במבחנה מיפוי כימי של מבני DNA G-Quadruplex על ידי bis-3-chloropiperidines

G-quadruplex הם מבנים משניים של חומצות גרעין שנוצרו בדרך כלל בתוך רצפי DNA עשירים בגואנין. המיפוי הכימי של G4 על ידי B-CePs מכוון לאפיון חוץ גופי של G4, ומאפשר זיהוי של הגואנינים הספציפיים המרכיבים את הטטרדות G. הזיהוי והאימות הניסיוני של G4s בתוך רצפים פוטנציאליים של יצירת G-quadruplex הוא נושא רלוונטי מבחינה ביולוגית, אשר מטופל כיום בעיקר באמצעות כלים חישוביים.

כדי לתמוך בתחזיות כאלה ולזהות את G4 הבלתי צפוי, מיפוי כימי על ידי B-CePs מייצג שיטה נגישה לזיהוי G4 ברצפי DNA. המיפוי הכימי על ידי B-CePs הוא חלופה נוחה לפרוטוקול טביעת הרגל הדימתיל סולפט הנפוץ לאפיון G-quadruplex. היתרון העיקרי של B-CePs הוא שהוא מפחית את מספר השלבים בפרוטוקול והוא מפחית את הכמות הראשונית של מצע ה- DNA.

המיפוי הכימי של B-CePs מתואר כאן עם רצף TBA כהוכחת היתכנות. הפרוטוקול יוביל לניסויים חדשים החלים על כל רצף פוטנציאלי אחר ליצירת G-quadruplex, שיחקרו הן את מבני הדנ"א והן את מבני הרנ"א.