この出版物は教育省からの助成金によって支えられた (広報賞 #P031C160025-17, プロジェクトのタイトル: 84.031 C) アクティブな幹のビルド婚約 (C ベース) のコロラド州立大学プエブロ (CSU-プエブロ) コミュニティに。我々 は現在動物に感謝、エルゼビア代表の結果を使用する権利を提供するためは、このプロトコルを公開する機会をご提供するゼウスのエディターと同様、以前の論文で出版します。クレア Varian ラモス博士、博士バーナード ・ Possidente (生物学科、スキッドモア カレッジ)、トーマス ・ グラジアーノ C 基本プログラム、博士ブライアン ・ ヴァンデン ・用いた (C ベース、生物学科、CSU プエブロ)、CSU プエブロ生物学部に感謝したいと思います(生物学科、コロラド州立大学プエブロ) の支援と援助です。

次のプロトコルは、毒素の経口摂取が適切なときに汚染されたメディアにショウジョウバエ属の種をリアに使用される実験的プロトコル露出の他の形態は、ショウジョウバエモデル11,15,16,26を使用可能です。このプロトコルで説明する方法は、以前ハーシュらによって記述されています。19とピーターソンら23,24,25。
1. 研究室でショウジョウバエのストック個体数を設定します。
<ol><li>一定の温度、光: 暗いサイクル テスト種の好みに応じて湿度にインキュベーターを設定することによってショウジョウバエの個体数をストック家にインキュベーターの環境制御 (または小さな部屋) を設定します。 注: 最寄りの環境条件によって異なります研究選択種の本来のエコロジー。たとえば、キイロショウジョウバエはサハラ以南のアフリカ27にネイティブとは通常、25 ° C、12:12: 明暗サイクル、および約 60% 湿度16,18,19,20で管理,21,22,23,24,25,28,29,30します一方、 D. montana範囲は広がるカナダおよび米国中西部、、くらいの寒い地域のほとんど。したがって、 D. montanaは通常 19-20 ° C と時々 24 h 光政権の交尾シーズン31中条件をシミュレートするために維持されます。ショウジョウバエの様々 な種の地理的な範囲の詳細な説明、ショウジョウバエ種分化パターンのウェブサイト32を参照してください。</li>
	<li>
どちらか在庫センターから最寄りのショウジョウバエ種や近交系ラインを入手 (材料の表を参照)、フィールドから要求、または収集野生遺伝子変数集団に別の研究所。 注: 次の手順は、研究所を維持するショウジョウバエの野生では、遺伝的変数集団を収集する方法を説明します。これらのメソッドは、1 つの餌のソースとターゲットの特定の種ではなく種の広い多様性を一度に収集する Markow ・ オグレディ33ヴェルナー ・ Jaenike34から変更されています。<ol>
<li>一晩冷凍庫で半ダース熟したバナナを凍結し、餌トラップを設定する前に解凍します。</li>
		<li>餌ボトルとエスケープではありませんでキャプチャするハエを許可するようにボトルの前の u 字状のスリットを切断することによって複数の 1-2 L のペットボトルを準備します。ハエが蓋を介してエスケープしないので、ボトルのキャップ、ペットボトルをキャップします。</li>
		<li>ボトルの底にはバナナの約 1 インチが含まれていますように、ボトルの底に吉濱バナナを追加します。瓶の中には、完熟トマトのスライスを配置します。酵母液に浸して、バナナを取得しますので、ボトルの底にバナナ酵母スラリー (ビール製造プロセスから残りの酵母) を追加します。</li>
		<li>ハエを酵母やバナナから離れて歩くきれいな基板を持っているので、ボトルに (直立した垂直方向の位置) に木の棒を追加します。 図 1は、これらのメソッドの最終的な製品を示しています。</li>
		<li>餌木でボトル一夜にしてすべて 24 時間口吸引瓶の外に飛ぶハングし、個別に iso 女性行を作成する中で女性を配置します。 注: 複数の女性のライン作成できます、ただし、それぞれの種の女性は明確に識別することができる場合にのみ。さらに、ショウジョウバエ属内でハエの生態的ニッチを占めるやそれらのニッチ (ヴェルナー ・ Jaenike34); に応じて栄養要件が異なりますヴェルナー ・ Jaenike34ダイエットの推奨事項と料理のレシピを参照してください。</li>
		<li>収集したショウジョウバエの種を識別するために解剖顕微鏡の下で成人の F1の子孫を調べる (Markow ・ オグレディ33と様々 な種を識別するに援助をヴェルナー ・ Jaenike の34を参照してください。).</li>
	</ol>
</li>
</ol><img alt="Figure 1" class="xfigimg" src="/files/ftp_upload/57450/57450fig1.jpg"> 図 1: トラップとフィールドにおけるショウジョウバエの野生の人口を集めるための餌の絵画表現。(A)フライ トラップ セットがコロラド州のローカル フィールドのサイトです。(B)ハエの緊密なビューは、この現場でセットをトラップします。<a href="/files/ftp_upload/57450/57450fig1large.jpg" target="_blank">この図の拡大版を表示するのにはここをクリックしてください</a>。
<ol start="3"><li>Iso 女性やインキュベーターの環境制御や部屋の一定の温度と湿度、: 明暗サイクルで複数女性のラインを維持します。これを行うには、家は、バイアルに飛ぶまたはボトルで媒体を優先、培地で卵を産む妊娠女性を許可します。幼虫と蛹の存在のバイアルを監視します。 注:ショウジョウバエ属内のハエ生態的ニッチを占めるし、異なる食事の要件とそれらのニッチ33,34によって環境の非生物的環境設定があります。環境設定と食事に関する勧告 (とさらに飛ぶ飼育上の命令) は、エルジン アンド ミラー28で見つけることができます・ シェイファーら。29ストッカーと勇敢な30Markow ・ オグレディ33ヴェルナー ・ Jaenike34野生で捕獲された種を使用して、種を識別できるまで、ローカルの環境条件は、インキュベーターでシミュレートできます。</li>
	<li>新鮮な媒体に頻繁に株式を譲渡、健康的なラインを維持する古い瓶を破棄し、ダニから感染を避けるためです。 注: 転送の周波数は、種のライフ サイクルによって異なります。たとえば、新鮮な媒体には、キイロショウジョウバエは 2 週間ごと転送します。研究室では、ラインを維持するの詳細については、ランドらを参照してください。16、エルジン アンド ミラー28、シェーファーら。科学教育、グリーン スパン35ストッカーと勇敢な30 29データベース36。</li>
</ol>2. リアショウジョウバエ汚染中
注: 新しい contaminant(s)、初めての研究室でショウジョウバエをテストした場合識別する致命的な線量 (カスタネダらを参照してください。37と Massieら38メソッド) と LD50 (カスタネダらを参照してください。37 ・ エイキンスら。39メソッドの) 最初。その後、目的の表現型出力; 生物学的関連性の高い濃度を識別するために用量反応曲線を実行します。ハーシュらを参照してください。19と周ら。40のメソッド。
<ol><li>汚染物質の化学的性質によって、目的の concentration(s) にある汚染された媒体の貯蔵液を準備します。 注: たとえば、PbAc の貯蔵液の準備: 汚染水に達すると必要な濃度で作られた媒体まで蒸留水 (dH20) に汚染物質を追加することによって酢酸鉛 (PbAc) 媒体の貯蔵液の準備します。たとえば、1,000 μ M の原液 PbAc、できることにより調製 PbAc dH20 1,000 μ M に達するまで PbAc。さらに、原液 (例えば1,000 μ M PbAc ソリューション) を必要な濃度に希釈 (500 μ M など PbAc) と同様に在庫としてこれらのソリューションを維持します。</li>
	<li>メディア コントロール メディアとして機能する製造元のガイドラインの準備します。次の製造元のガイドライン追加メディアを準備します。ただし、サプリメントは、dH20 汚染ソリューションを準備しました。 注: たとえば、インスタントショウジョウバエ媒体を使用している場合約小さじ 1 インスタント培地に追加プラスチック バイアル。培地に約 5 から 5.5 mL dH20 を追加します。ライブ コントロール メディアの準備の酵母の数粒を振りかけます。実験的メディアの準備、在庫ソリューションを補完 (500 μ M など PbAc) dH20。</li>
	<li>
コントロールと実験中にストック個体から繁殖可能な成熟した男性と女性を転送します。 注: 生殖成熟に時間後羽化ショウジョウバエ種41間が違います。<ol>
<li>やさしく利き手でダウン在庫ハエのバイアルをタップします。バイアルの下部に自動的に、ハエの移動を確認します。他の手では、バイアルをタップしながらバイアルのキャップを取り外し、ハエとバイアルの上にコントロールまたは汚染された培地の新鮮なバイアル。一緒にバイアルを保持し、それらを裏返して、やさしくタッピング、ハエはコントロールまたは汚染された培地の新鮮なバイアルに自動的に転送されます。まだハエのバイアルをタップ、バイアルをキャップします。</li>
		<li>各バイアルにハエの数を標準化することを確かめる複数のバイアルを繰り返します。 注: 大人数の合計転送経由でシングル転送または麻酔、混雑を避けるため使用バイアルのサイズによって異なります。</li>
		<li>24-96 h の中に産卵する相手に大人ができ、標準的な環境条件 (すなわちインキュベーター) で大人を孵化させなさい。</li>
		<li>24-96 時間後破棄遺体安置所 (鉱物油を充填し、タイトなフィッティング漏斗でキャップ フラスコ) で大人を残して受精テストの成熟する卵 (これは後で実験の被験者になる)。開発する卵を許可するインキュベーターでバイアルを配置します。</li>
		<li>メディアから浮上している幼虫を探してさまよう幼虫の瓶を監視します。</li>
	</ol>
</li>
</ol>3. さまざまな発達段階で被験者を収集します。
注: 実験科目は、あらゆる発達段階、ブラインド コード化された 15 mL コニカル チューブに配置され、蓄積のためにテストで収集することができます。汚染物質の蓄積をテスト用のメソッドは、研究されている汚染物質によって異なります。たとえば、PbAc の蓄積は、Inductively-Coupled プラズマ質量分析法 (ICP-MS)42を使用してテストできます。さらに、実験科目は様々 な汚染物質の表現型効果をテストするすべての発達段階で収集することができます。図 2は、43ショウジョウバエのライフ サイクルを示しています。図 3は、露出のための実験プロトコルとコレクションの異なる発達段階を示しています。
<img alt="Figure 2" class="xfigimg" src="/files/ftp_upload/57450/57450fig2.jpg"> 図 2:キイロショウジョウバエ(最も一般的に使用されるショウジョウバエモデル システム) のライフ サイクルの概念の概要します。ショウジョウバエのライフ サイクルの段階である: 卵 1)、2) 初令の幼虫、3) 第二齢幼虫、5) 放浪 3 齢幼虫 4) 3 齢幼虫 6) メジロ蛹, 7) 赤目さなぎ、8) 新しくこの大人、および 9) 成熟した大人です。<a href="/files/ftp_upload/57450/57450fig2large.jpg" target="_blank">この図の拡大版を表示するのにはここをクリックしてください</a>。
<img alt="Figure 3" class="xfigimg" src="/files/ftp_upload/57450/57450fig3.jpg"> 図 3: 経口両方の親 (F0) とその後の世代に汚染されたメディアにショウジョウバエを公開するための方法の概要 (F1以降).(A)公開された世代で開発中の経口暴露法(B)子孫 (希望の世代に1 F) に汚染物質の転送をテストする方法。この図は、ピーターソンらから変更されています。24<a href="/files/ftp_upload/57450/57450fig3large.jpg" target="_blank">この図の拡大版を表示するのにはここをクリックしてください</a>。
<ol><li>
徘徊 3 齢幼虫を収集します。
	<ol>
<li>ライト オン、インキュベーター内に幼虫が中から出てくる、インキュベーターでライトをオンにした後、h 内瓶の側面に上方に移動するとき、バイアルを監視を開始します。この時間以内には、慎重に木の棒やピンセットを使用バイアルの側面から放浪 3 齢幼虫を削除します。 注: 幼虫のコレクションの使用可能数が「2.3.4」中に産んだ卵の数によって異なります。</li>
		<li>幼虫から余分な培地を取り除き、dH2O を注ぐ dH2O ビーカーから小さなビーカーに幼虫を配置し、繊細なタスク ワイパーに幼虫を配置します。幼虫から余分な dH2O を削除優しく繊細なタスク ワイパーを使用すると、します。</li>
		<li>環境制御のインキュベーターで実験的集団を維持します。</li>
	</ol>
</li>
	<li>
新しくこの大人が収集します。
	<ol>
<li>バイアルの両側に沿って蛹の呈色反応を観察することで羽化のバイアルを監視します。 注意: 開発時に蛹が暗くなります。発生時間、特に前羽化は、試験動物種によって異なります。</li>
		<li>最初の大人は eclose を開始するときは、ダンプし、鉱物油を含む遺体安置所にこれらの大人を破棄します。</li>
		<li>ライトは、次の朝、インキュベーターでオン、ダンプし、可能性がありますは、この一晩または morningbefore ライト中に年齢不詳 (または処女) の大人を破棄します。</li>
		<li>約 4 時間後、バイアルに CO2銃で新しくこの大人として浮上している成人を麻酔します。解剖顕微鏡の下で CO2プレートに大人を配置します。男性と女性の ovipositors の前肢に櫛を探して大人をセックスします。 注:キイロショウジョウバエは、交配を避けるために羽化の 6 時間以内に収集する必要があるかもしれない他の種もはや発達回 (およびそのため、この時間枠の内で収集する必要はありません)。</li>
		<li>木の棒を使用して CO2皿の上別の大人。優しくセックス固有のグループの中の一致する既存の歴史に木の棒を使用して大人を転送します。</li>
	</ol>
</li>
	<li>
成熟した大人の後羽化を収集します。
	<ol>
<li>環境制御のインキュベーターで希望年齢後羽化に卵の段階から中の一致する前羽化露出のままに大人を許可します。</li>
		<li>単独で大人を自分の体を過剰な汚染された媒体を新郎に大人を許可するようにテストの前に 24 時間制御媒体に転送します。</li>
	</ol>
</li>
</ol>4. リアの多世代の影響や継代露出をテストする実験科目。
<ol><li>親の世代 (別名 P0または F0世代) をリアに「2.3」と「3.3」に「3.1」コントロールと「2.1」の手順に従って実験中にストックの集団から大人を転送します。</li>
	<li>大人が生殖成熟 (Pitnickらを参照してください。41)、単独でのコントロールや実験中の新鮮なバイアルに男性の転送 (前述の 2.3.1) バイアル。単独男性を含む新鮮なバイアルに女性の 1 つのバイアルを転送します。24 96 h. ダンプの中でチームメイトと卵を産む大人を許可し鉱物油を含む遺体安置所に大人を破棄し、再開発する子孫を許可するバイアルをインキュベートします。</li>
	<li>4.1 4.2 世代数の目的に応じてからの手順を繰り返します。</li>
</ol>

著者が明らかに何もありません。

キイロショウジョウバエは、遺伝子とキイロショウジョウバエと人間の13,14間の経路の広範な保全のための生物学的プロセスの範囲の強力なモデルとして確立しています。同じ理由で医学、強力なモデルである、ショウジョウバエは、毒性のエンドポイントの範囲で人為汚染の影響を研究する適切なモデル システムとして浮上しています。いくつかの所正常に使用しているキイロショウジョウバエモデル システムとして重金属11,16,18-25,37 を含む化合物の範囲を勉強するには ,,3839,40,44,45, エタノール46, ナノ粒子26,47, 農薬48と溶剤49。毒物学モデルとしてのショウジョウバエを利用する最近の努力にもかかわらず無数の毒性学の質問に答えるためのモデル システムとしての利用はまだ始まったばかりでです。しかし、その広範な使用、エンドポイントの医学的に関連のモデルとしてだけでなく、生態学上50と進化研究17での使用を考えると、その潜在的な毒性学的モデル システムとしては巨大です。
さまざまな毒性学的エンドポイントをテストする汚染されたメディアにショウジョウバエ属の様々 な種の飼育法を紹介します。露出の他の形態も考えられます (例えば吸入、皮膚暴露) モデルとしてのショウジョウバエを用いたこのプロトコルに焦点を当てて自然に摂取 (汚染物質に必要な汚染物質の経口摂取など、食物連鎖を通して)。これらのメソッドは、複数のショウジョウバエ種や汚染物質の使用に対応できます。ショウジョウバエの野生では、遺伝的変数集団において収集し、研究所で維持できます。トラップの餌; 種食の好みに応じて使用することができます多くのオプションがあります。フィールド コレクションのフィールド ガイド、Markow ・ オグレディ33ヴェルナー ・ Jaenike34を参照してください。さらに、メソッドは、様々 な重要な発達期間に発達期曝露の影響を決定する変更可能性があり、汚染物質暴露の長期的な多世代テストが可能になります。
これらのメソッドの重要なステップが含まれます: 環境制御条件、(2) フライ人口の過密、(3) 化学的性質によるとテスト汚染物質を希釈すること、(4) を選択の回避で株を飛ぶ (1) を維持します。テストの汚染物質の生物学的関連性の高い濃度は。環境規制のインキュベーター (または小部屋) の株式を維持する環境条件の追加バリエーションが結果を混同しないことが保証されます。さらに、現象の季節変化は、以前51を発見されているし、いくつかのショウジョウバエ種は冬52以上休眠を入力します。第二に、幼虫の過密開発30、成虫の体サイズ30、および長寿53の長期的な可能性があります。さらに、汚染物質の希釈は、汚染物質が生物学的汚染物質を蓄積するショウジョウバエのため利用可能なことを確認する手順は不可欠です。たとえば、PbAc を dH2O23、24、25日で溶解して他の化学物質は食塩水やエタノールに溶解する必要があります一方。結果の方向に影響することができます汚染物質の生物学的関連性の高い濃度を選択します。たとえば、PbAc の低用量は、高用量交尾19女性の平均数の有意な減少を示すに対し (20 分) 以内の男性と交尾平均数女性を増やします。テストの汚染物質の濃度を生物学的関連を識別するために読者は、致死量、LD50 用量反応曲線を実行する適切な用量を決定するを決定するための予備調査を実行している検討してください。特定のエンドポイントに濃度の範囲をテストする用量反応曲線を実行すると、さらにテストは、「有益な」または「有害」個人や集団に用量特定読者することが。
このプロトコルを決定する手段を提供します: 1) 複数の生物学的レベルのフィットネスと毒性エンドポイントに組織の相互作用2) 発達と創発的要因の役割3) 生態学上重要のエンドポイント。4) 医学的に重要のエンドポイント。5) 複数のストレッサーの対話の成果を生成するには・ 6) 世代を超えた長期的な暴露の影響。このプロトコルの有効性を示すためには、Pb (表 1)23,24を開発全体を通して公開される個人に蓄積を示す証拠を提供されました。さらに、代表的な結果を示す生態学的重要なエンドポイント上の暴露の影響をテストするこのプロトコルを使用することができること (e.g。、仲間選択24発達の鉛露出の影響)。さらに、他の人は複数の生物学的レベルの組織に及ぼす汚染物質をテストしている (生理的18,21, を含む遺伝的20,22と表現型レベル19,23,24,25)、医学的に重要なエンドポイント18,20,21,22,23、および長期的な多世代効果23,24 ,25,54。加えて、予備的なデータは、鉛曝露がキイロショウジョウバエ54で多産に継代後成的変化を誘導することを示します。このプロトコルの重要な制限事項は、ショウジョウバエにこのプロトコルの使用は、その初期の段階です。したがって、ある限られた出版物18,19,20,21,22,23,24,25アドレス プロトコルの開発と創発的要因、その他の生態学的重要なエンドポイント、複数のストレッサーと露出の進化的意義の役割など、追加の毒性学的質問に答えるな。
このプロトコルを使用すると、読者が当然のことながら生物学的に関連したメソッドを使用して摂取される汚染物質をテストできます。連続液体供給・ ソアレスらによって開発されました。55は経口摂取、特に農薬暴露のための別のアプローチです。ただし、連続液供給は液体汚染物質の成人摂取に適して、汚染物質には適用されません個人が公開前羽化をする可能性があります。これは、露出の開発の重要な期間の可能性を考えると特に重要です。以前の研究では、鉛露出23の重要な期間を示しています。したがって、ショウジョウバエは、重要な期間が決定されるまで、テスト前のプロセスショウジョウバエで汚染物質の潜在的なアクティブな除去を避けるための開発を通して公開ください。
要約すると、口頭での汚染物質にショウジョウバエを公開するためのプロトコルを提供しています。このプロトコルとモデル システムを使用して、毒物、同時に汚染物質8の影響を理解するためのより包括的なアプローチを取り入れながら動物実験に倫理的、非侵襲的アプローチへシフトします。

毎年、約 1,000 の新しい化学物質化学工業1,2; によって導入されます。しかし、これらの化学物質の数が少ないと環境への影響は、分布2,3の前にテストされます。大規模な災害が一般的な多種多様な汚染物質に致死と慢性的な暴露は人間と野生生物4、5の両方で広まっています。生態毒性および環境毒物学の歴史の焦点だった生存6,の汚染物質の影響を測定するための手段として致死、単一の化学物質の暴露、急性暴露、暴露、生理学的効果をテストするのには7,8,9,10. 開発、創発性、外部要因、動物実験に倫理的、非侵襲的なアプローチへの移行が、現在のアプローチを役割のため制限している (人口レベルなど、生態学的重要なエンドポイント8を媒介に生態系レベルの相互作用) を果たします。したがって、野生動物や実験室での脊椎動物を犠牲にしないでより包括的なアプローチを組み込む方法の必要性があります。
ショウジョウバエなどの無脊椎動物モデル システムは、毒性試験により包括的なアプローチの必要性に対処するための魅力的な代替手段です。キイロショウジョウバエ、元々 約世紀前の人間関係の遺伝的研究無脊椎動物モデル システムとして開発されました11。キイロショウジョウバエは目立つようにいくつかの理由のため使用脊椎動物モデルの代替として今: 1) 遺伝子とキイロショウジョウバエと人間間の経路の保護2) 短い世代時間の脊椎動物モデルと比較して3) 安価なコストでメンテナンス。4) 大規模なサンプル サイズを生成する際に緩和します。・ 5) 表現型- および生態学上-関連するエンドポイント11,12,13,14,15,16,17 をテストできるの茄多.
いくつか研究所11,15,16,17,18,19,20,21,22,23,24,25今使用しているキイロショウジョウバエ脊椎動物モデルの代替として毒性試験のため人間の汚染の影響を理解します。地元の野生しょうじょうばえのことが出来、同様、生態学的に答えるため野生動物 (と人間) の毒性モデルとして-、行動-、および組織の複数の生物学的レベルでの進化的関連の質問。モデルとしてのショウジョウバエ属内の種を使用して、いくつかの測定可能なエンドポイントが可能な11,15,16,18,19,20 ,21,22,23,24,25。毒物ショウジョウバエモデルを使用して、in addition、ことができます: 1) 倫理的組織の複数の生物学的レベルでの効果のリンク2) 創発的要因との開発の役割を組み込む3) 研究 (医学的に重要なエンドポイント) だけでなく生態学的重要なエンドポイント4) 同時に複数のストレスをテストします。5) および長期テスト世代 (例:進化および継代) ストレッサーの影響。したがって、モデル システムとしてショウジョウバエを使用すると、多数のアプローチ、研究室で、キイロショウジョウバエの近交系と機械的なアプローチを勉強に限定されないができます。
飼育、ショウジョウバエ毒性の様々 な質問に答えるための収集法を提案します。具体的には、1 の方法論について述べる) 媒体の 1 つ以上の汚染物質混入のショウジョウバエの飼育2) 開発 (例えば3 齢幼虫、蛹の場合、新しくこの大人と成熟した大人を徘徊); 全体ショウジョウバエを収集・ 3) テスト世代次世代伝送と毒性物質の長期吸入暴露の進化的意義に汚染された培地でショウジョウバエを飼育します。このプロトコルは、以前著者18,19,20,21,22,23,24を使用して,25を報告しています。発達の生理学、遺伝子および行動効果の違いは鉛 (Pb2 +) 露出です。このプロトコルは、どのように汚染物質が人間およびますます汚染環境で野生動物のための危険因子を理解するために不可欠であるより全体的な毒性学的アプローチを使用する毒物をできます。

<table border="1" fo:keep-together.within-page="1" fo:keep-with-next.within-page="always">
	<tbody>
		<tr>
			<td>Carolina Biological Instant Drosophila Medium Formula 4-24</td>
			<td>Carolina Biological</td>
			<td>173204</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Drosophila vials, Narrow (PS), Polystyrene, Superbulk, 1000 vials/unit</td>
			<td>Genessee Scientific</td>
			<td>32-116SB</td>
			<td>Used to store flies</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Flugs Closures for vials and bottles, Narrow plastic vials</td>
			<td>Genessee Scientific</td>
			<td>49-102</td>
			<td>Used to store flies</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Cardboard trays, trays only, narrow</td>
			<td>Genessee Scientific</td>
			<td>32-124</td>
			<td>Used to organize populations of flies</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Cardboard trays, dividers only, narrow</td>
			<td>Genessee Scientific</td>
			<td>32-126</td>
			<td>Used to organize populations of flies</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Thermo Scientific&#160;Nalgene Square Wide-Mouth HDPE Bottles with Closure</td>
			<td>Fischer Scientific</td>
			<td>03-312D</td>
			<td>Useful for storage of contaminants</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Thermo Scientific&#160;Nalgene Color-Coded LDPE Wash Bottles</td>
			<td>Fischer Scientific</td>
			<td>03-409-17C</td>
			<td>Useful for storage of contaminants</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Eppendorf&#160;Repeater M4 Manual Handheld Pipette Dispenser</td>
			<td>Fischer Scientific</td>
			<td>14-287-150</td>
			<td>Used to prepare medium</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Combitips Advanced Pipetter Tips - Standard, Eppendorf Quality Tips</td>
			<td>Fischer Scientific</td>
			<td>13-683-708</td>
			<td>Used to prepare medium</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Flypad, Standard Size (8.1 X 11.6cm)</td>
			<td>Genessee Scientific</td>
			<td>59-114</td>
			<td>Used to anesthetize flies</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Flystuff foot valve</td>
			<td>Genessee Scientific</td>
			<td>59-121</td>
			<td>Used to anesthetize flies</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Tubing, green (1 continguous foot/unit)</td>
			<td>Genessee Scientific</td>
			<td>59-124G</td>
			<td>Used to anesthetize flies</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Mineral Oil, Light, White, High Purity Grade, 500 mL HDPE Bottle</td>
			<td>VWR</td>
			<td>97064-130</td>
			<td>Used to make a morgue</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Glass Erlenmeyer Flask Set - 3 Sizes - 50, 150 and 250ml, Karter Scientific 214U2</td>
			<td>Walmart</td>
			<td>Not applicable</td>
			<td>Used to make a morgue</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>BGSET5 Glass Beaker Set Of 5</td>
			<td>Walmart</td>
			<td></td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Inbred or wildtype line of Drosophila</td>
			<td>Bloomington Drosophila Stock Center at Indiana University</td>
			<td></td>
			<td>https://bdsc.indiana.edu</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Wild popultions of Drosophila</td>
			<td>UC San Diego Drosophila Stock Center</td>
			<td></td>
			<td>https://stockcenter.ucsd.edu/info/welcome.php</td>
		</tr>
	</tbody>
</table>

experimental protocol for using drosophila as an invertebrate model system for toxicity testing in the laboratory

創発特性と外部要因 (人口レベルおよび生態系レベルの相互作用、特に) 毒性学的研究のほとんどと見なされますが、生態学的重要なエンドポイントを調停する際に重要な役割を再生します。キイロショウジョウバエ毒性、少数を示すための行動、神経学的、および遺伝的影響のため毒性モデルとして浮上しています。もっと重大に、ショウジョウバエ属の種は、統合フレームワークのアプローチ創発性を組み込むし、毒性研究に生態学上関連した質問に答えるのためのモデル システムとして利用できます。本稿の目的は、表現型の出力や生態学的に関連した質問の範囲にモデル システムとして使用する汚染物質にショウジョウバエ属の種を公開するためのプロトコルを提供することです。具体的には、1 にこのプロトコルを使用することができる) 複数の生物学的レベルの組織をリンクし、両方の個人および集団レベルのフィットネス; の毒性の影響を理解2) 発達暴露; のさまざまな段階で有害物質の影響をテストします。汚染物質; 3) テスト多世代と進化への影響・ 4) 同時に複数の汚染物質およびストレスをテストします。

口頭でショウジョウバエを公開すると開発中の contaminant(s) に、生物学的組織のさまざまなレベルでショウジョウバエを公開することによって様々 な毒性学的質問をテストできます。このセクションは、以前に発行された論文23,24にこのプロトコルを使用して得られた代表的な結果を示します。特に、このプロトコルに使用していた蓄積、除去および鉛 (Pb) の子孫23; の最初の世代の露出の同じ世代内の貯留の評価チームメイトの選択24蓄積の意味を勉強します。
表 1および図 4蓄積と F0と F1世代の両方で鉛の除去を決定にこのプロトコルを使用して得られた代表的な結果を表示します。
表 1に示す代表的な結果 Pb の世代内に露出されたときの蓄積を示す (様々 な用量で: 0、10、40、50、75、100、250、500 μ M PbAc) (放浪 3 齢幼虫、複数の発達段階でテストのサンプル蛹の場合、新しくこの大人と成熟した女性と男性) ・ ピーターソンら。23サンプルは、さまざまな発達段階、-20 ° C で凍って、硝酸、過酸化水素、扱われ、誘導結合プラズマ質量23,42を使用 Pb のテストで収集されました。
<table border="1" fo:keep-together.within-page="1" fo:keep-with-next.within-page="always"><tbody>
<tr>
<td>線量 (μ M PbAc)</td>
			<td style="text-align: center;">幼虫</td>
			<td style="text-align: center;">蛹の場合</td>
			<td style="text-align: center;">新しくこの大人</td>
			<td style="text-align: center;">成熟した大人の女性</td>
			<td style="text-align: center;">成熟した大人の男性</td>
		</tr>
<tr>
<td>0</td>
			<td style="text-align: center;">0.009 ± 0.001</td>
			<td style="text-align: center;">0.099 ± 0.02</td>
			<td style="text-align: center;">0.04 ± 0.005</td>
			<td style="text-align: center;">0.069 ± 0.031 現在</td>
			<td style="text-align: center;">0.0015 ± 0.003</td>
		</tr>
<tr>
<td>10</td>
			<td style="text-align: center;">0.42 ± 0.025</td>
			<td style="text-align: center;">0.46 ± 0.03</td>
			<td style="text-align: center;">0.12 ± 0.009</td>
			<td style="text-align: center;">0.12 ± 0.012</td>
			<td style="text-align: center;">0.056 ± 0.008</td>
		</tr>
<tr>
<td>40</td>
			<td style="text-align: center;">7.5 ± 0.67</td>
			<td style="text-align: center;"></td>
			<td style="text-align: center;"></td>
			<td style="text-align: center;"></td>
			<td style="text-align: center;"></td>
		</tr>
<tr>
<td>50</td>
			<td style="text-align: center;">5.2 ± 0.71</td>
			<td style="text-align: center;">2.77 ± 0.30</td>
			<td style="text-align: center;">1.11 ± 0.14</td>
			<td style="text-align: center;"></td>
			<td style="text-align: center;"></td>
		</tr>
<tr>
<td>75</td>
			<td style="text-align: center;">14 ± 1.06</td>
			<td style="text-align: center;"></td>
			<td style="text-align: center;"></td>
			<td style="text-align: center;"></td>
			<td style="text-align: center;"></td>
		</tr>
<tr>
<td>100</td>
			<td style="text-align: center;">12 ± 0.95</td>
			<td style="text-align: center;">4.7 ± 0.38</td>
			<td style="text-align: center;">3.36 ± 0.58</td>
			<td style="text-align: center;">1.20 ± 0.63</td>
			<td style="text-align: center;">1.24 ± 0.46</td>
		</tr>
<tr>
<td>250</td>
			<td style="text-align: center;">89 ± 8.49</td>
			<td style="text-align: center;"></td>
			<td style="text-align: center;"></td>
			<td style="text-align: center;">25.06 ± 4.72</td>
			<td style="text-align: center;">5.46 ± 0.75</td>
		</tr>
<tr>
<td>500</td>
			<td style="text-align: center;">271 ± 分 41 秒 01</td>
			<td style="text-align: center;">334.30 ± 39.43</td>
			<td style="text-align: center;">8.44 ± 0.84</td>
			<td style="text-align: center;">46.50 ± 14.72</td>
			<td style="text-align: center;">14.43 ± 1.83</td>
		</tr>
</tbody></table>表 1: 鉛負荷 (ng/個人) でテストを意味ショージョーバエ ・ テスト ステージに卵の段階から Pb に経口曝露後の開発中です。手段 (ng/フライ) 平均 ± 標準誤差 (n = 8 幼虫、 n = 3 コントロール飼育大人、 n = Pb 飼育大人 3 名)。野生型ショージョーバエ ・コントロールで飼育や媒体を有鉛 (0、10、40、50、75、100、250 または 500 μ M PbAc) 開発のさまざまな段階に卵の段階から。サンプルが収集し、ICP さん42ピーターソンらから変更されたこのテーブルを使用して鉛蓄積のテストします。23
図 4、親世代 (F0) はコントロール中で交配の大人へ卵の段階から Pb にさらされ、(F1) の子孫の第一世代が成人24までコントロール中で飼育しました。鉛の蓄積と除去を検出する方法・ ピーターソンらに類似していた。23. この実験からの結果を示す親の暴露は成人の子孫24の第一世代に伝わらない。したがって、このプロトコルを使用して、だは、進化的スケールが異なるだけでなく、F0暴露による次世代影響適応応答をテストすることが可能。ピーターソンらに同様の結果が見つかりました。23
<img alt="Figure 4" class="xfigimg" src="/files/ftp_upload/57450/57450fig4.jpg"> 図 4:鉛の蓄積ショージョーバエ ・ (A) の両親 (F0) と (B) の子孫を露出されていない (F1).バー (A)と(B)の平均 (ng/大人) ±SEM。 バー (a) 上記サンプル サイズを表示する (b)。p = < 0.001。(A) F0大人は 250 μ M にさらされた経口 PbAc ICP さん42(B) を使用して鉛蓄積をテストする (後 24 h 水洗) 年齢 5 d 後羽化と収集期間 6 日後羽化に卵の段階からこのプロトコルを使用F0大人制御中治療内交配します。非公開 F1子孫だった (このプロトコルを使用して) 成年期に卵の段階からコントロール中で飼育、誘導結合プラズマ質量分析法を用いた鉛蓄積のテストします。の (B):"CF + PbM"コントロール中両親と"CF + CM"= F1大人の飼育"PbF + CM"鉛中飼育父親 = F1大人"PbF + PbM"鉛中飼育の母親と F1大人を = = F1両親と大人は、鉛の中で飼育。この図は、ピーターソンらから変更されています。24<a href="/files/ftp_upload/57450/57450fig4large.jpg" target="_blank">この図の拡大版を表示するのにはここをクリックしてください</a>。 
表 1と図 4に示された結果を示すショウジョウバエは容易に異なる用量、発達段階、このプロトコルを使用して進化の体重計で鉛を蓄積します。したがって、口腔の汚染物質にキイロショウジョウバエを公開することでプロトコルの有効性を示します。
ピーターソンらによって使用されたここで説明したプロトコル図 5で24鉛曝露の選好に及ぼす影響をテストします。実験科目制成人期に卵の段階から飼育した成人期に卵の段階から媒体を鉛や水洗の 24 時間後の仲間の好みのテストします。ピーターソンら。24は、Pb にさらされた女性は優先的にコントロールまたは鉛露出男性のいずれかのオプションを与えられたとき鉛露出の男性と交配を発見しました。これらの結果は表現型の出力を確認するためのプロトコルの実装の 1 つの代表的な例です。
<img alt="Figure 5" class="xfigimg" src="/files/ftp_upload/57450/57450fig5.jpg"> 図 5:250 μ M にさらされる男女の仲間好み卵から PbAc ステージ成人にします。バー (A)、(B) と (C) で交尾成功 (60 分) で ± SEM. 平均パーセント (%) を表示 * * * p = < 0.001。 * p = < 0.05。(A)、(B) および (C) の被験者コントロールにさらされたまたは媒体の鉛 (250 μ M PbAc) 成人を成熟する卵の段階から、配偶者選択の違いをテストします。(A)いずれかのコントロールまたは Pb 飼育のオス (すなわち 2 選択肢テスト) の女性の好み。サンプル サイズ: N = 126 コントロール飼育女性と 137 Pb 飼育女性。(B)コントロールと Pb 飼育女性 (すなわち 2 選択肢テスト) の男性の好み。サンプル サイズ: N = 59 コントロール飼育オスと N = 64 Pb 飼育のオス。(C)の仲間で男女ともどちらかの露出 (つまりいいえ選択テスト) の 1 つのパートナーと組み合わせれば単独で好み。(C):"CF + CM"= コントロール飼育女性ペア 1 つ制御飼育のオスと 1 つ (N = 85 ペア)、"CF + PbM"= 1 つ制御飼育女性 1 Pb 飼育オスとペアになって (N = 79 ペア)、「PbF + CM」= 1 1 つコントロール飼育のオスとペアに Pb 飼育女性 (N = 91 ペア)、「PbF +PbM"= 1 Pb 飼育女性 + Pb 飼育男性 (N = 98 ペア)。この図は、ピーターソンらから変更されています。24.<a href="/files/ftp_upload/57450/57450fig5large.jpg" target="_blank">この図の拡大版を表示するのにはここをクリックしてください</a>。

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Experimental Protocol for Using Drosophila As an Invertebrate Model System for Toxicity Testing in the Laboratory

複数の世代の発達段階別に表現型の出力の範囲で露出の影響を勉強の目的と汚染物質にショウジョウバエ属の種を公開するため本稿では、詳細なプロトコルを提供します。

無脊椎動物モデル システムとしてショウジョウバエを使用して毒性を実験室でテストするための実験プロトコル

Emergent properties and external factors (population-level and ecosystem-level interactions, in particular) play important roles in mediating ...

experimental-protocol-for-using-drosophila-as-an-invertebrate-model

Nanyang Technological University

Research

JoVE Journal

Biology

Experimental Protocol for Using Drosophila As an Invertebrate Model System for Toxicity Testing in the Laboratory

12.6K ビュー.  Colorado State University-Pueblo. 複数の世代の発達段階別に表現型の出力の範囲で露出の影響を勉強の目的と汚染物質にショウジョウバエ属の種を公開するため本稿では、詳細なプロトコルを提供します。

ビデオ: Experimental Protocol for Using Drosophila As an Invertebrate Model System for Toxicity Testing in the Laboratory

Testing Nicotine Tolerance in Aphids Using an Artificial Diet Experiment

Plants may upregulate the production of many different seconday metabolites in response to insect feeding. One of these metabolites, nicotine, is well know to have insecticidal properties. One response of tobacco plants to herbivory, or being gnawed upon by insects, is to increase the production of this neurotoxic alkaloid. Here, we will demonstrate how to set up an experiment to address this question of whether a tobacco-adapted strain of the green peach aphid, Myzus persicae, can tolerate higher levels of nicotine than the a strain of this insect that does not infest tobacco in the field.

In this video and assay is demonstrated that tests the tolerance of nicotine to two types of aphids one that infests tobacco plants in the field and one that does not.

人工飼料の実験を使用してアブラムシにニコチン耐性をテスト

Plants may upregulate the production of many different seconday metabolites in response to insect feeding. One of these metabolites, nicotine, is well ...

生物学

The Preparation of Drosophila Embryos for Live-Imaging Using the Hanging Drop Protocol

Green fluorescent protein (GFP)-based timelapse live-imaging is a powerful technique for studying the genetic regulation of dynamic processes such as tissue morphogenesis, cell-cell adhesion, or cell death. Drosophila embryos expressing GFP are readily imaged using either stereoscopic or confocal microscopy. A goal of any live-imaging protocol is to minimize detrimental effects such as dehydration and hypoxia. Previous protocols for preparing Drosophila embryos for live-imaging analysis have involved placing dechorionated embryos in halocarbon oil and sandwiching them between a halocarbon gas-permeable membrane and a coverslip1-3. The introduction of compression through mounting embryos in this manner represents an undesirable complication for any biomechanical-based analysis of morphogenesis. Our method, which we call the hanging drop protocol, results in excellent viability of embryos during live imaging and does not require that embryos be compressed. Briefly, the hanging drop protocol involves the placement of embryos in a drop of halocarbon oil that is suspended from a coverslip, which is, in turn, fixed in position over a humid chamber. In addition to providing gas exchange and preventing dehydration, this arrangement takes advantage of the buoyancy of embryos in halocarbon oil to prevent them from drifting out of position during timelapse acquisition. This video describes in detail how to collect and prepare Drosophila embryos for live imaging using the hanging drop protocol. This protocol is suitable for imaging dechorionated embryos using stereomicroscopy or any upright compound fluorescence microscope.

The Preparation of Drosophila Embryos for Live-Imaging Using the Hanging Drop Protocol

A simple, inexpensive, and effective method of preparing Drosophila embryos for live-imaging analysis is presented. Our protocol provides humidity and gas exchange and does not compress the Drosophila embryo. This method is suitable for GFP-based live imaging of Drosophila embryos using a stereomicroscope or upright compound microscope.

の調製ショウジョウバエ</emハンギングドロッププロトコルを使用してライブイメージングのための>胚

Green fluorescent protein (GFP)-based timelapse live-imaging is a powerful technique for studying the genetic regulation of dynamic processes such as ...

Long-term Lethal Toxicity Test with the Crustacean Artemia franciscana

Our research activities target the use of biological methods for the evaluation of environmental quality, with particular reference to saltwater/brackish water and sediment. The choice of biological indicators must be based on reliable scientific knowledge and, possibly, on the availability of standardized procedures. In this article, we present a standardized protocol that used the marine crustacean Artemia to evaluate the toxicity of chemicals and/or of marine environmental matrices. Scientists propose that the brine shrimp (Artemia) is a suitable candidate for the development of a standard bioassay for worldwide utilization. A number of papers have been published on the toxic effects of various chemicals and toxicants on brine shrimp (Artemia). The major advantage of this crustacean for toxicity studies is the overall availability of the dry cysts; these can be immediately used in testing and difficult cultivation is not demanded1,2. Cyst-based toxicity assays are cheap, continuously available, simple and reliable and are thus an important answer to routine needs of toxicity screening, for industrial monitoring requirements or for regulatory purposes3. The proposed method involves the mortality as an endpoint. The numbers of survivors were counted and percentage of deaths were calculated. Larvae were considered dead if they did not exhibit any internal or external movement during several seconds of observation4. This procedure was standardized testing a reference substance (Sodium Dodecyl Sulfate); some results are reported in this work. This article accompanies a video that describes the performance of procedural toxicity testing, showing all the steps related to the protocol.

Long-term Lethal Toxicity Test with the Crustacean Artemia franciscana

This study concerns the development and standardization of a valuable methodological protocol to determine long-term (14 days) lethal toxicity exerted by chemical substances, industrial wastewater or sewage and liquid environmental samples on the saltwater crustacean, Artemia franciscana.

甲殻類との長期致死毒性試験アルテミアfranciscana</em

Our research activities target the use of biological methods for the evaluation of environmental quality, with particular reference to saltwater/brackish ...

Using Caenorhabditis elegans as a Model System to Study Protein Homeostasis in a Multicellular Organism

The folding and assembly of proteins is essential for protein function, the long-term health of the cell, and longevity of the organism. Historically, the function and regulation of protein folding was studied in vitro, in isolated tissue culture cells and in unicellular organisms. Recent studies have uncovered links between protein homeostasis (proteostasis), metabolism, development, aging, and temperature-sensing. These findings have led to the development of new tools for monitoring protein folding in the model metazoan organism Caenorhabditis elegans. In our laboratory, we combine behavioral assays, imaging and biochemical approaches using temperature-sensitive or naturally occurring metastable proteins as sensors of the folding environment to monitor protein misfolding. Behavioral assays that are associated with the misfolding of a specific protein provide a simple and powerful readout for protein folding, allowing for the fast screening of genes and conditions that modulate folding. Likewise, such misfolding can be associated with protein mislocalization in the cell. Monitoring protein localization can, therefore, highlight changes in cellular folding capacity occurring in different tissues, at various stages of development and in the face of changing conditions. Finally, using biochemical tools ex vivo, we can directly monitor protein stability and conformation. Thus, by combining behavioral assays, imaging and biochemical techniques, we are able to monitor protein misfolding at the resolution of the organism, the cell, and the protein, respectively.

Using Caenorhabditis elegans as a Model System to Study Protein Homeostasis in a Multicellular Organism

To study the relationship between protein homeostasis, stress and aging, we monitored changes in protein folding by following protein dysfunction, protein localization in the cell and protein stability at the organismal, cellular and protein levels, using the genetically tractable metazoan Caenorhabditis elegans as a model system.

The folding and assembly of proteins is essential for protein function, the long-term health of the cell, and longevity of the organism. Historically, the ...

A Protocol for Using Gene Set Enrichment Analysis to Identify the Appropriate Animal Model for Translational Research

Recent studies that compared transcriptomic datasets of human diseases with datasets from mouse models using traditional gene-to-gene comparison techniques resulted in contradictory conclusions regarding the relevance of animal models for translational research. A major reason for the discrepancies between different gene expression analyses is the arbitrary filtering of differentially expressed genes. Furthermore, the comparison of single genes between different species and platforms often is limited by technical variance, leading to misinterpretation of the con/discordance between data from human and animal models. Thus, standardized approaches for systematic data analysis are needed. To overcome subjective gene filtering and ineffective gene-to-gene comparisons, we recently demonstrated that gene set enrichment analysis (GSEA) has the potential to avoid these problems. Therefore, we developed a standardized protocol for the use of GSEA to distinguish between appropriate and inappropriate animal models for translational research. This protocol is not suitable to predict how to design new model systems a-priori, as it requires existing experimental omics data. However, the protocol describes how to interpret existing data in a standardized manner in order to select the most suitable animal model, thus avoiding unnecessary animal experiments and misleading translational studies.

We provide a standardized protocol for the use of gene set enrichment analysis of transcriptomic data to identify an ideal mouse model for translational research. 
This protocol can be used with DNA microarray and RNA sequencing data and can further be extended to other omics data if data are available.

遺伝子を使用するプロトコル設定トランスレーショナルリサーチの適切な動物モデルを識別するために濃縮分析

Recent studies that compared transcriptomic datasets of human diseases with datasets from mouse models using traditional gene-to-gene comparison ...

Laboratory Protocol for Genetic Gut Content Analyses of Aquatic Macroinvertebrates Using Group-specific rDNA Primers

Analyzing food webs is essential for a better understanding of ecosystems. For example, food web interactions can undergo severe changes caused by the invasion of non-indigenous species. However, an exact identification of field predator-prey interactions is difficult in many cases. These analyses are often based on a visual evaluation of gut content or the analysis of stable isotope ratios (&#948;15N and &#948;13C). Such methods require comprehensive knowledge about, respectively, morphologic diversity or isotopic signature from individual prey organisms, leading to obstacles in the exact identification of prey organisms. Visual gut content analyses especially underestimate soft bodied prey organisms, because maceration, ingestion and digestion of prey organisms make identification of specific species difficult. Hence, polymerase chain reaction (PCR) based strategies, for example the use of group-specific primer sets, provide a powerful tool for the investigation of food web interactions. Here, we describe detailed protocols to investigate the gut contents of macroinvertebrate consumers from the field using group-specific primer sets for nuclear ribosomal deoxyribonucleic acid (rDNA). DNA can be extracted either from whole specimens (in the case of small taxa) or out of gut contents of specimens collected in the field. Presence and functional efficiency of the DNA templates need to be confirmed directly from the tested individual using universal primer sets targeting the respective subunit of DNA. We also demonstrate that consumed prey can be determined further down to species level via PCR with unmodified group-specific primers combined with subsequent single strand conformation polymorphism (SSCP) analyses using polyacrylamide gels. Furthermore, we show that the use of different fluorescent dyes as labels enables parallel screening for DNA fragments of different prey groups from multiple gut content samples via automated fragment analysis.

Most common gut content analyses of macroinvertebrates are visual. Requiring intense knowledge about morphological diversity of prey organisms, they miss soft bodied prey and, due to strong comminution of prey, are nearly impossible for some organisms, including amphipods. We provide detailed, novel genetic approaches for macroinvertebrate prey identification in the diet of amphipods.

水生動物使用グループ固有の rDNA プライマーの遺伝的腸内容分析の研究プロトコル

Analyzing food webs is essential for a better understanding of ecosystems. For example, food web interactions can undergo severe changes caused by the ...

Establishment of an Extracellular Acidic pH Culture System

Conditions of the tumor microenvironment, such as hypoxia or nutrient starvation, play critical roles in cancer progression and malignancy. However, the role of acidic extracellular pH in tumor aggressiveness and its underlying mechanism has not been extensively studied compared to hypoxic or nutrient starvation conditions. In addition, a well-defined culture method to mimic the acidic extracellular tumor microenvironment has not been fully reported.
Here we present a simple in vitro culture method to maintain acidic extracellular pH using reduced bicarbonate and increased lactate or HCl concentrations in the culture medium. The medium pH was sustained for at least 24 h and gradually decreased by 72 h following culture of PANC-1 and AsPC-1 pancreatic cancer cells. Three distinct acidic media conditions in this study highly upregulated pH-responsive genes such as MSMO1, INSIG1, and IDI1 compared to hypoxia or nutrient starvation. The upregulation of these genes can be used as a marker of acidic pH. These simple techniques are beneficial to elucidate underlying mechanisms of tumor malignancy under acidic tumor microenvironment. Therefore, our extracellular acidic pH culture system enables discovery of cellular acidic pH responses not only in cancer cells but also in primary cells, such as renal tubular cells, in relation to the other acidic disorders including, diabetic ketoacidosis, lactic acidosis, renal tubular acidosis, and respiratory acidosis.

The acidic tumor microenvironment plays critical roles in tumor progression. To assess the effects of acidic extracellular pH on cancer cells in vitro, we established simple acidic culture systems.

酸性細胞外 pH 培養系の確立

Conditions of the tumor microenvironment, such as hypoxia or nutrient starvation, play critical roles in cancer progression and malignancy. However, the ...

A Protocol for Laboratory Housing of Turquoise Killifish (Nothobranchius furzeri)

The development of husbandry practices in non-model laboratory fish used for experimental purposes has greatly benefited from the establishment of reference fish model systems, such as zebrafish and medaka. In recent years, an emerging fish &#8211; the turquoise killifish (Nothobranchius furzeri) &#8211; has been adopted by a growing number of research groups in the fields of biology of aging and ecology. With a captive life span of 4 - 8 months, this species is the shortest-lived vertebrate raised in captivity and allows the scientific community to test &#8211; in a short time &#8211; experimental interventions that can lead to alterations of the aging rate and life expectancy. Given the unique biology of this species, characterized by embryonic diapause, explosive sexual maturation, marked morphological and behavioral sexual dimorphism - and their relatively short adult life span -&#160;ad hoc husbandry practices are in urgent demand. This protocol reports a set of key husbandry measures that allow optimal turquoise killifish laboratory care, enabling the scientific community to adopt this species as a powerful laboratory animal model.

A Protocol for Laboratory Housing of Turquoise Killifish Nothobranchius furzeri

Laboratory housing of turquoise killifish can be scaled up&#160;to house and efficiently raise thousands of individual fish in a centralized water filtration system, employing the same infrastructure used for standard zebrafish facilities. Here we detail a list of standardized procedures that allow efficient killifish maintenance.

研究室住宅のターコイズ メダカ (による furzeri) のためのプロトコル

The development of husbandry practices in non-model laboratory fish used for experimental purposes has greatly benefited from the establishment of ...

Protocols for Testing the Toxicity of Novel Insecticidal Chemistries to Mosquitoes

New classes of insecticides with novel modes of action are needed to control insecticide resistant populations of mosquitoes that transmit diseases such as Zika, dengue and malaria. Assays for rapid, high-throughput analyses of unformulated novel chemistries against mosquito larvae and adults are presented. We describe protocols for single point-dose and dose response assays to evaluate the toxicity of small molecule chemistries to the Aedes aegypti vector of Zika, dengue and yellow fever,&#160;the malaria vector, Anopheles gambiae and the northern house mosquito, Culex quinquefasciatus, on contact and via ingestion. As an example, we evaluated the toxicity of amitriptyline, a small molecule antagonist of G protein-coupled receptors, via larval, adult topical and adult blood-feeding assay. The protocols provide a starting point to investigate insecticide potential. Results are discussed in the context of additional experiments to explore product applications and mechanisms for delivery.

Protocols are described for assessing the toxicity of chemistries to immature and adult mosquitoes for development as new classes of larvicides, adulticides and endectocides. The protocols enable high-throughput testing of multiple chemistries at single-point dose and subsequent evaluation via dose response assay to determine toxicity on contact or via ingestion.

蚊を殺虫化合物小説の毒性試験のプロトコル

New classes of insecticides with novel modes of action are needed to control insecticide resistant populations of mosquitoes that transmit diseases such ...

An Air-liquid Interface Bronchial Epithelial Model for Realistic, Repeated Inhalation Exposure to Airborne Particles for Toxicity Testing

For toxicity testing of airborne particles, air-liquid interface (ALI) exposure systems have been developed for in vitro tests in order to mimic realistic exposure conditions. This puts specific demands on the cell culture models. Many cell types are negatively affected by exposure to air (e.g., drying out) and only remain viable for a few days. This limits the exposure conditions that can be used in these models: usually relatively high concentrations are applied as a cloud (i.e., droplets containing particles, which settle down rapidly) within a short period of time. Such experimental conditions do not reflect realistic long-term exposure to low concentrations of particles. To overcome these limitations the use of a human bronchial epithelial cell line, Calu-3 was investigated. These cells can be cultured at ALI conditions for several weeks while retaining a healthy morphology and a stable monolayer with tight junctions. In addition, this bronchial model is suitable for testing the effects of repeated exposures to low, realistic concentrations of airborne particles using an ALI exposure system. This system uses a continuous airflow in contrast to other ALI exposure systems that use a single nebulization producing a cloud. Therefore, the continuous flow system is suitable for repeated and prolonged exposure to airborne particles while continuously monitoring the particle characteristics, exposure concentration, and delivered dose. Taken together, this bronchial model, in combination with the continuous flow exposure system, is able to mimic realistic, repeated inhalation exposure conditions that can be used for toxicity testing.

Described is the cell culture and exposure method of an in vitro bronchial model for realistic, repeated inhalation exposure to particles for toxicity testing.

毒性試験のための空気中の粒子への現実的な反復吸入暴露のための気管支上皮モデル

For toxicity testing of airborne particles, air-liquid interface (ALI) exposure systems have been developed for in vitro tests in order to mimic realistic ...

無脊椎動物モデル システムとしてショウジョウバエを使用して毒性を実験室でテストするための実験プロトコル

無脊椎動物モデルシステムとしてショウジョウバエを使用して毒性を実験室でテストするための実験プロトコル