Yazarlar Çevre Bilim Maryland Merkezi&#39;nde Üniversitesi Todd Kana ile denitrifikasyon Walter Boynton ve Pete Sampou ve işbirlikçi çalışma yürüttüğü çalışmaları gözlemlerimizi kullanarak bu yaklaşım geliştirdi. Bizim denitrifikasyon yaklaşımlarının geliştirilmesi Maryland Deniz Hibe Programı ve Ulusal Bilim Vakfı desteği olmadan mümkün olmazdı. Burada kullanılan temsili veriler Maryland Deniz Grant tarafından desteklenen Maryland Deniz Grant (R / AQ-5c) ve yazma çabaları finansman ile toplanmıştır (R / SV-2), NOAA Chesapeake Körfezi Ofisi (NA13NMF4570210), İstiridye Kurtarma Ortaklığı Ulusal Bilim Vakfı (OCE1427019), Exelon Corporation ve Maryland Çevre Hizmet / Maryland Liman İdaresi.

Not: örselenmemiş sediment-su arayüzleri ile çekirdek toplama değişimi iyi deneysel ölçümlerin yapılması esastır; yüksek rahatsız çekirdekler örten su ile gözenek su çözünen maddeleri alışverişi olasıdır ve (II) Fe oksidasyon ve düşük sülfür bileşikleri aracılığıyla oksijen alımını arttırmıştır. Bu yazıda, sediman örneklemesi teknikleri ve çözünen ve gazların kimyasal analizler sadece üstünkörü eklenmesi ile sedimanlar sediment kuluçka prosedürlerini vurgulamaktadır. örnekleme öncesinde, ya da ilk sonuçlara göre, genel proje ihtiyaçlarına istatistiksel tasarım ya da küçük ölçekli mekansal değişkenlik beklenen miktarına göre çoğaltma derecesini belirler. Yinelenen çekirdek birçok çalışma ve üç kez kullandığı minimum daha iyi bir istatistiksel analiz izin için yararlıdır. 1. Tortu Toplama ve Taşıma Not: değişim deneyleri için sediment toplama çekirdekleri usi 1) manuel ekleme kullanılarak gerçekleştirilirtortuları tutmak için elle kapalı vana ile bir alüminyum kutup kullanarak karot, 2) kutup veya 3) kutu karot sığ yoluyla, dalgıçlar ya da sığ su veya sulak ng. <ol><li> her sitede, GPS kullanarak site konumunu kaydetmek bir su kalitesi sonda kullanılarak alt su oksijen, sıcaklık ve tuzluluk belirlemek ve PAR sensörü / metre kullanarak yüzey ve alt fotosentetik aktif radyasyon (PAR) belirler. <ol><li> sediment üzerinde 1 ~ m&#39;ye sonda su kalitesini düşürebilir ve alt su özelliklerini (derinlik, sıcaklık, çözünmüş oksijen, sıcaklık ve tuzluluk / iletkenlik) kaydedin. </li><li> Bir düşürücü çerçeve kullanarak sediment-su arayüzüne bir sualtı prob ile bir PAR sensörü indirin. ortam ışığı koşullarında ışık zayıflama tahmin etmek hemen hava-su arayüzü altında PAR okumalara tortu yüzeye yakın PAR okumaları karşılaştırın. </li><li> Bunu düşürücü, tekne / gemi yan üzerinde bir kutu oyma bıçağı dağıtma yavaş yavaş bozuklukları en aza indirmek içinsediment nüfuz üzerine. Görünür rahatsızlık veya aşırı tabanda çekirdek kutusunu inceleyin. <ol><li> Bir kutu çekirdek birimi için, sediment içine çekirdek tüpleri yerleştirin ve çekirdeğin üstünü örtecek bir butil tıpa kullanın. akı deneyler için, çekirdek içinde ideal bir tortu / su dengesi daha az tortu derinliği toplama su 15 cm ve kaba sediment 15 cm ya da yüksek oranda sıkıştırılmış çökelleri ise kabul edilebilir bir sonuçtur. Oksijen tükenmesi oranları aşırı değilseniz, daha fazla su sütunu yüksekliği doğru denge kayması. </li><li> Tipik olarak, derin su çalışmaları için ve bentik mikroalglerin veya büyük hayvan popülasyonlarının ile sedimanlar için 6.35 cm iç çapı çekirdek kullanmak 10 cm kimlik çekirdeği kullanın. Çekirdek büyüklüğü ana sınırı çekirdeğin alt kapak yeteneğidir. </li><li> gömülü bir O-halkası içeren bir akrilik alt plaka ile alt kapak. Yeterli çoğaltır toplanana kadar bu işlemi tekrarlayın. kutup çekirdek birimi, ilk etapta çekirdek li akrilik alt plaka ilener, çekirdek birimi gelen çekirdek kaldırmak ve stoper ekleyin. </li></ol></li></ol></li><li> siteden ortam su ile sular altında olduğunu uzun boylu yalıtımlı su soğutucusu yer çekirdekler; Bu yerinde sıcaklıklarda korumaya yardımcı olur. soğutucu dik kalmasını sağlamak. Taşıma sırasında rahatsız çekirdekleri atın. </li><li> deneylerde kullanılmak üzere 20 L bidonlarda içine tortu yüzeye yakın alınan alt su pompası. 10-20 L / dakika kapasiteli veya yüksek hızlı bir peristaltik pompa ile bir diyafram pompa kullanın. <ol><li> Sığ tabakalandırılmamış suda, suya &quot;dunking&quot; ile damacana doldurun. yüksek kapasiteli inline kartuş filtre kullanarak alt suyun süzülmesi sadece kontrol çekirdekleri su kolonundan düzeltme minimize (ışık) su kolonu oksijen alımı ya da fotosentez oranlarının yüksek olduğu bölgelerde yararlı olabilir. </li></ol></li><li> Kuluçka tesisi mümkün olduğunca çabuk çekirdeği taşıyın. genişletilmiş ulaşım, AER durumundasinyal dizisi çekirdekler oksijensiz ve yapay köpüren veya dolaşım gerekli olabilir. </li></ol> 2. İlk Kurulum <ol><li> Kuluçka tesisinde, bir inkübasyon küvet yer çekirdekleri ya kontrollü sıcaklık ile bir çevre odasında, ya da bir ısıtma / soğutma sirkülatör üzerinden sıcaklık kontrolü ile çift cidarlı inkübatör. 1.1.1 ölçülen alt su sıcaklıklarına sıcaklığını ayarlamak. </li><li> tamamen sediment çekirdekleri batış, inkübatör alt su ekleyin. Ayrıca yedek su dağıtılması için kullanılacak musluk ile 5 L&#39;lik karboya su ilave edilir. </li><li> inkübatör (sediman olmadan) bir su-tek çekirdek ekleyin. su kolonu boşlukları kullanımı gazları ve çözünen maddeleri etkileyen herhangi bir su sütunu süreçlerine telafi etmek için pek çok ortamda önemlidir. denitrifikasyon ölçümü için, bu boşlukları su sütunu süreçleri ancak çekirdek akrilik duvarları ile gaz alışverişini sadece yansıtabilir. </li><li> Kabarcık çekirdek w2 saat en az i hava termal dengeye ve örten su dolu oksijenlenmesini sağlamak. Onlar bir gecede tutulur ve zamanlı kurslar ertesi sabah başlatılabilir. Uzun ön inkübasyon süreleri etkinliği için değerlendirilmemiştir. <ol><li> yukarı doğru kabarcıklar sırasında suyun sürüklenmesine T sonuçlar altına yerleştirilmiş bir 1/8 &#39;tüp sadece oksijen sağlar, ama, havalandırma için, &quot;½ oluşan bir üç yollu bağlayıcı ile PVC boru küçük&quot; t &quot;bubbler kullanımı kuluçka küvet içinde, su ile iç su dolaşımı. </li></ol></li></ol> 3. Tortu su Kuluçka Prosedürleri <ol><li> sıcaklığı kontrol ettikten sonra, bu alan koşullara uyan sağlamak için çekirdek tepelerine iplik üstleri takın. Bu noktada, tank suyu gelen çekirdek mühür. Bu işlem sırasında çekirdek açık örnekleme valfini bırakın. El ile topacın alt tarafından hafifçe hava kabarcıklarını süpürme. </li><li> Eleİnkübasyon çekirdeklerinin üstleri daha yüksek sokmak yerine su damacana ~ 30-40 cm ve doğrultusunda herhangi bir havayı ortadan kaldırmak için aşağı doğru çizgiler boşaltın. Hala akan ederken, çekirdek tepelerine satırları ekleyin ve vanaları kapatın. </li><li> merkezi karıştırma pikap açın ve çekirdekler döndürmek, böylece dakikada ~ 40 kez dönme hızını ayarlamak veya su sütunu karıştırmak ancak tortu tekrar süspansiyon değil yeterli bir hızda. </li><li> Yaklaşık tüm çekirdekler mühürlendi 5 dakika sonra, yedek su vanasını ve örnek vanasını açın ve sonra bir Luer uydurma kullanarak örnek vanasına boru kısa bir parça eklemek. taşıncaya kadar dolar 7 ml&#39;lik cam tüp, alt Örnekleme tüpü yerleştirin. Önceki tüp sınırı için koruyucu olarak 30 g L-1 HgCl 2 10 ul ekle. <ol><li> kuluçka sıcaklığına yakın sıcaklıklarda sualtı bu örnekleri saklamak. Diğer laboratuvarlar başarıyla Sam için 12 ml &quot;ekzetaynerlere&quot; kullanmışple depolama. </li></ol></li><li> çözünen örnekleme için, numune vana bir 20 ml&#39;lik şırınga varil takın ve yedek su vanasını açın. şırınga varil dolu sadece yerçekimi kullanılarak kadar doldurur. Bir dalgıç ve bir filtre diski takın ve ardından şişeleri içine örnekleri filtre. besin analiz için bu örnekler dondurulur -20 analize kadar ° C. Not: Karanlıkta örnekleme zamanı ders tipik olarak oksijen alımını oranına bağlı 0.5&gt; 2 saat arasında değişen örnekleme arasındaki aralıklarla 4 örnekleme dönemleri kapsar. oksijen alımının düşük oranları ile, zaman aralıkları uzun; solunum oranlarının yüksek olduğu sedimanlarda, aralıklar kısa olması gerekir. Her bir numune, bir noktada alınan numunenin aşırı yüksek miktarlar bütün numune hacmi örnekleme çok büyük bir oranda neden olabilir; Çalışmalarımızda bu örnek hacimleri ihmal edilebilir bir düzeltme ile sonuçlanır. numune daha büyük bir hacmi büyük çaplı çekirdek ya da yüksek su sütunu yüksekliği, gerekirsegerekli olabilir. </li><li> Genellikle besin konsantrasyonları yeterli sinyal sağlayarak% 25 oksijen tükenişleri ile,% 50 oksijen tükenmesi bir eşiğin altında örnekleme bir zaman ders ile devam etmeyin. Burada, oksijen konsantrasyonları ve oksijen doygunluğu doğrudan analizi için kalibre optodes kullanın. <ol><li> Sedimanlar sığ, ışıklı ortamlardan ise, 4. örnekleme de, ışıkları açmak ve 3 sonraki örnekler alabilir. Çok fotosentetik sedimanlarda, O 2 ve kabarcık oluşumu süperdoyma bazı durumlarda gaz akıları ölçümünü sınırlar unutmayın. oksijen sürekli izleme fiber optik ölçüm teknolojisi son derece güvenilir ve hassas nispeten küçük sondalar sahip, giderek kalıcı ve değerli bir alternatif. </li></ol></li><li> sediment inkubasyon sonucunda, su sütununun yüksekliğini ölçmek veya doğrudan belirler için dereceli bir silindire su sütunu sifon ya atsu hacmi ine ve her çekirdek fotoğraf çekmek. </li></ol> 4. Numune Analizi <ol><li> Bir zar olarak N2, O2 ve Ar analizi için pompa örnekleri kütle spektrometresi girişi ve N2 oranı hesaplanır: Ar ve O 2: &lt;% 0,03 hassas 12,23 Ar. <ol><li> Çift bir membran girişine bir dört kutuplu kütle spektrometresi. peristaltik bir pompa kullanarak zar tüp içine örnek itin. plastik damacana örnek atık toplamak ve bağlı Hg koruyucu kimyasal atık olarak davranın. inkübasyon sıcaklığında hava ile dengelenmiş deiyonize su ile kalibre edin. </li></ol></li><li> besin ≤ 5 ml örnekler üzerinde veya otomatik analizörleri kullanarak küçük hacimlerde elle analiz gerçekleştirin. Örnek eritme üzerine, başlangıç ​​anında analiz eder. besin analizi prosedürü seçimi inkübasyon sırasında besin konsantrasyonu değişiklikleri gözlemlemek için yeterli bir kesinlik verim gerekir. tipik algılamasınırları 0.05 mmol L-1 ve zaman ders eğilimleri hem son derece düşük ve çok yüksek besin konsantrasyonları altında gözlemlemek zor olabilir &lt;vardır. <ol><li> çözünür reaktif fosforun kolorimetrik analizler için, askorbik asit phosphomolybdate tekniği kullanır. Amonyum analizleri için, bir fenol hipoklorit reaktifi 24 kullanarak bir gecede renk gelişimini kullanmaktadır. kolorimetrik analizler Otomatik ya segmentli akış veya ayrı bir analizör kullanarak, harika bir alternatif ve düşük örnek hacmi kullanmaktadır. </li><li> Nitrat artı nitrit analizleri için bir indirgeyici 25 olarak vanadyum klorür kullanılarak gecede renk gelişimi kullanmak, veya otomatik analizörü kullanımı </li><li> standart eğrileri bir UV / VIS spektrofotometre belirlenir absorbans karşılaştırın ve standartlar konsantrasyonları ve absorbanslardan bir gerileme gelen konsantrasyonları belirler. </li></ol></li></ol> Sediment-Su Döviz Kurunun 5. Hesaplanması <ol><li> Yamaç ľmol L -1 saat -1 olarak ifade ile, karanlık ve ışıklı inkubasyon hem bağımsız zamana karşı gaz veya besin konsantrasyonları gerileme. Su sütunu yalnızca çekirdek eğimi için kuluçka çekirdeklerinin yamaçlarında düzeltin. Sadece hesaplamalar için önemli regresyon (p &lt;0.05) kullanın; son verileri elektronik tablolar olmayan önemli veriler tespit. </li><li> örten suyun kimyasal bileşen konsantrasyonlarının değişim eğiminden çökelti su döviz kurları hesaplayın: <img alt="denklem 1" src="/files/ftp_upload/54098/54098equation1.jpg" /> F akı (ľmol m -2 saat -1) olduğu durumlarda, ΔC / ¨ t örten sudaki konsantrasyon değişikliği (ľmol L -1 saat -1) eğimi, V örten su hacmi (L) ve A kuluçkaya çekirdek (m -2) alanı, günlük akı tahmin ışık saat aydınlatılan oranı çarpmak .To olduğunuve karanlık saatleri ile çarpılır karanlık oranı ekleyin. </li></ol> 6. Raporlama <ol><li> sediment-su değişimi ölçümlerinden elde edilen sonuçları bildirirken diğer bilim örneklenmiş olan ortamı anlamak için, yeterli bilgi sağlamıyor. Temel bilgileri içerir: 1) Site konumu ve su derinliği, 2) bu tür saha ve inkübasyon sıcaklığı ve fiziksel özellikleri PAR, 3) oksijen, besin konsantrasyonları ve tuzluluk ve bu tanecik boyutu gibi 4) sediment özellikleri gibi alt su özellikleri, organik madde konsantrasyonları ve bentik hayvanların varlığı. </li></ol>

<ol>
	<li>Einsele, W. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Ueber+die+Beziehungen+des+Eisenkreislaufes+zum+Phosphatkreislauf+im+Eutrophen+See.">Ueber die Beziehungen des Eisenkreislaufes zum Phosphatkreislauf im Eutrophen See.</a> Arch.Hydrobiol. 29, 664-686 (1936).</li><li>Mortimer, C. H. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=The+exchange+of+dissolved+substances+between+mud+and+lake+water.">The exchange of dissolved substances between mud and lake water.</a> J Ecol. 29, 280-329 (1941).</li><li>Cowan, J. L. W., Boynton, W. R. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Sediment-water+oxygen+and+nutrient+exchanges+along+the+longitudinal+axis+of+Chesapeake+Bay:+Seasonal+patterns,+controlling+factors+and+ecological+significance.">Sediment-water oxygen and nutrient exchanges along the longitudinal axis of Chesapeake Bay: Seasonal patterns, controlling factors and ecological significance.</a> Estuaries. 19, 562-580 (1996).</li><li>Fisher, T. R., Carlson, P. R., Barber, R. T. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Sediment+nutrient+regeneration+in+three+North+Carolina+estuaries.">Sediment nutrient regeneration in three North Carolina estuaries.</a> Estuar. Coast. Shelf S.e. 14, 101-116 (1982).</li><li>McGlathery, K. J., Sundback, K., Anderson, I. C. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Eutrophication+in+shallow+coastal+bays+and+lagoons:+the+role+of+plants+in+the+coastal+filter.">Eutrophication in shallow coastal bays and lagoons: the role of plants in the coastal filter.</a> Mar. Ecol-Prog Ser. 348, 1-18 (2007).</li><li>Eyre, B. D., Ferguson, A. J. P. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Comparison+of+carbon+production+and+decomposition,+benthic+nutrient+fluxes+and+denitrification+in+seagrass,+phytoplankton,+benthic+microalgae-+and+macroalgae-dominated+warm-temperate+Australian+lagoons.">Comparison of carbon production and decomposition, benthic nutrient fluxes and denitrification in seagrass, phytoplankton, benthic microalgae- and macroalgae-dominated warm-temperate Australian lagoons.</a> Mar. Ecol-Prog Ser. 229, 43-59 (2002).</li><li>DiToro, D. M. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=.">.</a> Sediment Flux Modeling. , (2001).</li><li>Testa, J. M., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Sediment+flux+modeling:+Simulating+nitrogen,+phosphorus,+and+silica+cycles.">Sediment flux modeling: Simulating nitrogen, phosphorus, and silica cycles.</a> Estuar. Coast. Shelf S. 131, 245-263 (2013).</li><li>Kana, T. M., Cornwell, J. C., Zhong, L. J. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Determination+of+denitrification+in+the+Chesapeake+Bay+from+measurements+of+N-2+accumulation+in+bottom+water.">Determination of denitrification in the Chesapeake Bay from measurements of N-2 accumulation in bottom water.</a> Estuar. Coasts. 29, 222-231 (2006).</li><li>Hammond, D. E., Cummins, K. M., McManus, J., Berelson, W. M., Smith, G., Spagnoli, F. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Methods+for+measuring+benthic+nutrient+flux+on+the+California+Margin:+Comparing+shipboard+core+incubations+to+in+situ+lander+results.">Methods for measuring benthic nutrient flux on the California Margin: Comparing shipboard core incubations to in situ lander results.</a> Limnol. Oceanog Methods. 2, 146-159 (2004).</li><li>Miller-Way, T., Boland, G. S., Rowe, G. T., Twilley, R. R. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Sediment+oxygen+consumption+and+benthic+nutrient+fluxes+on+the+Louisiana+continental+shelf:+a+methodological+comparison.">Sediment oxygen consumption and benthic nutrient fluxes on the Louisiana continental shelf: a methodological comparison.</a> Estuaries. 17, 809-815 (1994).</li><li>Kana, T. M., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Membrane+inlet+mass+spectrometer+for+rapid+high-precision+determination+of+N2,+O2,+and+Ar+in+environmental+water+samples.">Membrane inlet mass spectrometer for rapid high-precision determination of N2, O2, and Ar in environmental water samples.</a> Anal. Chem. 66, 4166-4170 (1994).</li><li>Gao, Y., Cornwell, J. C., Stoecker, D. K., Owens, M. S. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Influence+of+cyanobacteria+blooms+on+sediment+biogeochemistry+and+nutrient+fluxes.">Influence of cyanobacteria blooms on sediment biogeochemistry and nutrient fluxes.</a> Limnol. Oceanogr. 59, 959-971 (2014).</li><li>Hopfensperger, K. N., Kaushal, S. S., Findlay, S. E. G., Cornwell, J. C. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Influence+of+Plant+Communities+on+Denitrification+in+a+Tidal+Freshwater+Marsh+of+the+Potomac+River,+United+States.">Influence of Plant Communities on Denitrification in a Tidal Freshwater Marsh of the Potomac River, United States.</a> J. Environ. Qual. 38, 618-626 (2009).</li><li>Cornwell, J. C., Kemp, W. M., Kana, T. M. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Denitrification+in+coastal+ecosystems:+environmental+controls+and+aspects+of+spatial+and+temporal+scale.">Denitrification in coastal ecosystems: environmental controls and aspects of spatial and temporal scale.</a> Aquat. Ecol. 33, 41-54 (1999).</li><li>LaMontagne, M. G., Valiela, I. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Denitrification+measured+by+a+direct+N2+flux+method+in+sediments+of+Waquoit+Bay,+MA.">Denitrification measured by a direct N2 flux method in sediments of Waquoit Bay, MA.</a> Biogeochemistry. 31, 63-83 (1995).</li><li>Nielsen, L. P. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Denitrification+in+sediment+determined+from+nitrogen+isotope+pairing.">Denitrification in sediment determined from nitrogen isotope pairing.</a> FEMS Microbiol Ecol. 86, 357-362 (1992).</li><li>Ferguson, A. J. P., Eyre, B. D., Gay, J. M. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Organic+matter+and+benthic+metabolism+in+euphotic+sediments+along+shallow+sub-tropical+estuaries,+northern+New+South+Wales,+Australia.">Organic matter and benthic metabolism in euphotic sediments along shallow sub-tropical estuaries, northern New South Wales, Australia.</a> Aq. Microb. Ecol. 33, 137-154 (2003).</li><li>Coley, T. L. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=.">.</a> The effect of flow on the fluxes of oxygen, dinitrogen gas, nitrate and ammonium in diffusively controlled sediments using stirred experimental chambers. , (2003).</li><li>Owens, M. S. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=.">.</a> Nitrogen cycling and controls on denitrification in mesoahaline sediment of Chesapeake Bay. , (2009).</li><li>Sundback, K., Jonsson, B. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Microphytobenthic+productivity+and+biomass+in+sublittoral+sediments+of+a+stratified+bay,+southeastern+Kattegat.">Microphytobenthic productivity and biomass in sublittoral sediments of a stratified bay, southeastern Kattegat.</a> J. Exp. Mar. Biol. Ecol. 122, 63-81 (1988).</li><li>Petersen, J. E., Cornwell, J. C., Kemp, W. M. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Implicit+scaling+in+experimental+enclosed+aquatic+ecosystems.">Implicit scaling in experimental enclosed aquatic ecosystems.</a> Oikos. 85, 3-18 (1999).</li><li>Kana, T. M., Weiss, D. L. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Comment+on+"Comparison+of+isotope+pairing+and+N-2+:+Ar+methods+for+measuring+sediment+denitrification"+by+B.+D.+Eyre,+S.+Rysgaard,+T.+Daisgaard,+and+P.+Bondo+Christensen.+2002.+Estuaries+25:+1077-1087.">Comment on "Comparison of isotope pairing and N-2 : Ar methods for measuring sediment denitrification" by B. D. Eyre, S. Rysgaard, T. Daisgaard, and P. Bondo Christensen. 2002. Estuaries 25: 1077-1087.</a> Estuaries. 27, 173-176 (2004).</li><li>Parsons, T. R., Maita, Y., Lalli, C. M. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=.">.</a> A Manual of Chemical and Biological Methods for Seawater Analysis. , (1984).</li><li>Doane, T. A., Horwath, W. R. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Spectrophotometric+determination+of+nitrate+with+a+single+reagent.">Spectrophotometric determination of nitrate with a single reagent.</a> Analytical Letters. 36, 2713-2722 (2003).</li><li>Testa, J. M., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Modeling+the+impact+of+floating+oyster+(Crassostrea+virginica)+aquaculture+on+sediment-water+nutrient+and+oxygen+fluxes.">Modeling the impact of floating oyster (Crassostrea virginica) aquaculture on sediment-water nutrient and oxygen fluxes.</a> Aquac. Environ. Interact. 7, 205-222 (2015).</li><li>Hamme, R. C., Emerson, S. R. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=The+solubility+of+neon,+nitrogen+and+argon+in+distilled+water+and+seawater.">The solubility of neon, nitrogen and argon in distilled water and seawater.</a> Deep-Sea Res. Part I-Oceanogr. Res. Papers. 51, 1517-1528 (2004).</li><li>Chong, L. S., Prokopenko, M. G., Berelson, W. M., Townsend-Small, A., McManus, J. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Nitrogen+cycling+within+suboxic+and+anoxic+sediments+from+the+continental+margin+of+Western+North+America.">Nitrogen cycling within suboxic and anoxic sediments from the continental margin of Western North America.</a> Marine Chemistry. 128, 13-25 (2012).</li><li>Eyre, B. D., Rysgaard, S., Dalsgaard, T., Christensen, P. B. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Comparison+of+isotope+pairing+and+N-2+:+Ar+methods+for+measuring+sediment-denitrification-assumptions,+modifications,+and+implications.">Comparison of isotope pairing and N-2 : Ar methods for measuring sediment-denitrification-assumptions, modifications, and implications.</a> Estuaries. 25, 1077-1087 (2002).</li><li>Lee, D. Y., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=The+Effects+of+Oxygen+Transition+on+Community+Respiration+and+Potential+Chemoautotrophic+Production+in+a+Seasonally+Stratified+Anoxic+Estuary.">The Effects of Oxygen Transition on Community Respiration and Potential Chemoautotrophic Production in a Seasonally Stratified Anoxic Estuary.</a> Estuar.Coasts. 38, 104-117 (2015).</li><li>MacIntyre, H. L., Geider, R. J., Miller, D. C. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Microphytobenthos:+The+ecological+role+of+the+"secret+garden"+of+unvegetated,+shallow-water+marine+habitats+.1.+Distribution,+abundance+and+primary+production.">Microphytobenthos: The ecological role of the "secret garden" of unvegetated, shallow-water marine habitats .1. Distribution, abundance and primary production.</a> Estuaries. 19, 186-201 (1996).</li><li>Aller, R. C., Mackin, J. E. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Open-incubation,+diffusion+methods+for+measuring+solute+reaction+rates+in+sediments.">Open-incubation, diffusion methods for measuring solute reaction rates in sediments.</a> J. Mar. Res. 47, 411-440 (1989).</li></ol>

Yazarlar ifşa hiçbir şey yok.

Burada açıklanan teknik sığ ve derin hem de sucul sistemlerin, sayısız türde uygulanmıştır, ve biz çoğu durumda iyi çalışması için bulduk. Bu yaklaşım meslektaşları tarafından kullanılan ve literatürde bildirilen yaklaşımlardan uyarlanmıştır; membran giriş kütle spektrometresi yoluyla denitrifikasyon ölçümü için optimize edilmiştir. Bu yaklaşımın güçlerinden biri aynı anda çekirdek çok sayıda işlemek için yeteneğidir. alternatif bir yaklaşım daha az çoğaltma siteleri maksimize etmektir olsa yinelenen veya üç çekirdekli her site kopyalayan bir çevre segmenti için ortalama değer doğada değişkenlik daha iyi temsil olabilir, bu şartlar altında, ölçümlerde güven artar. mevsimsel farklılıklar ortaya çıkması için, sitelerin daha az sayıda ölçüm zaman serisi yararlı bir strateji olabilir. Bu protokol, birkaç kritik adımlar vardır. yapma s Paramountuccessful ölçümler sağlam bir tortu su arayüzü ile çekirdek topluluğudur. alanında bu kriter yorucu olabilir uymayan çekirdekleri reddetme rağmen, yoksul çekirdekler kötü doğruluk ve hassasiyet yol açacaktır. aerobik çekirdekleri tutulması gazlı ve eserler en aza indirmek ve sağlıklı, sağlam mikrobik ve metazoan popülasyonlarını koruyacak orijinal koleksiyon sıcaklığına yakın. Son olarak, O2 ve N2 numuneler için, cıva klorid koruyucu eklenmeden kritiktir. Biz bu akı ölçümlerini tehlikeye düşürebilecek, flakon aşırı ısıtma ve soğutma da dahil olmak üzere gaz örneklerinin olduğu yanlış korunması, gözlemledik. Diğer laboratuvarlar başarıyla istihdam var 7.0 M ZnCl2 alt atık bertaraf maliyetlerini sahip daha az toksik bir koruyucu olarak; Bir 7 için 30 ul ilave uygun örnek ml. N2 ve Ar oranının hassas ve doğru analiz N2 belirlenmesi için anahtar </sub&gt; akıları. Gözlemlenen N2 Ar oranları, genel olarak ısıtılmış bakır 28 kullanılarak, analiz öncesi oksijen çıkarma savunmak için bazı araştırmacılar gelen oksijen konsantrasyonunun bir fonksiyonu olarak değişir. Laboratuvarda kullanılan aletleri N2 ile oksijeni etkisini belirlemek için kullanılmıştır: Ar oranları 23 sonuç mütevazı oksijen tükenmesi için çok &lt;0.03,% olarak tespit edilmiştir. Oksijen &quot;etkisi&quot; değerlendirirken yaklaşım farklılıklar farklı araştırmacılar 23,28,29 farklı sonuçlara yol görünür. N 2 büyük oksijen etkisi: Ar oranları N2 N akış içinde hatalı yüksek oranlarda yol açacak; bizim deneyim, biz göz ardı edilebilir N birçok gözlemler oksijen tükenmesi yüksek oranda altında 2 N akış var. Laboratuarlarda hangi N2 oksijen etkisi Giriş: Ar oranları büyük görünür, kullanışlı bir alternatif elektrotlar veya optodes ve oksijen kullanarak oksijen konsantrasyonlarının bağımsız bir ölçümdürinline ısıtılmış Cu kullanarak kütle spektrometrik analizinden çıkarma. Bu teknik sorun giderme Sadece sediman akışı verilerin incelenmesi üzerine mümkündür. regresyonlar karıştırma sürekli olup olmadığını, numuneler doğru toplanmış ve korunmuş olan fakir olduğunda anahtar faktörler dikkate ve zaman ister dersler düşük oranları tahmini sağlayamayacak kadar kısa idi. Deneylerin uzunluğu genellikle zaman ders regresyonlarında gömülü sinyal gürültü oranı artırmak için daha uzun inkubasyon gerektiren metabolizma düşük oranları ile, oksijen zamanla tarafından ayarlanır. O 2 baloncuklar elde oksijen üretiminin yüksek oranda gaz akıları zorlaştırır, ama çözünen akıları etkilenmemiş olabilir. Yaklaşımın sınırlarını anlamak için gereklidir. küçük çekirdekler bir metrekare% 0.3 kapsayan ve daha büyük çekirdekler% 0.6 kapsamaktadır. metre ölçeğinde önemli heterojenlik, Deriden heterojen dağılımları ile sitelerdeals veya bitkiler, bir ya da iki çekirdek yeterli bir temsil olmayabilir önerebilir. Ölçüm zorluklar mevcut bazı ortamlar da vardır. Kabarcıklar halinde gaz ayırıcı dahil etkilenmiş Ar oranları: denitrifikasyon ölçümü için, metan ya da oksijen kabarcıklarının varlığı N2 ile, teknik geçersiz kılabilir. Bentik mikroalg tarafından kolonize tortu olarak, N2 N2 Ar&#39;ye nisbetle ve azalma tercih edilen bir sıyırma oksijen kabarcıkları sonuçlar oluşumu Ar oranı. Genel olarak, biz kabarcıkları oluşur noktada denitrifikasyon ölçemez. Anaerobik ortamlar farklı zorluklar poz ve çekirdek havalandırma sediment-su arayüzünde redoks dinamiklerini değiştiriyor. Biz toplandıktan hemen sonra karıştırma üstleri ile çekirdeği kadar mühür ve tamamen 30 su sütunu değiştirmeden akıları başlar. ışıklı sedimanlar ile deneyler genellikle doyurarak veya yakın saturataydınlatma 31 seviyelerini ing ve böylece bentik mikroalg etkisini en üst düzeye çıkarmak. Sediment su değişimi ölçümleri sediment-su arayüzü üzerinden malzemelerin net akı bir ölçüm vardır. Ancak, bu ölçümler başına sıklıkla bu arayüz değişim kontrol mekanizmaları tespit edemez. araştırma sorusu anlayış mekanizmaları, organik madde reaktivitesi ilişkin diğer bilgiler terminal elektron alıcısı zonlanması, bioirrigation ve Biyotürbasyon ve fotosentetik organizmalar içeriyorsa gerekli olabilir. Gözenek suyu kimyası, organik madde reaktivitesi 32 doğrudan önlemler, hayvan popülasyonlarının sayımı, sediman biyo-sulama, tortu accretion veya redoks veya su kimyasını 13 örten deneysel manipülasyon belirlenmesini isteyebilir çabaları 7 Modelleme. Çalışmalarda, iyi sediment-su değişimi verisi su sedimanlar kimyasını anlamak önemli bir bileşeni olan,ve diğer ölçümlerle birlikte, su madde döngüleri tortu geri dönüşüm süreçleri için rolünü belirtir. tortu işlenmesiyle ilgili bakım, sıcaklık kontrolü, ve su sütunu karıştırma ile, çekirdek ınkübasyonlar sediman-su arayüzünde çözünen ve gaz alışverişine tahmini için yararlı bir yaklaşımdır. Ancak, burada kullanılan teknikler bazı ortamlarda ve inkübasyon öncesi genişletilmiş süreler gibi zor lojistik için değişiklik gerekebilir. Bugüne kadar, başarılı minimal değişiklik ile, kıyı, sulak, göl, rezervuar, nehir ve tutma gölet ortamları nehir ağzındaki bu kuluçka yaklaşımı uyguladık.

besin ve kirletici önemli lavabo çökelleri genellikle sucul ekosistemlerin kritik biojeokimyasal bileşenleridir ve vardır. Göl çökelleri içinde besin, gaz ve geçiş metal Biyojeokimya öncü çalışmalar redoks koşullarını 1,2 değişen vardı örten su ile çözünen ve gazların sediment alışverişini ortaya çıkardı. Besin elementleri için, sedimanlar bir fosfor kaynağı ve organik madde remineralizasyon sonra sabit azot ve fotosentetik olmayan ortamlarda 3,4 oksijen bir lavabo olabilir. Batık makrofitlerin, makro ve bentik mikroalglerin Fotosentez sediment-su arayüzü 5,6 arasında çözünmüş maddelerin alışverişi derin etkilere sahip olabilir. sediment-su arayüzü üzerinden çözünen ve gaz alışverişine ölçümleri mühendislik ve bilimsel wat kalibrasyonu da dahil olmak üzere, temel bilim ve uygulamalı bilim amaçlar için yapılırkalitesi modelleri 7,8 er. Bu yöntemlerin amacı, mümkün olduğunca, güvenilir ve doğru sediment-su döviz kurları sağlamaktır. yaklaşımlar çok çeşitli tortu su ara-yüzünde kimyasal değişimini değerlendirmek için kullanılmıştır. Tabakalı sistemlerde gaz ve çözünen maddelerin alt su birikimi 9 yararlı olabilir, ancak Termoklin veya pycnoclines üzerinde tortu su alışverişi için geçerli değildir olabilir. Eddy korelasyon dikey su hızlarının yüksek frekans ölçümü ile birlikte gazların, genellikle oksijen yüksek frekans ölçümleri gerektirir; Bu teknik yerinde kubbeleri ise. besin değişim çalışmaları için veri sağlayamaz şu anda muazzam sözü vardır ama ya odaları in situ sıcaklıkları, derin su basınçları ve ışık düzeyleri tortu daha geniş bir yüzey alanı kapsayan ve içinde sürdürülmesi avantajı ile, son derece tercih edilen bir yöntemdir 10. Uygulamada, bu geniş zaman gerektiren çok pahalı ölçümlerbüyük araştırma gemilerinde; uygulamaların çoğu kıyı bölgesi veya okyanus çökelleri derindir. Kararlı duruma ulaşması odaları aracılığıyla akışını kullanarak çekirdek inkübasyon teknikleri inkubasyon sırasında 11, oksijen içeren, nispeten sabit örten su kimyası korumak için mükemmel. oran içeri akan ve dışarı akan su ve su döviz kurları ile arasındaki konsantrasyon farklılıkları ile kararlı durumda belirlenir, çünkü bu ınkübasyonlar zaman önemli miktarda alabilir. Laboratuvarımızda tarafından kullanılan zaman ders çekirdek kuluçka yaklaşımı Kuzey Amerika ve Avrupa&#39;da farklı laboratuarlarda bir sayısına göre kullanılan yaklaşımlardan uyarlanmıştır ve bu genel yaklaşıma dayanan literatürün önemli bir miktardır. Biz sık sık denitrifikasyon olarak anılacaktır N 12 akılarında N2 ölçümü, bu yaklaşımı uyarlamış ve fotosentez ve fotosentetik olmayan tortu ortamlara bunu uygulamış, dahil estuaries 13, göller, rezervuarlar ve sulak 14. Bu çalışmalar sayesinde bizim genel yaklaşım iyi çalıştığı birçok ortamlar bulduk, bazıları da o değil. Bu süreç ekosistemlere azot önemli bir kaybı temsil ettiğinden denitrifikasyon ölçümü birçok farklı karasal ve sucul ortamlarda yapılmıştır. Çok sayıda yaklaşımlar denitrifikasyon ölçümleri, bazı doğrudan ve 15 bazı dolaylı yapmak için kullanılır olmuştur. Doğrudan N2 akışı ölçümler, yüksek atmosfer içeriği N2 ve su 16 içinde çözüldü daha sonra yüksek konsantrasyonlarda çok zordur. İki yaklaşım çevreyle ilgili oranları en iyi şekilde temsil sahip olarak ortaya çıkmıştır: N kullanarak izotop eşleştirme 17 ve N 2 izotoplar: laboratuvarda kullanılan Ar oranı. izotop eşleştirme yöntemi birçok ortamlarda başarıyla kullanılmaktadır ve düşük fiyatla yüksek hassasiyete sahip olmuştur. Biz N istihdam2: Ar oranı sadeliği nedeniyle yaklaşımı ve etkilenen ortamlarda yeterince hassas olduğu için biz sık sık çalışma. Bu yazıda, biz gaz ve çözünenlerin sediment-su değişimi ölçümü yapmak için son yirmi yılda kullanmış teknik yaklaşımı açıklar. sediment-su değişimi, herhangi bir ölçüm dikkate tarla koşullarında ve deneysel parametrelerin bir dizi içine almak gerekir. Bu faktörler sıcaklık, aydınlık / karanlık koşullar 18, sediment-su arayüzünde 19 karıştırma / fiziksel akışı, çözünmüş oksijen konsantrasyonlarını 20, ve iyi ölçümler yaparak temel unsurlarıdır diğer faktörlerdir. Çekirdekler bentik mikroalglerin büyümesi için yeterli aydınlatma aldığınız alanlarda toplanan Örneğin, karanlık ve ışık koşullarına 21 ikisini de deneylerini gereklidir. Benzer bir şekilde, oksijen, üstteki suyun eklenmesi çekirdekleri anoksik içinAlan koşulları çoğaltma değil. Kaçınılmaz eserler 22 yol açabilir sucul ekosistemlerin herhangi bir bölümünün Deneysel muhafaza; Bir tortu su değişimi ölçüm programı 1&#39;de kullanılan yaklaşımlar) her ekosistemde sediment-su değişimini kontrol eden faktörleri tanımak ve 2) deneysel manipülasyon türetilmiş eserler en aza indirmek önemlidir.

<table border="0" cellpadding="0" cellspacing="0" width="638">
	<colgroup>
		<col />
		<col />
		<col />
		<col />
	</colgroup>
	<tbody>
		<tr height="64">
			<td height="64" style="height:64px;width:179px;">Multiparameter sonde - temperature, oxygen, salinity</td>
			<td style="width:135px;">YSI</td>
			<td style="width:123px;">&#34;</td>
			<td style="width:203px;">Any high quality equipment will suffice</td>
		</tr>
		<tr height="22">
			<td height="22" style="height:22px;width:179px;">PAR Measurement</td>
			<td style="width:135px;">Li-Cor</td>
			<td align="right" style="width:123px;">6050000</td>
			<td style="width:203px;"></td>
		</tr>
		<tr height="22">
			<td height="22" style="height:22px;width:179px;">Pole corer</td>
			<td style="width:135px;"></td>
			<td style="width:123px;"></td>
			<td style="width:203px;">Built by machine shop</td>
		</tr>
		<tr height="49">
			<td height="49" style="height:49px;width:179px;">Box corer</td>
			<td style="width:135px;">DK-Denmark</td>
			<td style="width:123px;">HAPS Corer</td>
			<td style="width:203px;">We also use light box coring equipment</td>
		</tr>
		<tr height="67">
			<td height="67" style="height:67px;width:179px;">Small core tubes with o-ring fitted bottom, 3&#39; OD, 2.5&#39; Id.</td>
			<td style="width:135px;">various plastics companies</td>
			<td style="width:123px;"></td>
			<td style="width:203px;">Clear acrylic</td>
		</tr>
		<tr height="67">
			<td height="67" style="height:67px;width:179px;">Medium core tubes with o-ring, 4.5&#34; od, 4&#34; id</td>
			<td style="width:135px;">various plastics companies</td>
			<td style="width:123px;"></td>
			<td style="width:203px;">Clear acrylic</td>
		</tr>
		<tr height="22">
			<td height="22" style="height:22px;width:179px;">Butyl stopper size 13.5</td>
			<td style="width:135px;">generic</td>
			<td style="width:123px;"></td>
			<td style="width:203px;"></td>
		</tr>
		<tr height="22">
			<td height="22" style="height:22px;width:179px;">Stirring turntable</td>
			<td style="width:135px;"></td>
			<td style="width:123px;"></td>
			<td style="width:203px;">Built by machine shop</td>
		</tr>
		<tr height="22">
			<td height="22" style="height:22px;width:179px;">Incubation tub</td>
			<td style="width:135px;"></td>
			<td style="width:123px;"></td>
			<td style="width:203px;">Built by machine shop</td>
		</tr>
		<tr height="22">
			<td height="22" style="height:22px;width:179px;">Replacement water carboy</td>
			<td style="width:135px;">Nalgene</td>
			<td style="width:123px;">2320-0050</td>
			<td style="width:203px;"></td>
		</tr>
		<tr height="22">
			<td height="22" style="height:22px;width:179px;">7 mL glass stoppered tube</td>
			<td style="width:135px;">Chemglass</td>
			<td style="width:123px;">not on inventory</td>
			<td style="width:203px;">&#34;Exetainers&#34; used by other labs</td>
		</tr>
		<tr height="22">
			<td height="22" style="height:22px;width:179px;">20 mL plastic syringe</td>
			<td style="width:135px;">generic</td>
			<td style="width:123px;"></td>
			<td style="width:203px;"></td>
		</tr>
		<tr height="22">
			<td height="22" style="height:22px;width:179px;">Syringe filters</td>
			<td style="width:135px;"></td>
			<td style="width:123px;"></td>
			<td style="width:203px;"></td>
		</tr>
		<tr height="22">
			<td height="22" style="height:22px;width:179px;">Plastic tubing</td>
			<td style="width:135px;">Tygon</td>
			<td style="width:123px;">ACF00004-CP</td>
			<td style="width:203px;"></td>
		</tr>
		<tr height="43">
			<td height="43" style="height:43px;width:179px;">Compact Fluorescent Lights</td>
			<td style="width:135px;">Apollo Horticulture</td>
			<td style="width:123px;">CFL 8U 250W</td>
			<td style="width:203px;"></td>
		</tr>
	</tbody>
</table>

the benthic exchange of o2, n2 and dissolved nutrients using small core incubations

The measurement of sediment-water exchange of gases and solutes in aquatic sediments provides data valuable for understanding the role of sediments in nutrient and gas cycles. After cores with intact sediment-water interfaces are collected, they are submerged in incubation tanks and kept under aerobic conditions at in situ temperatures. To initiate a time course of overlying water chemistry, cores are sealed without bubbles using a top cap with a suspended stirrer. Time courses of 4-7 sample points are used to determine the rate of sediment water exchange. Artificial illumination simulates day-time conditions for shallow photosynthetic sediments, and in conjunction with dark incubations can provide net exchanges on a daily basis. The net measurement of N2 is made possible by sampling a time course of dissolved gas concentrations, with high precision mass spectrometric analysis of N2:Ar ratios providing a means to measure N2 concentrations. We have successfully applied this approach to lakes, reservoirs, estuaries, wetlands and storm water ponds, and with care, this approach provides valuable information on biogeochemical balances in aquatic ecosystems.

Choptank Nehri (Chesapeake Körfezi, MD) bir yetiştiricilik tesis yakınında sediman akışı ölçümlerinin sonuçları Şekil 1&#39;de gösterilmiştir ve bir ekosistem bağlamında bu sonuçların yorumlanması başka yerde 26 sunulmuştur. inkübasyonlar ışıklı inkübasyonlar verileri, ardından, koyu inkubasyon ile 7 saat boyunca gerçekleştirilmiştir. İki çekirdek elde edilen veriler de su sütunu yalnızca kontrol olarak gösterilir. Karanlıkta oksijen hızlı düşüş yanması ile biraz zayıflatılmış edildi; Mikroalg üretim fotosentez hızı oksijen değişim azalma oranı olan aydınlatma ana etkisi ile, solunum gibi yüksek değildi. Kontrol çekirdek ışığında karanlık ve küçük artışlar oksijen konsantrasyonu küçük düşüşler yaşadı. Ar, oranı ve: N2 konsantrasyonları N2 ile belirlendiGözlenen sıcaklık ve tuzluluk 27 hesaplanan Ar doygunluk edebiyat değerleri. N2 0.02% tipik bir hassasiyet Ar oranı, bu veriler ~ 0.1 umol L-1 N2 kesindir. Sediment çekirdekleri ve su sütunu boş çekirdek çekirdek için artış çok daha yüksek oranları ile, zamanla N2 artış vardı. Aydınlatma altında, yamaçları N2 değişim karanlık oranına genellikle benzerdir. Çözünmüş NH 4 + ve akıları&gt; 20 umol L karanlık artış -1 tek çekirdek için olan bu sitede oldukça yüksek. Işıklı NH 4 + akıları çok düşüktü. Her iki çekirdek ve su sütunu boş YOK x azalan vardı - konsantrasyon zamanla, aydınlatma sırasında tesviye. flux hepsi için, çekirdek hacmi ve diğer ilgili parametrelere konsantrasyonu verileri ve veri gösterilmektedir <st<html> Rong&gt; Tablo 1 ve 2. <img alt="Şekil 1" src="/files/ftp_upload/54098/54098fig1.jpg" /> Şekil kültürlü istiridye içeren yüzen ile kaplıydı Choptank Nehri sığ su sitesinden 1. Zaman ders veri. Veri çoğaltmak çekirdeklerin (A ve B) ve bir su sütunu boş verilerle vardır gösterilir. Oksijen N2 konsantrasyonları, NH 4 + ve NO x - (NO 3 toplamı - ve NO 2 - inkübasyon (gölgeli alanda karanlık kısmı hem sunulmuştur) ve inkübasyon aydınlatılmış kısmı için dördüncü kez. karanlık inkübasyon noktası da ışıklı zaman serilerinin ilk kez noktasıdır;. ışıklar hatları lineer regresyon olan örnekleme zamanında açık ve eğimler Tablo 1&#39;de sunulmuştur.98 / 54098fig1large.jpg &quot;target =&quot; _ blank &quot;&gt; bu rakamın daha büyük bir versiyonunu görmek için lütfen buraya tıklayınız. <table fo:keep-together.within-page="1"><tbody><tr><td fo:width="1.8in" style="width:220px"> Oksijen - Koyu </td><td> Süresi (saat) </td><td> çekirdek A </td><td> çekirdek B </td><td> Kontrol </td></tr><tr><td></td><td> 0 </td><td> 235,1 </td><td> 221,7 </td><td> 235,2 </td></tr><tr><td></td><td> 1.3 </td><td> 204,3 </td><td> 170.6 </td><td> 235,3 </td></tr><tr><td></td><td> 2.32 </td><td> 162.7 </td><td> 138.9 </td><td> 232 </td></tr><tr><td></td><td> 3.97 </td><td> 145.3 </td><td> 77.9 </td><td> 222,2 </td></tr><tr><td> R2 </td><td></td><td> 0,943 </td><td> 0.999 </td><td> 0.836 </td></tr><tr><td> Yamaç (mmol L-1 sa-1) </td><td></td><td> -23,5 </td><td> -35,9 </td><td> -3.4 </td></tr><tr><td> Düzeltilmiş Yamaç (ľmol L -1 sa -1) </td><td></td><td> -20,1 </td><td> -32,5 </td><td></td></tr><tr><td> Oranı (ľmol m -2 saat -1) </td><td></td><td> -3095 </td><td> -4875 </td><td></td></tr><tr><td> Oksijen - Işık </td><td> Süresi (saat) </td><td> çekirdek A </td><td> çekirdek B </td><td> Kontrol </td></tr><tr><td></td><td> 3.97 </td><td> 145.3 </td><td> 77.9 </td><td> 222,2 </td></tr><tr><td></td><td> 4.88 </td><td> 133.5 </td><td> 68.8 </td><td> 224,3 </td></tr><tr><td></td><td> 5.88 </td><td> 122.8 </td><td> 40.3 </td><td> 221,6 </td></tr><tr><td></td><td> 6.88 </td><td> 116 </td><td> 49.2 </td><td> 230,5 </td></tr><tr><td> R2 </td><td></td><td> 0,981 </td><td> 0.999 </td><td> 0.994 </td></tr><tr><td> Yamaç (mmol L-1 sa-1) </td><td></td><td> -10,1 </td><td> -9.8 </td><td> 2.9 </td></tr><tr><td> Düzeltilmiş Yamaç (ľmol L -1 sa -1) </td><td></td><td> -13 </td><td> -12,7 </td><td></td></tr><tr><td> Oranı (ľmol m -2 saat -1) </td><td></td><td> -2000 </td><td> -1905 </td><td></td></tr><tr><td> N 2 - Karanlık </td><td> Süresi (saat) </td><td> çekirdek A </td><td> çekirdek B </td><td> Kontrol </td></tr><tr><td></td><td> 0 </td><td> 466,46 </td><td> 466,40 </td><td> 466,62 </td></tr><tr><td></td><td> 1.3 </td><td> 466,74 </td><td> 467,49 </td><td> 466,11 </td></tr><tr><td></td><td> 2.32 </td><td> 467,55 </td><td> 468,18 </td><td> 466,74 </td></tr><tr><td&gt; </td><td> 3.97 </td><td> 468,24 </td><td> 468,98 </td><td> 467,12 </td></tr><tr><td> R2 </td><td></td><td> 0.963 </td><td> 0.98 </td><td> 0.854 </td></tr><tr><td> Yamaç N2 (ľmol L -1 sa -1) </td><td></td><td> 0.471 </td><td> 0.645 </td><td> 0.12 </td></tr><tr><td> Düzeltilmiş Yamaç N2 (ľmol L -1 sa -1) </td><td></td><td> 0.351 </td><td> 0.525 </td><td></td></tr><tr><td> Puan N 2 N (ľmol m -2 saat -1) </td><td></td><td> 108.1 </td><td> 157.5 </td><td></td></tr><tr><td> N2 - Işık </td><td> Süresi (saat) </td><td> çekirdek A </td><td> çekirdek B </td><td> Kontrol </td></tr><tr><td></td><td> 3.97 </td><td> 468,24 </td><td> 468,98 </td><td> 467,12 </td></tr><tr><td></td><td> 4.88 </td><td> 468,84 </td><td> 469,21 </td><td> 467,26 </td></tr><tr><td></td><td> 5.88 </td><td> 469,39 </td><td> 469,71 </td><td> 467,47 </td></tr><tr><td></td><td> 6.88 </td><td> 469,62 </td><td> 470,04 </td><td> 467,41 </td></tr><tr><td> R2 </td><td></td><td> 0.96 </td><td> 0.987 </td><td> 0,967 </td></tr><tr><td> Yamaç N2 (ľmol L -1 sa -1) </td><td></td><td> 0.481 </td><td> 0.378 </td><td> 0.096 </td></tr><tr><td> Düzeltilmiş Yamaç N2 (ľmol L -1 sa -1) </td><td></td><td> 0.386 </td><td> 0.282 </td><td></td></tr><tr><td> Puan N 2 N (ľmol m -2 saat -1) </td><td></td><td> 118.9 </td><td> 84.6 </td><td></td></tr><tr><td> Çekirdek Yüzey Alanı (m2) </td><td></td><td> 0.003165 </td><td> 0.003165 </td><td></td></tr&gt; <tr><td> Çekirdek Hacmi (L) </td><td></td><td> 0,4874 </td><td> 0,4747 </td><td></td></tr></tbody></table> . Ar ve N2: Choptank Nehri, Chesapeake Körfezi bir subestuary istiridye yetiştiricilik yüzen altında Tortul O 2 ve N 2 Tablo 1. Zaman ders veri gaz konsantrasyonları O 2 türetilen Ar oranları membran girişi ile belirlenen kütle spektrometrisi. Zaman ders regresyon R 2 değerleri değerleri&gt; 0,9025 (P &lt;0.05) açısından önem taşımaktadır. Eğimler doğrusal regresyon ile belirlenir ve düzeltilmiş pistleri sadece boş su sütununun değişim oranını çıkarılarak belirlenir. Pozitif oranları tortu dışında net flux vardır, negatif oranları sediment içine akı göstermektedir. N2 akışı verileri iştigal hale N2 N olarak ifade edilmiştirrison NH 4 + ve NO x - kolay akıları. Bu site çökelleri öncelikle tamamen aerobik su kolonu koşulları ile silt ve kil oluşan vardı. Çekirdek alanı 31.65 cm -2 ve su kolonu derinliği Tüm N2 için konsantrasyonları ve O 2 ľmol L olan 15.4 çekirdek A cm ve çekirdek B için 15.0 idi -1. N2 akı için nihai kuru N2 -N ifade edilir. <table fo:keep-together.within-page="1"><tbody><tr><td fo:width="1.8in" style="width:220px"> NH 4 + - Koyu </td><td> Süresi (saat) </td><td> çekirdek A </td><td> çekirdek B </td><td> Kontrol </td></tr><tr><td></td><td> 0 </td><td> 10.84 </td><td> 14.09 </td><td> 6.91 </td></tr><tr><td></td><td> 1.3 </td><td> 16.19 </td><td> 20.26 </td><td> 5.83 </td></tr><tr><td></td><td> 2.32 </td><td> 17.07 </td><td> 24.93 </td><td> 5.42 </td></tr><tr><td></td><td> 3.97 </td><td> 22.83 </td><td> 35.43 </td><td> 4.67 </td></tr><tr><td> R2 </td><td></td><td> 0,968 </td><td> 0,993 </td><td> 0.853 </td></tr><tr><td> Yamaç (mmol L-1 sa-1) </td><td></td><td> 2.88 </td><td> 5.36 </td><td> -0.53 </td></tr><tr><td> Düzeltilmiş Yamaç (ľmol L -1 sa -1) </td><td></td><td> 3.41 </td><td> 5.89 </td><td></td></tr><tr><td> Oranı (ľmol m -2 saat -1) </td><td></td><td> 525 </td><td> 884 </td><td></td></tr><tr><td> NH4 + - Işık </td><td> Süresi (saat) </td><td> çekirdek A </td><td> çekirdek B </td><td> Kontrol </td></tr><tr><td></td><td> 3.97 </td><td> 22.83 </td&gt; <td> 35.43 </td><td> 4.67 </td></tr><tr><td></td><td> 4.88 </td><td> 24.05 </td><td> 36.45 </td><td> 4.13 </td></tr><tr><td></td><td> 5.88 </td><td> 25.00 </td><td> 37,60 </td><td> 3.79 </td></tr><tr><td></td><td> 6.88 </td><td> 26.96 </td><td></td><td></td></tr><tr><td> R2 </td><td></td><td> 0,978 </td><td> 1 </td><td> 0,966 </td></tr><tr><td> Yamaç (mmol L-1 sa-1) </td><td></td><td> 1.37 </td><td> 1.13 </td><td> -0,55 </td></tr><tr><td> Düzeltilmiş Yamaç (ľmol L -1 sa -1) </td><td></td><td> 1.92 </td><td> 1.68 </td><td></td></tr><tr><td> Oranı (ľmol m -2 saat -1) </td><td></td><td> 296 </td><td> 252 </td><td></td></tr><tr><td> NO x - - Koyu </td><td> Süresi (saat) </td><td> çekirdek A </td><td> çekirdek B </td><td> Kontrol </td></tr><tr><td></td><td> 0 </td><td> 4.12 </td><td> 4.01 </td><td> 4.53 </td></tr><tr><td></td><td> 1.3 </td><td> 3.82 </td><td> 3.58 </td><td> 4.43 </td></tr><tr><td></td><td> 2.32 </td><td> 3.70 </td><td> 3.25 </td><td> 4.28 </td></tr><tr><td></td><td> 3.97 </td><td> 3.19 </td><td> 2.64 </td><td> 4.19 </td></tr><tr><td> R2 </td><td></td><td> 0.976 </td><td> 0.992 </td><td> 0,967 </td></tr><tr><td> Yamaç (mmol L-1 sa-1) </td><td></td><td> -0,229 </td><td> -0,345 </td><td> -0,089 </td></tr><tr><td> Düzeltilmiş Yamaç (ľmol L -1 sa -1) </td><td></td><td> -0.14 </td><td> -0,256 </td><td></td></tr><tr><td> Oranı (ľmol m -2 saat -1) </td><td></td><td> -21,6 </td><td> -38,4 </td><td></td></tr><tr><td> NO x - - Işık </td><td> Süresi (saat) </td><td> çekirdek A </td><td> çekirdek B </td><td> Kontrol </td></tr><tr><td></td><td> 3.97 </td><td> 3.19 </td><td> 2.64 </td><td> 4.19 </td></tr><tr><td></td><td> 4.88 </td><td> 3.06 </td><td> 2.59 </td><td> 4.06 </td></tr><tr><td></td><td> 5.88 </td><td> 3.18 </td><td> 2.41 </td><td> 4.02 </td></tr><tr><td></td><td> 6.88 </td><td> 2.95 </td><td> 2.35 </td><td> 4.2 </td></tr><tr><td> R2 </td><td></td><td> 0,934 </td><td> 0.909 </td><td> 0.9 </td></tr><tr><td> Yamaç (mmol L-1 sa-1) </td><td></td><td> -0,078 </td><td> -0,103 </td><td> 0 </td></tr><tr><td> Düzeltilmiş Yamaç (ľmol L -1 sa -1) </td><td></td><td> -0,078 </td><td> -0,103 </td><td></td></tr><tr><td> Oranı (ľmol m -2 saat -1) </td><td></td><td> -12 </td><td> -15,5 </td><td></td></tr><tr><td> Çekirdek Yüzey Alanı (m2) </td><td></td><td> 0.003165 </td><td> 0.003165 </td><td></td></tr><tr><td> Çekirdek Hacmi (L) </td><td></td><td> 0,4874 </td><td> 0,4747 </td><td></td></tr></tbody></table> NH 4 + ve NO x Tablo 2. Zaman kurs verileri - Tablo 1&#39;de zamanlı ders regresyon R için kullanılan aynı sediment çekirdeklerinden 2 değerleri değerleri&gt; 0,9025 (P &lt;0.05) açısından önem taşımaktadır. Eğimler doğrusal regresyon ile belirlenir ve düzeltilmiş pistleri sadece boş su sütununun değişim oranını çıkarılarak belirlenir. Pozitif oranlarının net tozları vardırsediment üzerinden, negatif oranları sediment içine akı göstermektedir. NH 4 + ve NO 2 için tüm konsantrasyonlar - ľmol L -1.

Watch this Scientific Journal Video about The Benthic Exchange of O2, N2 and Dissolved Nutrients Using Small Core Incubations at JoVE.com

The Benthic Exchange of O2, N2 and Dissolved Nutrients Using Small Core Incubations

Here, we present small core incubations for the measurement of sediment-water gas and solute exchange. These will provide reliable measurements of sediment-water exchange that assess the role of sediment in influencing biological and biogeochemical processes in aquatic ecosystems.

O Bentik Değişim<sub&gt; 2</sub&gt; K<sub&gt; 2</subKüçük Çekirdek KUluçkalar Kullanma&gt; ve Çözünmüş Besinler

The measurement of sediment-water exchange of gases and solutes in aquatic sediments provides data valuable for understanding the role of sediments in ...

the-benthic-exchange-o2-n2-dissolved-nutrients-using-small-core

Nanyang Technological University

Research

JoVE Journal

Environment

The Benthic Exchange of O2, N2 and Dissolved Nutrients Using Small Core Incubations

9.5K Görüntüleme.  University of Maryland Center for Environmental Science. Here, we present small core incubations for the measurement of sediment-water gas and solute exchange. These will provide reliable measurements of sediment-water exchange that assess the role of sediment in influencing biological and biogeochemical processes in aquatic ecosystems. 

Video: The Benthic Exchange of O2, N2 and Dissolved Nutrients Using Small Core Incubations

Measuring Fluxes of Mineral Nutrients and Toxicants in Plants with Radioactive Tracers

Unidirectional influx and efflux of nutrients and toxicants, and their resultant net fluxes, are central to the nutrition and toxicology of plants. Radioisotope tracing is a major technique used to measure such fluxes, both within plants, and between plants and their environments. Flux data obtained with radiotracer protocols can help elucidate the capacity, mechanism, regulation, and energetics of transport systems for specific mineral nutrients or toxicants, and can provide insight into compartmentation and turnover rates of subcellular mineral and metabolite pools. Here, we describe two major radioisotope protocols used in plant biology: direct influx (DI) and compartmental analysis by tracer efflux (CATE). We focus on flux measurement of potassium (K+) as a nutrient, and ammonia/ammonium (NH3/NH4+) as a toxicant, in intact seedlings of the model species barley (Hordeum vulgare L.). These protocols can be readily adapted to other experimental systems (e.g., different species, excised plant material, and other nutrients/toxicants). Advantages and limitations of these protocols are discussed.

In planta measurement of nutrient and toxicant fluxes is essential to the study of plant nutrition and toxicity. Here, we cover radiotracer protocols for influx and efflux determination in intact plant roots, using potassium (K+) and ammonia/ammonium (NH3/NH4+) fluxes as examples. Advantages and limitations of such techniques are discussed.

Radyoaktif izleyiciler ile Bitkilerde Mineral Besin ve Toksikantların Değişimler Ölçme

Unidirectional influx and efflux of nutrients and toxicants, and their resultant net fluxes, are central to the nutrition and toxicology of plants. ...

Çevre

Sediment Core Sectioning and Extraction of Pore Waters under Anoxic Conditions

We demonstrate a method for sectioning sediment cores and extracting pore waters while maintaining oxygen-free conditions. A simple, inexpensive system is built and can be transported to a temporary work space close to field sampling site(s) to facilitate rapid analysis. Cores are extruded into a portable glove bag, where they are sectioned and each 1-3 cm thick section (depending on core diameter) is sealed into 50 ml centrifuge tubes. Pore waters are separated with centrifugation outside of the glove bag and then returned to the glove bag for separation from the sediment. These extracted pore water samples can be analyzed immediately. Immediate analyses of redox sensitive species, such as sulfide, iron speciation, and arsenic speciation indicate that oxidation of pore waters is minimal; some samples show approximately 100% of the reduced species, e.g. 100% Fe(II) with no detectable Fe(III). Both sediment and pore water samples can be preserved to maintain chemical species for further analysis upon return to the laboratory.

A protocol for sectioning sediment cores and extracting pore waters under anoxic conditions in order to permit analysis of redox sensitive species in both solids and fluids is presented.

Anoksik Koşullarında Tortu Çekirdek Kesit ve Gözenek Waters Ekstraksiyon

We demonstrate a method for sectioning sediment cores and extracting pore waters while maintaining oxygen-free conditions. A simple, inexpensive system is ...

A Protocol for Collecting and Constructing Soil Core Lysimeters

Leaching of nutrients from land applied fertilizers and manure used in agriculture can lead to accelerated eutrophication of surface water. Because the landscape has complex and varied soil morphology, an accompanying disparity in flow paths for leachate through the soil macropore and matrix structure is present. The rate of flow through these paths is further affected by antecedent soil moisture. Lysimeters are used to quantify flow rate, volume of water and concentration of nutrients leaching downward through soils. While many lysimeter designs exist, accurately determining the volume of water and mass balance of nutrients is best accomplished with bounded lysimeters that leave the natural soil structure intact. 
Here we present a detailed method for the extraction and construction of soil core lysimeters equipped with soil moisture sensors at 5 cm and 25 cm depths. Lysimeters from four different Coastal Plain soils (Bojac, Evesboro, Quindocqua and Sassafras) were collected on the Delmarva Peninsula and moved to an indoor climate controlled facility. Soils were irrigated once weekly with the equivalent of 2 cm of rainfall to draw down soil nitrate-N concentrations. At the end of the draw down period, poultry litter was applied (162 kg TN ha-1) and leaching was resumed for an additional five weeks. Total recovery of applied irrigation water varied from 71% to 85%. Nitrate-N concentration varied over the course of the study from an average of 27.1 mg L-1 before litter application to 40.3 mg L-1 following litter application. While greatest flux of nutrients was measured in soils dominated by coarse sand (Sassafras) the greatest immediate flux occurred from the finest textured soil with pronounced macropore development (Quindocqua).

A detailed method for extraction and assembly of intact soil core lysimeters and their use for study of leachate and associated loss of nutrients from surface applied poultry litter is demonstrated.

Toprak Çekirdek lizimetereleri Toplama ve oluşturulması için bir protokol

Leaching of nutrients from land applied fertilizers and manure used in agriculture can lead to accelerated eutrophication of surface water. Because the ...

VacuSIP, an Improved InEx Method for In Situ Measurement of Particulate and Dissolved Compounds Processed by Active Suspension Feeders

Benthic suspension feeders play essential roles in the functioning of marine ecosystems. By filtering large volumes of water, removing plankton and detritus, and excreting particulate and dissolved compounds, they serve as important agents for benthic-pelagic coupling. Accurately measuring the compounds removed and excreted by suspension feeders (such as sponges, ascidians, polychaetes, bivalves) is crucial for the study of their physiology, metabolism, and feeding ecology, and is fundamental to determine the ecological relevance of the nutrient fluxes mediated by these organisms. However, the assessment of the rate by which suspension feeders process particulate and dissolved compounds in nature is restricted by the limitations of the currently available methodologies. Our goal was to develop a simple, reliable, and non-intrusive method that would allow clean and controlled water sampling from a specific point, such as the excurrent aperture of benthic suspension feeders, in situ. Our method allows simultaneous sampling of inhaled and exhaled water of the studied organism by using minute tubes installed on a custom-built manipulator device and carefully positioned inside the exhalant orifice of the sampled organism. Piercing a septum on the collecting vessel with a syringe needle attached to the distal end of each tube allows the external pressure to slowly force the sampled water into the vessel through the sampling tube. The slow and controlled sampling rate allows integrating the inherent patchiness in the water while ensuring contamination free sampling. We provide recommendations for the most suitable filtering devices, collection vessel, and storing procedures for the analyses of different particulate and dissolved compounds. The VacuSIP system offers a reliable method for the quantification of undisturbed suspension feeder metabolism in natural conditions that is cheap and easy to learn and apply to assess the physiology and functional role of filter feeders in different ecosystems.

VacuSIP, an Improved InEx Method for In Situ Measurement of Particulate and Dissolved Compounds Processed by Active Suspension Feeders

We introduce the VacuSIP, a simple, non-intrusive, and reliable method for clean and accurate point sampling of water. The system was developed and evaluated for the simultaneous collection of the water inhaled and exhaled by benthic suspension feeders in situ, to cleanly measure removal and excretion of particulate and dissolved compounds.

VacuSIP, bir Geliştirilmiş INEX Yöntemi için<em&gt; In Situ</em&gt; Partikül Ölçümü ve Çözünmüş bileşikler Aktif Süspansiyon besleme üniteleri İşlenmiş

Benthic suspension feeders play essential roles in the functioning of marine ecosystems. By filtering large volumes of water, removing plankton and ...

A Simple Approach to Manipulate Dissolved Oxygen for Animal Behavior Observations

The ability to manipulate dissolved oxygen (DO) in a laboratory setting has significant application to investigate a number of ecological and organismal behavior questions. The protocol described here provides a simple, reproducible, and controlled method to manipulate DO to study behavioral response in aquatic organisms resulting from hypoxic and anoxic conditions. While performing degasification of water with nitrogen is commonly used in laboratory settings, no explicit method for ecological (aquatic) application exists in the literature, and this protocol is the first to describe a protocol to degasify water to observe organismal response. This technique and protocol were developed for direct application for aquatic macroinvertebrates; however, small fish, amphibians, and other aquatic vertebrates could be easily substituted. It allows for easy manipulation of DO levels ranging from 2 mg/L to 11 mg/L with stability for up to a 5 min animal-observation period. Beyond a 5 min observation period water temperatures began to rise, and at 10 min DO levels became too unstable to maintain. The protocol is scalable to the study organism, reproducible, and reliable, allowing for rapid implementation into introductory teaching labs and high-level research applications. The expected results of this technique should relate dissolved oxygen changes to behavioral responses of organisms.

This article describes a simple and reproducible protocol to manipulate dissolved oxygen conditions in a laboratory setting for animal behavior studies. This protocol may be used in both teaching and research laboratory settings to evaluate organismal response of macroinvertebrates, fishes, or amphibians to changes in dissolved oxygen concentration.

Basit Yaklaşım Hayvan Davranışı Gözlemleri Çözünmüş Oksijen işlemek için

The ability to manipulate dissolved oxygen (DO) in a laboratory setting has significant application to investigate a number of ecological and organismal ...

Understanding Dissolved Organic Matter Biogeochemistry Through In Situ Nutrient Manipulations in Stream Ecosystems

Dissolved organic matter (DOM) is a highly diverse mixture of molecules providing one of the largest sources of energy and nutrients to stream ecosystems. Yet the in situ study of DOM is difficult as the molecular complexity of the DOM pool cannot be easily reproduced for experimental purposes. Nutrient additions to streams however, have been shown to repeatedly alter the in situ and ambient DOM pool. Here we demonstrate an easily replicable field-based method for manipulating the ambient pool of DOM at the ecosystem scale. During nutrient pulse experiments changes in the concentration of both dissolved organic carbon and dissolved organic nitrogen can be examined across a wide-range of nutrient concentrations. This method allows researchers to examine the controls on the DOM pool and make inferences regarding the role and function that certain fractions of the DOM pool play within ecosystems. We advocate the use of this method as a technique to help develop a deeper understanding of DOM biogeochemistry and how it interacts with nutrients. With further development this method may help elucidate the dynamics of DOM in other ecosystems.

Understanding Dissolved Organic Matter Biogeochemistry Through In Situ Nutrient Manipulations in Stream Ecosystems

Dissolved organic matter provides an important source of energy and nutrients to stream ecosystems. Here we demonstrate a field-based method to manipulate the ambient pool of dissolved organic matter in situ through easily replicable nutrient pulses.

Sayesinde Organik Madde biyojeokimya Çözünmüş Anlamak<em&gt; In Situ</em&gt; Akış Ekosistemlerde Besin manipülasyonları

Dissolved organic matter (DOM) is a highly diverse mixture of molecules providing one of the largest sources of energy and nutrients to stream ecosystems. ...

Continuous Instream Monitoring of Nutrients and Sediment in Agricultural Watersheds

Pollutant concentrations and loads in watersheds vary considerably with time and space. Accurate and timely information on the magnitude of pollutants in water resources is a prerequisite for understanding the drivers of the pollutant loads and for making informed water resource management decisions. The commonly used &#34;grab sampling&#34; method provides the concentrations of pollutants at the time of sampling (i.e., a snapshot concentration) and may under- or overpredict the pollutant concentrations and loads. Continuous monitoring of nutrients and sediment has recently received more attention due to advances in computing, sensing technology, and storage devices. This protocol demonstrates the use of sensors, sondes, and instrumentation to continuously monitor in situ nitrate, ammonium, turbidity, pH, conductivity, temperature, and dissolved oxygen (DO) and to calculate the loads from two streams (ditches) in two agricultural watersheds. With the proper calibration, maintenance, and operation of sensors and sondes, good water quality data can be obtained by overcoming challenging conditions such as fouling and debris buildup. The method can also be used in watersheds of various sizes and characterized by agricultural, forested, and/or urban land.

With the advancement of technology and the rise in end-user expectations, the need and use of higher temporal resolution data for pollutant load estimation has increased. This protocol describes a method for continuous in situ water quality monitoring to obtain higher temporal resolution data for informed water resource management decisions.

Besin ve tortu tarım havza içinde sürekli Instream izleme

Pollutant concentrations and loads in watersheds vary considerably with time and space. Accurate and timely information on the magnitude of pollutants in ...

Measuring the Flight Ability of the Ambrosia Beetle, Platypus Quercivorus (Murayama), Using a Low-Cost, Small, and Easily Constructed Flight Mill

The ambrosia beetle, Platypus quercivorus (Murayama), is the vector of a fungal pathogen that causes mass mortality of Fagaceae trees (Japanese oak wilt). Therefore, knowing the dispersal capacity may help inform trapping/tree removal efforts to prevent this disease more effectively. In this study, we measured the flight velocity and duration and estimated the flight distance of the beetle using a newly developed flight mill. The flight mill is low cost, small, and constructed using commonly available items. Both the flight mill arm and its vertical axis comprise a thin needle. A beetle specimen is glued to one tip of the arm using instant glue. The other tip is thick due to being covered with plastic, thus it facilitates the detection of rotations of the arm. The revolution of the arm is detected by a photo sensor mounted on an infrared LED, and is indicated by a change in the output voltage when the arm passed above the LED. The photo sensor is connected to a personal computer and the output voltage data are stored at a sampling rate of 1 kHz. By conducting experiments using this flight mill, we found that P. quercivorus can fly at least 27 km. Because our flight mill comprises cheap and small ordinary items, many flight mills can be prepared and used simultaneously in a small laboratory space. This enables experimenters to obtain a sufficient amount of data within a short period.

Measuring the Flight Ability of the Ambrosia Beetle, Platypus Quercivorus Murayama, Using a Low-Cost, Small, and Easily Constructed Flight Mill

We developed a low cost and small flight mill, constructed with commonly available items and easily used in experimentation. Using this apparatus, we measured the flight ability of an ambrosia beetle, Platypus quercivorus.

Ambrosia Beetle, Platypus Quercivorus (Murayama), ucuz, küçük ve kolayca inşa uçuş Mill kullanarak uçuş yeteneği ölçme

The ambrosia beetle, Platypus quercivorus (Murayama), is the vector of a fungal pathogen that causes mass mortality of Fagaceae trees (Japanese oak wilt). ...

Methods for Image-based Surveys of Benthic Macroinvertebrates and Their Habitat Exemplified by the Drop Camera Survey for the Atlantic Sea Scallop

Underwater imaging has long been used in the field of marine ecology but decreasing costs of high-resolution cameras and data storage have made the approach more practical than in the past. Image-based surveys allow for initial samples to be revisited and are non-invasive compared to traditional survey methods that typically involve nets or dredges. Protocols for image-based surveys can vary greatly but should be driven by target species behavior and survey objectives. To demonstrate this, we describe our most recent methods for an Atlantic sea scallop (Placopecten magellanicus) drop camera survey to provide a procedural example and representative results. The procedure is divided into three critical steps that include survey design, data collection, and data products. The influence of scallop behavior and the survey goal of providing an independent assessment of the U.S. sea scallop resource on the survey procedure are then discussed in the context of generalizing the method. Overall, the broad applicability and flexibility of the University of Massachusetts Dartmouth School for Marine Science and Technology (SMAST) drop camera survey demonstrates the method could be generalized and applied to a variety of sessile invertebrates or habitat focused research.

Image based surveying is an increasingly practical, non-invasive method to sample the marine environment. We present the protocol of a drop camera survey that estimates the abundance and distribution of the Atlantic sea scallop (Placopecten magellanicus). We discuss how this protocol can be generalized for application to other benthic macroinvertebrates.

Yansıma tabanlı anketler bentik Macroinvertebrates ve onların oturmaya elverişli için Atlantik deniz tarak tarafından açılan kamera anket örneği için yöntemleri

Underwater imaging has long been used in the field of marine ecology but decreasing costs of high-resolution cameras and data storage have made the ...

Detection of Viruses from Bioaerosols Using Anion Exchange Resin

This protocol demonstrates a customized bioaerosol sampling method for viruses. In this system, anion exchange resin is coupled with liquid impingement-based air sampling devices for efficacious concentration of negatively-charged viruses from bioaerosols. Thus, the resin serves as an additional concentration step in the bioaerosol sampling workflow. Nucleic acid extraction of the viral particles is then performed directly from the anion exchange resin, with the resulting sample suitable for molecular analyses. Further, this protocol describes a custom-built bioaerosol chamber capable of generating virus-laden bioaerosols under a variety of environmental conditions and allowing for continuous monitoring of environmental variables such as temperature, humidity, wind speed, and aerosol mass concentration. The main advantage of using this protocol is increased sensitivity of viral detection, as assessed via direct comparison to an unmodified conventional liquid impinger. Other advantages include the potential to concentrate diverse negatively-charged viruses, the low cost of anion exchange resin (~$0.14 per sample), and ease of use. Disadvantages include the inability of this protocol to assess infectivity of resin-adsorbed viral particles, and potentially the need for the optimization of the liquid sampling buffer used within the impinger.

An anion exchange resin-based method, adapted to liquid impingement-based bioaerosol sampling of viruses is demonstrated. When coupled with downstream molecular detection, the method allows for facile and sensitive detection of viruses from bioaerosols.