JoVE Journal

Bioengineering

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Nanyang Technological University

Quantification de l’organisation du collagène fibrillar avec des outils curvelet à base de transformation

Ici, nous présentons un protocole pour utiliser un outil logiciel MATLAB à base de transformation de courbes et open-source pour quantifier l’organisation du collagène fibrillar dans la matrice extracellulaire des tissus normaux et maladie. Cet outil peut être appliqué sur des images avec des fibres de collagène ou d’autres types de structures en ligne.

Chapitres dans cette vidéo

0:04

Introduction

0:43

CT-FIRE Fiber Extraction and Region of Interest (ROI) Analysis

2:34

Advanced CT-FIRE Post-Processing

4:09

CurveAlign Fiber Analysis: CT Mode Without Boundary

5:03

CurveAlign Fiber Analysis: CT-FIRE Mode with Boundary

6:14

CurveAlign Region of Interest (ROI) Analysis

6:56

Results: Representative Tumor-Associated Human Breast Cancer Tissue Microarray (TMA) Collagen Signatures

7:26

Conclusion

Vidéos Associées

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