JoVE Journal

Immunology and Infection

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Nanyang Technological University

Un flusso di lavoro di metaproteomica clinica implementato all'interno della piattaforma Galaxy Bioinformatics per analizzare le interazioni ospite-microbioma alla base della malattia umana

Trascrizione

La metaproteomica clinica offre approfondimenti sul microbioma umano e sui suoi contributi alla malattia. Abbiamo sfruttato la potenza computazionale della piattaforma Galaxy per sviluppare un flusso di lavoro bioinformatico modulare che facilita l'analisi metaproteomica complessa basata sulla spettrometria di massa e la caratterizzazione di diversi tipi di campioni clinici rilevanti per gli studi sulla malattia.

Capitoli in questo video

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Introduction

2:25

Addressing Challenges in Metaproteomics with an Integrated Workflow for Host and Microbial Protein Characterization Using the Galaxy Ecosystem

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