JoVE Journal

Environment

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Isolement et analyse des communautés microbiennes dans le sol, rhizosphère et racines dans des expériences de graminée vivace

Excavation des racines des plantes sur le terrain, ainsi que traitement d’échantillons dans la rhizosphère, endosphère et le sol sont décrites en détail, y compris les méthodes d’analyse de données et extraction de l’ADN. Cet article est conçu pour permettre aux autres laboratoires d’utiliser ces techniques pour l’étude du sol, endosphère et rhizosphère microbiomes.

Chapitres dans cette vidéo

0:04

Title

0:36

Plant Excavation, Soil Removal, and Bulk Soil Collection

1:46

Root and Rhizosphere Collection

2:44

Root Surface Sterilization

3:54

Processing Rhizosphere Samples

5:02

DNA Extraction and Soil Analysis Processing

6:33

DNA Extraction in 96-well Format

7:45

Rhizosphere Sample Loading

8:47

Results: Visualization and Statistical Methods Highlight Differences in Microbial Community Composition and Diversity Between Sample Types and Grass Species

10:03

Conclusion

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