 תקופת זיהום שעה. המסגרת הראשונית של הסרט מראה מקרופאגים רבים ברחבי השדה עם כמה שהם נגוע וכמה שphagocytized כמויות משתנות של תאי cryptococcal. כפי שהסרט מתקדם, התאים ar<html> דואר כל ניע וניתן לראות מסתובבים בשטח. אנו מסוגלים לעקוב אחרי כל אחד ממקרופאגים אלה כדי לראות איזה סוג של תהליך תאי שהם עוברים. <img alt="איור 2" fo:content-width="5in" src="/files/ftp_upload/52084/52084fig2highres.jpg" width="500" /> איור 2:. Exocytosis הראשי Murine מקרופאג עובר ללא ממס מקרופאג נגוע (לוח א &#39;, שצוין על ידי ראש חץ לבן) נראה שעבר את השלבים הראשונים של exocytosis לא אלים. Phagosome מתחיל להגדלה (BC פנל) ופטריות העומס מתחיל להשתנות. לאחר מכן תאי Cn כמה משתחררים למרחב תאי כפי שניתן לראות בלוחות DE. מקרופאג שני נגוע בלוח F, שצוין על ידי ראש חץ לבן, גם הוא עובר אירוע exocytosis לא אלים (לוח GH). בסופו של התהליך, גם מקרופאגים נותרים ריק (לוח I), כפי שמוצגים על ידי ראשי החץ הלבנים. סרגל קנה מידה מייצג 25 מיקרומטר. ss = &quot;jove_content&quot;&gt; <a href="https://www-jove-com.remotexs.ntu.edu.sg/files/ftp_upload/52084/Non-Lytic_Exocytosis.avi" target="_blank">סרט 2:.</a> exocytosis החזותי הראשוני Murine מקרופאג עובר לא אלים בסרט הזה, ברור שתאי cryptococcal הם בתוך הגבולות של מקרופאג נגוע. מקרופאג הופך נסער ושמרי תא ניתן לראות ניצנים בתוך phagosome. לאחר מכן תאי cryptococcal הם נמחקו במהירות לסביבה. מקרופאג נגוע שני עובר exocytosis לא אלים ויותר תאי שמרים משתחררים למרחב החוץ תאי. תאי המארח להישאר קיימא לאחר exocytosis cryptococcal כפי שצוינו על ידי היכולת שלהם להמשיך לנוע. <img alt="איור 3" fo:content-width="5in" src="/files/ftp_upload/52084/52084fig3highres.jpg" width="500" /> איור 3:. העברת Cell-Cell ראשי Murine מקרופאג עובר proc נוסףess שאפשר לתפוס את השימוש בפרוטוקול זה הוא העברת תאי תאים אשר מתרחשת כאשר תאי cryptococcal מועברים ממקרופאג אחד למקרופאג השכן. שני מקרופאגים נגועים נמצאים בסמיכות זה לזה שצוין על ידי ראשי חץ לבנים (לוח א &#39;) ולהעביר עוד יותר ליזום העברת תאי תאים (לוח ב&#39;). גשר תאי תאים שצוין על ידי ראשי החץ האדומים נוצר בין שני מקרופאגים כך שתאי cryptococcal אינם חשופים לסביבה במהלך ההעברה (לוח C, E). לאחר שההעברה הושלמה, התאים להתנתק (לוח D, F). סרגל קנה מידה מייצג 25 מיקרומטר. <a href="https://www-jove-com.remotexs.ntu.edu.sg/files/ftp_upload/52084/Cell-Cell_Transfer.mov" target="_blank">סרט 3:.</a> חזותי Cell-Cell העברה בין המקרופאגים נגועים בהזדמנות, מקרופאגים יהיו אינטראקציה באופן כזה שמאפשר העברה של תא cryptococcal בין תאי מארח. תאי השמרים אינם נחשפיםלסביבה תאית ותאי המארח להישאר קיימא. בסרט הזה, שני מקרופאגים נגועים ליצור גשרי תאי תאים בשתי הזדמנויות נפרדות לתאי cryptococcal הסעות ממקרופאג אחד למשנהו. <img alt="איור 4" fo:content-width="5in" src="/files/ftp_upload/52084/52084fig4highres.jpg" width="500" /> איור 4: הכנה מראה סכמטי של תאים.

Watch this Scientific Journal Video about Visualizing Non-lytic Exocytosis of Cryptococcus neoformans from Macrophages Using Digital Light Microscopy at JoVE.com

Visualizing Non-lytic Exocytosis of Cryptococcus neoformans from Macrophages Using Digital Light Microscopy

אנו מתארים כיצד לחזות ג macrophage- neoformans (CN) אינטראקציות בזמן אמת, עם דגש ספציפי על התהליך של exocytosis לא אלים באמצעות מיקרוסקופ אור דיגיטלית. שימוש בטכניקה זו באופן אינדיבידואלי מקרופאגים נגועים ניתן ללמוד לברר היבטים שונים של תופעה זו.

חזותי exocytosis ללא ממס של<em&gt; Neoformans קריפטוקוקוס</em&gt; מהמקרופאגים שימוש דיגיטלי אור מיקרוסקופית

Many aspects of the infection of macrophages by Cryptococcus neoformans have been extensively studied and well defined. However, one particular ...

visualizing-non-lytic-exocytosis-cryptococcus-neoformans-from

Nanyang Technological University

Research

JoVE Journal

Immunology and Infection

Visualizing Non-lytic Exocytosis of Cryptococcus neoformans from Macrophages Using Digital Light Microscopy

11.7K Views.  Albert Einstein College of Medicine.  אנו מתארים כיצד לחזות ג macrophage- neoformans (CN) אינטראקציות בזמן אמת, עם דגש ספציפי על התהליך של exocytosis לא אלים באמצעות מיקרוסקופ אור דיגיטלית. שימוש בטכניקה זו באופן אינדיבידואלי מקרופאגים נגועים ניתן ללמוד לברר היבטים שונים של תופעה זו. ...

Video: Visualizing Non-lytic Exocytosis of Cryptococcus neoformans from Macrophages Using Digital Light Microscopy

Visualizing Cell-to-cell Transfer of HIV using Fluorescent Clones of HIV and Live Confocal Microscopy

By fusing the green fluorescent protein to their favorite proteins, biologists now have the ability to study living complex cellular processes using fluorescence video microscopy. To track the movements of the human immunodeficiency virus core protein during cell-to-cell transmission of human immunodeficiency virus, we have GFP-tagged the Gag protein in the context of an infectious molecular clone of HIV, called HIV Gag-iGFP. We study this viral clone using video confocal microscopy. In the following visualized experiment, we transfect a human T cell line with HIV Gag-iGFP, and we use fluorescently labeled uninfected CD4+ T cells to serve as target cells for the virus. Using the different fluorescent labels we can readily follow viral production and transport across intercellular structures called virological synapses. Simple gas permeable imaging chambers allow us to observe synapses with live confocal microscopy from minutes to days. These approaches can be used to track viral proteins as they move in from one cell to the next.

This visualized experiment is a guide for utilizing a fluorescent molecular clone of HIV for live confocal imaging experiments.

חזותי Cell ל-תא העברה של HIV באמצעות המשובטים פלורסנט של HIV מיקרוסקופיה confocal חיים

By fusing the green fluorescent protein to their favorite proteins, biologists now have the ability to study living complex cellular processes using ...

Assessing Anti-fungal Activity of Isolated Alveolar Macrophages by Confocal Microscopy

The lung is an interface where host cells are routinely exposed to microbes and microbial products. Alveolar macrophages are the first-line phagocytic cells that encounter inhaled fungi and other microbes. Macrophages and other immune cells recognize Aspergillus motifs by pathogen recognition receptors and initiate downstream inflammatory responses. The phagocyte NADPH oxidase generates reactive oxygen intermediates (ROIs) and is critical for host defense. Although NADPH oxidase is critical for neutrophil-mediated host defense1-3, the importance of NADPH oxidase in macrophages is not well defined. The goal of this study was to delineate the specific role of NADPH oxidase in macrophages in mediating host defense against A. fumigatus. We found that NADPH oxidase in alveolar macrophages controls the growth of phagocytosed A. fumigatus spores4. Here, we describe a method for assessing the ability of mouse alveolar macrophages (AMs) to control the growth of phagocytosed Aspergillus spores (conidia). Alveolar macrophages are stained in vivo and ten days later isolated from mice by bronchoalveolar lavage (BAL). Macrophages are plated onto glass coverslips, then seeded with green fluorescent protein (GFP)-expressing A. fumigatus spores. At specified times, cells are fixed and the number of intact macrophages with phagocytosed spores is assessed by confocal microscopy.

A method to evaluate the ability of isolated mouse alveolar macrophages to control the growth of phagocytosed Aspergillus spores by confocal microscopy.

הערכת פעילות אנטי פטרייתי של מבודדים מכתשיים המקרופאגים ידי מיקרוסקופיה confocal

The lung is an interface where host cells are routinely exposed to microbes and microbial products. Alveolar macrophages are the first-line phagocytic ...

Macrophage Cholesterol Depletion and Its Effect on the Phagocytosis of Cryptococcus neoformans

Cryptococcosis is a life-threatening infection caused by pathogenic fungi of the genus Cryptococcus. Infection occurs upon inhalation of spores, which are able to replicate in the deep lung. Phagocytosis of Cryptococcus by macrophages is one of the ways that the disease is able to spread into the central nervous system to cause lethal meningoencephalitis. Therefore, study of the association between Cryptococcus and macrophages is important to understanding the progression of the infection. The present study describes a step-by-step protocol to study macrophage infectivity by C. neoformansin vitro. Using this protocol, the role of host sterols on host-pathogen interactions is studied. Different concentrations of methyl--cyclodextrin (MCD) were used to deplete cholesterol from murine reticulum sarcoma macrophage-like cell line J774A.1. Cholesterol depletion was confirmed and quantified using both a commercially available cholesterol quantification kit and thin layer chromatography. Cholesterol depleted cells were activated using Lipopolysacharide (LPS) and Interferon gamma (IFN&#947;) and infected with antibody-opsonized Cryptococcus neoformans wild-type H99 cells at an effector-to-target ratio of 1:1. Infected cells were monitored after 2 hr of incubation with C. neoformans and their phagocytic index was calculated. Cholesterol depletion resulted in a significant reduction in the phagocytic index. The presented protocols offer a convenient method to mimic the initiation of the infection process in a laboratory environment and study the role of host lipid composition on infectivity.

Macrophage Cholesterol Depletion and Its Effect on the Phagocytosis of Cryptococcus neoformans

In this article, a protocol for infection of macrophages with Cryptococcus neoformans is described. Also, a method for sterol depletion from the macrophages is explained. These protocols provide a guide to study fungal infections in vitro and examine the role of sterols in such infections.

כולסטרול מקרופאג דלדול והשפעתו על phagocytosis של<em&gt; Neoformans קריפטוקוקוס</em

Cryptococcosis is a life-threatening infection caused by pathogenic fungi of the genus Cryptococcus. Infection occurs upon inhalation of spores, which are ...

Investigating Mast Cell Secretory Granules; from Biosynthesis to Exocytosis

Mast Cells (MC) are secretory cells of the immune system that accomplish their physiological and pathological functions by releasing pre-formed and newly synthesized allergic, inflammatory and immunoregulatory mediators. MCs&#8217; mediators affect multiple tissues and organs culminating in allergic and immune responses. The synthesis, storage and release of the MC mediators are highly regulated. The pre-formed mediators are packed in cytoplasmic secretory granules&#160;(SG) that fuse with the plasma membrane and release their content by regulated exocytosis. We present a protocol, based on the co-expression of a gene of interest with a reporter gene that is targeted to the SGs and is released in a regulated fashion alongside the endogenous SG mediators. The protocol enables high resolution four dimensional confocal analyses of the MC SGs and monitoring their timeline from biogenesis to triggered exocytosis. Thus, using this protocol for screening genes of interest for their phenotypic and functional impact allows deciphering the molecular mechanisms that govern the biogenesis and exocytosis of the MC SGs and identifying the regulators involved. Thereby, further insights into the cellular mechanisms that account for MCs function in health and disease should be provided.

The goal of the present&#160;protocol was to develop a method that will allow functional genomic analyses of mast cell secretion. The protocol is based on quantitative assessment of the release of a fluorescent reporter gene cotrasfected with the gene of interest and real time&#160;analyses of the secretory granule&#39;s morphology.

חוקר תא פיטום הפרשת הגרגרים; מיוסינתזה לExocytosis

Mast Cells (MC) are secretory cells of the immune system that accomplish their physiological and pathological functions by releasing pre-formed and newly ...

Biolistic Transformation of a Fluorescent Tagged Gene into the Opportunistic Fungal Pathogen Cryptococcus neoformans

The basidiomycete Cryptococcus neoformans, an invasive opportunistic pathogen of the central nervous system, is the most frequent cause of fungal meningitis worldwide resulting in more than 625,000 deaths per year worldwide.&#160;Although electroporation has been developed for the transformation of plasmids in Cryptococcus, only&#160;biolistic&#160;delivery provides&#160;an effective means to transform&#160;linear&#160;DNA&#160;that can be integrated into the genome by homologous recombination.&#160;
Acetate has been shown to be a major fermentation product during cryptococcal infection, but the significance of this is not yet known.&#160;A bacterial pathway composed of the enzymes xylulose-5-phosphate/fructose-6-phosphate phosphoketolase (Xfp) and acetate kinase (Ack) is one of three potential pathways for acetate production in C. neoformans. Here, we demonstrate the biolistic transformation of a construct, which has the gene encoding Ack fused to the fluorescent tag mCherry, into&#160;C. neoformans. We then confirm integration of the ACK-mCherry fusion into the&#160;ACK&#160;locus.

Biolistic Transformation of a Fluorescent Tagged Gene into the Opportunistic Fungal Pathogen Cryptococcus neoformans

Biolistic transformation is a method used to generate stable integration of DNA into the genome of the opportunistic pathogen Cryptococcus neoformans through homologous recombination. We will demonstrate biolistic transformation of a construct, which has the gene encoding acetate kinase fused to the fluorescent tag mCherry into&#160;C. neoformans.

שינוי Biolistic של פלורסנט Tagged Gene לOpportunistic פטרייתיים פתוגן<em&gt; Neoformans קריפטוקוקוס</em

The basidiomycete Cryptococcus neoformans, an invasive opportunistic pathogen of the central nervous system, is the most frequent cause of fungal ...

Measuring Physiological Responses of Drosophila Sensory Neurons to Lipid Pheromones Using Live Calcium Imaging

Unlike mammals, insects such as Drosophila have multiple taste organs. The chemosensory neurons on the legs, proboscis, wings and ovipositor of Drosophila express gustatory receptors1,2, ion channels3-6, and ionotropic receptors7 that are involved in the detection of volatile and non-volatile sensory cues. These neurons directly contact tastants such as food, noxious substances and pheromones and therefore influence many complex behaviors such as feeding, egg-laying and mating. Electrode recordings and calcium imaging have been widely used in insects to quantify the neuronal responses evoked by these tastants. However, electrophysiology requires specialized equipment and obtaining measurements from a single taste sensillum can be technically challenging depending on the cell-type, size, and position. In addition, single neuron resolution in Drosophila can be difficult to achieve since taste sensilla house more than one type of chemosensory neuron. The live calcium imaging method described here allows responses of single gustatory neurons in live flies to be measured. This method is especially suitable for imaging neuronal responses to lipid pheromones and other ligand types that have low solubility in water-based solvents.

Measuring Physiological Responses of Drosophila Sensory Neurons to Lipid Pheromones Using Live Calcium Imaging

The forelegs and proboscis of Drosophila contain a rich repertoire of gustatory sensory neurons. Here, we present a method using calcium imaging to measure physiological responses from sensory neurons in the foreleg and proboscis of live flies upon exogenous application of a gustatory pheromone.

מדידת תגובות פיזיולוגיות של<em&gt; תסיסנית</em&gt; עצב סנסורי כדי ליפידים פרומונים שימוש סידן הדמיה חיה

Unlike mammals, insects such as Drosophila have multiple taste organs. The chemosensory neurons on the legs, proboscis, wings and ovipositor of Drosophila ...

Isolation, Characterization, and Purification of Macrophages from Tissues Affected by Obesity-related Inflammation

Obesity promotes a chronic inflammatory state that is largely mediated by tissue-resident macrophages as well as monocyte-derived macrophages. Diet-induced obesity (DIO) is a valuable model in studying the role of macrophage heterogeneity; however, adequate macrophage isolations are difficult to acquire from inflamed tissues. In this protocol, we outline the isolation steps and necessary troubleshooting guidelines derived from our studies for obtaining a suitable population of tissue-resident macrophages from mice following 18 weeks of high-fat (HFD) or high-fat/high-cholesterol (HFHCD) diet intervention. This protocol focuses on three hallmark tissues studied in obesity and atherosclerosis including the liver, white adipose tissues (WAT), and the aorta. We highlight how dualistic usage of flow cytometry can achieve a new dimension of isolation and characterization of tissue-resident macrophages. A fundamental section of this protocol addresses the intricacies underlying tissue-specific enzymatic digestions and macrophage isolation, and subsequent cell-surface antibody staining for flow cytometric analysis. This protocol addresses existing complexities underlying fluorescent-activated cell sorting (FACS) and presents clarifications to these complexities so as to obtain broad range characterization from adequately sorted cell populations. Alternate enrichment methods are included for sorting cells, such as the dense liver, allowing for flexibility and time management when working with FACS. In brief, this protocol aids the researcher to evaluate macrophage heterogeneity from a multitude of inflamed tissues in a given study and provides insightful troubleshooting tips that have been successful for favorable cellular isolation and characterization of immune cells in DIO-mediated inflammation.

This protocol allows a researcher to isolate and characterize tissue-resident macrophages in various hallmark inflamed tissues extracted from diet-induced models of metabolic disorders.

בידוד, אפיון, טיהור של מקרופאגים רקמות מושפעות על ידי דלקת הקשורות להשמנת יתר

Obesity promotes a chronic inflammatory state that is largely mediated by tissue-resident macrophages as well as monocyte-derived macrophages. ...

Visualizing Macrophage Extracellular Traps Using Confocal Microscopy

A primary method used to define the presence of neutrophil extracellular traps (NETs) is confocal microscopy. We have modified established confocal microscopy methods to visualize macrophage extracellular traps (METs). These extracellular traps are defined by the presence of extracellular chromatin with co-expression of other components such as granule proteases, citrullinated histones, and peptidyl arginase deiminase (PAD). The expression of METs is generally measured after exposure to a stimulus and compared to un-stimulated samples. Samples are also included for background and isotype control. Cells are analyzed using well-defined image analysis software. Confocal microscopy may be used to define the presence of METs both in vitro and in vivo in lung tissue.

Macrophage extracellular traps are a newly described entity. This article will concentrate on confocal microscopy methods and how they are visualized in vitro and in vivo from lung samples.

להמחיש מלכודות חוץ-תאי מקרופאג באמצעות מיקרוסקופיה קונפוקלית

A primary method used to define the presence of neutrophil extracellular traps (NETs) is confocal microscopy. We have modified established confocal ...

Isolation of Salmonella typhimurium-containing Phagosomes from Macrophages

Salmonella typhimurium is a facultative intracellular bacterium that causes gastroenteritis in humans. After invasion of the lamina propria, S. typhimurium bacteria are quickly detected and phagocytized by macrophages, and contained in vesicles known as phagosomes in order to be degraded. Isolation of S. typhimurium-containing phagosomes have been widely used to study how S. typhimurium infection alters the process of phagosome maturation to prevent bacterial degradation. Classically, the isolation of bacteria-containing phagosomes has been performed by sucrose gradient centrifugation. However, this process is time-consuming, and requires specialized equipment and a certain degree of dexterity. Described here is a simple and quick method for the isolation of S. typhimurium-containing phagosomes from macrophages by coating the bacteria with biotin-streptavidin-conjugated magnetic beads. Phagosomes obtained by this method can be suspended in any buffer of choice, allowing the utilization of isolated phagosomes for a broad range of assays, such as protein, metabolite, and lipid analysis. In summary, this method for the isolation of S. typhimurium-containing phagosomes is specific, efficient, rapid, requires minimum equipment, and is more versatile than the classical method of isolation by sucrose gradient-ultracentrifugation.

Isolation of Salmonella typhimurium-containing Phagosomes from Macrophages

We describe here a simple and quick method for the isolation of Salmonella typhimurium-containing phagosomes from macrophages by coating the bacteria with biotin and streptavidin.

בידוד של סלמונלה typhimurium-המכיל Phagosomes של מקרופאגים

Salmonella typhimurium is a facultative intracellular bacterium that causes gastroenteritis in humans. After invasion of the lamina propria, S. ...

Visualizing Intracellular SNARE Trafficking by Fluorescence Lifetime Imaging Microscopy

Soluble N-ethylmaleimide sensitive fusion protein (NSF) attachment protein receptor (SNARE) proteins are key for membrane trafficking, as they catalyze membrane fusion within eukaryotic cells. The SNARE protein family consists of about 36 different members. Specific intracellular transport routes are catalyzed by specific sets of 3 or 4 SNARE proteins that thereby contribute to the specificity and fidelity of membrane trafficking. However, studying the precise function of SNARE proteins is technically challenging, because SNAREs are highly abundant and functionally redundant, with most SNAREs having multiple and overlapping functions. In this protocol, a new method for the visualization of SNARE complex formation in live cells is described. This method is based on expressing SNARE proteins C-terminally fused to fluorescent proteins and measuring their interaction by F&#246;rster resonance energy transfer (FRET) employing fluorescence lifetime imaging microscopy (FLIM). By fitting the fluorescence lifetime histograms with a multicomponent decay model, FRET-FLIM allows (semi-)quantitative estimation of the fraction of the SNARE complex formation at different vesicles. This protocol has been successfully applied to visualize SNARE complex formation at the plasma membrane and at endosomal compartments in mammalian cell lines and primary immune cells, and can be readily extended to study SNARE functions at other organelles in animal, plant, and fungal cells.

This protocol describes a new method allowing for the quantitative visualization of complex formation of SNARE proteins, based on F&#246;rster resonance energy transfer, and fluorescence lifetime imaging microscopy.

להמחיש מוקש תאיים סחר על-ידי קרינה פלואורסצנטית שלמים הדמיה במיקרוסקופ

Soluble N-ethylmaleimide sensitive fusion protein (NSF) attachment protein receptor (SNARE) proteins are key for membrane trafficking, as they catalyze ...

חזותי exocytosis ללא ממס של

Summary

Explore More Videos

Chapters in this video