Maximilian Boesch는 Austrian Science Fund FWF의 Erwin Schrödinger Fellows (승인 번호 J-3807)의 지원을받습니다.

이 프로토콜은 표준 기관의 윤리적 검토위원회 지침을 완전히 준수합니다. 여기에 묘사 된 프로토콜을 사용하여 인간 또는 동물 조직을 조사하는 경우 연구자는 해당 기관 또는 국가의 관련 검토위원회의 승인을 받아야합니다. 주의 : 생물학적 시료의 안전한 취급에 대한 표준 예방 조치가이 프로토콜에 적용됩니다. 여기에는 장갑과 실험복을 착용하고 가능한 한 바이오 안전성 캐비닛 아래에서 작업을 수행하는 것이 포함됩니다. 1. 세포의 준비 <ol><li> 암 세포주 <ol><li> 적절한 매체 ( 예 : 10 % ( V / V ) FBS, 2 MM L - 글루타민과 1x 페니실린 / 스트렙토 마이신으로 보충 RPMI 1640) 10-30 ML 37 ° C에서 각각의 인간 또는 마우스 암 세포주를 문화와 수확 0.05 % 트립신 -EDTA 또는 다른 일부 de-att로 소화를 사용하는 아 집단 ( 즉, 70-90 %)에서의 세포감사 절차. 카운팅 챔버와 트리 판 블루 얼룩을 사용하여 세포 수를 결정하고 생존력을 확인하십시오. 생존 세포의 비율은 85 %를 초과해야합니다. 참고 : SP 구획을 ​​포함하는 인간 암 세포주의 예에는 MCF7 / HTB-22 및 SKBR3 / HTB-30 (유방암), A2780 및 SKOV-3 / HTB-77 (난소 암) 및 A549 (폐암) 26이 포함 됩니다. </li></ol></li><li> 생체 외 종양 조직 <ol><li> 신선한 외과 종양 표본을 가져 가거나 또는 이식 가능한 또는 유 전적으로 조작 한 마우스 종양 모델에서 종양 조직을 수확하십시오. 200-1,000 mg의 조직을 가져 와서 기계적 분해 ( 예 : 가위 또는 메스 사용) 및 효소 분해 ( 예 : collagenase / dispase / DNase 칵테일 사용)를 통해 단일 세포 현탁액을 생성하십시오. </li><li> 샘플을 70 μm 컷오프 여과기로 여과하십시오. 셀 수를 결정하고 카운팅 챔버 및 트리 팬 (trypan)을 사용하여 생존력을 확인하십시오ue 염색법. 참고 : 소화 칵테일에는 종종 200 μg / mL 콜라게나 제 P, 0.8 U / mL 디스 패제 및 25 μg / mL DNase I가 포함되며 배양 시간은 일반적으로 20 - 50 분 사이입니다. 이상적으로, 조직 분해는 조사중인 조직에 대해 최적화 된 프로토콜 27 , 28 , 29에 따라 수행 됩니다. </li></ol></li></ol> 2. 샘플 테스트 <ol><li> 신선한 배지에서 세포 농도를 1 x 106 세포 / mL로 조정하십시오 (염료 압출은 활성 에너지를 소비하는 과정에서 중요합니다). 마지막으로, 1mL의 샘플을 일반 유동 세포 계측법 / FACS 둥근 바닥 튜브 ( &#39;테스트&#39;로 표시)로 옮긴다. 참고 : 최적의 결과를 얻으려면 세포 농도를 적정해야합니다 (예 : 5 x 10 5 -1 x 10 6 -2.5 x 106 세포 / mL). 그러나보다 낮은 세포 농도더 높은 해상도 19 . 최대 수의 SP 세포가 회수되어야하는 분류 용도에 대해서만 세포 농도를 1 x 107 세포 / mL까지 증가시키는 것이 좋습니다. </li><li> 10 μM의 DCV를 샘플에 첨가하고 부드럽게 볼 텍싱하거나 3 ~ 5 배 재현하여 잘 섞는다. 억제 컨트롤로 진행하십시오. 참고 : 최적의 결과는 트리거링 염료 (예 : 2.5; 5; 10; 20 μM)의 적정에 따라 달라질 수 있지만 일반적으로 염료 농도가 높을수록 해상도가 더 높아집니다. </li></ol> 3. 억제 컨트롤 <ol><li> 염료 함유 세포 현탁액 250 μL를 새로운 유동 세포 계측법 / FACS 둥근 바닥 튜브 ( &#39;대조군&#39;으로 표시)에 옮긴다. 50 μM의 verapamil 또는 20 μM의 FTC를 첨가하고 pipetting으로 잘 섞는다. 참고 : Verapamil과 FTC는 SP 분석을 위해 가장 잘 확립 된 억제제이지만 다른 유출 펌프 특성y : 베라파밀은 ABCB1과 ABCB5를 포함한 몇 가지 ABC 약물 전달체를 억제하는 반면, FTC는 ABCG2 6 , 19 에 특이 적이다. 개별 샘플의 SP 상태가 알려지지 않은 경우 별도의 튜브에서 verapamil과 FTC를 모두 사용하는 것이 좋습니다. </li></ol> 4. 염색 <ol><li> &#39;테스트&#39;및 &#39;컨트롤&#39;튜브를 모두 막아서 37 분간 37 ° C에서 어두운 곳에서 90 분 동안, 15 분마다 부드럽게 교반하십시오. SP 세포에서 염료 압출의 대부분은 처음 45 분 이내에 발생하지만 비 SP 세포 (해상도에 기여)의 염료 축적은 75-90 분 19 후에 최대입니다. </li><li> 얼룩이 완료되면, 3-4 ML 얼음으로 차가운 PBS에 세포를 씻어 100 μL (PBS뿐만 아니라)의 볼륨에 펠렛을 resuspend. 세포를 어둠에 보관하고 얼음 위에서 식힌 다음 추가 마커를 염색합니다. 또는 직접적으로 flow cytometric ana를 수행하십시오용해. </li></ol> 5. 다른 마커에 대한 비용 <ol><li> DCV - 스테인드 세포에 fluorochrome - 복합 항체의 원하는 패널을 추가 잘 혼합하고 4 ~ 20 분 동안 암흑에서 C를 품어. 3 - 4 ML 얼음으로 차가운 PBS에 세포를 씻어 죽은 세포 차별로 진행합니다. 참고 : DCV와 쉽게 호환되고 보상을 필요로하지 않는 항체는 PerCP 또는 PerCP-Cy5.5, PE-Cy7, APC, Alexa Fluor 647, APC-Cy7, APC-H7, BV711, Alexa Fluor 750 및 BV786 . DCV와 호환되지만 보상이 필요할 수있는 형식에는 FITC, Alexa Fluor 488, PE 및 BV650이 포함됩니다. 사실상 DCV와 호환되지 않는 형식으로는 BV421, V450 및 V500이 있습니다. </li><li> 특정 제조 업체가 권장하는 농도로 DCV로 염색 된 세포에 7-AAD (또는 PI)를 첨가하고 어둠 속에서 5 ~ 10 분 동안 표본을 품을 수 있습니다. 70 μm 컷 - 오프 strainers 통해 샘플을 필터링하고 흐름 cytometric 분석을 진행합니다.</li></ol> 6. 플로우 사이토 메트릭 분석 참고 : 샘플 준비가 완료되는 즉시 모든 염색계가 설정되도록 염색 과정 중에 각 유세포 분석기를 켜는 것이 좋습니다. 여기에는 시스템 성능 추적 및 탱크 재충전과 같은 표준 유지 관리 절차도 포함됩니다. <ol><li> 유동 세포 계측기에서 세포를 취득하고 bivariate FSC / SSC 도트 플롯 (그림 1B)에서 그들을 게이트. FSC의 다른 신호 ( 즉, 높이, 너비, 면적)를 비교하여 doublets 및 aggregates를 제외합니다 (그림 1C). <ol><li> 죽은 세포 마커가 포함 된 경우, 생존 가능한 세포 분획 ( 예 : 7-AAD- 음성)에 게이트가 삽입됩니다 ( 그림 1D ). &#39;파란색&#39;및 &#39;빨간색&#39;DCV 방출에 대해 이중 변이 점 그림에서 생존 가능한 단일 세포를 시각화합니다. 이를 위해 y 축 ( 예 : 450/50)에 &#39;파란색&#39;형광 채널을 표시하고 &#39;적색 &#39;형광 채널 ( 예 : 525/50). </li><li> 두 채널을 선형 모드로 전환하고 SP가 왼쪽 하단 사분면의 플롯 측면 에 위치하도록 검출기 전압을 그에 따라 조정합니다. 반대로, non-SP는 세포주기 분포 (G1 및 G2)를 반영하는 플롯의 오른쪽 위 사분면에 위치합니다. SP를 게이트하고 획득을 중지하십시오 ( 그림 1E ). 참고 : DCV 정의 SP 세포는 보라색 레이저 여기 소스 ( 예 : 405 nm 레이저 라인)가 장착 된 유동 세포 계측기를 사용하여 감지 할 수 있습니다. 방출 된 형광은 선형 모드와 2 변수 도트 플롯에 표시된 2 개의 개별 채널에서 측정되는 것이 SP 분석의 특유한 것입니다. DCV의 &#39;청색&#39;방출은 약 450 nm에서 측정되며 ( 예 : 450/40 표준 필터로 측정) DCV의 &#39;적색&#39;방출은 약 510-585 nm에서 측정됩니다 ( 예 : 510/50, a 525/50 또는 585/15 필터) 19 . 분석의 특수한 화학적 특성으로 인해 SP와 비 SP 세포 사이의 분리는 일반적으로 &#39;적색&#39;형광 채널 19 에서 더 높습니다. </li></ol></li><li> 금지 컨트롤을로드하고 데이터를 획득하십시오. SP 세포는 이제 사라 졌거나 실질적으로 감소되었습니다 ( 그림 1F ). 필요한 경우이 데이터를 기반으로 SP 게이트를 수정하십시오. </li><li> SP 세포에 의한 표면 마커 발현을 조사하기 위해, x 축 상에 DCV의 &#39;적색&#39;형광을 남겨두고 대수 모드 ( 예 : APC)에서 y 축 상에 각각의 형광 채널을 표시한다. 대응 검출기 전압을 조정하고 연구 마커 (들) ( 그림 1G )에 대한 긍정적 인 얼룩이 SP 세포의 분율을 게이트. SP 세포에 의한 특정 마커의 동시 발현은 플롯 30 의 좌측 상부 사분면에서 각각의 신호를 산출한다. </li><li> 기록데이터를 수집 및 / 또는 정렬 할 수 있습니다. </li></ol>

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저자는 선언 할 이해 관계가 없습니다. 원고 작성에는 비 저자가 개입하지 않습니다.

암의 임상 관리의 진행은 또한 CSCs를 타깃으로하는 치료 양식 개발에 달려있다. 생물학적 시료로부터 CSCs의 신뢰성있는 분리를 가능하게하는 방법은 적합한 표적의 동정을 가속화 할 것이므로이 노력에서 매우 중요합니다. SP 분석은 ABC 약물 전달체를 발현하는 CSC 집단을 확인하기위한 확립되고 가치있는 기술이며 DCV의 구현은 표준 유동 세포 계측 도구에 대한 적용 가능성을 확장 시켰습니다. 기계적으로, SP 구별은 ABC 약물 전달체에 의한 활성 염료 유출을 이용하여 낮은 형광에 기초한 CSC를 검출하여 대응하는 비 SP에 잔류하는 꼬리의 측면 에서 특징적인 위치 파악을 수반한다. 중요한 것은 DCV 기반의 SP 검출은 강력하고 직접적인 방법으로 가장 중요한 단계는 (i) 세포 준비 (ii) 염색 과정 (iii) 적절한 억제제 선택(iv) 유동 세포 계측 분석. 염료 압출은 활성 에너지를 소비하는 과정이기 때문에 특히 좋은 세포 생존력으로 시작하는 것이 적절합니다. 생존 가능한 (약물 전달체 - 발현) 세포 만이 SP를 생성 할 수있다. 또한, 염료 농도와 세포 밀도 사이의 비율을 최적화하여 SP 세포의 분리를 향상시키는 것이 종종 의미가 있습니다 (차례로 이것은 DCV와 세포의 적정을 필요로합니다). 일반적으로 염료 농도가 높고 세포 농도가 낮 으면 분리가 개선됩니다. 성공적인 DCV 실험의 핵심은 ABC 약물 전달체 활성의 약리학 적 억제제를 사용하여 SP의 기능 검증입니다. 앞에서 언급했듯이 verapamil과 FTC는 SP 분석을위한 가장 확실한 억제제 중 하나이며 다른 펌프 특이성을 가지고 있습니다 (FTC는 ABCG2에 특화된 반면 verapamil은 여러 펌프를 억제합니다). SP 상태가 알려지지 않은 샘플의 경우,억제제. 또 다른 방법은 pan-ABC 약물 전달체 억제제 인 reserpine 4를 사용하는 것 입니다. 그러나 연구원은이 화합물의자가 형광이 잠재적으로 DCV 신호에 간섭 할 수 있다는 것을 알아야합니다 19 . 세포가 청색 및 적색 DCV 방출에 대해 분석되면 검출기 전압을 조정하여 두 개체군 ( 예 : SP 및 비 SP)이 최대 간격으로 보일 수 있도록해야합니다. 그림이 이상하게 보일 경우 대수 스케일링이 이유가 될 수 있습니다 (이 경우 두 채널을 다시 선형 모드로 전환). 또한 DCV 기반 SP 분석법은 암에 특이 적이 지 않으며 원래 암 종양에 응용하기 위해 개발 된 것도 아니라는 점에 유의해야합니다. 대신 ABC 약물 전달체에 특이적이고 따라서 혈통과 같은 생리 학적 (조직) 줄기 세포의 검출 및 분리를 촉진합니다 - Sca-1 + c-kit +조혈 모세포 25 . 또한, 중요한 신체 부위에 전용 장벽을 설정하는 차별화 된 세포 유형도 SP 특성을 나타낼 수 있습니다 20 . 따라서 DCV 기반 SP 검출을 일차 조직에 적용하는 것은 적절한 마커를 사용하여 표적 세포 집단의 특정 식별을 요구합니다. CSC 집단 9 , 23 중 약물 유출 펌프의 높은 보전 측면에서 볼 때, DCV 기반 SP 검출은 광범위하게 적용될 수 있는데, 이는 다른 세균층 원산지 9 , 17 , 18 . 다른 이점으로는 (i) 약물 내성에 직접적인 관련이있는 세포가 확인된다. (특히 질병과 관련된 암세포 부분의 태클에 중요하다.(ii) 정적 인 매개 변수가 아닌 기능적 매개 변수의 검출이 더 많은 분석 특이성을 부여하고 결의 19,31,32를 향상시킬 수 있다는 것을 의미한다. 개념적 / 기술적 측면에서, DCV 기반 SP 검출은 항체 매개 염색과 분명히 구별된다 : (i) 표적 구조는 세포 내 국소화를 나타내며 단백질이 아닌 핵산을 나타낸다. (ii) 분석은 단순히 존재 또는 밀도가 아니라 단백질 활동을 감지합니다. (iii) 표적 세포는 양성 신호가 아닌 낮은 형광성으로 정의된다. (iv) DNA 결합 염료로서, DCV는 얼룩 동안 세포 또는 염료 농도의 약간의 변화에도 민감합니다 19 . (v) DCV 형광은 대수적이지 않고 선형 모드에서 측정됩니다. (vi) DCV 형광 ( 즉 단일 형광 단에 의해 생성 된 형광)은 두 개의 분리 된 채널, 즉 n단일 파장 범위에서. 이러한 특성에도 불구하고 DCV 기반 SP 분석은 수행하기 쉽고 분명히 CSC 연구를위한 유동 세포 계측 도구 상자를 확장합니다. DCV 기반의 SP 분석은 기존의 항체 매개 표면 염색 (다양한 포맷이 가능함) 및 ALDH 효소 활성을 검출하는 상업적 분석과 호환되는 다른 마커에 대한 비용 절감을위한 많은 가능성을 제공합니다. 그러나 여기서 우리는 표면 염색에 초점을 맞추었고 독자는 ALDH 활성의 동시 검출에 관한 방법 론적 세부 사항을보기 위해 출판 된 문헌 4 를 참고했다. 어쨌든, DCV 유발 SP 분석은 죽은 세포 차별과 결합되어야하며이 목적을위한 명백한 시약은 7-AAD 및 PI입니다. 참고로, DCV 정의 SP 세포 (및 비 SP 대조군 세포)는 해당 유동 세포 계측 도구의 분류 적용을 사용하여 실시간으로 정화 될 수 있습니다. SP 분석은 기능적 PA를 검출하기 때문에생존 가능한 세포 만 생산할 수있는 람 라머 (rameter)는 회수 된 SP 세포의 생존 가능성이 일반적으로 높을 것으로 예상된다 (때로는 대략 100 %). 그럼에도 불구하고 정렬 후 생존 가능성에 문제가 있다면 분류기 노즐의 크기, 완충제의 성질, 분류 중 온도와 같은 다른 기술적 인 매개 변수를 확인할 수 있습니다 (70μm 노즐을 사용하여 결코 문제가 없었 음) 생존력, 그러나 더 큰 노즐은 여전히 ​​매우 섬세한 세포에 도움이 될 수 있음). 회수 된 세포는 qRT-PCR, 웨스턴 블 랏팅 및 전체 발현 프로파일 링 ( 예 : 유전자 배열 또는 최신 RNASeq 기술 사용)과 같은 하류 분석을받을 수 있습니다. 또한, 분리 된 SP 세포는 기능적 줄기 세포 특성 ( 예 : 단일 세포 클론 성 및 연속 이식)에 대해 조사되거나, 9 개월 동안 안정한 풍부하거나 심지어 순수한 SP 세포의 세포주를 확립하기 위해 계대 배양 될 수있다. 우리의우리는 DCV로 정의 된 CSCs 9 를 부분 배양하기 위해 정상적인 배양기와 일반 2D 플라스틱 플라스크를 사용했지만 고정 배양 / 3D 배양 조건 및 특수 배지와 같은 줄기 세포 선택 양식 또한 가능할 것입니다. 우리는 주어진 SP 구획의 시험 관내 확대를위한 가장 유리한 조건은 개별적으로 검사 할 필요가 있다고 제안한다. 요약하면 DCV 기반 SP 분석을 통한 CSC 식별 / 격리의 상세한 실험 작업 흐름을 보여줍니다. 우리의 논문은 CSC 연구원들이 자체 실험실에서이 유용한 방법을 구현하고 확립하는 것을 도울 것이며 암의 임상 관리 개선을위한 치료 용 항 -CSC 전략의 해설을 더욱 촉진시켜야한다.

1 차 암 치료법의 효능은 질병의 유전 및 분자 이해의 진보와 치료 용 항체 및 소분자 억제제와 같은 표적 약물의 출현으로 인해 지난 10 년 동안 상당히 향상되었습니다. 대조적으로, 전이성 및 재발 성 질환은 여전히 ​​치료가 불가능하고, 이환률 및 사망률은이 임상 환경에서 여전히 높습니다. CSCs는 종양 내의 분명한 하위 집단을 대표하고 clonogenicity / tumorigenicity, 다중 약물 저항 및 비대칭 세포 분열과 같은 표준 줄기 세포 특성을 부여받습니다. 따라서 CSC는 전이성 진행과 종양 이질성을 촉진 할뿐만 아니라 환자가 재발하는 경향이있는 치료 중에도 지속됩니다. 그러므로 치료 CSC 제거는 질병 재발을 예방하고 암의 장기 치료를 가능하게하는 중요한 의학적 필요성이다. </sup&gt;. 취약성 식별 및 CSC 퇴치 전략의 설명은 후속 발현 프로파일 작성 및 / 또는 기능 조사를 위해 생물학적 샘플로부터 정제 할 수있는 방법에 크게 의존합니다. 차례로, 그러한 방법은 이들 세포에 특이적인 표면, 세포 내 또는 기능성 마커에 의존한다. CSC 특이적인 표면 마커는 CD44, CD133, CD24 및 CD90을 포함하지만 이에 국한되지 않고 유방암 및 대장 암을 포함한 다양한 종양 개체에서 CSC 개체군을 확인하는 데 사용되었습니다. 또 다른 마커, 알데히드 탈수소 효소 (ALDH)는 세포 내 국소화를 보여 주며 효소 전환이 빛을 생성하는 각각의 기질을 제공하여 기능적으로 검출 될 수 있습니다. 이 검사를 사용하여 CSC 집단은 다양한 종양 개체에서도 확인되었습니다. 일반적으로 SP 분석이라고도하며 여기에서 묘사 된 보완적인 방법<html> ethodological 세부 정보, 형광 염료 줄기 같은 세포의 작은 인구를 식별하는 ABC 약물 전송에 의한 활성 염료 유출을 활용 6 , 7 , 8 . 이를 위해, 주어진 샘플을 수동 확산을 통해 모든 세포로 들어가는 친 지질 성 DNA 결합 형광 단의 존재 하에서 배양하고, 결합을 위해 핵 및 미토콘드리아 DNA를 표적으로한다. ABC 약물 전달체 발현이없는 비 -CSCs는 형광을 감소시키는 염료를 축적하는 반면, CSC는 형광을 감소시키는 염료를 능동적으로 압출한다. 약물 전달체 활성의 약리학 적 억제는 SP 표현형을 폐기하고 기능적으로 확인하며 대조 목적으로 사용해야한다. SP 특성을 나타내는 CSC 개체군이 난소 암 9 , 10 , 전립선 암 11 ,&gt; 12, 유방암 13 , 폐암 14 , 자궁 내막 암 15 , 신경아 교종 16 , 17 및 뼈 육종 18 . 중요한 물질은 비록 특정 종양 세포 판별 전략 (특정 숙주 세포 집단이 SP 특성을 나타낼 수 있음)과 같은 추가적인 문제를 제기하지만, SP 분석은 암 세포주와 원발 종양 조직 모두와 양립 할 수 있습니다 19 , 20 . 두 가지 가장 확립 된 SP- 부여 약물 전달체는 ABCB1 / P- 당단백 / MDR1 / CD243 및 ABCG2 / Bcrp1 / CD338 8,9,21; 그러나 다른 약물 전달체도 SP 표현형 ( 예 : ABCB5)의 분자 결정 인자 일 수 있습니다 22 . ABCB1ABCG2의 활성이 fumitremorgin C (FTC) 6 , 19 로 특이 적으로 제거 될 수있는 반면, 베라파밀로 효과적으로 차단 될 수있다. SP 분석의 특별한 강점은 다른 염색 ( 예 : 표면 마커 및 ALDH)과 결합 할 수 있으며 살아있는 세포 복구가 가능하므로 하위 기능 조사와 호환된다는 것입니다. 더욱이, SP 검출은 CSC 집단 중 ABC 약물 전달체의 높은 보존으로 인해 광범위하게 적용 가능하다. 원래 SP 검출은 Hoechst 33342를 유발 염료로 사용하여 수행되었습니다 24 . 이 염료는 우수한 해상도를 달성하지만 자외선 레이저 여기가 필요합니다. 따라서 그 적용 성은 하이 엔드 유동 세포 계측기에 자연적으로 제한됩니다. DyeCycle Violet (DCV) 25 의 도래는 새로운 Avenu(자외선 레이저 소스가 DCV-SP 세포를 분해하기에 충분 함)가 부족한 표준 유동 세포 계측기구에이 방법의 적용 가능성을 확장시켰다. 중요하게도 Hoechst 33342와 DCV는 일반적인 펌프 특이성을 공유하므로 두 염료 모두 동일한 세포 집단을 식별해야합니다. 여기서는 DCV 기반 SP 분석에 대한 자세한 실험 프로토콜을 제공하여 독립적 인 실험실에서 쉽고 빠르게 재생산 할 수 있습니다. 따라서 우리는이 유용한 세포 생물학적 방법의 최적화 및 표준화에 기여해야하는 CSC 연구원을위한 자료로 우리의 논문을 인식합니다.

<table border="1" fo:keep-together.within-page="1" fo:keep-with-next.within-page="always">
	<tbody>
		<tr>
			<td>Vybrant DyeCycle Violet</td>
			<td>Thermo Fisher Scientific</td>
			<td>V35003</td>
			<td>Ready to use</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Verapamil hydrochloride</td>
			<td>Sigma-Aldrich</td>
			<td>V4629</td>
			<td>Dissolve in ethanol</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Fumitremorgin C</td>
			<td>Sigma-Aldrich</td>
			<td>F9054</td>
			<td>Dissolve in DMSO</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>7-AAD (or propidium iodide)</td>
			<td>BioLegend</td>
			<td>420403</td>
			<td>Ready to use</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Standard cell culture reagents (e.g., medium, FBS, L-glutamine, antibiotics, PBS, trypsin-EDTA, etc.)</td>
			<td>Different suppliers</td>
			<td></td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Sample/cells of interest (e.g., human or murine cancer cell line, human or murine tumor tissue)</td>
			<td>Different suppliers</td>
			<td></td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Flow cytometric instrument (analyzer or cell sorter)</td>
			<td>Different suppliers</td>
			<td></td>
			<td>Violet laser source required</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>FACS tubes (round-bottom)</td>
			<td>Different suppliers</td>
			<td></td>
			<td>Tubes with cap recommended</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>70 &#181;m cut-off strainers</td>
			<td>Different suppliers</td>
			<td></td>
			<td>Optional but recommended</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Digestion enzyme mix (e.g., collagenase/dispase/Dnase)</td>
			<td>Different suppliers</td>
			<td></td>
			<td>Only relevant for tissue dissociation</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Flurochrome-conjugated antibodies against surface markers of interest</td>
			<td>Different suppliers</td>
			<td></td>
			<td>Optional</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>ALDEFLUOR Kit</td>
			<td>STEMCELL Technologies</td>
			<td>01700</td>
			<td>Optional</td>
		</tr>
	</tbody>
</table>

harnessing the dna dye-triggered side population phenotype to detect and purify cancer stem cells from biological samples

암은 줄기 세포 중심 질병이며이 세포의 박멸이 주요 치료 목표가되었습니다. Cancer Stem Cells (CSCs)의 취약성을 해독하고 적절한 분자 표적을 확인하는 것은 세포주 및 생체 외 종양 조직과 같은 이종 시료에서 특유한 차별을 허용하는 방법에 의존합니다. 유동 세포 계측법 / FACS는 단일 세포 수준에서 생물학적 시료를 다중 매개 변수 분석하는 강력한 기술이며 하류 분석을 위해 살아있는 세포를 회수 할 수있는 최신 방법입니다. 알데하이드 탈수소 효소 효소 활성의 검출뿐만 아니라 CD44 및 CD133과 같은 표면 마커는 종종 FACS에 의한 종양 샘플로부터의 CSC를 정의하고 분류하는데 사용되어왔다. 방법 론적 세부 사항에서 여기에 묘사 된 보완적인 접근법은 ABC 약물 전달체에 의한 기능성 염료 압출을 사용하며, 이는 측면 집단 (SP)으로 일반적으로 불리는 형광성 세포의 개별 집단을 확인합니다. SP암세포는 표준 줄기 세포 특징을 나타내고, 염료 압출 약물 전달체 (가장 빈번하게 ABCB1 / P- 당단백 / MDR1 / CD243 및 ABCG2 / Bcrp1 / CD338)를 억제하는 제제를 사용하여 폐색되고 기능적으로 확인 될 수있다. 또한 SP 분석법은 표면 항원 염색, 알데하이드 탈수소 효소 검출 및 사상 세포 판별 ( 예 : 7-AAD 또는 propidium iodide (PI))과 같은 다른 유동 세포 계측법 평가와 호환됩니다. 따라서 우리는 표현형 매개 변수가 아닌 기능적으로 기계적으로 CSC 식별, 격리 및 하위 특성화를위한 가치 있고 광범위하게 적용 가능한 방법을 설명합니다. 원래 Hoechst 33342를 트리거링 염료로 사용해 왔지만 여기에서는 보라색 레이저 소스가 장착 된 모든 유동 세포 계측기에서 분해 할 수있는보다 최근의 Violet 염료 기반 SP 표현형에 초점을 맞 춥니 다.

A2780 세포의 대표적인 SP 분석은 이전에 세포의 1 % 미만을 차지하는 SP를 보유하고있는 것으로 보이는 인간 난소 암 세포주 9) . 세포를 10 % ( v / v ) FBS, 2 mM L- 글루타민 및 1x 페니실린 / 스트렙토 마이신이 보충 된 RPMI 1640에서 37 ℃에서 배양하고, 0.05 % 트립신 -EDTA로 처리하여 85 % 컨 플루 언시에서 수확 하였다. 세포를 PBS로 세척하고 70 μm cut-off strainers로 여과 하였다. 세포 수는 계수 챔버를 사용하여 결정되었고 trypan blue 염색법과 1 x 106 세포 / mL (신생 배지)를 어두운 곳에서 37 ℃에서 90 분 동안 10 μM DCV로 염색 하였다. 병행하여, 동일한 분량을 정확히 같은 조건하에 20 μM FTC의 존재하에 배양 하였다. 세포를 4 mL PBS로 세척하고 ABCG2에 대한 APC- 접합 항체를 미리 시험 한 농도의 &#39;시험&#39;튜브에 첨가 하였다. 부화 후4 ℃에서 25 분 동안 세포를 PBS로 세척하고, 7-AAD를 첨가하여 죽은 세포를 표지 하였다. 샘플을 얼음으로 냉각시키고 FACS 장치로 분석 하였다. 표본 게이팅 전략은 조직 표본 시료와 같은 매우 이질적인 물질이 특정 표면 마커 ( 예 : EpCAM, CD45, CD31)를 사용하여 표적 세포 분획의 사전 정의가 필요할 수 있음에도 불구하고 다른 시료에도 보편적으로 적용 할 수 있습니다. 표시된 결과는 다른 실험실에서 DCV 기반 SP 탐지에 대한 참조로 사용하기위한 것입니다. 따라서 조사 된 세포 집단의 상대적인 위치 측정은 독립적 인 생물학적 시료를 가진 다른 연구자들이 얻은 것과 비교해 볼 때 대략 비슷하지만 반드시 동일하지는 않아야한다. <img alt="그림 1" src="/files/ftp_upload/55634/55634fig1.jpg" /> 그림 1 : 워크 플로우 및 대표 결과. (A) DCV stainin을 이용한 SP 검출의 주요 흐름도지. 추가 마커에 대한 비용은 선택 사항이지만, 죽은 세포 차별을 적극 권장합니다. ( BG ) FACS 장비에서 수행 한 A2780 인간 난소 암 세포의 대표적인 SP 분석. 세포는 FSC / SSC 특성 (B)에 따라 문이 열리고 FSC의 다른 매개 변수 ( 예 : 높이와 너비) ( C )를 비교하여 이중선과 응집체가 제외됩니다. 그 후, 7-AAD- 음성 (또는 PI- 음성) 세포 분획 ( D )을 게이팅함으로써 사균을 구별한다. 라이브 단일 세포는 다음 파란색과 빨간색 DCV 방출에 대한 선형 2 변소 점 플롯에 표시되며 SP (및 해당 비 SP)는 게이팅 ( E )됩니다. 이제는 각각의 억제 컨트롤 (이 경우에는 FTC가 사용됨)을 사용하여 동일한 분석이 수행되며 SP 게이트 ( F ) 내에서 세포가 거의 완전히 사라집니다. 마지막으로, 식별 된 SP는 더 자세히 특성화 될 수 있습니다 ( 예 : dete염료 압출에 책임이있을 수있는 ABC 약물 전달체를 종결시켜 SP 표현형을 부여한다 (이 경우 ABCG2, FTC 감수성과 일치 함). ( G ). FTC, fumitremorgin C; ALDH, 알데히드 탈수소 효소. <a href="https://ecsource-jove-com.remotexs.ntu.edu.sg/files/ftp_upload/55634/55634fig1large.jpg" target="_blank">이 그림의 더 큰 버전을 보려면 여기를 클릭하십시오.</a>

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Harnessing the DNA Dye-triggered Side Population Phenotype to Detect and Purify Cancer Stem Cells from Biological Samples

생물학적 시료에서 줄기 세포 집단의 특성 분석 및 분리를 허용하는 방법은 암 및 그 이상에서 줄기 세포 표적 처리의 발전에 중요합니다. 여기에서 우리는 염료에 의해 유발 된 부작용 표현형을 사용하는 암 줄기 세포 분리를위한 상세한 프로토콜을 제공합니다.

DNA 염료에 의한 측면 집단 표현형을 활용하여 생물학적 샘플에서 암 줄기 세포를 검출하고 정제

Cancer is a stem cell-driven disease and eradication of these cells has become a major therapeutic goal. Deciphering vulnerabilities of Cancer Stem Cells ...

harnessing-dna-dye-triggered-side-population-phenotype-to-detect

Nanyang Technological University

Research

JoVE Journal

Cancer Research

7.6K 조회수.  Kantonsspital St. Gallen.  생물학적 시료에서 줄기 세포 집단의 특성 분석 및 분리를 허용하는 방법은 암 및 그 이상에서 줄기 세포 표적 처리의 발전에 중요합니다. 여기에서 우리는 염료에 의해 유발 된 부작용 표현형을 사용하는 암 줄기 세포 분리를위한 상세한 프로토콜을 제공합니다. 

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Cell-Free DNA Integrity Analysis in Urine Samples

Although the presence of circulating cell-free DNA in plasma or serum has been widely shown to be a suitable source of biomarkers for many types of cancer, few studies have focused on the potential use of urine cell-free (UCF) DNA. Starting from the hypotheses that normal apoptotic cells produce highly fragmented DNA and that cancer cells release longer DNA, the potential role of UCF DNA integrity was evaluated as an early diagnostic marker capable of distinguishing between patients with prostate or bladder cancer and healthy individuals.
A UCF DNA integrity analysis is proposed on the basis of four quantitative real-time PCRs of four sequences longer than 250 bp: c-MYC, BCAS1, HER2, and AR. Sequences that frequently have an increased DNA copy number in bladder and prostate cancers were chosen for the analysis, but the method is flexible, and these genes could be substituted with other genes of interest. The potential utility of UCF DNA as a source of biomarkers has already been demonstrated for urologic malignancies, thus paving the way for further studies on UCF DNA characterization. The UCF DNA integrity test has the advantage of being non-invasive, rapid, and easy to perform, with only a few milliliters of urine needed to carry out the analysis.

A method for analyzing DNA integrity in the cell-free supernatant fraction of urine samples is proposed. The method is suitable for early detection of urological malignancies and has proven accurate for the early diagnosis of bladder cancer.

소변 샘플에서 셀 무료 DNA 무결성 분석

Although the presence of circulating cell-free DNA in plasma or serum has been widely shown to be a suitable source of biomarkers for many types of ...

연구

암 연구학

Simple and Rapid Method to Obtain High-quality Tumor DNA from Clinical-pathological Specimens Using Touch Imprint Cytology

It is critical to determine the mutational status in cancer before administration and treatment of specific molecular targeted drugs for cancer patients. In the clinical setting, formalin-fixed paraffin-embedded (FFPE) tissues are widely used for genetic testing. However, FFPE DNA is generally damaged and fragmented during the fixation process with formalin. Therefore, FFPE DNA is sometimes not adequate for genetic testing because of low quality and quantity of DNA. Here we present a method of touch imprint cytology (TIC) to obtain genomic DNA from cancer cells, which can be observed under a microscope. Cell morphology and cancer cell numbers can be evaluated using TIC specimens. Furthermore, the extraction of genomic DNA from TIC samples can be completed within two days. The total amount and quality of TIC DNA obtained using this method was higher than that of FFPE DNA. This rapid and simple method allows researchers to obtain high-quality DNA for genetic testing (e.g., next generation sequencing analysis, digital PCR, and quantitative real time PCR) and to shorten the turnaround time for reporting results.

Obtaining high-quality genomic DNA from tumor tissues is an essential first step for analyzing genetic alterations using next generation sequencing. In this article, we present a simple and rapid method to enrich tumor cells and obtain intact DNA from touch imprint cytology specimens.

터치 인쇄물 세포학을 사용 하 여 병 적인 임상 표본에서 높은-품질 종양 DNA를 간단 하 고 빠른 방법

It is critical to determine the mutational status in cancer before administration and treatment of specific molecular targeted drugs for cancer patients. ...

Modeling Osteosarcoma Using Li-Fraumeni Syndrome Patient-derived Induced Pluripotent Stem Cells

Li-Fraumeni syndrome (LFS) is an autosomal dominant hereditary cancer disorder. Patients with LFS are predisposed to a various type of tumors, including osteosarcoma--one of the most frequent primary non-hematologic malignancies in the childhood and adolescence. Therefore, LFS provides an ideal model to study this malignancy. Taking advantage of iPSC methodologies, LFS-associated osteosarcoma can be successfully modeled by differentiating LFS patient iPSCs to mesenchymal stem cells (MSCs), and then to osteoblasts--the cells of origin for osteosarcomas. These LFS osteoblasts recapitulate oncogenic properties of osteosarcoma, providing an attractive model system for delineating the pathogenesis of osteosarcoma. This manuscript demonstrates a protocol for the generation of iPSCs from LFS patient fibroblasts, differentiation of iPSCs to MSCs, differentiation of MSCs to osteoblasts, and in vivo tumorigenesis using LFS osteoblasts. This iPSC disease model can be extended to identify potential biomarkers or therapeutic targets for LFS-associated osteosarcoma.

Here, we present a protocol for the generation of induced pluripotent Stem Cells (iPSCs) from Li-Fraumeni Syndrome (LFS) patient derived fibroblasts, differentiation of iPSCs via mesenchymal stem cells (MSCs) to osteoblasts, and modeling in vivo tumorigenesis using LFS patient-derived osteoblasts.

Li Fraumeni 증후군 환자에서 파생 된 유도 만능 줄기 세포를 사용 하 여 다리를 모델링

Li-Fraumeni syndrome (LFS) is an autosomal dominant hereditary cancer disorder. Patients with LFS are predisposed to a various type of tumors, including ...

Mesenchymal Stem Cell Isolation from Pulp Tissue and Co-Culture with Cancer Cells to Study Their Interactions

Cancer as a multistep process and complicated disease is not only regulated by individual cell proliferation and growth but also controlled by tumor environment and cell-cell interactions. Identification of cancer and stem cell interactions, including changes in extracellular environment, physical interactions, and secreted factors, might enable the discovery of new therapy options. We combine known co-culture techniques to create a model system for mesenchymal stem cells (MSCs) and cancer cell interactions. In the current study, dental pulp stem cells (DPSCs) and PC-3 prostate cancer cell interactions were examined by direct and indirect co-culture techniques. Condition medium (CM) obtained from DPSCs and 0.4 &#181;m pore sized trans-well membranes were used to study paracrine activity. Co-culture of different cell types together was performed to study direct cell-cell interaction. The results revealed that CM increased cell proliferation and decreased apoptosis in prostate cancer cell cultures. Both CM and trans-well system increased cell migration capacity of PC-3 cells. Cells stained with different membrane dyes were seeded into the same culture vessels, and DPSCs participated in a self-organized structure with PC-3 cells under this direct co-culture condition. Overall, the results indicated that co-culture techniques could be useful for cancer and MSC interactions as a model system.

We provide protocols for evaluation of mesenchymal stem cells isolated from dental pulp and prostate cancer cell interactions based on direct and indirect co-culture methods. Condition medium and trans-well membranes are suitable to analyze indirect paracrine activity. Seeding differentially stained cells together is an appropriate model for direct cell-cell interaction.

펄프 조직 문화와 공동 암 세포와 그들의 상호 작용을 공부 하에서 중간 엽 줄기 세포 분리

Cancer as a multistep process and complicated disease is not only regulated by individual cell proliferation and growth but also controlled by tumor ...

Obtaining Cancer Stem Cell Spheres from Gynecological and Breast Cancer Tumors

Cancer stem cells (CSC) are a small population with self-renewal and plasticity which are responsible for tumorigenesis, resistance to treatment and recurrent disease. This population can be identified by surface markers, enzymatic activity and a functional profile. These approaches per se are limited, due to phenotypic heterogeneity and CSC plasticity. Here, we update the sphere-forming protocol to obtain CSC spheres from breast and gynecological cancers, assessing functional properties, CSC markers and protein expression. The spheres are obtained with single-cell seeding at low density in suspension culture, using a semi-solid methylcellulose medium to avoid migration and aggregates. This profitable protocol can be used in cancer cell lines but also in primary tumors. The tridimensional non-adherent suspension culture thought to mimic the tumor microenvironment, particularly the CSC-niche, is supplemented with epidermal growth factor and basic fibroblast growth factor to ensure CSC signaling. Aiming for robust identification of CSC, we propose a complementary approach, combining functional and phenotypic evaluation. Sphere-forming capacity, self-renewal and sphere projection area establish CSC functional properties. Additionally, characterization comprises flow cytometry evaluation of the markers, represented by CD44+/CD24- and CD133, and Western blot, considering ALDH. The presented protocol was also optimized for primary tumor samples, following a sample digestion procedure, useful for translational research.

The aim of this methodology is to identify cancer stem cells (CSC) in cancer cell lines and primary human tumor samples with the sphere-forming protocol, in a robust manner, using functional assays and phenotypic characterization with flow cytometry and Western blot.

부인과 및 유방암 종양에서 암 줄기 세포 구체 획득

Cancer stem cells (CSC) are a small population with self-renewal and plasticity which are responsible for tumorigenesis, resistance to treatment and ...

Analysis of Side Population in Solid Tumor Cell Lines

Cancer stem cells (CSCs) are an important cause of tumor growth, metastasis, and recurrence. Isolation and identification of CSCs are of great significance for tumor research. Currently, several techniques are used for the identification and purification of CSCs from tumor tissues and tumor cell lines. Separation and analysis of side population (SP) cells are two of the commonly used methods. The methods rely on the ability of CSCs to rapidly expel fluorescent dyes, such as Hoechst 33342. The efflux of the dye is associated with the ATP-binding cassette (ABC) transporters and can be inhibited by ABC transporter inhibitors. Methods for staining cultured tumor cells with Hoechst 33342 and analyzing the proportion of their SP cells by flow cytometry are described. This assay is convenient, fast, and cost-effective. Data generated in this assay can contribute to a better understanding of the effect of genes or other extracellular and intracellular signals on the stemness properties of tumor cells.

A convenient, fast, and cost-effective method to measure the proportion of side population cells in solid tumor cell lines is presented.

고형 종양 세포주에서 측면 인구의 분석

Cancer stem cells (CSCs) are an important cause of tumor growth, metastasis, and recurrence. Isolation and identification of CSCs are of great ...

Detection of Cell-Free DNA in Blood Plasma Samples of Cancer Patients

Identifying mutations in tumors of cancer patients is a very important step in disease management. These mutations serve as biomarkers for tumor diagnosis as well as for the treatment selection and its response in cancer patients. The current gold standard method for detecting tumor mutations involves a genetic test of tumor DNA by means of tumor biopsies. However, this invasive method is difficult to be performed repeatedly as a follow-up test of the tumor mutational repertoire. Liquid biopsy is a new and emerging technique for detecting tumor mutations as an easy-to-use and non-invasive biopsy approach.
Cancer cells multiply rapidly. In parallel, numerous cancer cells undergo apoptosis. Debris from these cells are released into a patient&#8217;s circulatory system, together with finely fragmented DNA pieces, called cell-free DNA (cfDNA) fragments, which carry tumor DNA mutations. Therefore, for identifying cfDNA based biomarkers using liquid biopsy technique, blood samples are collected from the cancer patients, followed by the separation of plasma and buffy coat. Next, plasma is processed for the isolation of cfDNA, and the respective buffy coat is processed for the isolation of a patient&#39;s genomic DNA. Both nucleic acid samples are then checked for their quantity and quality; and analyzed for mutations using next-generation sequencing (NGS) techniques.
In this manuscript, we present a detailed protocol for liquid biopsy, including blood collection, plasma, and buffy coat separation, cfDNA and germline DNA extraction, quantification of cfDNA or germline DNA, and cfDNA fragment enrichment analysis.

In this paper we present a detailed protocol for non-invasive liquid biopsy technique, including blood collection, plasma and buffy coat separation, cfDNA and germline DNA extraction, quantification of cfDNA or germline DNA, and cfDNA fragment enrichment analysis.

암 환자의 혈장 샘플에서 세포없는 DNA 의 검출

Identifying mutations in tumors of cancer patients is a very important step in disease management. These mutations serve as biomarkers for tumor diagnosis ...

Isolation and Functional Assessment of Human Breast Cancer Stem Cells from Cell and Tissue Samples

Breast cancer stem cells (BCSCs) are cancer cells with inherited or acquired stem cell-like characteristics. Despite their low frequency, they are major contributors to breast cancer initiation, relapse, metastasis and therapy resistance. It is imperative to understand the biology of breast cancer stem cells in order to identify novel therapeutic targets to treat breast cancer. Breast cancer stem cells are isolated and characterized based on expression of unique cell surface markers such as CD44, CD24 and enzymatic activity of aldehyde dehydrogenase (ALDH). These ALDHhighCD44+CD24- cells constitute the BCSC population and can be isolated by fluorescence-activated cell sorting (FACS) for downstream functional studies. Depending on the scientific question, different in vitro and in vivo methods can be used to assess the functional characteristics of BCSCs. Here, we provide a detailed experimental protocol for isolation of human BCSCs from both heterogenous populations of breast cancer cells as well as primary tumor tissue obtained from breast cancer patients. In addition, we highlight downstream in vitro and in vivo functional assays including colony forming assays, mammosphere assays, 3D culture models and tumor xenograft assays that can be used to assess BCSC function.

This experimental protocol describes the isolation of BCSCs from breast cancer cell and tissue samples as well as the in vitro and in vivo assays that can be used to assess BCSC phenotype and function.

세포 및 조직 샘플에서 인간 유방암 줄기 세포의 분리 및 기능 평가

Breast cancer stem cells (BCSCs) are cancer cells with inherited or acquired stem cell-like characteristics. Despite their low frequency, they are major ...

Pooled shRNA Library Screening to Identify Factors that Modulate a Drug Resistance Phenotype

Understanding clinically relevant driver mechanisms of acquired chemo-resistance is crucial for elucidating ways to circumvent resistance and improve survival in patients with acute myeloid leukemia (AML). A small fraction of leukemic cells that survive chemotherapy have a poised epigenetic state to tolerate chemotherapeutic insult. Further exposure to chemotherapy allows these drug persister cells to attain a fixed epigenetic state, which leads to altered gene expression, resulting in the proliferation of these drug-resistant populations and eventually relapse or refractory disease. Therefore, identifying epigenetic modulations that necessitate the survival of drug-resistant leukemic cells is critical. We detail a protocol to identify epigenetic modulators that mediate resistance to the nucleoside analog cytarabine (AraC) using pooled shRNA library screening in an acquired cytarabine-resistant AML cell line. The library consists of 5,485 shRNA constructs targeting 407 human epigenetic factors, which allows high-throughput epigenetic factor screening.

High-throughput RNA interference (RNAi) screening using a pool of lentiviral shRNAs can be a tool to detect therapeutically relevant synthetic lethal targets in malignancies. We provide a pooled shRNA screening approach to investigate the epigenetic effectors in acute myeloid leukemia (AML).

약물 내성 표현형을 조절하는 인자를 식별하기 위한 풀링된 shRNA 라이브러리 스크리닝

Understanding clinically relevant driver mechanisms of acquired chemo-resistance is crucial for elucidating ways to circumvent resistance and improve ...

Simple and Fast Rolling Circle Amplification-Based Detection of Topoisomerase 1 Activity in Crude Biological Samples

Isothermal amplification-based techniques such as the rolling circle amplification have been successfully employed for the detection of nucleic acids, protein amounts, or other relevant molecules. These methods have shown to be substantial alternatives to PCR or ELISA for clinical and research applications. Moreover, the detection of protein amount (by Western blot or immunohistochemistry) is often insufficient to provide information for cancer diagnosis, whereas the measurement of enzyme activity represents a valuable biomarker. Measurement of enzyme activity also allows for the diagnosis and potential treatment of pathogen-borne diseases. In all eukaryotes, topoisomerases are the key DNA-binding enzymes involved in the control of the DNA topological state during important cellular processes and are among the important biomarkers for cancer prognosis and treatment.
Over the years, topoisomerases have been substantially investigated as a potential target of antiparasitic and anticancer drugs with libraries of natural and synthetic small-molecule compounds that are investigated every year. Here, the rolling circle amplification method, termed rolling circle enhanced enzyme activity detection (REEAD) assay that allows for the quantitative measurement of topoisomerase 1 (TOP1) activity in a simple, fast, and gel-free manner is presented.By cleaving and ligating a specially designed DNA substrate, TOP1 converts a DNA oligonucleotide into a closed circle, which becomes the template for rolling circle amplification, yielding ~103 tandem repeat rolling circle products. Depending on the nucleotide incorporation during the amplification, there is the possibility of different readout methods, from fluorescence to chemiluminescence to colorimetric. As each TOP1-mediated cleavage-ligation generates one closed DNA circle, the assay is highly sensitive and directly quantitative.

A protocol for the sensitive and quantitative detection of topoisomerase 1 activity using the rolling circle enhanced enzyme activity detection assay is described. The method allows detection of topoisomerase 1 activity from purified components or cell/tissue extracts. This protocol has wide-ranging applications in any field involving detection of enzymatic activity.

간단하고 빠른 롤링 서클 증폭 기반 조잡한 생물학적 시료에서 토포이소머라제 1 활성 검출

Isothermal amplification-based techniques such as the rolling circle amplification have been successfully employed for the detection of nucleic acids, ...