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Die Schritte, die zur täglichen Abstimmung und Optimierung der Leistung einer CyTOF Masse Zytometer beschrieben. Kommentare zu optimalen Probenaufbereitung und Durchfluss werden diskutiert
In den letzten Jahren hat die schnelle Analyse von Einzelzellen üblicherweise durchgeführt mittels Durchflusszytometrie und fluoreszenzmarkierten Antikörpern. Allerdings ist das Problem der spektralen Überlappung von Fluorophor-Emissionen die Anzahl der gleichzeitigen Sonden begrenzt. Dagegen ist die neue Masse CyTOF Zytometer von DVS Sciences Paare eine Flüssigkeit einzellige Einführungssystem mit einem ICP-MS. 1 Anstatt Fluorophore werden chelatisierende Polymere enthaltenden hoch angereicherten Metall-Isotope an Antikörper oder andere spezifische Sonden gekoppelt. 2-5 Aufgrund der Metall-Reinheit und Massenauflösung der Masse Zytometer, gibt es keine "spektrale Überlappung" von benachbarten Isotope, und daher keine Notwendigkeit zur Kompensation Matrizen. Zusätzlich, aufgrund der Verwendung von Lanthanidmetallen, gibt es keine biologischen Hintergrund und damit kein Äquivalent Autofluoreszenz. Mit einer Masse Fenster Spanning Atommasse 103-203, theoretisch bis zu 100 Etiketten könnten gleichzeitig unterschieden werden. Gegenwärtig, Mehr als 35 Kanäle zur Verfügung mit dem Chelatisierungsreagenzien ab DVS Sciences, ermöglicht beispiellose Dissektion der immunologische Profil der Proben. 6-7
Nachteile sind die Masse Zytometrie strengen Notwendigkeit eines gesonderten Metallisotops pro Sonde (kein Äquivalent vorwärts oder side scatter), und die Tatsache, dass es ein zerstörungsfreies Verfahren (keine Möglichkeit der Sortierung Rückgewinnung) ist. Die aktuelle Konfiguration der Masse Zytometer hat auch eine Zellen-Übertragungsrate von nur ca. 25% und erfordern somit eine höhere Anzahl von Zellen-Eingang.
Optimale tägliche Leistung der Masse Zytometer erfordert mehrere Schritte. Das grundlegende Ziel der Optimierung besteht darin, die gemessene Signalintensität der gewünschten Metall-Isotope (M) maximieren, bei gleichzeitiger Minimierung der Bildung von Oxiden (M 16), daß das M Signalintensität zu verringern und stören beliebiger Signal an M +16. Der erste Schritt ist, um sich aufzuwärmen das Gerät so ein heißer, stabile ICP Plasma hergestellt wurde. Zweitens müssen die Einstellungen für aktuelle und Make-up-Gas-Strömungsrate auf einer täglichen Basis optimiert werden. Während der Probenahme wird der maximale Zelle Ereignisrate von Detektor-Effizienz und die Verarbeitungsgeschwindigkeit zu 1000 Zellen / Sekunde begrenzt. Jedoch in Abhängigkeit von der Probe Qualität, eine langsamere Zelle Ereignisrate (300-500 Zellen / Sekunde) ist in der Regel wünschenswert, damit eine bessere Auflösung zwischen Zellen Ereignisse zu maximieren und somit intaktes Singuletts über Dubletts und Schutt. Schließlich trägt angemessene Reinigung der Maschine am Ende des Tages minimieren Hintergrundsignal durch freie Metall.
Alle Zellproben für die CyTOF müssen fixiert und permeabilisiert werden. Dies ermöglicht eine größere Eintrag des Iridium-haltigen DNA-Interkalator, und verhindert auch, dass während der Zelllyse MilliQ Wasser waschen und Resuspension Schritte unmittelbar vor der Injektion in die Masse Cytometer.
Ein. Start-up der Messe Cytometer
Abbildung 1. CyTOF Bedienfeld leuchtet vor der Inbetriebnahme.
Abbildung 2. CyTOF Bedienfeld leuchtet nach Plasma und gezündet Start-up erfolgreich abgeschlossen.
Abbildung 3. Massenkalibrierung Registerkarte angezeigt, der Hintergrundwerte für verschiedene Isotope nach dem Waschen und Wasser abspülen. Die Region rund um TOF 9400-9800 entspricht Xenon-Isotope in der Argon-Gas, und sollte immer vorhanden sein. Klicken Sie hier für eine größere Abbildung zu sehen .
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Abbildung 4. Massenkalibrierung Registerkarte angezeigt, der vertikale Streifen für verschiedene Isotope im DVS Tuning-Lösung. Klicken Sie hier für eine größere Abbildung zu sehen .
Abbildung 5. Aktuelle Tuning-Profil.
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Abbildung 6. Make-up-Gas Tuning-Profil.
Abbildung 7. Messung der Tuning-Lösung Signalintensitäten nach Optimierung Strom-und Make-up-Gas.
3. Laufende Proben
Abbildung 8. Acquisition Fenster während Probe läuft, zeigt horizontalen Reihen von Stellen entsprechend den Elementen mit drei separaten Zelle Ereignissen verbunden.ww.jove.com/files/ftp_upload/4398/4398fig8large.jpg "target =" _blank "> Klicken Sie hier für eine größere Abbildung zu sehen.
4. Reinigen des Geräts Nach dem Gebrauch
Abbildung 9. Massenkalibrierung Registerkarte Fenster, während der Post-run Reinigung mit DVS Waschlösung. Die vertikalen Streifen im TOF Region 9800-11000 sind Antikörper-Label Isotope aus der Maschine gereinigt werden. Die vertikalen Streifen rund TOF 11500 zu den beiden Ir Interkalator Isotopen entsprechen. Klicken Sie hier für eine größere Abbildung zu sehen .
5. Abschalten der Maschine
Nach dem obigen Protokoll sollte durchzuführen vier Dinge. Erstens wird damit ausreichende Aufwärmzeit für die Masse Zytometer erzeugen einen heißen, stabiles Plasma für optimales Signal und minimalen Oxidbildung. Zweitens ausreichendes Waschen der Masse Zytometer mit MilliQ Wasser und DVS Waschlösung (Abbildung 9) wird dazu beitragen, die Niveaus von Metall Adsorption an die Schläuche und andere Teile der Maschine und hilft, Hintergrund während Probenaufnahme reduzieren (Abb. 8). Es wird auch helfen entfernen Sie alle Zellen, die in der Maschine stecken und könnte somit minimiert Verschleppung von Probe zu Probe. Drittens während Oxidbildung kann nicht vollständig verhindert werden, richtige Abstimmung der Masse Zytometer (Figuren 5-7) wird optimieren Gesamtsignal bei der gewünschten Masse M Hilfe, unter Minimierung Hintergrund an der Oxid Masse M +16. Wie in Abbildung 10 zu sehen, unsachgemäße tuning (magenta) deutlich Oxidbildung bei erhöhtenM 16 an den richtig abgestimmt Probe (dunkelblau) verglichen. Dies hat den Effekt der leicht abnehmende gewünschte Signal am M und signifikant erhöht unerwünschte Hintergrundinterferenz bei M +16.
Schließlich sollte ein ausreichendes Waschen der Probe in Puffer und schließlich in MilliQ Wasser Metall / Antikörper Hintergrundsignal auf akzeptable Werte zu reduzieren. Die MilliQ Wasser wäscht und Resuspension sind entscheidend für die Aufrechterhaltung der stetigen Aktuelle Einstellungen im Verlauf von mehreren Stunden Laufzeit. Proper Verdünnung der Probe in MilliQ Wasser hat auf einer täglichen Basis von Stichproben ermittelt werden. Allerdings Verdünnen auf ~ 10 6 (Start-) Zellen / ml ist ein guter Ort, um zu beginnen. Basierend auf der ersten Probe von einem Satz, können mehr oder weniger Verdünnung für nachfolgende Proben untergebracht werden. Proper Waschen und richtige Verdünnung wird sichergestellt, minimal Hintergrund und die größte Auflösung von Zellen, aber gleichzeitig die Notwendigkeit für Geschwindigkeit (Abbildung 8).
Abbildung 10. Effekt der richtigen Abstimmung auf das gewünschte Signal, und die Differenz in Oxidbildung zwischen verschiedenen Lanthanidenmetallen. Polystyrol-Kügelchen mit natürlichen Überflusses La139, Pr141, Tb159, Tm169 und Lu175 von DVS Sciences wurden in Zelle Akquisition Modus ausgeführt werden. Getrennte Proben der Perlen wurden zu den angegebenen Schminken Gasströmungsraten (vgl. Abb. 6) verlaufen. Die Daten wurden mit FlowJo v9.4.9 für Mac, einschließlich Ausblendung Schutt aus zerbrochenen Perlen. Die richtig abgestimmt Probe betrug bei 0,74 l / min. Diese hatten höhere Signalintensitäten als bei niedrigeren Strömungsgeschwindigkeiten und höheren Signal an "M" Metall Massen mit weniger Signal an den "M 16" Oxid Massen als die unsachgemäß abgestimmt Signal. A. Signal an "M" und Masse La139 Tm169. Beachten Sie, dass La139 Signalintensität mehr als Tm169 wird durch Make-up Gasdurchsatz betroffen. B. Signal bei "M 16" Oxid Massees 155 und 185, entsprechend La139 + O16 und O16 Tm169 + Oxide sind. Es gibt keine eigentliche "Gd155" oder "Re185" in den Perlen. Das Oxid Signal in der "Gd155" Kanal ist besonders stark, da La139 wird leicht oxidiert. Dies stellt eine der höchsten von Oxid kann man erwarten, zu begegnen. C. Graph von "M" und "M +16" Signalintensitäten als Funktion von Make-up Gasdurchsatz. Gefüllte Symbole repräsentieren Masse "M", während offene Symbole Masse "M 16" darstellen. Die Farbe der Linien an die jeweilige Masse "M" entsprechen. Beachten Sie, dass La139 und Pr141 stark durch Make-up Gasdurchsatz betroffen, auch einen Punkt erreicht, wo mehr Masse "M 16" Oxid vorhanden ist als die Masse "M". Klicken Sie hier für eine größere Abbildung zu sehen .
In den letzten Jahrzehnten hat sich Fluoreszenz-Durchflusszytometrie war ein Arbeitstier Verfahren zur Analyse von einzelnen Zellen, sowohl in Bezug auf Oberflächen-Expression und funktionelle Assays. Allerdings hat die Fragen der spektralen Überlappung der Fluoreszenzfarbstoffe die Anzahl der gleichzeitigen Marker begrenzt. Während Experimente mit mehr als 12 gleichzeitige Marker gemeldet wurden, macht die Höhe der Entschädigung notwendigen dies technisch schwierig.
Statt Fluorophore, Pionier Masse Zytometrie von DVS Sciences verwendet Polymere mit chelatisierenden Seiten für Metalle als Marker für Antikörper. 1-3 Aufgrund der Reinheit der Metalle und der Masse Auflösung von ICP-MS, es ist tatsächlich keine "spektrale Überlappung." Da die meisten der eingesetzten Elemente nicht biologisch relevanten, gibt es auch wenig Hintergrund zu bewirken "Autofluoreszenz." Diese Tatsachen erlauben die Verwendung von mehr als 30 gleichzeitige Markierungen in einem einzigen Experiment. 6,7 Es gibt auch einen breiteren dydynamischen Bereich des Signals in der ICP-MS als in einem typischen Fluoreszenz-Experiment.
Allerdings hat Masse Zytometrie Einschränkungen. Es ist eine zerstörungsfreie Technik: Zellen können nicht für die Sortierung und weitere Experimente wiederhergestellt werden. Die Masse hat eine strenge Zytometer Anforderung für die Gegenwart von Metallen: wenn ein Metall nicht vorhanden ist, eine Zelle wird nicht erkannt. Dies ist der Hauptgrund für die Verwendung von Metall-Chelat-DNA-Interkalatoren, um korrekte Prozent-of-übergeordneten Statistiken zu gewährleisten, da alle Zellen unabhängig davon, ob jeder Antikörper-Sonden binden detektiert wird. 3,6-7 Schließlich wird die Stromzelle Übertragungseffizienz der Maschine beträgt ~ 25%, verglichen mit einem Wirkungsgrad von> 90% für ein fluoreszierendes Durchflußzytometer. Daher wird eine größere Anzahl von Zellen beginnend oft erforderlich, insbesondere für seltene Zellpopulationen. Jedoch ist dies in der Regel durch die Tatsache, dass eine einzige Masse Zytometer Probe häufig ersetzt mehrere fluoreszierenden Proben ausgewogen. Schließlich ist die maximale Zell-Besitzstandsition Rate ist viel langsamer als Standard-Leuchtstofflampen Durchflusszytometer bei ~ 1000 Zellen / sec; optimale Rate ist oft die Hälfte. Daher nimmt jede Probe mehr zu laufen.
Mehrere Zeitungen haben kürzlich auf der Färbung von verschiedenen Arten von Zellproben veröffentlicht worden. 3,5-7 Der Zweck dieses Artikels ist es, Informationen über die richtige Verwendung eines CyTOF TM Masse Zytometer zum Laufen Proben. Wartung der Vernebler durch Rückspülung mit und Lagerung in 5% Citranox minimiert Aufbau von Zelltrümmern und Metallen, wodurch die Wahrscheinlichkeit von Verstopfungen. Wartung der Maschine für eine optimale Leistung ist zweigeteilt. Erstens hilft die richtige Stimmung (Strom, Make-up-Gas) der Maschine auf mindestens täglich eine ordnungsgemäße Messung. Zweitens ausreichendes Waschen mit MilliQ Wasser zwischen jeder Probe und mit Waschlösung am Ende läuft zu entfernen aufgebauten organischen und anorganischen Verunreinigungen zu minimieren hilft Hintergrund im allgemeinen und Verschleppungzwischen den Proben. Schließlich hat die Qualität der Probenvorbereitung einen großen Einfluss auf die Qualität der Erfassung. Mehrere Wäschen in Puffer und schließlich in MilliQ Wasser helfen entfernen Metall-Hintergrund aus Interkalatoren oder unspezifische Antikörper-Bindung. Proper Verdünnung der Zellprobe hilft Gleichgewicht optimale Auflösung zwischen Zelle Veranstaltungen bei gleichzeitiger Minimierung der gesamten Laufzeit pro Probe. Proper Verdünnung auch minimiert die Wahrscheinlichkeit besteht, dass eine Verstopfung im Vernebler.
Fehlerbehebung Häufige Probleme
Ein. Die Maschine ist nicht vorbei "RFG vorbereiten" Schritt beim Start-up
Unter der Karte Cage auf der Registerkarte Instrument Set-up-Fenster, drücken Sie "Reset" unter HLG. Versuchen Sie, die Maschine zu starten. Wenn dies nicht beheben das Problem, schließen Sie die Software wieder zu öffnen, drücken Sie "Reset" wieder, und versuchen zu starten. Wenn dies immer noch nicht behoben das Problem, überprüfen Sie die HLG Generatorschalter Schalter auf der linken hinteren Ecke des Geräts. Wenn ausgelöst,Neupositionierung auf "On", drücken Sie "Reset", und versuchen zu starten. Wenn dies immer noch nicht behoben das Problem, wenden Sie sich DVS.
2. Die Maschine schaltet sich während des Betriebs
Dies kann auch geschehen durch große Tröpfchen, zu beginnenbilden, wenn der Vernebler beginnt zu verstopfen. Wenn dieser Fehler auftritt, entfernen Sie den Vernebler für die Reinigung, legen Sie eine saubere Vernebler und neu zu starten.
Weitaus seltener, kann die dünne Probe Schlauch zwischen der Probenschleife und dem Vernebler verstopfen. Dies kann durch anomal niedrige Flussrate von Flüssigkeit, wenn der Schlauch aus dem Zerstäuber entfernt diagnostiziert werden. Wenn dies der Fall ist, entfernen Sie den betroffenen Schläuche und Verschraubungen mit frischen Schläuchen aufgebaut werden, und ersetzen mit einem neuen Vernebler Anschlüsse und Schläuche Kit.
3. Keine Isotop Streifen (oder Zelle Ereignisse) sichtbar während Zellprobe Akquisition (Abbildung 8), oder während Sie Massenkalibrierung Registerkarte Fenster (Abbildungen 3, 4, 9)
Fragen 3c und 3d kann auch durch Ausführen einer Probe der Eu-haltigen Polystyroleichung Perlen überprüft werden. Sie werden mit rund 1 Mio. / mL (Vortex auch vor dem Zeichnen Probe!) Geliefert. Daher wäre Füllen der 450 ul Probenschleife geben aprund 450.000 Perlen. Die CyTOF TM Zellübertragung Effizienz ist machine-dependent, aber ca. 15-30%. Daher würde 67,500-135,000 Wulst Ereignisse aus diesem Injektion erwarten. Zahlen unter daß stimmen mit einer Verstopfung in dem Schlauch oder Vernebler.
Die Zelle / Bead Übertragungseffizienz ist etwas gelegentlich testen, um keine langfristige Trends beachten.
Die Autoren arbeiten beide am Human Immune Überwachungszentrum, ein Service-Center an der Stanford University, die Nutzungsgebühren erhebt sich ausschließlich auf die Kosten von Assays, einschließlich Masse Zytometrie erholen.
Wir möchten Dr. Evan Newell und Dr. Sean Bendall für Rückfragen danken. Wir möchten auch DVS Sciences und Dr. Sean Bendall für eine Probe der Multi-Lanthanoid-Polystyrol-Kügelchen danken. Wir sind dankbar für die Finanzierung von NIH 2 U19 AI057229.
Name | Company | Catalog Number | Comments |
Name des Reagenzes | Firma | Katalog-Nummer | Kommentare |
CyTOF TM Masse Zytometer | DVS Sciences | ||
Waschlösung | DVS Sciences | 201071 | 0,05% Flusssäure in Wasser |
Tuning-Lösung | DVS Sciences | 201072 | 0,5 ppm La, Cs, Tb, Tm, Ir, Spurenelemente Salpetersäure |
Eu-haltigen Polystyrol-Kügelchen | DVS Sciences | 201073 | Enthält natürliche Überfluß Eu Isotopen; Perlen an rund 1 Mio. / ml geliefert |
Multi-Lanthanoid-(La / Pr / Tb / Tm / Lu) - Polystyrol-Kügelchen | DVS Sciences | Noch nicht im Handel erhältlichen | Enthält natürliche Überfluß Isotope von börsennotierten Lanthaniden |
Salpetersäure (konzentriert) | Fisher Scientific | A467-500 | Optima Spur-Metall reinen ICP-MS Grade |
Polystyrol mit rundem Boden Rohr mit Zell-Sieb cap-5mL | BD | 352235 | verwendet werden, um Zellproben vor der Injektion filtern |
Norm-Ject Tuberkulin Spritze 1ml | Henke Sass Wolf | 4010-200V0 | silikonfrei, latexfrei |
Norm-Ject Spritze-3 mL | Henke Sass Wolf | 4010.000V0 | silikonfrei, latexfrei |
MilliQ Wasser | 18 M reines Wasser, darf nicht in Glas-oder Plastikflaschen, die mit handelsüblichen Waschmittel (wegen ihrer hohen Barium-present) gewaschen wurden gespeichert werden. | ||
Citranox | Sigma-Aldrich | Z273236 | saures Reinigungsmittel |
Argon-Gas | Praxair | AR 5.0UH-T | 99,999% Ultra-hohe Reinheit |
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