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この論文では、細胞ベースのイメージングスクリーニングにより、オートファジーフラックスをモニタリングして新しい分子を同定する方法について詳しく説明します。
オートファジーは、ホメオスタシスを調節する中心的なメカニズムです。オートファジーの変化は、老化関連疾患の一因となります。オートファジーの調節因子を同定する表現型法は、新規治療法の同定に利用できる可能性があります。この記事では、ヒト軟骨細胞のオートファジーフラックス(mCherry-EGFP-LC3B)のレポーターとしてLC3を使用してオートファジーフラックスをモニターするために開発された細胞ベースのイメージングスクリーニングワークフローについて説明します。データ取得は、自動化されたハイコンテントイメージングスクリーニングシステム顕微鏡を使用して行われます。アルゴリズムベースの自動画像解析プロトコルが開発され、オートファジーフラックスを活性化する分子を特定するために検証されました。重要な手順、説明文、および現在のオートファジーモニタリングプロトコルに対する改善点が報告されています。老化の特徴を標的とする生理学的に関連性のある表現型スクリーニングアプローチは、加齢に伴う筋骨格系疾患に対するより効果的な創薬戦略を促進することができます。
多くの慢性疾患は、オートファジーの欠陥など、老化の特徴と関連しています1。変形性関節症(OA)は最も蔓延している関節疾患であり、高齢化社会の日常生活を制限する上で大きな影響を及ぼしますが、予防策も疾患修飾治療もまだ利用できません2。
関節の老化と変形性関節症は、オートファジーの欠陥や老化など、軟骨変性の進行を定義する特徴と関連しています3,4。筋骨格系組織のオートファジーを標的とすることで、リウマチ性疾患の革新的な治療法を見つけることができます5,6。オートファジーの薬理学的調節は、前臨床疾患モデル7への介入に有望で関連性のあるメカニズムです。OAでは、オートファジーの活性化が関節機能障害の予防に用いられています8。定量分析を可能にする堅牢で再現性のあるプロトコルに基づいてオートファジーをモニタリングする方法は、新規薬剤を同定し、老化の疾患関連特性の薬理学的標的化を促進するために使用できます。
オートファジーフラックスは分解活性を反映しており、オートファジー9を活性化する新しい分子を特定するための適切な測定値です。本研究では、ヒト軟骨細胞のオートファジーレポーター細胞株(TC28a2)を用いてオートファジー分解活性を測定することにより、オートファジーフラックスを測定するために開発された方法について述べています。mCherry-EGFP-LC3-一過性発現は、生細胞のリソソーム10におけるGFPシグナルとmCherry LC3シグナルとの間のpH感度の違いを定量化することにより、オートリソソームの形成および分解イベントの同時モニタリングを可能にする。
報告されたこのフローサイトメトリー法を生軟骨細胞の安定発現イメージングモニタリングシステムに適応させることで、軟骨生物学の文脈でオートファジーフラックスを活性化する分子を同定できる可能性があります。
1. 不死化ヒト軟骨細胞のオートファジーレポーター細胞株の作製
注:フローサイトメトリーの定量的読み出しを確立することにより、pBABE-mCherry-GFP-LC3の安定トランスフェクションによるオートファジーレポーター細胞株の作製は、以前に説明した11。レトロウイルストランスフェクションでは、コトランスフェクションプロセス中のHEK 293-T17と感染ステップのT/C28a2の2つの細胞株を使用しました。
2. 生軟骨細胞における画像ベースのオートファジーフラックスアッセイ
注:クローンを選択した後、アッセイを開始してオートファジーフラックスを定量します。
3. オートファジーフラックスのデータ取得と解析
オートファジーフラックスは、薬理学的調節または細胞ストレス応答によって細胞内でモニターできます。不死化ヒト軟骨細胞(T/C28a2)を用いて、LC3をオートファジー用の蛍光レポーター(mCherry-EGFP-LC3B)として用いたオートファジーレポーター細胞株を開発しました。 図1 は、ヒト軟骨細胞のオートファジーレポーター細胞株(mCherry-EGFP-LC3-T/C28a2)の開発から始まり、薬理学的調節によるオートファジーフラックスの誘導または阻害、そしてハイコンテントイメージング顕微鏡によるデータ解析までのスクリーニングアッセイの概略的なワークフローを示しています。 図2 は、オートファジーフラックスをモニタリングしてオートファジーモジュレーターを同定するセルベースイメージングアッセイの概略図を示しています。このシステムの基礎は、mCherryに比べてオートリソソームの酸性環境に対するEGFP蛍光の感度が高いことにあります。 図3 は、細胞ベースの画像からオートファジーフラックスを定量化するための解析のシーケンスを示しています。 図4 は、クロロキンとラパマイシンのmCherry/GFPの比率で表される低オートファジーフラックスと高オートファジーフラックスの代表的な画像を示しています。
図1:細胞ベースのイメージングアッセイによるオートファジーフラックスの測定に使用したワークフローの概略図。 オートファジーレポーター細胞株を作製するために、レトロウイルストランスフェクションでは、コトランスフェクションプロセスではHEK 293-T17細胞株を、感染ステップではT/C28a2不死化ヒト軟骨細胞の2つの細胞株を使用しました。pBABE-puro-mCherry-EGFP-LC3Bプラスミドを前述の10 のように細胞に導入し、ピューロマイシンを使用してウイルストランスフェクション後の安定した細胞培養を選択しました。細胞を増殖培地中の384ウェルプレート(1ウェルあたり4 x 103 細胞)に播種し、処理前に37°Cおよび5%CO2 で24時間インキュベートしました。次に、培地を取り出し、増殖培地に 2% FCS と 1% P/S、および 2.5 μL/mL ピューロマイシンを添加しました。細胞を30 μMクロロキンおよび10 μMラパマイシンで処理しました。データ取得には、ハイコンテントスクリーニングシステムを使用しました。読み取りプロトコルを開発するために、いくつかのチャネルと露光時間を選択しました。データは画像解析ソフトウェアを使用して解析し、解析プロトコルを選択しました。最後に、相対強度スポットのmCherry/EGFP比を確認しました。 この図の拡大版を表示するには、ここをクリックしてください。
図2:オートファジーモジュレーターを同定するための細胞ベースのイメージングアッセイの表現。 pBABE-puro-mCherry-EGFP-LC3Bプラスミドを細胞内に導入しました。オートファジーが活性化されると、貨物はファゴフォアに飲み込まれ、オートファゴソームが生成されました。LC3は脂質化され、LC3がカーゴ受容体と相互作用できるオートファゴソーム膜に取り込まれました。オートファゴソームとEGFP pKa ≥ 6.0の塩基性環境により、緑色蛍光が発せられました。オートファジーフラックスが続くと、オートファゴソームがリソソームと融合し、オートリソソームが作られ、pHが低下し、赤橙色の蛍光が発せられました。 この図の拡大版を表示するには、ここをクリックしてください。
図3:さまざまなビルディングブロックを使用して細胞画像からオートファジーフラックスを定量化し、プロトコルを作成するための解析のシーケンス。 核は、ヘキストチャネルを使用して同定されました。次に、フルオレセイン(EGFP)とRFPの2つのチャネルを使用して細胞質を同定しました。次に、細胞集団を選択するために境界オブジェクトを削除しました。ソフトウェアは、セル全体を緑色で、不完全なセルを赤色で識別します。同定された各細胞質では、斑点(スポットと呼ばれる)の蓄積が見られました。最後に、各細胞質からの相対強度スポットを計算し、LC3活性化に関連するmCherry/EGFPの比率に基づいてオートファジーフラックスを定量しました。スケールバー = 50 μm。 この図の拡大版を表示するには、ここをクリックしてください。
図4:クロロキンとラパマイシンで処理したmCherry-EGFP-LC3 T/C28a2軟骨細胞のイメージングによる定量。 2% FCS を添加した培地をコントロールとして使用しました。クロロキンはオートファジーフラックス阻害剤として使用されました。オートファジーフラックスが活性化されると、オートファゴソームが作られましたが、オートファゴソームとリソソームの融合は起こりませんでした。そのため、オートファゴソームが蓄積し、緑色蛍光が発せられ、mCherry/EGFPの比率が減少しました。さらに、ラパマイシンはオートファジーフラックス活性化剤として使用されました。オートファゴソームがリソソームと融合すると、pHが低下し、赤橙色の蛍光が発せられ、mCherry/EGFPの比率が上昇しました。スケールバー = 50 μm。 この図の拡大版を表示するには、ここをクリックしてください。
モノクローナル集団 | 条件 | レシオ mCherry/EGFP フローサイトメトリー | レシオ mCherry/EGFP HTS |
クローンB | DMEM 2% FCSの | 1 | 1 |
ラパマイシン 5 μM | 1.5 | 1.13 | |
クロロキン 30 μM | 0.96 | 0.76 | |
クローンD | DMEM 2% FCSの | 1 | 1 |
ラパマイシン 5 μM | 1.32 | 1.22 | |
クロロキン 30 μM | 1.05 | 0.76 | |
クロンH | DMEM 2% FCSの | 1 | 1 |
ラパマイシン 5 μM | 1.64 | 1.12 | |
クロロキン 30 μM | 0.88 | 0.87 |
表1:フローサイトメトリーとHTSによって得られたデータで、オートファジーフラックスを定量し、最適なモノクローナル集団を選択します。
チャンネル | エミッション (nm) | 励起(nm) | 露出 (ミリ秒) |
明視野 | 652−760 | 感染 | 20 |
ヘキスト | 410−480 | 360−400 | 100 |
フルオレセイン | 500−550 | 460−490 | 700 |
RFPの | 560−630 | 520−550 | 1000 |
表2:オートファジーフラックスプロセスのハイコンテントスクリーニング解析のための画像取得設定。各チャンネルの発光波長と励起波長、露光時間。
オートファジーの欠陥は、加齢に伴う関節変性の重要な特徴ですが、オートファジーを標的とした予防的治療も疾患修飾的治療も、軟骨変性に対する治療法はまだありません2。オートファジーは、その関連性と臨床的意義から、創薬と開発の関心対象となっていますが、この重要な恒常性メカニズムの変化を直接モニタリングする方法は困難であることが証明されています。
ここでは、生きたヒト軟骨細胞におけるオートファジーフラックスを決定するための細胞ベースの表現型アッセイについて説明します。オートファジー活性化のデュアルレポーターであるmCherry-EGFP-LC3を含むプラスミドは、フローサイトメトリー11により、生細胞におけるGFPシグナルとmCherryシグナルのpH感度の違いによるオートリソソームの形成と分解イベントを同時にモニターするために使用されます。mCherry-EGFP-LC3Bを安定して高発現するヒト軟骨細胞は、オートファゴソームフラックスのダイナミクスを正確にモニターするために使用できます。軟骨細胞を用いた細胞ベースのイメージングアッセイは、オートリソソーム形成による動的なpH変化をリアルタイムで観察できるため、オートファジーモジュレーターの同定に使用することができます。オートファジーが活性化すると、ファゴフォアとオートファゴソームが生成され、使い捨ての貨物を捕まえます。LC3の脂質化、オートファゴソーム膜への包含、およびカーゴ受容体との相互作用は、緑色蛍光の発光に対応するpKa ≥ 6.0の基本環境を提供します。オートファジーフラックスが持続すると、オートファゴソームはリソソームと融合してオートリソソームを生成し、pHが低下して赤オレンジ色の蛍光を発します。
プロトコールを設定するための重要なステップには、高品質の細胞培養とDNAを使用してウイルス粒子を生成することにより高いトランスフェクション効率を得ること、最適な抗生物質処理とフローサイトロメトリーソーティングによる高レベルの導入遺伝子を持つ細胞クローンの効率的な選択、高品質の画像がオートファジーフラックスの定量分析を可能にするための細胞単層の穏やかな操作が含まれます。 また、オートファジーフラックスイベントから得られる有意な数の関連シグナルを正確に同定することもできます。
現在の方法はフローサイトメトリーに大きく依存しており、細胞を懸濁状態にする必要があるため、細胞間コミュニケーションや細胞内イベントに関する情報を取得するのが困難です。精度が高く、小さな亜集団や複雑な亜集団の精製には適していますが、ソーティングが遅すぎる場合があり、表面受容体密度の平均に関するデータしか提供されません。したがって、細胞ベースのイメージングは、静的分析によるマーカーの検出によるオートファジーのモニタリングと測定に利点があり、例えば、アップレギュレーションと分解阻害を区別することはできません12。また、画像取得の高感度化と、画像のキャプチャと分析を可能にする自動化された方法は、ハイコンテントスクリーニングシステムを使用することによってのみ可能です。自動定量分析では、軟骨細胞をクロロキンに曝露することで得られるオートファジーシグナルは一貫して低く(緑色)、軟骨細胞をラパマイシン(赤橙色)に曝露することで高いオートファジー活性化シグナルが得られることが示されています。これらの逆の効果により、大規模な実験でオートファジーを調節する薬剤(低分子のライブラリー、ゲノムの機能喪失または機能獲得スクリーニングライブラリーなど)を体系的に同定することができます。実際、この細胞ベースのアッセイを薬物転用アプローチで使用することにより、脂質低下薬として使用されたPPARαフィブラートは、変形性関節症の疾患修飾治療薬候補として特定されました13。
この方法は、フローサイトメトリーを生軟骨細胞の安定発現イメージングモニタリングシステムに適応させます。このプロトコールは、軟骨生物学の文脈でオートファジーフラックスを活性化する分子の同定を可能にするだけでなく、これらのメカニズムに影響を与える薬剤をスクリーニングする方法を可能にする可能性があります。
著者は何も開示していません。
この研究は、Instituto de Salud Carlos III- Ministerio de Ciencia, Innovación y Universidades, Spain, Plan Estatal 2013-2016 and Fondo Europeo de Desarrollo Regional (FEDER), "Una manera de hacer Europa", PI14/01324 and PI17/02059 の支援を受けました。 Innopharma Pharmacogenomics プラットフォームは、標的の検証と前臨床段階への薬剤候補の発見に適用されました。また、リウマチ学研究財団(FOREUM)のご支援にも感謝いたします。
Name | Company | Catalog Number | Comments |
100 mm cell culture plate | Corning | 430167 | Cell culture plate |
12-well multiplate | Corning | 353043 | Cell culture plate |
15 mL Centrifuge conical tube | Falcon-Corning | 352095 | Centrifuge conical tube |
24-well multiplate | Corning | 351147 | Cell culture plate |
25 cm2 Cell Culture Flask | Falcon-Corning | 353014 | Cell culture flask |
384-well multiplate Cell Carrier | Perkin Elmer | 6007550 | Cell culture plate |
6-well multiplate | Corning | 351146 | Cell culture plate |
96-well multiplate | Corning | 353077 | Cell culture plate |
Acoustic liquid handling technology | Labcyte | − | https://www.labcyte.com |
Chloroquine | Sigma-Aldrich | C6628 | autophagic flux inhibitor |
Dimethyl Sulfoxide (DMSO) | Sigma-Aldrich, St. Louis, MO | D2650 | Disolvent |
Dulbecco's Modified Eagle's Medium (DMEM) | Lonza, Basel, Switzerland | BE-604F | T/C28a2 growth medium |
Eagle's Minimum Essential Medium (EMEM) | ATCC | 30–2003 | HEK 293-T17 growth medium |
FACScalibur cytometer | Becton Dickinson, CA | − | https://www.bdbiosciences.com/en-eu |
Fetal Bovine Serum (FBS) | Sigma-Aldrich, St. Louis, MO | F9665 | HEK 293-T17 serum |
Fetal Calf Serum (FCS) | Gibco by Life Technologies, CA | 26010–074 | Serum |
FuGene | Promega | E2691 | A nonliposomal mixture of lipids as a plasmid delivery method to create autophagy reported cell line |
Handheld electronic 384 channel pipette | Integra | − | https://www.integra-biosciences.com/united-states/en/electronic-pipettes/viaflo-96384#downloads |
Hank's Balanced Salt Solution (HBSS) | Sigma-Aldrich | H6648 | Buffer |
HEK 293-T17 | ATCC | CRL-11268 | Kidney cell line. Cells were used to facilitate retroviral packaging |
High Content Screening System | Perkin Elmer | − | https://www.perkinelmer.com/es/product/operetta-cls-system-hh16000000 |
Hoechst 33342 | Thermo Fisher Scientific | 62249 | DNA staining |
Image Analysis Software | Perkin Elmer | − | https://www.perkinelmer.com/es/product/harmony-4-9-office-license-hh17000010 |
Liquid Handler workstation | Perkin Elmer | − | https://www.perkinelmer.com/es/category/janus-liquid-handler-workstations |
Microplate washer robot | Biotek | − | https://go.biotek.com/405tradein |
Opti-MEM® (1x) | Thermo Fisher Scientific | 11058 | Transfection medium |
Paraformaldehyde (PFA) | Sigma-Aldrich | 158127 | Fixer |
pBABE-puro mCherry-EGFP-LC3B | Addgene, Cambridge, MA | 22418 | Plasmid |
pCL-Eco | Addgene, Cambridge, MA | 12371 | Plasmid |
Penicillin-Streptomycin (P/S) | Sigma-Aldrich | P0781 | Antibiotic |
Phosphate-buffered saline (PBS) | MP Biomedicals | 2810305 | Buffer |
Puromycin | Sigma-Aldrich, St. Louis, MO | P8833 | Antibiotic |
Rapamycin | Calbiochem, Germany | 5053210 | autophagic flux activator |
Software CellQuestPro | Becton Dickinson | − | https://www.bdbiosciences.com/en-eu |
Syringe filters 0.45 μm | Corning | CLS431220 | Sterile filter |
T/C28a2 | − | − | human chondrocytes cell line |
Trypsin | Gibco by Life Technologies, CA | 15400054 | Trypsin used with T/C28a2 cells |
Trypsin | Sigma-Aldrich, St. Louis, MO | SM-2002-C | Trypsin used with HEK 293-T17 cells |
VSV.G | Addgene, Cambridge, MA | 14888 | Plasmid |
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