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세포 변성 효과 (CPE) 기반의 분석, 용량 - 반응 분석 및 시간 - 중 - 추가 TOA () 분석 등의 세 가지 분석은 물론, 개발, 최적화, 검증 및 Bluetongue 바이러스에 대한 새로운 항 바이러스제 (BTV)를 식별하기 위해 사용 된 새로 확인 된 항 바이러스제에 사용할 수있는 기계 장치의 액션 (대학교 미술관)을 결정하기로.
BTV에 대한 잠재적 인 항 바이러스제를 확인하기 위해, 우리는 개발, 최적화 및 여기에 제시된 세 가지 분석을 확인했다. CPE 기반의 분석은 화합물은 항 바이러스 효능을 보여 큰 화합물 라이브러리를 화면으로 사용되었는지 여부를 평가하기 위해 개발 된 최초의 분석이었다. 한편, 항 바이러스의 세포 독성은 CPE 기반 분석을 사용하여 평가 될 수있다. 용량 - 반응 분석을 선택된 바이러스에 대한 효능의 범위를 결정하기 위해 디자인 된, 50 % 억제 농도 (IC 50)이나 유효 농도 (EC 50)뿐만 아니라 세포 독성의 범위 (CC 50) 즉. 토아 분석은 BTV 바이러스 라이프 사이클 또는 호스트 세포 기계에 대한 가능한 영향 동안 새로운 항 바이러스제의 기본 메커니즘을 결정하는 최초의 대학교 미술관의 연구에 사용 하였다. 이러한 분석은 세포 배양 시스템의 항 바이러스 효능을 평가하는데 매우 중요합니다, 우리의 최근의 연구지도를 위해 사용되어왔다BTV에 대한 새로운 항 바이러스제의 숫자의 식별을 보내고.
BTV는 속 Orbivirus, 가족 Reoviridae에 프로토 타입 이중 가닥 RNA 바이러스이다. BTV는 세계 1,2 30억달러 / 년 손실, 양, 염소, 소와 다른 가축 등 국내 가축의 가장 중요한 질병 중 하나입니다. 이국적인 BTV의 혈청 형에 나열된 중요한 동물 병원체는 "USDA 높은 위험성 평가 가축 병원체." 최근 다시 부상 BTV의 북부 유럽 3,4에 걸쳐 여러 국가의 주요 가축 질병의 발생과 양을 발생했습니다. 경제적으로 중요한 결과 및 모델 시스템으로서, BTV는 유용한, 분자 유전 학적 및 구조적 연구의 대상이되어 왔으며, 몇몇 백신이 개발되었다. 그러나, 항 바이러스 약물 발견을위한 적합한 분석법의 부족 때문에, BTV 대에는 항 바이러스제는 없다.
모델 시스템으로 BTV를 사용하여 최근의 높은 처리량 검사 (HTS) 캠페인, 우리는 거라고, eveloped 최적화 아르보 바이러스 5에 대한 잠재적 인 광범위한 스펙트럼 항 바이러스를 식별 할 수있는 CPE 기반의 분석을 확인. CPE 기반의 분석은 신속하고 관찰 할 수있는 CPE / 세포 사멸 5-7을 유발 바이러스의 숫자에 대한 항 바이러스 약물 발견에 사용 된 잘 인식 분석이다. 우리의 시스템에서, 포스트 BTV 감염, CPE는 헬라, BSR 및 HEK 293T 8을 포함한 척추 동물의 세포에 분명하다. BTV 유도 CPE는 CellTiter 글로 세포 생존 시약 키트 (CTG 키트) 9를 포함한 다양한 세포 생존 검출 방법을 사용하여 모니터링하고 정량화 할 수있다. 이 키트는 대사 적으로 활성 살아있는 세포의 존재를 신호 셀룰러 ATP의 정량에 기초 문화 가능한 세포의 개수 표시를 결정한다. 최적의 조건에서, 여기에 제시된 CPE 기반의 분석은 "혼합 및 측정"한 단계 프로토콜 및 안정 발광 신호와 유연성의 가능성을 보여 주었다. 한편, 독성 화합물의 redu세포 생존 능력을의 cing은이 CPE 기반 분석에서 제외됩니다. CPE 기반의 분석은 그 견고성과 BTV에 대한 항 바이러스 약물 발견을위한 신뢰성을 보여 잠재적 인 항 바이러스 리드 화합물 (들 여섯 새로운 클러스터의 식별에지도하는 NIH 분자 도서관 작은 분자 저장소 (MLSMR)를 화면에 사용 된 ) 5.
잠재적 인 항 바이러스 화합물을 CPE 기반 분석을 사용하여 확인 된 경우는 항 바이러스 효능 및 독성 2의 범위를 결정하기 위하여 열 - 농도 용량 - 반응 분석을 실시 할 필요가있을 것이다. 항 바이러스 효능은 50 % 억제 농도 (IC 50) 또는 50 % 유효 농도 (EC 50)로 표현,베이스 라인과 최대 사이에 바이러스에 의한 CPE 반 억제하는 약물의 농도이다. 항 바이러스제의 세포 독성은, 50 %의 세포 독성 농도 (CC 50) 즉, 농도는기준선과 최대 사이의 50 % 세포 독성을 유발하는 약물. 50 % SI (SI 50)로 표시 선택적 지수 (SI)는 바이러스에 의한 CPE에 대한 항 바이러스의 특이성을 결정 CC 50 / IC (50)로부터 계산된다. IC 50 (또는 EC 50), CC (50)와 SI (50) 값은 항 바이러스 화합물은 강력하고 더 약물 개발을위한 선택 여부를 확인하는 중요한 조치이다.
항 바이러스가 시험 관내에서 어떠한 명백한 독성을 나타내지 않았다 아직 방지 바이러스 CPE 및 생산성 바이러스 라이프 사이클을 유도 할 때, 그 2 대학교 미술관을 특성화하는 것이 중요하다. 우리는 바이러스에 의해 영향 바이러스 라이프 사이클의 수 단계 (들)를 결정하기 위하여 토아 분석을 수행하여 그러한 특성을 개시. 일반적으로, 항 바이러스 화합물을 상이한 시간 전 또는 후 바이러스 감염시 세포에 첨가 하였다. 항 바이러스가 감염된 세포에 추가 된 경우 그 대상들에 게시이전 단계에 첨가 한 비교하여 TEP 감염 과정 동안, 그것은 낮은 활성을 초래할 것이다. 따라서, 토아 연구는 하나의 바이러스 라이프 사이클 또는 바이러스 성 수명주기에 관여 호스트 기계에, 화합물의 항 바이러스 효능, 그것의 잠재적 인 대상을 결정하는 것이 중요합니다.
세 가지 분석법을 위해, 세포 생존율은 제조업체의 지시에 5 다음 CTG 키트를 사용하여 측정 하였다. 이 검출 시스템은 다양한 내부 소프트웨어를 사용하여 분석 할 수있는 적절한 발광 신호를 출력한다. 각각의 분석은 적어도 8 개의 복제본이 중으로 확인 및 수행 하였다. 모든 콘텐츠 데이터의 경우, 평균값 (AVE), 표준 편차 (STDEV) 및 공동 효율적인 변동 (CV) 등 세 가지 파라미터는, 분석의 견고성을 결정하기 위해 분석 하였다. 분석의 견고성이 결정되면, 데이터가 더 분석하고 다양한 biostatics 및 graphi를 이용하여 나타내 어질 것이다C 공구 2.
1. 셀, 바이러스 및 항 바이러스 화합물
2. CTG 키트를 사용하여 CPE 기반 분석
3. 용량 - 반응 분석
4. 시간의 - 추가 TOA () 분석
5. 데이터 분석
1. 화합물의 항 바이러스 효능
세포 기반 분석 CPE는, 개발 및 최적화 이전 2,5 바와 같이 BTV 대해 신규 바이러스제를 식별하는 발광 기반 CTG 키트를 사용하여 시험 관내에서 입증되었다. 열 - 투여 량 반응 분석은 살아있는 세포 5,11 제시 세포 ATP의 정량에 기초 문화 대사 생존 세포의 수를 측정함으로써 확인 된 리드 화합물의 항 바이러스 효능 및 독성을 반영하기 위해 사용 하였다. 우리의 이전 보고서에서 잠재적 인 항 바이러스 화합물의 수는 BTV 5에 대한 HTS를 통해 식별 된 각 클러스터에서 화합물을 포함하여, 평가, 및 그 유도체를 통해 새로이 합성 2했다. 해당 EC (50)에 기초하여, CC (50) 및 SI (50)는 여러 가지 유망한 납 화합물은 강력한 항 바이러스 효능, 낮은 독성 및 높은 선택성으로 확인되었다. 예를 들어, compound052 (C052)0.27 ± 0.12 μM의 EC 50 (그림 1) 2 82.69 μM의 CC (50), 비선형 회귀 분석에서 모두 보여주는 전형적인 회귀 곡선이 분석을하기로 결정했습니다. C052의 SI (50)는 해당 EC (50) 및 CC (50) 값을 기준 (306)에서 결정되었다. 나노 몰 규모의 항 바이러스 효과, 낮은 독성, 결과적으로 높은 SI (50)는 C052은 BTV에 대한 강력하고 선택적인 항 바이러스가 될 수 있음을 지적했다.
2. 항 바이러스 화합물에 대한 잠재적 인 대학교 미술관
토아 분석은 화합물의 표적이 바이러스 성 수명주기의 가능한 단계 (들)을 결정하는 것을 목표로했다. 이전 BTV 감염에 1 ~ 2 시간에서 C052을 추가 할 때, 즉, -1과 -2 HPI, 항 바이러스 효능은, C052은 바이러스 라이프 사이클의 초기 단계를 넘어 행동 할 수 있음을 나타내는 나노 몰 스케일 (그림 2) 2에 남아 바이러스 항목으로. FurtheC052이 아니라 24 이후 HPI 감염된 세포에 첨가 될 때까지 rmore, 항 바이러스 효능은 변화가 없었다. 32 HPI에서 첨가 할 경우, 생존 세포의 비율은 C052는 바이러스 라이프 사이클의 단계에서 더 적은 보호되었음을 나타내는, C052 처리 세포에서 감소 하였다. 48 HPI에 추가 할 때, BTV 유도 CPE에서 BSR 세포에 대한 보호 조치가 없었다. 보통 24 HPI 내에서 감염된 세포에 완료 BTV 바이러스 복제의 첫 번째주기 때문에, 우리의 결과는 C052는 바이러스 복제, 포장, 성숙 및 송신 등 BTV 바이러스 라이프 사이클의 후반 단계에서, 역할을 할 수 있다고 제안했다. 한편, C052 늦게 바이러스 라이프 사이클 2시 참여했다 호스트 세포의 기계에서 작동 할 수 있다는 것도 가능하다.
표 1. 용량 - 반응 분석을위한 플레이트 레이아웃. C052의 항 바이러스 효과를 평가했다384 - 웰 플레이트 내의 96 - 웰 스케일 D. BTV 감염 플러스 다른 C052 농도 등 각 처리는, 팔 복제본 수행 하였다. 72 HPI에서, 세포 생존율은 CTG 키트를 사용하여 측정 하였다.
표. 시간의 - 추가 TOA () 분석을위한 2 판의 레이아웃입니다. 레이아웃에 표시된 C052의 토아 분석이 384 웰 플레이트에서 평가 하였다. BTV 감염 플러스 C052을 추가의 시간을 포함하여 각각의 처리는, 팔 복제본으로 행했다. -2와 -1 HPI는 C052이 BTV 감염하기 전에 세포에 추가 된 것을 나타냅니다. 0 HPI에서, BTV 및 C052 동시에 추가되었다. 72 HPI에서, 세포 생존 능력은 CTG 키트를 사용하여 측정 하였다. 표를 보려면 여기를 클릭하십시오 .
그림 1. 도면에 나타낸 바와 같이 C052. 세포의 항 바이러스 효능은 C052의 열 상이한 농도의 존재하에 0.01의 MOI에서 BTV로 감염시켰다. 세포 생존율은 CTG 키트를 사용하여, 72 HPI에서 결정 하였다. 각 데이터 포인트는 다섯 개의 반복의 의미와 SD를 나타냅니다. 이 그림은 구 등에서 수정되었습니다. 2012 2.
그림 2. 표시된 바와 C052위한 시간 형 - 가산 분석. 2.5 ㎜이고, 각각 0.27 mM의 AT, C052은 상이한 HPI에서 BTV 감염된 세포에 첨가하고, BTV 유도 CPE, 또는 세포 생존에 대하여 C052의 보호는, 사용하여 측정 하였다 72 HPI 각 데이터 포인트에서 CTG 킷은 평균값을 나타내여덟 독립적 인 반복 실험에서의 및 SD. 이 그림은 구 등에서 수정되었습니다. 2,012 2.
바이러스 히트 초기 식별, 항 바이러스 약물 발견과 개발을위한 중요한 단계 중 하나는, 정량 가능한 마커를 선택하는 간단한 프로토콜을 개발, 충분한 신호와 10 % 미만의 CV를 획득 포함하는 견고한 분석법을 개발하는 것이다. 대부분의 생화학 적 또는 세포 - 기반 화면 인해 선별 과정에서 필요한 재현성 및 스크리닝하는 분자의 잠재적으로 많은 수의 가장 강력한, 간단하고 저렴한 분석, 기초 화학 시작점을 제공하도록 설계된다. CPE 기반 분석은 큰 화합물 라이브러리에서 효과적인 히트를 식별하기 위해 이러한 요구 사항을 충족하도록 지정되었다. CPE는 바이러스의 증식과 관련된 배양 된 세포에 악영향을 의미한다. 다양한 분석법기구에게 사균의 수 (세포 독성), 생균 수 (생존)를 나타내는 다른 마커의 다양한 측정을 통해 CPE 표시기를 사용 가능하고,세포 사멸 (아폽토시스). CPE 기반 분석 용 상용 시약은 간단한 분석 프로토콜을 사용할 수 있습니다. 예를 들어, CTG 키트는 하나의 "혼합 및 측정"단계를 포함하고 널리 바이러스에 의한 CPE를 정량화하는 데 사용되었습니다. 그러나, CPE 기반의 분석은 빠른 CPE를 유도 할 수있는 바이러스로 제한됩니다. 빠른 CPE를 유발하지 않는 바이러스에 대한 다양한 분석이 개발되고있다. 예를 들어, 플리 - 은닉 세포주를 이용한 레 플리 콘 - 기반 분석법은 번역, 폴리 프로테인 프로세싱 및 마이너스 - 플러스 - 가닥 RNA 합성 12-14 포함한 바이러스 복제의 억제제 스크리닝을 허용한다. 안티센스 RNA 전략 및 소분자 라이브러리 가상 선별도 가능 바이러스제 15,16을 식별하는데 사용될 수있다. 그럼에도 불구하고, 항 바이러스 약물의 효능은 전체 바이러스의 라이프 사이클에 대하여 항 바이러스 효능을 평가할 수있는 시험 관내 세포 - 기반 분석에서 검증하는 것이 중요하다. CPE 기반분석은 성공적으로 높은 처리량 형식으로 적응 인플루엔자 바이러스 6,17, 중증 급성 호흡기 증후군 코로나 바이러스 (SARS-CoV의) 18에 대한 최근 수행 HTS 검진 등의 큰 화합물 라이브러리의 심사에 대한 가장 신뢰할 수 있고 강력한 분석 중 하나입니다되었습니다 , 19 arenaviruses 및 Reovirus (Bluetongue 바이러스) 5.
용량 - 반응 분석은 더 일반적으로 큰 화합물 라이브러리를 심사 한 후, 단일 투여 CPE 기반의 분석을 통해 확인 된 히트의 항 바이러스 효능을 검증하기 위해 지정되었다. 이 안타, 항 바이러스 활성을 확인하지만, 약이 될 자신의 잠재력을 나타 내기 위해 추가 확인이 필요합니다. 화합물의 항 바이러스 효능 EC 50, CC (50)과 투여 량 반응 분석을 사용하여 SI 값 50을 통해 분석을 통해 제시 될 수있다. 한편, 아웃 오프 대상 또는 잘못된 반응이 식별 될 것입니다 리드 샘플의 수ounds가 좁혀 수 있습니다. 이 분석을 통해 화합물의 역가 및 독성의 순서는 특히 구조 활동 관계 (SAR) 분석 및 향후 의약 화학의 수정을 위해, 미래의 항 바이러스 약물 발견을 직접 선정 할 수있다. 사실, 화합물 C052는 시험 관내 및 생체 내에서 모두 좋은 마약과 같은 속성과 관련된 복합 C003,의 파생했다.
약물에 대한 요구 사항을 충족하기 위해, 생리적 농도에서 목표와 화합물의 상호 작용을 특성화하기 위해 대학교 미술관, 즉을 결정하기 위하여 필요한 것이다. 다양한 분석, 즉 대상을 억제뿐만 아니라,하지만 허용 용해성, 침투성, 단백질 결합, 선택, 대사 및 독성 프로파일을 가지고, 특히 항 바이러스제의 개발되었다. 대학교 미술관의 연구는 힘든 노력, 강력한 EC 50, 높은 CC 50 시간 만 몇 가지 선택 분자를 필요로 낮은 처리량 분석 이었기 때문에고등학교의 SI (50) 값은 쉽게 분석 할 수 있습니다. 이 단계에서 화합물의 각서를 이해하는 것은 세포 활동의 해석 또는 그것의 부재에 깊이를 추가 할 수 있습니다. 토아 연구는 바이러스가 바이러스 또는 호스트 목표와 상호 작용할 때 무대를 좁힐 수 지정되어 있습니다. 화합물을 아는 것은 더욱 대학교 미술관 분석을위한 즉각적인 방향을 제공 할 수있는 특정 단계 바이러스 라이프 사이클의 기판과의 경쟁이 치열합니다. 또한, 분석 등의 알려진 메커니즘에 더 강력한 세포 기반 분석은 직접 단백질 (21) 표면에 바인딩 바이러스를 억제, HIV-1 인테그라 제 억제제 (20)에 대한 화면은 실제 검사 22 전에 알려진 대학교 미술관을 제공하는 데 사용할 수 있습니다. 이 검사에서 안타 지정된 대학교 미술관에 잘 관련 수도 있지만, 실제로 대학교 미술관은 기타 ToA와 행동 연구의 다른 메커니즘에 피사체가해야 할 수도 있습니다.
요약하면, 여기에보고 된 세 가지 분석을 사용하여, 우리는 성공적으로 상영 확인했습니다C003과 C052 (2)를 포함 BTV에 대한 몇 가지 강력한 항 바이러스제. 특히, C052의 SI (50) (C052은 BTV에 대한 높은 선택성을 제안하는, 306에 최대였다. 토아 원래 논문에서 제시된 다른 대학교 미술관의 연구를 통해, 우리는 C052가 호스트와 상호 작용하는 잠재적 인 항 바이러스제이 될 수 있다고 제안 autophagy에 기계 장치, 안티 - BTV 약물로 개발 될 수있다.
저자는 더 경쟁 재정적 이익이 없다는 것을 선언합니다.
이 프로젝트는 보조금 1R03MH08127-01와 NIH에서 Q. 리튬에 7R03MH08127-02에서 지원하고, UAB에서 의학 교실에서 충격의 펀드 Q. 리 하였다. Molette 기금 오번 대학에서 지원을 받고있다. 우리는 또한 작업 과정에서 양 Pulin 최 씨 블라디미르 Musiienko의 기술 조교 감사합니다.
Name | Company | Catalog Number | Comments |
Name | Company | Catalog Number | Comments |
DMEM medium | Gibco | 1134218 | For cell culture |
FBS | Gibco | 16000044 | For cell culture |
0.05% Trypsin-EDTA | Gibco | 1000185 | For cell culture |
DPBS | Gbico | 1049769 | For cell culture |
CellTiter-Glo (CTG) kit | Promega | TB288 | For cell viability measurement |
70% ethanol | Fisher | S25309B | Diluted from 95% |
Antiviral huashilcompounds | NIH MLSMR and de novo synthesis | ||
BTV-10 | ATCC | VR-187 | |
BSR cell | Developed in house | ||
Synergy-II multi-mode microplate reader | BioTek | For luminescent signal reading | |
MicroFlo select dispenser | BioTek | Adding cells, virus, and reagents | |
384-well flat-bottom microplate | CORNING | 28908031 | For cell culture |
Gen. 5 software | BioTek | For analysis of reading outputs from Synergy-II multi-mode microplate reader | |
GraphPad Prism 5 | GraphPad | Version 5 | For biostatic analysis and plot |
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