この研究は、フロリダのBankhead-コーリーチームサイエンスグラント（2BT03）、健康/米国国立癌研究所（1R21CA164322-01）とモフィットがんセンターのチームサイエンスグラントの国立研究所の状態によって資金を供給されました。この作品は、H·リー·モフィットがんセンター＆研究所、NCI指定の総合がんセンター（P30-CA076292）でのトランスレーショナルリサーチコア施設によって部分的にサポートされています。初代細胞へのアクセスは、モフィットがんセンターで合計がん医療プロトコルを介して可能になりました。

<ol>
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The authors have no conflict of interest to disclose.

要約すると、これは、骨髄の再構成において、一次MM細胞と薬剤のex vivoでの薬力学の化学的感受性を定量化するための強力かつ高スループットの方法です。このプロトコル内の重要なステップは、ウェルの適切な播種され、適切な（予期される結果については、図2を参照）フォーカス：MMと間質細胞が均一に分布されていることを確認し、その間質細胞は、ウェルの底に付着しているMMすべてのこと細胞は同じ焦点面にあり、MM細胞は暗いリングに囲まれた明るいディスクの側面を持っていること。 不適切な播種の場合には（ 図5参照）、実験を続けるのではなく、第二のプレートに播種しません。問題は、低いまたは高いMMまたは間質細胞密度は、細胞の均一な分布を確実にするためにシーディング工程中に播種し、定期的に再懸濁する前に、チューブ内の細胞濃度を確認した検出された場合メディアで。リピータ機能またはロボットディスペンサーのマルチチャンネルピペットを使用することは著しく、この問題を軽減することができます。このアッセイで使用される媒体（1:10）への細胞/マトリックスの割合が播種し、従って条件を検討することができ、ウェルの数を最大化しようとしました。 1：しかし、癌細胞又は間質によって産生されるか、または消費可溶性因子を研究するためには、メディアへの細胞/マトリックスの割合は1にすることをお勧めします。 現在実施されるように、このシステムは、非接着細胞を定量化します。ソフトウェアが変更され、間質の形態学的特徴に調整される必要がある間質の細胞性の変化を定量化するために。これは、間質区画における癌細胞または薬剤の効果を研究するための有用な特徴であろう。ここで説明したシステムは、それらが付着し、間質と結合している場合は特に、また、接着性癌細胞の細胞充実性を定量化することができません。ソリューションは、デジタルイメージのままで変更になります電子分析アルゴリズムは形態学的特徴に基づいて、間質のがんを分離する、またはいずれかの集団から細胞を同定するために使用することができる蛍光色素を有する集団のいずれかを事前にインキュベートします。 逐次測定は、したがって、はるかに詳細を提供することができるように、従来のアプローチと比較して、このプロトコルの重要性は、非破壊で、骨髄微小環境のex vivo再構成において一次癌細胞の薬物応答を評価する能力であります薬力学、のではなく、固定された時点での情報です。我々のアッセイ前6の制限の一つは、濃度の線形ウィンドウ内薬物感受性の評価を可能に薬物拡散によって生成直線勾配でした。各ウェルは、別個のエンティティであるため、現在のアッセイは、薬物濃度の任意の範囲にわたって生存能力の評価を可能にします。両方のアッセイは、しかし、（同等の結果を生成します<strong&gt;補足図4）。 このアプローチの複数の将来のアプリケーションの中で、当社グループは、臨床反応にこれらのアッセイが提供する薬力学情報を推定する数学的モデルを使用して焦点を当てています。この目標を達成するために、我々は、薬物誘発性細胞死の動態を記述する微分方程式のシステムに各薬物について（ 図4C）、得られたデータポイントに適合することを提案します。そして、これらの数学的モデルの臨床療法における各薬剤の既知の薬物動態学的特性のために適用することで、患者6の実際の応答を推定することが可能です。ロボットシステムを用いて播種し、昏睡を自動化することで、介護医薬品のが、また（1,536ウェルプレート中）サンプル当たり百実験薬の上だけでなく、標準をテストすることが可能です。これは実験的な薬の何百もに試験できるインシリコでの臨床試験のための可能性を開くことになります患者試料のコホート、従って仮想臨床試験13の生存曲線を作成します。

この方法の目的は、生理学的条件にできるだけ近くに、これらの結果は、化学療法抵抗性のサブを識別するために使用できる十分な精度で、ex vivoでの薬剤のパネルに、多発性骨髄腫（MM）初代細胞の薬剤感受性を特徴付けることです腫瘍負荷と、内集団は最終的に、臨床応答を推定するために設計された計算モデルをパラメータ化します。 計算モデルは、癌ホスト治療相互作用のような複雑なシステムを分析するための強力なツールです。しかし、モデルのみ、それらをパラメータ化するために使用されるデータと同じくらい良いです。それらはしばしば相互に排他的な実験条件で得られるように残念なことに、文献において利用可能なほとんどのデータは、そのようなモデルをパラメータ化するために、その現在の形で使用することができません。このように、新しい実験が頻繁に必要な実験パラメータのセットを取得することを目標に必要とされます。ほとんどの生存性アッセイは、しかしながら、破壊的と目されています我々は、時間点の数が少ない、しばしばのみに限定されるもの。このような実験は、システムの時間的動態に関する情報を提供することができないので、これは非常に、計算モデルをパラメータ化するために化学感受性アッセイの使用をハンディキャップ。これは多くの場合、このように利用可能な実験条件の数を制限し、サンプル当たり数百万人に限定されるものではなく、生検後の短い寿命を持っている一次癌細胞と特にそうです。また、ほとんどの生存性アッセイは、さらに細胞を摂動し、実行することができる実験の数を制限し、プロトコルに余分な作業を追加して定量化、時の非癌（間質）細胞から癌の分離を必要と。 40年前、サーモンと共同研究者1は、腫瘍細胞の化学感受性を評価するためのインビトロのコロニー形成アッセイにおけるそれらの有名なを提案しました。残念ながら、このアッセイは、による複数のMYE少数の混合成功を収めて対照条件下でコロニーを形成することができたロマ（MM）患者サンプル：これは、多発性骨髄腫幹細胞2と呼ばれている、MM細胞の0.1％に、0.001％のわずかな部分群を複製することができたことが推定されました。これは、かなりのアッセイの成功率、さらにより最近のモデル3に、一度に試験することができる薬物の数を制限しました。 （標準または実験）MM剤は四十年以上前に多数ある場合、この問題は今はるかに重要です。 これらの初期のアッセイの主な制限は、それらの二分出力されます。患者が特定の薬物を「感受性」または「抵抗性」のいずれかです。いいえ情報は、腫瘍集団の感度および不均一性の程度に関して提供されていません。このように、急成長している耐性細胞の小さな亜集団の患者は、治療に「敏感」に分類されますが、すぐに再発だろう、そのためではないベン治療からefit。癌患者4,5の全生存期間（OS）での応答の持続時間の重要性を考えると、それはこれらのアッセイが適切に一貫してOSを推定することができませんでしたか明らかです。 注文これらの制限を回避するために、および薬物のパネルにパーソナライズ臨床応答を推定することになる患者固有の計算モデルを生成することができるように、我々は、多発性骨髄腫（MM）細胞株の非破壊検査の薬剤感受性のための方法を開発しました細胞外マトリックスおよび間質6を含む骨髄微小環境のex vivo再構築、および一次MM細胞。このアッセイは、しかし、その寸法は、コスト機器の所定枚で一度に実行することができる実験や薬の数を制限し、特定の商用マイクロ流体スライド、に頼るの制限がありました。 ここに記載されているシステムは、高にこのオリジナル検定を拡張します器官用量応答プラットフォーム-throughput、非破壊細胞生存度を定量するために、デジタル画像解析アルゴリズムに基づいて、薬物のインビトロスクリーニングのため。 384ウェルまたは1536ウェルプレートの各プライマリMM細胞、細胞外マトリックス、および患者由来の間質及び成長因子を含む、骨髄微小環境の3次元再構成です。ライブ顕微鏡とデジタル画像解析は、用量反応面を生成するために使用される、異なる薬剤濃度での細胞死のイベントを検出するために使用されます。 インビトロデータから、数学的モデルは、（患者の腫瘍負荷内のサブ集団の大きさと化学感受性を識別し、腫瘍が臨床レジメン6に生理的条件下で薬剤（単数または複数）に応答する方法をシミュレートするために使用することができ図1）。 このプラットフォームの主な革新は次の通りである：（a）癌細胞の数が少ない、必要な（薬物コンセントあたり1,000〜10,000配給）; （b）は、生理学的条件（細胞外マトリクス、ストローマ、患者由来の成長因子）における薬効の評価を、 （c）の生存性マーカー7から無毒性のみ明視野画像を用いているため、このように蛍光8または生物発光9を用いて細胞をトランスフェクトする必要がありません。 （d）は、連続撮影は、濃度および暴露時間（薬力学）の関数としての薬剤の効果を提供します。および（e） インビトロと計算進化のモデル間の統合は、臨床転帰6（シルバら、準備中）を推定します。 間質細胞から癌を識別するためにデジタル画像解析アルゴリズムを可能にする重要な要因は、ウェルの底にそれらの異なる親和性である：MM細胞が付着し、マトリックス中に懸濁状態で残っていない、間質細胞は、底部に付着している間よく、その後ストレッチ。 この分離はあっても、MMおよび間質Aかかわらず、これが発生します同時に播種し、インキュベーションのO / Nプロセスの間に発生する再。プレートの遠心分離器でスピンダウンし、次の播種は、さらに、このプロセスを加速します。間質が低いプロファイルと暗い影（ 図2）を維持しながら、結果として、MM細胞は、暗いリングに囲まれた円形の明るいディスクなどの画像に表示されます。アルゴリズムの調整は、このようなサイズおよび形状のような他の形態学的特徴に基づいて、独立した癌および間質に行うことができるが、このように、現在の形式でのアッセイは、非接着性癌細胞に最も適しています。このプロトコルでは、（骨髄由来の間葉系幹細胞）BMSCとHUVECS、骨髄の間質および血管周囲のニッチを代表して、細胞外マトリックス（コラーゲンと基底膜マトリックス）の2種類だけでなく、共培養の2つのタイプを記述します、それぞれ。 、薬剤ごとに5つの濃度と2つの複製を384ウェルプレートを使用して、我々はTESすることができました一人の患者のサンプルと31種類の薬までトン。 補足図1は 、ロボットピペッターを使用して、最適な分布を表す1,536ウェルプレートでは、この数が、3は 、現在手動細胞播種のために使用されるレイアウトを示している図 127です。 図3の設計では、各384ウェルプレートは、21の薬剤を用いて試験し、7つの異なる薬物、または一人の患者の試料で3患者サンプルを運ぶことができます。各薬剤は、5つの濃度で表され、各条件をデュプリケートで播種されます。 4対照ウェル（薬剤を添加していないが）7薬（例えば、ウェル36〜39、126-129および200〜203）の各セットのために播種します。使用される薬物の効力を保証するために、ヒト骨髄腫細胞株（ 例えば、H929ま ​​たはMM1.S）がシードされ、そして（ウェル76から89）に使用される薬物のそれぞれの最高濃度でデュプリケートで薬漬け。陽性細胞株のコントロールは、それらの用量応答曲線が同程度の交流であるため、使用される薬剤は、十分な効力を有することを保証しますロス実験。 2つのウェルは、（ウェル75及び90）は、撮像時のベンチトップインキュベータで可能性のある問題を検出すること、言い換えれば、環境条件の制御などの骨髄腫細胞株を播種します。ウェルの列挙は、取得時間を低減し、装置の摩耗を減少させ、顕微鏡の電動ステージによって移動距離を減少させるために、ジグザグのパターンに従います。

<table border="0" cellpadding="0" cellspacing="0">
	<tbody>
		<tr>
			<td>EVOS FL AUTO</td>
			<td>AMG</td>
			<td>AMAFD1000 + AMC1000</td>
			<td>Digital microscope equipped with motorized stage and bench top incubator.</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>384-well plate CellBind</td>
			<td>CORNING</td>
			<td>CLS3683 SIGMA</td>
			<td>Corning CellBIND 384 well plates 
			384 well plate, polystyrene, CellBIND surface, sterile, clear flat bottom, black, w/lid</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>1,536-well plate CellBind</td>
			<td>CORNING</td>
			<td>CLS3832 ALDRICH</td>
			<td>Corning 1536 well plates, low base, surface treatment CellBIND, sterile</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Ficoll-Paque Plus&#160;</td>
			<td>GE Healthcare</td>
			<td>GE17-1440-02 SIGMA</td>
			<td>For in vitro isolation of lymphocytes from human peripheral blood.</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>CD138 magnetic beads</td>
			<td>Miltenyi&#160;</td>
			<td>130-051-301</td>
			<td>Antibody conjugated magnetic beads for selection of CD138+ cells.</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>LS columns</td>
			<td>Miltenyi&#160;</td>
			<td>&#160;130-042-401</td>
			<td>Column for separation of cells.</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>MidiMACS Separator</td>
			<td>Miltenyi&#160;</td>
			<td>130-042-302</td>
			<td>Magnet for separation column.</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Matrigel</td>
			<td>Sigma-Aldrich</td>
			<td>E6909 SIGMA</td>
			<td>ECM Gel from Engelbreth-Holm-Swarm murine sarcoma</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Getrex</td>
			<td>Life Technologies</td>
			<td>A1413201</td>
			<td>LDEV-Free Reduced Growth Factor Basement Membrane Matrix</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>HUVEC</td>
			<td>Life Technologies</td>
			<td>C-003-25P-B</td>
			<td>Human Umbilical Vein Endothelial Cells (HUVEC )</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>RPMI-1640 media</td>
			<td>GIBCO</td>
			<td>11875-093</td>
			<td>RPMI 1640 Medium + L-Glutamine + Phenol Red</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>FBS Heat inactivated</td>
			<td>GIBCO</td>
			<td>10082-147</td>
			<td>Fetal Bovine Serum, certified, heat inactivated, US origin</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>3.1mg/mL Bovine collagen type I</td>
			<td>Advanced Biomatrix</td>
			<td>5005-B</td>
			<td>Bovine Collagen Solution, Type I, 3 mg/ml, 100 ml</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Precision XS</td>
			<td>BIOTEK</td>
			<td>PRC3841</td>
			<td>Robotic pipettor system</td>
		</tr>
	</tbody>
</table>

an organotypic high throughput system for characterization of drug sensitivity of primary multiple myeloma cells

本研究では、患者由来の多発性骨髄腫（MM）細胞の化学感受性と不均一性を推定するためにex vivoでの薬剤感受性アッセイおよびデジタル画像解析を組み合わせた新規な方法を説明します。このアプローチは、patient-新たに細胞外マトリックス（コラーゲンまたは基底膜マトリックス）及び間質（含む各骨髄微小環境の再構成からなる、マルチウエルプレートに実装マイクロ流体チャンバに骨髄吸引物から抽出された一次MM細胞を播種することからなります由来間葉系幹細胞）またはヒト由来の内皮細胞（HUVEC）。チャンバは、異なる薬剤および濃度で薬漬けされており、デジタルカメラを搭載した電動式顕微鏡において、明視野顕微鏡を介して96時間連続して撮像されます。デジタル画像解析ソフトウェアは、膜の動きの存在下または非存在下で生細胞と死細胞を検出し、関数Oと生存率の変化の曲線を生成しますF薬物濃度および曝露時間。私たちは、各薬剤に対する腫瘍集団の化学感受性のパラメータだけでなく、腫瘍の不均一性の尺度として存在する亜集団の数を決定する計算モデルを使用しています。これらの患者に合わせたモデルは、その後、治療計画をシミュレートし、臨床応答を推定するために使用することができます。

。実験の流れを簡単に図1に記載されているすべてのステップが正常に完了している場合は、顕微鏡により得られた画像は、 図2に相当する必要があります：MM細胞を生きはっきり明るくディスクおよび骨髄幹細胞またはHUVECをとして見られるべきでかろうじて見えるはずですよく背景に分布。 図2Aに見られるように、MM細胞を、一人の患者から他のサイズの範囲であるが、一般に、それらは、細胞株よりも小さいです。それらは実際に実験の期間中にエクスビボで複製されないので（96時間）は、それらが高濃度（1-3万細胞/ mlで）で播種することができます。 BMSCは、ロープロファイルを提示し、十分にストレッチの底に付着するように間質は、かろうじて検出可能であるべきです。ヒト骨髄腫細胞株H929は、患者由来のMM細胞（ 図2B）よりも有意に大きく、24時間以内に複製します。画像の混雑を防ぐために、MM細胞株を参照してくださいされています低い密度、030万/ mlでDEDは、 図2C及び2Dは ​​、HUVECSと共培養し、それぞれ、患者由来のMM細胞およびヒト骨髄腫細胞株H929を表す図 。 HUVECSは、第一のウェルの底に付着し、その後、互いに接触し、ネットワークを形成する、後で厚く、ルーメンとなっているし始めます。 図4は、画像解析アルゴリズムにより生成される処理ビデオから予想されるものを例示し、実験の終了時に骨髄幹細胞およびHUVECを内に、または非常に小さな緑の信号と緑色に疑似着色生MM細胞（ 図4A）が検出されない示しますすべてのMM細胞が死んでいる、最高薬物濃度（ 図4B）で。ソフトウェアは、異なるウェルからの結果を集約し、異なる薬物濃度（ 図4C）での露光時に生存能力の漸進的な損失を示すチャートを構築する必要があります。の用量応答曲線コントロール細胞株（ 例えば、H929ま ​​たはMM1.S）は先の実験と同じでなければなりません。著しい逸脱は実験に使用される薬剤の原液に問題がある可能性があります。 これは、慎重にアーチファクトが画像解析ソフトウェアを誤解し、誤った結果をもたらすことができるように、画像形成処理を開始する前に播種したすべてのウェルを観察することが重要です。例えば、 図5（a）は、凝集塊を形成し、これらの細胞につながる、ウェル中の骨髄幹細胞の過剰な密度またはトリプシン処理および播種の間に時間が長すぎた結果を示している。 図5（b）は、MM細胞の「コロニー」を示しています。細胞株は、高い密度で播種される場合、それは他の一つのセルを識別することはますます困難になるように、それらが複製するようにそれらがコロニーを形成し、これは、デジタル画像解析アルゴリズムの精度を低下させる。 図5Cは、反対の例であります少なすぎるMM細胞を播種しました。 T骨髄吸引液から得られたMM細胞の数は、以下の500,000、および再懸濁の前にチューブ内に残っ「デッドボリューム」を高密度でMM細胞を再懸濁するために必要なメディアの量に匹敵するようになるとき、彼はしばしば起こります。この問題を解決するために、使用されるチューブのデッドボリュームを決定し、これを希釈計算に含まれる。 図5Dは、斜め焦点面の一例です。左上のMM細胞は明るく、右下のものが暗いかに注意してください。これは、午前不均一に配置され、プレートまたは正しく配置された対物レンズによって引き起こされます。これは、画像の異なる部分でのMM細胞が異なるカウントされます。スケールバー（各画像の右下）が500ミクロンを表します。 <img alt="図1" src="/files/ftp_upload/53070/53070fig1.jpg" /> 図1.プロトコル全体の説明。（A）骨marro中生検ワット吸引の1つの余分なチューブは、プロトコルのために得られます。 （B）多発性骨髄腫（MM）細胞を磁気吸引中の他の細胞から分離されます。 MM細胞（MM）、非MM細胞と血漿を含有する（C）三管は、それぞれ、分離プロセスから得られます。前の吸引から（D）骨髄由来間葉系幹細胞（骨髄幹細胞）を新たに取得したMM細胞と共培養し、細胞外マトリックス（コラーゲンまたは基底膜マトリックス）中に再懸濁しました。 （E）は 、プレートは、できるだけ多くのMMは、同じ焦点面にあり、BMSCは、ウェルの底に付着する準備ができていることを確実にするためにスピンダウンされます。マトリックスが重合されるまで、プレートをインキュベータ内に配置されます。 （F）各ウェルに培地と患者由来の血漿の混合物で充填されています。プレートをインキュベータO / Nに配置されています。 （G）薬物を各ウェルに添加し、プレートを顕微鏡に配置されますデジタルカメラ、電動ステージと、ベンチトップインキュベータを搭載し、96時間の期間、一定の間隔で画像化しました。 （H）各ウェルについての画像ファイルは、膜の動きに基づいて、セグメントがMM細胞を生きたアルゴリズムを用いて分析した（生細胞は、疑似緑色に着色されている）、各時点での各ウェルのために細胞性の変化とのスプレッドシートを作成しています。スケールバー（右下）が500ミクロンを表します。薬剤および濃度によって（I）ソフトウェアプログラムグループ井戸と初期措置が100％になるように正規化用量反応の曲線とのスプレッドシートを作成しますが。 <a href="https://www-jove-com.remotexs.ntu.edu.sg/files/ftp_upload/53070/53070fig1large.jpg" target="_blank">この図の拡大版を表示するには、こちらをクリックしてください。</a> <img alt="図2" src="/files/ftp_upload/53070/53070fig2.jpg" /> ウェルの2プレドラッグ期待外観図。（A）間質と共培養したMM細胞。 （B）間質と共培養したヒト骨髄腫細胞株H929。 （C）HUVECSとの共培養でMM細胞を患者に由来します。 （D）HUVECSとの共培養中のヒト骨髄腫細胞株H929。スケールバー（各図の右下）が500ミクロンを表す。 <a href="https://www-jove-com.remotexs.ntu.edu.sg/files/ftp_upload/53070/53070fig2large.jpg" target="_blank">この図の拡大版を表示するには、こちらをクリックしてください。</a> <img alt="図3" src="/files/ftp_upload/53070/53070fig3.jpg" /> 図3は、384ウェルプレートのウェルの空間的な分布をしてください。各384ウェルプレートは、21の薬剤を用いて試験し、7つの異なる薬物、または一人の患者の試料で3患者サンプルを運ぶことができます。ライトグリーン、ライトブルーと黄褐色のウェルは、三つの異なる患者からのMM細胞が含まれています。 RX1、Rx2と、などが、5の異なるコンでそれぞれ、異なる薬剤を表しますcentrationsと重複しています。 4つのウェルは、各患者のためのコントロール（患者2のために患者1のための36〜39、126-129および200-203患者3用）として使用されています。オレンジ色のウェルを二重に、それ​​ぞれの薬物の最も高い薬剤濃度での細胞株が含まれています。黄色のウェルは、細胞株コントロール（薬物なし）である。 <a href="https://www-jove-com.remotexs.ntu.edu.sg/files/ftp_upload/53070/53070fig3large.jpg" target="_blank">この図の拡大版を表示するには、こちらをクリックしてください。</a> <img alt="図4" src="/files/ftp_upload/53070/53070fig4.jpg" /> デジタル画像解析および用量反応グラフの図4の例。骨髄幹細胞との共培養における（A）MM細胞を、コラーゲンに埋め込 ​​まれたIは、50 nmのカーフィルゾミブの濃度に曝露しました。画像解析アルゴリズムは緑色で生細胞および擬似色、それらを検出します。 （B）画像は、実験期間中一定の間隔で取得されます。このconcentratiで薬物の上に、ほとんど全ての細胞は、96時間の終わりに死んでいます。 （C）のグラフは、100％として= 0時間の時間のための正規化された96時間の間隔に沿っカーフィルゾミブ5つの異なる濃度についての生存細胞の数の変化を示しています。ヒト骨髄腫細胞株MM1.Sは薬効のための対照として使用しました。スケールバー（AおよびBの右下）は500μmを表すが。 <a href="https://www-jove-com.remotexs.ntu.edu.sg/files/ftp_upload/53070/53070fig4large.jpg" target="_blank">この図の拡大版を表示するには、こちらをクリックしてください。</a> <img alt="図5" src="/files/ftp_upload/53070/53070fig5.jpg" /> 図5.一般的なエラーは、播種またはイメージングプレート。（A）間質細胞は「もつれ」 しています 。 （B）MM細胞の「コロニー」。 （C）が少なすぎるMM細胞。 （D）は、焦点面を斜め。スケールバー（各画像の右下）は500μmを表します。 <a href="https://www-jove-com.remotexs.ntu.edu.sg/files/ftp_upload/53070/53070fig5large.jpg" target="_blank">この図の拡大版を表示するには、こちらをクリックしてください。</a> <img alt="図1 SUP" src="/files/ftp_upload/53070/53070fig1sup.jpg" /> ロボットピペッターを使用して、補足図1. 384ウェルプレート中のウェルの最適空間分布。この構成では31の異なる薬剤は、5つの異なる濃度および2反復（緑）で試験することができます。また、細胞株と陽性対照（ピンク）薬物効力を確実にするために使用することができます。 <a href="https://www-jove-com.remotexs.ntu.edu.sg/files/ftp_upload/53070/SuppFigure1.jpg" target="_blank">この図の拡大版を表示するには、こちらをクリックしてください。</a> <img alt="図2燮" src="/files/ftp_upload/53070/53070fig2sup.jpg" /> 補足図2の空間分布<html>薬物「マスタープレート」。薬物希釈プレートを作成するために、各ウェルは20倍の濃度で31薬の一つが含まれ、このプレートを使用しますロボットピペッター。 <a href="https://www-jove-com.remotexs.ntu.edu.sg/files/ftp_upload/53070/SuppFigure2.jpg" target="_blank">この図の拡大版を表示するには、こちらをクリックしてください。</a> <img alt="図3燮" src="/files/ftp_upload/53070/53070fig3sup.jpg" /> ロボットピペッターでプレートを調製する際に使用される井戸の補足図3の番号。プロトコールに記載されているソフトウェアは適切に薬や濃度に井戸をマッピングするために、ウェルのこの番号が必要になります。 <a href="https://www-jove-com.remotexs.ntu.edu.sg/files/ftp_upload/53070/SuppFigure3.jpg" target="_blank">表示するにはこちらをクリックしてくださいこの図の拡大版。</a> /ftp_upload/53070/53070fig4sup.jpg &quot;/&gt; 補足図4.マイクロ流体スライドとの比較（キンら 、2014）、および現在のプロトコル。以前のシステム（左上ボルテゾミブ、中央左メルファラン）で、現在のシステムで24時間測定H929多発性骨髄腫細胞株の用量応答（右上ボルテゾミブと右中央メルファラン）。比較のために、両方のプラットフォームのための24時間でのLD50は3.9 nmおよびボルテゾミブ4.1 nMであり、6.4μMとメルファランのための14.65ミクロンであった。 <a href="https://www-jove-com.remotexs.ntu.edu.sg/files/ftp_upload/53070/SuppFigure4.jpg" target="_blank">この図の拡大版を表示するには、こちらをクリックしてください。</a>

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An Organotypic High Throughput System for Characterization of Drug Sensitivity of Primary Multiple Myeloma Cells

We describe a high-throughput drug sensitivity assay for primary multiple myeloma cells. It consists of a reconstruction of the bone marrow microenvironment (including extracellular matrix and stroma) in multi-well plates, and a non-invasive method for longitudinal quantification of cell viability.

一次多発性骨髄腫細胞の薬剤感受性の特徴付けのための器官のハイスループットシステム

In this work we describe a novel approach that combines ex vivo drug sensitivity assays and digital image analysis to estimate chemosensitivity and ...

an-organotypic-high-throughput-system-for-characterization-drug

Nanyang Technological University

Research

JoVE Journal

Medicine

8.6K ビュー.  H. Lee Moffitt Cancer Center and Research Institute. We describe a high-throughput drug sensitivity assay for primary multiple myeloma cells. It consists of a reconstruction of the bone marrow microenvironment (including extracellular matrix and stroma) in multi-well plates, and a non-invasive method for longitudinal quantification of cell viability.

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Isolation, Characterization and Comparative Differentiation of Human Dental Pulp Stem Cells Derived from Permanent Teeth by Using Two Different Methods

Developing wisdom teeth are easy-accessible source of stem cells during the adulthood which could be obtained by routine orthodontic treatments. Human pulp-derived stem cells (hDPSCs) possess high proliferation potential with multi-lineage differentiation capacity compare to the ordinary source of adult stem cells1-8; therefore, hDPSCs could be the good candidates for autologous transplantation in tissue engineering and regenerative medicine. Along with these benefits, possessing the mesenchymal stem cells (MSC) features, such as immunolodulatory effect, make hDPSCs more valuable, even in the case of allograft transplantation6,9,10. Therefore, the primary step for using this source of stem cells is to select the best protocol for isolating hDPSCs from pulp tissue. In order to achieve this goal, it is crucial to investigate the effect of various isolation conditions on different cellular behaviors, such as their common surface markers &amp; also their differentiation capacity.
Thus, here we separate human pulp tissue from impacted third molar teeth, and then used both existing protocols based on literature, for isolating hDPSCs,11-13 i.e. enzymatic dissociation of pulp tissue (DPSC-ED) or outgrowth from tissue explants (DPSC-OG). In this regards, we tried to facilitate the isolation methods by using dental diamond disk. Then, these cells characterized in terms of stromal-associated Markers (CD73, CD90, CD105 &amp; CD44), hematopoietic/endothelial Markers (CD34, CD45 &amp; CD11b), perivascular marker, like CD146 and also STRO-1. Afterwards, these two protocols were compared based on the differentiation potency into odontoblasts by both quantitative polymerase chain reaction (QPCR) &amp; Alizarin Red Staining. QPCR were used for the assessment of the expression of the mineralization-related genes (alkaline phosphatase; ALP, matrix extracellular phosphoglycoprotein; MEPE &amp; dentin sialophosphoprotein; DSPP).14

The method described isolation and characterization of human Dental Pulp Stem Cells (hDPSCs) by using either enzymatic dissociation of pulp (DPSC-ED) or direct outgrowth of stem cells from pulp tissue explants (DPSC-OG). Then followed by in vitro comparative differentiation of both types of hDPSCs into odontoblasts.

単離、特徴付けと二つの異なる方法を使用して永久歯に由来するヒト歯髄幹細胞の分化の比較

Developing wisdom teeth are easy-accessible source of stem cells during the adulthood which could be obtained by routine orthodontic treatments. Human ...

医学

Coculture System with an Organotypic Brain Slice and 3D Spheroid of Carcinoma Cells

Patients with cerebral metastasis of carcinomas have a poor prognosis. However, the process at the metastatic site has barely been investigated, in particular the role of the resident (stromal) cells. Studies in primary carcinomas demonstrate the influence of the microenvironment on metastasis, even on prognosis1,2. Especially the tumor associated macrophages (TAM) support migration, invasion and proliferation3. Interestingly, the major target sites of metastasis possess tissue-specific macrophages, such as Kupffer cells in the liver or microglia in the CNS. Moreover, the metastatic sites also possess other tissue-specific cells, like astrocytes. Recently, astrocytes were demonstrated to foster proliferation and persistence of cancer cells4,5. Therefore, functions of these tissue-specific cell types seem to be very important in the process of brain metastasis6,7.
Despite these observations, however, up to now there is no suitable in vivo/in vitro model available to directly visualize glial reactions during cerebral metastasis formation, in particular by bright field microscopy. Recent in vivo live imaging of carcinoma cells demonstrated their cerebral colonization behavior8. However, this method is very laborious, costly and technically complex. In addition, these kinds of animal experiments are restricted to small series and come with a substantial stress for the animals (by implantation of the glass plate, injection of tumor cells, repetitive anaesthesia and long-term fixation). Furthermore, in vivo imaging is thus far limited to the visualization of the carcinoma cells, whereas interactions with resident cells have not yet been illustrated. Finally, investigations of human carcinoma cells within immunocompetent animals are impossible8.
For these reasons, we established a coculture system consisting of an organotypic mouse brain slice and epithelial cells embedded in matrigel (3D cell sphere). The 3D carcinoma cell spheres were placed directly next to the brain slice edge in order to investigate the invasion of the neighboring brain tissue. This enables us to visualize morphological changes and interactions between the glial cells and carcinoma cells by fluorescence and even by bright field microscopy. After the coculture experiment, the brain tissue or the 3D cell spheroids can be collected and used for further molecular analyses (e.g. qRT-PCR, IHC, or immunoblot) as well as for investigations by confocal microscopy. This method can be applied to monitor the events within a living brain tissue for days without deleterious effects to the brain slices. The model also allows selective suppression and replacement of resident cells by cells from a donor tissue to determine the distinct impact of a given genotype. Finally, the coculture model is a practicable alternative to in vivo approaches when testing targeted pharmacological manipulations.

The organotypic brain slice coculture with carcinoma cells enables visualizing morphological changes by fluorescence as well as bright field (video) microscopy during the process of carcinoma cell invasion of brain tissue. This model system also allows for cell exchange and replenishment approaches and offers a wide variety of manipulations and analyses.

器官型脳スライスと癌細胞の3Dスフェロイドとの共培養システム

Patients with cerebral metastasis of carcinomas have a poor prognosis. However, the process at the metastatic site has barely been investigated, in ...

High Throughput Characterization of Adult Stem Cells Engineered for Delivery of Therapeutic Factors for Neuroprotective Strategies

Mesenchymal stem cells (MSCs) derived from bone marrow are a powerful cellular resource and have been used in numerous studies as potential candidates to develop strategies for treating a variety of diseases. The purpose of this study was to develop and characterize MSCs as cellular vehicles engineered for delivery of therapeutic factors as part of a neuroprotective strategy for rescuing the damaged or diseased nervous system. In this study we used mouse MSCs that were genetically modified using lentiviral vectors, which encoded brain-derived neurotrophic factor (BDNF) or glial cell-derived neurotrophic factor (GDNF), together with green fluorescent protein (GFP). 
Before proceeding with in vivo transplant studies it was important to characterize the engineered cells to determine whether or not the genetic modification altered aspects of normal cell behavior. Different culture substrates were examined for their ability to support cell adhesion, proliferation, survival, and cell migration of the four subpopulations of engineered MSCs. High content screening (HCS) was conducted and image analysis performed. 
Substrates examined included: poly-L-lysine, fibronectin, collagen type I, laminin, entactin-collagen IV-laminin (ECL). Ki67 immunolabeling was used to investigate cell proliferation and Propidium Iodide staining was used to investigate cell viability. Time-lapse imaging was conducted using a transmitted light/environmental chamber system on the high content screening system.
Our results demonstrated that the different subpopulations of the genetically modified MSCs displayed similar behaviors that were in general comparable to that of the original, non-modified MSCs. The influence of different culture substrates on cell growth and cell migration was not dramatically different between groups comparing the different MSC subtypes, as well as culture substrates. 
This study provides an experimental strategy to rapidly characterize engineered stem cells and their behaviors before their application in long-term in vivo transplant studies for nervous system rescue and repair.

This study describes an experimental platform to rapidly characterize engineered stem cells and their behaviors before their application in long-term in vivo transplant studies for nervous system rescue and repair.

神経保護戦略のための治療因子の送達のために設計成体幹細胞の高スループット特性評価

Mesenchymal stem cells (MSCs) derived from bone marrow are a powerful cellular resource and have been used in numerous studies as potential candidates to ...

A Brain Tumor/Organotypic Slice Co-culture System for Studying Tumor Microenvironment and Targeted Drug Therapies

Brain tumors are a major cause of cancer-related morbidity and mortality. Developing new therapeutics for these cancers is difficult, as many of these tumors are not easily grown in standard culture conditions. Neurosphere cultures under serum-free conditions and orthotopic xenografts have expanded the range of tumors that can be maintained. However, many types of brain tumors remain difficult to propagate or study. This is particularly true for pediatric brain tumors such as pilocytic astrocytomas and medulloblastomas. This protocol describes a system that allows primary human brain tumors to be grown in culture. This quantitative assay can be used to investigate the effect of microenvironment on tumor growth, and to test new drug therapies. This protocol describes a system where fluorescently labeled brain tumor cells are grown on an organotypic brain slice from a juvenile mouse. The response of tumor cells to drug treatments can be studied in this assay, by analyzing changes in the number of cells on the slice over time. In addition, this system can address the nature of the microenvironment that normally fosters growth of brain tumors. This brain tumor organotypic slice co-culture assay provides a propitious system for testing new drugs on human tumor cells within a brain microenvironment.

Many types of human brain tumors are localized to specific regions within the brain and are difficult to grow in culture. This protocol addresses the role of tumor microenvironment and investigates new drug treatments by analyzing fluorescent primary brain tumor cells growing in an organotypic mouse brain slice. &#160;

腫瘍微小環境と標的薬物療法研究のための脳の腫瘍/器官スライス共培養系

Brain tumors are a major cause of cancer-related morbidity and mortality. Developing new therapeutics for these cancers is difficult, as many of these ...

Forskolin-induced Swelling in Intestinal Organoids: An In Vitro Assay for Assessing Drug Response in Cystic Fibrosis Patients

Recently-developed cystic fibrosis transmembrane conductance regulator (CFTR)-modulating drugs correct surface expression and/or function of the mutant CFTR channel in subjects with cystic fibrosis (CF). Identification of subjects that may benefit from these drugs is challenging because of the extensive heterogeneity of CFTR mutations, as well as other unknown factors that contribute to individual drug efficacy. Here, we describe a simple and relatively rapid assay for measuring individual CFTR function and response to CFTR modulators in vitro. Three dimensional (3D) epithelial organoids are grown from rectal biopsies in standard organoid medium. Once established, the organoids can be bio-banked for future analysis. For the assay, 30-80 organoids are seeded in 96-well plates in basement membrane matrix and are then exposed to drugs. One day later, the organoids are stained with calcein green, and forskolin-induced swelling is monitored by confocal live cell microscopy at 37 &#176;C. Forskolin-induced swelling is fully CFTR-dependent and is sufficiently sensitive and precise to allow for discrimination between the drug responses of individuals with different and even identical CFTR mutations. In vitro swell responses correlate with the clinical response to therapy. This assay provides a cost-effective approach for the identification of drug-responsive individuals, independent of their CFTR mutations. It may also be instrumental in the development of future CFTR modulators.

Forskolin-induced Swelling in Intestinal Organoids: An In Vitro Assay for Assessing Drug Response in Cystic Fibrosis Patients

This protocol describes an assay for measuring CFTR function and CFTR modulator responses in cultured tissue from subjects with cystic fibrosis (CF). Biopsy-derived intestinal organoids swell in a cAMP-driven fashion, a response that is defective (or strongly reduced) in CF organoids and can be restored by exposure to CFTR modulators.

フォルスコリン誘発性腸オルガノイドに腫れ：<em&gt;インビトロ</em&gt;アッセイ嚢胞性線維症患者における薬物反応を評価するための

Recently-developed cystic fibrosis transmembrane conductance regulator (CFTR)-modulating drugs correct surface expression and/or function of the mutant ...

Optimized LC-MS/MS Method for the High-throughput Analysis of Clinical Samples of Ivacaftor, Its Major Metabolites, and Lumacaftor in Biological Fluids of Cystic Fibrosis Patients

Defects in the cystic fibrosis trans-membrane conductance regulator (CFTR) are the cause of cystic fibrosis (CF), a disease with life-threatening pulmonary manifestations. Ivacaftor (IVA) and ivacaftor-lumacaftor (LUMA) combination are two new breakthrough CF drugs that directly modulate the activity and trafficking of the defective CFTR-protein. However, there is still a dearth of understanding on pharmacokinetic/pharmacodynamic parameters and the pharmacology of ivacaftor and lumacaftor. The HPLC-MS technique for the simultaneous analysis of the concentrations of ivacaftor, hydroxymethyl-ivacaftor, ivacaftor-carboxylate, and lumacaftor in biological fluids in patients receiving standard ivacaftor or ivacaftor-lumacaftor combination therapy has previously been developed by our group and partially validated to FDA standards. However, to allow the high-throughput analysis of a larger number of patient samples, our group has optimized the reported method through the use of a smaller pore size reverse-phase chromatography column (2.6 &#181;m, C8 100 &#197;; 50 x 2.1 mm) and a gradient solvent system (0-1 min: 40% B; 1-2 min: 40-70% B; 2-2.7 min: held at 70% B; 2.7-2.8 min: 70-90% B; 2.8-4.0 min: 90% B washing; 4.0-4.1 min: 90-40% B; 4.1-6.0 min: held at 40% B) instead of an isocratic elution. The goal of this study was to reduce the HPLC-MS analysis time per sample dramatically from ~15 min to only 6 min per sample, which is essential for the analysis of a large amount of patient samples. This expedient method will be of considerable utility for studies into the exposure-response relationships of these breakthrough CF drugs.

Ivacaftor and ivacaftor-lumacaftor combination are two new CF drugs. However, there is still a dearth of understanding on their PK/PD and pharmacology. We present an optimized HPLC-MS technique for the simultaneous analysis of ivacaftor and its major metabolites, and lumacaftor.

Ivacaftor、主要な代謝産物および嚢胞性線維症患者の体液中の Lumacaftor の臨床サンプルの高スループット分析のための最適化された LC-MS/MS 法

Defects in the cystic fibrosis trans-membrane conductance regulator (CFTR) are the cause of cystic fibrosis (CF), a disease with life-threatening ...

Improved Method for the Establishment of an In Vitro Blood-Brain Barrier Model Based on Porcine Brain Endothelial Cells

The aim of this protocol presents an optimized procedure for the purification and cultivation of pBECs and to establish in vitro blood-brain barrier (BBB) models based on pBECs in mono-culture (MC), MC with astrocyte-conditioned medium (ACM), and non-contact co-culture (NCC) with astrocytes of porcine or rat origin. pBECs were isolated and cultured from fragments of capillaries from the brain cortices of domestic pigs 5-6 months old. These fragments were purified by careful removal of meninges, isolation and homogenization of grey matter, filtration, enzymatic digestion, and centrifugation. To further eliminate contaminating cells, the capillary fragments were cultured with puromycin-containing medium. When 60-95% confluent, pBECs growing from the capillary fragments were passaged to permeable membrane filter inserts and established in the models. To increase barrier tightness and BBB characteristic phenotype of pBECs, the cells were treated with the following differentiation factors: membrane permeant 8-CPT-cAMP (here abbreviated cAMP), hydrocortisone, and a phosphodiesterase inhibitor, RO-20-1724 (RO). The procedure was carried out over a period of 9-11 days, and when establishing the NCC model, the astrocytes were cultured 2-8 weeks in advance. Adherence to the described procedures in the protocol has allowed the establishment of endothelial layers with highly restricted paracellular permeability, with the NCC model showing an average transendothelial electrical resistance (TEER) of 1249 &#177; 80 &#937; cm2, and paracellular permeability (Papp) for Lucifer Yellow of 0.90 10-6 &#177; 0.13 10-6 cm sec-1 (mean &#177; SEM, n=55). Further evaluation of this pBEC phenotype showed good expression of the tight junctional proteins claudin 5, ZO-1, occludin and adherens junction protein p120 catenin. The model presented can be used for a range of studies of the BBB in health and disease and, with the highly restrictive paracellular permeability, this model is suitable for studies of transport and intracellular trafficking.

Improved Method for the Establishment of an In Vitro Blood-Brain Barrier Model Based on Porcine Brain Endothelial Cells

The aim of the protocol is to present an optimized procedure for the establishment of an in vitro blood-brain barrier (BBB) model based on primary porcine brain endothelial cells (pBECs). The model shows high reproducibility, high tightness, and is suitable for studies of transport and intracellular trafficking in drug discovery.

体外血液脳関門ブタ脳血管内皮細胞に基づくモデルの確立のための改良法

The aim of this protocol presents an optimized procedure for the purification and cultivation of pBECs and to establish in vitro blood-brain barrier (BBB) ...

Isolation of Primary Human Decidual Cells from the Fetal Membranes of Term Placentae

The decidua, also known as the pregnant endometrium, is a critically important reproductive tissue. Decidual cells, comprised mainly of decidualized stromal cells and immune cells, are responsible for the secretion of hormonal and inflammatory factors which are critical for successful blastocyst implantation, placental development and play a role in the initiation of labor at term and preterm. Many pregnancy complications can arise from perturbations of a fine balance of different cell populations comprising decidua. Alterations in the proportion of specific decidual cell types may disrupt these crucial processes and increase the risk of developing serious complications of pregnancy, such as embryo implantation failure, intrauterine growth restriction, preeclampsia and preterm labor. The protocol outlined here demonstrates a cost and time effective method for the isolation of primary human decidual cells collected from the fetal membranes of term placentae. By combining enzymatic digestion and gentle mechanical disruption of the decidual tissue, a high yield of decidual cells was obtained with virtually no chorion contamination. Importantly, isolated decidual cells were characterized (stromal cells (55-60%), leukocytes (35%), epithelial (1%) or trophoblast (0.01%) cells) and maintained high viability (80%) which was confirmed by multicolor imaging flow cytometry assay. This protocol is specific to the decidua parietalis and can be adapted to first and second trimester placentae. Once isolated, decidual cells can be used for a multitude of experimental applications aiming to understand the role of different decidual cell sub-populations in pregnancy complications.

This protocol demonstrates a method for the isolation of primary human decidual cells collected from the fetal membranes of term placentae which can be used for a variety of applications (i.e. immunocytochemistry, flow cytometry, etc.) aiming to study the role of different cell populations in pregnancy complications.

用語胎盤の胎児膜から主のひと脱落膜細胞の分離

The decidua, also known as the pregnant endometrium, is a critically important reproductive tissue. Decidual cells, comprised mainly of decidualized ...

High-Throughput Analysis of Optical Mapping Data Using ElectroMap

Optical mapping is an established technique for high spatio-temporal resolution study of cardiac electrophysiology in multi-cellular preparations. Here we present, in a step-by-step guide, the use of ElectroMap for analysis, quantification, and mapping of high-resolution voltage and calcium datasets acquired by optical mapping. ElectroMap analysis options cover a wide variety of key electrophysiological parameters, and the graphical user interface allows straightforward modification of pre-processing and parameter definitions, making ElectroMap applicable to a wide range of experimental models. We show how built-in pacing frequency detection and signal segmentation allows high-throughput analysis of entire experimental recordings, acute responses, and single beat-to-beat variability. Additionally, ElectroMap incorporates automated multi-beat averaging to improve signal quality of noisy datasets, and here we demonstrate how this feature can help elucidate electrophysiological changes that might otherwise go undetected when using single beat analysis. Custom modules are included within the software for detailed investigation of conduction, single file analysis, and alternans, as demonstrated here. This software platform can be used to enable and accelerate the processing, analysis, and mapping of complex cardiac electrophysiology.

This protocol describes the setup and use of ElectroMap, a MATLAB-based open-source software platform for analysis of cardiac optical mapping data. ElectroMap provides a versatile high-throughput tool for analysis of optical mapping voltage and calcium datasets across a wide range of cardiac experimental models.

エレクトロマップを用いた光マッピングデータのハイスループット解析

Optical mapping is an established technique for high spatio-temporal resolution study of cardiac electrophysiology in multi-cellular preparations. Here we ...

A High-Throughput Electrochemiluminescence 7-Plex Assay Simultaneously Screening for Type 1 Diabetes and Multiple Autoimmune Diseases

Islet autoantibodies (IAbs) are widely used in type 1 diabetes (T1D) diagnosis and prediction. Four major IAbs to insulin (IAA), glutamate decarboxylase-65 (GADA), insulinoma antigen-2 (IA-2A), and zinc transporter-8 (ZnT8A) are equally important in disease prediction. Presently, up to 40% of patients diagnosed with T1D go on to develop other autoimmune disorders. Unfortunately, current screening methods using a single autoantibody for measurement are laborious and inefficient for large scale screening studies. We recently developed a simple multiplexed electrochemiluminescence (ECL) assay to address these current issues. The assay combines all 7 autoantibody tests into one well. Each well includes three IAbs (IAA, GADA, and IA-2A), autoantibodies to thyroid peroxidase (TPOA) and thyroid globulin (ThGA) to detect autoimmune thyroid disease, autoantibodies to tissue transglutaminase (TGA) for celiac disease, and autoantibodies to interferon alpha (IFN&#945;A) for autoimmune polyglandular syndrome-1 (APS-1); all of which screen for T1D and other relevant autoimmune diseases, simultaneously. The multiplex ECL assay is based on the single ECL assay platform, but instead uses the multiplex plate combining multiple autoantibody assays, up to 10, into a single well. The main difference from the single ECL assay is that each antibody-antigen complex formed in the fluid-phase is restrained onto a specific spot on each well through a linker system on the multiplex plate. The 7-Plex ECL assay, in the present study, is validated against standard radio-binding assays (RBA) and single ECL assays, using a large cohort of newly diagnosed T1D patients and age-matched healthy controls, resulting in excellent assay sensitivity and specificity.

We model a simple multiplexed ECL assay that combines 7 autoantibody assays together. The assay is capable of screening for T1D and multiple other autoimmune diseases, simultaneously, including celiac disease, autoimmune thyroid disease, and autoimmune polyglandular syndrome 1.