Method Article
A mass spectrometry imaging (MSI) source operated at atmospheric pressure was developed by coupling mid-infrared laser desorption and electrospray post-ionization. Exogenous ice matrix was used as the energy-absorbing matrix to facilitate resonant desorption of tissue-related material. This manuscript provides a step-by-step protocol for performing IR-MALDESI MSI of whole-body neonatal mouse.
質量分析(MS)のために、周囲のイオン化源は、過去10年間に多くの関心の対象となっています。マトリックス支援レーザ脱離エレクトロスプレーイオン化(MALDESI)は、このような方法の例であり、マトリックス支援レーザー脱離/イオン化(MALDI)( 例えば、脱着のパルス性質)及びエレクトロスプレーイオン化(ESI)( 例えば、ソフトイオン化の特徴)合成されます。 MALDESIの主要な利点の1つは、その固有の汎用性です。 MALDESI実験では、紫外線(UV)又は赤外線(IR)レーザ共振内因性または外因性のマトリックスを励起するために使用することができます。マトリックスの選択は、分析物依存せず、励起に使用されるレーザー波長のみに依存します。 IR-MALDESI実験では、氷の薄層は、エネルギー吸収マトリックスとして試料表面上に堆積されます。 IR-MALDESIソースジオメトリは、液体試料の分析だけでなく、BIOLのための実験の統計的設計(DOE)を使用して最適化されていますogical組織標本。また、強固なIR-MALDESI画像源は、調整可能な中間IRレーザはコンピュータ制御XY並進ステージと高分解能質量分析計を用いて同期される場合、開発されています。カスタムグラフィカルユーザインタフェース(GUI)は、レーザの繰返し速度のユーザ選択を可能にする、ボクセル当たりのショット、試料ステージのステップサイズ、及び脱着の間の遅延とソースのイベントをスキャン数。 IR-MALDESIは、繊維と染料と生物組織切片のMSIの法医学的分析のような様々な用途に使用されてきました。内因性代謝物の組織切片内の外因性生体異物の範囲の異なる分析物の分布を測定し、この技術を用いて定量することができます。この原稿で提示プロトコルは、全身の組織切片のIR-MALDESI MSIのために必要な主な手順について説明します。
マイクロプローブモードでの質量分析イメージング(MSI)は、試料の表面上の別個の位置でのビーム(レーザーまたはイオン)によって表面からの試料の脱離を伴います。各ラスタ点で、質量スペクトルが生成され、取得されたスペクトルは、それらが収集された元の空間位置とともに、同時に試料中の多数の分析物をマッピングするために使用することができます。質量分析の感度と特異性に結合されたイメージングのこのラベルのない方法は、MSIは、質量分析1,2の中で最も急速に進化する分野の一つとなって助けました。
マトリックス支援レーザー脱離/イオン化(MALDI)MSI分析のために使用される最も一般的なイオン化法です。しかし、有機マトリックス及びMALDIの真空要件の必要性は、再現性、サンプルスループット、および方法を用いて分析することができる試料のタイプに重大な制限をもたらします。大気圧(AP)IO数nization方法は、これらの制限3を回避するために、近年開発されてきました。これらの周囲のイオン化法は、それらの天然の状態に非常に近いと分析前の試料調製工程を簡略化環境において、生物学的試料の分析を可能にします。マトリックス支援レーザ脱離エレクトロスプレーイオン化(MALDESI)は、イオン化法4,5の例です。
IR-MALDESI実験では、氷の薄層は、エネルギー吸収マトリックスとして組織表面上に堆積されます。中赤外レーザーパルス氷マトリックスによって吸収され、水の伸縮モード共鳴を励起OHによる表面からの中性物質の脱離を容易にします。直交エレクトロの荷電液滴に中性パーティションを脱着しESI状4-6の後のイオン化されています。それが交流をするのに役立ちますので、外因性の氷マトリックスの添加は、組織内の内因性の水だけに依存よりも好ましいです異なる組織区画中の水分量の変動をカウントし、組織のイメージング実験において〜15倍7,8によって脱着6を高め、イオン存在度を改善することが示されています。
本研究では、新生児マウス全身で異なる器官全体の代謝物の分布を誘発するためにIR-MALDESI MSIを利用しています。 IR-MALDESI源の調整可能なパラメータの概要が与えられ、そして組織切片を正常に画像化のために必要なステップが示されています。
注:以下のプロトコルは、IR-MALDESI MSI実験を行うために必要なすべての手順について説明します。より綿密な最適化されたIR-MALDESI源の幾何学とレーザー、ステージとの同期、および質量分析計についての詳細は、別の場所で5,6見つけることができます。このプロトコルで使用される動物の組織サンプルは、施設内動物管理使用委員会(IACUC)とノースカロライナ州立大学の規則に従って得ました。
1.組織標本
2. IR-MALDESI準備/校正
図1. IR-MALDESI回路図とパラメータを設定します。(A)IR-MALDESIソースセットアップの概略図(正確な縮尺ではない)と調節可能なパラメータ。 (B)組織切片のイメージングのための最適化されたパラメータ値を。 この図の拡大版をご覧になるにはこちらをクリックしてください。
4.質量分析イメージングデータ集録
IR-MALDESI MSI動作図2.ユーザー・インターフェース。RASTIRスキャン制御プログラムのスクリーンショットが提示されています。 PERFのためのステップ(5)正しい番号を選択する、(4)ファイルに名前を与え、(3)(単位mm)段階のステップサイズを選択すること、(2)ROIを描く、MSI実験をorming(1)レーザスポットの位置を特定しています希望繰り返し率と共に、ボクセル当たりのパルス、及び(6)イメージングおよびMSのセットアップのためのリストを確認する。 この図の拡大版をご覧になるにはこちらをクリックしてください。
パラメーター | 値 |
イオン化モード | ポジティブ |
エレクトロ電圧 | |
溶剤流量 | 2μL/分 |
キャピラリー温度 | 275°C |
走査範囲 | m / z 250-1,000 |
検索の種類 | フルスキャン |
射出時間 | 110ミリ秒 |
解像力 |
全身IR-MALDESI MSIで使用される表1の機器パラメータ。
5.データ解析
図3 MSiReaderのユーザインタフェース。 v1.0の 20。ファイルをソフトウェアにロードされると、目的の分析物のイオンマップは、(1)のppmまたはThの中のm / z及び公差を入力することにより表示されます。このような(2)補間または(3)正規化などの更なる分析を行うこともできます。組織の光学像もインポートして重ね合わせることができますより良い視覚化のためのイオンマップ(4)。非標的組織(マゼンタライン)の面積と基準面積オフ組織(緑色のボックス)を選択することで、組織特異的なピークを抽出するために使用することができる機能(5)ピークピッキングを分析するために。 の拡大版をご覧になるにはこちらをクリックしてください。この図。
図4に示す画像は、全身の組織切片で異なる器官における代謝物の空間的な分布を示します。身体の特定の領域に固有のm / z値は、画像生成のためのバッチ処理に続いて、MSiReader PeakFinderを用いて発見されました。イメージオーバーレイツール( 図3-4)を得られたイオンマップと氷のマトリックスの沈着の前に撮影した光学像を整列させるために使用されました。動物の細胞膜における構造的役割( 図4A)から予想されるように、他の代謝産物は、特定の器官または組織区画内の異なる分布( 図4B-D)を示すのに対し、コレステロールは、すべての組織タイプで観察されます。
図4.代表IR-MALDESI MSIの画像。 ADフォー metaboli全マウスセクション内の化合物の局在を実証するテイオンマップ。脂質クラスは、各画像の右下に注釈が付けられています。組織切片の光学像は、臓器の可視化を支援するために、イオンマップ内に重畳されている。 この図の拡大版をご覧になるにはこちらをクリックしてください。
上記のプロトコルは、IR-MALDESI MSI実験を行うための重要なステップについて説明します。マトリックス・アプリケーション・プロセス(第3節)は、昇華またはスプレー塗布ロボット噴霧器を用いて、MALDI MSI実験のために、典型的なマトリックス・アプリケーション・プロセスに似て約20分を取ります。また、IR-MALDESIはマトリックス結晶6への検体の分配に依存しない、氷マトリックスが広く関係なく、それらの質量、サイズ、または化学的特性のすべての分析物のために使用することができます。また、氷の使用は、一般的なMALDI実験23で観察された下位m / z範囲内のマトリックス関連イオンを排除します。
実験内のすべてのステップは、高品質MSIデータを生成するために必要とされるが、実験の過程でエレクトロ安定性は、再現性のIR-MALDESIイオン発生のために不可欠です。相対湿度は、撮像実験の経過にわたって監視する必要があります一定の氷マトリックス層を維持します。 IR-MALDESIの脱着は氷6の厚さに比較的不浸透性です。しかし、いくつかのイメージング実験は、監視されていない場合は氷層が煩雑になることがあった複数の時間を取ることができます。この目的のために、比例積分導関数(PID)コントローラは、最近、エンクロージャ内の温度および相対湿度を監視し、必要に応じて調整するためにソースに統合されています。
MSIは、表面からの検体の直接サンプリングを伴うため、クロマトグラフィー分離は、スペクトルの複雑さを軽減するために使用することはできません。さらに、実験室の環境に存在する周囲のイオンは、目的の分析物(複数可)からの信号に干渉する可能性があります。生物学的サンプル内の化合物の多様な範囲と合わせ、周囲イオンからのスペクトルの複雑さは、高質量精度かつ高分解能質量分析計へIR-MALDESI(および他の周囲MSI源)のカップリング、秒を必要とします正確で詳細なイオンマップの生成を容易にするために、この実験で使用されるものとしてUCH。
この研究では、IR-MALDESI全体マウスの種々の器官における内因性代謝物の種々の空間的分布を明らかにするために使用しました。 MSiReaderにアルゴリズムをピークピッキングは異なるクラスからの脂質たその多くが、500以上の組織特異的なイオンを識別することができました。このプロトコルは、異なる器官24,25に、同時にそのような薬物および薬物代謝産物などの外因性化合物の分布をモニターするために使用することができます。全身薬物分布研究のためのゴールドスタンダードは、全身オートラジオグラフィー24です。しかし、この方法は時間がかかり、放射性標識化合物を必要とし、それは分析物の分子構造についての情報を提供しないので、親薬物とその代謝産物とを区別することができません。また、可能にしながら、IR-MALDESIと全身MSIは、これらの問題を回避します有機マトリックスの添加なしに、周囲環境で実行される分析。
The authors declare no competing financial interests.
The authors thank Professor H. Troy Ghashghaei from NCSU Department of Molecular Biomedical Sciences for providing the whole mouse tissue. The authors also gratefully acknowledge the financial assistance received from National Institutes of Health (R01GM087964), the W.M. Keck foundation, and North Carolina State University.
Name | Company | Catalog Number | Comments |
IR-MALDESI Source | Custom-made | N/A | Please refer to references 4 and 12 for an in-depth discussion of IR-MALDESI source development. |
Q Exactive Plus | Thermo Scientific | Q Exactive Plus Hybrid Quadrupole-Orbitrap Mass Spectrometer | |
Water, HPLC Grade | Burdick & Jackson | AH365-4 | |
Methanol, HPLC Grade | Burdick & Jackson | AH230-4 | |
Formic Acid | Sigma Aldrich | 56302 | |
Tunable mid-IR Laser | Opotek Inc. | IR Opolette | Tunable 2,700-3,100 nm IR OPO laser |
Nitrogen Gas | Arc3 Gases | AG S-NI300-5.0 | Grade 5.0 high purity nitrogen gas cylinder (300) |
Cryostat | Leica Biosystems | CM 1950 | Cryomicrotome |
High Profile Microtome Blades | Leica Biosystems | 3802123 | Leica DB80HS |
Mounting Medium (OCT) | Leica Biosystems | 3801480 | Surgipath FSC 22 mounting medium |
Cryostat Specimen Disc | Leica Biosystems | 14047740045 | 40 mm diameter |
Glass Microscope Slides | VWR | 48312-003 | Frosted, selected, pre-cleaned |
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