JoVE Journal

Bioengineering

This content is Open Access.

Von Voxel zu Wissen: ein praktischer Leitfaden für die Segmentierung der Elektronenmikroskopie Komplexe 3D-Daten

Please note that all translations are automatically generated. Click here for the English version.

24.5K Views

•

12:08 min

•

August 13th, 2014

DOI :

10.3791/51673-v

August 13th, 2014

•

Wen-Ting Tsai¹, Ahmed Hassan¹, Purbasha Sarkar², Joaquin Correa¹^,³, Zoltan Metlagel¹, Danielle M. Jorgens¹, Manfred Auer¹^,²

¹Life Sciences Division, Lawrence Berkeley National Laboratory, ²Joint Bioenergy Institute, Physical Biosciences Division, Lawrence Berkeley National Laboratory, ³National Energy Research Scientific Computing Center, Lawrence Berkeley National Laboratory

Zusammenfassung

Der Engpass für Mobil 3D-Elektronenmikroskopie ist die Merkmalsextraktion (Segmentierung) in hochkomplexen 3D-Dichtekarten. Wir haben eine Reihe von Kriterien, die den Orientierungsrahmen in Bezug auf die Segmentierungsansatz (manuell, halbautomatisch oder automatisch) ist am besten geeignet für verschiedene Datentypen entwickelt, so dass ein Ausgangspunkt für eine effektive Segmentierung.

Weitere Videos entdecken

3D Elektronenmikroskopie

Merkmalsextraktion

manuelle R ckverfolgung

Kapitel in diesem Video

0:05

Title

4:47

Manual Tracing of Features of Interest

2:04

Manual Abstracted Model Generation

8:10

Automated Density-based Segmentation

9:15

Custom-tailored Automated Segmentation

9:41

Results: Application of Four Segmentation Approaches to Example Data Sets

11:29

Conclusion

Ähnliche Videos

article

Eine Methode zur 3D-Rekonstruktion und Virtual Reality-Analyse von Glia- und Neuronalzellen

12.7K Views

article

3D Reconstruction and Analysis of Thin Subcellular Neuronal Structures using Focused-Ion Beam Scanning Electron Microscopy Data

1.0K Views

article

Korrelat konfokale und 3D-Elektronenmikroskopie eines spezifischen Sinneszelle

11.4K Views

article

Volumen-Segmentierung und Analyse von biologischen Materialien mit SuRVoS (Super-Region Volumen Segmentierung)-Workbench

9.8K Views

article

Simplified Volumetric Models as an Effective Strategy for Segmenting Actin Networks in Cryo-Electron Tomograms

201 Views

article

Gezielte Studien mit serial Block Face und Focused Ion Beam Scan Electron Microscopy

9.1K Views

article

Serielle Block-Face-Rasterelektronenmikroskopie (SBF-REM) biologischer Gewebeproben

7.4K Views

article

Eine kartographische 3D-Beschreibung der Zelle durch Kryo-Soft-Röntgentomographie

3.8K Views

article

Dreidimensionale Charakterisierung von interorganellen Kontaktstellen in Hepatozyten mittels serieller Schnittelektronenmikroskopie

5.4K Views

article

Deep-Learning-basierte Segmentierung von Kryo-Elektronen-Tomogrammen

8.4K Views

Copyright © 2025 MyJoVE Corporation. Alle Rechte vorbehalten

Wir verwenden Cookies, um Ihre Erfahrung auf unserer Website zu verbessern.

Indem Sie unsere Website weiterhin nutzen oder auf „Weiter“ klicken, stimmen Sie zu, unsere Cookies zu akzeptieren.

Weitere Informationen