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Nanyang Technological University

Ultralow genoma entrada biblioteca preparação de um único espécime Tardigrade de sequenciamento

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9.4K Views

•

10:28 min

•

July 15th, 2018

DOI :

10.3791/57615-v

July 15th, 2018

•

Yuki Yoshida¹^,², Sayuri Konno¹^,³, Ryousuke Nishino¹^,³, Yumi Murai¹^,³, Masaru Tomita¹^,²^,³, Kazuharu Arakawa¹^,²^,³

¹Institute for Advanced Biosciences, Keio University, ²Systems Biology Program, Graduate School of Media and Governance, Keio University, ³Faculty of Environment and Information Studies, Keio University

Resumo

Contaminação durante o sequenciamento de genoma de organismos microscópicos continua a ser um grande problema. Aqui, nós mostramos um método para sequenciar o genoma de um Tardigrada de um único espécime com tão pouco quanto 50 pg de DNA genômico sem amplificação do genoma inteiro para minimizar o risco de contaminação.

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Ultrabaixa entrada

livre de contamina o

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0:00

Title

1:11

Sample preparation and contaminant exclusion

2:10

Homogenization and DNA extraction

4:41

Sequencing library construction

5:48

Purification of the PCR reaction

6:19

DNA quality check and quantification, and sequencing

7:43

Sequencing of the DNA library

8:02

Representative results

9:35

Closing remarks

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