シングルセルRNAシーケンシングのためのヒトおよびマウス腫瘍組織サンプルの解離

私たちの研究の範囲は、標準治療の免疫療法における反応または耐性のメカニズムを研究することです。私たちの研究室では、腫瘍に対する免疫応答を成功させる要因は何かを理解し、これらの治療の予測因子を特定して、耐性を克服できる標的を見つけることができるかどうかを理解しようとしています。近年の最大の進歩は、シングルセルRNAシーケンシング技術の開発と統合です。

これにより、個々の細胞の分子的特徴を偏りなくリアルタイムで体系的に研究することができ、これらの複雑で進化する腫瘍生態系の解剖に役立ちます。免疫療法に対する反応メカニズムの研究には、多くの前臨床モデルが用いられていますが、ヒトの免疫に重要な免疫学的決定因子はまだわかっていません。患者サンプルをリアルタイムで処理および分析することは、特定の腫瘍内のすべての細胞コンパートメントを調査する能力にとって非常に重要です。

当研究室では、偏りのないゲノムおよびトランスクリプトーム技術を用いて、抗原提示機構の欠陥がメラノーマの免疫療法耐性と関連していることを発見しました。最近では、シングルセルアプローチを使用して、黒色腫と頭頸部がんの患者の転帰に関連するユニークなT細胞の状態と骨髄細胞の極性を発見しました。私たちのプロトコルの最大の利点は、そのシンプルさにあります。

これは、複数の種類のがんから大小の腫瘍標本を短時間で解離するために調整された万能プロトコールであり、生存率の高い単一細胞懸濁液の生成に至ります。