Experimentos de relajación de RMN ¹⁵N para la investigación de la dinámica estructural de proteínas de picosegundos a nanosegundos

Investigamos la dinámica estructural de las proteínas mediante espectroscopía de RMN para comprender mejor la función molecular. RMN son las siglas de Espectroscopia de Resonancia Magnética Nuclear. Reduce el efecto de que los espines nucleares de los átomos de hidrógeno pueden hacer la transición entre dos estados energéticamente diferentes y un campo magnético automático.

Podemos utilizar la espectroscopia de RMN para estudiar la dinámica estructural de proteínas intrínsecamente desordenadas. Estas proteínas son muy flexibles, cambian constantemente de forma y, con frecuencia, solo se pliegan en una estructura estable cuando interactúan con otras moléculas. Utilizamos experimentos de relajación de RMN para estudiar cómo se mueve la columna vertebral de la proteína en escalas de tiempo muy cortas, que van desde picosegundos hasta nanosegundos, mientras nos enfocamos en cada residuo específico a lo largo de la cadena de proteínas.

Este protocolo lo guiará paso a paso a través de la configuración de experimentos de relajación de RMN en un espectrómetro de RMN dirigido a científicos con conocimientos básicos de RMN, garantiza una configuración rápida y precisa e introduce conceptos clave en la dinámica de la columna vertebral de proteínas de una manera accesible. Este protocolo hace que las secuencias de pulso de relajación de RMN sean fácilmente accesibles para los científicos que estudian la dinámica de las proteínas. Los experimentos de relajación por RMN proporcionan información dinámica específica del residuo.

Con este enfoque experimental, se puede comprender mejor la dinámica de la columna vertebral de las proteínas, el impacto de la interacción proteína-proteína en la dinámica estructurada y los cambios estructurales en la respuesta a los cambios ambientales.