This work was partially supported by B.G. Negev technology and Linda Powers's contribution.

ניסויים בבעלי חיים אושרו על ידי ועדת האתיקה לניסויים בבעלי חיים באוניברסיטת בן גוריון (IL-39-08-2010). הפקת חלבון .1 עכבר מוח <ol style=";text-align:right;direction:rtl"><li style=";text-align:right;direction:rtl"> הכן 3 צינורות של 15 מ&quot;ל כל אחת מכיל 5 מ&quot;ל צינורות הפתרון ומקום של רינגר על קרח. </li><li style=";text-align:right;direction:rtl"> להקריב את העכבר באמצעות ההרדמה Isoflurane (זהירות - להשתמש במנדף כימי) ל10-20 שניות אחריו נקע בצוואר הרחם ועריפת ראש מיידי. </li><li style=";text-align:right;direction:rtl"> הסר את המוח מהגולגולת ולשטוף במשך כמה שניות עם הפתרון של קרח קר הצלצול כדי למנוע נזק לרקמת המוח. </li><li style=";text-align:right;direction:rtl"> באמצעות סכין כירורגית, להפריד את המוח הקטן (CR) וגזע המוח (BS) מקליפת המוח הקדמית. בשלב הבא, להפריד את המוח הקטן מגזע המוח ולחתוך את האונה הקדמית (FL) מקליפת המוח הקדמית; להסיר את הנורה חוש הריח מהאונה הקדמית. הנח את האזורים במוח 3 ב15 מ&quot;ל הצינורות המיועדים. </li><li style=";text-align:right;direction:rtl"> Homogenize הרקמות בצינור אחד. הוספת frפתרון קרח אש הצלצול של קר ולכן כל צינור מכיל את אותו נפח ו צנטריפוגות במשך 7 דקות ב800 x גרם. </li><li style=";text-align:right;direction:rtl"> הסר את supernatant ולהוסיף של חיץ תמוגה בחורים 100 μl על צינור אחד. מערבבים היטב, על ידי העברה כמה פעמים הפתרון (~ 10) באמצעות מזרק 1 מ&quot;ל עם מחט G 21, ולדגור על קרח למשך 30 דקות. </li><li style=";text-align:right;direction:rtl"> העבר את התוכן של כל צינור לצינור מיקרו צנטריפוגות חדש ו צנטריפוגות במשך 30 דקות ב 13,000 x גרם. העבר את supernatant לצינור מיקרו צנטריפוגות חדש ולקבוע את ריכוז החלבון בשיטה הוקמה בעבר. אחסן את תמציות החלבון בaliquots של 10 μl ב -80 מעלות צלזיוס. </li></ol> .2 TRAP Assay הכנת מכשירים, פתרונות תגובה, וחישובי דילול חלבון <ol style=";text-align:right;direction:rtl"><li style=";text-align:right;direction:rtl"> הכן מספר המתאים של צינורות מיקרו צנטריפוגות שכותרתו עבור דילולים תמצית חלבון וחיץ תגובת telomerase. לבצע את כל pipetting בפרוטוקול באמצעות טיפים מסנן למניעת זיהום. </li&gt; <li style=";text-align:right;direction:rtl"> להפשיר את הפתרונות על הקרח הבא: תערובת TRAP תגובת 10x, פריימר TS, dNTP של, תמציות UPW וחלבון (ראה טבלה של חומרים לריכוזי חומרים כימיים וחומרים כימיים). </li><li style=";text-align:right;direction:rtl"> לדלל את הפתרון של תמצית החלבון לריכוז סופי של 1 מיקרוגרם / μl באמצעות מים טהורים לחלוטין (UPW). </li></ol> .3 תגובת הטלומרז <ol style=";text-align:right;direction:rtl"><li style=";text-align:right;direction:rtl"> הכן תערובת תגובת telomerase ידי הוספה הבאה לצינור מיקרו צנטריפוגות: לערבב 2 μl TRAP (10x), פריימר μl 1 TS (0.1 מיקרוגרם), dNTPs 1 μl (10 מ&quot;מ) ו15 UPW μl. לדוגמאות רבות, להכפיל כמויות הנ&quot;ל במספר דוגמאות, בתוספת 1. </li><li style=";text-align:right;direction:rtl"> הוספת 19 μl של תערובת התגובה לצינור כל תגובה ולהוסיף 1 μl של התמצית מדוללת חלבון (1 מיקרוגרם חלבונים) על צינור אחד עבור נפח סופי של μl 20. </li><li style=";text-align:right;direction:rtl"> מניחים את צינורות התגובה באמבט מים מחוממים מראש 30 מעלות צלזיוס למשך 45 דקות. </li></ol> .4 תגובת PCR <ol style=";text-align:right;direction:rtl"><li style=";text-align:right;direction:rtl"> חמש עשרה מילn לפני סוף תגובת telomerase, להפשיר הפתרונות הבאים: פריימר ACX, טיטניום תקי הצפת, UPW. </li><li style=";text-align:right;direction:rtl"> הכן תערובת תגובת PCR על ידי הוספה הבאה לצינור מיקרו צנטריפוגות: 2.5 μl טיטניום תקי חוצץ (10x), פריימר 1 μl ACX (0.1 מיקרוגרם), 2 μl UPW (μl 1 כאשר IC משמש) ו0.5 μl טיטניום תקי פולימראז (50x). לדוגמאות רבות, להכפיל כמויות הנ&quot;ל במספר דוגמאות בתוספת 2. </li><li style=";text-align:right;direction:rtl"> להוסיף 6 μl של PCR לערבב על צינור אחד PCR ולהוסיף כל הנפח של תגובת telomerase (20 μl) לצינור אחד עבור נפח סופי של μl 26. </li><li style=";text-align:right;direction:rtl"> הכנס את צינורות PCR לCycler תרמו PCR ולהפעיל את התכנית הבאה: - 90 ° C - 2 דקות. - 94 ° C -. שניות 30 * - 60 ° C -. שניות 30 * - 72 ° C -. שניות 45 * - 72 ° C - 2 דקות. מוצרי PCR חנות ב -20 C °. * = 34 מחזורים </li></ol> .5 Agarose Mini-GEהכנת ליטר, דוגמאות ריצה, וג&#39;ל הכתמה <ol style=";text-align:right;direction:rtl"><li style=";text-align:right;direction:rtl"> הוסף 25 מ&quot;ל חיץ אלקטרופורזה המצונן (TBE) ובר ומערבב לכוס שהיא 2-4 פעמים הנפח של פתרון החיץ ומפזרים באיטיות ב1.125 גרם של הרזולוציה הגבוהה אבקת agarose (HR) ואילו הפתרון הוא עורר במהירות . הסר את בר והמערבב, מכסה את הכוס עם ניילון נצמד ופירס בחור קטן לאוורור. מחממים את הכוס במיקרוגל בעצמה &quot;נמוכה&quot; במשך 3 דקות ולאחר מכן לעבור לשלטון &quot;גבוה&quot; ולחמם את הפתרון בפולסים קצרים עם טיפול שלא לגרום לשפיכה. שים לב שכאשר הקצף שנוצר על ידי חימום הופך בועות גדולות ונעלם אחרי כמה שניות, agarose מוכן. </li><li style=";text-align:right;direction:rtl"> עופרת ג&#39;ל למנגנון מיני ג&#39;ל אופקי, לאחר ג&#39;ל מתמצק בטמפרטורת חדר מאפשר את הג&#39;ל לצנן ל20 דקות ב 4 ° C לפני השימוש. </li><li style=";text-align:right;direction:rtl"> לטעון כל מסלול עם 25 μl של מדגם TRAP (מוצרי PCR TRAP 20 μl ו5 צבע ג&#39;ל טעינת μl 6x) ולרוץ ב110 V עבור 3 שעות בחדר קר 4 מעלות צלזיוס. </li><li style=";text-align:right;direction:rtl"> הכן 3x כתם חומצת גרעין עובד פתרון על ידי הוספת 15 μl 10,000x כתם גרעין חומצה, פתרון מניות 50 מ&quot;ל זוגי מים מזוקקים (DDW) עם 0.1 M NaCl (0.29 ז). כתם ג&#39;ל ל20 דקות עם רעד עדין. </li><li style=";text-align:right;direction:rtl"> השתמש transilluminator UV עם 302 אורך גל כדי לראות את להקות DNA סולם TRAP. </li></ol>

<ol>
	<li>Urquidi, V., Tarin, D., Goodison, S. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Role+of+telomerase+in+cell+senescence+and+oncogenesis.">Role of telomerase in cell senescence and oncogenesis.</a> Annu Rev Med. 51, 65-79 (2000).</li><li>Cong, Y., Shay, J. W. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Actions+of+human+telomerase+beyond+telomeres.">Actions of human telomerase beyond telomeres.</a> Cell Res. 18, 725-732 (2008).</li><li>Tichon, A., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Oxidative+stress+protection+by+novel+telomerase+activators+in+mesenchymal+stem+cells+derived+from+healthy+and+diseased+individuals.">Oxidative stress protection by novel telomerase activators in mesenchymal stem cells derived from healthy and diseased individuals.</a> Curr.Mol. Med. 13, 1010-1022 (2013).</li><li>Lannilli, F., Zalfa, F., Gartner, A., Bagni, C., Dotti, C. G. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Cytoplasmic+TERT+associates+to+RNA+granules+in+fully+mature+neurons:+Role+in+the+translational+control+of+the+cell+cycle+inhibitor+p15INK4B.">Cytoplasmic TERT associates to RNA granules in fully mature neurons: Role in the translational control of the cell cycle inhibitor p15INK4B.</a> PloS one. 8, e66602 (2013).</li><li>De Jesus, B. B., Blasco, M. A. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Potential+of+telomerase+activation+in+extending+health+span+and+logevity.">Potential of telomerase activation in extending health span and logevity.</a> Curr opinion in Cell Biology. 24, 1-5 (2012).</li><li>Blackburn, E., Collins, K. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Telomerase:+An+RNP+enzyme+synthesizes+DNA.">Telomerase: An RNP enzyme synthesizes DNA.</a> Cold Spring Harb Perspect Biol. 3, 1-9 (2011).</li><li>Klapper, W., Shin, T., Mattson, M. P. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Differential+regulation+of+telomerase+activity+and+TERT+expression+during+brain+development+in+mice.">Differential regulation of telomerase activity and TERT expression during brain development in mice.</a> J. Neurosci. Res. 64, 252-260 (2001).</li><li>Caporaso, G. L., Lim, D. A., Alvarez-Buylla, A., Chao, M. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Telomerase+activity+in+the+subventricular+zone+of+adult+mice.">Telomerase activity in the subventricular zone of adult mice.</a> Mol. Cell Neurosci. 23, 693-702 (2003).</li><li>Eitan, E., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Novel+Telomerase-increasing+compound+in+mouse+brain+delays+the+onset+of+amyotrophic+lateral+sclerosis.">Novel Telomerase-increasing compound in mouse brain delays the onset of amyotrophic lateral sclerosis.</a> EMBO Mol. Med. 4, 313-329 (2012).</li><li>Kim, N. W., Wu, F. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Advances+in+quantification+and+characterization+of+telomerase+activity+by+the+telomeric+repat+amplification+protocol+(TRAP).">Advances in quantification and characterization of telomerase activity by the telomeric repat amplification protocol (TRAP).</a> Nuc. Acid Res. 25, 2595-2597 (1997).</li></ol>

The authors declare that they have no competing financial interests.

ניתוח של פעילות telomerase במוח העכבר באמצעות assay TRAP מורכב מ -4 שלבים עיקריים: 1) חלבוני חילוץ מאזורים ספציפיים של רקמת המוח 2) TS התארכות פריימר על ידי telomerase - תגובת telomerase 3) הגברה של תוצרי תגובת telomerase על ידי 4 PCR הפרדה) של מוצרי PCR באמצעות ג&#39;ל agarose ברזולוציה גבוהה. assay TRAP שונה זה מטפל בשני קשיים עיקריים העולים מassay המסורתי: השימוש בdCTP של רדיואקטיביים לגילוי רגיש של הפרדת מוצרים ועמוד PCR של סולם DNA. ג&#39;ל agarose רזולוציה גבוה מפשט את זיהוי של תוצרי תגובת telomerase (סולם DNA) בהשוואה לקשה להתמודד עמוד רצף. בנוסף, צביעת חומצות הגרעין היא פתרון שאינו רעיל עם רגישות גבוהה הנדרשת לזיהוי של כמות הקטנה של DNA. תשומת לב מיוחדת צריכה להינתן לשלבים הקריטיים הבאים: 1) שמירת הזמן בין ההסרה ולתפעול רקמה עד למינימום כדי לשמור על שלמות חלבון 2) בחורים יש להימנע refreezing מאגר תמוגה צריכה להישמר 3 תמציות חלבון) בaliquots ומופשרים פעם לפני השימוש. הימנע refreezing של דגימות. בעיות עלולות להתרחש במהלך שלב הכנת ג&#39;ל מאז agarose ג&#39;ל ריכוז הגבוה נוטה גלישה ודורש תשומת לב רבה במהלך בישול. הטכניקה מחזיקה במספר מגבלות עם ההכרח של ריצת ג&#39;ל בחדר קר. בנוסף, הכמות הנמוכה של מוצרי PCR לא ניתן לראות על שולחן UV. רמת פעילות telomerase משתנה בין רקמות שונות ונחשבת לנמוך במוח. פרוטוקול זה מציע שיטת זיהוי רגישה יותר, בהשוואה לassay רדיואקטיבי המסורתי המאפשר זיהוי טוב יותר של פעילות telomerase במוח. למרות ששיטות זמן יעיל שונות (ערכות זמינות צעד אחד assay TRAP, באמצעות labeleד TS פריימר לגילוי) שיטות אלה באופן משמעותי יותר יקר. יתר על כן, השימוש בagarose מבטל את המפגע הרעיל של שימוש בג&#39;ל polyacrylamide. כפי שנחשף מתוצאות הנציג, על ידי שימוש בשיטה שתוארה לעיל, ניתן להדגים את ההבדלים ברמות פעילות telomerase בין האזורים השונים במוח ובין הזכר לנקבה. שיטה זו יכולה לשמש לזיהוי של פעילות telomerase ברקמות נורמליות אחרות עם פעילות telomerase נמוכה.

Telomerase הוא ribonucleoprotein המורכבת מtelomerase ההפוך transcriptase (טרט), למקטע הקטליטית של telomerase, ומרכיב RNA (TERC). התפקיד הקנוני של telomerase הוא לשמר את האורך הנכון של הטלומרים על ידי הוספת רצפים חוזרים (TTAGGG) לקצות telomeric, לכן קידום יושרת גנומי, ותא התפשטות 1. תפקידים נוספים יוחסו לטרט בתאים, כלומר היא מעניקה התנגדות לאפופטוזיס הנגרם על ידי סוכן מזיק שונים 2, מגן על תאי גזע mesenchymal אדם מלחץ חמצוני 3, ומשחק תפקיד הפרו הישרדות בתאי עצב מובחן באופן מלא על ידי הקשר שלה לTIA1 RNA החיובי גרגרים 4. טרט מתבטא ופועל בעיקר בתאים סומטיים החלוקה וברוב סוגי הסרטן, ואילו רמות ביטוי אנזים והפעילות מוסדרות בחוזקה בתאי החלוקה הלא 5,6. מחקרים הראו כי בrמוח אודנט, פעילות telomerase הופך בלתי ניתנת לגילוי על ידי לאחר לידה יום 10, בעוד טרט mRNA נשמר ברמות נמוכות יותר בבגרותם 7. מחקרים אחרים הראו פעילות telomerase בתוך האזור הבוגר תת חדרית, הנורה חוש הריח, ההיפוקמפוס, ובמוח הקטן המבוגר והקליפה 8. אנחנו הוכיחו לאחרונה כי תרכובות רומן המגבירות ביטוי telomerase ופעילות במייתרי המוח ועמוד השדרה הפעילו השפעות נוירו בN-מתיל-D-aspartate (NMDA) - עכברים שהוזרקו, עכבו את תחילתו ואת התקדמות המחלה הטרשת לרוחב amyotrophic במהונדס SOD1 עכברים והגדילו את ההישרדות של תאי עצב מוטוריים בחוט השדרה של עכברים אלה 9. כדי להבין את התפקיד הפרו הישרדות של telomerase בתאי עצב ובמוח באופן מלא, זה חיוני כדי לפתח assay מהיר פשוט ויחסית רגיש לזיהוי של פעילות telomerase באזורים השונים של המוח. R telomericפרוטוקול ההגברה EPEAT (TRAP) הוא assay רגיש ידוע שילוב הפעילות הקנוני של telomerase ותגובת השרשרת של פולימראז (PCR). ב assay זה, telomerase מוסיף TTAGGG חוזר למצע telomerase (פריימר TS) oligonucleotide, ואחריו ההגברה PCR אשר מייצרת 6 זוגות בסיס סולם DNA (נ&quot;ב) באמצעות TS פריימר ההפוכה -. ACX 32 P כותרת dCTP של המשמשים לאיתור כמות נמוכה של מוצרי PCR. סולם DNA נפתר על ידי ג&#39;ל אלקטרופורזה polyacrylamide רצף (עמוד). שתי עוצמת להקות DNA ואורכו של סולם DNA משקפים הסכום של מולקולות אנזים פעילים וprocessivity בהתאמה 10. assay המסורתי זה מחזיק כמה קשיים עיקריים: הסכנה של חשיפה לחומרים רדיואקטיביים, גדולים וקשים להתמודד עמוד רצף והצריכה של ריצת ג&#39;ל הזמן וחשיפת סרט של מוצר רדיואקטיבי (לילה בשני המקרים). </p&gt; פרוטוקול זה מציע assay משופר אינו רדיואקטיביים agarose מיני ג&#39;ל המבוסס. הסולם נ&quot;ב DNA 6 נפתר באמצעות 4.5% agarose ג&#39;ל ברזולוציה גבוהה והאיתור מושגת באמצעות כתם חומצת גרעין רגיש מאוד. השילוב של שימוש ברזולוציה גבוהה agarose מיני ג&#39;ל וכתם חומצת גרעין רגיש מציע קל לטפל assay, מבטל את הסכנה של חשיפה לקרינה רדיואקטיבית ולקצר באופן משמעותי את משך זמן assay הכולל מ3 ימים לכמה שעות.

<table border="0" cellpadding="0" cellspacing="0" width="1102">
	<tbody>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:251px;">Name of Material/ Equipment</td>
			<td style="width:83px;">Company</td>
			<td style="width:143px;">Catalog Number</td>
			<td style="width:628px;">Comments/Description</td>
		</tr>
		<tr height="49">
			<td height="49" style="height:49px;width:251px;">TRAP Mix (X10)</td>
			<td style="width:83px;"></td>
			<td style="width:143px;"></td>
			<td style="width:628px;">Made manually, mix the following in UPW: 630mM KCl, 200mM Tris-HCl pH8.2, 10mM EDTA, 15mM MgCl2, 1mg/ml BSA, 0.5% TWEEN (purchased from sigma). Aliquots are freezed&#160; in -20 C.</td>
		</tr>
		<tr height="41">
			<td height="41" style="height:41px;width:251px;">Ringer&#39;s solution</td>
			<td style="width:83px;"></td>
			<td style="width:143px;"></td>
			<td style="width:628px;">Made manually, mix the following in DDW: 124mM NaCl, 3mM KCl, 1.25mM NaH2PO4*H2O, 2mM MgSO4, 26mM NaHCO3, 1.802 g/L D-(+)-glucose anhydrous.</td>
		</tr>
		<tr height="42">
			<td height="42" style="height:42px;width:251px;">Isoflurane</td>
			<td style="width:83px;">Minrad INC.</td>
			<td style="width:143px;">NDC 60307-110-10</td>
			<td style="width:628px;">Handle with care in a chemical hood</td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:251px;">dNTP&#39;s 10 mM</td>
			<td style="width:83px;">Sigma</td>
			<td style="width:143px;">D7295</td>
			<td style="width:628px;"></td>
		</tr>
		<tr height="42">
			<td height="42" style="height:42px;width:251px;">TS primer (5&#39;-AATCCGTCGAGCAGAGTT-3&#39;)</td>
			<td style="width:83px;">Sigma</td>
			<td style="width:143px;"></td>
			<td style="width:628px;">DNA oligos orderd in DRY format and UPW added according to requierd concentration</td>
		</tr>
		<tr height="63">
			<td height="63" style="height:63px;width:251px;">ACX primer (5&#39;-GCGCGGCTTACCCTTACCCTTACCCTAACC-3&#39;)</td>
			<td style="width:83px;">Sigma</td>
			<td style="width:143px;"></td>
			<td style="width:628px;">DNA oligos orderd in DRY format and UPW added according to requierd concentration</td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:251px;">Titanium Taq Polymerase/Buffer</td>
			<td style="width:83px;">Clontech</td>
			<td style="width:143px;">S1792/S1793</td>
			<td style="width:628px;"></td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:251px;">High Resolution agarose</td>
			<td style="width:83px;">Sigma</td>
			<td style="width:143px;">A4718</td>
			<td style="width:628px;">Any high quality high-resolution agarose may be sutible</td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:251px;">Mini-gel apparatus&#160;</td>
			<td style="width:83px;">Bio-Rad</td>
			<td style="width:143px;">170-4466</td>
			<td style="width:628px;"></td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:251px;">Nucleic-acid Stain (GEL-RED)</td>
			<td style="width:83px;">Biotium</td>
			<td style="width:143px;">41003</td>
			<td style="width:628px;"></td>
		</tr>
		<tr height="42">
			<td height="42" style="height:42px;width:251px;">IC primer (5&#39;-ATCGCTTCTCGGCCTTTT-3&#39;)</td>
			<td style="width:83px;">Sigma</td>
			<td style="width:143px;"></td>
			<td style="width:628px;">DNA oligos orderd in DRY format and UPW added according to requierd concentration</td>
		</tr>
		<tr height="63">
			<td height="63" style="height:63px;width:251px;">CHAPS lysis buffer</td>
			<td style="width:83px;">Cell Signaling Technology</td>
			<td style="width:143px;">9852S</td>
			<td>Add PMSF (protease inhibitor) to a final concentration of 1mM</td>
		</tr>
		<tr height="42">
			<td height="42" style="height:42px;width:251px;">Ultra Pure Water (UPW)</td>
			<td style="width:83px;">Biological Industries</td>
			<td style="width:143px;">01-866-1B</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="62">
			<td height="62" style="height:62px;width:251px;">CD-1 mice</td>
			<td style="width:83px;">HARLAN Laboratories INC.</td>
			<td style="width:143px;"></td>
			<td></td>
		</tr>
	</tbody>
</table>

telomerase activity in the various regions of mouse brain: non-radioactive telomerase repeat amplification protocol (trap) assay

Telomerase, ribonucleoprotein, הוא אחראי לשמירה על אורך הטלומרים ולכן קידום יושרה, התפשטות, ותוחלת חיים הגנומי. בנוסף, telomerase מגן על המיטוכונדריה מלחץ חמצוני ומעניק התנגדות לאפופטוזיס, המצביע על החשיבות האפשרית שלו שלשרד של אי mitotic, תאים מאוד פעילים כגון תאי עצב. אנחנו הוכיחו בעבר את היכולת של מפעילי telomerase רומן להגביר את פעילות telomerase וביטוי באזורים במוח העכבר השונים ולהגן על תאי הנוירונים מוטוריים מלחץ חמצוני. תוצאות אלו מחזקות את הרעיון שtelomerase מעורב בהגנה על תאי עצב מנגעים שונים. כדי להדגיש את תפקידו של telomerase במוח, אנחנו כאן להשוות את הפעילות של telomerase במוח עכבר זכר ונקבה ואת תלותה בגיל. assay TRAP הוא שיטה סטנדרטית לאיתור פעילות telomerase ברקמות שונות או שורות תאים. כאן אנו מדגימים את analyאחות של פעילות telomerase בשלושה אזורים במוח העכבר על ידי שאינו denaturing הפקת חלבון באמצעות בחורים תמוגה חיץ ואחריו שינוי של assay TRAP הסטנדרטי. ב assay 2-שלב זה, telomerase אנדוגני מתארך מצע ספציפי telomerase (פריימר TS) על ידי הוספת TTAGGG 6 חזרות נ&quot;ב (תגובת telomerase). תוצרי תגובת telomerase הם מוגברים על ידי תגובת PCR יצירת סולם DNA של 6 תוספות נ&quot;ב. הניתוח של סולם DNA נעשה על ידי 4.5% ג&#39;ל אלקטרופורזה agarose ברזולוציה גבוהה ואחרי צביעה עם כתם חומצת גרעין רגיש מאוד. בהשוואה לassay TRAP המסורתי שעושה שימוש ב32 P כותרת dCTP של רדיואקטיביים לגילוי DNA וג&#39;ל אלקטרופורזה polyacrylamide לפתרון סולם DNA, פרוטוקול זה מציע זמן שאינו רעיל חיסכון assay מלכודת להערכת פעילות telomerase במוח העכבר, הממחיש את היכולת לזהות הבדלים בtelomerasפעילות דואר באזור במוח עכבר הנשי וגברי השונים.

תמציות חלבון תא כל הוכנו מהאונה הקדמית (FL), גזע המוח (BS) ומוח קטן (CR), הנגזרים מ3 CD-1 עכברי זכרי CD-1 נשים ו -3 בגילים ישנים 1 ו -3 חודשים ל assay הותאם TRAP ו3 עכברי זכרים CD-1 בגיל 2 חודשים ישנים עבור assay TRAP רדיואקטיבי. פעילות telomerase זוהתה ב1 מיקרוגרם חלבונים לחלץ באמצעות assay TRAP שונה ו2 מיקרוגרם חלבונים לחלץ עבור assay TRAP רדיואקטיבי. איתור של פעילות הטלומרז ידי assay TRAP רדיואקטיביים ועל ידי assay TRAP שונה מראה כי להדמיה טובה יותר ורזולוציה של מוצרי DNA telomerase הוא ציין עם assay שונה כפי שניתן לראות לפי האורך והאינטנסיביות של סולם DNA (איור 1 א נ 1 ג ו1D). הפחתה הדרגתית של מוצרי DNA telomerase הוא ציין כאשר יורד ריכוז של תמציות חלבון, הנגזרות משורת תאי גליובלסטומה U-251, שימשה Suggeעוקץ את הרגישות של שיטת assay TRAP הותאם לצורך זיהוי של פעילות telomerase בריכוזים נמוכים יותר של חלבונים לחלץ (איור 1). פעילות telomerase גבוהה באופן משמעותי נראית באזורי פלורידה וBS לעומת CR בנקבות בת 3 חודשים וגברים כפי שנחשפה על ידי העצמה של להקות DNA ואורכו של סולם מוצרי DNA. בנוסף, הוא הראה כי במהלך מעבר העכבר לעליית פעילות telomerase הבגרות בפלורידה והירידות בBS וCR (1D איור). השוואה בין המינים מוכיחה כי בפעילות telomerase FL הוא גבוה יותר בנשים בניגוד לBS וCR מראים פעילות telomerase גבוהה יותר אצל גברים. ברקמות המבטאות רמות נמוכות של פעילות הטלומרז מצאנו כי זיהוי של סולם DNA באמצעות PCR הוא יעיל יותר מבלי להשתמש בבקרה הפנימית פריימר (IC), מאז IC מנצל TS כפריימר קדימה ובכך מפריע להגברת סולם DNA. שחזור של נתונים מושגת על ידי חזרה על כל ניסוי מספר פעמים. <img alt="איור 1" fo:content-width="5in" src="/files/ftp_upload/51865/51865fig1highres.jpg" width="500" /> פעילות איור 1 הטלומרז במוח העכבר: מסורתית לעומת assay TRAP שונה. ) פעילות הטלומרז ב3 אזורים במוח נותחה על ידי assay TRAP רדיואקטיבי (-1 CD עכברים ישנים 2 חודשי זכר, 2 מיקרוגרם חלבונים לחלץ). רגישות של assay TRAP שונה מוצגת על ידי הפחתת ריכוזים של החלבונים ב &#39;) לחלץ נגזרת מגליובלסטומה U -251 תא שורה. פעילות הטלומרז ב3 אזורים במוח של 1 (ג) ו -3 (ד) חודשים נקבה CD-1 ישנה ועכברים זכרי C, D). סולם DNA מתחיל בלהקת 50 נ&quot;ב עם 6 תוספות נ&quot;ב. (NC - ביקורת שלילית, IC- שליטה, BS הפנימי - גזע המוח, CR - המוח הקטן, FL - אונה קדמית).

Watch this Scientific Journal Video about Telomerase Activity in the Various Regions of Mouse Brain: Non-Radioactive Telomerase Repeat Amplification Protocol TRAP Assay at JoVE.com

Telomerase Activity in the Various Regions of Mouse Brain: Non-Radioactive Telomerase Repeat Amplification Protocol TRAP Assay

Telomerase is expressed in the neonatal brain and also in distinct regions of the adult brain. We present a non-toxic time saving TRAP assay for the analysis of telomerase activity in various regions of the mouse brain and detection of differences in telomerase activity between male and female mouse brains.

פעילות telomerase באזורים שונים של מוח עכבר: הטלומרז לא רדיואקטיבי חזור הגברה פרוטוקול Assay (TRAP)

Telomerase, a ribonucleoprotein, is responsible for maintaining the telomere length and therefore promoting genomic integrity, proliferation, and ...

telomerase-activity-various-regions-mouse-brain-non-radioactive

Nanyang Technological University

Research

JoVE Journal

Neuroscience

Telomerase Activity in the Various Regions of Mouse Brain: Non-Radioactive Telomerase Repeat Amplification Protocol (TRAP) Assay

14.6K Views.  Ben-Gurion University of the Negev. Telomerase is expressed in the neonatal brain and also in distinct regions of the adult brain. We present a non-toxic time saving TRAP assay for the analysis of telomerase activity in various regions of the mouse brain and detection of differences in telomerase activity between male and female mouse brains.

Video: Telomerase Activity in the Various Regions of Mouse Brain: Non-Radioactive Telomerase Repeat Amplification Protocol TRAP Assay

The NeuroStar TMS Device: Conducting the FDA Approved Protocol for Treatment of Depression

The Neuronetics NeuroStar Transcranial Magnetic Stimulation (TMS) System is a class II medical device that produces brief duration, pulsed magnetic fields. These rapidly alternating fields induce electrical currents within localized, targeted regions of the cortex which are associated with various physiological and functional brain changes.1,2,3
In 2007, O'Reardon et al., utilizing the NeuroStar device, published the results of an industry-sponsored, multisite, randomized, sham-stimulation controlled clinical trial in which 301 patients with major depression, who had previously failed to respond to at least one adequate antidepressant treatment trial, underwent either active or sham TMS over the left dorsolateral prefrontal cortex (DLPFC). The patients, who were medication-free at the time of the study, received TMS five times per week over 4-6 weeks.4
The results demonstrated that a sub-population of patients (those who were relatively less resistant to medication, having failed not more than two good pharmacologic trials) showed a statistically significant improvement on the Montgomery-Asberg Depression Scale (MADRS), the Hamilton Depression Rating Scale (HAMD), and various other outcome measures. In October 2008, supported by these and other similar results5,6,7, Neuronetics obtained the first and only Food and Drug Administration (FDA) approval for the clinical treatment of a specific form of medication-refractory depression using a TMS Therapy device (FDA approval K061053).
In this paper, we will explore the specified FDA approved NeuroStar depression treatment protocol (to be administered only under prescription and by a licensed medical profession in either an in- or outpatient setting).

In this article, we examine the methodology and considerations relevant to the FDA approved depression treatment protocol using the Neuronetics NeuroStar TMS device.

התקן TMS NeuroStar: ניהול ה-FDA פרוטוקול מאושר לטיפול דיכאון

The Neuronetics NeuroStar Transcranial Magnetic Stimulation (TMS) System is a class II medical device that produces brief duration, pulsed magnetic ...

Purification of Mouse Brain Vessels

In the brain, most of the vascular system consists of a selective barrier, the blood-brain barrier (BBB) that regulates the exchange of molecules and immune cells between the brain and the blood. Moreover, the huge neuronal metabolic demand requires a moment-to-moment regulation of blood flow. Notably, abnormalities of these regulations are etiological hallmarks of most brain pathologies; including glioblastoma, stroke, edema, epilepsy, degenerative diseases (ex: Parkinson&#8217;s disease, Alzheimer&#8217;s disease), brain tumors, as well as inflammatory conditions such as multiple sclerosis, meningitis and sepsis-induced brain dysfunctions. Thus, understanding the signaling events modulating the cerebrovascular physiology is a major challenge. Much insight into the cellular and molecular properties of the various cell types that compose the cerebrovascular system can be gained from primary culture or cell sorting from freshly dissociated brain tissue. However, properties such as cell polarity, morphology and intercellular relationships are not maintained in such preparations. The protocol that we describe here is designed to purify brain vessel fragments, whilst maintaining structural integrity. We show that isolated vessels consist of endothelial cells sealed by tight junctions that are surrounded by a continuous basal lamina. Pericytes, smooth muscle cells as well as the perivascular astrocyte endfeet membranes remain attached to the endothelial layer. Finally, we describe how to perform immunostaining experiments on purified brain vessels.

We describe a protocol allowing the purification of the mouse brain's vascular compartment. Isolated brain vessels include endothelial cells linked by tight junctions and surrounded by a continuous basal lamina, pericytes, vascular smooth muscle cells, as well as perivascular astroglial membranes.

טיהור של כלי מוח עכבר

In the brain, most of the vascular system consists of a selective barrier, the blood-brain barrier (BBB) that regulates the exchange of molecules and ...

High Resolution Quantitative Synaptic Proteome Profiling of Mouse Brain Regions After Auditory Discrimination Learning

The molecular synaptic mechanisms underlying auditory learning and memory remain largely unknown. Here, the workflow of a proteomic study on auditory discrimination learning in mice is described. In this learning paradigm, mice are trained in a shuttle box Go/NoGo-task to discriminate between rising and falling frequency-modulated tones in order to avoid a mild electric foot-shock. The protocol involves the enrichment of synaptosomes from four brain areas, namely the auditory cortex, frontal cortex, hippocampus, and striatum, at different stages of training. Synaptic protein expression patterns obtained from trained mice are compared to na&#239;ve controls using a proteomic approach. To achieve sufficient analytical depth, samples are fractionated in three different ways prior to mass spectrometry, namely 1D SDS-PAGE/in-gel digestion, in-solution digestion and phospho-peptide enrichment. 
High-resolution proteomic analysis on a mass spectrometer and label-free quantification are used to examine synaptic protein profiles in phospho-peptide-depleted and phospho-peptide-enriched fractions of synaptosomal protein samples. A commercial software package is utilized to reveal proteins and phospho-peptides with significantly regulated relative synaptic abundance levels (trained/na&#239;ve controls). Common and differential regulation modes for the synaptic proteome in the investigated brain regions of mice after training were observed. Subsequently, meta-analyses utilizing several databases are employed to identify underlying cellular functions and biological pathways.

The identification of molecules and pathways controlling synaptic plasticity and memory is still a major challenge in neuroscience. Here, a workflow is described addressing the relative quantification of synaptic proteins supposedly involved in the molecular reorganization of synapses during learning and memory consolidation in an auditory learning paradigm.

גבוהה פרופיל Proteome Synaptic החלטה כמותי של אזורים במוח העכבר לאחר למידה אפליה שמיעתית

The molecular synaptic mechanisms underlying auditory learning and memory remain largely unknown. Here, the workflow of a proteomic study on auditory ...

High-throughput Analysis of Locomotor Behavior in the Drosophila Island Assay

Advances in next-generation sequencing technologies contribute to the identification of (candidate) disease genes for movement disorders and other neurological diseases at an increasing speed. However, little is known about the molecular mechanisms that underlie these disorders. The genetic, molecular, and behavioral toolbox of Drosophila melanogaster makes this model organism particularly useful to characterize new disease genes and mechanisms in a high-throughput manner. Nevertheless, high-throughput screens require efficient and reliable assays that, ideally, are cost-effective and allow for the automatized quantification of traits relevant to these disorders. The island assay is a cost-effective and easily set-up method to evaluate Drosophila locomotor behavior. In this assay, flies are thrown onto a platform from a fixed height. This induces an innate motor response that enables the flies to escape from the platform within seconds. At present, quantitative analyses of filmed island assays are done manually, which is a laborious undertaking, particularly when performing large screens.
This manuscript describes the &#34;Drosophila Island Assay&#34; and &#34;Island Assay Analysis&#34; algorithms for&#160;high-throughput, automated data processing and quantification of island assay data. In the setup, a simple webcam connected to a laptop collects an image series of the platform while the assay is performed. The &#34;Drosophila Island Assay&#34; algorithm developed for the open-source software Fiji processes these image series and quantifies, for each experimental condition, the number of flies on the platform over time. The &#34;Island Assay Analysis&#34; script, compatible with the free software R, was developed to automatically process the obtained data and to calculate whether treatments/genotypes are statistically different. This greatly improves the efficiency of the island assay and makes it a powerful readout for basic locomotion and flight behavior. It can thus be applied to large screens investigating fly locomotor ability, Drosophila models of movement disorders, and drug efficacy.

High-throughput Analysis of Locomotor Behavior in the Drosophila Island Assay

The island assay is a relatively new, cost-effective assay that can be used to evaluate the basic locomotor behavior of Drosophila melanogaster. This manuscript describes algorithms for automatic data processing and objective quantification of island assay data, making this assay a sensitive, high-throughput readout for large genetic or pharmacological screens.

ניתוח תפוקה גבוהה של התנהגות גינקולוגיות וזמינותו האי דרוזופילה

Advances in next-generation sequencing technologies contribute to the identification of (candidate) disease genes for movement disorders and other ...

Use of Synaptic Zinc Histochemistry to Reveal Different Regions and Laminae in the Developing and Adult Brain

Characterization of anatomical and functional brain organization and development requires accurate identification of distinct neural circuits and regions in the immature and adult brain. Here we describe a zinc histochemical staining procedure that reveals differences in staining patterns among different layers and brain regions. Others have utilized this procedure not only to reveal the distribution of zinc-containing neurons and circuits in the brain, but also to successfully delineate areal and laminar boundaries in the developing and adult brain in several species. Here we illustrate this staining procedure with images from developing and adult ferret brains. We reveal a zinc-staining pattern that serves as an anatomical marker of areas and layers, and can be reliably used to distinguish visual cortical areas in the developing and adult visual cortex. The main goal of this protocol is to present a histochemical method that allows the accurate identification of layers and regions in the developing and adult brain where other methods fail to do so. Secondarily, in conjunction with densitometric image analysis, this method allows one to assess the distribution of synaptic zinc to reveal potential changes throughout development. This protocol describes in detail the reagents, tools, and steps necessary to successively stain frozen brain sections. Although this protocol is described using ferret brain tissue, it can easily be adapted for use in rodents, cats, or monkeys as well as in other brain regions.

We describe a histochemical procedure that reveals characteristic laminar and areal zinc staining patterns in different brain regions. The zinc-staining pattern may be used in conjunction with other anatomical markers to reliably distinguish layers and regions in the developing and adult brain.

השימוש להסטולוגיה אבץ סינפטית כדי לחשוף אזורים שונים שנבזזו במוח המתפתח, למבוגרים

Characterization of anatomical and functional brain organization and development requires accurate identification of distinct neural circuits and regions ...

Large-scale Three-dimensional Imaging of Cellular Organization in the Mouse Neocortex

The mammalian neocortex is composed of many types of excitatory and inhibitory neurons, each with specific electrophysiological and biochemical properties, synaptic connections, and in vivo functions, but their basic functional and anatomical organization from cellular to network scale is poorly understood. Here we describe a method for the three-dimensional imaging of fluorescently-labeled neurons across large areas of the brain for the investigation of the cortical cellular organization. Specific types of neurons are labeled by the injection of fluorescent retrograde neuronal tracers or expression of fluorescent proteins in transgenic mice. Block brain samples, e.g., a hemisphere, are prepared after fixation, made transparent with tissue clearing methods, and subjected to fluorescent immunolabeling of the specific cell types. Large areas are scanned using confocal or two-photon microscopes equipped with large working distance objectives and motorized stages. This method can resolve the periodic organization of the cell type-specific microcolumn functional modules in the mouse neocortex. The procedure can be useful for the study of three-dimensional cellular architecture in the diverse brain areas and other complex tissues.

Here we describe a procedure for tissue clearing, fluorescent labeling, and large-scale imaging of mouse brain tissue which, thereby, enables visualization of the three-dimensional organization of cell types in the neocortex.

הדמיה תלת מימדי בקנה מידה גדול של ארגון הסלולר קליפת העכבר

The mammalian neocortex is composed of many types of excitatory and inhibitory neurons, each with specific electrophysiological and biochemical ...

Localization of the Locus Coeruleus in the Mouse Brain

The locus coeruleus (LC) is a major hub of norepinephrine producing neurons that modulate a number of physiological functions. Structural or functional abnormalities of LC impact several brain regions including cortex, hippocampus, and cerebellum and may contribute to depression, bipolar disorder, anxiety, as well as Parkinson disease and Alzheimer disease. These disorders are often associated with metal misbalance, but the role of metals in LC is only partially understood. Morphologic and functional studies of LC are needed to better understand the human pathologies and contribution of metals. Mice are a widely used experimental model, but the mouse LC is small (~0.3 mm diameter) and hard to identify for a non-expert. Here, we describe a step-by-step immunohistochemistry-based protocol to localize the LC in the mouse brain. Dopamine-&#946;-hydroxylase (DBH), and alternatively, tyrosine hydroxylase (TH), both enzymes highly expressed in the LC, are used as immunohistochemical markers in brain slices. Sections adjacent to LC-containing sections can be used for further analysis, including histology for morphological studies, metabolic testing, as well as metal imaging by X-ray fluorescence microscopy (XFM).

The locus coeruleus is a small cluster of neurons involved in a variety of physiological processes. Here, we describe a protocol to prepare mouse brain sections for studies of proteins and metals in this nucleus.

לוקליזציה של Coeruleus לוקוס במוח העכבר

The locus coeruleus (LC) is a major hub of norepinephrine producing neurons that modulate a number of physiological functions. Structural or functional ...

Quantifying Subcellular Ubiquitin-proteasome Activity in the Rodent Brain

The ubiquitin-proteasome system is a key regulator of protein degradation and a variety of other cellular processes in eukaryotes. In the brain, increases in ubiquitin-proteasome activity are critical for synaptic plasticity and memory formation and aberrant changes in this system are associated with a variety of neurological, neurodegenerative and psychiatric disorders. One of the issues in studying ubiquitin-proteasome functioning in the brain is that it is present in all cellular compartments, in which the protein targets, functional role and mechanisms of regulation can vary widely. As a result, the ability to directly compare brain ubiquitin protein targeting and proteasome catalytic activity in different subcellular compartments within the same animal is critical for fully understanding how the UPS contributes to synaptic plasticity, memory and disease. The method described here allows collection of nuclear, cytoplasmic and crude synaptic fractions from the same rodent (rat) brain, followed by simultaneous quantification of proteasome catalytic activity (indirectly, providing activity of the proteasome core only) and linkage-specific ubiquitin protein tagging. Thus, the method can be used to directly compare subcellular changes in ubiquitin-proteasome activity in different brain regions in the same animal during synaptic plasticity, memory formation and different disease states. This method can also be used to assess the subcellular distribution and function of other proteins within the same animal.

This protocol is designed to efficiently quantify ubiquitin-proteasome system (UPS) activity in different cellular compartments of the rodent brain. Users are able to examine UPS functioning in nuclear, cytoplasmic and synaptic fractions in the same animal, reducing the amount of time and number of animals needed to perform these complex analyses.

בדיקת כימות משנית אוביקוויאין-פעילות פרוטאסדום במוח מכרסם

The ubiquitin-proteasome system is a key regulator of protein degradation and a variety of other cellular processes in eukaryotes. In the brain, increases ...

Collection of Frozen Rodent Brain Regions for Downstream Analyses

As our understanding of neurobiology has progressed, molecular analyses are often performed on small brain areas such as the medial prefrontal cortex (mPFC) or nucleus accumbens. The challenge in this work is to dissect the correct area while preserving the microenvironment to be examined. In this paper, we describe a simple, low-cost method using resources readily available in most labs. This method preserves nucleic acid and proteins by keeping the tissue frozen throughout the process. Brains are cut into 0.5&#8211;1.0 mm sections using a brain matrix and arranged on a frozen glass plate. Landmarks within each section are compared to a reference, such as the Allen Mouse Brain Atlas, and regions are dissected using a cold scalpel or biopsy punch. Tissue is then stored at -80 &#176;C until use. Through this process rat and mouse mPFC, nucleus accumbens, dorsal and ventral hippocampus and other regions have been successfully analyzed using qRT-PCR and Western assays. This method is limited to brain regions that can be identified by clear landmarks.

This procedure describes the collection of discrete frozen brain regions to obtain high-quality protein and RNA using inexpensive and commonly available tools.

אוסף של אזורים קפואים המוח מכרסם עבור ניתוח במורד הזרם

As our understanding of neurobiology has progressed, molecular analyses are often performed on small brain areas such as the medial prefrontal cortex ...

Dissection and Isolation of Murine Glia from Multiple Central Nervous System Regions

The methods presented here demonstrate laboratory procedures for the dissection of four different regions of the central nervous system (CNS) from murine neonates for the isolation of glial subpopulations. The purpose of the procedure is to dissociate microglia, oligodendrocyte progenitor cells (OPCs), and astrocytes from cortical, cerebellar, brainstem, and spinal cord tissue to facilitate further in vitro analysis. The CNS region isolation procedures allow for the determination of regional heterogeneity among glia in multiple cell culture systems. Rapid CNS region isolation is performed, followed by the mechanical removal of meninges to prevent meningeal cell contamination of glia. This protocol combines gentle tissue dissociation and plating on a specified matrix designed to preserve cell integrity and adherence. Isolating mixed glia from multiple CNS regions provides a comprehensive analysis of potentially heterogenous glia while maximizing the use of individual experimental animals. Additionally, following dissociation of regional tissue, mixed glia are further divided into multiple cell types including microglia, OPCs, and astrocytes for use in either single cell type, cell culture plate inserts, or co-culture systems. Overall, the demonstrated techniques provide a comprehensive protocol of broad applicability for careful dissection of four individual CNS regions from murine neonates and includes methods for the isolation of three individual glia cell types to examine regional heterogeneity in any number of in vitro cell culture systems or assays.

Here we present a protocol for in vitro isolation of multiple glial cell populations from a mouse CNS. This method allows for the segregation of regional microglia, oligodendrocyte precursor cells, and astrocytes to study the phenotypes of each in a variety of culture systems.

דיסקציה ובידוד של מורין גליה ממספר אזורים במערכת העצבים המרכזית

The methods presented here demonstrate laboratory procedures for the dissection of four different regions of the central nervous system (CNS) from murine ...