Method Article
Descriviamo un insieme di tecniche per studiare il comportamento spontaneo di nuotare liberamente pesci debolmente elettrica per un periodo prolungato di tempo, in modo sincrono i misurando temporizzazione di scarico organo elettrico dell'animale, la posizione del corpo e la postura sia preciso e affidabile in un acquario appositamente progettato all'interno di un sensoriale camera di isolamento.
Monitoraggio del comportamento a lungo termine in grado di catturare e quantificare comportamenti animali naturali, comprese quelle che si verificano di rado. Comportamenti come l'esplorazione e le interazioni sociali possono essere meglio studiate osservando sfrenato, gli animali si comportano liberamente. Pesci elettrici debolmente (WEF) di visualizzazione esplorativa facilmente osservabili e comportamenti sociali emettendo organo scarica elettrica (EOD). Qui, descriviamo tre tecniche efficaci per misurare in modo sincrono la EOD, posizione del corpo, e la postura di un WEF nuoto libero per un periodo di tempo prolungato. In primo luogo, si descrive la costruzione di un serbatoio sperimentale all'interno di una camera di isolamento progettato per bloccare fonti esterne di stimoli sensoriali come luce, suono e vibrazioni. L'acquario è stato suddiviso per ospitare quattro provini e porte automatiche controllare a distanza l'accesso degli animali per l'arena centrale. In secondo luogo, si descrive un metodo di misurazione di temporizzazione EOD in tempo reale, preciso e affidabile da banche di nuoto WEF. Distorsioni di segnale causate dai movimenti del corpo dell'animale sono corretti da media spaziale e fasi di lavorazione temporali. In terzo luogo, si descrive una configurazione subacquea di imaging nel vicino infrarosso per osservare i comportamenti degli animali notturni imperturbati. Impulsi di luce infrarossa sono stati usati per sincronizzare la temporizzazione tra il video e il segnale fisiologico per una durata di registrazione lunghi. Il nostro software di monitoraggio automatizzato di misura la posizione del corpo dell'animale e la postura in modo affidabile in una scena acquatica. In combinazione, queste tecniche consentono osservazione lungo termine del comportamento spontaneo di nuotare liberamente pesci debolmente elettrica in modo affidabile e preciso. Crediamo che il nostro metodo può essere applicato in modo simile allo studio di altri animali acquatici rapportando loro segnali fisiologici con comportamenti esplorativi o sociali.
Sfondo. Esperienze quantitative sul comportamento animale (ad esempio scelta forzata, shock evitamento, T-labirinto, ecc.) Sono tipicamente utilizzati per studiare ipotesi specifiche riguardanti le abilità senso-motorie, di apprendimento e di formazione della memoria. Tuttavia, questi esperimenti restrittive perdere gran parte della ricchezza del comportamento animale naturale e sono suscettibili di tradursi in modelli semplificate del sottostante basi neurali del comportamento. Esperimenti in condizioni più naturalistiche sono quindi un complemento importante con il quale possiamo esplorare più a fondo un repertorio comportamentale specie. Esperimenti su animali liberi di muoversi, tuttavia, devono affrontare sfide tecniche uniche come artefatti di registrazione indotti dal movimento. A differenza di risposte stimolo-evocato, che si verificano spontaneamente il comportamento esplorativo non può essere previsto; quindi soggetti sperimentali devono essere costantemente monitorati e tracciati per un periodo di tempo prolungato. Domande di ricerca specifiche can essere meglio affrontati da organismi accuratamente selezionati e gli strumenti tecnici disponibili. Ad esempio, la registrazione e la stimolazione tecniche ottiche come sensori di calcio geneticamente codificato 1 e optogenetics 2 sono state applicate con successo per muoversi liberamente organismi modello genetiche 3-5. In alternativa, sistemi di telemetria neurali miniaturizzati in grado di registrare e stimolare lo spostamento piccoli animali 6,7 liberamente.
Pesci elettrici. Specie WEF generano scariche elettriche organi (EOD), che consentono loro di percepire le loro immediate vicinanze o di comunicare su distanze maggiori. Pattern temporali di EOD variano in condizioni diverse, come auto-movimenti 8,9, stimoli sensoriali 10,11, 12,13 e le interazioni sociali. Pulse-specie tipo WEF producono un treno di impulsi discreti, a differenza delle specie di onda di tipo che generano forme d'onda quasi-sinusoidale continuo. In generale, di tipo impulsivo specie mostra more tasso variabile EOD rispetto alle specie d'onda di tipo e tassi EOD animali riflettere molto attentamente il contenuto della novità del loro ambiente sensoriali 10,14. Specie Pulse-tipo possono ridurre immediatamente l'intervallo tra impulsi (IPI) all'interno di un singolo ciclo di impulso in risposta a una perturbazione sensoriale romanzo (risposta novità 10,11,14). Il comportamento elettrico continuo di questi pesci può essere turbato da stimoli sensoriali incontrollate provenienti da fonti esterne, e diversi tipi di stimoli come vibrazione, suono, luce, e la luce sono noti risposte novità di trigger. Pertanto, speciali precauzioni devono essere adottate per bloccare o attenuare gli stimoli sensoriali esterni durante un'osservazione a lungo termine di nuotare liberamente WEF. In questo modo, variazioni della frequenza EOD e traiettorie di movimento possono essere specificamente attribuiti a stimoli presentati dallo sperimentatore.
Acquario serbatoio e camera di isolamento. Abbiamo quindi messo più strati di materiali ad assorbimento delle vibrazioni under un grande acquario (2,1 mx 2,1 mx 0,3 m), e circondato il serbatoio con un involucro isolante per bloccare le fonti esterne di luce, rumore elettrico, il suono e flusso di calore. Tasso EOD dipende dalla temperatura circostante 15,16, quindi la temperatura dell'acqua è strettamente regolata in un intervallo tropicale (25 ± 1 ° C) per le specie Sudamericana WEF. Abbiamo costruito un ampio e poco profondo (10 cm Profondità acqua) serbatoio per osservare i comportamenti esplorativi spaziali del WEF principalmente ristrette in due dimensioni (Figura 1A). Il serbatoio è stato ripartito in un'arena centrale di osservare i comportamenti spaziali, e quattro scomparti d'angolo per ospitare separatamente singoli pesci (Figura 1B). Ogni scompartimento è stato costruito a tenuta stagna per impedire la comunicazione elettrica tra gli individui. Accesso animali all'arena centrale è stato controllato dall'esterno da quattro porte motorizzate. I cancelli sono stati collocati tra i compartimenti, e divennero stagna quando è bloccatoda nylon ala-noci. L'assenza di parti metalliche sono stati usati sott'acqua dal WEF reagiscono sensibilmente ai metalli.
Registrazione EOD. EOD vengono generati in maniera stereotipata per l'attivazione di un singolo (in Mormiridi) o più organi elettrici spazialmente distribuiti (in Gymnotiforms) 17,18. Modulazioni temporali del tasso di EOD possono rivelare attività neurali di livello superiore, dal momento che il pacemaker midollare riceve gli input neurali diretti da regioni cerebrali superiori, come il nucleo prepacemaker diencefalica, che a sua volta riceve le proiezioni assonale dal prosencefalo 19. Tuttavia, i tempi EOD deve essere accuratamente estratta da una registrazione della forma d'onda prima e non polarizzato da distorsioni indotti dal movimento dell'animale. Il campo elettrico generato da un WEF può essere approssimato come un dipolo; quindi EOD ampiezze di impulso a elettrodi di registrazione dipendono dalle distanze relative e orientamenti tra l'animale e gli elettrodi 8,20. Self-movem di Animalgenitori cambiano la geometria relativa tra l'animale e gli elettrodi, così spostamenti causano le ampiezze EOD a diversi elettrodi a variare nel tempo in modo volatile (vedere la Figura 2B Giu et al. 8). Inoltre, l'auto-movimenti cambiano anche la forma delle forme d'onda registrate EOD, perché i contributi relativi da diverso insieme di organi elettrici dipendono dalle loro posizioni lungo la lunghezza del corpo e le loro curvature locali introdotta dalla coda flessione. Le distorsioni indotti dal movimento delle ampiezze e forme EOD possono portare a misure temporanee EOD imprecise e inaffidabili. Abbiamo superato questi problemi spazialmente media di forme d'onda multiple EOD registrate in luoghi diversi, e con l'aggiunta di un filtro di estrazione busta di determinare con precisione la tempistica EOD da un WEF nuotare liberamente. Inoltre, la nostra tecnica misura le ampiezze EOD, che indicano se un animale è a riposo o in movimento attivamente in base alla variazione della EODampiezze nel tempo (vedi figure 2E e 2F). Abbiamo registrato segnali differenziale amplificati dalle coppie di elettrodi di registrazione per ridurre il rumore di modo comune. Poiché gli impulsi EOD vengono generati a intervalli di tempo irregolari, l'evento time-series EOD hanno una frequenza di campionamento variabile. La serie temporale EOD può essere convertito in una frequenza di campionamento costante mediante interpolazione se richiesto da uno strumento analitico di scelta.
La registrazione del video. Sebbene la registrazione EOD può monitorare un'attività movimento lordo di un animale, registrazione video consente misurazioni dirette della posizione del corpo di un animale e la postura. Vicino infrarosso (NIR) illuminazione (λ = 800 ~ 900 nm) consente l'osservazione visiva imperturbabile di nuotare liberamente pesci 21,22, dal momento che WEFs sono più attivi nelle tenebre ei loro occhi non sono sensibili alle NIR dello spettro 23,24. La maggior parte dei sensori di immagini digitali (ad esempio, CMOS o CCD) in grado di acquisire spettro NIR con il wavelengtgamma h tra 800-900 nm, dopo aver rimosso una connessione a infrarossi (IR) bloccando il filtro 25. Alcuni webcam consumer di fascia alta offrono alta definizione, ampio angolo di visualizzazione e una buona sensibilità low-light, che può produrre una qualità d'immagine paragonabile o superiore al livello professionale telecamere IR disponibili a costi molto maggiori. Inoltre, alcune webcam consumer-grade sono in bundle con software di registrazione che permette una durata di registrazione esteso da comprimere il video senza perdita di qualità. La maggior parte delle fotocamere di livello professionale offrono sincronizzazione TTL uscite impulsi di tempo o ingressi impulsi TTL grilletto 26 per allineare i tempi tra il video con i segnali digitalizzati, ma questa caratteristica è generalmente assente in webcam consumer-grade. Tuttavia, i tempi tra una registrazione video e un digitalizzatore segnale può essere abbinato con precisione da concomitanza acquisizione di un IR periodicamente LED lampeggiante con la fotocamera e il digitalizzatore segnale. La sincronizzazione degli impulsi IR iniziale e finale può essere utilizzato uns due marcatori di calibrazione di tempo per convertire i numeri di fotogramma video l'unità di tempo segnale digitizer e viceversa.
Lighting & background. Cattura di immagini attraverso l'acqua può essere tecnicamente impegnativo a causa dei riflessi della luce sulla superficie dell'acqua. La superficie dell'acqua può agire come uno specchio per riflettere una scena visiva sopra l'acqua, e caratteristiche visive oscure subacqueo; quindi la scena di sopra dell'acqua deve essere reso featureless per evitare interferenza visiva. Per l'intera immagine acquario, una telecamera deve essere posizionato direttamente sopra l'acqua, e dovrebbe essere nascosto dietro il soffitto sopra un piccolo foro visualizzazione per impedire la sua riflessione sulla superficie dell'acqua. Inoltre, la superficie dell'acqua può produrre riflessi e illuminazione non uniforme se le sorgenti luminose sono proiettati in modo errato. Illuminazione indiretta può ottenere una luminosità uniforme su tutta acquario puntando le fonti di luce verso il soffitto, in modo tale che il soffitto e il wal circostantels può riflettere e diffondere i raggi di luce prima di raggiungere la superficie dell'acqua. Scegliere un illuminatore IR che corrisponde a una risposta spettrale della fotocamera (ad esempio 850 nm di lunghezza d'onda di picco). Il rumore elettrico dalle fonti di luce può essere minimizzato utilizzando luci a LED e piazzare i loro alimentatori in corrente continua al di fuori della gabbia di Faraday. Posizionare uno sfondo bianco sotto il serbatoio, dal pesce contrasta bene in uno sfondo bianco a lunghezze d'onda NIR. Analogamente, l'uso di colore bianco opaco sulle superfici interne della camera di isolamento fornisce uniforme e luminoso retroilluminazione.
Monitoraggio video. Dopo una registrazione video, un algoritmo di inseguimento automatico immagine può misurare posizioni e posture del corpo dell'animale nel tempo. Il monitoraggio video può essere eseguita automaticamente da una software pronto per l'uso (Viewpoint o Ethovision), o il software programmabile dall'utente (OpenCV o MATLAB Processing Toolbox Image). Come primo passo di inseguimento immagine,un'area inseguimento valido deve essere definito disegnando una forma geometrica di escludere l'area esterna (funzionamento mascheratura). Successivamente, l'immagine di un animale deve essere isolato dal contesto sottraendo un'immagine di sfondo da un'immagine contenente l'animale. L'immagine sottratta viene convertito in un formato binario applicando una soglia di intensità, in modo tale che il baricentro e l'asse di orientamento possono essere calcolate dalle operazioni morfologiche binarie. In Gymnotiforms 27-29 e 30-32 Mormiridi, la densità electroreceptor è il più alto vicino alla regione della testa, quindi la posizione della testa in qualsiasi momento, indica una posizione di massima acutezza sensoriale. Le posizioni di testa e di coda possono essere determinate automaticamente applicando le operazioni di rotazione dell'immagine e del riquadro di delimitazione. Le estremità di testa e di coda possono essere distinti l'uno dall'altro da essi definendo manualmente nel primo frame, e tenendo traccia delle rispettive posizioni dal confronto di due quadri successivi.
Questa procedura è conforme ai requisiti della Università di Ottawa Comitato Animal Care. Nessun conflitto di interessi è dichiarato. Si prega di fare riferimento alla Tabella dei Materiali e reagenti per le marche e modelli di attrezzature e materiali elencati di seguito. Sono forniti scritte personalizzate Spike2 e MATLAB script e dati di esempio nel file supplementare.
1. Acquario serbatoio e isolamento Camera Setup
2. EOD inseguimento
3. Sincronizzata Monitoraggio Video
Monitoraggio dei risultati EOD
Le forme d'onda EOD registrate da diverse coppie di elettrodi varia in ampiezze e forme come previsto dalle loro posizioni uniche e orientamenti (Figura 2C alto). L'uso di più coppie di elettrodi assicurata forte ricezione del segnale a tutte le possibili posizioni e orientamenti del WEF all'interno del serbatoio. La forma d'onda busta (Figura 2C sotto, tracce verde) conteneva sempre un unico picco per ciclo EOD, che serviva come un marcatore tempo affidabile per determinare con precisione gli intervalli tra impulsi e il tasso di EOD istantanea (IPI = -1). I picchi EOD successivi sono state riunite e interpolati linearmente ad intervalli di tempo costanti (Figura 2D migliori, traccia nera), e il tasso di EOD istantanea è stata simile interpolati a intervalli di tempo costanti (in basso figura 2D, traccia rosa). La procedura di ricampionamento costante di tempo facilita la sincronizzazione dell'ora siainterpolare la traiettoria di movimento e il segnale EOD, e permette di sfruttare da un maggior numero di strumenti analitici per dati in serie temporale costante nel campione. Le ampiezze EOD registrati a elettrodi esterni rimasto costante mentre un animale è a riposo (Figura 2E top), ma varia nel tempo mentre l'animale spostato a causa del cambio di posizione e orientamento dipolo (Figura 2F alto). Così, il movimento pesce potrebbe dedurre osservando la variazione delle ampiezze EOD nel tempo. Il tasso di EOD di base è rimasto basso durante pesce era a riposo (Figura 2E in basso), ma il tasso di EOD è diventato significativamente più alto, mentre il pesce nuotava attivamente (Figura 2F alto). La nostra osservazione è coerente con la correlazione positiva tra il tasso EOD e il movimento pesce come precedentemente riportato 8,9,34,35.
Risultati di monitoraggio video
Traiettoria e mediane dell'animale sono mostrati in Fig. ure 3E con il primo e l'ultimo fotogramma di immagine sovrapposti. Il tempo-corso di cambiamento della postura è stato catturato mentre il pesce è stato bruscamente girando per due secondi, e le linee mediane di pesce vengono tracciate ogni 200 msec. La linea mediana pesce avviato correttamente alla testa-punta e terminato alla punta della coda dei pesci. Le immagini di pesce strettamente concordati con le linee mediane cingolati automaticamente nonostante le ombre fuse dall'animale. Figura 3F illustra il tasso variabile nel tempo medio di EOD (τ = 0,0625 sec) di colore, che si sovrappone con la traiettoria in tempo abbinato della testa di pesce -tip. Durante la durata di svolta 2 sec, il tasso medio EOD raggiunto il suo picco mentre l'animale era nel mezzo della fase di tornitura, e il tasso diminuita verso la fine della rotazione. Questo risultato rappresentante dimostra che il nostro metodo può essere applicato con successo per studiare la relazione tra i movimenti autoguidati e la modulazione tasso EOD durante nuotare liberamente.
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Figura 2. Impostazione della registrazione EOD e risultati rappresentativi. A) Il pannello di sinistra mostra l'assemblaggio di elettrodo costituito da un elettrodo sottile di grafite, un breve segmento di cavo coassiale, e un BNC Jack. Il pannello di destra mostra elettrodi istruzioni di fissaggio. Nastro adesivo è utilizzato per posizionare temporaneamente il gruppo elettrodi, e calafataggio silicone è stato applicato a tenere permanentemente l'elettrodo. B) Lo schema elettrico. Due elettrodi 90 ° orientati sono appaiati, differenziale amplificato e filtrato. Quattro canali di registrazione sono stati digitalizzati di fuori del Faraday cetà. C) Illustrazione delle fasi di elaborazione del segnale EOD. Le prime tracce mostrano le forme d'onda prime provenienti da quattro coppie di elettrodi, che vengono rettificati e sommate per produrre la traccia grigia sotto. Buste unimodali sono estratti dalla forma d'onda grigia con il "root-mean-Square" (RMS) Filtro (traccia verde). Le ampiezze EOD e IPI sono determinati dalle vette busta. D) Le variabili nel tempo EOD ampiezze (in alto) e il tasso di EOD istantanea (in basso) sono riportati su una scala temporale più lungo di C). Le ampiezze EOD ed il tasso istantaneo (IPI = -1) sono interpolati a intervalli di tempo regolari unendo i picchi busta (tracce nere). E) Uguale D), ma tracciati su una scala temporale più lungo, mentre pesce era a riposo. F) Stessa E), mentre i pesci attivamente nuotando. Clicca qui per vedere l'immagine ingrandita .
Figura 3. Impostazione del monitoraggio video e risultati rappresentativi. A) L'installazione di illuminazione e la fotocamera è illustrato. Il infrarossi (IR) e sorgenti di luce visibile sono attaccati alle pareti e puntati verso il soffitto, in modo tale che la superficie del soffitto riflette e diffonde la luce per proiettare un'illuminazione uniforme su tutta la vasca. La telecamera è nascosta sopra il pannello del soffitto per impedire la riflessione sulla superficie dell'acqua. Un LED IR è posizionato in uno dei quattro angoli del serbatoio per generare impulsi di sincronizzazione di tempo. B) di generazione di immagine di sfondo un composito è illustrato. Due cornici immagine (immagini in alto) sono combinati per formare l'immagine di sfondo composito (in basso a sinistra) sostituendo la regione contenente l'animale (cosìCoperchio quadrato rosso) con la regione, senza l'animale (tratteggiata quadrato rosso). Area di fuori dell'arena centrale è mascherato in nero (in basso a destra). C) Isolare il contorno di pesce. Una cornice immagine (in alto a sinistra) viene sottratta dalla immagine di sfondo (in alto a destra) per produrre l'immagine differenza (in basso a sinistra), e convertito l'immagine binaria (in basso a destra) applicando una soglia di intensità. D) Misura della posizione del corpo e la postura sono illustrati. L'immagine binaria dell'animale (blob) è stata ruotata per allineare l'asse maggiore con l'asse x (in alto a destra), e centrato al suo baricentro. Il blob stato separato alla testa (rosso) e coda (blu) parti, e ciascuna parte è stata ruotata separatamente per determinare la sua riquadro di delimitazione. Il blob è stato orientato al telaio dell'animale di riferimento (in basso a sinistra), e cinque punti caratteristici (head-end, mid-testa, metà corpo, metà-tail, coda-end) sono stati determinati dai punti medi del riquadro di delimitazione bordi. E) Time-lapse iml'età delle linee mediane di pesce tracciati ogni 200 msec. Il primo e l'ultimo fotogramma di immagine sono sovrapposte durante la durata di svolta 2 sec. F) Il tasso medio EOD è rappresentato in pseudo-colori e sovrapposto con la traiettoria della testa di pesce. Le stesse immagini sono utilizzate come in E). Clicca qui per vedere l'immagine ingrandita .
Importanza delle nostre tecniche. In sintesi, abbiamo prima descritto la costruzione di un grande acquario e una camera di isolamento per osservare i comportamenti esplorativi spontanee prodotte dal WEF. Successivamente, abbiamo dimostrato la tecnica di registrazione e il monitoraggio del tasso di EOD e gli stati di movimento dal pesce sfrenato in tempo reale utilizzando più coppie di elettrodi. Infine, abbiamo descritto la tecnica dell'infrarosso registrazione video attraverso l'acqua in modo sincronizzato tempo, e l'algoritmo di inseguimento immagine per misurare la posizione del corpo e la postura. Come una preparazione sperimentale, WEF offre un vantaggio importante per lo studio dei comportamenti sensoriali guidati attivi dimostrando tasso EOD facilmente quantificabili, che equivale alla frequenza di campionamento electrosensory attiva. La combinazione di queste tecniche può consentire l'osservazione preciso e affidabile a lungo termine 8 di comportamenti spontanei di sfrenato WEF. Inoltre, la maggioranza del nostro setup può essere costruito from ampiamente disponibili materiali da costruzione e componenti elettronici facilmente ottenibili. Le tecniche descritte qui sono stati sviluppati e testati per soddisfare le nostre esigenze sperimentali negli ultimi anni. Pertanto, si consiglia queste tecniche per gli studi futuri di comportamenti esplorativi spontanee di nuotare liberamente WEF.
Camera di isolamento. La camera di isolamento prevede condizioni sperimentali ben controllate bloccando fonti esterne di luce, vibrazione, suono e rumore elettrico con diversi gradi di efficacia. La performance luce blocco è stato testato posizionando una telecamera motorizzata all'interno della camera di isolamento buio, e nessuna perdita di luce esterna è stata osservata dalla fotocamera dopo la scansione ubicazione utilizzando il controllo remoto pan. La superficie di smorzamento delle vibrazioni installato sotto l'attenuazione serbatoio fornito dalle vibrazioni esterne canalizzati dal pavimento, e la sovrapposizione di più strati di gomma e schiuma era efficace per bloccare la maggior parteeventi vibrazioni esterne. Tuttavia, gli eventi vibrazioni intermittenti come la chiusura della porta rumoroso di località vicine, hanno fatto scatenare reazioni novità in rare occasioni. Anche se una tabella di aria anti-vibrazione potrebbe fornire prestazioni di isolamento superiore da vibrazioni di fondo, sarebbe proibitivo per l'acquisto di un tavolo di aria abbastanza grande per il nostro acquario. Pertanto, abbiamo messo un sottomarino idrofono per individuare ed escludere gli eventi quando grandi vibrazioni esterne attivate risposte novità. Per ridurre ulteriormente l'influenza del rumore esterno del laboratorio, i nostri esperimenti sono stati condotti durante le ore di punta (dopo le 18:00). Allo stesso modo, il rumore acustico per via aerea esterna è stata attenuata attraverso le pareti della camera di isolamento riempiti con isolamento in fibra di vetro batte. Anche se non abbiamo oggettivamente quantificare le prestazioni di attenuazione del suono, la maggior parte del suono di sottofondo in un ambiente di laboratorio non ha innescato le risposte novità. In rare occasioni, un suono forte improvviso dal grilletto esternoEd una risposta novità, ma un evento del genere è stato rilevato dalla registrazione idrofono, e raramente si è verificato durante le ore di punta. L'acquario ha fornito sufficientemente grande area per i nostri animali di nuotare liberamente ed esplorare. La dimensione del serbatoio è stato scelto in proporzione alla lunghezza di specie abbiamo usato (fino a 30 cm), ma la dimensione del serbatoio può essere ridotta se sono stati usati animali più piccoli. Abbiamo scelto gimnoto sp. tra le diverse specie di impulso-tipo per le loro grandi dimensioni del cranio per facilitare le registrazioni elettrofisiologiche durante privo di nuoto 36. La qualità di registrazione elettrica può migliorare l'utilizzo più costosi maglie rame, e schermatura del ventilatore di scarico utilizzato per il controllo dell'umidità.
Tecnica di misura EOD. La nostra tecnica di registrazione EOD multi-canale permesso misurazione tempi EOD preciso e affidabile dal nuoto libero pesce. Usando la nostra tecnica, tutti gli impulsi generati EOD nuotando liberamente WEF sono stati rilevati senza perdere o l'aggiunta di un peccatoGLE impulso per una durata di registrazione lungo di sei ore (vedere Figura 12 giugno et al. 8). Le misure di registrazione EOD non solo il tasso EOD, ma anche il livello di attività del tempo variabile EOD ampiezze di picco registrati a elettrodi esterni. Le ampiezze EOD registrati sono determinate dalla geometria relativa tra gli elettrodi di registrazione di un animale e, quindi movimenti degli animali inducono variazioni delle ampiezze EOD (Figura 2F). Il livello di attività è stata calcolata dalla variabilità (RMS) della ampiezza pendenza EOD all'interno di una finestra mobile (0,5 sec). Usando questo metodo, la registrazione video non sarebbe necessaria per misurare il livello di attività per un lungo periodo di tempo, e la registrazione EOD solo può essere sufficiente. Invece di utilizzare una registrazione video, la posizione del corpo e la postura del WEF possono essere dedotte dalla registrazione EOD solo sulla base delle posizioni degli elettrodi, la geometria di un serbatoio, e un modello teorico di un dipolo corrente. Utilizzando un recordi simileinstallazione ng, Jun et al. 20 hanno proposto un metodo di monitoraggio elettrico in tempo reale per il monitoraggio di più WEFs in presenza di un oggetto, che mette a confronto intensità del segnale misurato ai più coppie di elettrodi di registrazione con le voci della tabella di ricerca contenenti intensità di segnale previsti in note località dipolo attuali. Il metodo di monitoraggio elettrico offre maggiore affidabilità di monitoraggio in un ambiente visivamente ingombra in cui gli animali vengono spesso ostruite dalla vista, o durante il monitoraggio di più animali. Habitat naturalistici del WEF contengono molti ostacoli visivi come piante acquatiche e radici, in cui il metodo di tracciamento elettrico potrebbe fornire monitoraggio più affidabile con i requisiti di installazione semplici di tracking visivo. In linea di principio, il nostro metodo è direttamente applicabile alla specie WEF onda di tipo dopo il cambio costanti di tempo del filtro. Il passo rettifica introdurrà due modi per ciclo EOD, dal momento che la forma d'onda EOD è approssimativamente sinusoidale in specie onda tipo. In questo caso, Il tasso di EOD istantanea può essere determinato saltando tutti gli altri marcatori di tempo EOD di ignorare la fase EOD negativo. WEF in grado di rilevare gli elettrodi di registrazione quando nuotano nelle vicinanze quindi abbiamo evitato di utilizzare grandi o metallici elettrodi che possono essere sentite da più lontano 37, e invece utilizzati elettrodi di grafite sottile (2 mm di diametro). Cavi coassiali sottili (RG-174) sono stati utilizzati con i gruppi di elettrodi per la flessibilità, ma cavi coassiali spessi (RG-54) sono stati utilizzati per il cablaggio su lunghe distanze per schermatura elettrica superiore. Tolto durata della registrazione EOD può essere raggiunto abbassando la frequenza di campionamento, ma con una risoluzione temporale inferiore come un trade-off. La media e la variabilità del tasso EOD varia tra le specie, così la finestra di tempo per il livellamento del tasso EOD istantanea deve essere regolato in modo appropriato. Una finestra di tempo più breve è raccomandato per specie aventi medio più breve e più piccola variabilità nel IPI (es Gymnotiforms), e un tempo più lungo window è raccomandato per le specie che hanno più media e più alta variabilità nella IPI (ad es Mormiridi).
Illuminazione e configurazione della telecamera. Registrazioni video forniscono osservazioni comportamentali quantitativi e qualitativi, e qui abbiamo descritto le modalità di costituzione, la registrazione e l'elaborazione dei dati di immagine. Installazione illuminazione gioca un ruolo importante nella produzione di immagini di alta qualità, e l'angolo di proiezione della luce è un fattore importante per l'imaging animali sottomarini. In condizioni di luce non ottimali, la superficie dell'acqua può formare riflessi e riflessioni, che possono interferire con l'inseguimento immagine soprattutto quando gli animali generano onde di superficie. I problemi dovuti ai riflessi possono essere eliminati proiettando sorgenti luminose dal fondo di una vasca. Per un piccolo serbatoio, matrici di LED possono essere posizionati direttamente sotto il serbatoio e brillano attraverso un pannello diffusore per generare l'intensità della luce uniforme 38. Allo stesso modo per un serbatoio più grande, una sorgente di luce cun essere posizionato sotto il serbatoio, e l'intensità della luce uniforme può essere realizzato consentendo distanza sufficiente per diffondere luce 39. Nella nostra impostazione, siamo stati costretti a proiettare la luce da sopra il serbatoio a causa di vincoli di spazio, stabilità strutturale, e il posizionamento di riscaldamento sotto il serbatoio. Abbiamo evitato i problemi di abbagliamento e di riflessione, utilizzando l'illuminazione indiretta, in modo tale che le sorgenti luminose sono state proiettate verso il soffitto. Rendendo la parte superiore della camera bianca informe e opaco, senza riflessi erano visibili sulla superficie dell'acqua. Per l'immagine tutta l'arena centrale, un obiettivo grandangolare può essere montato sulla fotocamera, ma alcuni obiettivi (lente fish-eye) possono causare una significativa distorsione a barilotto. La distorsione a barilotto può essere corretto utilizzando un foglio griglia di calibrazione sotto il serbatoio per misurare le coordinate di pixel dei punti della griglia visualizzate al centro del serbatoio. Insieme con i punti della griglia corrispondenti in centimetri, una matrice di trasformazione può essere calcolato per correct la distorsione a barilotto 40. Si consiglia di telecamere ad alta risoluzione se la dimensione animale è molto più piccola della dimensione del serbatoio, in modo che un numero sufficiente di pixel può essere ottenuto dall'animale per misurare correttamente la sua postura.
Monitoraggio Immagine e sincronizzazione del tempo. L'algoritmo di inseguimento immagine qui descritto fa uso dell'operazione regione di interesse (ROI) per misurare rapidamente la posizione del corpo e la postura. L'operazione ROI riduce la dimensione dell'immagine da elaborare, e limita la gamma di inseguimento vicino alla posizione animale dal fotogramma precedente. Abbiamo estratto la postura del corpo (linea mediana) utilizzando la rotazione delle immagini e le operazioni di delimitazione-box anziché l'operazione di immagine scheletrizzazione al solito, che a volte non è riuscito a produrre una singola linea mediana ben definito. Cornice dell'animale di riferimento è situato al centro del riquadro di delimitazione testa, che consente l'analisi del comportamento egocentrico. La principale fonte di errore nella tracki immagineng è dovuto all'effetto ottico di proiezione a grandangolo. Idealmente, i movimenti verticali di animali non dovrebbero influenzare la misurazione della posizione in 2D, ma il più lontano dall'asse di imaging centrali, la maggior parte della dimensione verticale è proiettata alla fotocamera. La rifrazione sulla superficie dell'acqua ha ridotto l'effetto ottico di proiezione del 28% nel nostro setup di imaging (altezza fotocamera = 1.8 m, profondità = 10 cm, raggio serbatoio = 75 cm), e il peggiore errore di posizione era ± 1,4 centimetri alla circolare recinzione. La tempistica tra la EOD e registrazioni video sono stati sincronizzati utilizzando impulsi LED infrarossi per spiegare la deriva di tempo tra il video e gli orologi di digitalizzazione del segnale, e diversi tempi di avvio della registrazione. L'incertezza previsto nella sincronizzazione tra il video e registrazioni EOD è proporzionale all'intervallo di cattura della trama, ad esempio, 15 fotogrammi al secondo (fps) Frame Rate cattura comporterà l'allineamento incertezza tempo di ± 33 msec. Tale grado di time precisione è sufficiente per tracciare i pesci in movimento lento, ma una telecamera ad alta velocità può essere richiesto per il monitoraggio rapido animali in movimento. Si consiglia brillante intensità della luce con un aumento del frame rate, dal momento che il tempo di esposizione del sensore è inversamente proporzionale alla frequenza dei fotogrammi.
Lavoro futuro. Interazioni sociali tra più WEFs possono essere studiate tenendo traccia dei loro segnali EOD e le posizioni del corpo, e il sistema di tracciamento deve associare correttamente il EOD l'ubicazione dello stesso individuo. Secondo il metodo di localizzazione dipolo descritto da giugno et al. Un 20 con configurazione simile, le posizioni degli animali desunti dai loro segnali EOD ricevuti elettrodi multipli possono essere abbinati all'uscita tracciamento visivo per identificare correttamente gli impulsi EOD da diversi individui. Monitoraggio Immagine di molteplici animali può essere effettuata una sola persona alla volta utilizzando l'operazione di ROI. Un ROI può essere inizialmente definito attorno a un individuo diessere rintracciato, e il ROI sarà riposizionato in ogni fotogramma con il corpo una posizione aggiornata. Gli altri pesci saranno esclusi dall'analisi inseguimento immagine quando appare al di fuori del ROI, e se è apparso dentro, l'immagine di altri pesci possono essere rimossi automaticamente controllando se la sua immagine tocca il confine ROI. A volte, due animali contattarsi e le loro immagini fondono, e se così, una maschera possono essere disegnati manualmente per separare l'immagine dell'altro pesce. Un altro lavoro interessante futuro è il video tracking tridimensionale per rivelare le sequenze complesse di movimento durante la cattura prede 22 o interazioni sociali. MacIver et al. 22 usato due telecamere per visualizzare un acquario rettangolare dalla parte superiore e la parte per ricostruire un modello di corpo tridimensionale. Tuttavia, questo approccio non funzionerebbe nel nostro caso, poiché ci sono pareti divisorie che bloccano viste laterali e l'acquario ha molto larghezza maggiore profondità. Invece, sarebbe più appliCavo di installare più telecamere sul soffitto in prospettiva diversa angoli simile a quella di installazione utilizzato da Hedrick 41. Per maggiore precisione, l'effetto di rifrazione introdotto dall'acqua e l'angolo della telecamera obliquo dovrebbe essere corretta calibrando immagini in tre dimensioni. Il nostro metodo di monitoraggio visivo potrebbe essere applicato per studiare il flusso elettrico immagine sulla superficie del corpo di pesce 42,43 quando il pesce nuota vicino un oggetto. Come studiato da Hofmann et al. 26, sarebbe interessante indagare flusso elettrico l'immagine dell'oggetto durante il nuoto libero in funzione della distanza dell'oggetto, forma, dimensione e materiale. In definitiva, i nostri metodi combinati con le registrazioni neurali dal nuoto liberamente pesce 44-46 possono rivelare nuove intuizioni da osservazioni di cambiamenti nell'attività neuronale e il tasso EOD mentre il pesce si impegna in esplorazione oggetto o interazioni sociali.
Gli autori non hanno nulla da rivelare.
Questo lavoro è stato generosamente sostenuto dalle scienze naturali e ingegneria Research Council del Canada (NSERC) e Canadian Institutes of Health Research (CIHR).
Name | Company | Catalog Number | Comments |
Aquarium Construction | |||
Electrically shielded floor heater | ThermoSoft Corp., IL, USA | ThermoTile | www.thermosoft.com |
Tempered glass panel | generic | 0.5 in thick, used for the aquarium construction | |
Aquarium grade silicone | generic | ||
Acrylic sheet | generic | 0.25 in thick, matte white | |
Natural rubber sheet | generic | 0.25 in thick | |
Servomotor | HTECHRCD Inc., Korea | HS-325HB, 180deg rotation | www.servocity.com |
Servomotor arm mount | HITECHRCD Inc., Korea | 56362 Large Spline | www.servocity.com |
Servomotor controller (6 channels) | Sparkfun | ROB-09664 | Micro Maestro 6-channel USB Servo Controller |
Active USB extension cable | C2G | 38990 | 12 m USB 2.0 A Male to A Female 4-Port Active Extension Cable |
Exhaust fan | Nutone | ILFK120 | www.homedepot.com |
Vertical aquarium filter | Tetra, Germany | Whisper Internal Power Filter - 40i | |
Crushed coral | Used to increase the pH of the tank water | ||
EOD Recording Setup | |||
Graphite Electrodes | Staedtler, Germany | Mars Carbon 2-mm type HB | Shave the outer coating |
Physiological Amplifier/Filter | Intronix, Canada | 2015F | |
Coaxial Cable | generic | RG174 | For electrodes assembly |
Coaxial Cable | generic | RG54 | For wiring use |
BNC jack connector for RG-174 | Amphenol Connex | 112160 | For electrodes assembly |
BNC plug connector for RG-54 | Amphenol Connex | 112116 | For wiring use |
Signal digitizer hardware | Cambridge Electronic Design, UK | Power MKII 1401 | |
Signal digitizer software | Cambridge Electronic Design, UK | Spike 2. ver 7 | |
Visual Tracking Setup | |||
White LED light | IKEA, Sweden | DIODER 201.194.18 | www.ikea.com |
Infrared LED light (850 nm) | Scene Electronics, China | S8100-60-B/C-IR | Remove built-in fan |
USB webcam | Logitech Inc., CA, USA | C910 | Remove Infrared blocking filter |
Motorized camera | Logitech Inc., CA, USA | Quickcam Orbit | Remove Infrared blocking filter |
Video recording software | Logitech Inc., CA, USA | Logitech Quickcam Software | Download from www.logitech.com |
MATLAB | Mathworks, MA, USA | 2012a | Image processing toolbox |
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