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Numérisation Retroviral: Mapping des sites d'intégration MLV pour définir des régions réglementaires spécifiques à une cellule

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10:10 min

•

May 28th, 2017

DOI :

10.3791/55919-v

May 28th, 2017

•

Oriana Romano¹^,², Ingrid Cifola³, Valentina Poletti⁴, Marco Severgnini³, Clelia Peano³, Gianluca De Bellis³, Fulvio Mavilio¹^,⁴, Annarita Miccio¹^,²^,⁴^,⁵

¹Center for Genome Research, Department of Life Sciences, University of Modena and Reggio Emilia, ²Laboratory of Chromatin and Gene Regulation During Development, Imagine Institute, ³Institute for Biomedical Technologies, CNR, ⁴Généthon, ⁵Sorbonne Paris Cité - Université Paris Descartes

Résumé

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Genetics

Num ro 123

Virus de la leuc mie Moloney

Sites d int gration

Interaction virus h te

Cis l ments r gulateurs

R gulation pig n tique

Identit cellulaire

Analyse r trovirale

s quen age massif

Chapitres dans cette vidéo

0:05

Title

0:45

MLV Transduction of Human Cells

1:41

Restriction Enzyme Digestion and Linker Ligation

3:05

First-round Linker-mediated PCR

3:43

Second Round Linker-mediated PCR

5:17

Library Preparation and Dilution for Massive Sequencing of MLV Integration Sites

7:53

Results: Mapping MLV Integration into Epigenetically-defined Regulatory Regions

9:23

Conclusion

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