Method Article
Mikrobobinler kullanılarak ultra yüksek alan manyetik rezonans mikroskobu (MRM) kullanılarak yüksek uzamsal çözünürlükte biyolojik doku çalışması için bir protokol sunulmuştur. Mikrobobinlerin karakterizasyonu için adım adım talimatlar verilir. Son olarak, görüntüleme optimizasyonu bitki kökleri üzerinde gösterilmiştir.
Bu protokol, mr mikroskobu (MRM) olarak da adlandırılan yüksek çözünürlüklü manyetik rezonans görüntüleme (MRG) için tasarlanmış biyolojik numunelerle birlikte solenoidal mikrobobinler için bir sinyal-gürültü oranı (SNR) kalibrasyonu ve numune hazırlama yöntemini tanımlar. Medicago truncatula kök örneklerinde gösterilen pre-klinik MRG spektrometrelerindekullanılabilir. Microcoils, RF rezonatörünün boyutunu ilgi örneğinin boyutuyla eşleştirerek duyarlılığı artırır ve böylece belirli bir veri toplama zamanında daha yüksek görüntü çözünürlükleri sağlar. Nispeten basit tasarımı sayesinde, solenoidal mikrobobinler basit ve ucuz inşa etmek ve kolayca örnek gereksinimlerine adapte edilebilir. Sistematik olarak, bir referans çözümü kullanarak yeni veya ev yapımı mikrobobinlerin nasıl kalibre edilebildiğini açıklarız. Kalibrasyon adımları şunlardır: bir nutation eğrisi kullanarak darbe güç tayini; RF-alan homojenliğinin tahmini; ve standart darbe dizilerini kullanarak hacim normalleştirilmiş sinyal-gürültü oranı (SNR) hesaplanması. Küçük biyolojik numuneler için numune hazırlamada önemli adımların yanı sıra manyetik duyarlılık farklılıkları gibi olası azaltıcı faktörler tartışılmıştır. Optimize edilmiş bir solenoid bobinin uygulamaları, bir kök örneğinin yüksek çözünürlüklü (13 x 13 x 13 μm3, 2,2 pL) 3D görüntülemesi ile gösterilmiştir.
Manyetik rezonans görüntüleme, insandan tek hücrelere kadar çok çeşitli biyolojik numuneleri invaziv bir şekilde görüntülemek için çok yönlü biraraçtır, 1,2,3. Tıbbi görüntüleme uygulamaları için MR-tarayıcılar genellikle 1,5 T ile 3 T alan gücüne sahip mıknatıslar kullanırken, tek hücreli uygulamalar çok daha yüksek alan güçlü1,3,4görüntülenir. 100 mikrometrenin altındaki çözünürlüklerde örneklerin incelenmesine manyetik rezonans mikroskobu (MRM)5denir. Ancak MRM, mevcut diğer mikroskopi veya görüntüleme tekniklerine (örn. optik mikroskopi veya BT) göre düşük sinyal-gürültü oranı (SNR) ile karşılaştırıldığında zarar görür. SNR6'yıoptimize etmek için çeşitli yaklaşımlar izlenebilir. Bir yaklaşım daha yüksek bir manyetik alan gücü kullanmaktır, tamamlayıcı bir yaklaşım ise tek tek numuneler için sinyal dedektörü optimize etmektir. İkincisi için, dedektörboyutları ilgi örneğinin boyutlarına uyacak şekilde ayarlanmalıdır. Çapı ≈0.5-2 mm olan küçük numuneler için (örn. kök dokular), Mikrobobinler, SNR bobin çapı6,7ile ters orantılı olduğu için yararlıdır. Hayvan hücrelerinde 7,8 x 7,8 x 15 μm3'e kadar olan çözünürlüklere özel mikrobobinler kullanılarak ulaşılmıştır8. Mikrocoil türleri çeşitli, düzlemsel ve solenoid bobinler ile en yaygın uygulamave doku geometrisi 9 bağlı olarak kullanılır. Düzlemsel bobinler yüzeyine yakın yüksek hassasiyete sahiptir, bu da ince dilimler üzerindeki uygulamalar için yararlıdır. Örneğin, perfüzyon doku görüntüleme için özel olarak tasarlanmış bir yöntem düzlemsel microcoils10için açıklanmıştır. Ancak, düzlemsel bobinler duyarlılık yüksek bir düşüş ve iyi tanımlanmış referans darbe gücü var. Solenoid bobinler, silindirik olan, uygulama daha geniş bir alana sahip ve daha kalın örnekler için tercih edilir. Burada, solenoid bobinin özelliklerini, mikrocoil MRG için numune ler hazırlamak için bir protokol, hem de bir solenoid mikrobobin kalibrasyonu(Şekil 1A) açıklar.
Solenoid bobin, örneği tutan bir kılcal damarın etrafında bir tirbuşon gibi sarmal bir iletken telden oluşur (Şekil 1B). Mikrobobmontajlar sadece emaye bakır tel, kapasitörler bir ürün yelpazesine ve bileşenleri lehim için uygun bir taban kullanılarak inşa edilebilir(Şekil 1B). En büyük avantajları, birim hacim başına SNR ve B1 alan homojenliği açısından iyi performans özellikleri ile birlikte, basitlik ve düşük maliyettir. Yapı nın kolaylığı, bobin tasarımlarının ve geometrilerinin hızlı bir şekilde yinelanmasını sağlar. Solenoid mikrocoil tasarım ve prob karakterizasyonu(yani, elektronik teorisi, çalışma tezgahı ölçümleri ve bobin geometrileri çeşitli için spektrometre ölçümleri) özel gereksinimleri yaygın başka bir yerde7tarif edilmiştir7 ,11,12,13,14.
Bir solenoid bobin başka bir yerde açıklanan kurallara göre istenilen boyutlar için tasarım kuralları akılda tutarak inşa edilebilir15,16. Bu özel durumda, 1,5 mm dış çapında bir kılcal damar etrafında halkalı, emaye bakır telden yapılmış, 1,5 mm iç çapı ile bir bobin kullanılmıştır. Bu solenoid, bir tuning kondansatör (2,5 pF), değişken eşleşen kapasitör (1,5-6 pF) ve bakır bağlantı tellerinden oluşan bir devrenin yapıldığı taban plakası üzerinde tutulur(Şekil 1A, 1C). Alet kondansatör 950 MHz istenilen rezonans frekansını elde etmek için seçilirken, eşleşen kondansatör 50 Ohm'luk bir empedansta maksimum sinyal iletimini elde etmek için seçilir. Büyük kondansatör, daha hassas bir ayar için değişkendir. Normal operasyonda, sonda tabanındaki kapasitörler kullanılarak atokslama ve eşleştirme yapılır. Monte edilmiş mikrobobinin mıknatısa yerleştirilebilmesi için bir sondaüzerine monte edilmesi gerekir. Sisteme bağlı olarak ek bir tutucu gerekebilir. Burada Bir Micro5 prob ile birlikte bruker Konsol Avance III HD ile 22.3 T mıknatıs kombinasyonu kullanın. Bu durumda, probun 1H kanalına bağlanmak için gerekli bağlantılara sahip değiştirilmiş bir destek kesici uç kullandık (Şekil 1A).
Bobinin duyarlılık la uyumlu tasarımı, bakır bobinin numuneye yakın olması nedeniyle oluşan duyarlılık uyuşmazlıklarını azaltmak için perfluorinated sıvıiçeren bir rezervuar içerir17. Bir rezervuar bobin içine plastik bir şırınga yapılmış ve fomblin ile doldurulmuş. Perflorlu sıvının bobini içine alması gerektiğinden, numunenin mevcut çapı 1 mm dış çapa indirgenir. Numune değişiminin kolaylığı için numune dış çapı 1 mm ve iç çapı 700 m olan bir kılcal damarda hazırlanmıştır. Numune hazırlama için gerekli araçlar Şekil 2A'dagösterilmiştir.
Temel deneysel MR parametreleri, degrade sistemi, alan gücü ve konsol dahil olmak üzere kullanılan sistemin donanımına son derece bağlıdır. Birim hacmi başına 90° darbe uzunluğu ve gücü, B 1-homojenliği ve SNR'ı (SNR/mm3)en uygun olan sistem performansını tanımlamak için çeşitli parametreler kullanılabilir. SNR/mm3 aynı sistem18farklı bobinlerin performansını karşılaştırmak için yararlıdır. Sistemler arasında donanım farklılıkları olsa da, kıyaslama protokolünün tek tip uygulaması da sistem performansının karşılaştırını kolaylaştırır.
Bu protokol kalibrasyon ve numune hazırlama üzerinde duruluyor. Solenoid mikrocoils performansıadım adım karakterizasyonu gösterilir: 90 ° darbe uzunluğu veya güç kalibre; RF- alan homojenliğini değerlendirmek; ve birim hacim başına SNR hesaplanması (SNR/mm3). Bir hayalet kullanılarak standart laştırılmış spin-yankı ölçümü, farklı uygulamaların optimizasyonuna olanak tanıyan bobin tasarımlarının karşılaştırılmasını kolaylaştırmak için tanımlanmıştır. Mikrobobinlere özgü hayalet ve biyolojik numune preparatları tanımlanmıştır. Protokol, ticari olarak kullanılabilen bir mikrogörüntüleme sistemi ile donatılmış uygun dar delikli (≤60 mm) dikey mıknatıs üzerinde uygulanabilir. Diğer sistemler için, bir kılavuz olarak hizmet verebilir ve bazı ayarlamalar ile kullanılabilir.
Mrölçümleri için biyolojik numune hazırlama genellikle çok geniş değildir, çünkü numune mümkün olduğunca sağlam olarak görüntülenir. Ancak, biyolojik dokudaki hava boşlukları manyetik duyarlılık farklılıkları nedeniyle görüntü eserlerine neden olabilir19. Etkisi artan manyetik alan gücü ile artar20. Bu nedenle, hava boşlukları yüksek alan güçlü kaçınılmalıdır, ve bu doku etrafında hava önlemek için bir sıvı içinde örnek daldırma ve doku yapıları içinde hava boşluklarının kaldırılması gerektirebilir. Özellikle, mikrobobinler kullanıldıklarında, istenilen örnek dokunun eksizyonu gerekebilir, ardından uygun bir sıvıya batırılabilir. Bunu, numunenin önceden kesilmiş bir kılcal damara yerleştirilmesi ve son olarak kılcal ağda ile kapama nın izlenmesi takip edilir. Tutkal yerine bir dolgu olarak balmumu kullanarak, alev sızdırmazlık veya alternatifler, örnek kolayca ayıklanabilir anlamına gelir. Bu prosedür Medicago truncatula kökünde gösterilmiştir, küçük bir baklagiller bitki. Bu protokolün bir avantajı, MRI ölçümü sırasında numune yok olmadığından, MR verilerinin optik mikroskopi ile daha sonra birlikte kaydedilmesi potansiyelidir.
Sunulan protokol yerinde ölçümlerde yüksek uzamsal çözünürlük için uygundur ve daha ayrıntılı tasarımlar yaşam destek sistemleriyle ilgili zorlukların ele alınması gereken in vivo numunelerinin görüntülenmesine olanak sağlayabilir.
NOT: Bu protokol, 1,5 mm'lik bir iç çap (ID) solenoid bobinin bobin özelliklerinin kullanımı ve değerlendirilmesi prosedürlerini açıklar (Şekil 1). Protokolü göstermek için kullanılan bobin, duyarlılıkla eşleşen bir rezervuarda bulunur, ancak protokol eşsiz bobinler için de aynı şekilde geçerlidir. Protokol diğer boyutlara ve farklı spektrometre kurulumlarına uyarlanabilir.
1. Referans numune hazırlama
2. Örnek hazırlama
3. Numunenin montajı
4. Bobin özelliklerinin belirlenmesi
5. Yüksek çözünürlüklü görüntüleme
6. Daha fazla çalışma veya depolama için numuneleri geri alma
Bobin Karakterizasyonu
Bir bobinin başarılı bir şekilde ayarı ve eşleşmesi üzerine, performansı Bobin Q-faktörü, 90° referans darbesi ve SNR/mm3ile karakterize edilebilir. Burada gösterilen 1,5 mm ID duyarlılık uyumlu solenoid bobin için, ölçülen Q-factor (boşaltılmış) 244 iken, 5 mm'lik kuş kafesi bobini için 561 mm idi.
Referans 90° darbe 0.6 W güç seviyesinde 12 μs idi; cf. 5 mm'lik kuş kafesi bobini için 45 W'da 5 μs(Şekil 4 ve Şekil 5). Bu bir RF darbe alanı gücü eşittir(B1), mikrobobin için 0.53 mT kullanarak ve 1.17 mT kuş kafesi bobin i için14 y jiromanyetik oranı ise tau darbe süresi. Darbe güç seviyeleri(P)farklı olduğundan, bobinler iletim verimliliği açısından karşılaştırılabilir
: 0.69 mT/W1/2 ve 0.18 mT/W1/2 mikrobobin ve kuş kafesi için sırasıyla14. 90° darbe ile karşılaştırıldığında, mikrobobinin kuş kafesi bobininden 4 kat daha hassas ≈ bir faktör olduğu saptandı.
Duyarlılık eşleştirmesinin etkisi
Ultra yüksek alan mukavemetlerinde, örnek ve bobin duyarlılığı Şekil 7A,7B'degörüldüğü gibi görüntü kalitesi için baskın bir faktör haline gelir. Duyarlılık eşleşen sıvı rezervuarı olmayan bir bobinle karşılaştırıldığında, sinyal referans numunede daha uzun ve daha homojen bir şekilde korunur. Ancak, duyarlılık rezervuarı nedeniyle, maksimum numune boyutları rezervuar olmadan bobin e göre azalır.
Yüksek çözünürlüklü görüntüleme
Bir Medicago truncatula kökü örneğinin 13 x 13 x 13 μm3 yüksek çözünürlüğe 20 saat 23 dakikada ulaşıldı(Şekil 8). Kök yüzeyinden başlayarak, kök korteks, kök dışında bazı artık su ile birlikte görülür. Ayrıca, ksilem phloem çevreleyen karanlık bir bant olarak gözlenir. Bazı hava cepleri tam sinyal kaybı ile karanlık noktalar olarak gözlenir.
M. truncatula simbiyotik kök nodülleri de bu protokol kullanılarak görüntülenebilir(Şekil 9). Biraz daha büyük eşsiz bir bobin (uzunluk yaklaşık 3500 μm, iç çapı 1500 μm) kullanılarak, 33 dakikada 16 x 16 x 16μm'ye kadar çözünürlüğe sahip görüntüler elde edildi.
Şekil 1: Bir solenoid mikrobobin. (A) Solenoid bobin tasarımı tel helically döngülü oluşur, genellikle bir kılcal etrafında sarılmış. Telin kalınlığı, çapı, sargı sayısı ve tel aralığı gibi geometrisi bobin özelliklerini etkiler. (B) Duyarlılık eşleşen sıvı (Fomblin) için bir rezervuar ile ev yapımı solenoid mikrobobin. 0.4 mm kalınlığında, 1500 μm dış çapı ve 3500 μm'lik bobin uzunluğu ile kılcal damar çevresinde altı kez kaplı bakır tel yaradan oluşur. Bobin bir şırınga yapılmış bir rezervuar batırılır. Dış çapı 1000 m'ye kadar olan örnek kılcal damarlar takılabilir. İki kondansatör kullanılır, indüktörlü seri halinde 1.5 pF kondansatör, indüktöre paralel olarak ikinci bir değişken 1.5-6 pF kondansatör yerleştirilir. Tüm bileşenler fiberglas tahtaya (sarı) lehimlenir. Rezervuarı desteklemek için modifiye edilmiş bir ticari tutucuya (gri polimer) monte edilmiştir. (C) Solenoid bobin tasarım bileşenleri: 1. solenoid bobin, 2. örnek kapiller, 3. 1.5 pF alamı kondansatör, 4. değişken eşleşen kapasitör, 5. fiberglas taban plakası, 6. bakır tel yol açar. Bu rakamın daha büyük bir sürümünü görüntülemek için lütfen buraya tıklayın.
Şekil 2: Stereomikroskop altında numune hazırlama. (A) Mikrobobinlerin hazırlanması için gerekli öğeler. Soldan sağa: 1. CuSO4 referans çözümü, 2. perfluorodecalin, 3. mikrobobin, 4. neşter, 5. pozitif gerilim cımbız, 6. cımbız, 7. kılcal damarlar dış çapı = 1000 μm, 8. balmumu kalem, 9. kılcal balmumu, 10. nitril eldiven, 11. stereomikroskop, 12. Petri çanak kapaklı cam izle, 13. büyüme substrat bitki malzemesi. Gösterilmez: Ø 0.8 x 40 mm iğne ve ince mendil kağıt ile 2 mL şırınga. (B) Her ikisi de su altında tutulurken, cımbız kullanarak bir kılcal içine örnek ekleme kapatın. (C) Erimiş balmumu kullanılarak kılcal damarsızlık mühürleme. (D) Hazırlanan kılcal damarın mikrobobinin içine yerleştirilmesi. Bu rakamın daha büyük bir sürümünü görüntülemek için lütfen buraya tıklayın.
Şekil 3: Mikro görüntüleme sondasının bileşeni. (A) Su soğutma, ısıtma, sıcaklık sensörleri, degrade gücü, RF (koaksiyel konektör görünür) ve isteğe bağlı prob tanımlama (PICS) için gerekli tüm bağlantıları içeren Micro5 prob tabanı. Prob tabanının altında, değişken ayar ve eşleşen kapasitörlerin ayarlanmasına olanak tanıyan düğümler ve prob'u spektrometrenin içinde yerinde tutmak için istinat vidaları bulunmaktadır. (B) Sonda tabanının üzerine monte edilen ev yapımı mikrobobin. Ayarı ve eşleştirmeye izin veren prob tabanına monte edilmiş değişken kapasitörlere (beyaz seramik) dikkat edin. (C) Degradenin topraklanması için su soğutma kaprisleri ve altın kaplama kontaklarla sonda tabanına monte edilmiş entegre 3 eksenel degrade. Bu rakamın daha büyük bir sürümünü görüntülemek için lütfen buraya tıklayın.
Şekil 4: Nutation eğrisi. Referans darbe gücünü belirlemek için bir nutation eğrisi elde edilir. Referans darbe gücü (90° darbe) z yönünde mevcut tüm manyetizasyonu enine düzleme çeviren bir B1 alanı oluşturmak için gereken güç ve darbe uzunluğunun birleşimi olarak tanımlanır. Bir dizi darbe degrade kodlama yokluğunda kaydedilir. Her darbe ile, ya darbe uzunluğu veya darbe gücü artımlı. Burada darbe gücü 0,6 W olarak ayarlanırken, darbe uzunluğu her seferinde 1 μ'lık olarak artımlanır. Maksimum sinyal yoğunluğu 90° darbeyi gösterir, yaklaşık 12 μs. 180° darbe de minimum yoğunluk kullanılarak bu şekilde belirlenebilir. Bu rakamın daha büyük bir sürümünü görüntülemek için lütfen buraya tıklayın.
Şekil 5: 90° darbe gücünün görsel tayini. Yaklaşık bir referans darbe gücü bir nutation eğrisi kullanılarak bulunduktan sonra, darbe uzunluğu değiştirilerek görsel olarak kontrol edilebilir. Bobine bağlı olarak, B1 alanı değişikliklere karşı az çok hassas olabilir. (A) 11 μs darbe uzunluğu. (B) 12 μs darbe uzunluğu, bu bobin için en uygun. (C) 13 μs darbe uzunluğu. (D) 20 μs darbe uzunluğu. Darbe gücü çok yüksek ayarlanırsa, aşırı devrilme oluşabilir, böylece bobinin (ok ucu) merkezindeki görüntü yoğunluğunu azaltır. Artan B1 alanı, görüntünün genişliğinde de görülebileceği gibi bobinin menzilini de artırır. Bu rakamın daha büyük bir sürümünü görüntülemek için lütfen buraya tıklayın.
Şekil 6: İlgi Alanı yerleşimi. Normalleştirilmiş snr hesaplaması için ilgi bölgeleri (YG) görülebilir. Ortalama örnek yoğunluğu, referans çözüm numunesi içine giren bir YG'den alınır. Ortalama gürültü ve standart sapma, görüntünün köşelerinde bulunan bir veya daha fazla YG'den hesaplanır. Bu rakamın daha büyük bir sürümünü görüntülemek için lütfen buraya tıklayın.
Şekil 7: Gradyan eko görüntüleme ile değerlendirilen RF homojenliği. Bir dizi degrade yankısı kullanarak RF(B1 -Alan) homojenliğini değerlendirmek için birden fazla degrade yankı (MGE) dizisi kullanılır. Temel parametreler: tekrarlama süresi 200 ms, yankı süresi 3.5 ms yankı sayısı 48, yankı aralığı 3.5 ms, 64 ortalamalar, edinme süresi 27 m 18 s, çevirme açısı 30°. Görüş alanı 5 x 5 mm, matris 128 x 128, çözünürlük 39 x 39 x 200 μm.(A) Duyarlılık-uyumlu bobin. RF bobinini çevreleyen duyarlılık eşleştirme sıvısı (Fomblin) bobin teli nedeniyle duyarlılık etkilerini azaltır. Yankı süresi arttıkça küçük hava kabarcıkları sinyal kaybına neden olur. (B) Eşit bobin çapına sahip bir bobin (duyarlılık eşleşmez). Daha uzun yankı zamanlarında, B0 alan inhomogeneity neden artan eserler gözlenmektedir. Bu rakamın daha büyük bir sürümünü görüntülemek için lütfen buraya tıklayın.
Şekil 8: Medicago truncatula kök bölümünün 3boyutlu görüntülemesi. (Üst) FLASH görüntü. Epidermis (e), korteks (c), phloem (ph) ve ksilem (ksy) dahil olmak üzere kök bölümünün çeşitli özellikleri ayırt edilebilir. Kökteki hava cepleri (a) tam sinyal kaybına neden olur. Temel parametreler şunlardır: Tekrarlama süresi 70 ms, yankı süresi 2.5 ms, 256 ortalamalar, edinme süresi 20 h 23 m. Çözünürlük 13 x 13 x 13 μm3. Matris boyutu 128 x 64 x 64 ve görüş alanı 1.6 x 0.8 x 0.8 mm idi. Alıcı bant genişliği 50 kHz. (Alt) MSME görüntüsü. Temel parametreler şunlardır: Tekrarlama süresi 500 ms, yankı süresi 5.2 ms, 28 ortalama, kazanım süresi 15 h 55 m. Çözünürlük 13 x 13 x 13 μm3. Matris boyutu 128 x 64 x 64 ve görüş alanı 1.6 x 0.8 x 0.8 mm idi. Alıcı bant genişliği 70 kHz. Bu rakamın daha büyük bir sürümünü görüntülemek için lütfen buraya tıklayın.
Şekil 9: Medicago truncatula kök nodülünün 3boyutlu görüntülemesi. (Üst) Düşük çözünürlüklü görüntü. Temel parametreler şunlardır: Tekrarlama süresi 60 ms, yankı süresi 2.3 ms, 4 ortalama, edinme süresi 4 m. Çözünürlük 31 x 31 x 31 μm3. Matris boyutu 64 x 32 x 32 ve görüş alanı 2 x 1 x 1 mm idi. Alıcı bant genişliği 50 kHz. (Alt) Yüksek çözünürlüklü görüntü. Temel parametreler şunlardır: Tekrarlama süresi 60 ms, yankı süresi 2.3 ms, 8 ortalama, edinme süresi 33 m. Çözünürlük 16 x 16 x 16 μm3. Matris boyutu 128 x 64 x 64 ve görüş alanı 2 x 1 x 1 mm idi. Alıcı bant genişliği 50 kHz. Bu rakamın daha büyük bir sürümünü görüntülemek için lütfen buraya tıklayın.
Birçok malzeme ve jeolojik numune, burada kullanılan diziler tarafından görüntülenemez önemli ölçüde kısa T2 gevşeme süreleri olduğundan, bu protokol biyolojik numuneler için en uygun olanıdır. Hatta bazı biyolojik dokular, hangi yüksek örnek manyetik duyarlılık heterojenite sergileyen, etkileri alan gücü 24 ile ilişkili olarak ultra-yüksek alanda görüntü zor olabilir24. Protokol sadece yeni bobinler için yararlı değil, aynı zamanda sorun giderme ve potansiyel sorunların tanısında yardımcı olabilir. Yeni veya bilinmeyen örnekleri sınarken, bu protokol, deneme kurulumunun belirtimlere göre çalıştığını doğrulamak için başvuru çözümü üzerinde önceden gerçekleştirilebilir. Spektrometre yapıtve arıza kaynağı olarak dışlanabileceğinden, sorun gidermede bu yardımcı olur. Buna ek olarak, bu, prob üzerindeki ayar ve eşleşen kapasitörleri mikrobobin için tipik değerlere ayarlar.
İlk denemede sinyal kaydedilmezse, yerelleştirici scan'ın görüş alanı büyütülebilir ve numunenin görülip görülmediğini kontrol eder. Ardından, bobinin doğru ayarlanıp ayarlanıp ayarlatılolmadığını yeniden kontrol edin ve başka bir yerelleştirici tarayıp denemeyi deneyin. Bobinin ek istenmeyen rezonans modları sergilemesi mümkündür, bu durumda doğru olanın belirlenmesi gerekir. Hala görüntü elde edilenemezse, mikrobobin tertibatıiçindeki konumunu kontrol etmek için numuneyi çıkarın ve numunenin sağlam olduğunu doğrulayın (örn. mühürlerde hava kabarcığı veya sızıntı yok). Son olarak, pfd yerine su ile bir örnek hazırlanabilir. Numunenin lokalize tbmada çok az tespit edilebilir sinyal vermesi durumunda, kılcal damardaki su hala tespit edilebilir.
Mikrobobinler ideal olarak örneğe çok yakın olduğundan, hava ve tel arasındaki manyetik duyarlılık farkları Şekil 7B'degörüldüğü gibi ek sinyal kaybına neden olabilir. Potansiyel eserler mekansal yanlış haritalama ve anormal sinyal yoğunluğu değişimi içerir. Özellikle degrade-eko tipi darbe dizileri bu tekdüze olmayan sinyal kaybından etkilenir. Bu nedenle, florinert sıvı (Fomblin veya FC-43) tel batırarak, bir duyarlılık eşleşen bobin sundu. Bu protokolde yer alan B1 tahmin yöntemi, B1 duyarlılık farklılıklarının bobin tertibatının tasarımına duyarlılık eşleştirme stratejilerinin dahil edilmesini gerektirip gerekmediğini belirlemeye yardımcı olabilir. Bir duyarlılık uyumlu bobin oluşturmak için alternatif bir yaklaşım duyarlılık eşleşen telkullanmaktır 25. Ayrıca, sadece bobin nedeniyle duyarlılık sorunları bu yaklaşım ile ele alınmaktadır. Numunenin içindeki duyarlılık uyuşmazlıkları (örn. hava boşlukları nedeniyle) zorlu olmaya devam eder.
Hava cepleri veya kabarcıklar, hava nın ve sıvı nın veyanumunenin arabirimindeki duyarlılık farklılıklarının neden olduğu kapsamlı sinyal kaybına neden olan deneysel bir sorun teşkil eder(Şekil 5A). Başarılı numune hazırlamanın kritik bir yönü hem numunenin hem de kapillerin batırışıdır. Ancak, küçük kabarcıklar bile, özellikle degrade yankı türü dizileri için sinyal kayıplarına neden olabilir. Mobil hava kabarcıkları, numuneyle temas edene kadar kılcal damardan geçebilirler. Bu etkilerden bazıları kılcal damarı hafifçe yatırarak hafifletilebilir, böylece bir ucu diğerinden daha yüksektir. Eğim, numuneyi rahatsız etmeden potansiyel hava kabarcıklarının üst uçta yerinde tutulmasını sağlar. Dehidratasyon büyük hava kabarcıkları oluşturmak için neden olabilir gibi, kılcal balmumu iyi bir mühür formları kontrol etmek de önemlidir.
Numunenin içindeki hava boşlukları için, PFD hücre zarlarını delmezken hücreler arası hava alanlarını doldurmak için kullanılmıştır26. Ancak, bu yaklaşımla bile, tüm hava alanlarını kaldırabildik. Ayrıca, bu yaklaşım biz genellikle mümkün olduğunca noninvaziv bir sistem çalışma arzusu nedeniyle tercih edilmez ek bir ajan, ihtiyaç anlamına gelir.
Kılcal damarların silindirik şekli, perfüzyon kurulumlarının özellikle biyopsiler veya canlı kök materyalindeki çalışma süreçleri gibi çürümeye karşı savunmasız dokular için uygun olması gerektiği anlamına gelir. İki adım bir perfüzyon kurulum fark edebilirim. İlk olarak, bir orta yem tüpü yanı sıra kılcal bir drenaj tüpü bağlamak bir chemostat oluşturmak için yeterli olacaktır. İkinci olarak, örnek kılcal damarına bir girintineklenmesi, numuneyi akış yönüne karşı yerinde tutabilir. Bu düzlemsel microcoils10için yayınlanan bir protokol benzer.
MR görüntülemenin noninvaziv yapısı, bu protokolde kullanılan inert sıvı ile birlikte (PFD veya Fomblin) deneylertamamlandıktan sonra, numuneler daha fazla çalışma için kılcal damarlarından çıkarılabilir anlamına gelir. Kombinasyonlar optik veya elektron mikroskobu ve diğer yıkıcı görüntüleme tekniklerini içerir. Son zamanlarda Medicago truncatula kök nodülleri27optik mikroskopi ile bir arada göstermiştir.
Biz ultra-yüksek alan NMR spektrometre üzerinde özel mikrobobinler kullanarak bitki materyalgörüntüleme için bir yöntem göstermiştir. Nispeten büyük numune hacimleri iyi RF homojenliği ile yüksek çözünürlükte incelenebilir. Ayrıca, spektroskopik görüntüleme başka türlü mümkün olandan daha yüksek çözünürlüklerde yapılabilir. Mikrobobin tasarımının numunelere uyarlanması, bobin performans özelliklerini belirlemek için etkili bir yöntemle kolaylaştırılır. Solenoid bobin yaklaşımı da kolayca hayvan dokusu da dahil olmak üzere bitkiler dışında diğer örnekler, uygulanabilir.
Yazarların açıklayacak bir şeyi yok.
950 MHz'lik cihazdaki deneyler, Hollanda'nın NWO tarafından finanse edilen Ulusal Yol Haritası Büyük Ölçekli Tesisi uNMR-NL tarafından desteklendi (proje 184.032.207). R.S. BioSolarCells konsorsiyum projesi U2.3 tarafından desteklendi. J.R.K. Hollanda Manyetik Rezonans Araştırma Okulu (NMARRS) lisansüstü okulu [022.005.029] tarafından desteklendi. Medicago truncatula örneklerini sağladıkları için Defeng Shen ve Ton Bisseling'e teşekkür ederiz. Klaartje Houben, Marie Renault ve Johan van der Zwan'a uNMR-NL tesisinde teknik destek için teşekkür ederiz. Ayrıca Volker Lehmann, Henny Janssen ve Pieter de Waard'a teknik yardım için teşekkür ederiz. Frank Vergeldt, John Philippi ve Karthick B. Sai Sankar Gupta'ya tavsiyelerinden dolayı şükranlarımızı sunuyoruz. Son olarak, jessica de Ruiter'e videonun seslendirmesini sağladığı için teşekkür ederiz.
Name | Company | Catalog Number | Comments |
Reference solution preparation | |||
CuSO4 | Sigma-aldrich | 469130 | Crystalline powder for creating reference solution |
D2O | Sigma-aldrich | 151882 | Liquid used to prepare reference sample |
Weigh Scale | Sartorius | PRACTUM513-1S | Scale for weighing compounds |
Sample preparation | |||
Capillary 1000 μm (Outer diameter) | Hilbenberg GmbH | 1408410 | Sample capillaries |
Capillary wax | Hampton Research | HR4-328 | Solid wax used to seal samples |
Disposable Scalpel | Swann-Morton | No. 11 | Used to excise samples |
Perfluorodecalin | Sigma-aldrich | P9900 | Liquid used for submerging sample |
Stereo Microscope | Olympus | SZ40 | Tabletop binocular microscope |
Syringe | Generic | - | Used to apply PFD and manipulate the sample |
Vacuum Pump | Vacuubrand | MZ2C | Two-stage membrane vacuumpump used for removing air pockets from samples. |
Wax pen | Hampton Research | HR4-342 | Handheld wax pen used to melt and apply capillary wax to samples |
Imaging Hardware | |||
22.3 T Magnet | Bruker GmbH | 950 US2 | Narrowbore superconducting magnet |
Air cooler | Bruker GmbH | - | Used to regulate probe temperature |
Console | Bruker GmbH | Avance III HD | Controls operation of the spectrometer |
Micro5 gradient coils | Bruker GmbH | Mic5 | Removable gradient coils mount on the Micro5 probe body |
Micro5 Probe body | Bruker GmbH | Mic5 | Holds microcoils and gradient coils |
RF microcoil | Home-built | - | contains Fomblin |
Vector Network Analyzer | Copper Mountain Technologies | TR1300/1 | Used to perform S11 reflectance test, frequency range 300kHz to 1.3 GHz |
Water cooler | Bruker GmbH | BCU-20 | Open loop watercooling to dissipate heat from gradient coil operation. |
Bu JoVE makalesinin metnini veya resimlerini yeniden kullanma izni talebi
Izin talebiThis article has been published
Video Coming Soon
JoVE Hakkında
Telif Hakkı © 2020 MyJove Corporation. Tüm hakları saklıdır