JoVE Journal

Biochemistry

This content is Open Access.

Mikrobiyal protein ve özel metabolit verilerinin analizi için açık kaynak MALDı TOF-MS ıdbac Pipeline kullanma

Transkript

IDBac, bakteriyel kolonilerden kazınmış hücre malzemesinde toplanan, hem bozulmamış protein hem de özel metabolit spektrumlu verileri birleştiren açık kaynaklı Kütle Spektrometrisi bazlı Biyoinformatik boru hattıdır. Boru hattı araştırmacılar hızlı bir şekilde on binlerce bakteriyel koloniler Putatif taksonom gruplara düzenlemek için izin verir ve daha fazla özel metaboliti üretimi dayalı ayırt.

Bu videodaki bölümler

0:04

Title

1:10

Preparation of MALDI Target Plates and Data Acquisition

2:02

Installing the IDBac Software and Starting with Raw Data

2:47

Work with Previous Experiments

3:22

Setting up Protein Data Analysis and Creating Mirror Plots

4:07

Clustering Samples Using Protein Data

4:49

Customizing the Protein Dendrogram and Inserting Samples from a Separate Experiment into the Dendrogram

5:32

Analyzing Specialized Metabolite Data and Metabolite Association Networks (MANs)

6:51

Results: Analysis of Microbial Protein and Specialized Metabolite Data by IDBac

8:28

Conclusion

İlgili Videolar

Sitemizdeki deneyiminizi iyileştirmek için çerezleri kullanıyoruz

Sitemizi kullanmaya devam ederek ya da "Devam et" butonuna tıklayarak, çerezleri kabul edebilirsiniz.