우리는 박사 부부의 토론,지도와 지원에 감사드립니다. 마이클 Andreeff MD, 박사., 야렛 벅스 박사. MD 앤더슨 유동 세포 계측법 및 세포 이미징 핵심 시설에서. 이 작품은 FCM의 국립 암 연구소 (RC1-CA146381, CA-083639, R01NS06994, CA116199 및 CA109451에서 교부금에 의해 부분적으로 지원되었다. ELS는 국방부 육군 부 (BC083397)에 의해 지원된다.

동계 쥐과 골수 이식 (BMT)는 기관 IACUC 프로토콜에 의해 승인 된 (주 :이 프로토콜의 성공은 멀티 스펙트럼 분석 대상으로 어떠한 라벨링 된 셀 타입 (들)의 이용을 필요로하고, 하류의 분석을 용이하게하기 위하여, 하나는 어떤 유전자를 이용할 수 또는 안정 세포 라벨링. 우리는 어떤 셀, 조직, 또는 기관 - 투 - 수 이식 모델과 연구가 유용하다고 생각 이식 등의 다양하고 독특한 레이블 인구를 포함 할 수있는 적용 할 수있는 것이 좋습니다. 또한, 셀룰러 시스템을 멀티 레이블 이러한 여러 혈통을 포함하는 형질 전환 생쥐에서 발견 된 것과 같은 제한된 형광 인구가 - 수있는 특정 병적 인 상태의 연구를위한 이식 합병증을 제거하도록 설계되어야 표시. <ol><li> 치명적 기증자의 골수와 재구성하기 전에 9.5 Gy를 4 시간 단일 용량으로 BMT받는 사람 쥐를 조사. (BMT GFP받는 연령 6 ~ 10 주 정도합니다.) </li><li> 클리핑 및 무균 수술 가위로 두 다리를 노출 다시 그것을 풀기 전에 70 % 에탄올로 마우스 펠트를 적 십니다. 천장 관절의 장골을 포함하여 다리 전체를 제거합니다. 다만 발목 위하고 철저하게 뼈의 모든 근육, 인대 및 초과 조직을 제거 절단하여 발을 폐기하십시오. PBS (PBS-2)에서 2 % 멸균 FBS를 사용하여 23 G 바늘 경골, fibia과 장골의 문장에서 세척 골수. (BMT의 RFP 기증자 기관의 기준에 따라 희생해야합니다.) </li><li> 부드럽게 조각과는 메스와 집게를 사용하여 조각으로 남아있는 뼈를 분쇄 한 후 300 rpm에서 37 ° C에서 나는 1 시간 동안 3 ㎍ / ㎖의 콜라게나 제와 50 ㎖에 원뿔 튜브를 놓습니다. </li><li> PBS-2 튜브를 위로하고 새로운 튜브에 뜨는을 수집하고 플러시 세포와 결합. 4 ℃에서 5 분 동안 250RPM에서 스핀 다운 </li><li> PBS-2 세포를 재현 탁하고 40 nm의 셀 필터를 통해 필터링. 이 시점에서, 세포는 fluorescen 표지 할 수있다t는 하나 BMT 특정 인구를 조작하고자하는 경우 (FACS)를 정렬 셀을 활성화. </li><li> 마우스 당 100 ㎕의 PBS 당 2 × 10 6 세포를 재현 탁. 체계적으로 꼬리 또는 복고풍 궤도 정맥 베벨 사이드 업에 의해 조사 GFP받는 사람 생쥐에 주입하기 위해 29 G 바늘을 사용합니다. 만 생착 컨트롤로 100 ㎕의 PBS와 함께 하나의 마우스를 주입한다. 주사 전에 혈관을 팽창 및 사출에 꼬리 정맥 주입 억제를 사용하는 가열 램프를 사용합니다. 꼬리 포스트 분사에 가벼운 압력을 적용 할 수 멸균 거즈가있다. </li><li> 3 주는 BMT를 게시 혈액 복고풍 궤도를 수집하고 GFP 순환 세포의 존재 및 RFP 순환 세포의 유무를 확인하기 위해 유동 세포 계측법에 의해 분석한다. 컨트롤 마우스는이 시점에서 사망 한 것입니다. </li></ol> 2. 종양 생착 기관 IACUC 가이드 라인에 따르면, <ol><li> ID8에게 사전에 생체 주입 (1 × 10 6 C에 체외에서 생쥐 난소 종양 세포를 성장마우스 당 ELL 학생). 주입의 날,를 Trypsinize 세포는 100 μL 당 1 × 10 6 세포를 PBS에 PBS 세척에 resuspend. </li><li> 마우스 intaperitoneal 공동으로 종양 세포를 주입, 바늘 베벨 사이드 업해야합니다. 70 % 에탄올을 주입 광경을 소독. 왼쪽 아래 또는 복부의 오른쪽 아래 사분면에 주사 (두개골 약간 여성 마우스의 복부 젖꼭지의 하부 집합으로 내측), 장기를 타격하지 마십시오. 목덜미에 의해 잡아 새끼 손가락이나 반지 손가락으로 꼬리를 잡고 마우스를 억제합니다. 마우스는이 절차에 이소 플루 란으로 마취 할 수 있습니다. </li><li> 이러한 약간의 복부 팽만감 등의 종양 생착의 징후가 명백 할 때 쥐를 희생. 이 4-12 주 이상을 발생합니다. </li><li> IP 캐비티에서 소비세 종양. 캐비티 내의 종양은 장기의 표면에 주변에 흰색 결절과 같이 표시됩니다. 메스, 종양을 제거하고 24 시간 고정 10 % 포르말린의 튜브 / 항아리에 넣습니다. 조직 학적 P배상은 병리 / 조직학 코어에 아웃 소싱 할 수있는 시약 및 재료는 파라핀의 임베딩 및 슬라이드 준비를 위해 쉽게 사용할 수없는 경우. 이후 염색 절차 유리 슬라이드에 5-8 μm의 조각으로 장 조직. </li></ol> 3. 다중 매개 변수 면역 형광 염색법 <ol><li> 실험에 사용 모든 형광 프로브 단일 색상 제어 슬라이드를 준비합니다. 이 시나리오에서는, 4 개의 색깔이 사용됩니다. 따라서, 각각의 색에 대한 네 개의 슬라이드뿐만 아니라 배경 소음 제어하고 전체 조합의 염색을 위해 마지막으로 하나의 슬라이드에 대한 하나의 슬라이드. (총 슬라이드 = 6) 슬라이드는 실험적인 변화를 최소화하기 위해 동일한 방식으로 나란히 처리됩니다. </li><li> 1 시간 동안 56 ° C에서 파​​라핀 섹션을 굽는다. </li><li> 흘려 슬라이드 크실렌에 10 분간 3 배. </li><li> 배 5 분 100 % 에탄올을 씻으십시오. </li><li> 1X 3 분 95 % 에탄올 세척 </li><li> 1X 2 min90 % 에탄올을 씻으십시오. </li><li> 1X 2 min70 % 에탄올을 씻으십시오. </li><l물에서 나는&gt; 워시 1X 2 분. 천천히 물 10 배 안팎으로 염색 랙을 몰두. </li><li> 마지막 세척 시리즈 중, 2 분 (고에 전자 레인지)에 대한 사전 종기 구연산 나트륨 완충액. (사용되는 항체에 따라 트리스-EDTA 완충액으로 대체 할 수있다) </li><li> 구연산 나트륨 완충액 (10 % 힘 또는 압력 밥솥 전자 레인지)에서 20 분 동안 슬라이드를 끓인다. 버퍼가 비등하면, 전자 렌지를 끄고 앉아 보자. </li><li> 열원에서 제거하고 슬라이드가 식을 때까지 구연산 나트륨 완충액에 30 분간 휴식을 할 수 있습니다. </li><li> 5 분 동안 물에 슬라이드를 씻어. </li><li> 자궁 펜 종양 부분의 주위에 표시하고 1 시간 동안 차단 버퍼 2 % BSA / 1 % FBS 말레 산을 넣어. 그들이이 단계에서 건조시키지 않는 개별적으로 슬라이드를 준비합니다. </li><li> 버퍼를 차단에 최적의 희석에 기본 항체를 준비합니다. (사용 된 항체는 다른 종의 모든 (또는 IgG의 사슬 바리에이션 EX다면 : 동일한 종의 IgG2a VS의 IgG1)들이 같은 과정을 조합하여 사용할 수있다화롯불의 잠복기. 항체 종가 겹치는 경우에, 배양 항체는 교차 반응을 최소화하기 위해 순차적으로 수행되어야한다.) </li><li> 이 시점에서, 전용 버퍼를 차단하는 두 개의 슬라이드를 둡니다. 이 두 슬라이드 흠 제어 및 핵 오염 제어 역할을합니다. 다른 하나의 컬러 컨트롤은 개별 차 항체와 함께 배양한다. 남은 분석 슬라이드 일차 항체의 조합을 가질 것이다. </li><li> 에서 천천히 회전하는 통에 습기 챔버 상자 1 차 항체로 슬라이드를 품어 4 ° 하룻밤 (~ 16 ~ 20 시간) (주 : 4 + 형광, 연속 염색 또는 직접 활용하여 작업 할 때하는 항체 교차 반응을 최소화 할 필요가있다 . 모든 항체가 슬라이드에 적용 될 때까지 이러한 상황이 단계를 반복 1.16-1.21에서.) </li><li> 부드럽게 진탕 PBST에서 10 분 (배)에 슬라이드를 씻으십시오 </li><li> 세척이 진행되는 동안, 최종 희석 Alexafluor 488, 594 및 647 차 항체를 준비버퍼를 차단하는 1:1,000의. (이 항체와 희석이 일괄 처리를 통해 시간이 지남에 형광을 유지하기 위해 항상 4 ° C에서 어두운에 보관되어 있는지 확인하십시오.) </li><li> 단일 색상 제어 슬라이드에 사용 된 일차 항체의 종류와 일치하는 단일 Alexafluor 희석을 배치합니다. 모든 차 항체는 분석 슬라이드에 배치됩니다. 흠 핵 스테인드 제어 슬라이드는이 단계를 통해 차단 버퍼에 남아있을 것입니다. </li><li> 2 시간 동안 실온에서 천천히 회전하는 통에 (빛의 노출을 피하기 위해 알루미늄 호일로 덮여) 수분 챔버 상자에 품어. </li><li> 부드럽게 진탕 PBST에서 5 분 (배)에 슬라이드를 씻으십시오. 빛으로부터 보호하기 위해 알루미늄 호일로 커버. </li><li> 1 DAPI 전용 슬라이드로 분하고 분석 슬라이드 DAPI (1:10,000)를 추가합니다. 빛으로부터 보호하기 위해 알루미늄 호일로 커버. 다른 슬라이드는 세척 용기에 덮여 남아있을 수 있습니다. </li><li> 두 DAPI-배양을 씻으DAPI의 얼룩과 다른 슬라이드를 오염시키지로서 처음 5 분 세척을위한 별도의 용기에 슬라이드. 제 5 분간 세척을 위해, 슬라이드는 (모든 세척은 쉐이커에 수행되어야한다) PBST로 결합 될 수있다. 빛으로부터 보호하기 위해 알루미늄 호일로 커버. </li><li> 물에 간단히 딥 슬라이드 전에 덮개를 미끄러지는 (형광을 유지하기 위해 수성 장착 매체와 1.5 두께) </li><li> RT 어두운 건조 3 시간을 보자. </li><li> 손톱 경화제와 커버 슬립의 가장자리를 밀봉. (아세톤 형광 신호를 해소 할 수 있습니다로 매니큐어를 사용하지 마십시오). </li><li> 바로 슬라이드를 분석하거나 미래 분석을 위해 4 ° C에 저장할 수 있습니다. </li></ol> 4. 다중 분광 영상 <ol><li> 데이터 수집을 위해 뉘앙스 소프트웨어 올림푸스 X-63 수직 현미경 (액정 조정할 수있는 필터를 포함) 뉘앙스 EX 카메라를 이용하여 멀티 스펙트럼 이미지를 수집합니다. </li><li> 해상도를 높이기 위해 오일 대물를 사용하여 이미지를 수집한다. </li><li> InitiaL 세트 업 사용의 각 형광의 스펙트럼 범위 설정이 포함되어 있습니다. <ol class="lalpha"><li> 4 색 : <ol class="lroman"><li> DAPI : 420 - 480 ㎚ </li><li> AF488 : 490 - 580 ㎚ </li><li> AF594 : 590-640nm의 </li><li> AF647 : 650-720nm </li></ol></li></ol></li><li> 스펙트럼 범위의 각각에 대해 적절한 노출 시간을 구하는 분석 슬라이드의 초기 이미지를 취할. </li><li> 소프트웨어는 서로 형광체의 신호 대 잡음비 및 백그라운드 신호를 식별하고 분리하는 데 사용하는 &quot;스펙트럼 라이브러리&quot;를 만들기. (참고 : 3 형광 = 4 제어 슬라이드, 5 형광 = 6 제어 슬라이드 : 각 형광 색소는 데이터 세트의 적절한 분석 예를 보장하기 위해 적절한 파장 곡선 스펙트럼 라이브러리를 조립하기 위해 자신의 단일 색상 제어 슬라이드가 있어야합니다.). <ol><li> 첫 번째 이미지 흠없는 슬라이드를. 이 슬라이드는 스펙트럼 librar 내에서 지정됩니다배경으로 y를 입력합니다.&gt; </li><li> 이미지 DAPI 전용 두 번째 슬라이드. 이 슬라이드는 &quot;그리기&quot;도구를 사용하여 DAPI 염색 핵을 지정하는 데 사용됩니다 및 DAPI로 스펙트럼 라이브러리에 저장됩니다.&gt; </li><li> 이미지 AF488 만 세 번째 밀어 넣습니다. 이 슬라이드는 &quot;무승부&quot;도구를 사용하여 AF488-스테인드 영역을 지정하는 데 사용되며 AF488과 스펙트럼 라이브러리에 저장됩니다.&gt; </li><li> 이미지 AF594-4 위에 밀어 넣습니다. 이 슬라이드는 &quot;무승부&quot;도구를 사용하여 AF594-스테인드 영역을 지정하는 데 사용되며 AF594과 스펙트럼 라이브러리에 저장됩니다.&gt; </li><li> 이미지 AF647 전용 다섯 번째십시오. 이 슬라이드는 &quot;무승부&quot;도구를 사용하여 AF647-스테인드 영역을 지정하는 데 사용되며 AF647과 스펙트럼 라이브러리에 저장됩니다.&gt; </li><li> 각 스펙트럼 성분의 컬렉션을 이어스펙트럼 라이브러리와 프로토콜을 저장합니다.&gt; </li></ol></li><li> 스펙트럼 라이브러리가 완료되면, 이미지를 저장 / 현미경 분석 슬라이드에 관심 영역을 찾아 수집합니다.&gt; </li></ol> 5. 멀티 스펙트럼 화상의 정량 분석 <ol><li> 소프트웨어 통보하여 획득 한 뉘앙스 이미지의 대표 구색을 가져옵니다. </li><li> 프로그램의 지시에 따라 저장 스펙트럼 라이브러리를 엽니 다 </li><li> 분석 할 그 조직의 영역을 식별합니다. (지방 조직에 비해 예를 들어 종양 조직). </li><li> DAPI 얼룩을 기준으로 각각의 세포를 식별합니다. 세포질 핵의 형태에 기초하여 자동으로 정의 될 것이다. </li><li> 각 형광 매개 변수에 대한 선택의 형광 강도 판독을 선택 (예 : 평균, 표준 편차) </li><li> 일괄 이미지를 획득하고 제안 된 알고리즘을 이용하여 소프트웨어 프로세스를 보자. </li><li> 화상 처리가 종료되면, 병합결과 파일. </li><li> 엑셀 (또는 다른 분석 소프트웨어 패키지)에 결과를 열고 XY 축에서 서로에 대해 두 형광 강도를 음모. 각각의 형광 강도는 셀 당 주어진다. 이중 양성 세포는 오른쪽 상단 사분면에 나타납니다. 사용자는베이스 라인 형광 강도를 정의해야합니다. </li></ol>

<ol>
	<li>Kidd, S., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Origins+of+the+tumor+microenvironment:+quantitative+assessment+of+adipose-derived+and+bone+marrow-derived+stroma.">Origins of the tumor microenvironment: quantitative assessment of adipose-derived and bone marrow-derived stroma.</a> PLoS ONE. 7, e30563 (2012).</li><li>Quintavalla, J., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Fluorescently+labeled+mesenchymal+stem+cells+(MSCs)+maintain+multilineage+potential+and+can+be+detected+following+implantation+into+articular+cartilage+defects.">Fluorescently labeled mesenchymal stem cells (MSCs) maintain multilineage potential and can be detected following implantation into articular cartilage defects.</a> Biomaterials. 23, 109-119 (2002).</li><li>Sasaki, M. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Mesenchymal+stem+cells+are+recruited+into+wounded+skin+and+contribute+to+wound+repair+by+transdifferentiation+into+multiple+skin+cell+type.">Mesenchymal stem cells are recruited into wounded skin and contribute to wound repair by transdifferentiation into multiple skin cell type.</a> Journal of immunology. 180, 2581-2587 (2008).</li><li>Spaeth, E. L. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Mesenchymal+stem+cell+transition+to+tumor-associated+fibroblasts+contributes+to+fibrovascular+network+expansion+and+tumor+progression.">Mesenchymal stem cell transition to tumor-associated fibroblasts contributes to fibrovascular network expansion and tumor progression.</a> PLoS ONE. 4, e4992 (2009).</li><li>Wels, J., Kaplan, R. N., Rafii, S., Lyden, D. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Migratory+neighbors+and+distant+invaders:+Tumor-associated+niche+cells.">Migratory neighbors and distant invaders: Tumor-associated niche cells.</a> Genes and Development. 22, 559-574 (2008).</li><li>Weis, S. M., Cheresh, D. A. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Tumor+angiogenesis:+molecular+pathways+and+therapeutic+targets.">Tumor angiogenesis: molecular pathways and therapeutic targets.</a> Nat. Med. 17, 1359-1370 (2011).</li><li>Bataille, F. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Multiparameter+immunofluorescence+on+paraffin-embedded+tissue+sections.">Multiparameter immunofluorescence on paraffin-embedded tissue sections.</a> Applied immunohistochemistry &amp; molecular morphology : AIMM / official publication of the Society for Applied Immunohistochemistry. 14, 225-228 (1097).</li><li>van Vlierberghe, R. L., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Four-color+staining+combining+fluorescence+and+brightfield+microscopy+for+simultaneous+immune+cell+phenotyping+and+localization+in+tumor+tissue+sections.">Four-color staining combining fluorescence and brightfield microscopy for simultaneous immune cell phenotyping and localization in tumor tissue sections.</a> Microscopy research and technique. 67, 15-21 (2005).</li><li>Robertson, D., Savage, K., Reis-Filho, J. S., Isacke, C. M. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Multiple+immunofluorescence+labelling+of+formalin-fixed+paraffin-embedded+(FFPE)+tissue.">Multiple immunofluorescence labelling of formalin-fixed paraffin-embedded (FFPE) tissue.</a> BMC cell biology. 9, 13 (2008).</li><li>Qiu, P., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Extracting+a+cellular+hierarchy+from+high-dimensional+cytometry+data+with+SPADE.">Extracting a cellular hierarchy from high-dimensional cytometry data with SPADE.</a> Nat Biotechnol. 29, 886-891 (2011).</li><li>Belizario, J. E., Akamini, P., Wolf, P., Strauss, B., Xavier-Neto, J. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=New+routes+for+transgenesis+of+the+mouse.">New routes for transgenesis of the mouse.</a> Journal of applied. 53, 295-315 (2012).</li></ol>

FCM, CMB, 그리고 ELS는 공개 할 갈등과는 아무런 관련이 없습니다.

여기서 우리는 종양 미세 환경의 골수 유래 기질 성분을 분석하기 위해, 멀티 플렉스 셀룰러 조성물 MIMicc - 멀티 스펙트럼 심문으로 서술 멀티 스펙트럼 영상의 응용을 설명하지만 이러한 방법론과 개념은 복잡한 구도 다른 세포 성분을 해독에 적용될 수있다 이러한 상처 치유 반응 중 또는 재생 조직 중에 본 것과 같은 조직. 이 실험에서 우리는 형광 접목 종양 미세 환경 내의 호스트 유래 세포로부터 골수 유래의 세포를 구별하는 트랜스 제닉 마우스를 이용하지만이 기법은 리포터 유전자 표지 된 세포의 사용라는 것으로, 유전자 라벨을 발현하는 세포에 특히 수정할 수있는입니다 , HA, FLAG 태그 레이블 세포 등 11 -도 쉽게 LacZ를, 글루 쿠로, 그의 (6 배)으로, 면역 조직 화학 염색에 의해 식별 가능합니다. 우리의 모델에서는 다음이식 생쥐의 희생은, 종양 부분을 처리하고 세포의 기원을 확인하는 항체로 염색 하였다; RFP + 골수 유래 도너 또는 GFP + 숙주 조직 유래. 그림 2에서, 우리는 종양 미세 환경 내에서 호스트 파생 GFP + 세포와 공동으로 표현하는 두 개의 마커를 표시합니다. 그러나, 우리는도 2d에 동일한 시스템을 사용하여 일곱 색 얼룩을위한 잠재 성을 보여준다. 이러한 데이터는 우리의 이식 및 멀티 스펙트럼 이미징 모델을 이용하여 할 수있는 것의 표현이다. 이 시스템은 매우 유연하고 등의 추가 매개 변수를 수용 할 수있는 : 1 - 변경된 BMT 인구 / 형질 전환 마우스 모델 2 - 다른 종양 / 질병 모델, 또는 3 - 대체 마커 (예, 표면, 세포, 인산화 단백질). 일반적으로, 동일한 슬라이드 면역 얼룩의 숫자가 증가함에 따라, 데이터 분석 그러나 멀티 스펙트럼 이미징 플랫폼과, 갑각류를 사용되기 힘든연관된 정보 unmixing 소프트웨어는 효율적으로 신뢰성과 결과를 재현 할 수 있습니다. 우리는 잠재적 인 항체 ​​종과 표 1의 형광 라벨 조합을 제공합니다. 또한,이 기술로 인해 기본 연구 모델 이외에 임상 조직 샘플에 적용 가능한이 기술 만들기 모두 냉동과 파라핀 조직 절편을 사용하는 잠재적으로 프로브 / 항체 선택의 다양성을 허용한다.

조직 개발 및 수리를 이해하는 것은 상처 치유, 2,3 재생 의학, 발달 생물학, 종양 생물학에 참여하는 세포 구성 요소를 해명에 중요하다. 수리의 상황에서, 많은 종류의 세포는 혈관, ECM 증착, 확산 및 조직 구조 조정에 도움이 주변의 미세 환경에 침투. 셀룰러 요인과 표현형은 다 항목, 지역화를 식별 할 수있는 다중화 마커, 분화 상태와 조사 미세 환경 내 세포 성분 사이의 상호 작용을 기반으로 식별 될 수있다. 여기서, 우리는 다중 분광 영상과 스펙트럼 unmixing 방법론 다음이 여러 가지 빛깔의 - 다세포 이식 모델의 프로토 타입 예를 들어 종양의 발달을 설명합니다. 종양의 진행이 향상 확산을 포함 여러 인수 기능에 의해 표시되는 여러 단계의 과정이다, ntiapoptotic 침습적 혈관 속성은. 4 종양 개발은 성장 인자, 구조 행렬, 혈관 네트워크와 면역 변조를 제공하기 위해 주변 환경에 모집 비 종양 세포에 의해 촉진된다. 1,5,6이 microhabitat가에서 파생 된 세포로 구성 지역, 이웃 등 지방 등의 조직, 혈관 및 골수 유래 세포 1과 먼 소스. 비 종양 세포 결합의 정도는 종종 종양의 단계 / 등급에 해당하는 종양의 수요에 따라 달라집니다. 지지 종양 미세 환경의 역할을 이해하기 위해, 하나의 비종 양성 세포 집단의 기원과 분화 잠재력을 이해해야한다. 이 프로토콜은 로컬 티슈 변환 해주는 둘 골수 유래 세포 성분의 시각화를 통한 종양 진행의 해석을 돕기 위해 설계되었으며세포 에드. 형광 리포터 유전자를 발현하는 형질 전환 생쥐를 활용하여, 우리는 치명적 조사 RFP (적색 형광 단백질) 마우스로 GFP (녹색 형광 단백질)의 골수를 이식. 성공적인 골수 생착 다음, 동계 종양 세포주 orthotopically 주입 4-8 주간 생착시킨다. 그 결과 종양 마우스에서 절제와 기질 구성 요소를 시각화하는 면역 염색 (IF)에 처리됩니다. 다중 마커 그러나 스펙트럼 중복을 가지고 형광 마커의 조합에 대한 가능성을 향상시키는 다중 분광 영상 / unmixing 플랫폼을 사용하여, 상당한 최적화 7-9을 포함 일반적으로 사용되는 기술됩니다. 여기에서 우리는 우리가 세포의 기원, 세포 분화 성을 분석하기 위해 얼룩 하나의 슬라이드에 종양 섹션에있는 여덟 마커까지 분석하는 다중 세포 조성물을 MIMicc - 멀티 스펙트럼 심문 전화 기술을 제시ATUS와 종양 미세 환경 내에서 구성 요소의 세포 - 세포 상호 작용. 이 간단한 예는 항체를 이용하여 다섯, 여섯, 이상의 마커 또는 세포 내 프로 중심의 형광등 식입니다. 표 1은 고려 적절한 종의 잠재적 인 형광 항체 염색 조합을 분석하기 위해에 따라 확장 할 수있는 잠재력을 가지고 있습니다.

<table border="1" fo:keep-together.within-page="always">
		<tbody>
		 <tr>
			<td>Name of the reagent</td>
			<td>Company</td>
			<td>Catalogue number</td>
			<td></td>
		 </tr>
		 <tr>
			<td>.2 &mu;m filter</td>
			<td >Fisher</td>
			<td>09-740-35A</td>
			<td></td>
		 </tr>
		 <tr>
			<td>10 ml lure lock </td>
			<td >BD</td>
			<td>309604</td>
			<td></td>
		 </tr>
		 <tr>
			<td>25 G needle</td>
			<td >Cardinal</td>
			<td>BF305122</td>
			<td></td>
		 </tr>
		 <tr>
			<td>40nm filter</td>
			<td >BD</td>
			<td>352340</td>
			<td></td>
		 </tr>
		 <tr>
			<td>50 ml conical tube</td>
			<td >Fisher</td>
			<td>1495949A</td>
			<td></td>
		 </tr>
		 <tr>
			<td>Alexafluor 488-ms1</td>
			<td >invitrogen</td>
			<td>A21121</td>
			<td></td>
		 </tr>
		 <tr>
			<td>Alexafluor 594-Rb</td>
			<td >invitrogen</td>
			<td>A21207</td>
			<td></td>
		 </tr>
		 <tr>
			<td>Alexafluor 647-ch</td>
			<td >Invitrogen</td>
			<td>A21449</td>
			<td></td>
		 </tr>
		 <tr>
			<td>BSA</td>
			<td >Sigma</td>
			<td>A7906-500G</td>
			<td></td>
		 </tr>
		 <tr>
			<td>Cover slips</td>
			<td >Corning</td>
			<td>2940-243</td>
			<td></td>
		 </tr>
		 <tr>
			<td>CRI-Nuance</td>
			<td>Caliper Life Sciences</td>
			<td></td>
			<td></td>
		 </tr>
		 <tr>
			<td>Dapi</td>
			<td >Invitrogen</td>
			<td>D1306</td>
			<td></td>
		 </tr>
		 <tr>
			<td>DMEM</td>
			<td >CellGro</td>
			<td>10-017-CV</td>
			<td></td>
		 </tr>
		 <tr>
			<td>Ethanol</td>
			<td >Dharmacon</td>
			<td>4004-DV</td>
			<td></td>
		 </tr>
		 <tr>
			<td>FBS</td>
			<td >invitrogen</td>
			<td>16000-044</td>
			<td></td>
		 </tr>
		 <tr>
			<td>GFP-ms1</td>
			<td >Abcam</td>
			<td>ab38689</td>
			<td></td>
		 </tr>
		 <tr>
			<td>Insulin needle</td>
			<td >BD</td>
			<td>329424</td>
			<td></td>
		 </tr>
		 <tr>
			<td>Maleic acid</td>
			<td >Acros</td>
			<td>100-16-7</td>
			<td></td>
		 </tr>
		 <tr>
			<td>Moisture chamber box</td>
			<td >Evergreen</td>
			<td>240-9020-Z10</td>
			<td></td>
		 </tr>
		 <tr>
			<td>Mounting media</td>
			<td >dako</td>
			<td>S3023</td>
			<td></td>
		 </tr>
		 <tr>
			<td>Nail hardener</td>
			<td >Sally Hansen</td>
			<td>2103</td>
			<td></td>
		 </tr>
		 <tr>
			<td>Pap pen</td>
			<td >Abcam</td>
			<td>Ab2601</td>
			<td></td>
		 </tr>
		 <tr>
			<td>Pen/Strep L Glut</td>
			<td >invitrogen</td>
			<td>10378016</td>
			<td></td>
		 </tr>
		 <tr>
			<td>Steril PBS</td>
			<td >invitrogen</td>
			<td>14040-182</td>
			<td></td>
		 </tr>
		 <tr>
			<td>Trypsin</td>
			<td >invitrogen</td>
			<td>252000-56</td>
			<td> </td>
		 </tr>
 <tr>
 	<td></td>
 <td></td>
 <td></td>
 <td>
 Blocking Buffer	
	<table border="1" fo:keep-together.within-page="always">
 <tbody>
 <tr>
 <td>maleic acid</td>
 <td>14.51 g </td>
 </tr>
 <tr>
 <td>NaCl</td>
 <td>10.95 g</td>
 </tr>
 <tr>
 <td>NaOH pellets (to 7.5pH)</td>
 <td>9+g</td>
 </tr>
 <tr>
 <td>Distilled water</td>
 <td>250 ml</td>
 </tr>
 </tbody>
 </table>
	*add 0.2% Tween-20 to 1x solution for blocking buffer with 2%BSA/2%FBS. Stir and filter. 
	Antigen retrieval buffers:
	<table border="1" fo:keep-together.within-page="always">
 <tbody>
 <tr>
 <td colspan="2">Tris-EDTA Buffer (10 mM Tris Base, 1 mM EDTA Solution, 0.05% Tween 20, pH 9.0)</td>
 </tr>
 <tr>
 <td>Tris Base</td>
 <td>1.21 g</td>
 </tr>
 <tr>
 <td>EDTA</td>
 <td>0.37 g</td>
 </tr>
 <tr>
 <td>Distilled water</td>
 <td>1000 ml (100 ml to make 10x, 50 ml to make 20x)</td>
 </tr>
 <tr>
 <td>Tween 20</td>
 <td>0.5 ml</td>
 </tr>
 </tbody>
 </table>
	*Store at RT for 3 months or at 4 &deg; C for longer
	<table border="1" fo:keep-together.within-page="always">
 <tbody>
 <tr>
 <td colspan="2">Sodium Citrate Buffer (10 mM Sodium Citrate, 0.05% Tween 20, pH 6.0)</td>
 </tr>
 <tr>
 <td>Tri-sodium citrate (dihydrate)</td>
 <td>2.94 g</td>
 </tr>
 <tr>
 <td>Distilled water</td>
 <td>1000 ml</td>
 </tr>
 <tr>
 <td>HCl (adjust pH to 6.0)</td>
 <td>1N</td>
 </tr>
 <tr>
 <td>Tween 20</td>
 <td>0.5 ml</td>
 </tr>
 </tbody>
 </table>
 </td>
 </tr>
		</tbody>
 </table>

quantitative multispectral analysis following fluorescent tissue transplant for visualization of cell origins, types, and interactions

복합 조직의 발달로 여러 셀룰러 요소의 포스팅을 이해하는 욕망 등의 조직, 종양 형성 또는 혈관 생성의 재생에 참여할 다수의 세포 유형으로, 우리의 종양 발달의 멀티 셀룰러 이식 모델을 고안 세포 집단은 서로 다른 색깔의 형광 리포터 유전자 쥐에서 발생하고, 이식 접목 또는 개발 종양과 주위에 주입한다. 이러한 색깔의 세포는 다음 모집 종양 기질에 통합됩니다. 정량적으로 골수 유래의 종양 간질 세포를 평가하기 위하여, 우리는 IACUC 승인 한 생쥐를 발현 치명적 조사 RFP로 형질 전체 골수를 이식 GFP 발현. orthotopically 이식 된 생쥐에 주입했다 0ovarian 종양 6-8 주 포스트 생착을 절제 및 관련 종양을 감지하는 기원의 골수 마커 (GFP)뿐만 아니라 항체 마커 분석 하였다멀티 스펙트럼 화상 기술을 이용하여 기질. 우리는 그 양적 세포가있는 (원본 리포터 유전자 라벨 기준)부터 인구, 4, 5 unmix 할 수있는 능력과 함께 표시되는 평가하는 fluoroprobes의 멀티 스펙트럼 unmixing을 사용하여, 우리는 멀티 플렉스 세포 조성물의 MIMicc - 멀티 스펙트럼 심문 호출 방법을 적용 슬라이드 증가 당 6 개 이상의 스펙트럼, 우리는 세포 계통 또는 정밀도를 높이기 위해 분화와 관련된 추가 면역 조직 화학 염색을 추가했습니다. 공동화 다중 형광 신호, 종양의 기질 인구가, 추적 열거 마커 염색을 기준으로 특징 될 수있다을 감지하는 소프트웨어를 활용. 1

우리 형질 BMT 마우스 모델에서 종양 접목을 분석하는 멀티 스펙트럼 영상 기술을 사용하여, 우리는 골수 유래의 아르 간질 종양 성분을 식별 할 수있다. 초기 BMT는 유동 세포 계측법에 의해 3 주 후 이식 (그림 1)을 확인 하였다. Orthotopically는 BMT의 생착 확인서가 초기 종양 주사 다음 절제 포르말린이 육주 수정 된 다음과 같은 레이블이없는 난소 종양을 주입했다. 파라핀 종양 섹션은 &lt;8 μm의 조각의 단면과 염색 하였다. 적절한 단일 색상 제어 슬라이드가 배경 형광도 하나를 포함하여 각 형광을 위해 만들어졌다. 표 1은 잠재적 인 정화와 2-7 매개 변수에 대한 형광 색소의 조합을 포함한다. 염색 절차에 따라, 이미지는 뉘앙스 카메라 부착과 뉘앙스 소프트웨어를 사용하여 획득 하였다. 단일 색상 제어 슬라이드와 스펙트럼 라이브러리 (그림 2A)를 생성 한 후, 우리는 w감수 할 수에 &quot;unmix&quot;(항체 # 1) 핵 DAPI 및 두 개의 다른 마커와 함께 GFP의 표현을 보여주는 촬영 한 멀티 레이블 난소 종양 부분의 이미지 (항체 # 2, # 3). 더 많은 마커 (그림 2B) 추가가 가능하며, 2C-D 여섯 마커 플러스 핵 얼룩 종양 부분의 이미지를 보여줍니다 피규어. 마지막으로, 모든 인수 이미지 분석에 대한 인폼 (CaliperLS, Hopkinton, MA)를 사용하여 소프트웨어에 수입되었다. 뉘앙스 (CaliperLS, Hopkinton, MA)를 사용하여 소프트웨어 Metamorph의 (분자 장치) 또는 IPLab (Scanalytics, BD 바이오 사이언스)와 같은 다른 패키지와 호환됩니다. 또한, 이미지와 스펙트럼 데이터 세트는 TIFF 파일로 저장하고이 파일 형식을 읽는 모든 프로그램에서 볼 수 있습니다. 인폼 소프트웨어를 사용하여, 우리는 종양의 섹션 내에서 관심의 조직 영역 (그림 3a 및 E)을 분류하고 셀 바스 당 각 형광 색소의 형광 강도에 대한 알고리즘을 설정 할 수 있었다DAPI 핵 얼룩에 ED (그림 3B-C). 마지막으로, 우리는 두 개의 마커, AF488과 AF647 (그림 3D)의 형광 강도에 따라 각 개별 셀을 그릴 수 있었다. 우리는 결정 형광 강도의 임계 값 (그림 4)를 기반으로 두 배 긍정적 인 세포 인구를 설립했다. 데이터 세트는 여러 파라미터들에 더 복잡 해짐에 따라 데이터 SPADE 소프트웨어 (10) (농도 정규화 이벤트 스패닝 트리 진행성 분석)를 사용하여 분석 할 수 있도록이 수행 될 아무런 갖지만, 전위가있다. 이 소프트웨어는 대용량 데이터 세트에 공동 발현 경향의 시각화를 가능하게하고 분석 조직 섹션 내에서 공동으로 표현 마커의 클러스터 사이의 연결 / 관계를 의미 할 수 있습니다. 표 1. 2-7 색 멀티 플렉스 염색에 대한 면역 형광 염색을 제어 준비. (A) 4 색 옵션까지 포함한다. (B) </stroNG&gt; (C)은 가시 광선 스펙트럼 내에서 일곱 색 옵션이 포함되어있는 반면 빛 스펙트럼의 근적외선 부분을 위반하는 항체를 이용하여 7 색깔 옵션까지 포함되어 있습니다. <img src="/files/ftp_upload/50385/50385fig1.jpg" alt="그림 1" fo:content-width="6in" fo:src="/files/ftp_upload/50385/50385fig1highres.jpg"/> 그림 1. 유동 세포 계측법에 의해 골수 이식 확인. (A) RFP의 +를 제어하고 GFP + 세포에 대한 GFP + 마우스와 (C)를 ​​제어하는 비교 RFP + 조혈 세포에 대한 (B) 양의 GFP 형질 전환받는 마우스 내의 순환 조혈 세포 집단의 도트 플롯. <img src="/files/ftp_upload/50385/50385fig2.jpg" alt="그림 2"/> 그림 2. 스펙트럼 혼합되지 않은 이미지 처리. (A) </stron. g&gt; 난소 종양 부분의 분석을 위해 만든 4 색 스펙트럼 라이브러리의 스크린 샷 (B) 멀티 스펙트럼 이미지 형광 표지 세포를 보여주는 쥐의 난소 종양 부와 # 1 : AF488 (예 495 ㎚ / EM 510 nm의) # 2 : AF594 (ex590/em617 뉴 멕시코), # 3 : AF647 (예를 650/em 668 nm의) 핵 : DAPI (예 350/em 470 NM). 하나의 색깔은 흰색으로 표시되는 난소 종양 부분의 분석을 위해 만든 7 색 스펙트럼 라이브러리 (C) 스크린 샷 (D) 멀티 스펙트럼 이미지 형광 표지 세포를 보여주는 쥐의 난소 종양 부와 핵 :.. DAPI (ex350/em470 뉴 멕시코 ) AF488 (예를 495/em 519 nm의) AF514 (ex518/em540 뉴 멕시코), AF568 (예 578/em 603 nm의) AF594 (예 590/em 617 nm의) AF633 (예 632/em 647 nm의); AF660 (예를 663/em 690 NM)와. 하나의 색깔은 흰색뿐만 아니라 일치하는 복합 색으로 표시됩니다. <a href="https://www-jove-com.remotexs.ntu.edu.sg/files/ftp_upload/50385/50385fig2large.jpg" target="_blank">큰 그림을 보려면 여기를 클릭하십시오</a> . <img src="/files/ftp_upload/50385/50385fig3.jpg" alt="그림 3" fo:content-width="4.75in" fo:src="/files/ftp_upload/50385/50385fig3highres.jpg"/> 그림 3. 정량의 MIMicc 묘사 분석을 알립니다. (A) 순으로 화상 (B) 핵 염색 DAPI에 기초하여 셀 분할이어서 티슈 세그먼트의 분류를 나타낸다. (C) 형광 라벨의 정량은 핵과 세포질에서 측정 (D)로 내보낼 수 추가 분석을 위해 엑셀. (E)는 티슈 분할 알고리즘은 또한 티슈 아키텍처 아닌 전적으로 별개 조직 영역에서 염색을 분류하는 더욱 강력한 분석 도구를 제공하는 형광 색소 식별에 근거 티슈 서브 타입을 식별 할 수있다. 이 이미지에서는 컴퓨터가 architectura에 따라 5 개의 서브 영역을 식별하는 훈련을하고있다조직 내에서 L 패턴 배경이 빈 공간에 의해 정의가, 용혈성 종양 조직 내에서 적혈구의 풍요 로움에 의해 정의되고, 종양이 인구 밀도가 높은 세포에 의해 정의되고, 지방이 많은, 대칭, 빈 세포 구획에 의해 정의되고, 근육이 있습니다 가로 무늬 패턴으로 정의됩니다. <a href="https://www-jove-com.remotexs.ntu.edu.sg/files/ftp_upload/50385/50385fig3large.jpg" target="_blank">큰 그림을 보려면 여기를 클릭하십시오</a> . <img src="/files/ftp_upload/50385/50385fig4.jpg" alt="그림 4"/> 그림 4. (20) 획득 된 영상에서 개별 세포의 줄거리는 AF647으로 표시 AF488과 αSMA으로 표시 GFP의 형광 강도에 따라 이중 양성 세포를 보여줍니다. 보충 문서. <a href="https://www-jove-com.remotexs.ntu.edu.sg/files/ftp_upload/50385/Tips_and_Tricks_for_Multiplexing_5_or_more_probes.docx">다중 5 개 이상의 프로브 팁과 트릭.</a> </a&gt;

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Quantitative Multispectral Analysis Following Fluorescent Tissue Transplant for Visualization of Cell Origins, Types, and Interactions

복잡한 조직 대중은 장기에서 종양, 다양한 세포 요소로 구성되어있다. 우리는 세포의 기원뿐만 아니라 단백질 발현에 따라 세포의 특성을 해독 스펙트럼 unmixing 다음 다중 매개 면역 형광 염색과 함께 멀티 라벨 형광 형질 전환 마우스를 이용한 조직 내에서 세포의 표현형의 기여를 밝혀.

세포의 기원, 종류, 그리고 상호 작용의 시각화를위한 형광 조직 이식에 따라 정량 멀티 스펙트럼 분석

With the desire to understand the contributions of multiple cellular elements to the development of a complex tissue; such as the numerous cell types that ...

quantitative-multispectral-analysis-following-fluorescent-tissue

Nanyang Technological University

Research

JoVE Journal

Medicine

9.3K 조회수.  MD Anderson Cancer Center.  복잡한 조직 대중은 장기에서 종양, 다양한 세포 요소로 구성되어있다. 우리는 세포의 기원뿐만 아니라 단백질 발현에 따라 세포의 특성을 해독 스펙트럼 unmixing 다음 다중 매개 면역 형광 염색과 함께 멀티 라벨 형광 형질 전환 마우스를 이용한 조직 내에서 세포의 표현형의 기여를 밝혀. 

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Orthotopic Aortic Transplantation: A Rat Model to Study the Development of Chronic Vasculopathy

Research models of chronic rejection are essential to investigate pathobiological and pathophysiological processes during the development of transplant vasculopathy (TVP).
The commonly used animal model for cardiovascular chronic rejection studies is the heterotopic heart transplant model performed in laboratory rodents. This model is used widely in experiments since Ono and Lindsey (3) published their technique. To analyze the findings in the blood vessels, the heart has to be sectioned and all vessels have to be measured.
Another method to investigate chronic rejection in cardiovascular questionings is the aortic transplant model (1, 2). In the orthotopic aortic transplant model, the aorta can easily be histologically evaluated (2). The PVG-to-ACI model is especially useful for CAV studies, since acute vascular rejection is not a major confounding factor and Cyclosporin A (CsA) treatment does not prevent the development of CAV, similar to what we find in the clinical setting (4). A7-day period of CsA is required in this model to prevent acute rejection and to achieve long-term survival with the development of TVP.
This model can also be used to investigate acute cellular rejection and media necrosis in xenogeneic models (5).

This video demonstrates the orthotopic aortic transplant model as a simple model to study the development of transplant vasculopathy (TVP) in rats.

Orthotopic 대동맥 이식 : 만성 Vasculopathy의 개발 연구에 생쥐 모델

Research models of chronic rejection are essential to investigate pathobiological and pathophysiological processes during the development of transplant ...

연구

의학

Quantitative Visualization and Detection of Skin Cancer Using Dynamic Thermal Imaging

In 2010 approximately 68,720 melanomas will be diagnosed in the US alone, with around 8,650 resulting in death 1. To date, the only effective treatment for melanoma remains surgical excision, therefore, the key to extended survival is early detection 2,3. Considering the large numbers of patients diagnosed every year and the limitations in accessing specialized care quickly, the development of objective in vivo diagnostic instruments to aid the diagnosis is essential. New techniques to detect skin cancer, especially non-invasive diagnostic tools, are being explored in numerous laboratories. Along with the surgical methods, techniques such as digital photography, dermoscopy, multispectral imaging systems (MelaFind), laser-based systems (confocal scanning laser microscopy, laser doppler perfusion imaging, optical coherence tomography), ultrasound, magnetic resonance imaging, are being tested. Each technique offers unique advantages and disadvantages, many of which pose a compromise between effectiveness and accuracy versus ease of use and cost considerations. Details about these techniques and comparisons are available in the literature 4.
Infrared (IR) imaging was shown to be a useful method to diagnose the signs of certain diseases by measuring the local skin temperature. There is a large body of evidence showing that disease or deviation from normal functioning are accompanied by changes of the temperature of the body, which again affect the temperature of the skin 5,6. Accurate data about the temperature of the human body and skin can provide a wealth of information on the processes responsible for heat generation and thermoregulation, in particular the deviation from normal conditions, often caused by disease. However, IR imaging has not been widely recognized in medicine due to the premature use of the technology 7,8 several decades ago, when temperature measurement accuracy and the spatial resolution were inadequate and sophisticated image processing tools were unavailable. This situation changed dramatically in the late 1990s-2000s. Advances in IR instrumentation, implementation of digital image processing algorithms and dynamic IR imaging, which enables scientists to analyze not only the spatial, but also the temporal thermal behavior of the skin 9, allowed breakthroughs in the field.
In our research, we explore the feasibility of IR imaging, combined with theoretical and experimental studies, as a cost effective, non-invasive, in vivo optical measurement technique for tumor detection, with emphasis on the screening and early detection of melanoma 10-13. In this study, we show data obtained in a patient study in which patients that possess a pigmented lesion with a clinical indication for biopsy are selected for imaging. We compared the difference in thermal responses between healthy and malignant tissue and compared our data with biopsy results. We concluded that the increased metabolic activity of the melanoma lesion can be detected by dynamic infrared imaging.

We demonstrated that malignant pigmented lesions with increased metabolic activity generate quantifiable amounts of heat and the measurement of the transient thermal response of the skin to a cooling excitation allows quantitative identification of melanoma and other skin cancers (vs. non-proliferative nevi) at an early stage of the disease.

양적 시각화 및 동적 써멀 이미징을 사용하여 피부암의 감지

In 2010 approximately 68,720 melanomas will be diagnosed in the US alone, with around 8,650 resulting in death 1. To date, the only effective treatment ...

Improved Visualization of Lung Metastases at Single Cell Resolution in Mice by Combined In-situ Perfusion of Lung Tissue and X-Gal Staining of lacZ-Tagged Tumor Cells

Metastasis is the main cause of death in the majority of cancer types and consequently a main focus in cancer research. However, the detection of micrometastases by radiologic imaging and the success in their therapeutic eradication remain limited.
While animal models have proven to be invaluable tools for cancer research1, the monitoring/visualization of micrometastases remains a challenge and inaccurate evaluation of metastatic spread in preclinical studies potentially leads to disappointing results in clinical trials2. Consequently, there is great interest in refining the methods to finally allow reproducible and reliable detection of metastases down to the single cell level in normal tissue. The main focus therefore is on techniques, which allow the detection of tumor cells in vivo, like micro-computer tomography (micro-CT), positron emission tomography (PET), bioluminescence or fluorescence imaging3,4. We are currently optimizing these techniques for in vivo monitoring of primary tumor growth and metastasis in different osteosarcoma models. Some of these techniques can also be used for ex vivo analysis of metastasis beside classical methods like qPCR5, FACS6 or different types of histological staining. As a benchmark, we have established in the present study the stable transfection or transduction of tumor cells with the lacZ gene encoding the bacterial enzyme &beta;-galactosidase that metabolizes the chromogenic substrate 5-bromo-4-chloro-3-indolyl-beta-D-galactopyranoside (X-Gal) to an insoluble indigo blue dye7 and allows highly sensitive and selective histochemical blue staining of tumor cells in mouse tissue ex vivo down to the single cell level as shown here. This is a low-cost and not equipment-intensive tool, which allows precise validation of metastasis8 in studies assessing new anticancer therapies9-11. A limiting factor of X-gal staining is the low contrast to e.g. blood-related red staining of well vascularized tissues. In lung tissue this problem can be solved by in-situ lung perfusion, a technique that was recently established by Borsig et al.12 who perfused the lungs of mice under anesthesia to clear them from blood and to fix and embed them in-situ under inflation through the trachea. This method prevents also the collapse of the lung and thereby maintains the morphology of functional lung alveoli, which improves the quality of the tissue for histological analysis. In the present study, we describe a new protocol, which takes advantage of a combination of X-gal staining of lacZ-expressing tumor cells and in-situ perfusion and fixation of lung tissue. This refined protocol allows high-sensitivity detection of single metastatic cells in the lung and enabled us in a recent study to detect "dormant" lung micrometastases in a mouse model13, which was originally described to be non-metastatic14.

Improved Visualization of Lung Metastases at Single Cell Resolution in Mice by Combined In-situ Perfusion of Lung Tissue and X-Gal Staining of lacZ-Tagged Tumor Cells

The novel protocol reported in the present study allows selective detection of lung metastases at single cell resolution in mice by combined in-situ lung perfusion and fixation and X-Gal staining of lacZ-tagged tumor cells.

복합에 의한 마우스의 싱글 셀 해상도에서 폐 Metastases의 향상된 시각화<em&gt;에서 시츄</em폐 조직 및 X-걸의 착색의&gt; 재관류<em&gt; lacZ</em&gt; 태그 종양 세포

Metastasis is the main cause of death in the majority of cancer types and consequently a main focus in cancer research. However, the detection of ...

Isolation of Cardiomyocyte Nuclei from Post-mortem Tissue

Identification of cardiomyocyte nuclei has been challenging in tissue sections as most strategies rely only on cytoplasmic marker proteins1. Rare events in cardiac myocytes such as proliferation and apoptosis require an accurate identification of cardiac myocyte nuclei to analyze cellular renewal in homeostasis and in pathological conditions2. Here, we provide a method to isolate cardiomyocyte nuclei from post mortem tissue by density sedimentation and immunolabeling with antibodies against pericentriolar material 1 (PCM-1) and subsequent flow cytometry sorting. This strategy allows a high throughput analysis and isolation with the advantage of working equally well on fresh tissue and frozen archival material. This makes it possible to study material already collected in biobanks. This technique is applicable and tested in a wide range of species and suitable for multiple downstream applications such as carbon-14 dating3, cell-cycle analysis4, visualization of thymidine analogues (e.g. BrdU and IdU)4, transcriptome and epigenetic analysis.

Cardiac nuclei are isolated via density sedimentation and immunolabeled with antibodies against pericentriolar material 1 (PCM-1) to identify and sort cardiomyocyte nuclei by flow cytometry.

사후 조직에서 Cardiomyocyte 핵의 분리

Identification of cardiomyocyte nuclei has been challenging in tissue sections as most strategies rely only on cytoplasmic marker proteins1. Rare events ...

Quantitative Analysis of Chromatin Proteomes in Disease

In the nucleus reside the proteomes whose functions are most intimately linked with gene regulation. Adult mammalian cardiomyocyte nuclei are unique due to the high percentage of binucleated cells,1 the predominantly heterochromatic state of the DNA, and the non-dividing nature of the cardiomyocyte which renders adult nuclei in a permanent state of interphase.2 Transcriptional regulation during development and disease have been well studied in this organ,3-5 but what remains relatively unexplored is the role played by the nuclear proteins responsible for DNA packaging and expression, and how these proteins control changes in transcriptional programs that occur during disease.6 In the developed world, heart disease is the number one cause of mortality for both men and women.7 Insight on how nuclear proteins cooperate to regulate the progression of this disease is critical for advancing the current treatment options.
Mass spectrometry is the ideal tool for addressing these questions as it allows for an unbiased annotation of the nuclear proteome and relative quantification for how the abundance of these proteins changes with disease. While there have been several proteomic studies for mammalian nuclear protein complexes,8-13 until recently14 there has been only one study examining the cardiac nuclear proteome, and it considered the entire nucleus, rather than exploring the proteome at the level of nuclear sub compartments.15 In large part, this shortage of work is due to the difficulty of isolating cardiac nuclei. Cardiac nuclei occur within a rigid and dense actin-myosin apparatus to which they are connected via multiple extensions from the endoplasmic reticulum, to the extent that myocyte contraction alters their overall shape.16 Additionally, cardiomyocytes are 40% mitochondria by volume17 which necessitates enrichment of the nucleus apart from the other organelles. Here we describe a protocol for cardiac nuclear enrichment and further fractionation into biologically-relevant compartments. Furthermore, we detail methods for label-free quantitative mass spectrometric dissection of these fractions-techniques amenable to in vivo experimentation in various animal models and organ systems where metabolic labeling is not feasible.

Advances in mass spectrometry have allowed the high throughput analysis of protein expression and modification in a host of tissues. Combined with subcellular fractionation and disease models, quantitative mass spectrometry and bioinformatics can reveal new properties in biological systems. The method described herein analyzes chromatin-associated proteins in the setting of heart disease and is readily applicable to other in vivo models of human disease.

질병의 염색질 Proteomes의 정량 분석

In the nucleus reside the proteomes whose functions are most intimately linked with gene regulation. Adult mammalian cardiomyocyte nuclei are unique due ...

Murine Heterotopic Heart Transplant Technique

It is now over forty years since this technique was first reported by Corry, Wynn and Russell. Although it took some years for other labs to become proficient in and utilize this technique, it is now widely used by many laboratories around the world. A significant refinement to the original technique was developed and reported in 2001 by Niimi. Described here are the techniques that have evolved over more than a decade in the hands of three surgeons (Plenter, Grazia, Pietra) in our center. These techniques are now being passed on to a younger generation of surgeons and researchers.
Based largely on the Niimi experience, the procedures used have evolved in the fine details - details which we will endeavor to relate here in such a way that others may be able to use this very useful model. Like Niimi, we have found that a video aid to learning is a priceless resource for the beginner.

The manuscript describes the steps required to perform the heterotopic heart transplant in the mouse.

쥐 이소성 심장 이식 기술

It is now over forty years since this technique was first reported by Corry, Wynn and Russell. Although it took some years for other labs to become ...

Multi-electrode Array Recordings of Human Epileptic Postoperative Cortical Tissue

Epilepsy, affecting about 1% of the population, comprises a group of neurological disorders characterized by the periodic occurrence of seizures, which disrupt normal brain function. Despite treatment with currently available antiepileptic drugs targeting neuronal functions, one third of patients with epilepsy are pharmacoresistant. In this condition, surgical resection of the brain area generating seizures remains the only alternative treatment. Studying human epileptic tissues has contributed to understand new epileptogenic mechanisms during the last 10 years. Indeed, these tissues generate spontaneous interictal epileptic discharges as well as pharmacologically-induced ictal events which can be recorded with classical electrophysiology techniques. Remarkably, multi-electrode arrays (MEAs), which are microfabricated devices embedding an array of spatially arranged microelectrodes, provide the unique opportunity to simultaneously stimulate and record field potentials, as well as action potentials of multiple neurons from different areas of the tissue. Thus MEAs recordings offer an excellent approach to study the spatio-temporal patterns of spontaneous interictal and evoked seizure-like events and the mechanisms underlying seizure onset and propagation. Here we describe how to prepare human cortical slices from surgically resected tissue and to record with MEAs interictal and ictal-like events ex vivo.

We here describe how to perform multi-electrode array recordings of human epileptic cortical tissue. Epileptic tissue resection, slice preparation and multi-electrode array recordings of interictal and ictal events are demonstrated in detail.

인간의 간질 수술 후 두피 조직의 다중 전극 어레이 레코딩

Epilepsy, affecting about 1% of the population, comprises a group of neurological disorders characterized by the periodic occurrence of seizures, which ...

Murine Kidney Transplant Technique

The first mouse kidney transplant technique was published in 19731 by the Russell laboratory. Although it took some years for other labs to become proficient in and utilize this technique, it is now widely used by many laboratories around the world. A significant refinement to the original technique using the donor aorta to form the arterial anastomosis instead of the renal artery was developed and reported in 1993 by Kalina and Mottram 2 with a further advancement coming from the same laboratory in 1999 3. While one can become proficient in this model, a search of the literature reveals that many labs still experience a high proportion of graft loss due to arterial thrombosis. We describe here a technique that was devised in our laboratory that vastly reduces the arterial thrombus reported by others 4,5. This is achieved by forming a heel-and-toe cuff of the donor infra-renal aorta that facilitates a larger anastomosis and straighter blood flow into the kidney.

The goal of this manuscript is to describe the steps required to perform a kidney transplant in a mouse, paying particular attention to the details of the arterial anastomosis.

쥐 신장 이식 기술

The first mouse kidney transplant technique was published in 19731 by the Russell laboratory. Although it took some years for other labs to become ...

Vein Interposition Model: A Suitable Model to Study Bypass Graft Patency

Bypass grafting is an established treatment method for coronary artery disease. Graft patency continues to be the Achilles heel of saphenous vein grafts. Research models for bypass graft failure are essential for a better understanding of pathobiological and pathophysiological processes during graft patency loss. Large animal models, such as pigs or sheep, resemble human anatomical structures but require special facilities and equipment. This video describes a rat vein interposition model to investigate vein graft patency loss. Rats are inexpensive and easy to handle. Compared to mouse models, the convenient size of rats permits better operability and enables a sufficient amount of material to be obtained for further diverse analysis. In brief, the inferior epigastric vein of a donor rat is harvested and used to replace a segment of the femoral artery. Anastomosis is conducted via single stitches and sealed with fibrin glue. Graft patency can be monitored non-invasively using duplex sonography. Myointimal hyperplasia, which is the main cause for graft patency loss, develops progressively over time and can be calculated from histological cross sections.

This video demonstrates a model to study the development of myointimal hyperplasia after venous interposition surgery in rats.

정맥 삽입 위치 모델 : 바이 패스 이식 개통을 연구하기위한 적절한 모델

Bypass grafting is an established treatment method for coronary artery disease. Graft patency continues to be the Achilles heel of saphenous vein grafts. ...

Quantitative Visualization of Leukocyte Infiltrate in a Murine Model of Fulminant Myocarditis by Light Sheet Microscopy

Light-sheet fluorescence microscopy (LSFM), in combination with chemical clearing protocols, has become the gold standard for analyzing fluorescently labelled structures in large biological specimens, and is down to cellular resolution. Meanwhile, the constant refinement of underlying protocols and the enhanced availability of specialized commercial systems enable us to investigate the microstructure of whole mouse organs and even allow for the characterization of cellular behavior in various live-cell imaging approaches. Here, we describe a protocol for the spatial whole-mount visualization and quantification of the CD45+ leukocyte population in inflamed mouse hearts. The method employs a transgenic mouse strain (CD11c.DTR)that has recently been shown to serve as a robust, inducible model for the study of the development of fulminant fatal myocarditis, characterized by lethal cardiac arrhythmias. This protocol includes myocarditis induction, intravital antibody-mediated cell staining, organ preparation, and LSFM with subsequent computer-assisted image post-processing. Although presented as a highly-adapted method for our particular scientific question, the protocol represents the blueprint of an easily adjustable system that can also target completely different fluorescent structures in other organs and even in other species.

Here, we describe a light-sheet microscopy approach to visualize the cardiac CD45+ leukocyte infiltrate in a murine model of aseptic fulminant myocarditis, which is induced by the intratracheal diphtheria toxin treatment of CD11c.DTR mice.

Light Sheet Microscopy에 의한 심근 성 심근염의 Murine 모델에서의 백혈구 침윤의 정량적 시각화

Light-sheet fluorescence microscopy (LSFM), in combination with chemical clearing protocols, has become the gold standard for analyzing fluorescently ...