Method Article
Qui, descriviamo un metodo di omogeneizzazione ad alta velocità assistita da separazione magnetica per la produzione su larga scala di nanovescicole derivate dall'endosoma come un nuovo tipo di mimici degli esosomi (EM) che condividono la stessa origine biologica e struttura, morfologia e composizione proteica simili delle vescicole extracellulari (EV) native.
Le vescicole extracellulari (EV) hanno attirato un'attenzione significativa nella ricerca fisiologica e patologica, nella diagnosi e nel trattamento delle malattie; Tuttavia, la loro traduzione clinica è stata limitata dalla mancanza di approcci di produzione su larga scala. Pertanto, questo protocollo fornisce un metodo di omogeneizzazione ad alta velocità assistito da separazione magnetica per la produzione su larga scala di nanovescicole derivate da endosomi come un nuovo tipo di mimici degli esosomi (EM) derivati dagli endosomi, che hanno una resa circa 100 volte superiore rispetto al metodo di ultracentrifugazione convenzionale. In questo metodo, le nanoparticelle magnetiche (MNP) sono state internalizzate dalle cellule parentali tramite endocitosi e sono state successivamente accumulate all'interno dei loro endosomi. Quindi, gli endosomi caricati con MNPs sono stati raccolti e purificati mediante trattamento ipotonico e separazione magnetica. Un omogeneizzatore ad alta velocità è stato utilizzato per rompere gli endosomi caricati con MNP in nanovescicole monodisperse. Le vescicole derivate dall'endosoma risultanti presentano la stessa origine biologica e struttura, caratterizzate dall'analisi del tracciamento delle nanoparticelle, dal microscopio elettronico a trasmissione e dal western blotting. La loro morfologia e composizione proteica sono simili a quelle delle vescicole extracellulari native, il che indica che le vescicole extracellulari possono potenzialmente fungere da surrogato a basso costo e ad alto rendimento delle vescicole extracellulari native per le traduzioni cliniche.
Le vescicole extracellulari (EV) sono piccole vescicole secrete da quasi tutte le cellule con una gamma di dimensioni comprese tra 30 e 150 nm, contenenti abbondanti sostanze bioattive. A seconda della cellula di origine, le vescicole extracellulari mostrano un'elevata eterogeneità, possedendo più componenti specifiche per le cellule madri1. Le vescicole extracellulari vengono rilasciate nei fluidi corporei e trasportate in siti distanti dove vengono assorbite dalle cellule bersaglio per l'azione2, che può essere utilizzata per fornire un'ampia gamma di molecole bioattive e farmaci per la riparazione dei tessuti, la diagnosi e il trattamento dei tumori e la modulazione immunitaria 3,4. Tuttavia, altre nanoparticelle biologiche (ad esempio, lipoproteine) e nanovescicole (ad esempio, vescicole extracellulari derivate da percorsi non endosomiali) con proprietà biofisiche simili nei fluidi corporei influenzano inevitabilmente l'isolamento e la purificazione delle vescicole extracellulari. Ad oggi, l'ultracentrifugazione rimane il gold standard per l'isolamento delle EV e sono stati sviluppati altri metodi di isolamento, tra cui la centrifugazione a gradiente di densità del saccarosio, l'ultrafiltrazione, la precipitazione del polietilenglicole, la cromatografia e l'isolamento delle microsfere immunomagnetiche5. L'attuale collo di bottiglia che limita la traduzione clinica e la commercializzazione delle terapie con EV è la grave mancanza di tecniche di isolamento che consentano un isolamento altamente scalabile e riproducibile delle EV 6,7,8. Le tecniche tradizionali di isolamento delle vescicole extracellulari (ad esempio, l'ultracentrifugazione e la cromatografia ad esclusione dimensionale) soffrono di una bassa resa (1 x 107-1 x 108/1 x 10 6 cellule), di un lungo ciclo di produzione (24-48 ore), di una scarsa riproducibilità della qualità del prodotto e richiedono apparecchiature di produzione costose e ad alta intensità energetica che non sono in grado di soddisfare l'attuale domanda clinica di vescicole extracellulari6.
I mimici degli esosomi (EM), surrogati sintetici delle vescicole extracellulari native, hanno attirato un'attenzione importante a causa della loro struttura, funzione e scalabilità molto simili nella produzione. La principale fonte di EM proviene dall'estrusione diretta di intere cellule parentali con sezionamento continuo 9,10, dimostrando potenti funzioni biologiche come EV native11,12. Ad esempio, gli EM derivati dalle cellule staminali mesenchimali del cordone ombelicale umano (hUCMSC) esercitano effetti di guarigione delle ferite simili a quelli delle vescicole extracellulari native e sono più ricchi di composizione proteica13. Sebbene gli EM derivati da cellule intere abbiano la complessità biologica delle vescicole extracellulari, il loro principale svantaggio è l'eterogeneità dei prodotti perché sono inevitabilmente contaminati da vari organelli cellulari e detriti cellulari. L'analisi della localizzazione delle proteine ha inoltre rivelato che gli EM derivati dall'estrusione di cellule intere contengono molte proteine non specifiche per le vescicole extracellulari provenienti dai mitocondri e dal reticolo endoplasmatico13. Inoltre, la maggior parte dei metodi per la produzione di EM richiede ancora l'ultracentrifugazione, un processo che richiede molto tempo ed energia14. Considerando il fatto che gli esosomi derivano esclusivamente da endosomi cellulari, abbiamo ipotizzato che le nanovescicole derivate da endosomi bioingegnerizzati possano ricapitolare meglio l'omologia biologica tra esosomi ed EM rispetto agli EM derivati dalla membrana cellulare ben consolidati prodotti con il metodo di estrusione dell'intera cellula14. Tuttavia, la produzione di nanovescicole derivate da endosomi è difficile a causa della mancanza di approcci praticabili.
Sono stati condotti studi clinici utilizzando le vescicole extracellulari come surrogato della terapia cell-free e di un sistema di somministrazione di farmaci su scala nanometrica per il trattamento di varie malattie. Ad esempio, le vescicole extracellulari derivate da cellule staminali mesenchimali del midollo osseo sono state utilizzate per trattare la polmonite grave causata da COVID-19 e hanno ottenuto risultati promettenti. Recentemente, anche le vescicole extracellulari geneticamente modificate che trasportano le proteine CD24 hanno dimostrato potenti benefici terapeutici per il trattamento dei pazienti COVID-1915,16. Tuttavia, il requisito clinico della terapia con EV non può ancora essere soddisfatto con i metodi di isolamento tradizionali a causa della bassa resa e del basso costo. Questo studio riporta la produzione su larga scala di nanovescicole derivate dall'endosoma attraverso un approccio di omogeneizzazione ad alta velocità assistito da separazione magnetica. Sfrutta la via dell'endocitosi delle MNP per isolare gli endosomi caricati con MNP tramite separazione magnetica, seguita da omogeneizzazione ad alta velocità per formulare gli endosomi in nanovescicole monodisperse. Poiché i tipi di endosomi raccolti da questo protocollo sono diversi, sono ancora necessarie ulteriori ricerche approfondite per stabilire le buone pratiche di fabbricazione (GMP) nel settore. Questo nuovo approccio di preparazione EM è più efficiente in termini di tempo (5 minuti di omogeneizzazione ad alta velocità) per ottenere nanovescicole omologhe alle vescicole extracellulari native. Produce esponenzialmente più vescicole dalla stessa quantità di cellule rispetto all'ultracentrifugazione, che può essere generalmente applicata a vari tipi di cellule.
NOTA: Uno schema del metodo è mostrato nella Figura 1.
1. Preparazione e isolamento EM
2. Caratterizzazione EM (Figura 2 e Figura 3)
3. Rilevamento della funzione EM in vitro
Il flusso di lavoro della preparazione EM mediante omogeneizzazione ad alta velocità assistita da separazione magnetica è mostrato nella Figura 1. Le cellule internalizzano IONP modificati con polilisina da 10 nm, che sono specificamente accumulati negli endosomi tramite endocitosi (Figura 3A). Dopo essere stati trattati con tampone ipotonico e omogeneizzati, gli endosomi caricati con IONP vengono rilasciati dalle cellule e successivamente raccolti mediante separazione magnetica. Gli endosomi isolati vengono ulteriormente ricostituiti in nanovescicole monodisperse, note anche come EM, mediante omogeneizzazione ad alta velocità. Abbiamo esplorato diversi parametri chiave (ad esempio, velocità e tempo di omogeneizzazione) per identificare condizioni di preparazione EM ottimizzate (Figura 2). Infine, è stata scelta una velocità di omogeneizzazione di 140 x g per 5 minuti come condizione ottimizzata considerando la dimensione delle particelle e la resa degli EM prodotti. Gli IONP liberi e gli EM caricati con IONP vengono infine rimossi dalla soluzione del prodotto finale mediante un secondo ciclo di separazione magnetica per ottenere EM privi di IONP. Il metodo produce nanovescicole altamente uniformi e monodisperse da endosomi di cellule parentali, che condividono la stessa origine biologica delle vescicole extracellulari native.
Per confrontare le vescicole extracellulari ottenute mediante ultracentrifugazione con le EM generate con questo metodo, BMSC e 293T sono state preparate per le vescicole extracellulari e le EM. Il diametro e la morfologia degli EM sono stati analizzati mediante NTA e TEM. La morfologia delle BMSC-EM ha la caratteristica di una tipica struttura vescicolare a forma di ciotola ed è delimitata da un doppio strato lipidico (Figura 3A). Come analizzato da NTA, sia i BMSC-EM che i 293T-EM hanno un diametro idrodinamico simile a quello dei veicoli elettrici nativi (BMSC-EV e 293T-EV) (Figura 3B). Le rese di BMSC-EMs di omogeneizzazione ad alta velocità sono state di 8,16 × 10 8-1,42 × 109/1 × 10 6 cellule, e la resa delle EV native preparate mediante ultracentrifugazione è stata solo di 7,2 × 10 7-1,12 × 108/1 × 106cellule. Allo stesso modo, le rese di 293T-EMs di omogeneizzazione ad alta velocità sono state di 3,71 × 10 8-7,58 × 108/1 × 10 6 cellule, che raggiungono fino a circa 100 volte superiori a quelle delle 293T-EV native preparate con il metodo convenzionale dell'ultracentrifuga (≈5,5 × 10 6/1 × 10 6cellule) (Figura 4A).
Inoltre, i risultati del western blotting hanno mostrato che i BMSC-EM contengono gli stessi biomarcatori proteici delle vescicole extracellulari (CD63 e annessina). Sia gli EM che le EV sono negativi per l'espressione di Calnexin, suggerendo che gli EM prodotti con questo metodo non hanno quasi nessuna contaminazione della membrana plasmatica (Figura 3C). Non vi è alcuna differenza significativa nella concentrazione proteica tra EM ed EV, le BMSC-EM e le BMSC-EV hanno mostrato concentrazioni proteiche totali simili, 11,15 μg/1 × 10 9 particelle e 14,71 μg/1 ×10 9 particelle tramite il kit di analisi delle proteine BCA. Inoltre, le 293T-EM e le 293T-EV hanno mostrato concentrazioni proteiche totali rispettivamente di circa 31,8 μg/1 × 109 particelle e 9,95 μg/1 × 109 particelle (Figura 4B). Questi risultati indicano che gli EM hanno una composizione proteica simile a quella degli EV nativi. Per rilevare se gli EM possono essere endocitosi, gli EM e le EV marcati con PKH26 sono stati co-incubati con BMSC e ID8 a una concentrazione di 1 × 109 particelle/mL per 8 ore e le cellule sono state osservate al microscopio a fluorescenza confocale per confermare che gli EM potevano essere prontamente assorbiti dalle cellule per l'azione così come le EV (Figura 5).
Figura 1: Diagramma schematico del metodo di omogeneizzazione ad alta velocità assistita da magneti. Fase 1: Le cellule internalizzano gli IONP negli endosomi attraverso l'endocitosi. Fase 2: Raccogliere gli organelli, compresi gli endosomi caricati con IONP, dopo il trattamento ipotonico e l'omogeneizzazione. Fase 3: Purificare gli endosomi caricati con IONP mediante separazione magnetica. Fase 4: Gli endosomi vengono omogeneizzati e ricostituiti in nanovescicole monodisperse. Fase 5: Rimuovere gli IONP liberi e gli EM caricati con IONP mediante separazione magnetica per raccogliere gli EM privi di IONP. Fare clic qui per visualizzare una versione più grande di questa figura.
Figura 2: L'ottimizzazione delle condizioni di preparazione EM. (A) Il diametro e il PDI dei BMSC-EM in risposta alle variazioni di velocità di omogeneizzazione quando il tempo è impostato a 5 min sono stati analizzati da DLS. (B) Il diametro e il PDI dei BMSC-EM in risposta alle variazioni del tempo di omogeneizzazione quando la velocità di omogeneizzazione è impostata a 140 x g sono stati analizzati da DLS. (C) Il diametro e il PDI dei BMSC-EM in diversi punti temporali di archiviazione sono stati analizzati da DLS. (D) Il diametro e la concentrazione di BMSC-EMs in risposta alle variazioni di velocità di omogeneizzazione quando il tempo è impostato a 5 min sono stati analizzati mediante NTA. (E) Il diametro e la concentrazione di BMSC-EM in risposta alla variazione del tempo di omogeneizzazione quando la velocità di omogeneizzazione è impostata a 140 x g sono stati analizzati mediante NTA. (F) Il diametro e la resa delle BMSC-EM in risposta alla co-incubazione delle cellule BMSC con IONPs di diverse concentrazioni sono stati analizzati mediante NTA. p < 0,0001. Fare clic qui per visualizzare una versione più grande di questa figura.
Figura 3: Caratterizzazione degli EM. (A) Caratterizzazione TEM della morfologia delle cellule parentali con IONP endocitosi, endosomi ed EM. Le barre della scala rappresentano 500 nm. (B) I diametri idrodinamici di BMSC-EM, BMSC-EV, 293T-EM e 293T-EV sono caratterizzati da NTA. (C) Risultati dell'analisi Western blot di BMSC-EMs, BMSC-EVs e lisati cellulari BMSC. Fare clic qui per visualizzare una versione più grande di questa figura.
Figura 4: Il rendimento dei mercati emergenti è superiore a quello dei veicoli elettrici. (A) Il rendimento dei mercati emergenti e dei veicoli elettrici preparati da BMSC e 293T è stato analizzato mediante NTA. (B) Resa proteica di EM e EV preparati a partire da BMSC e 293T. **p < 0,01. Fare clic qui per visualizzare una versione più grande di questa figura.
Figura 5: Immagini rappresentative al microscopio a fluorescenza di EV e EM marcati con PKH26 internalizzati da BMSC e ID8. Le barre della scala rappresentano 10 μm. Fare clic qui per visualizzare una versione più grande di questa figura.
Come surrogato della terapia cell-free e di un sistema di somministrazione di farmaci su scala nanometrica, le vescicole extracellulari devono ancora soddisfare le loro aspettative cliniche e un ostacolo principale è la mancanza di metodi di produzione e purificazione scalabili e riproducibili6. Pertanto, vari tipi di EM sono stati sviluppati come analoghi delle EV con complessità biologica simile14. Ad oggi, l'esempio EM più comunemente usato sono le nanovescicole derivate dalla membrana plasmatica cellulare. La preparazione di tali nanovescicole è relativamente facile e diretta estrudendo direttamente intere cellule madri17. Tuttavia, le nanovescicole derivate dalla membrana plasmatica cellulare non possono ricapitolare le vescicole extracellulari native a causa di due inconvenienti: in primo luogo, l'origine biologica di queste nanovescicole proviene dalla membrana plasmatica cellulare, che contiene diverse composizioni lipidiche e proteiche rispetto alle vescicole extracellulari native; In secondo luogo, le contaminazioni, tra cui proteine, acidi nucleici e lipidi da organelli non EV e detriti cellulari, causano l'inevitabile eterogeneità EM. In questo metodo, abbiamo incubato cellule con IONP e raccolto endosomi caricati con IONP attraverso la separazione magnetica, quindi generato nanovescicole monodisperse tramite omogeneizzazione ad alta velocità, ottenendo infine EM privi di IONP mediante un secondo ciclo di separazione magnetica. Inoltre, abbiamo ottimizzato le condizioni di preparazione dei campi elettromagnetici esplorando l'impatto di diversi parametri, come la velocità e il tempo di omogeneizzazione, sulle dimensioni e sulla resa dei mercati emergenti. Questo protocollo sfrutta un interessante fenomeno biologico: le MNP (ad esempio, IONP a 10 nm) possono essere internalizzate in modo efficiente da quasi tutte le cellule tramite endocitosi e accumulate esclusivamente negli endosomi, non in altri organelli. Questo processo biologico unico ha permesso l'isolamento di endosomi caricati con MNP senza contaminazioni non EV tramite separazione magnetica. In cambio, le nanovescicole preparate da questi endosomi cellulari purificati potrebbero ricapitolare più fedelmente la complessità biologica delle vescicole extracellulari native.
Inoltre, lo standard aureo del metodo di isolamento delle EV è l'ultracentrifugazione, che costa terreni di coltura cellulare massicci e un lungo tempo di elaborazione di oltre 5 ore e produce solo 1 × 107-1 × 108 particelle da 1 x 10 6 cellule6. I metodi tradizionali di estrusione di cellule parentali intere comprendono più fasi che coinvolgono l'estrusione di membrane ad altissima pressione e l'ultracentrifugazione, che hanno una resa relativamente più elevata ma richiedono attrezzature costose17. Tuttavia, la resa, l'efficienza, i costi e la manodopera dei mercati emergenti sono notevolmente migliorati utilizzando il nostro protocollo. L'omogeneizzatore ad alta velocità è un'apparecchiatura comune e a basso costo per un breve tempo di elaborazione di 5 minuti in questo protocollo e questo metodo può produrre fino a 100 volte più EM da 1 × 106 celle rispetto alle vescicole extracellulari native. Tuttavia, questo metodo presenta alcune limitazioni, come la perdita di proteine endosomiali durante l'omogeneizzazione ad alta velocità, ed è stato dimostrato che le MNP endocitose dalle cellule possono essere trasferite ai lisosomi, il che costituirebbe una potenziale contaminazione18.
In prospettiva, gli EM possono essere ingegnerizzati per esercitare importanti funzioni biologiche come le loro controparti native, il che può servire come un nuovo e promettente tipo di terapia biologica. Le sostanze bioattive (ad esempio, proteine e acidi nucleici) possono essere integrate negli EM attraverso la selezione di specifiche cellule parentali (ad esempio, cellule staminali19) o modificazioni genetiche (ad esempio, proteine di fusione20). Ad esempio, le nanovescicole derivate da cellule mediante l'estrusione di cellule staminali embrionali viventi hanno un effetto positivo sul processo di recupero o di guarigione delle ferite19. La modificazione genetica è un approccio alternativo per generare EM con specifiche funzioni biologiche. Ad esempio, quando le cellule sono state trasfettate con vettori di nanocorpi del recettore del fattore di crescita antiepidermico (EGFR) fusi a peptidi segnale di ancoraggio del glicosilfosfatidilinositolo (GPI), i nanocorpi di EGFR possono essere ancorati sulla superficie delle vescicole extracellulari per colpire le cellule tumorali che esprimono EGFR20. Gli EM hanno funzionato bene come surrogato della terapia cell-free e come sistema di somministrazione di farmaci su scala nanometrica in diversi studi preclinici14, ma c'è una mancanza di una comprensione meccanicistica completa dell'EM o della terapia basata su EV con preoccupazioni sull'eterogeneità e la riproducibilità di EV e EM nelle indagini cliniche. Nel loro insieme, le funzioni biologiche degli EM e le loro implicazioni cliniche giustificano ulteriori indagini.
D.W. e P.G. sono co-inventori di una domanda di brevetto depositata dall'Istituto di Medicina di Base e Cancro (IBMC), Accademia Cinese delle Scienze. L'altro autore dichiara di non avere conflitti di interesse.
Gli autori riconoscono l'uso di strumenti presso la Shared Instrumentation Core Facility presso l'Istituto di Medicina di Base e Cancro (IBMC), Accademia Cinese delle Scienze. Questo studio è stato sostenuto dalla National Natural Science Foundation of China (NSFC; 82172598), dalla Natural Science Foundation della provincia di Zhejiang, Cina (LZ22H310001), dal 551 Health Talent Training Project della Health Commission of Zhejiang Province, Cina, dal Progetto di ricerca sullo sviluppo agricolo e sociale dell'Ufficio municipale per la scienza e la tecnologia di Hangzhou (2022ZDSJ0474) e dalla sovvenzione di ricerca interdisciplinare Qiantang.
Name | Company | Catalog Number | Comments |
Annexin antibody | ABclonal | A11235 | Western blotting |
BCA assay kit | Beyotime | P0012 | Protein concentration assay |
Calnexin | GeneTex | HL1598 | Western blotting |
CD63 antibody | ABclonal | A19023 | Western blotting |
Cell lysis buffer for Western and IP | Beyotime | P0013 | Western blotting |
Centrifuge | Beckman | Allegra X-30R | Cell centrifuge |
CO2 incubator | Thermo | Cell culture | |
Confocal laser scanning fluorescence microscopy | NIKON | A1 HD25 | Photo the fluorescence picture |
DMEM basic (1x) | GIBCO | C11995500BT | Cell culture |
Dynamic light scattering (DLS) | Malvern | Zetasizer Nano ZS ZEN3600 | Diameter analysis |
Electric glass homogenizer | SCIENTZ(Ningbo, China) | DY89-II | Low-speed homogenization |
Exosome-depleted FBS | system Bioscience | EXO-FBS-50A-1 | Cell culture |
High-speed homogenizer | SCIENTZ(Ningbo, China) | XHF-DY | High-speed homogenization |
Magnetic grate | Tuohe Electromechanical Technology (Shanghai, China) | NA | Magnetic separation |
PKH26 Red Fluorescent Cell Linker Kit for General Cell Membrane Labeling | Sigma-Aldrich | PKH26GL-1KT | The kit contains PKH26 cell linker in ethanol and Diluent C |
Polylysine-modified iron oxide nanoparticles (IONPs) | Zhongke Leiming Technology (Beijing, China) | Mag1100-10 | Cell culture |
Potassium chloride | Aladdin | 7447-40-7 | Cell hypotonic treatment |
Protease inhibitor cocktail | Beyotime | P1030 | Proteinase inhibitor |
Sodium citrate | Aladdin | 7447-40-7 | Cell hypotonic treatment |
Transmission electron microscopy (TEM) | JEOL | JEM-2100plus | Morphology image |
Ultracentrifuge | Beckman | Optima XPN-100 | Exosome centrifuge |
ZetaView nanoparticle tracking analyzers | Particle Metrix | PMX120 | Nanoparticle tracking analysis |
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