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Biology

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Nanyang Technological University

Divergence du microbiote racinaire dans différents habitats sur la base de réseaux de corrélation pondérés

Transcription

L’analyse du réseau a été appliquée pour évaluer l’association de diverses communautés microbiennes écologiques, telles que le sol, l’eau et la rhizosphère. Présenté ici est un protocole sur la façon d’utiliser l’algorithme WGCNA pour analyser différents réseaux de co-occurrence qui peuvent se produire dans les communautés microbiennes en raison de différents environnements écologiques.

Chapitres dans cette vidéo

0:06

Introduction

0:46

I. Data Download

1:05

II. Optimal Power Value Determination

2:38

III. Construction of a Co-Expression Network and Module Identification

4:25

IV. Preservation Test

5:44

V. Correlation Analysis of the Module Membership

6:55

VI. Analysis of the Microbial Flora in the Microbial Differential Network Module

7:43

Resuts: Analysis of Differences in Rice delavayi Root Microbial Communities Based on Weighted Co‐Expression Network

9:18

Conclusion

Vidéos Associées

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