Method Article
* Diese Autoren haben gleichermaßen beigetragen
Hier beschreiben wir ein Protokoll zur Verwendung von vierdimensionaler In-vivo-Ultraschallbildgebung und ex vivo-Massenspektrometrie-Bildgebung zur Beurteilung biomechanischer und biomolekularer Veränderungen im kardiovaskulären System der Maus. Diese Technik wird zur Analyse des kardialen Umbaus bei chirurgisch induziertem Myokardinfarkt und vaskulären Veränderungen bei alternden Tieren eingesetzt.
Herz-Kreislauf-Erkrankungen (CVD) sind die häufigste Todesursache in den Vereinigten Staaten. Schäden im Herz-Kreislauf-System können auf Umwelteinflüsse, Traumata, Arzneimitteltoxizität oder zahlreiche andere Faktoren zurückzuführen sein. In der Folge verändern sich das Herzgewebe und die Gefäße strukturell und weisen eine verminderte Funktion auf. Die Schädigung und der daraus resultierende Umbau können mit Ultraschall (US) auf Organebene und Massenspektrometrie (MSI) auf molekularer Ebene nachgewiesen und quantifiziert werden. Dieses Manuskript beschreibt eine innovative Methodik zur Untersuchung der kardialen Pathophysiologie von Mäusen, die in vivo vierdimensionale (4D) Ultraschallbildgebung und -analyse mit ex vivo matrixgestützter Laserdesorption/Ionisation (MADLI) MSI des Herzens koppelt. 4D-Ultraschall kann dynamische volumetrische Messungen liefern, einschließlich radialer Verschiebung, Oberflächendehnung und Längsdehnung während eines gesamten Herzzyklus. Im Gefäßsystem werden MSI und Ultraschall verwendet, um die Zusammensetzung der Gefäßwand, die Hämodynamik und die Dynamik der Gefäßwand zu beurteilen. Die Methodik kann auf die Untersuchung einer Vielzahl von Herz-Kreislauf-Erkrankungen zugeschnitten werden, indem funktionelle Metriken von Interesse und/oder das MALDI-MSI-Protokoll angepasst werden, um auf bestimmte Moleküle abzuzielen. MALDI MSI kann zur Untersuchung von Lipiden, kleinen Metaboliten, Peptiden und Glykanen verwendet werden. Dieses Protokoll beschreibt die Verwendung von MALDI MSI für die ungezielte lipidomische Analyse und die Verwendung von Ultraschallbildgebung für die kardiovaskuläre Hämodynamik und Biomechanik.
Herz-Kreislauf-Erkrankungen (CVD) sind weltweit eine der häufigsten Todesursachen1. Die Prävention und Behandlung von Herz-Kreislauf-Erkrankungen erfordert ein tiefgreifendes Verständnis der molekularen Anpassungen an biomechanische Kräfte und der daraus resultierenden Veränderungen der mechanischen Eigenschaften. Im gesamten Herz-Kreislauf-System spielen biomechanische Kräfte eine wichtige Rolle für die Funktion und Struktur des Gewebes2. Die mechanischen Eigenschaften des Herz-Kreislauf-Gewebes (CV) werden von diesen Kräften beeinflusst, was sie zu Indikatoren für Gesundheit und Krankheitmacht 3,4,5,6. Um Herz-Kreislauf-Erkrankungen zu verhindern, zu diagnostizieren und zu behandeln, ist es von entscheidender Bedeutung, Methoden zum Verständnis und zur Beobachtung der Prozesse der Krankheitsentstehung und -progression zu entwickeln. Die biomedizinische Bildgebung war der Schlüssel zur Generierung physiologischer und mechanistischer Erkenntnisse, und neue Bildgebungstechnologien und Analysetechniken werden ständig entwickelt. Dieses Protokoll demonstriert eine Methodik zur Kombination von zwei kardiovaskulären Bildgebungs- und Analysetechniken, um das Potenzial dieser Bildgebungsmodalitäten bei ischämischen Herzerkrankungen und vaskulärer Alterung zu validieren.
Forscher auf dem Gebiet der Biomechanik nähern sich der Erforschung der Biomechanik häufig über eine Kombination aus in vivo-, ex vivo- und in silico-Methoden . Frühere Forschungen zur molekularen Biomechanik konzentrierten sich hauptsächlich auf die Proteine7 (insbesondere die extrazellulären Matrixproteine Kollagen und Elastin aufgrund ihres Einflusses auf die biomechanischen Eigenschaften), und die Arbeit zur Kombination der In-vivo-Bildgebungsbiomechanik mit molekularen Studien beschränkte sich auf Histologie und Immunhistochemie. Obwohl diese Ansätze viele molekulare Indikatoren liefern können und vorgeschlagene Mechanismen des Umbaus von EZM und Zellen hervorgebracht haben, sind sie in der Regel auf die derzeit verfügbaren Färbungen bzw. Antikörper beschränkt. In diesem Forschungsgebiet fehlen große Klassen von Molekülen, z.B. Lipide. Obwohl diese molekularen Klassen mechanistisch beteiligt sein können oder auch nicht, sind die daraus resultierenden molekularen Anpassungen wichtig zu verstehen, da diese Moleküle potenzielle Ziele sowohl für diagnostische Marker als auch für Therapeutika sein könnten. Analytische chemische Techniken, wie z. B. die Flüssigkeitschromatographie-Massenspektrometrie (LC-MS), können angewendet werden; Allerdings geht bei diesen Techniken die räumliche Orientierung der Moleküle verloren. Mit der massenspektrometrischen Bildgebung (MSI) bleibt die räumliche Verteilung der Moleküle intakt, und mehrere Analyttypen (Klassen von Molekülen) können mit seriellen Schnitten abgebildet werden. MSI ist ein leistungsstarkes Analysewerkzeug zur Untersuchung der räumlichen Verteilung nahezu aller Arten von Molekülen in biologischem Gewebe, einschließlich Metaboliten, Lipiden, Glykanen, Peptiden und niedermolekularen Arzneimitteln8. Matrixgestützte Laserdesorption/Ionisation (MALDI) MSI ist eine Art von MSI, die sich gut für die forschungsbasierte Analyse von Molekulargewichten im Bereich von 50-8000 Da eignet. MALDI-MSI ist eine Ionisationstechnik, bei der eine laserenergieabsorbierende Matrix auf die Probe aufgebracht wird, um die Ionisation der interessierenden Analyten zu unterstützen. Dieser Ansatz verhindert, dass man sich auf ein molekulares Ziel beschränkt, und kann mit Hilfe von Bioinformatik-Werkzeugen bestimmen, welche Moleküle einen Einfluss auf die biomechanischen Eigenschaften und den Umbau haben.
Der vierdimensionale Ultraschall (4DUS) ist eine nicht-invasive in vivo-Methode, die sowohl für die zeitliche als auch für die räumliche Charakterisierung des Herzens nützlich ist. 4DUS verwendet eine Reihe von Cine-Loops mit hoher Bildrate aus verschiedenen Ebenen und kompiliert sie zu einem 3D-Datensatz, der zeitliche Informationen enthält. Dies ermöglicht die direkte Visualisierung und Quantifizierung der komplexen 3D-Formänderungen der Herzkammern im Laufe des Herzzyklus, ohne sich auf geometrische Annahmen verlassen zu müssen, wie es für die traditionelle 2D-Echokardiographie erforderlich ist. 4DUS ermöglicht die Berechnung von in vivo funktionellen Metriken aus der komplexen Form und Bewegung des Herzens 9,10, und MALDI MSI ermöglicht die räumliche Untersuchung biologischer Moleküle innerhalb des Herzgewebes ex vivo11. Um Veränderungen im Herzen mit Herz-Kreislauf-Erkrankungen vollständig zu verstehen, müssen sowohl mechanische als auch molekulare Mechanismen untersucht werden. Daher wird eine kombinierte Methodik zur Untersuchung der Pathophysiologie des Mausherzens vorgeschlagen, die die 4DUS-Bildgebung und -Analyse mit MALDI MSI von Lipiden im Herzen koppelt. Diese Methodik wird in einem murinen Modell des Myokardinfarkts demonstriert.
Die vaskuläre Biomechanik spielt auch eine entscheidende Rolle bei der Regulierung der kardiovaskulären Funktion2. Eine Gefäßversteifung, die mit dem Altern einhergeht, ist ein Risikofaktor für CVD12. Die biomechanischen und hämodynamischen Veränderungen der Gefäße können mit Ultraschall dargestellt werden. Die molekulare Zusammensetzung der Gefäßwände ist ein wichtiger Bestandteil der Biomechanik und auch äußerst empfindlich gegenüber hämodynamischen Kräften. Zum Beispiel wurde die oszillatorische Wandscherspannung mit der Entwicklung von atherosklerotischen Plaques in Verbindung gebracht3. Im Folgenden werden die vorläufigen Daten zur Gefäßmechanik und Hämodynamik bei gealterten Tieren vorgestellt.
Das Team interessiert sich für den Zusammenhang zwischen Biomechanik und molekularer Zusammensetzung in verschiedenen Krankheitszuständen. Die präklinische Ultraschallbildgebung und MSI werden eingesetzt, um die räumliche Verteilung von molekularen Veränderungen in einem Gewebe und die damit verbundenen biomechanischen Veränderungen, die während des Krankheitsverlaufs auftreten, zu bestimmen. In diesem Bericht werden diese Methoden ausführlich beschrieben und vorläufige Daten zum Herzen und zum Gefäßsystem des Kopfes/Halses vorgestellt.
Die beschriebenen Tierversuche werden mit Genehmigung des University of Tennessee, Knoxville Institutional Animal Care and Use Committee, durchgeführt.
1. Ultraschall13
2. Euthanasie und Gewebeentnahme
3. Massenspektrometrische Bildgebung
Die oben beschriebenen bildgebenden Verfahren wurden für zwei Vorstudien verwendet: Myokardinfarkt-Umbau (MI) und Gefäßalterung. Für die kardialen Experimente wurde eine permanente Koronararterien-Ligatur-Operation durchgeführt, um einen akuten Myokardinfarkt zu induzieren18,19. 4D-Ultraschall und MALDI MSI wurden schrittweise am selben Gewebe durchgeführt, wodurch physiologische und molekulare Veränderungen sichtbar wurden. Repräsentative Bilder von Molekülionen in einem infarktierten Herzen sind in Abbildung 5 dargestellt. Das m/z 577.52 wurde mutmaßlich als Cohibin C oder D zugeordnet. Obwohl für die Identifizierung von Analyten (LC-MS oder Tandem-MS) weitere Analysen erforderlich sind, wurde Cohibin in Rinderherzen gefunden20 und könnte auch auf einen Umbau hinweisen21,22. Veränderungen der ventrikulären Struktur und Funktion können auch mit einer Hoch- und Herunterregulierung der Ziellipide in der jeweiligen Region in Verbindung gebracht werden (Abbildung 6). In der 4DUS-Abbildung stellt das grün-gelbe Ende des Farbspektrums Gewebe mit einer Oberflächendehnungsgröße von weniger als 20 % dar, was dem infarktierten Gewebe23 entspricht. Das gelbe Ende des Spektrums repräsentiert auch im MS-Bild infarzierte Regionen, was mit Lipiden korrespondiert, von denen bekannt ist, dass sie im infarzierten Gewebe hochreguliert sind24. Die genaue Lokalisation wurde jedoch nicht zwischen dem US-Bild des Herzens und dem geschnittenen Gewebe registriert. Um In-vivo- und Ex-vivo-Daten zu vergleichen, muss der Benutzer die Anzahl der Kryosektionsumdrehungen zählen, um auf eine bestimmte Tiefe vom Scheitelpunkt aus zu schneiden, wie oben beschrieben. Um die biomechanischen Messungen von US an MSI zu koppeln, ist es entscheidend, dass die Delokalisation der Analyten im MSI25 minimiert wird. Ein Beispiel für die Delokalisierung von Lipiden in einer Längsachsenansicht des Herzens ist in Abbildung 7 dargestellt.
Für die vaskuläre Alterung wurden zwei Altersgruppen von C57BL/6-Mäusen untersucht: jung (10-12 Wochen) und alt (12 Monate) bei Männchen und Weibchen. Zum Vergleich von Geschlecht und Alter wurde ein One-Way-ANOVA und ein Post-hoc-Test (Honest Importance Difference, HSD) von Tukey durchgeführt. Alle Daten werden als Mittelwert ± Standardabweichung angegeben. Die Geschwindigkeit und der Gefäßdurchmesser wurden in der Halsschlagader und in der Halsvene gemessen. Die Umfangsdehnungswerte wurden mit Hilfe von Gleichung 1 berechnet. Repräsentative Ergebnisse sind in Abbildung 8 dargestellt. Die Stammwerte zwischen jungen Männern (n = 5) und älteren Männern (n = 5) waren statistisch nicht signifikant und wurden daher als eine (n = 10) Gruppe kombiniert, um sie mit jungen (n = 10) und gealterten (n = 10) Frauen zu vergleichen (Abbildung 8A). Es gab keinen statistischen Unterschied zwischen den Gruppen für die zirkumferentielle zyklische Dehnung (CCS). Für die systolische Geschwindigkeit der Halsschlagader hatten junge Weibchen höhere Geschwindigkeiten im Vergleich zu älteren Weibchen (p = 0,02) und Männchen (p = 0,01, Abbildung 8B). Abbildung 8C zeigt eine räumliche Darstellung von drei verschiedenen Molekülen, die in der jungen weiblichen C57BL/6 NHsd (Envigo) Maus-Halsschlagader vorhanden sind. Mögliche Zuordnungen für diese Moleküle sind Häm mit m/z 616.18, PC(36:2) mit m/z 808.58 und Lyso PC(18:0) mit m/z 546.35. Diese Lipide sind wichtige Indikatoren für die Gesundheit von Herz-Kreislauf-Erkrankungen, insbesondere bei Atherosklerose: PC(36:2) ist bei atherosklerotischen Mäusen erhöht26und Lysophosphatidylcholine sind eine Phospholipidkomponente von atherogenen Lipoproteinen27.
Abbildung 1: Versuchsaufbau. (A) Ultraschallaufbau mit den notwendigen Verbrauchsmaterialien vor Beginn der Experimente. (B) Tier und Elektroden/Rektumsonde mit Klebeband gesichert. (C) Wärmelampe zur Aufrechterhaltung der Körperkerntemperatur. Bitte klicken Sie hier, um eine größere Version dieser Abbildung anzuzeigen.
Abbildung 2: Repräsentative Tieraufstellung. (A,B) PSLAX-Setup und das entsprechende PSLAX-US-Image sowie (C,D) US-Setup und US-Image für die kurze Achse. Die Lage und Ausrichtung des Herzens kann von Tier zu Tier variieren, so dass möglicherweise Anpassungen vorgenommen werden müssen. Bitte klicken Sie hier, um eine größere Version dieser Abbildung anzuzeigen.
Abbildung 3: Gratbefreien mit Aluminiumfolienbooten. (A) Folienboote aus Aluminium (Al). (B) Alle Boote mit einem Herz, das sich im Boot befindet. (C) Al-Boote, die auf flüssigem Stickstoff treiben. Bitte klicken Sie hier, um eine größere Version dieser Abbildung anzuzeigen.
Abbildung 4: Kryosektion und Gewebevorbereitung für MALDI. (A) Mausherz auf Kryostat-Chuck mit OCT. Apex ist in OCT eingebettet, aber anderes Gewebe bleibt frei von OCT-Kontaminationen. (B) Skaliertes digitales 3D-Rendering des linken Ventrikels, das mit der 4D US MATLAB-GUI erstellt wurde, wird verwendet, um die Schnitterstellung zu leiten. Die Skala ist in mm angegeben. (C) Objektträger aus Glas mit aufgetautem Herzgewebe, mit Matrize besprüht und in den MALDI-Objektträgerhalter gelegt. Bitte klicken Sie hier, um eine größere Version dieser Abbildung anzuzeigen.
Abbildung 5: Molekül-Ionen-Bild (m/z 577.52) für drei Kurzachsenschnitte eines MI-Herzens im positiven Ionenmodus mit DHB-Matrix. Die Heatmap zeigt die relative Intensität (d. h. die Abundanz) in der Gewebeprobe. Für diese mutmaßliche Zuordnung (Cohibin C oder D) weist der Analyt im Vergleich zu anderen Regionen des Herzens eine höhere Häufigkeit in der linken Ventrikelwand (gelbe und rote Pixel) auf. Bitte klicken Sie hier, um eine größere Version dieser Abbildung anzuzeigen.
Abbildung 6: Das Ventrikelbild links stammt aus demselben Herzen, das auf dem rechts gezeigten Molekülionenbild von MSI zu sehen ist. Beachten Sie, dass das 4D-US-Bild nur das LV darstellt und MS-Bilder einen Querschnitt des gesamten Herzens zeigen. Regionen, die mit MALDI MSI abgebildet wurden, sind mit A-F gekennzeichnet. Hier waren die Regionen B, C und D vertreten. Überlagerte Heatmaps zeigen hoch- und herunterregulierte Lipide. Bitte klicken Sie hier, um eine größere Version dieser Abbildung anzuzeigen.
Abbildung 7: Überlagerung von vier m/z-Bildern eines Mausherzens (Matrix, Häm, PC(38:6) und PC(40:6)). Die rosa Pfeile zeigen die Delokalisation von Häm und PC(38:6), da sich diese Analyten mit dem Matrixpeak außerhalb der Herzregion überlappen. Bitte klicken Sie hier, um eine größere Version dieser Abbildung anzuzeigen.
Abbildung 8: Repräsentative Ergebnisse. (A) Umfangsdehnung der Halsschlagader zwischen drei Gruppen ohne statistischen Unterschied zwischen den Mittelwerten. (B) Die systolische Geschwindigkeit der Halsschlagader war bei jungen Frauen höher als bei älteren Frauen (p = 0,02) und Männern (p = 0,01). (C) Molekulare Überlagerung von drei verschiedenen Molekülen in der Halsschlagader. Rot steht für Häm mit m/z 616.18, Weiß für das Molekül mit m/z 808.58 und Lila für ein Molekül mit m/z 546.35. Dieses Bild zeigt die Lokalisation von Lipiden mit hoher Signalintensität im jungen weiblichen C57BL/6-Karotisgewebe. M: Männchen (zusammen jung und alt), YF: junges Weibchen, AF: altes Weibchen. N=30 Bitte klicken Sie hier, um eine größere Version dieser Abbildung anzuzeigen.
Problem | Lösungen |
Walzen | Stabilisator nach unten/oben bewegen |
Passen Sie die Schnittgeschwindigkeit an | |
Anpassen der Schnittachse | |
Halten Sie den Stabilisator am Griff gedrückt | |
Verwenden Sie den Pinsel zum Entwirren und übertragen Sie es dann auf die Folie | |
Die Scheibe bündelt sich an der Klinge | Stabilisator nach oben in Richtung Klinge bewegen |
Die Scheibe kommt nicht auf das Metalltablett | Stabilisator vom Schild weg nach unten bewegen |
Die Scheibe klebt an der Rasierklinge/Stabilisator/Metallwanne (Kondensation) | Lassen Sie den Deckel geschlossen und lassen Sie alles abkühlen. Vermeiden Sie nach Möglichkeit das Einatmen in die Motorhaube (siehe unten) |
Unvollständiger Profilschnitt | Erhöhen Sie die Schnittdicke und schneiden Sie, bis das vollständige Profil erreicht ist, und kehren Sie dann zur ursprünglichen Dicke zurück |
Statisch | Schneide die Scheibe ab, drücke den Finger auf die Überrollstange und übertrage sie dann auf die Rutsche |
Einfrieren von Artefakten (Tearing) | Erhöhen Sie die Schnittstärke (vermerken Sie dies unbedingt im Notizbuch); Erhöhen Sie die Temperatur des Kryostaten leicht. |
Beispiel-Pausen | Bereiten Sie die Entnahme (gefaltetes Papier oder Folie) unter der Probe vor und versuchen Sie, die Probe mit dem Schnitt darauf fallen zu lassen, ziehen Sie sich NICHT aus dem Schnitt zurück, da die Probe herunterfallen kann. |
Tabelle 1: Häufige Probleme und Schritte zur Fehlerbehebung bei der Kryosektion von Proben.
Die Bildgebung in den USA kann vom Bediener abhängen, aber die Verwendung anatomischer Orientierungspunkte und eine angemessene Schulung können die Verzerrung des Benutzers begrenzen. 2D-Ultraschall ist besonders anfällig für Variabilität zwischen den Benutzern, da die Ansichten winkelabhängig sind, während 4DUS weniger anfällig ist, da die Erfassung das gesamte Volumen umfasst und winkelunabhängig ist. Es wurde auch festgestellt, dass die Bildreproduzierbarkeit aufgrund der verstellbaren Tierplattform und des Schallkopfhalters leichter zu erreichen ist. Die Datenerhebung in den USA sollte idealerweise während einer gesamten Studie von demselben Forscher durchgeführt werden, um technisch abgeleitete Datenänderungen zu vermeiden.
Die Aufrechterhaltung der Körperkerntemperatur ist wichtig, da Temperaturänderungen die kardiovaskuläre Hämodynamik und die biomechanischen Messungen verändern können 28,29,30,3 1. Zusätzlich zur Heizplatte für die Bildgebung wird empfohlen, eine externe Heizung zu verwenden, z. B. eine Wärmelampe, wie in Abbildung 1 gezeigt. Diese Wärmelampe wird vom Benutzer so eingestellt, dass sie eine rektale Temperatur von 37 °C aufrechterhält.
Für die Ultraschallbildgebung ist die Benennung von Studien-/Serien bei großen Datensätzen wichtig. Für 4D-Bilder sollte die Namenskonvention konsistent sein, und die Maus-ID sollte bei der Benennung des 4D-Bildes vor dem Speichern enthalten sein. Aufgrund der unterschiedlichen Dateitypen wird das 4D-Bild nicht automatisch mit den anderen Bildern in der Studie gespeichert. Wenn die Maus-ID nicht im Namen des 4D-Bildes enthalten ist, ist es daher schwierig zu unterscheiden, welches Bild dem zu analysierenden Tier entspricht. Für die Bildanalyse kann der Forscher zur Minimierung von Verzerrungen für Tiergruppen verblindet werden.
Weitere Ressourcen für die Ultraschallbildgebung und -analyse finden Sie im VisualSonics Learning Hub: https://www.visualsonics.com/learning-hub-online-video-training-our-users
Für die Bildgebung mit einer früheren Version des Vevo-Ultraschallsystems siehe den zuvor veröffentlichten Artikel13.
Beim Entnehmen und Einfrieren von Gewebe kann das Gewebe reißen, wenn die Alufolienschiffchen sinken. Achten Sie darauf, gefrorene Proben schonend zu behandeln, da die gefrorenen Proben sehr spröde sind. Zwingen Sie das gefrorene Gewebe nicht in kleine Röhrchen. Wir empfehlen konische 50 mL Röhrchen für Transport und Lagerung. Für die Sektion des Gewebes enthält Tabelle 1 Modifikationen, die sich als hilfreiche Ausgangspunkte für die Fehlerbehebung erwiesen haben. Achten Sie darauf, dass das OCT den Abschnitt, der aufgetaut ist, nicht kontaminiert. OCT enthält PEG, eine Verunreinigung in der Massenspektrometrie. Bei der Beobachtung des Spektrums deutet eine häufige Wiederholung von 44 Da auf eine PEG-Kontamination hin. PEG ist auch in vielen Reinigungsmitteln enthalten, daher sollten Glaswaren nicht mit Reinigungsmitteln gereinigt werden, sondern mit Ethanol, bevor sie autoklaviert werden. Die Wassermontage ist zwar mühsamer, beseitigt aber die Begrenzung der Kontamination von OCT-Proben.
Für MALDI MSI ist die Anwendung der Matrix entscheidend für eine adäquate Laserdesorption und für die Minimierung der Analytdelokalisierung25. Wenn neue Matrixprotokolle gewünscht werden, sollten diese vor der Anwendung auf das Versuchsgewebe getestet werden. Zusätzlich kann Gewebe auf den Objektträgern nach der MSI-Datenerfassung für die Histologie gefärbt werden11 oder ein Multiplexbild kann mit wiederholter Bildgebungaufgenommen werden 32.
Eine Einschränkung dieses Protokolls ist die fehlende Co-Registrierung der Datensätze, die im Mittelpunkt unserer zukünftigen Arbeit steht. Durch das Zählen der Umdrehungen beim Schneiden kann der Benutzer jedoch bestimmen, welche Schnittposition den aus dem 4DUS analysierten Funktionsbereichen entspricht, was es dem Benutzer ermöglicht, Massenspektrometrie und Ultraschallmetriken an bestimmten Stellen im Herzen zu vergleichen. Für dieses Protokoll besteht das Ziel darin, die molekulare Zusammensetzung (MSI) an Stellen des Herzens zu bestimmen, die mit den Veränderungen der funktionellen Metriken in den 3D-Stammdaten (US) korrelieren. Dieses Protokoll registriert keine Pixeldaten zwischen den ex vivo- und den in vivo-Daten, da das 4D US funktionelle biomechanische Daten liefert. Andere Forscher haben jedoch begonnen, Computertechniken für die Co-Registrierung von Ex-vivo-Bildgebung mit In-vivo-Modalitäten zu entwickeln, die mehr molekulare Informationen in Pixeln/Voxeln liefern, wie z. B. die photoakustische Bildgebung33, die Magnetresonanztomographie (MRT)34, die MRT mit Ultraschall35 oder die Positronen-Emissions-Tomographie-Computertomographie (PET-CT)36,37.
Dieses aktuelle Protokoll könnte dazu beitragen, molekulare Biomarker für Krankheiten zu identifizieren und sie mit physiologischen Phänomenen in Verbindung zu bringen, die zu funktionellen biomechanischen Veränderungen des linken Ventrikels führen. Die hier etablierte Methodik kann auf die Untersuchung einer Vielzahl physikalischer Phänomene zugeschnitten werden, indem funktionelle Metriken von Interesse und/oder das MALDI-MSI-Protokoll angepasst werden, um auf bestimmte Moleküle abzuzielen. Obwohl bei der Entwicklung dieses Protokolls Lipide untersucht wurden, könnte derselbe Rahmen für einen multiomischen Ansatz verwendet werden, bei dem Proteine, Glykane, Metaboliten usw. in Bezug auf die physiologischen und funktionellen Veränderungen untersucht werden, die mit der 4D-US-Bildgebung und -Analyse identifiziert wurden.
Zusammenfassend wurde ein multimodales Bildgebungsprotokoll entwickelt, um die kardiovaskuläre Funktion und die molekulare Struktur zu beurteilen. Diese Technik könnte es Forschern ermöglichen, nicht-invasive In-vivo-Bildgebung und molekulare Ex-vivo-Bildgebung zu verwenden, um neue bildgebende Biomarker zu identifizieren und neuartige Therapien zu bewerten.
Craig J. Goergen ist ein bezahlter Berater von FUJIFILM VisualSonics.
Allison Jones wird unterstützt durch das Graduiertenstipendium des University of Tennessee, Mechanical, Aerospace & Biomedical Engineering Department. Die in dieser Veröffentlichung (Conner Earl) berichtete Forschung wurde vom National Heart, Lung, and Blood Institute der National Institutes of Health F30HL162452 unterstützt. Der Inhalt liegt ausschließlich in der Verantwortung der Autoren und gibt nicht unbedingt die offizielle Meinung der National Institutes of Health wieder.
Name | Company | Catalog Number | Comments |
2,5-dihydroxybenzoic acid (DHB) | Supelco, >99.0% (HPLC) | 85707-10MG-F | DHB matrix substance for MALDI-MS; https://www.sigmaaldrich.com/US/en/product/sigma/85707?cm_sp=Insite-_-wimsShippingEmailRecs_wims EmailAPI_wimsGruCrossEntropy-_-wimsEmailAPI10-3 |
9-aminoacridine (9AA) | Supelco, ≥99.5% (HPLC) | 92817-1G | 9-Aminoacridine matrix substance for MALDI-MS; https://www.sigmaaldrich.com/US/en/product/sial/92817?srsltid=AfmBOooiQjQ4pWv_XxITkU 4Lkm0UnHXKekGS_ dFl7V40V9QLWoPpNLoc |
Aquasonic Ultrasound Gel | Parker Laboratories | Parker 01-02 | Ultrasound Gel; https://www.parkerlabs.com/products/aquasonic-100-ultrasound-transmission-gel/ |
Benchtop Dewar Flasks | ThermoScientific | 4150-2000 | Container for liquid nitrogen; https://www.thermofisher.com/order/catalog/product/4150-4000?gclid=Cj0KCQjwpvK4BhDUARIsA DHt9sQVc2f-NxN04Nb5Mv F6TZ7GLHWWDEeqDYmEvtKJSQ YHDeVgZ9qylvYaAs27EALw_wcB &source=google_shopping&ISO_ CODE=us&LANG_CODE=en&ef_id =Cj0KCQjwpvK4BhDUARIsADHt9 sQVc2f-NxN04Nb5MvF6TZ7GLHWWDE eqDYmEvtKJSQYHDeVgZ9qylvYa As27EALw_wcB:G:s&s_kwcid=AL!3652 !3!716188292869!!!g!2366243726129 !!21787513085!171591181194&ev_chn =shop&cid=0se_gaw_30092024_ PBYTXL&source=google_shopping &ISO_CODE=us&LANG_CODE= en&gad_source=1 |
Cryostat | Leica Biosystems | CM Series | https://www.leicabiosystems.com/us/histology-equipment/cryostats/ |
Dessicator | VWR | 89054-052 | https://us.vwr.com/store/product/9104882/desiccator-plastic-ace-glass-incorporated |
Epredia MX35 Premier Disposable Low-profile Microtome Blades | Fisher Scientific | 3052835 | Cryostat blade; https://www.fishersci.com/shop/products/mx35-premier-disposable-low-profile-microtome-blades/3052835 |
Falcon 15 mL Conical Centrifuge Tubes | Fisher Scientific | 14-959-53A | Conical Tubes; https://www.fishersci.com/shop/products/falcon-15ml-conical-centrifuge-tubes-5/1495953A?gclid=Cj0KCQjwpvK4BhDUARIsA DHt9sSBcy5n-lhShligJUOX5KKVGn0bt87 8AB2_muOD2PPTue1phpZgeqwa AqgiEALw_wcB&ef_id=Cj0KCQjw pvK4BhDUARIsADHt9sSBcy5n-lhS hligJUOX5KKVGn0bt878AB2_muO D2PPTue1phpZgeqwaAqgiEALw_ wcB:G:s&ppc_id=PLA_goog_20861 45674_81843405034_1495953A__ 386247001345_165426395473886 37329&ev_chn=shop&s_kwcid=AL!4428!3 !386247001345!!!g!856907751004!& gad_source=1 |
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Gas Nitrogen | Airgas | N/A | |
Glass microscope slides | Electron Microscopy Sciences | 71873-02 | https://www.emsdiasum.com/positive-charge-microscope-slides |
Liquid Nitrogen | Airgas | N/A | |
Mass Spectrometer | Waters | Synapt G2-Si | https://www.waters.com/waters/en_US/SYNAPT-G2-Si-Mass-Spectrometry/nav.htm?locale=en_mkcid=1000251Foodety%3C/a%3E&cid=134740653&bcid= 134528734 |
Matrix Sprayer | HTX Technologies | M3+ | https://www.htximaging.com/htx-m3-sprayer |
Methanol (HPLC), >99.9% | Fisher Chemical | A4524 | Methanol; https://www.fishersci.com/shop/products/methanol-hplc-fisher-chemical-9/A4524?crossRef=A4524#?keyword=A4524 |
Preclinical Ultrasound System | FUJIFILM VisualSonics | Vevo 3100 | https://www.visualsonics.com/product/imaging-systems/vevo-3100; Vevo F2 has replaced the Vevo 3100 in production. System includes isoflurane vaporizer and induction box. |
Reynolds Wrap | N/A | N/A | Aluminum foil |
Signagel Electrode Gel | Parker Laboratories | Parker 15-60 | Electrode Conducting Gel; https://www.parkerlabs.com/products/signagel-electrode-gel/ |
Sterile Lubricating Jelly | Medline | MDS032273Z | Lubricating Gel; https://www.medline.com/ce/product/Sterile-Lubricating-Jelly/Lubricating-Jelly/Z05-PF03664?sku=MDPMDS032273H |
Surgical instruments: scissors, forceps/tweezers, sutures | Fine Science Tools | 11252-00, 11050-10, 14016-14, 14084-08, 15000-08 | info@finescience.com |
Surgical Sponges 200 Pack –Gauze Pads Non sterile -First Aid Wound Care Dressing Sponge –Woven Medical Nonstick, Non Adherent Mesh Scrubbing | Medpride | B08RZGQ5GW | Gauze; https://www.amazon.com/Medpride-Surgical-Sponges-200-Pack/dp/B08RZGQ5GW/ref=asc_df_B08RZGQ5GW/?tag=hyprod-20&linkCode=df0&h vadid=693270340506&hvpos= &hvnetw=g&hvrand=960915122 2290977669&hvpone=&hvptwo= &hvqmt=&hvdev=c&hvdvcmdl=& hvlocint=&hvlocphy=9192978&hv targid=pla-1245491514869&psc= 1&mcid=33f4d647c88630c79116 888d565a63b0 |
Tissue-Plus O.C.T. Compound | Fisher Scientific | 23-730-571 | OCT; https://www.fishersci.com/shop/products/tissue-plus-o-c-t-compound-2/23730571 |
Wood Handled Cotton Swabs and Applicators | Fisherbrand | 22-363-160 | Cotton swab; https://www.fishersci.com/shop/products/wood-handled-cotton-swabs-applicators-8/p-7146852 |
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