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* Diese Autoren haben gleichermaßen beigetragen
Desorption Elektrospray-Ionisations-Massenspektrometrie (DESI-MS) ist eine Methode, mit der Umgebungsluft Proben, einschließlich biologischen Geweben, mit minimaler Probenvorbereitung abgebildet werden kann. Durch Rastern der Probe unterhalb der Ionisationselektrode, bietet dieses Spray-basierte Technik ausreichender räumlicher Auflösung auf molekularen Eigenschaften von Interesse in Gewebeschnitten zu erkennen.
Massenspektrometrie Imaging (MSI) bietet ungezielte molekularen Informationen mit der höchsten Spezifität und räumlicher Auflösung für die Untersuchung von biologischen Geweben zu den hundert bis zehn Mikrometer-Skala. Wenn unter Umgebungsbedingungen durchgeführt wird Probe Vorbehandlung überflüssig und vereinfacht damit das Protokoll unter Beibehaltung der hohen Qualität der erhaltenen Informationen. Desorption Elektrospray-Ionisation (DESI) ist ein Spray auf Umgebungstemperatur MSI Technik, die für die direkte Entnahme von Oberflächen im Freien, auch in vivo ermöglicht. In Verbindung mit einem Software-gesteuerten Probentisch verwendet, wird die Probe unter der DESI Ionisationselektrode gerastert und in den Zeitbereich, m / z Informationen mit der chemischen Spezies räumliche Verteilung korreliert. Die Genauigkeit der DESI-MSI Ausgang hängt von der Quelle Ausrichtung und Positionierung in Bezug auf die Probenoberfläche und Massenspektrometer Einlass. Hier prüfen wir, wie man Gewebeschnitte für DESI vorzubereiten imaging und zusätzlichen experimentellen Bedingungen, die direkt auf die Bildqualität. Insbesondere beschreiben wir das Protokoll für die Bildgebung von Rattenhirn Gewebeschnitten durch DESI-MSI.
Untargeted Bildgebung mittels Massenspektrometrie ermöglicht die Übernahme von chemischen Informationen für die Entdeckung und Hypothesen-generierenden Anwendungen. Gezielte Bildgebung eines bekannten chemischen von Interesse auf der anderen Seite kann eine erhöhte Empfindlichkeit und Selektivität durch spezifische Verfahren Entwicklung zu erleichtern. Massenspektrometrie Imaging (MSI) wird am häufigsten auf Gewebe mit MALDI, 1 Sekundärionen-Massenspektrometrie (SIMS), 2 und Umgebungstemperatur Ionisation Techniken, einschließlich Desorption Elektrospray-Ionisation (DESI), 3 Laserablation-Elektrospray-Ionisation (LAESI), 4 durchgeführt, 5 und flüssigen Mikro-junction-Oberfläche Probenahmesonde (LMJ-SSP). 6 In MALDI und SIMS, müssen die Proben physikalisch aus der Probe entfernt werden, und müssen flach und dünn, wie sie im Hochvakuum analysiert. MALDI erfordert Beschichtung der Probe mit einer Strahlung absorbierenden Matrix, das Hinzufügen einer zusätzlichen und umständlich Schritt zur Probenvorbereitung. SIMShat die höchste laterale Auflösung, aber Beschuss mit hochenergetischen Teilchen verursacht umfangreiche molekulare Fragmentierung. Deshalb füllen MSI durch Umgebungslicht Methoden eine Nische, wo weiche Analyse mit minimaler Probenvorbereitung ist wünschenswert. Doch bis heute werden alle Methoden noch durch das Erfordernis der flachen Probe Flächen begrenzt.
DESI verwendet eine pneumatisch unterstützte aufgeladen Lösungsmittel Spray an der Probenoberfläche gerichtet zu desorbieren und zu ionisieren Analyten. 7 Das Arbeitsmodell für die Desorption und anschließende Ionisation durch DESI als "Tropfen Pick-up-Modell" bekannt ist. 8-10 Die geladenen primären Tröpfchen hergestellt von der DESI Sonde mit der Oberfläche kollidiert, Benetzung und Ausbildung einer Dünnschicht, in die der Analyt durch eine Fest-Flüssig-microextraction Mechanismus 8 Nachfolgende Tröpfchenkollisionen ergeben Impulsübertragung und Start des zweiten Tröpfchen, die das Material von der Oberfläche entnommen wird aufgelöst . 9,10 Letztlich GasPhase Ionen sind vermutlich durch ESI Fortsätze nach dem Ionenverdampfung, Ladung Rückstand Modelle oder andere Modelle, 11 hergestellt werden, wobei der genaue Ionenbildung Verfahren DESI erst noch zu experimentell bewiesen. 12 DESI Empfindlichkeit ist stark abhängig von der Löslichkeit der Analyt in dem Solvens, wie Desorption beruht auf der lokalisierten microextraction. 13
In Verbindung mit einem Software-gesteuerten Probentisch verwendet, wird die Probe mit unidirektional Spur Schrittmotors unter der DESI Ionisationselektrode abgetastet und durch den Zeitbereich, m / z Informationen mit der chemischen Spezies räumliche Verteilung (Fig. 1) korreliert. Seit dem ersten proof of principle DESI-MSI Experiment von Van Berkel und Kertesz im Jahr 2006 berichtet, hat 14 die Technik deutlich gereift 15 mit gemeldeten Anwendungen in der Analyse von Lipiden, 3,16 Drogenmetaboliten 17,18 disease Biomarker, 19 Hirngewebe, 3,18,20 Lungengewebe, 18 Nierengewebe, 18 Hodengewebe, 18 Nebennieren, 17 Dünnschichtchromatographieplatten, 21 und Algen Oberflächen. 22. Die Routine Auflösung von Bildern von DESI-MSI erhaltene 100-200 um, die letztlich durch die wirksame Fläche durch das Spray extrahiert wird bestimmt, sondern Auflösungen so niedrig wie 40 um berichtet worden. 23-25 Solche Auflösung und einfache Analyse macht DESI-MSI geeignet für die schnelle und einfache Analyse von biologischen Gewebeproben mit Oberflächen im Bereich 0,5-5 cm 2, so dass der Erwerb von wertvollen Geodaten besser zu verstehen biologischen Prozessen 26. Hier wird als ein Beispiel für eine typische DESI-MSI-Anwendung, überprüfen wir die Einzelheiten des Verfahrens für die Durchführung einer erfolgreichen Experiment mit bildgebenden von Lipiden im Rattenhirn Gewebe. Die beiden wichtigsten Schritte in dem Protokoll sind dieGewebepräparation 27 und DESI Optimierung der Ionenquelle, wie unten beschrieben.
1. Tissue Schnitte
Hinweis: Wir empfehlen die Montage von zwei Sektionen pro Folie, mit einem Abschnitt für die Optimierung und die andere für die Bildgebung. Sofern Teile sind nicht für den sofortigen Imaging, Speicher Folien in -80 ° C Gefrierschrank in einer Dia-Box bis zur Analyse bereit.
2. DESI Optimization
3. Tissue Imaging
4. Bildverarbeitung
Abbildung 3 zeigt ein repräsentatives Spektrum von einer unbehandelten Rattenhirn Abschnitt erhalten. Im positiven Modus wird das Massenspektrum von Phosphatidylcholine aufgrund ihres hohen Ionisierungseffizienz (zurückzuführen auf die positiv geladenen quaternären Ammoniumgruppen) dominiert. Die gesamte Ionenbild der Gewebeschnitt ist auch in Fig. 3 gezeigt, mit umfangreicher Signal über den gesamten Abschnitt des Gehirns. Key Lipide erfasst sind in Tabelle 1 durch Vergleiche Literatur identifiziert.
Die räumliche Verteilung der Lipide Beispiel (Abbildung 4) zeigen, wie die relative Häufigkeit der verschiedenen Arten Phosphatidylcholin zwischen grauen und weißen Substanz des Gehirns verändert. Zum Beispiel [PC 34:1 + K] +, m / z 798,5364, zeigt erhöhte Intensität in der Hirnrinde (graue Substanz), während [PC 36:1 + K] +, m / z 826,5558, zeigt erhöhte Intensität in die Kleinhirnstiel (white Angelegenheit). Das zusammengesetzte Bild für die beiden Ionen (Abbildung 4c) erhalten hebt den Kontrast in Lipid-Verteilung über die Gewebeschnitte. Die räumliche Verteilung der andere wichtige Lipide im Gehirn sind ebenfalls in Tabelle 1 aufgeführt. Diese Verteilungen stimmen mit früheren Studien. 28-30
Abbildung 1. Schematische Darstellung der DESI-MSI Abbildungsverfahren. DESI (a) zur Oberflächenanalyse von Geweben verwendet wird, und wenn die Probe in einer gesteuerten Bewegung (b) unterhalb der Source gerastert, Massenspektren, Intensität vs m / z (c ), als Funktion der Zeit (d) erfasst wird. Diese Daten werden dann über den Zeitbereich mit der Bewegung korreliert, um eine chemische Bildes(E). Klicke hier, um eine größere Abbildung anzuzeigen .
Abbildung 2. Schematische Darstellung der DESI Quelle.
Abbildung 3. Durchschnittliche ganze Gewebe-Spektrum mit reichlicher m / z-Werte mit (a) und Totalionenstrom Bild (b) von DESI-MSI in positive Ionen-Modus erworben.
Abbildung 4. Ausgewählte Ionen Bildmaterial von Phosphocholinen in Rattenhirngewebe von DESI-MSI in positive Ionen-Modus erworben; (a) [PC 34:1 + K] +, m / z 798,5364, (b) [PC 36:1 + K] + , m / z 826.5558 (c) zusammengesetzte Bild von m / z 798, blau, und 826, rot.
Spezies | m / z | Lokalisierung (Materie) |
[PC 32:0 + Na] + | 756.5335 | Grau |
[PC 32:0 + K] + | 772.5165 | Grau |
[PC 36:4 + H] + | 782.5477 | Weiß |
[PC 34:1 + K] + | 798.5364 | Grau |
[PC 38:4 + H] + | 810.5716 | Weiß |
[PC 36:1 + K] + | 826.5558 | Weiß |
Tabelle 1. Key Lipid Identitäten und Lokalisation im Gehirn Abschnitt.
Die Optimierung der DESI Quellgeometrie ist entscheidend für eine erfolgreiche MSI Experimente. Die mehreren Variablen, die zur Ausrichtung des Systems unmittelbar auf Empfindlichkeit und Auflösung. Wenn während der Optimierung, hat der Experimentator Schwierigkeiten bei der Beschaffung Signal, empfehlen wir die Verwendung rot Sharpie Stelle auf der Folie als Maßstab gezeichnet; der Farbstoff Rhodamin 6G, m / z 443, erzeugt ein starkes Signal in der positiven Ionen-Modus und kann verwendet werden für anfängliche Optimierung. Außerdem ist die Auswahl des Lösungsmittels für DESI entscheidend für die Empfindlichkeit, als Analyt Übertragung und Ionisation hängt von der Gewinnung des Analyten von der Oberfläche in dem dünnen Film gebildet wird. 13 Viele Elektrospray-Ionisation-kompatiblen Lösungsmitteln und Mischungen verwendet werden, um in der Desolvatation unterstützen und Ionisation Prozess abhängig von der Klasse der Verbindung von Interesse bei der Analyse.
Wie bereits erwähnt, ist die Auflösung des DESI-MS Bild depends in erster Linie auf die Quelle Geometrie. Bildauflösung in der Größenordnung von 200 um wird regelmäßig von DESI-MSI erhalten, wenn dieser höher ist als Laser-basierten und / oder im Vakuum bildgebenden Verfahren, die von ~ 10-150 um. 5,31 Auflösung so hoch wie 40 um reichen kann Es wurde berichtet, mit DESI, 24 jedoch 200 um für die routinemäßige Bildgebung ausreicht Analyse von großen biologischen Gewebeschnitten. Die Qualität der inneren Quarzglaskapillare der DESI-Quelle wird auch Auswirkungen auf die Bildqualität und Auflösung. Die empfohlene Innendurchmesser der Kapillare 50 um, so groß ID Kapillaren ergeben eine größere Sprays und größere Bildauflösung. 25 Wenn diese Kapillare nicht quadratisch oder geschnitten wird rissig, das Spray nicht konisch sein, was zu unregelmäßig geformten Auswirkungen Stelle, schlechte Qualität und reproduzierbare Bilder.
Nicht nur, dass die Quelle die Auflösung der Geometrie DESI-MSI beeinflussen, es spielt auch eine bedeutende Rolle bei der Empfindlichkeitdes Verfahrens. Deshalb ist die Geometrie zu optimieren und konstant gehalten werden während des gesamten Verfahrens. Wenn die Probe nicht planar ist oder nicht genau waagerecht montiert ist, die Source-Geometrie ändert, wodurch sich die Reaktionszeit und die Schaffung eines Artefakt im Bild. 23 Obwohl DESI-MSI an ebenen Proben beschränkt wird 3D-Bildgebung von biologischen Geweben hergestellt möglich durch die 2D-Bildgebung von seriellen Gewebeschnitten, die dann in ein dreidimensionales Bild gestapelt sind. 32 Dieser Ansatz kann auch für andere MSI Methoden, einschließlich SIMS, MALDI, LAESI usw. 33 Dreidimensionale Massenspektrometrie Bilder können auch eingesetzt werden erstellt von der schrittweisen Beseitigung von Schichten des Materials, durch Laserpulse zum Beispiel, und Re-Imaging. 34
Die positive Analyse der Modus Rattenhirn Gewebe erleichtert erfolgreiche Bildgebung Phosphatidylcholinen und einige Medikamente und Metaboliten. 18. Um diese Analyse zu ergänzen, Bildgebung in negativE-Modus erzeugt ein Spektrum mit einer größeren Vielfalt von Klassen von Lipiden, 28,35 und kann verwendet werden, um eine umfassende Analyse der Gewebeschnitte bereitzustellen. In Fällen, in denen mehr als eine Lipid-Spezies zu einer bestimmten m / z-Wert zugeordnet werden können, können Tandem-Massenspektrometrie zur Identifizierung verwendet werden. Tandem-Massenspektrometrie dient auch als zusätzliche Methode der Lipid Identität Bestätigung. 35
Ambient Massenspektrometrie Bildgebung durch DESI wurde als wirksam erwiesen bei der Abbildung Lipide in Rattenhirngewebe. Informationen über MSI Experimenten erhalten einen Einblick in Krankheiten mit veränderter Ebenen der Phospholipide wie Alzheimer-Krankheit, Down-Syndrom und Diabetes ua verbundene Dienstleistungen zu erbringen. 36-38 Angesichts der hohen Fülle von Lipiden und ihre Rollen in biologischen Prozessen existieren viele biologische Systeme das wäre von den Informationen über bildgebende Massenspektrometrie erhalten profitieren. Mit vielen potenziellen MethodenBild zu biologischen Proben mittels Massenspektrometrie, ambient Ionisierungsmethoden, DESI insbesondere ein Mittel, dies zu tun mit eingeschränkter Probenvorbereitung und erhöht einfache Analyse.
Die Autoren erklären, dass sie keine finanziellen Interessen haben.
Diese Arbeit wird durch ARRA NSF MRI Instrument Development Grant # 0923179 zu FMF unterstützt. Wir danken Aqua Asberry, Lab-Koordinator für die Parker H. Petit Institut für Bioengineering und Biowissenschaften Histologie Kern, für die Unterstützung bei Gewebe Schnitte.
Name | Company | Catalog Number | Comments |
Reagents | |||
Tissue-Tek O.C.T. Compound | Sakura-Finetek | 4583 | http://www.sakuraeu.com/products/showitem.asp?cat=11&subcat=48 |
Acetonitrile | EMD | AX0156-6 | OmniSolv, LC-MS Grade |
Acetic Acid | Sigma Aldrich | 695092-500 ml | |
Equipment | |||
Cryostat microtome | Thermo Scientific | CryoStar* NX70 | Any available microtome can be used for tissue sectioning http://www.thermoscientific.com/ecomm/servlet/productsdetail?productId=13958375&groupType=PRODUCT&searchType=0&storeId=11152&from=search&ca=cryostar |
Omni Spray®DESI Spray Head | Prosolia Inc. | Can also use the 2-D Omni Spray® Source kit instead of assembling components of imaging experiment http://www.prosolia.com/sources.php | |
High Voltage Power Supply | Stanford Research Systems, Inc. | PS350/5000V-25W | http://www.thinksrs.com/products/PS300.htm |
Rope heater, RTD, controller | Omega | http://www.omega.com/toc_asp/subsectionSC.asp?subsection=M02&book=Heaters | |
Labview | National Instruments | Version 7.1 | |
Translational stage | Prior Scientific | Optiscan II | http://www.prior.com/productinfo_auto_motorized_optiscan.html |
AccuTOF Mass Spectrometer | JEOL | JMS-T100LC | Can use any mass spectrometer equipped with an extended capillary atmospheric pressure interface |
A correction was made to Imaging of Biological Tissues by Desorption Electrospray Ionization Mass Spectrometry. There was an error with an author's name. The author's surname was appended with a missing character:
Rachel V. Bennett
instead of:
Rachel V. Bennet
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