Bu sistemin oluşturulması 5RO1MH77027 tarafından desteklenmiştir.

TSsystem içinde üç tam otomatik protokolleri (eşleştirme, enstrümantal ve klasik koşullanma iştahlı) ve anahtar protokol Rutgers New Brunswick de Hayvan Bakım ve Tesisler Komitesi tarafından onaylanmıştır. 1.. Fiziksel Sistemini Kurmak <ol><li> Dolapları ortamlarda test ayarlama (bkz. Şekil 1). </li><li> Protokol kontrol bilgisayarlarda test ortamlarında sağlanan deney-kontrol yazılımı yükleyin. Not: başka bir amaçla bu bilgisayarları kullanmayın! </li></ol> 2. Yazılım Sistem Kurma <ol><li> Veri analiz yazılımı yüklü olduğu sunucu (bkz. Şekil 1) test ortamları kontrol bilgisayar (lar) sabit diskleri erişebilirsiniz böylece LAN (yerel ağ) kurmak. </li><li> &quot;Bulut&quot; veri depolama için bir dosya eşitleme hesabı kurmak. </li><li> PuBir bulut-klasör senkronize ticari programlama dilinin arama yolunda TSsystem klasör ve alt klasörleri t. Not: TSsystem bir yazılım araç olduğunu, yani onun tarafından oluşturulan çıktı dosyalarına hasat olduğunda otomatik olarak verileri işler karmaşık veri analizi ve veri-grafik kod oluşturulmasını kolaylaştıracaktır 30 üzerinden yüksek düzey işlevleri bir kütüphane Deney-kontrol programı. Tüm komutlar Deney yapının alanlarda veri üzerinde işlem ve (bakınız Şekil 2) ile aynı yapıda, diğer alanlardaki sonuçları koydu. Bu açık kaynak komutları en yaygın kullanılan ticari, bilimsel programlama ve grafik dillerinden birinde yazılmış. Bu en yararlı bir istatistik araç kutusu dahil olmak üzere birçok diğer &quot;avadanlıklarını&quot; vardır. </li></ol> 3. Deneme başlangıç <ol><li> (Bkz. Şekil 3) TSbegin arayın. Not: TSbegin bir entegrasyon olduğunuTSsystem araç kutusunda ractive GUI (I nterface G raphic U ser). Ondan türetilen ham veriler ve tüm sonuçlar TSsystem araç kutusundaki diğer fonksiyonlar tarafından alınacaktır içine hiyerarşik veri yapısını oluşturma sürecinde kullanıcıyı açar. </li><li> (Bkz. Şekil 4) TSaddprotocol arayın. Not: TSaddprotocol TSsystem araç kutusunda bir GUI. Bu protokolü feshetme ve bir sonrakine gitmek için kararını otomatik olacak bu karar kodu belirtilerek, ve kullanılacak karar kriterlerini belirterek, deneysel bir protokol için kontrol parametrelerini belirleme sürecinde kullanıcıyı açar. </li><li> 7/24 canlı-test ortamlarında, çevre başına bir fare fareler yerleştirin. Notlar: numaralı deneysel ortamlarda (vb Kutu 1, Kutu 2) Her gider fare kimlik numarasını not dikkat edin. Ayrıca, deney-kontrol tanımlayan harfini notYerel Alan Ağı (LAN) ve IP adresi bilgisayar. </li><li> (Şekil 5) TSstartsession arayın. Not: TSstartsession TSsystem araç kutusunda bir GUI. Bu deneysel bir oturumu başlangıç ​​sürecinde kullanıcıyı açar. Deney oturumları, birkaç farklı davranış test protokolleri çalıştırılır sırasında bir ya da iki haftada bir, son. TSstartsession mağazalar oturumu başladığında protokol kontrol yazılımı okur makro gider bilgileri. Dahil yolunu ve protokol kontrol yazılımı okur kod dosyasının adıdır. TSsystem analitik yazılımı hiyerarşik veri yapısı içine bu kodu okur, bu yüzden herhangi bir zamanda yürürlükte kesin protokole olarak şüphe yoktur asla. </li><li> Kontrol bilgisayarlara gidin ve o bilgisayar tarafından kontrol kutuları için oturumu başlatmak için, MedPC klasöre yazılır makro çağırmak. </li></ol> 4. Veri Analizi <ol><li> Eğer yeni bir protokol oluşturduk varsa, büyük ölçüde karmaşık verilerin oluşturulması analizleri basitleştirmek, hangi TSsystem araç kutusunda komutları kullanarak uygun veri analizi ve grafik kod yazmak. Not: Veri analizi ve sonuçları aşağıda açıklanmıştır TSsystem araç kutusunda dahil üç protokol için grafik kodu. Onlar açık bir kaynak, çünkü onlar irade değiştirilmiş olabilir. Bu analizler için kod yoğun kolay kullanıcı belirtilen protokolleri sonuçları analiz için kod oluşturmak için yapar, yorumladı edilir. </li><li> Deney süresi (birçok hafta 24 saat) için, olası ekipman arızaları (elektrik kesintileri, spontan, kontrol-bilgisayar reboot, pelet besleyici arızaları, vb), TSsystem veri-analiz belirten sunucudan e-posta uyarıları için monitör programı algılar. </li><li> TSsystem yazılı veri-analiz kod inci denir her zaman ürettiği performans araziler EğitimE analiz zamanlayıcı (tipik olarak 2-4 kez / gün). Not: Analiz Zamanlayıcı kullanıcı tarafından belirlenen aralıklarla veri analizi ve grafik programı çağırır. Çağrılan program TSsystem fonksiyonları ile yazılmıştır. Bu hiyerarşik veri yapısı içine protokol kontrol yazılımı yazıyor hangi dosyadan hasat ham verileri okur. Sonra, bu verileri analiz eder ve analizlerin sonuçlarını grafikler. Hiyerarşik veri yapısını içeren dosya bulut bir dosya senkronizasyon klasöründe saklanır. Bu otomatik off-site yedekleme sağlar. Erişim izni olan tüm personel ve işbirlikçilerinin bilgisayarlarda yapı dosyasının otomatik olarak dosya senkronizasyonu kopyalarını depolar. Belirtilen grafikler otomatik olarak belirtilen personelin ve işbirlikçilere-postayla gönderiliyor. Bir okul müdürü araştırmacı herhangi bir zamanda dünyanın her yerinden gelen test ilerlemeyi izlemek ve gerekirse uzaktan oturup gelen, on line, deney protokolü revize olabilire fareler test ediliyor nerede. </li><li> Onlar (bkz. Şekil 2) yarı gerçek zamanlı olarak, kullanılabilir hale gibi hiyerarşik veri yapısında veri ve özet istatistikleri incelemek için TSbrowser kullanın. </li></ol>

<ol>
	<li>Gallistel, C. R., Shizgal, P., Yeomans, J. S. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=A+portrait+of+the+substrate+for+self-stimulation.">A portrait of the substrate for self-stimulation.</a> Psychol. Rev. 88, 228-273 (1981).</li><li>Takahashi, J. S. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Molecular+neurobiology+and+genetics+of+circadian+rhythms+in+mammals.">Molecular neurobiology and genetics of circadian rhythms in mammals.</a> Ann. Rev. Neurosci. 18, 531-553 (1995).</li><li>Mackay, T. F. C., Stone, E. A., Ayroles, J. F. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=The+genetics+of+quantitative+traits:+challenges+and+prospects.">The genetics of quantitative traits: challenges and prospects.</a> 10, 565-577 (2009).</li><li>Weber, J. N., Peterson, B. K., Hoekstra, H. E. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Discrete+genetic+modules+are+responsible+for+complex+burrow+evolution+in+Peromyscus+mice.">Discrete genetic modules are responsible for complex burrow evolution in Peromyscus mice.</a> Nature. 493, 402-405 (2013).</li><li>Balsam, P. D., Drew, M. R., Gallistel, C. R. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Time+and+Associative+Learning.">Time and Associative Learning.</a> Compar. Cogn. Behav. Rev. 5, 1-22 (2010).</li><li>Gallistel, C. R., Gibbon, J. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Psychol+Rev.">Psychol Rev.</a> Psychol Rev. 107, 289-344 (2000).</li><li>Ward, R. D., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Conditional+Stimulus+Informativeness+Governs+Conditioned+Stimulus&#8212;Unconditioned+Stimulus+Associability.">Conditional Stimulus Informativeness Governs Conditioned Stimulus&#8212;Unconditioned Stimulus Associability.</a> J. Exp. Psychol. Animal Behav. Process. 38, 217-232 (2012).</li><li>Gallistel, C. R., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Is+matching+innate.">Is matching innate.</a> J. Exp. Anal. Behav. 87, 161-199 (2007).</li><li>Herrnstein, R. J. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Derivatives+of+matching.">Derivatives of matching.</a> Psychol. Rev. 86, 486-495 (1979).</li><li>Mark, T. A., Gallistel, C. R. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Kinetics+of+matching.">Kinetics of matching.</a> J. Exp. Psychol. Animal Behav. Process. 20, 79-95 (1994).</li><li>Brandeis, R., Brandys, Y., Yehuda, S. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=The+use+of+the+Morris+water+maze+in+the+study+of+memory+and+learning.">The use of the Morris water maze in the study of memory and learning.</a> Int. J. Neurosci. 48, 29-69 (1989).</li><li>Foucaud, J., Burns, J. G., Mery, F. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Use+of+spatial+information+and+search+strategies+in+a+water+maze+analog+in+Drosophila+melanogaster.">Use of spatial information and search strategies in a water maze analog in Drosophila melanogaster.</a> PLoS ONE. 5, (2010).</li><li>Logue, S. F., Paylor, R., Wehner, J. M. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Hippocampal+lesions+cause+learning+deficits+in+inbred+mice+in+the+Morris+water+maze+and+conditioned-fear+task.">Hippocampal lesions cause learning deficits in inbred mice in the Morris water maze and conditioned-fear task.</a> Behav. Neurosci. 111, 104-113 (1997).</li><li>Upchurch, M., Wehner, J. M. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Differences+between+inbred+strains+of+mice+in+Morris+water+maze+performance.">Differences between inbred strains of mice in Morris water maze performance.</a> Behav. Genet. 18, 55-68 (1988).</li><li>Zilles, K., Wu, J., Crusio, W. E., Schwegler, H. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Water+maze+and+radial+maze+learning+and+the+density+of+binding+sites+of+glutamate,+GABA,+and+serotonin+receptors+in+the+hippocampus+of+inbred+mouse+strains.">Water maze and radial maze learning and the density of binding sites of glutamate, GABA, and serotonin receptors in the hippocampus of inbred mouse strains.</a> Hippocampus. 10, 213-225 (2000).</li><li>Chen, G., King, J. A., Burgess, N., O'Keefe, J. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=How+vision+and+movement+combine+in+the+hippocampal+place+code.">How vision and movement combine in the hippocampal place code.</a> Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 110, 378-383 (2013).</li><li>Gallistel, C. R. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=.">.</a> The organization of learning. , (1990).</li><li>Wittlinger, M., Wehner, R., Wolf, H. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=The+desert+ant+odometer:+a+stride+integrator+that+accounts+for+stride+length+and+walking+speed.">The desert ant odometer: a stride integrator that accounts for stride length and walking speed.</a> J. Exp. Biol. 210, (2007).</li><li>Challet, E., Mendoza, J., Dardente, H., Pevet, P. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Neurogenetics+of+food+anticipation.">Neurogenetics of food anticipation.</a> Eur. J. Neurosci. 30, 1676-1687 (2009).</li><li>Arcediano, F., Miller, R. R. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Some+constraints+for+models+of+timing:+A+temporal+coding+hypothesis+perspective.">Some constraints for models of timing: A temporal coding hypothesis perspective.</a> Learn. Mot. 33, 105-123 (2002).</li><li>Denniston, J. C., Blaisdell, A. P., Miller, R. R. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Temporal+Coding+in+Conditioned+Inhibition:+Analysis+of+Associative+Structure+of+Inhibition.">Temporal Coding in Conditioned Inhibition: Analysis of Associative Structure of Inhibition.</a> J. Exp. Psychol. Animal Behav. Process. 30, 190-202 (2004).</li><li>Balci, F., Freestone, D., Gallistel, C. R. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Risk+assessment+in+man+and+mouse.">Risk assessment in man and mouse.</a> Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 106, 2459-2463 (2009).</li><li>Kheifets, A., Gallistel, C. R. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Mice+take+calculated+risks.">Mice take calculated risks.</a> Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 109, 8776-8779 (2012).</li><li>Fetterman, J. G., Killeen, P. R. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Categorical+scaling+of+time:+Implications+for+clock-counter+models.">Categorical scaling of time: Implications for clock-counter models.</a> J. Exp. Psychol. Animal Behav. Process. 21, 43-63 (1995).</li><li>Luby, M., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Food+anticipatory+activity+behavior+of+mice+across+a+wide+range+of+circadian+and+non-circadian+intervals.">Food anticipatory activity behavior of mice across a wide range of circadian and non-circadian intervals.</a> PLoS One. 7, (2012).</li><li>Lee, S. A., Vallortigara, G., Ruga, V., Sovrano, V. A. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Independent+effects+of+geometry+and+landmark+in+a+spontaneous+reorientation+task:+a+study+of+two+species+of+fish.">Independent effects of geometry and landmark in a spontaneous reorientation task: a study of two species of fish.</a> Animal Cogn. 15, 861-870 (2012).</li><li>Rodriguiz, R., Wetsel, W. C., Levin, E. D., Buccafusco, J. J. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=.">.</a> Animal Models of Cognitive Impairment Ch. 12. , (2006).</li><li>Gallistel, C. R., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Fully+Automated+Cognitive+Assessment+of+Mice+Strains+Heterozygous+for+Cell--Adhesion+Genes+Reveals+Strain--Specific+Alterations+in+Timing+Precision.">Fully Automated Cognitive Assessment of Mice Strains Heterozygous for Cell--Adhesion Genes Reveals Strain--Specific Alterations in Timing Precision.</a> Philosoph. Trans. Royal Soc. B. , (2013).</li></ol>

Yazarlar ifşa hiçbir şey yok.

Bizim yöntem, insan emeğinin bir minimum zaman minimum miktarda kerede birçok fareler için biliş, öğrenme ve bellek, birkaç farklı mekanizmalarının işleyişi üzerinde fizyolojik anlamlı, kantitatif sonuçlar geniş bir yelpazede verir ve hiçbir elliyor gün, hafta veya test aylarında deneysel konularda. Bu nitelikler genetik ve farmakolojik tarama programları için uygun. Bu minimal modifiye off-the-raf donanım (test kutuları ve yuva küvetler) kullanır. Bu genetik olarak ve / veya farmakolojik olarak manipüle farelerin bilişsel kapasiteleri test etmek için diğer şu anda kullanılan yöntemlere göre daha az sürede temel biliş daha yönleri üzerinde farelerden daha fazla veri üretir. Bu piyasada mevcut, iyi desteklenen dillerde yazılmış açık kaynak yazılım iki türlü bağlıdır: 1) deneysel protokollerin uygulanması için (Malzeme) test ekipmanları üreticisi tarafından sağlanan bir dil veveri kaydı; 2) bir çevrimiçi açık kaynak araç, TSsystem, yarı-gerçek-zamanlı veri analizi, grafik, ve karar verme. Araç en yaygın kullanılan birinde yazılı ve iyice (Malzeme) özel bilimsel veri analizi ve grafik dilleri desteklenmektedir. Birlikte ham veri ile deneysel protokolleri, ve ham verilerden elde edilen tüm sonuçları yönetilir deney-kontrol kodu, tek bir veri yapısında tutulur çünkü TSsystem araç, açık ve güvenli bir veri izi sağlar. Bu hiyerarşik veri yapısı bu alanın içeriğini göstermektedir ki içinde bir elektronik başlıklarını gibi işlev alan isimler vardır. Bir elektronik başlıklarını farklı olarak, bu veri yapısında alan adları indekslenebilen vardır. Veri özetleme ve grafik komutları, örneğin, başlıklar üzerinden bir yol belirterek her yerde yapıya veri erişebilirsiniz: &quot;Experiment.Subject (3).Oturum (2). TrialTypeCS.Trial (5). NumPokes. &quot; Özel araç kutusunda, TSsystem içinde komutlar, bu alanlardaki veri üzerinde çalışan ve aynı yapı içinde başka bir alana veya alanlara sonuçları saklayın. Genellikle bir işlemin sonuçları saklandığı alan veya alanlar TSsystem komutu tarafından oluşturulur. Veri analizi, bu kod aynı yapı kendini depolanabilir. Yapının farklı düzeylerde keyfi uzunlukta açıklayıcı notlar koymak olabilir Notlar alanları içerir. Kullanıcı veri alanlarının içeriğini açıklayan ve yorumlama, ek notlar alanlar yapabilirsiniz. Böylece, yapı arşivleme veya kamuya erişilebilir veritabanı mağazalarında çevrimiçi tek bir dosyada deney ve veri analizi ilgili her yönünü koyarak. Deneme çalışırken, veri yapısını içeren dosya senkronize edilir bir klasörde &quot;bulut.&quot; Bu düzenleme off-site depolama ve state-of-sanat yedekleme sigortalanır. Bu erişim sağlarbir araştırmacı internet erişimi olan her yerde ve her veri analizi ve grafik en son sürümü. Kritik adımlar. Bir test protokolü yapımında önemli adımlar şunlardır: <ol><li> Bilgisayar kontrollü fare test cihazının ticari tedarikçi tarafından sağlanan dilde proses kontrol kod yazma ve hata ayıklama (Ekipman ve Malzemeleri bakınız). Kimin temsilcisi sonuçlar yukarıda incelendi protokoller ile sopalarla bir kullanıcı Tamamlayıcı Malzeme sağlanan kodu kullanabilirsiniz. Bu tek kod dosyası yukarıda tarif edilen test protokolleri herhangi bir veya tüm uygular. Test belirli bir noktada belirli bir konu için ameliyat protokolü protokol parametre değerlerinin sütun o anda yürürlükte olan bağlıdır. Kullanıcı test başlamadan önce TSaddprotocol kullanarak hangi sırayla çalıştırılır, bu protokollerin belirler. Protokol özgü Aralık Ek Malzeme bulunuyorision kodları ve karar alanlar. Kullanıcı sadece karar kriterlerini belirtmek gerek. Bu karar kriterleri, belirli bir konu için belirli bir protokol toplanan ne kadar veri yönetir. Her denekten Sonuçlar grafiksel olarak her biri 24 saatlik bir süre içinde bir kaç kez tasvir olduğundan, kullanıcının şimdiye kadar her bir fareden elde edilen sonuçların ışığında, bir fare-by-fare olarak yukarı veya aşağı doğru kriterleri ayarlayabilirsiniz. </li><li> TSsystem araç kutusunda komutları kütüphanesini kullanarak yarı-gerçek-zamanlı veri analizi ve grafik kod yazma ve hata ayıklama. Kimin temsilcisi sonuçlar yukarıda incelendi protokoller ile sopalarla bir kullanıcı Yardımcı Malzeme sağlanan kodu kullanabilirsiniz. Her test protokolü (eşleştirme, enstrümantal ve klasik koşullanma ve zamanlanmış hazne anahtarlama) için bir master analiz işlevi yoktur. Protokol bağımsız sorunsuz çekim analizler yapar ve protokol özgü analy çağıran başka bir ana fonksiyon (DailyAnalysis.m),sis fonksiyonları onun sorunsuz çekim tamamlandığında. </li><li> Protokol düzgün ve tüm fareler sağlıklı tutmak için yeterli granül elde edilir ki çalıştığından emin olmak için veri analizi kod tarafından üretilen grafikler günlük izlenmesi. </li></ol> Sorun Giderme. Bir veya daha fazla deneyler çalıştıran her DailyAnalysis.m fonksiyonu zamanlayıcı fonksiyonu ile her 24 saat içinde 2 veya daha fazla kez denir. Denir durumunda, bu hiyerarşik veri yapısını içerir ve tüm aktif konular için o yapının içine ham veri dosyaları okur dosyasını yükler. Bu ham veri dosyaları proses kontrol yazılımı tarafından her 10 dakikada yazılır. DailyAnalysis işlevi, temel kontrolleri bir dizi çalışır. Her fare son 24 saat içinde pelet yeterli sayıda elde etti Her fare etkin olduğu, topak dağıtıcılar düzgün çalıştığını doğrulamak için kullanıcı etkinleştirmek ve bu grafikler üretir. D yokluğuata saat bazıları kullanıcı sayısı belirtilen bir fare, bir kullanıcı tarafından belirtilen kritik değer, ya da bir pelet dağıtıcı, düzgün bir tetik e-posta uyarılarını faaliyet olmadığını düşündüren sayısal sonuçları altına düştüğünde elde edilen pelet bir dizi. Değişiklikler. Proses kontrol kodu ve TSsystem kodu açık kaynak ve yaygın yorumladı, çünkü kullanıcılar kendi protokollerini hazırlamak olabilir. Kod Yardımcı Malzeme sağlanan hangi protokoller tek iştahlı protokolleri vardır. Onlar davranışı hedef bilişsel mekanizmaların işleyişine bağlıdır hangi nicel yönlerini ortaya çıkarmak için gıda ödül kullanın. Bununla birlikte, ticari bir fare test odaları ayak şoku ile korkusu klima sağlayan bir konfigürasyonda sipariş edilebilir. Böylece, sistem, içeriksel hem de uygulamak cued ve proses kontrol ve yarı gerçek-zamanlı veri anal hem gerekli bilgisayar kodu yazmak mümkün kullanıcılar için zaman günün-korku klima olabilirYsis. Ek Malzeme sağlanan ağır yorumladı kod dosyaları gerekli yeni kod oluşturulmasını kolaylaştıracaktır. Sınırlamalar. Biliş temel mekanizmaları uzay ve zaman içinde kendilerini bulmak ve olay olasılıkları ve görevli riskleri tahmin etmek hayvanları sağlayacak olanlardır. Burada anlatılan tam otomatik test sistemi zaman kendilerini bulmak için fareler sağlayacak mekanizmaların kapsamlı test sağlar ve olasılıkları ve görevli riskleri tahmin etmek. Ancak, bu alanda kendilerini bulmak sağlayacak mekanizmaları hakkında çok sınırlı bilgi sağlar. Uygun protokol ve zamanlanmış anahtarlama protokol test fare test kutusu içindeki yerini temelinde özdeş siloları ayırt olup olmadığını. Hem Bununla birlikte, örneğin, bu protokoller testlerin hiçbiri, bilinen bir boşluk 26 veya th geometrisini kullanarak yönelmelerini hayvanlar sağlayan mekanizmaBir fare tükendi ne kadar ölçer ve bu ölü hesaplaşma 18 merkezi bir rol oynar e kilometre sayacı. . Tekniğin önemi burada davranışsal test tekniği beş önemli yollarından davranışsal farmakoloji ve davranışsal genetikte yaygın olarak kullanılan çoğu diğer tekniklerden farklıdır açıklanmıştır: İlk olarak, fizyolojik olarak anlamlı ölçümler yapar. Bunlar, benzer sonuçlar ile analiz elektrofizyolojik ve biyokimyasal seviyede tekrar edilebilir, böyle bir aralık süresi temsil doğruluğu ve kesinliği gibi ölçümler, bulunmaktadır. Fizyolojik olarak anlamlı davranışsal ölçümleri bu moleküler ya da hücresel veya devre seviyesi mekanizma o davranışsal bildirim mekanizması nörobiyolojik gerçekleştirilmesidir form güvenli bağlantı hipotezler kurulmasında önemli bir rol oynamaktadır. Örnekler spektral duyarlılık fonksiyonları ve dönem ve phas davranışsal ölçüm vardırBu tür sirkadiyen saat olarak osilatörler es. Fizyolojik anlamlı olmayan davranışsal ölçümleri farklı örnekleri bir fare totarod asabilirsiniz zaman miktarıdır, bir su labirentinde bir batık platformu bulmak için ortalama gecikme, kadranda yüzerek yörüngesini yüzdesi platformu daha önce nerede bulundu ve daha önce bir test odasında bir fare donuyor şok olmuştur o zaman fraksiyonu. İkincisi, bir otomatik, yüksek hacimli, yüksek verimlilik işlemdir. Farelere test sırasında işlenmez. Birçok fareler temel bilişsel mekanizmaları hakkında nicel bilgi veren birkaç farklı protokollerin çalışması sırasında, az zaman yatırım ile, laboratuvar alanı sınırlı bir miktarda aynı anda test edilebilir. Çoğu davranışsal test koyun ve test aparatı bunları kaldırmak için farelerin günlük kullanım gerektirir. Su labirenti ve conte en popüler Bazı prosedürler (<html> Her ölçü alınır ve görüntü kayıtları zaman alıcı bir puanlama sonra örneğin xtual korku şartlandırma) hemen önce ve hemen fare işleme gerektirir. Üçüncü olarak, sonuçlar analiz ve yarı gerçek zamanlı olarak grafikle ve test testi tek tek ilerlemesi, her bir fare için otomatik olarak gerçekleşir edilir. Bu, her bir fare-to saat veriler ışığında fare fare (karar kriterleri değiştirme, örneğin,) prosedürü ayarlama sağlar. Yaygın olarak kullanılan testler veriler genellikle test çalıştırmak olmuştur uzun süre sonra analiz edilir. Bu her prosedürün zaman aynı miktarda toplu fareler çalışan gerektirir. Farklı fareler zaman çok farklı miktarlarda sonra farklı prosedürler ana nedeni bu savurgan olduğunu. Kolektif test süresi çok kısa yapılırsa, birçok fare görevi ana değil, hemen hemen tüm fareler görevi usta böylece yeterince uzun yapılmış ise, bazı farelerin daha uzun gereğinden fazla çalıştırılır. ent &quot;&gt; Dördüncü, TSsystem araç kutusunun tasarım hangi protokol ve hangi parametrelerin herhangi bir test herhangi bir noktada ameliyat edildi hakkında hiçbir belirsizlik, yayınlanan özet istatistikler ve geri ham verilere grafiklerden bir sağlam, kolayca izlenebilir rotanın sağlar Testler, her fare veri hacmi yüksek (zaman-damgalı olaylar binlerce) elde zaman fare. Birçok akım testleri her bir fare için çok az veri elde, bu durumda, veri iz. kısa ve kolayca takip, sonra veri iz . Zamanla, biraz farklı proses kontrol kod dosya oluşturulacak, uzun kötü parçalanmış ve takip etmek zor olabilir; birçok farklı veri analiz kod dosyaları yazılır; farklı kod dosyaları farklı bir önceki sonuçları dosyalar üzerinde çalışan birçok farklı sonuç dosyaları üretmek. Bu hepsi bir arada kaydedildiğinden emin olmak için pek çok farklı elektronik dosyaları ve zor arasındaki karmaşık ilişkileri takip etmek zor olur. TSsystem, ham veri ve Intüm bunları aynı hiyerarşik veri yapısında saklanır türemiştir. Böylece, yayınlanan sonuçlar yatan ham veriden ayrı olamaz. Her oturum için proses kontrol kodu otomatik olarak aynı deneyde önceki tüm proses kontrol koduna karakteri TSsystem yazılım ve karşılaştırılmıştır karakteri tarafından okundu. Herhangi bir fark varsa, yeni bir oturum için kod, veri ve bu süreç kontrol versiyonu tanımlayan bir dizi otomatik olarak bir fare bu oturum için bir alan içine girilen ile birlikte yapısında depolanır. Böylece, proses kontrol kodun her sürümü otomatik olarak bu kodu yürütme elde veri olarak aynı yapı içinde saklanır. Hangi veri bir çok sürümü protokolünün hangi sürümünde gelen olarak bu sistem ile, bir emin değildir. Sayısı genellikle az olan veri analizi kod dosyaları, aynı zamanda analiz tamamlanması üzerine, bu yapı içinde depolanabilir. Bu bir tek d her şeyi koyarşubeleşme yapısı (ne astı ne) tarafından ve alan adları bilgilerin birçok farklı türleri arasındaki ilişkiler hem gösterir ata yapısı. Beşinci olarak, ilgili tüm bilgileri bir arada özetleri ayıklamak ve grafikler oluşturmak için kullanılan çok yüksek seviyeli veri-analiz komutları ile, saklandığı TSsystem, özünde hiyerarşik veri yapısı laboratuarlar arasındaki karmaşık davranış fenotipleme verilerin mümkün paylaşımı yapan . Tek bir elektronik dosya diğer araştırmacılara veri işleme tüm düzeyleri, ve, sindirilmiş özetlenmiş ve verileri grafikle bilgisayar koduna anlaşılır, işletilebilir erişim sağlar. Zengin eski verilerin daha sonra reanalysis mümkün ayarlar yapar. Bu da büyük kullanılabilir kamu davranışsal ve bilişsel fenotipleme veritabanlarının oluşturulmasını mümkün kılar. Gelecek uygulamalar. Tam otomatik sistem laboratuar derslerinde yararlı olabilir in hayvan davranışı. Bu fareler ve bunu yaparken onların sağlığı için olası tehditler hakkında görevli kaygıların doğru kullanımı konusunda öğrencilerin çok sayıda talimat giderek zahmetli sorunu finesses. Bu, şimdiye kadar onları ele olmadan gerçek fareler ile deney tasarlama ve yürütme öğrencilerin çok sayıda sağlar. Öğretim kullanmak için, bir öğrenci onlar geliştirdiler protokolde fare başarımlı gözlemlemek böylece, test kutularında küçük ucuz infrared video kameralar koymak isteyebilirsiniz. Bulut içinde saklanan tek bir hiyerarşik veri yapısı içinde ham verilerin yerleştirilmesi mümkün veri içeri olarak birçok farklı öğrenci aynı verileri analiz etmek için yapar

Biliş temel mekanizmalar aracılık hücresel ve moleküler mekanizmaların tanıtılması ayı genetik, moleküler genetik, moleküler biyoloji ve nörofarmakolojinin güçlü teknikler getirmek için, fizyolojik olarak anlamlı ölçmek yüksek hacimli, yüksek verimlilikte bir psikofiziksel tarama yöntemleri gerekir bilişsel mekanizmalarının özellikleri. Bir mekanizmanın bir psychophysically ölçülebilir, fizyolojik olarak anlamlı nicel özellik davranış ile ölçülür ve elektrofizyolojik veya biyokimyasal yollarla edilebilir bir özelliktir. Örnekler rodopsin soğurma spektrumu, sirkadyen saatin serbest çalışma süresi, ve iç yan ön beyin demeti içinde 1,2 ödül akson refrakter süresi vardır. Hücresel ve moleküler ölçümlerine göre olabilir Psikofiziksel ölçümler nicel yazışma yoluyla psikolojik mekanizmaları hücresel ve moleküler mekanizmaları bağlamak için bir temel yatıyordu. Exampl içine, çubukların dış segmentlerinde rodopsin yerinde absorpsiyon spektrumunda insan skotopik spektral duyarlılık fonksiyonu üzerine superimposes olması foton-tetiklenen rodopsin izomerizasyonunu skotopik vizyonunda ilk adım olduğunu güçlü bir delildir. Karmaşık davranış kalıplarının nicel yönleri de davranışsal genetik 3,4 içinde QTL yöntemlerin kullanımına merkezi vardır. Köklü enstrümantal ve Pavlov öğrenme protokolleri üzerine fareler (ve fareleri) performansı zaman gibi soyut miktarını ölçmek beyin mekanizmaları bağlıdır, sayı, süresi, hızı, olasılık, risk ve mekansal konumu. Örneğin, Pavlovian şartlandırılmış cevapların edinim hızı takviye edici etkinlikleri (tipik olarak, gıda servis) ve yaklaşan takviye 5-7 için sinyalin başlamasından sonra takviye ortalama gecikme arasındaki ortalama aralık arasındaki orana bağlıdır. İkinci Examp içinle, bir eşleştirme protokol iki besleme hunilere ziyaretlerin ortalama süresi oranı yaklaşık bu iki haznede 8-10 donatı oranlarının oranına eşittir. Altta yatan mekanizmaları ile ilgilenen nörologlar günümüzde yaygın olarak kullanılan davranışsal test yöntemleri koymak yoluyla düşük, çoğunlukla, düşük hacimli için vardır, ve emek yoğun 26. Örneğin, sirkadyen osilatörler davranışsal olarak ölçülen dönemleri ve fazlar sirkadiyen süresi ve faz elektrofizyolojik ve biyokimyasal önlemlere göre olabilir, yanı Ayrıca, elektrofizyolojik ve biyokimyasal yöntemlerle ölçülen miktarları ile karşılaştırılabilir miktarlarda ölçer. Güncel davranışsal test yöntemleri gibi mekansal öğrenme, zamansal öğrenme, ya da öğrenme korku, yerine yatan mekanizmaların yanı öğrenme, kategorilerine odaklanmak. Uzamsal öğrenme 11-15 yaygın olarak kullanılan su labirenti testi bu sh bir örnektirortcomings. Mekansal öğrenme bir kategoridir. Bu kategorideki Öğrenme ölü hesaplaşma 16,17 mekanizmasıdır biri mekanizmasında bağlıdır. Ölü hesaplaşma kilometre sayacı, mesafe koşmak 18 ölçen mekanizma üzerinde sırayla bağlıdır. Benzer şekilde, zamansal öğrenme bir kategoridir. Yaklaşık 24 saatlik bir süre ile bir osilatör olaylar 17,19 cereyan ettiği günün saati öğrenmek için hayvanlar için gerekli olduğundan bir sirkadiyen saat, bu kategorideki öğrenmeye bağlı olduğu mekanizmaları arasında yer alıyor. Gıda beklenti sağlar saat henüz 19 tespit edilmelidir. Bir saat bir zaman ölçme mekanizmadır. Dönemlerde geniş bir yelpazesi ile endojen osilatörler beyin bu saatler 16,17 fazlarını kayıt zaman içinde olayların bulmak için izin verir. Zamanında yerleri kayıt yeteneği zaman içinde yerleri arasında yani, mesafeler, süreler ölçüm sağlar. Ilişkisel öğrenme t bağlıdırO süreler 5,6,20,21 ve beynin ölçümleri. Sayaçlar numarası ölçme mekanizmaları vardır. Bir olasılık da, bir alt-grubun numerosity ve süperset ve numerosity arasındaki oran, çünkü ölçüm sayısı, olasılık tahmini sağlar. Bir oran bu sayı ölçülmüştür, üzerinde aralığın süresine bölünmesiyle olayların sayısı olduğu için, oran tahminle olanak sağlamaktadır ölçüm sayısı ve ölçme süresi. Süresi ölçümleri, sayı, oran, olasılık ve değişen risklere davranışsal ayarlamaları etkinleştirin. 22,23 Bizim yöntem bu temel mekanizmaların doğruluk ve hassasiyet ölçüm üzerinde duruluyor. Doğruluk beynin ölçü objektif bir ölçü karşılık hangi ölçüde olduğunu. Hassas, örneğin sabit bir hedef değerin beynin ölçüde değişiklik veya belirsizlik, sabit bir süresidir. Weber&#39;in Kanunu psikofizik eski ve en güvenli kurulmuş sonucudur. Bu iddia ettiğini ve hassasbir büyüklüğün beynin ölçü bu miktar sabit bir parçasıdır. Bir dağılımın varyasyon istatistikçinin katsayısı Weber Kesir, (σ / μ), hassasiyet ölçer. Nesnel ortalamaya psikofiziksel ortalama oranı (örn. karar süresi ortalama) (objektif süresi ortalama) doğruluk ölçüsüdür. Insan miktarını en aza indirirken Burada sunulan yöntem hacmi (laboratuar alanı belirli bir miktarda herhangi bir zamanda, taranmakta olan hayvan sayısı) ve veri akışını (tek bir hayvanın tarama ortalama süresi ile bölünmesiyle elde edilen bilgileri ve miktar) en üst düzeye çıkarır emek ölçümler yapmak için gerekli ve ivediliği maksimize hangi ile bilinir hale taraması sonuçları. Burada sunulan veriler, analiz yazılım mimarisi otomatik olarak ham veri ve tüm sonuçlar özet ve tek d birlikte verilerden elde edilen istatistikleri koyarsayıların anlaşılır geniş denizleri hale alan başlıkları ile ata yapı, orada bulunan. Analitik yazılım sadece bu yapıda veri üzerinde çalışır ve her zaman aynı yapı içinde alanlarındaki faaliyetlerinin sonuçlarını saklar. Bu ham verilerden yayınlanmış özetleri ve grafikler için sağlam bir iz sigortalanır. Yazılım otomatik yapısına tam otomatik test yönetilir deney-kontrol programları yazar, ve otomatik olarak ham veri hangi program geldiği gösterir. Böylece, deneysel koşullar test her noktasında, her bir hayvan için yürürlükte olduğu gibi hangi şüphesiz ve özet istatistik ham verilerden elde edilmiştir konusunda hiçbir şüphe ile, kusursuz bir veri izi korur. Veri korunması bu yöntem büyük ölçüde mümkün diğer laboratuarlar daha bu zengin veri setlerini analiz etmek için yapım, standart davranış tarama veri tabanlarının gelişimini kolaylaştırır. <p class = &quot;jove_content&quot;&gt; Bu yöntem bağlı olduğu firmware ve yazılım için destek kaybı riskini en aza indirir. Test aygıtı trivially köklü bir ticari bir kaynaktan modifiye edilir. Programlama dilleri protokol kontrolü için donanım üreticisi tarafından sağlanan özel dil vardır, ve, veri analizi ve grafik için, bir amaca, ticari olmayan, açık kaynak kodlu araç kutusu (TSsystem) çok yaygın olarak desteklenen ticari, bilimsel programlama, veri yazılı analizi ve grafik dili. Araç uzun zaman damgalı olay kayıtlara yapısal bilgi ve özet istatistikleri ayıklanması için üst düzey komutları içerir. Protokol-uygulama programları ve veri analiz programları açık kaynak ve iyice belgelenmiştir. Eleme sistemi, Şekil 1 &#39;de şematize edilmiştir. On dolapları, her içeren 8 test ortamları 80 fareler t sağlayan bir 10 ft x 15 ft laboratuvar odasında kurulabiliro bir anda çalıştırabilirsiniz. Bir parti duvarında bir liman geçerek Kablolar başka bir odada elektrik / elektronik arabirim kartları ve PC&#39;lere ortamları bağlamak gerekir. PC&#39;ler protokol kontrol programları çalıştırmak. Bir bilgisayar her 2 dolaplar (16 ortamlarda test) için gereklidir. PC&#39;ler veri analizi ve grafik yazılımı çalıştıran bir sunucu için bir Yerel Alan Ağı üzerinden bağlanmalıdır.

<table border="0" cellpadding="0" cellspacing="0" width="881">>
	<tbody>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:213px;">SmartCtrl Connection Panel</td>
			<td style="width:127px;">Med Associates</td>
			<td style="width:136px;">SG-716B (115)</td>
			<td style="width:339px;">control panel for inputs/outputs</td>
			<td style="width:67px;">8</td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:213px;">SmartCtrl Interface Module</td>
			<td style="width:127px;">Med Associates</td>
			<td style="width:136px;">DIG-716B (114)</td>
			<td>smart card for each chamber</td>
			<td>8</td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:213px;">Universal Cable</td>
			<td style="width:127px;">Med Associates</td>
			<td style="width:136px;">SG-210CB (115)</td>
			<td>cable from smart card to control panel</td>
			<td>1</td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:213px;">Tabletop Interface Cabinet</td>
			<td style="width:127px;">Med Associates</td>
			<td style="width:136px;">SG-6080C (109)</td>
			<td>cabinet to hold smart cards</td>
			<td>1</td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:213px;">Rack Mount Power Supply</td>
			<td style="width:127px;">Med Associates</td>
			<td style="width:136px;">SG-500 (112)</td>
			<td>28 volt power</td>
			<td>1</td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:213px;">Wide Mouse Test Chamber</td>
			<td style="width:127px;">Med Associates</td>
			<td style="width:136px;">ENV-307W (31)</td>
			<td>test chamber</td>
			<td>8</td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:213px;">Filler Panel Package</td>
			<td style="width:127px;">Med Associates</td>
			<td style="width:136px;">ENV-307W-FP (32)</td>
			<td>various-size panels for test chamber</td>
			<td>8</td>
		</tr>
		<tr height="42">
			<td height="42" style="height:42px;width:213px;">Wide Mouse Modular Grid Floor</td>
			<td style="width:127px;">Med Associates</td>
			<td style="width:136px;">ENV-307W-GF (31)</td>
			<td>test chamber floor grid</td>
			<td>8</td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:213px;">Head Entry Detector</td>
			<td style="width:127px;">Med Associates</td>
			<td style="width:136px;">ENV-303HDW (62)</td>
			<td>head entry/pellet entry into hopper</td>
			<td>40</td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:213px;">Pellet Dispenser</td>
			<td style="width:127px;">Med Associates</td>
			<td style="width:136px;">ENV-203-20 (73)</td>
			<td>feeder</td>
			<td>16</td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:213px;">Pellet Receptacle</td>
			<td style="width:127px;">Med Associates</td>
			<td style="width:136px;">ENV-303W (61)</td>
			<td>hopper</td>
			<td>24</td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:213px;">Pellet Receptacle Light</td>
			<td style="width:127px;">Med Associates</td>
			<td style="width:136px;">ENV-303RL (62)</td>
			<td>hopper light</td>
			<td>24</td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:213px;">House Light</td>
			<td style="width:127px;">Med Associates</td>
			<td style="width:136px;">ENV-315W (43)</td>
			<td>house light</td>
			<td>8</td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:213px;">IR Controller</td>
			<td style="width:127px;">Med Associates</td>
			<td style="width:136px;">ENV-253B (77)</td>
			<td>entry detector for tube between nest and test</td>
			<td>16</td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:213px;">Fan</td>
			<td style="width:127px;">Med Associates</td>
			<td style="width:136px;">ENV-025F28 (42)</td>
			<td>exhaust fan for each chamber</td>
			<td>8</td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;">Polypropylene Nest Tub</td>
			<td></td>
			<td></td>
			<td>nest box</td>
			<td>8</td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;">Acrylic Connection Tube</td>
			<td></td>
			<td></td>
			<td>connection between nest and test areas</td>
			<td>8</td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:213px;">Steel Cabinet</td>
			<td></td>
			<td></td>
			<td>cabinet to hold test chambers (78&#34;H, 48&#34;W, 24&#34;D)</td>
			<td>1</td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:213px;">Windows computer</td>
			<td style="width:127px;"> </td>
			<td style="width:136px;"> </td>
			<td>running MedPC experiment-control software</td>
			<td>1</td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:213px;">Server</td>
			<td style="width:127px;"> </td>
			<td style="width:136px;"> </td>
			<td>running Matlab, linked to exper-control computer by LAN</td>
			<td>1</td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:213px;"> </td>
			<td style="width:127px;"> </td>
			<td style="width:136px;"> </td>
			<td></td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:213px;">Software</td>
			<td style="width:127px;"> </td>
			<td style="width:136px;"> </td>
			<td></td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:213px;">MedPC software</td>
			<td style="width:127px;">Med Associates</td>
			<td style="width:136px;"> </td>
			<td>proprietary process-control programming language</td>
			<td>1</td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:213px;">Matlab w Statistics Toolbox</td>
			<td style="width:127px;">Matlab</td>
			<td style="width:136px;"> </td>
			<td>proprietary data analysis and graphing programing system</td>
			<td>1</td>
		</tr>
		<tr height="63">
			<td height="63" style="height:63px;width:213px;">TSsystem</td>
			<td></td>
			<td style="width:136px;">in Supplementary Material w updates from senior author</td>
			<td>Open-source Matlab Toolbox</td>
			<td>1</td>
		</tr>
		<tr height="189">
			<td height="189" style="height:189px;width:213px;">Note: This is the euipment needed for one cabinet, containing 8 test environments. Hardware must be replicated for each such cabinet. However one computer can control 2 cabinets (16 test environments)</td>
			<td style="width:127px;"> </td>
			<td style="width:136px;"> </td>
			<td></td>
			<td></td>
		</tr>
	</tbody>
</table>

automated, quantitative cognitive/behavioral screening of mice: for genetics, pharmacology, animal cognition and undergraduate instruction

Biz live-biliş temel mekanizmaların genetik ve farmakolojik manipülasyonlar etkilerinin değerlendirilmesi ve farelerde öğrenme için 7/24 davranışsal test sistemi tam otomatik, yüksek verim, yüksek hacimli, tarif. Standart bir polipropilen fare gövdesi küvet edilen bir standart ticari bir fare deney kutusuna bir akrilik boru ile bağlanır. Test kutu besleyiciler pelet bağlı 2 olan 3 haznelerini vardır. Tüm dahili bir LED aydınlatıcı ve kızılötesi (IR) ile kafa kafaya girdiler için izlenir kirişler. Fareler tarama sırasında sevkini ortadan ortamda yaşamak. Onlar protokol kontrol yazılımı ve yarı-gerçek-zamanlı veri analizi ve grafik yazılımı biz yazdım hangi, (klasik) protokolleri (enstrümantal) ve Pavlovyan edimsel performans ile iki veya daha fazla günlük beslenme dönemlerde onların yiyecek almak. Veri analizi ve grafik rutinleri çok büyük zaman-s analizini basitleştirmek için oluşturulan bir MATLAB tabanlı bir dilde yazılmışdavranışsal ve fizyolojik bir olay kayıtlarını sıkıştırılır ve ham verileri tek bir veri yapısı içinde yayınlanan grafikler ve istatistik tüm ara analizler yoluyla tam bir veri izi korumak için. Veri analizi, kod veriler birkaç kez bir gün ve otomatik olarak &quot;bulut&quot; saklanan ve üzerinde-laboratuvarda bilgisayar, istatistik ve grafiksel analizler, özne onu hasadın. Bu nedenle, tek tek farelerin ilerleme görselleştirilir ve her gün ölçülür. Veri analizi, kod protokol bireysel konuların protokolü otomatik avans izin, protokol kontrol koduna konuşuyor. Uygulanan davranışsal protokolleri eşleşen, autoshaping, zamanlanmış huni-anahtarlama, zamanlanmış huni-anahtarlama, dürtüsellik ölçümü ve gıda durumu sirkadiyen beklentisiyle risk değerlendirme. Açık kaynak protokol kontrol ve veri analizi kod yeni protokollerin eklenmesi kolaylaştırır. Sekiz ortamlarda test kabinede x 78 x 24 bir 48 sığacak; böyle iki sürücü kabininiinets (16 ortamlar) bir bilgisayar tarafından kontrol edilebilir.

Watch this Scientific Journal Video about Automated, Quantitative Cognitive/Behavioral Screening of Mice: For Genetics, Pharmacology, Animal Cognition and Undergraduate Instruction at JoVE.com

Automated, Quantitative Cognitive/Behavioral Screening of Mice: For Genetics, Pharmacology, Animal Cognition and Undergraduate Instruction

Genetik ve farmakolojik manipülasyonlar etkilerini değerlendirmek amacıyla, mekansal yerelleştirme, zamansal lokalizasyonu, süresi, hızı ve olasılık tahmini, risk değerlendirmesi, dürtüsellik ve doğruluğunu ve hafıza hassasiyet arabuluculuk mekanizmalarının fizyolojik anlamlı özelliklerini ölçmek için tam otomatik sistem Farelerde biliş temel mekanizmaları.

Farelerin Otomatik, Kantitatif / Bilişsel Davranışçı Tarama: Genetik, Farmakoloji, Hayvan Biliş ve Lisans Öğretim İçin

We describe a high-throughput, high-volume, fully automated, live-in 24/7 behavioral testing system for assessing the effects of genetic and ...

automated-quantitative-cognitivebehavioral-screening-mice-for

Nanyang Technological University

Research

JoVE Journal

Behavior

14.2K Görüntüleme.  Rutgers University.  Genetik ve farmakolojik manipülasyonlar etkilerini değerlendirmek amacıyla, mekansal yerelleştirme, zamansal lokalizasyonu, süresi, hızı ve olasılık tahmini, risk değerlendirmesi, dürtüsellik ve doğruluğunu ve hafıza hassasiyet arabuluculuk mekanizmalarının fizyolojik anlamlı özelliklerini ölçmek için tam otomatik sistem Farelerde biliş temel mekanizmaları. 

Video: Automated, Quantitative Cognitive/Behavioral Screening of Mice: For Genetics, Pharmacology, Animal Cognition and Undergraduate Instruction

The Modified Hole Board - Measuring Behavior, Cognition and Social Interaction in Mice and Rats

This protocol describes the modified hole board (mHB), which combines features from a traditional hole board and open field and is designed to measure multiple dimensions of unconditioned behavior in small laboratory mammals (e.g., mice, rats, tree shrews and small primates). This paradigm is a valuable alternative for the use of a behavioral test battery, since a broad behavioral spectrum of an animal&#8217;s behavioral profile can be investigated in one single test.
The apparatus consists of a box, representing the &#8216;protected&#8217; area, separated from a group compartment. A board, on which small cylinders are staggered in three lines, is placed in the center of the box, representing the &#8216;unprotected&#8217; area of the set-up. The cognitive abilities of the animals can be measured by baiting some cylinders on the board and measuring the working and reference memory. Other unconditioned behavior, such as activity-related-, anxiety-related- and social behavior, can be observed using this paradigm. Behavioral flexibility and the ability to habituate to a novel environment can additionally be observed by subjecting the animals to multiple trials in the mHB, revealing insight into the animals&#8217; adaptive capacities.
Due to testing order effects in a behavioral test battery, na&#239;ve animals should be used for each individual experiment. By testing multiple behavioral dimensions in a single paradigm and thereby circumventing this issue, the number of experimental animals used is reduced. Furthermore, by avoiding social isolation during testing and without the need to food deprive the animals, the mHB represents a behavioral test system, inducing if any, very low amount of stress.

This protocol describes the modified hole board, which is a behavioral test set-up that comprises the characteristics of an open field and a traditional hole board. This set-up enables the differential analysis of unconditioned behavior of small laboratory mammals as well as the analysis of cognitive abilities.

Modifiye Delik Kurulu - Fareler ve Sıçanlarda Davranışı, Biliş ve Sosyal Etkileşim Ölçme

This protocol describes the modified hole board (mHB), which combines features from a traditional hole board and open field and is designed to measure ...

Davranış

Assessment of Social Cognition in Non-human Primates Using a Network of Computerized Automated Learning Device (ALDM) Test Systems

Fagot &#38; Paleressompoulle1 and Fagot &#38; Bonte2 have published an automated learning device (ALDM) for the study of cognitive abilities of monkeys maintained in semi-free ranging conditions. Data accumulated during the last five years have consistently demonstrated the efficiency of this protocol to investigate individual/physical cognition in monkeys, and have further shown that this procedure reduces stress level during animal testing3. This paper demonstrates that networks of ALDM can also be used to investigate different facets of social cognition and in-group expressed behaviors in monkeys, and describes three illustrative protocols developed for that purpose. The first study demonstrates how ethological assessments of social behavior and computerized assessments of cognitive performance could be integrated to investigate the effects of socially exhibited moods on the cognitive performance of individuals. The second study shows that batteries of ALDM running in parallel can provide unique information on the influence of the presence of others on task performance. Finally, the last study shows that networks of ALDM test units can also be used to study issues related to social transmission and cultural evolution. Combined together, these three studies demonstrate clearly that ALDM testing is a highly promising experimental tool for bridging the gap in the animal literature between research on individual cognition and research on social cognition.

Assessment of Social Cognition in Non-human Primates Using a Network of Computerized Automated Learning Device ALDM Test Systems

Fagot &#38; Paleressompoulle1 have published an automated learning device (ALDM) aimed at testing individual cognitive abilities in semi-free ranging monkeys. The main goal of our protocol is to use a network of ALDM test units to study social cognition in non-human primates.

Bilgisayarlı Otomatik Öğrenme Cihazı (aldm) Test Sistemleri bir Ağı Kullanma Olmayan insan Primatlar Sosyal Biliş Değerlendirilmesi

Fagot &#38; Paleressompoulle1 and Fagot &#38; Bonte2 have published an automated learning device (ALDM) for the study of cognitive abilities of monkeys ...

A Protocol for Housing Mice in an Enriched Environment

Environmental enrichment (EE) is a housing environment for mice that boosts mental and physical health compared to standard laboratory housing. Our recent studies demonstrate that environmental enrichment decreases adiposity, increases energy expenditure, resists diet induced obesity, and causes cancer remission and inhibition in mice. EE typically consists of larger living space, a variety of &#8216;toys&#8217; to interact with, running wheels, and can include a number of other novel environmental changes. All of this fosters a more complex social engagement, cognitive and physical stimulations. Importantly, the toy location and type of toy is changed regularly, which encourages the mice to adapt to a frequently changing and novel environment. Many variables can be manipulated in EE to promote health effects in mice. Thus these approaches are difficult to control and must be properly managed to successfully replicate the associated phenotypes. Therefore, the goal of this video is to demonstrate how EE is properly set up and maintained to assure a complex, challenging, and controlled environment so that other researchers can easily reproduce the protective effects of EE against obesity and cancer.

Environmental enrichment for mice requires a complex and challenging setup, as well as comprehensive husbandry and handling techniques to assure robust metabolic and anti-cancer effects in the mice. This protocol provides detailed procedures to reproduce the above mentioned effects in mice.

Bir Zenginleştirilmiş Ortamında Konut Fareler için Protokol

Environmental enrichment (EE) is a housing environment for mice that boosts mental and physical health compared to standard laboratory housing. Our recent ...

Introducing Clicker Training as a Cognitive Enrichment for Laboratory Mice

Establishing new refinement strategies in laboratory animal science is a central goal in fulfilling the requirements of Directive 2010/63/EU. Previous research determined a profound impact of gentle handling protocols on the well-being of laboratory mice. By introducing clicker training to the keeping of mice, not only do we promote the amicable treatment of mice, but we also enable them to experience cognitive enrichment. Clicker training is a form of positive reinforcement training using a conditioned secondary reinforcer, the "click" sound of a clicker, which serves as a time bridge between the strengthened behavior and an upcoming reward. The effective implementation of the clicker training protocol with a cohort of 12 BALB/c inbred mice of each sex proved to be uncomplicated. The mice learned rather quickly when challenged with tasks of the clicker training protocol, and almost all trained mice overcame the challenges they were given (100% of female mice and 83% of male mice). This study has identified that clicker training for mice strongly correlates with reduced fear in the mice during human-mice interactions, as shown by reduced anxiety-related behaviors (e.g., defecation, vocalization, and urination) and fewer depression-like behaviors (e.g., floating). By developing a reliable protocol that can be easily integrated into the daily routine of the keeping of laboratory mice, the lifetime experience of welfare in the mice can be improved substantially.

The development of new refinement strategies for laboratory mice is a challenging task that contributes towards fulfilling the 3R principle. This protocol introduces clicker training as a cognitive enrichment program for laboratory mice.

Laboratuvar Fareler için Bilişsel Zenginleştirme olarak Clicker Eğitim Tanıtımı

Establishing new refinement strategies in laboratory animal science is a central goal in fulfilling the requirements of Directive 2010/63/EU. Previous ...

Battery of Behavioral Tests Assessing General Locomotion, Muscular Strength, and Coordination in Mice

Behavioral testing is used in pre-clinical trials to assess the phenotypic effects and outcomes that a particular disease or treatment has on the animal&#39;s wellbeing and health. There are numerous behavioral tests that may be applied. We selected a test for general locomotion, the open field test (OFT); a test for muscular strength, the mesh test (MT); and a test for coordination, the rotarod test (RR). Testing can be accomplished on a weekly or monthly basis. As a test for general locomotion, the OFT works by objectively monitoring movement parameters while the mouse is in an open field apparatus. The field is generally a 2&#39; x 2&#39; box, and the movements are recorded through laser sensing or through video capture. The mouse is placed in the center of the open field and allowed to move freely for the test. The MT uses the latency for a mouse to fall off an inverted screen as a measure of muscular strength. A mouse is placed on a screen, which is inverted over a clear box, and is timed for their latency to fall. Three trials are performed, with the best of the three trials scored for that day. A score of 60 s is the maximum time a mouse is left inverted. Mice are given a 5-min rest period between mesh test trials. Lastly, an accelerated protocol on the RR assesses motor coordination and endurance. During a trial, a mouse walks on a rotating rod as it increases in speed from 4 rpm to 40 rpm over 5 min. The trial ends when the mouse touches the magnetized pressure sensor upon falling. Each mouse undergoes three trials, and the best trial is scored for that day. This combined behavioral data allows for the global assessment of mobility, coordination, strength, and movement of the test animals. At least two out of the three behavioral testing measures must show improvement for an animal to qualify as having overall improved motor function.

Behavioral testing is used in pre-clinical trials to assess the phenotypic effects of a disease or treatment on an animal's wellbeing. In order to globally assess motor functioning, we selected tests for general locomotion, muscular strength, and coordination: the open field test, the mesh test, and the rotarod test, respectively.

Batarya-in davranış değerlendirilmesi genel hareket, kas gücü ve koordinasyon farelerde testleri

Behavioral testing is used in pre-clinical trials to assess the phenotypic effects and outcomes that a particular disease or treatment has on the ...

Systematic Assessment of Well-Being in Mice for Procedures Using General Anesthesia

In keeping with the 3R Principle (Replacement, Reduction, Refinement) developed by Russel and Burch, scientific research should use alternatives to animal experimentation whenever possible. When there is no alternative to animal experimentation, the total number of laboratory animals used should be the minimum needed to obtain valuable data. Moreover, appropriate refinement measures should be applied to minimize pain, suffering, and distress accompanying the experimental procedure. The categories used to classify the degree of pain, suffering, and distress are non-recovery, mild, moderate, or severe (EU Directive 2010/63). To determine which categories apply in individual cases, it is crucial to use scientifically sound tools.
The well-being-assessment protocol presented here is designed for procedures during which general anesthesia is used. The protocol focuses on home cage activity, the Mouse Grimace Scale, and luxury behaviors such as burrowing and nest building behavior as indicators of well-being. It also uses the free exploratory paradigm for trait anxiety-related behavior. Fecal corticosterone metabolites as indicators of acute stress are measured over the 24-h post-anesthetic period.
The protocol provides scientifically solid information on the well-being of mice following general anesthesia. Due to its simplicity, the protocol can easily be adapted and integrated in a planned study. Although it does not provide a scale to classify distress in categories according to the EU Directive 2010/63, it can help researchers estimate the degree of severity of a procedure using scientifically sound data. It provides a way to improve the assessment of well-being in a scientific, animal-centered manner.

We developed a protocol to assess well-being in mice during procedures using general anesthesia. A series of behavioral parameters indicating levels of well-being as well as glucocorticoid metabolites were analyzed. The protocol can serve as a general aid to estimate the degree of severity in a scientific, animal-centered manner.

Esenlik farelerde sistematik değerlendirilmesi için genel anestezi yordamları

In keeping with the 3R Principle (Replacement, Reduction, Refinement) developed by Russel and Burch, scientific research should use alternatives to animal ...

Tickling, a Technique for Inducing Positive Affect When Handling Rats

Handling small animals such as rats can lead to several adverse effects. These include the fear of humans, resistance to handling, increased injury risk for both the animals and the hands of their handlers, decreased animal welfare, and less valid research data. To minimize negative effects on experimental results and human-animal relationships, research animals are often habituated to being handled. However, the methods of habituation are highly variable and often of limited effectiveness. More potently, it is possible for humans to mimic aspects of the animals&#39; playful rough-and-tumble behavior during handling. When applied to laboratory rats in a systematic manner, this playful handling, referred to as tickling, consistently gives rise to positive behavioral responses. This article provides a detailed description of a standardized rat tickling technique. This method can contribute to future investigations into positive affective states in animals, make it easier to handle rats for common husbandry activities such as cage changing or medical/research procedures such as injection, and be implemented as a source of social enrichment. It is concluded that this method can be used to efficiently and practicably reduce rats&#39; fearfulness of humans and improve their welfare, as well as reliably model positive affective states.

This article demonstrates the standardized application of playful handling, a tickling technique designed to mimic rat rough-and-tumble play. This technique is effective at reducing fearful reactions to humans and generating positive affect when rats are handled for common husbandry activities and medical and research procedures such as injection.

Gıdıklama, fareler işlerken olumlu etkiler Inducing tekniği

Handling small animals such as rats can lead to several adverse effects. These include the fear of humans, resistance to handling, increased injury risk ...

An Automated T-maze Based Apparatus and Protocol for Analyzing Delay- and Effort-based Decision Making in  Free Moving Rodents

Many neurological and psychiatric patients demonstrate difficulties and/or deficits in decision making. Rodent models are helpful to produce a deeper understanding of the neurobiological causes underlying the decision-making problems. A cost-benefit based T-maze task is used for measuring decision making in which rodents choose between a high reward arm (HRA) and a low reward arm (LRA). There are two paradigms of the T-maze decision-making task, one in which the cost is a time delay and the other in which it is physical effort. Both paradigms require a tedious and labor-intensive management of experimental animals, multiple doors, pellet reward, and arm choice recordings. In the current work, we invented an apparatus based on traditional T-maze with full automation for pellet delivery, door management and choice recordings. This automated setup can be used for the evaluation of both delay- and effort-based decision making in rodents. With the protocol described here, our lab investigated the decision-making phenotypes of multiple genetically modified mice. In the representative data, we showed that the mice with ablated medial habenular showed aversions of both delay and effort and tended to choose the immediate and effortless reward. This protocol helps to decrease the variability caused by experimenter intervention and to enhance experiment efficiency. In addition, chronic silicon probe or microelectrode recording, fiber-optic imaging and/or manipulation of neural activity can be easily applied during the decision-making task using the setup described here.

This article introduces an automated T-maze apparatus that we invented, and a protocol based on this apparatus for analyzing delay-based decision making and effort-based decision making in free moving rodents.

Otomatik bir T-maze cihazları ve protokol dayalı karar vermede gecikme ve çaba tabanlı ücretsiz taşıma kemirgenler çözümlemek için

Many neurological and psychiatric patients demonstrate difficulties and/or deficits in decision making. Rodent models are helpful to produce a deeper ...

Automated, Long-term Behavioral Assay for Cognitive Functions in Multiple Genetic Models of Alzheimer's Disease, Using IntelliCage

Multiple factors&#8212;such as aging and genes&#8212;are frequently associated with cognitive decline. Genetically modified mouse models of cognitive decline, such as Alzheimer&#39;s disease (AD), have become a promising tool to elucidate the underlying mechanisms and promote the therapeutic advances. An important step is the validation and characterization of expected behavioral abnormality in the models, in the case of AD, cognitive decline. The long-term behavioral investigations of laboratory animals to study the effect of aging demand substantial efforts from researchers. The IntelliCage system is a high-throughput and cost-effective test battery for mice that eliminates the need for daily human handling. Here, we describe how the system is utilized in the long-term phenotyping of a genetic Alzheimer&#39;s disease model, specifically focusing on the cognitive functions. The experiment employs repeated battery of tests that assess spatial learning and executive functions. This cost-effective age-dependent phenotyping allows us to identify the transient and/or permanent effects of genes on various cognitive aspects.

This paper describes a protocol for cognitive assessments for genetic models of the Alzheimer&#39;s disease using the IntelliCage system, which is a high throughput automated behavioral monitoring system with operant conditioning.

Otomatik, Alzheimer hastalığının IntelliCage kullanarak, birden çok genetik modellerinde bilişsel işlevler için uzun vadeli davranış tahlil

Multiple factors&#8212;such as aging and genes&#8212;are frequently associated with cognitive decline. Genetically modified mouse models of cognitive ...

Measuring Active and Passive Tameness Separately in Mice

Domesticated animals such as dogs and laboratory mice show a high level of tameness, which is important for humans to handle them easily. Tameness has two behavioral components: a reluctance to avoid humans (passive tameness) and a motivation to approach humans (active tameness). To quantify these components in mice, we previously developed behavioral tests for active tameness, passive tameness, and the willingness to stay on a human hand, each designed to be completed within 3 min. The data obtained were used for selective breeding, with a large number of mice analyzed per generation. The active tameness test measures the movement of the mouse toward a human hand and the contact it engages in. The passive tameness test measures the duration of time that a mouse tolerates human touch. In the stay-on-hand test, a mouse is placed on a human hand and touched slowly using the thumb of that hand; the duration of time that the animal remains on the hand is measured. Here, we describe the test set-up and apparatus, explain the procedures, and discuss the appropriate data analysis. Finally, we explain how to interpret the results.

Tameness in animals includes a reduction of avoidance responses to humans (passive tameness) and an increase in active approaches to humans (active tameness). Here, we describe detailed protocols for three behavioral tests (active tameness, passive tameness, and stay-on-hand tests) to separately measure the active and passive tameness of mice.

Aktif ve pasif Tameness ayrı olarak farelerde ölçme

Domesticated animals such as dogs and laboratory mice show a high level of tameness, which is important for humans to handle them easily. Tameness has two ...